Entry: PS50953

General information about the entry

Entry name [info] KID
Accession [info] PS50953
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50953
Associated ProRule [info] PRU00312

Name and characterization of the entry

Description [info] KID domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=60;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=55;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6737099; R2=0.0107733; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3674.93333; R2=24.46667; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=541; N_SCORE=8.5; H_SCORE=10085; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=356; N_SCORE=6.5; H_SCORE=10085; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -5, -7,-26, -9, -3,-26,  0,-10,-15, -1,-18, -6, -2,-14, 11, -4,  1, -4,-15,-23,-14,  3;
/M: SY='Q'; M= -7, -8,-26,-12, -7,-20,-13,-12, -3,-10,-12, -4, -3, -2,  3,-11, -3, -3, -7,-26,-14, -4;
/M: SY='S'; M=  1, -4,-20, -2,  4,-23,  7,-10,-22, -9,-20,-14,  2,-13,  3,-10, 15,  1,-17,-30,-19,  3;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-22, -7, -3,-20,-16,-10, -6, -8,-17, -8,  3, -1,  4, -9,  8,  5, -8,-31,-15, -1;
/M: SY='M'; M=  0,-11,-20,-17,-13,-13,-12,-12,  4,-12,  0,  7, -6,-20, -4,-13, -7, -6,  4,-25,-11, -9;
/M: SY='T'; M=  1, -5,-17, -8, -4,-18,-15,  4,-14, -5,-16, -7, -1,-14,  3,  0, 10, 11, -7,-29, -9, -2;
/M: SY='E'; M=-11, 10,-28, 17, 27,-33,-19,  1,-22,  5,-19,-11,  1, -9, 27,  0, -1, -9,-22,-28,-15, 27;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-17, -8, -4,-16,-14,  3,-13,-10,-10, -6, -1,-14,  3, -9, 11, 11, -9,-29, -8, -1;
/M: SY='E'; M= -2,  6,-26,  8, 14,-29, -4, -5,-25, -2,-25,-17,  6,  4,  8, -7,  6, -5,-25,-30,-21, 10;
/M: SY='E'; M= -1,  7,-21, 12, 14,-24,-13,  7,-21, -4,-20,-15,  3,-11,  2, -8,  7, -3,-14,-33,-13,  7;
/M: SY='D'; M= -9, 19,-23, 28,  9,-28,-11, -4,-24, -5,-19,-17,  8,-12,  6, -8,  8, -1,-19,-35,-16,  8;
/M: SY='Q'; M= -9,  7,-26, 12, 15,-29,-17,  0,-19, -1,-13, -8,  1,-12, 23, -2,  1, -6,-21,-28,-13, 19;
/M: SY='D'; M=-10, 20,-26, 29, 27,-32,-15, -2,-29,  2,-23,-19,  8, -7, 14, -4,  6,  0,-25,-33,-17, 20;
/M: SY='S'; M= -4, -2,-20, -6, -1, -8, -2, -8,-13,-11,-11, -5,  4,-16, -6,-10,  6, -1,-13,-27,-12, -3;
/M: SY='S'; M=  5, -7,-14, -8, -8,-16,  3,-12,-12,-12,-19, -6,  1,-15, -5,-12, 22,  9, -4,-34,-17, -7;
/M: SY='D'; M=-16, 27,-27, 39,  9,-28,-13, 11,-28, -7,-17,-18, 11,-14, -1,-10, -2, -8,-22,-36,-11,  3;
/M: SY='S'; M= -1, 18,-17, 25,  7,-27, -4, -6,-27, -6,-30,-24, 14,-10,  0,-10, 26,  9,-17,-40,-20,  4;
/M: SY='D'; M= -9,  7,-28, 14, 14,-27,  1,-11,-21, -6,-18,-15,  0,-12, -3,-12, -3,-11,-16,-29,-19,  5;
/M: SY='D'; M=  5, 10,-22, 13,  3,-28, 11,-12,-28, -8,-23,-20,  4,-11, -6,-13,  8, -2,-19,-29,-22, -1;
/M: SY='D'; M= -5, 14,-22, 20, 10,-25,-12, -8,-18, -7,-22,-18,  8,-10,  0,-12, 13,  2,-13,-36,-17,  4;
/M: SY='S'; M= 10, -1,-20, -2,  7,-24, -7,-11,-19, -6,-24,-18,  2, 11, -1,-12, 14,  3,-17,-32,-22,  2;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-30, -1, 14,-33, -7, -1,-27, 16,-24, -8,  0,-12, 28, 16, -3,-11,-27,-21,-14, 20;
/M: SY='K'; M=-14, -2,-30, -2,  7,-27,-20, 10,-29, 33,-25, -8,  1,-14, 15, 33, -9,-11,-22,-21, -6,  9;
/M: SY='R'; M=-10, -8,-26, -9, -1,-20,-16, 11,-27, 17,-20, -9,  1,-18,  7, 44, -3, -8,-18,-23, -8, -1;
/M: SY='R'; M=-18, -9,-30, -9, -2,-21,-11,  8,-31, 21,-21,-10,  1,-20,  7, 54, -9,-12,-22,-21, -9, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-27, 17, 31,-30,  2, -5,-32,  0,-25,-21,  4, -7,  7, -7,  6, -8,-27,-31,-22, 19;
