ID ZF_SWIM; MATRIX. AC PS50966; DT 01-MAR-2004 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Zinc finger SWIM-type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1868844; R2=0.0123659; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=471; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=349; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=-100; B1=-150; E0=-100; E1=-110; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='Y'; M=-16,-21,-26,-24,-20,30,-28,-9,0,-15,1,1,-17,-27,-16,-13,-17,-9,4,-2,47,-20; MA /M: SY='T'; M=-9,-7,-24,-7,2,-12,-19,-6,-13,2,-11,-6,-6,-14,1,5,-2,13,-10,-20,-6,1; MA /M: SY='V'; M=-1,-25,-9,-28,-26,-3,-29,-26,23,-19,8,8,-24,-26,-24,-19,-8,2,35,-29,-9,-25; MA /M: SY='Q'; M=-6,-4,-23,-5,0,-15,-16,-3,-12,-2,-12,-5,-2,-14,2,-1,-1,-1,-10,-22,-7,0; MA /M: SY='I'; M=-4,-23,-20,-26,-20,0,-24,-18,16,-21,12,8,-20,-23,-17,-19,-14,-7,14,-18,-2,-20; MA /M: SY='D'; M=-7,6,-23,8,4,-22,-5,-7,-21,-2,-18,-13,3,-13,-1,-5,0,-5,-17,-26,-13,1; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='L'; M=-6,-8,-20,-9,-6,-6,-14,-11,-4,-9,1,-1,-7,-15,-7,-8,-7,-5,-4,-18,-6,-7; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='D'; M=-6,7,-21,9,6,-20,-7,-4,-20,2,-18,-13,6,-9,1,0,1,-3,-16,-24,-12,3; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='D'; M=-5,6,-18,7,4,-19,-5,-5,-18,1,-15,-11,6,-8,0,-1,0,-3,-15,-24,-13,1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='D'; M=-4,2,-18,3,2,-16,-3,-6,-17,-1,-15,-10,0,-9,-3,-3,-1,-5,-13,-21,-11,-1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='E'; M=-6,0,-19,1,2,-12,-11,-5,-13,-2,-11,-8,-1,-10,-2,-2,-1,-1,-10,-18,-5,-1; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-21; MA /M: M=-4,-8,-15,-9,-5,-6,-10,-10,-2,-7,-2,-2,-7,-13,-7,-7,-5,-4,0,-13,-5,-6; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21; MA /M: SY='E'; M=-4,0,-18,-1,1,-14,-7,-5,-13,-2,-12,-7,0,-10,-1,-3,0,-2,-10,-20,-8,0; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: M=0,-10,-13,-13,-12,-11,-9,-11,-11,-10,-13,-8,-6,-16,-10,-9,-1,-3,-7,-19,-7,-12; MA /M: SY='S'; M=-6,-2,-21,-3,0,-10,-16,-4,-17,1,-16,-11,0,-15,-1,1,3,3,-13,-20,-1,-1; MA /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30; MA /M: SY='S'; M=3,5,-15,20,1,-19,-7,-11,-18,-8,-21,-16,15,-10,-3,-10,62,59,-10,-35,-17,-1; MA /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30; MA /M: SY='P'; M=-6,-8,-26,-5,2,-23,-12,-10,-22,1,-22,-14,-6,18,-2,0,-3,-6,-21,-26,-17,-2; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: M=-4,-4,-19,-4,-4,-11,-12,-6,-13,-4,-11,-7,-4,-17,-4,-5,-4,-6,-10,-14,-3,-5; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-21,-18,25,-15,-11,-7,-17,-3,-4,-14,-18,-19,-14,-14,-10,-8,19,16,-16; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='E'; M=-4,2,-19,3,10,-18,-12,-3,-14,3,-11,-7,1,-8,10,0,-1,-4,-14,-20,-10,10; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='H'; M=-9,-2,-19,-4,-3,-9,-11,1,-13,-2,-10,-6,0,-16,-2,1,-2,-2,-12,-18,-1,-3; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=-4,-3,-26,-5,-6,-23,17,-2,-29,-2,-24,-14,4,-15,-5,-1,0,-10,-23,-23,-15,-6; MA /M: M=-8,-12,-26,-15,-14,-4,-9,-10,-4,-13,-4,-3,-7,-17,-12,-11,-10,-8,-7,-13,0,-14; MA /M: SY='P'; M=-10,-15,-26,-14,-10,-10,-22,-14,-5,-13,-6,-4,-15,23,-11,-15,-13,-9,-10,-18,-7,-13; MA /M: SY='C'; M=-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30; MA /M: SY='K'; M=-6,-6,-22,-7,2,-21,-18,-8,-20,19,-21,-9,-2,-13,4,16,-2,-4,-13,-22,-9,2; MA /M: SY='H'; M=-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,140,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30,-30; MA /M: SY='I'; M=3,-22,-17,-28,-21,-6,-3,-22,19,-19,10,11,-18,-21,-14,-19,-11,-5,17,-22,-7,-19; MA /M: SY='L'; M=10,-24,-17,-28,-21,1,-4,-28,16,-21,17,9,-22,-34,-18,-19,-14,-6,16,-18,-1,-21; MA /M: SY='A'; M=27,-10,-14,-17,-9,-16,5,-24,-12,-7,-11,-8,-8,-13,-9,-11,-5,-1,-4,-20,-14,-10; MA /M: SY='V'; M=15,-24,-13,-26,-22,-10,-3,-24,16,-20,13,7,-23,-24,-21,-20,-8,-5,25,-25,-9,-22; MA /M: SY='L'; M=5,-19,-18,-23,-14,4,-23,-13,6,-15,12,7,-17,-22,-13,-13,-14,-7,4,-16,3,-14; MA /M: SY='L'; M=-10,-15,-22,-18,0,1,-24,-8,3,-13,9,5,-12,-22,2,-9,-13,-5,-1,-15,6,-11; MA /M: SY='A'; M=1,-8,-18,-11,-6,-11,-14,-1,-5,-5,-5,-4,-5,-17,-3,-4,0,-1,-8,-22,-3,-5; MA /M: SY='L'; M=-6,-17,-14,-20,-14,-3,-22,-11,0,-10,6,6,-15,-22,-10,-7,-12,-7,3,-14,3,-13; MA /M: SY='N'; M=-4,-1,-21,-4,-1,-18,-5,-7,-17,-1,-14,-9,2,-17,-1,-2,-2,-6,-15,-24,-11,-2; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=48(47); /POSITIVE=47(46); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=N_Hulo; CC /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=SWIM-type; CC /VERSION=4; DR Q9SWG3 , FAR1_ARATH , T; Q9LIE5 , FHY3_ARATH , T; DR Q9LKR4 , FRS10_ARATH, T; Q9SY66 , FRS11_ARATH, T; DR Q3E7I5 , FRS12_ARATH, T; Q5UBY2 , FRS1_ARATH , T; DR Q3EBQ3 , FRS2_ARATH , T; Q9ZVC9 , FRS3_ARATH , T; DR Q6NQJ7 , FRS4_ARATH , T; Q9SZL8 , FRS5_ARATH , T; DR Q9SSQ4 , FRS6_ARATH , T; Q9M8J3 , FRS7_ARATH , T; DR Q9S793 , FRS8_ARATH , T; Q9SZL7 , FRS9_ARATH , T; DR Q55DJ8 , IRLC_DICDI , T; Q13233 , M3K1_HUMAN , T; DR P53349 , M3K1_MOUSE , T; Q62925 , M3K1_RAT , T; DR O13600 , SWS1_SCHPO , T; P47264 , Y018_MYCGE , T; DR P75093 , Y020_MYCPN , T; O29156 , Y1109_ARCFU, T; DR Q58888 , Y1493_METJA, T; O53500 , Y2102_MYCTU, T; DR P33353 , YEHQ_ECOLI , T; P96714 , YWQB_BACSU , T; DR Q9BR11 , ZSWM1_HUMAN, T; Q9CWV7 , ZSWM1_MOUSE, T; DR Q8NEG5 , ZSWM2_HUMAN, T; Q9D9X6 , ZSWM2_MOUSE, T; DR Q96MP5 , ZSWM3_HUMAN, T; Q8CFL8 , ZSWM3_MOUSE, T; DR Q9H7M6 , ZSWM4_HUMAN, T; Q8C7B8 , ZSWM4_MOUSE, T; DR Q9P217 , ZSWM5_HUMAN, T; Q80TC6 , ZSWM5_MOUSE, T; DR Q9HCJ5 , ZSWM6_HUMAN, T; Q80TB7 , ZSWM6_MOUSE, T; DR A4FVI0 , ZSWM7_DANRE, T; Q55FI7 , ZSWM7_DICDI, T; DR Q19AV6 , ZSWM7_HUMAN, T; Q9CWQ2 , ZSWM7_MOUSE, T; DR A7E305 , ZSWM8_BOVIN, T; Q9VWN9 , ZSWM8_DROME, T; DR A7E2V4 , ZSWM8_HUMAN, T; Q3UHH1 , ZSWM8_MOUSE, T; DR Q5V5N9 , SYE_HALMA , F; PR PRU00325; DO PDOC50966; //