PROSITE entry PS50953
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | KID |
Accession [info] | PS50953 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-JAN-2004 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC50953 |
Associated ProRule [info] | PRU00312 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | KID domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6737099; R2=0.0107733; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3346.6372070; R2=3.0167682; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=541; H_SCORE=4979; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=356; H_SCORE=4421; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= -5, -7,-26, -9, -3,-26, 0,-10,-15, -1,-18, -6, -2,-14, 11, -4, 1, -4,-15,-23,-14, 3; /M: SY='Q'; M= -7, -8,-26,-12, -7,-20,-13,-12, -3,-10,-12, -4, -3, -2, 3,-11, -3, -3, -7,-26,-14, -4; /M: SY='S'; M= 1, -4,-20, -2, 4,-23, 7,-10,-22, -9,-20,-14, 2,-13, 3,-10, 15, 1,-17,-30,-19, 3; /M: SY='S'; M= -4, -3,-22, -7, -3,-20,-16,-10, -6, -8,-17, -8, 3, -1, 4, -9, 8, 5, -8,-31,-15, -1; /M: SY='M'; M= 0,-11,-20,-17,-13,-13,-12,-12, 4,-12, 0, 7, -6,-20, -4,-13, -7, -6, 4,-25,-11, -9; /M: SY='T'; M= 1, -5,-17, -8, -4,-18,-15, 4,-14, -5,-16, -7, -1,-14, 3, 0, 10, 11, -7,-29, -9, -2; /M: SY='E'; M=-11, 10,-28, 17, 27,-33,-19, 1,-22, 5,-19,-11, 1, -9, 27, 0, -1, -9,-22,-28,-15, 27; /M: SY='S'; M= 2, -5,-17, -8, -4,-16,-14, 3,-13,-10,-10, -6, -1,-14, 3, -9, 11, 11, -9,-29, -8, -1; /M: SY='E'; M= -2, 6,-26, 8, 14,-29, -4, -5,-25, -2,-25,-17, 6, 4, 8, -7, 6, -5,-25,-30,-21, 10; /M: SY='E'; M= -1, 7,-21, 12, 14,-24,-13, 7,-21, -4,-20,-15, 3,-11, 2, -8, 7, -3,-14,-33,-13, 7; /M: SY='D'; M= -9, 19,-23, 28, 9,-28,-11, -4,-24, -5,-19,-17, 8,-12, 6, -8, 8, -1,-19,-35,-16, 8; /M: SY='Q'; M= -9, 7,-26, 12, 15,-29,-17, 0,-19, -1,-13, -8, 1,-12, 23, -2, 1, -6,-21,-28,-13, 19; /M: SY='D'; M=-10, 20,-26, 29, 27,-32,-15, -2,-29, 2,-23,-19, 8, -7, 14, -4, 6, 0,-25,-33,-17, 20; /M: SY='S'; M= -4, -2,-20, -6, -1, -8, -2, -8,-13,-11,-11, -5, 4,-16, -6,-10, 6, -1,-13,-27,-12, -3; /M: SY='S'; M= 5, -7,-14, -8, -8,-16, 3,-12,-12,-12,-19, -6, 1,-15, -5,-12, 22, 9, -4,-34,-17, -7; /M: SY='D'; M=-16, 27,-27, 39, 9,-28,-13, 11,-28, -7,-17,-18, 11,-14, -1,-10, -2, -8,-22,-36,-11, 3; /M: SY='S'; M= -1, 18,-17, 25, 7,-27, -4, -6,-27, -6,-30,-24, 14,-10, 0,-10, 26, 9,-17,-40,-20, 4; /M: SY='D'; M= -9, 7,-28, 14, 14,-27, 1,-11,-21, -6,-18,-15, 0,-12, -3,-12, -3,-11,-16,-29,-19, 5; /M: SY='D'; M= 5, 10,-22, 13, 3,-28, 11,-12,-28, -8,-23,-20, 4,-11, -6,-13, 8, -2,-19,-29,-22, -1; /M: SY='D'; M= -5, 14,-22, 20, 10,-25,-12, -8,-18, -7,-22,-18, 8,-10, 0,-12, 13, 2,-13,-36,-17, 4; /M: SY='S'; M= 10, -1,-20, -2, 7,-24, -7,-11,-19, -6,-24,-18, 2, 11, -1,-12, 14, 3,-17,-32,-22, 2; /M: SY='Q'; M=-10, -2,-30, -1, 14,-33, -7, -1,-27, 16,-24, -8, 0,-12, 28, 16, -3,-11,-27,-21,-14, 20; /M: SY='K'; M=-14, -2,-30, -2, 7,-27,-20, 10,-29, 33,-25, -8, 1,-14, 15, 33, -9,-11,-22,-21, -6, 9; /M: SY='R'; M=-10, -8,-26, -9, -1,-20,-16, 11,-27, 17,-20, -9, 1,-18, 7, 44, -3, -8,-18,-23, -8, -1; /M: SY='R'; M=-18, -9,-30, -9, -2,-21,-11, 8,-31, 21,-21,-10, 1,-20, 7, 54, -9,-12,-22,-21, -9, -2; /M: SY='E'; M= -6, 9,-27, 17, 31,-30, 2, -5,-32, 0,-25,-21, 4, -7, 7, -7, 6, -8,-27,-31,-22, 19; /M: SY='I'; M=-10,-21,-29,-26,-10, -8,-34,-20, 27,-20, 13, 12,-16,-17, -5,-20,-16,-10, 12,-21, -4,-11; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='A'; M= 22, 0,-11,-10, -8,-17, -7,-15,-12, -9,-14,-12, 4,-11, -8,-13, 16, 19, -5,-28,-17, -8; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='S'; M= 10, 0,-10, 0, 0,-20, 