/M: SY='I'; M=-10,-21,-29,-26,-10, -8,-34,-20, 27,-20, 13, 12,-16,-17, -5,-20,-16,-10, 12,-21, -4,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A'; M= 22,  0,-11,-10, -8,-17, -7,-15,-12, -9,-14,-12,  4,-11, -8,-13, 16, 19, -5,-28,-17, -8;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='R'; M=-18, -2,-29, -5,  1,-21,-17,  0,-29, 28,-22,-11,  8,-19,  9, 56, -7, -9,-21,-23,-11,  1;
/M: SY='K'; M=-11, -4,-29, -5,  5,-25,-20, -7,-24, 40,-23, -2, -2,-13,  9, 31,-11,-10,-16,-20, -9,  6;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 20,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='N'; M= -8, 23,-21, 16,  4,-24, -9, -2,-24,  9,-27,-18, 27,-14,  1,  3,  9,  6,-21,-34,-16,  2;
/M: SY='D'; M=-19, 44,-30, 63, 26,-39,-11,  0,-39,  1,-29,-29, 17, -9,  3, -9,  0,-10,-30,-39,-20, 14;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='S'; M= 11, -2,-17, -3,  2,-23, 12,-12,-24,-10,-26,-19,  4,-11, -3,-12, 22,  5,-15,-32,-22, -1;
/M: SY='G'; M=  7, -6,-20, -8,-12,-24, 32,-17,-28,-15,-26,-18,  2,-15,-12,-16, 15,  2,-18,-27,-24,-12;
/M: SY='P'; M=  2,  6,-28, 13, 12,-30, -4,-11,-26, -5,-23,-20, -2, 15, -3,-14,  0, -9,-23,-29,-23,  3;
/M: SY='D'; M= -6, 16,-26, 25, 18,-30, -2, -8,-27, -3,-21,-20,  3,-10, -1,-10,  0,-10,-19,-31,-20,  9;
/M: SY='P'; M= -9,-10,-27,-13, -7,-16,-21,-13, -4,  0, -8,  2, -7,  9, -5, -6, -9, -3, -9,-25,-12, -8;
/M: SY='A'; M=  8,-15,-17,-18,-16,-15,  1,-17, -6,-10, -9, -1,-11,-19,-13, -8,  2, -3,  5,-25,-16,-15;
/M: SY='B'; M=-10,  5,-24,  5,  2,-21, -8, -7,-18,  5,-16, -6,  4,-15, -1,  4, -3, -4,-13,-28,-14,  0;
/M: SY='K'; M= -5,  1,-25, -2, -1,-20,-15, -5,-13,  4,-11,  0,  2, -6,  4,  3, -7, -7,-15,-26,-13,  0;
/M: SY='E'; M=-10,  7,-27, 10, 13,-27,-14,  6,-28, 12,-27,-16,  8, -2,  6,  9,  1, -6,-24,-30,-13,  8;
/M: SY='G'; M= -4,  0,-28, -1,  3,-25, 15,-11,-23,-10,-23,-16,  6, -4, -6,-13,  3, -9,-22,-28,-23, -2;
/M: SY='D'; M=-13,  2,-29,  5, -1,-14,-13, -6,-10,-11,-10,-10, -1, -5, -7,-14, -9,-10,-15,-21, -3, -6;
/M: SY='E'; M=  1,  8,-25, 13, 21,-29,  5, -8,-30, -3,-23,-20,  2, -8,  2,-10,  5, -8,-24,-29,-22, 12;
/M: SY='E'; M= -5, 13,-24, 21, 36,-28,-12, -3,-28,  2,-25,-21,  6, -5, 11, -5, 12, -1,-24,-35,-20, 23;
/M: SY='B'; M= -6, 11,-22, 10,  6,-25, -5, -7,-24,  1,-23,-16, 10,-11,  4, -3,  9,  9,-19,-30,-17,  5;
/M: SY='S'; M=  1, -7,-20, -6, -2,-22,  2,-11,-19,-11,-20,-13, -1, -2,  2,-11, 15,  3,-16,-31,-19, -1;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-24,  0, 10,-25, -6,  2,-24, -5,-23,-14,  1,  2,  6, -7, 10,  3,-21,-30,-15,  7;
/M: SY='S'; M=  1, -2, -4, -2,  0,-20,-13,-13,-18, -4,-19,-15, -1,-15, -5, -2, 10,  5, -7,-33,-18, -3;
/M: SY='G'; M= -2,  0,-23,  3,  2,-23,  8,-12,-25, -3,-20,-15,  2,-14, -4, -7,  8, -3,-18,-29,-19, -1;
/M: SY='S'; M=  7, -5,-18, -5,  8,-19,-13,-12,-15, -1,-15,-12, -4,-11,  0,  0,  9,  5, -6,-28,-16,  3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_08 which contains 320'201 sequence entries.


Total number of hits 15 in 15 different sequences
Number of true positive hits 15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KID
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
15 sequences

ATF1_BOVIN  (Q08DA8), ATF1_HUMAN  (P18846), ATF1_MOUSE  (P81269), 
CREB1_BOVIN (P27925), CREB1_HUMAN (P16220), CREB1_MOUSE (Q01147), 
CREB1_RAT   (P15337), CREBB_DROME (Q9VWW0), CREB_HYDVD  (P51984), 
CREB_HYDVU  (P51985), CREM_BOVIN  (Q1LZH5), CREM_CANFA  (P79145), 
CREM_HUMAN  (Q03060), CREM_MOUSE  (P27699), CREM_RAT    (Q03061)
» More

PDB
[Detailed view]
2 PDB

1KDX; 2LXT

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission