PROSITE entry PS50969

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	FCP1
Accession [info]	PS50969
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAR-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50969
Associated ProRule [info]	PRU00336

Name and characterization of the entry

Description [info]

FCP1 homology domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=162;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=157;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2764904; R2=0.0218987; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9720.5312500; R2=4.5313435; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=376; H_SCORE=11424; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=193; H_SCORE=10595; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -5, -8,-25, -9, -5,-10,-15, -6,-11, -6, -7, -5, -6, -7, -4, -3, -7, -7,-13,-20, -4, -6;
/M: SY='R';  M= -7, -6,-23, -8, -2,-11,-16, -6,-13, -1,-11, -5, -2,-11,  1,  3, -3, -2,-12,-22, -6, -2;
/M: SY='E';  M= -7,  3,-20,  3,  6,-22,-16, -4,-21,  4,-19,-12,  3,-10,  6,  6,  1, -1,-17,-27,-12,  5;
/M: SY='R';  M= -9, -3,-26, -6, -2,-22, -9, -3,-22,  9,-20, -9,  3, -5,  4, 15, -3, -3,-20,-25,-14, -1;
/M: SY='R';  M=-12, -6,-25, -7,  3,-24,-21, -8,-23, 30,-21, -6, -4,-11,  8, 31,-10, -9,-16,-22,-11,  4;
/M: SY='K';  M=-11,-13,-27,-12, -5,-10,-24,-13, -7,  4,  2,  1,-13, -5, -6,  0,-17, -9, -9,-20, -5, -7;
/M: SY='T';  M= -5,-15,-14,-19,-15, -3,-24,-17,  5,-17,  9,  2,-13,-20,-14,-13, -2, 15,  7,-26, -5,-15;
/M: SY='L';  M= -9,-27,-19,-27,-20,  5,-30,-22, 21,-26, 36, 16,-27,-28,-20,-19,-24, -8, 17,-22, -3,-21;
/M: SY='V';  M= -4,-29,-13,-31,-28,  2,-31,-28, 29,-20, 13, 12,-26,-28,-26,-20,-14, -4, 38,-26, -7,-27;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-21,-32,-22, 15,-31,-22, 22,-28, 36, 16,-27,-28,-22,-21,-25, -9, 14,-17,  2,-22;
/M: SY='D';  M=-17, 43,-29, 60, 19,-37, -8, -1,-38,  0,-29,-28, 19,-10,  0, -9,  1, -8,-29,-38,-20,  9;
/M: SY='L';  M=-10,-29,-17,-31,-22,  7,-30,-20, 22,-29, 42, 21,-28,-29,-19,-21,-27,-10, 12,-21, -1,-21;
/M: SY='D';  M=-16, 40,-28, 50, 17,-34, -9,  1,-34,  3,-29,-26, 25,-12,  2, -3,  2, -7,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='E';  M= -9,  9,-28, 10, 15,-26,  2, 12,-28, -3,-23,-15, 10,-13,  8, -5,  0,-11,-28,-26,-11, 10;
/M: SY='T';  M= -3, -7,-13,-15,-13, -4,-22,-17, -3,-14, -2, -4, -6,-15,-13,-13,  9, 33,  3,-27, -6,-13;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-22,-28,-21,  6,-31,-21, 24,-28, 40, 19,-26,-27,-19,-21,-26,-10, 14,-21, -1,-21;
/M: SY='I';  M=  0,-27,-14,-32,-25,  3,-29,-25, 24,-25, 21, 12,-24,-25,-22,-23,-16, -6, 23,-22, -5,-25;
/M: SY='H';  M=-15,  4,-18,  6,  2,-15,-19, 35,-24, -4,-19, -9,  4,-19,  1, -4, -6,-11,-21,-25,  8, -1;
/M: SY='T';  M=  3,-11,-13,-16,-11,-11,-17,-14, -6, -9, -9, -6, -7,-12, -9, -7,  5,  8, -1,-26,-10,-11;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='T';  M= -2, -2,-15, -5, -5,-13,-10,-10,-10, -5,-13, -9,  0,-15, -7, -6,  4,  5, -4,-17, -9, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='Y';  M= -9, -8,-20,-10, -6,  3,-14, -5, -9, -8, -8, -4, -7,-15, -4, -8, -5, -2, -9, -1,  4, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='B';  M= -7,  4,-19,  3,  0,-14, -9, -5,-15,  2,-14, -8,  4,-11, -1,  0,  1,  1,-11,-21, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='R';  M= -4, -7,-15, -8, -5, -6, -7, -6,-10, -1, -9, -4, -4, -4, -4,  1, -2, -1, -8,-13, -5, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-3;
/M: SY='T';  M= -1, -2, -7, -4, -3,-10, -6, -7, -9, -1, -9, -4, -1, -5, -3, -2,  2,  3, -5,-15, -7, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-3; IM=0; DM=-3;
/M:         M= -4, -4,-10, -5, -1, -7,-11, -6, -5, -5, -4, -1, -3, -1, -2, -5, -3, -2, -6,-16, -7, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -3, -1,-16,  0,  1,-12, -5, -2,-10, -1, -9, -6, -2, -6,  0, -2, -1, -4, -9,-14, -5,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M:         M= -6, -5,-12, -4,  0, -7, -9, -4, -5, -5, -5, -2, -6,-10, -4, -7, -5, -5, -4,-13, -1, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='R';  M= -7,  0,-13,  0, -1,-15, -8, -3,-15,  2,-14, -9,  2, -2, -2,  3, -2, -4,-12,-20,-10, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='H';  M= -6, -1,-13, -2, -1, -9,-11,  1, -8, -6, -6, -5,  1, -8, -4, -4, -3, -5, -7,-19, -6, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='S';  M=  0,  3,-15,  3,  3,-15,-10, -7,-13,  2,-13, -9,  1, -9,  1,  0,  5,  3, -8,-20, -9,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M:         M= -8, -7,-19, -8, -6, -2, -8, -3, -9, -7, -7, -5, -5, -4, -9, -8, -7, -6, -9,-14, -2, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='D';  M= -6,  0,-18,  3,  2,-11,-10, -7, -9, -5, -5, -5, -4, -7, -3, -6, -4, -4, -8,-19, -8, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M:         M= -6, -4,-15, -3, -5, -7,-10, -9, -6, -6, -5, -4, -5,-13, -5, -8, -4, -3, -4,-16, -4, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='R';  M= -6, -5,-19, -5, -4,-13,-10, -3, -9,  0, -9, -3, -4, -6, -3,  3, -6, -6, -6,-18, -7, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='V';  M= -3,-13,-14,-16,-12,  3,-17,-12,  1, -9, -3, -2,-10,-11,-12, -5, -3,  2,  6,-15, -2,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -4, -6,-19, -5,  2,-10,-13, -7, -9,  0, -8, -5, -6, -4, -2, -3, -4, -5, -9,-16, -5, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M:         M= -3,-10,-17,-13, -8, -3,-11,-10, -3, -8, -3,  0, -8, -5, -8,-10, -4, -1, -3,-14, -3, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='E';  M= -6,  0,-21,  2,  3,-15, -7, -8,-17, -1,-15,-12, -1, -2, -2, -1, -3, -6,-14,-16,-12,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='A';  M=  1, -9,-17,-11, -7, -9, -7,-10, -5, -8, -7, -4, -6,-12, -7, -7, -1, -3, -2,-19, -9, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-3;
/M: SY='R';  M=-11, -8,-27, -9, -3, -9,-13,  4,-17,  0,-11, -6, -4,-17,  0,  5, -8, -9,-16,-15,  4, -3;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-22, -4,  1,-17,-13, -4,-15,  0,-16,-10,  0,-10, -2, -1, -2, -6,-13,-25,-10, -2;
/M:         M= -7, -5,-16, -8, -7,-13,-11, -4,-12, -9, -8, -3, -4,-13, -6, -7, -4, -2,-11,-25, -8, -7;
/M:         M= -8, -9,-26,-10, -6,-10, -7,-12,-13, -9, -8, -7, -7,-10, -7, -7, -7, -6,-13,-16, -8, -8;
/M: SY='Y';  M=-11,-20,-25,-23,-20, 12,-23, -7,  3,-15,  2,  5,-16,-25,-15,-11,-15, -9,  2,  3, 17,-18;
/M: SY='Y';  M=-11,-15,-20,-17,-12,  1,-21, -2, -8, -8, -2, -2,-12,-19, -9, -3,-11, -3, -8, -7, 13,-12;
/M: SY='V';  M= -5,-21,-17,-24,-20,  2,-27,-21, 15,-17,  5,  4,-18,-21,-19,-14, -7,  3, 21,-24, -4,-20;
/M: SY='Y';  M=-12,-16,-19,-19,-13,  0,-25, -5, -6,  1, -4,  1,-14,-22, -9,  0,-16, -9, -5, -4,  9,-11;
/M: SY='K';  M= -7,-13,-24,-14, -3, -8,-17,-14,-11,  5, -2, -1,-12,-13, -6,  1,-14,-10, -9,-19, -7, -5;
/M: SY='R';  M=-19,-11,-30,-11, -1,-19,-21, -2,-26, 27,-17, -8, -2,-20,  8, 62,-11,-10,-17,-20, -9, -1;
/M: SY='P';  M= -8,-18,-38,-10,  0,-29,-19,-19,-20, -8,-29,-19,-18, 81, -9,-18, -8, -9,-28,-30,-29, -9;
/M: SY='Y';  M=-11, -9,-27,-11,-14,  4,  1, 15,-19,-13,-14, -8, -3,-23,-12,-11, -9,-13,-19, -6, 18,-14;
/M: SY='V';  M=  5,-23, -2,-27,-21, -5,-23,-23,  9,-21, 12,  6,-22,-25,-18,-20,-12, -5, 13,-21,-10,-19;
/M: SY='D';  M=-12,  8,-23, 14,  7,-22,-15,  5,-25, -1,-19,-14,  2,-12, -2, -1, -5, -8,-19,-26,-10,  1;
/M: SY='E';  M= -9,  6,-27, 11, 24,-17,-19,  1,-21,  1,-13,-13,  0,-11,  6, -2, -4, -9,-20,-25, -8, 15;
/M: SY='F';  M=-17,-29,-20,-37,-28, 65,-27,-20,  2,-29, 14,  3,-21,-30,-36,-20,-20,-10,  2,  4, 23,-28;
/M: SY='L';  M=-10,-28,-16,-30,-20, 13,-29,-19, 15,-27, 38, 16,-26,-29,-20,-18,-25, -9,  8,-19,  1,-20;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-23,  5, 10,-21,-11, -8,-22,  8,-19,-14,  4,-12,  2,  4,  2, -3,-16,-27,-15,  6;
/M: SY='Y';  M=-10,-10,-24,-10,  0, -5,-22, -2,-12,  1, -9, -5, -8,-17, -1,  2, -6, -3, -9,-13,  6, -2;
/M: SY='L';  M=  3,-22, -3,-27,-21, -5,-24,-19, 11,-22, 13,  9,-20,-24,-18,-21,-12, -4, 13,-26, -9,-20;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S';  M= 10, -7,-17,-11, -7,-10, -5, -8,-12,-11,-14,-10, -2,-15, -4,-13, 11,  2, -9,-20, -4, -6;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -6,  5,-26,  5, 16,-25,-16, -3,-24, 14,-22,-13,  4, -4, 10,  5, -1, -5,-22,-26,-14, 12;
/M: SY='Y';  M=-12,-10,-25,-13,-12,  1,-20, -4, -3,-12,  1,  3, -8,-18,-10,-10,-13, -6, -7, -9,  5,-12;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='Y';  M=-16,-23,-22,-27,-23, 38,-28,  0, -2,-15,  0, -2,-20,-29,-20,-14,-19,-10, -6, 22, 49,-22;
/M: SY='E';  M= -9, 10,-23, 17, 35,-28,-17, -3,-28,  7,-22,-19,  3, -3, 10,  1,  1, -8,-25,-31,-19, 22;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-20,-31,-24,  2,-31,-23, 28,-23, 25, 19,-25,-26,-20,-18,-19, -5, 25,-23, -3,-23;
/M: SY='V';  M= -2,-17,-20,-19,-20, -7,-14, -4,  6,-17, -2,  3,-15,-23,-17,-17, -8, -7, 13,-21,  0,-20;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-22,-33,-26,  2,-34,-24, 32,-25, 17, 14,-23,-21,-22,-24,-16, -5, 28,-23, -3,-27;
/M: SY='W';  M=-17,-27,-26,-30,-25, 31,-26,-14, -4,-21, -1, -4,-24,-29,-23,-18,-22,-14, -7, 41, 31,-22;
/M: SY='T';  M=  3, -1,-11, -7, -7,-14,-14,-16,-12, -9,-16,-13,  3,-11, -6, -8, 25, 36, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='A';  M= 10, -7,-16,-11, -8,-12, -7, -9, -8, -9, -9,  1, -4,-15, -4,-12,  7,  2, -5,-24, -9, -6;