0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10, 0,-10, 40, 20,-10,-40,-20, 0; /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20, 0,-10, 0, 0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20; /M: SY='R'; M=-18, -2,-29, -5, 1,-21,-17, 0,-29, 28,-22,-11, 8,-19, 9, 56, -7, -9,-21,-23,-11, 1; /M: SY='K'; M=-11, -4,-29, -5, 5,-25,-20, -7,-24, 40,-23, -2, -2,-13, 9, 31,-11,-10,-16,-20, -9, 6; /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30, 0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20, 0,-30; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 20,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10, 9,-16, 4,-21; /M: SY='N'; M= -8, 23,-21, 16, 4,-24, -9, -2,-24, 9,-27,-18, 27,-14, 1, 3, 9, 6,-21,-34,-16, 2; /M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 63, 26,-39,-11, 0,-39, 1,-29,-29, 17, -9, 3, -9, 0,-10,-30,-39,-20, 14; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21, 9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20, 0,-21; /M: SY='S'; M= 11, -2,-17, -3, 2,-23, 12,-12,-24,-10,-26,-19, 4,-11, -3,-12, 22, 5,-15,-32,-22, -1; /M: SY='G'; M= 7, -6,-20, -8,-12,-24, 32,-17,-28,-15,-26,-18, 2,-15,-12,-16, 15, 2,-18,-27,-24,-12; /M: SY='P'; M= 2, 6,-28, 13, 12,-30, -4,-11,-26, -5,-23,-20, -2, 15, -3,-14, 0, -9,-23,-29,-23, 3; /M: SY='D'; M= -6, 16,-26, 25, 18,-30, -2, -8,-27, -3,-21,-20, 3,-10, -1,-10, 0,-10,-19,-31,-20, 9; /M: SY='P'; M= -9,-10,-27,-13, -7,-16,-21,-13, -4, 0, -8, 2, -7, 9, -5, -6, -9, -3, -9,-25,-12, -8; /M: SY='A'; M= 8,-15,-17,-18,-16,-15, 1,-17, -6,-10, -9, -1,-11,-19,-13, -8, 2, -3, 5,-25,-16,-15; /M: SY='B'; M=-10, 5,-24, 5, 2,-21, -8, -7,-18, 5,-16, -6, 4,-15, -1, 4, -3, -4,-13,-28,-14, 0; /M: SY='K'; M= -5, 1,-25, -2, -1,-20,-15, -5,-13, 4,-11, 0, 2, -6, 4, 3, -7, -7,-15,-26,-13, 0; /M: SY='E'; M=-10, 7,-27, 10, 13,-27,-14, 6,-28, 12,-27,-16, 8, -2, 6, 9, 1, -6,-24,-30,-13, 8; /M: SY='G'; M= -4, 0,-28, -1, 3,-25, 15,-11,-23,-10,-23,-16, 6, -4, -6,-13, 3, -9,-22,-28,-23, -2; /M: SY='D'; M=-13, 2,-29, 5, -1,-14,-13, -6,-10,-11,-10,-10, -1, -5, -7,-14, -9,-10,-15,-21, -3, -6; /M: SY='E'; M= 1, 8,-25, 13, 21,-29, 5, -8,-30, -3,-23,-20, 2, -8, 2,-10, 5, -8,-24,-29,-22, 12; /M: SY='E'; M= -5, 13,-24, 21, 36,-28,-12, -3,-28, 2,-25,-21, 6, -5, 11, -5, 12, -1,-24,-35,-20, 23; /M: SY='B'; M= -6, 11,-22, 10, 6,-25, -5, -7,-24, 1,-23,-16, 10,-11, 4, -3, 9, 9,-19,-30,-17, 5; /M: SY='S'; M= 1, -7,-20, -6, -2,-22, 2,-11,-19,-11,-20,-13, -1, -2, 2,-11, 15, 3,-16,-31,-19, -1; /M: SY='E'; M= -4, -2,-24, 0, 10,-25, -6, 2,-24, -5,-23,-14, 1, 2, 6, -7, 10, 3,-21,-30,-15, 7; /M: SY='S'; M= 1, -2, -4, -2, 0,-20,-13,-13,-18, -4,-19,-15, -1,-15, -5, -2, 10, 5, -7,-33,-18, -3; /M: SY='G'; M= -2, 0,-23, 3, 2,-23, 8,-12,-25, -3,-20,-15, 2,-14, -4, -7, 8, -3,-18,-29,-19, -1; /M: SY='S'; M= 7, -5,-18, -5, 8,-19,-13,-12,-15, -1,-15,-12, -4,-11, 0, 0, 9, 5, -6,-28,-16, 3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 16 in 16 different sequences |
Number of true positive hits | 16 in 16 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 0 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 1 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | KID |
Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
16 sequences
ATF1_BOVIN (Q08DA8), ATF1_HUMAN (P18846), ATF1_MOUSE (P81269), CREB1_BOVIN (P27925), CREB1_HUMAN (P16220), CREB1_MOUSE (Q01147), CREB1_RAT (P15337), CREBB_DROME (Q9VWW0), CREBH_CAEEL (Q9U2I0), CREB_HYDVD (P51984), CREB_HYDVU (P51985), CREM_BOVIN (Q1LZH5), CREM_CANLF (P79145), CREM_HUMAN (Q03060), CREM_MOUSE (P27699), CREM_RAT(Q03061)» more
|
PDB [Detailed view] |
3 PDB
1KDX; 2LXT; 7TBH |