/M: SY='G';  M= 10, -6,-17, -9, -7,-21, 13,-14,-22, -9,-19,-14, -2,-15, -8,-10,  7, -2,-15,-24,-17, -8;
/M: SY='T';  M= -3, -4,-17, -6, -5,-17,-11,-12,-11, -5,-13, -6, -1,-12, -3, -7,  6,  7, -8,-28,-13, -4;
/M: SY='R';  M= -8, -9,-28, -8,  7,-19,-15, -8,-19,  8,-14, -6, -7, -7,  5, 14, -7, -9,-16,-19,-12,  5;
/M: SY='E';  M= -7,  2,-25,  2,  6,-21,-12, -4,-15, -2,-13, -6,  2, -9,  3, -1, -2, -5,-15,-28,-14,  3;
/M: SY='Y';  M=-15,-13,-27,-17,-18, 18,-24, 11, -3,-11, -3, -3,-11,-27,-11,-10,-15, -7, -9, 17, 50,-17;
/M: SY='A';  M= 26,-14,-10,-21,-15,-14, -8,-17, -1,-13, -6, -2,-12,-16,-13,-18,  4,  0,  8,-24,-15,-14;
/M: SY='E';  M=-10,  4,-25,  6,  8,-20,-18,  2,-17,  0,-12, -7,  1,-14,  7,  2, -2, -5,-16,-28, -9,  6;
/M: SY='P';  M= -6, -2,-27, -2,  6,-23,-18, -9,-14, -1,-16, -9, -2,  8,  4, -3, -2, -3,-16,-28,-16,  3;
/M: SY='I';  M= -7,-25,-18,-30,-24, -1,-31,-23, 28,-19, 16, 18,-21,-24,-19,-18,-17, -7, 25,-24, -5,-23;
/M: SY='L';  M=  1,-22, -9,-27,-21, -3,-25,-23, 14,-23, 17,  9,-22,-24,-19,-21,-15, -6, 14,-20, -7,-21;
/M: SY='D';  M= -8, 13,-25, 14, 10,-25,-11,  1,-24,  6,-21,-13, 10,-13,  8,  4,  0, -6,-22,-29,-14,  8;
/M: SY='I';  M= -6,-16,-25,-19,-10, -5,-25,-16,  4, -6,  4,  4,-13,-19, -8, -4,-13, -8,  2,-17, -4,-10;
/M: SY='L';  M=-10,-27,-22,-31,-24,  7,-31,-22, 26,-27, 30, 17,-23,-26,-20,-22,-23, -8, 17,-17,  0,-23;
/M: SY='D';  M=-16, 30,-28, 42, 11,-29, -7,  3,-31, -5,-22,-19, 11,-13, -2,-10, -2, -9,-24,-34,-15,  4;
/M: SY='P';  M= -7,-15,-31,-12, -5,-23,-13,-18,-15, -7,-20,-13,-12, 40,-10,-11, -7, -6,-18,-27,-22,-11;
/M: SY='D';  M=-10, 16,-22, 19, 11,-25,-12, -3,-25,  2,-21,-17, 11, -9,  2, -2,  1, -5,-22,-31,-15,  6;
/M: SY='R';  M= -5, -4,-26, -6, -3,-21,  6, -6,-27,  6,-21,-13,  3,-16, -1, 13, -1, -7,-20,-23,-15, -3;
/M: SY='M';  M= -9,-10,-20,-13, -6,-12,-16, -6, -7, -1, -5,  2, -7,-19, -3,  0, -9, -7, -6,-21, -3, -6;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-18,-25,-19,  3,-26,-19, 11,-20, 13,  6,-18,-15,-17,-18,-15, -5,  6,-18,  0,-20; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='F';  M=-10,-14,-17,-18,-15, 11,-17,-14, -3,-11, -1,  0,-10,-21,-16, -8, -8, -4,  0,-16,  0,-15; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='Y';  M= -6, -4,-16, -5, -5, -7, -8,  1,-15, -4,-13, -8, -1,-17, -2, -3,  0, -4,-13,-14,  5, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-4;
/M: SY='R';  M= -5, -6,-18, -6,  0,-11,-14, -2,-11,  6, -8, -4, -4,-12,  4, 10, -4, -5, -8,-16, -4,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='L';  M=-11,-20,-20,-22,-15, 14,-21,-13,  5,-16, 15,  6,-18,-21,-15,-11,-18, -8,  0,  2, 10,-15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-4;
/M: SY='Y';  M=-10,-12,-24,-13,-14, 15,-21,  1, -5,-13, -2, -4,-10,-24,-13,-11,-10, -6, -6, -1, 28,-15;
/M: SY='R';  M=-16, -8,-29, -7,  0,-20,-18, -2,-26, 25,-19, -8, -1,-19,  8, 49, -9, -9,-17,-20, -8,  0;
/M: SY='D';  M= -9,  8,-24, 12,  4,-21,-15, -9,-14, -6,-14,-11,  0,-13,  1, -8, -1, -1,-10,-29,-13,  2;
/M: SY='H';  M= -6, -4,-20, -5, -3,-15,-17,  4,-11, -5, -9, -3, -1,-17,  0, -2, -2, -5,-10,-26, -5, -3;
/M: SY='C';  M= -5, -9, 38,-15,-10,-14,-22,-18,-18,-17,-14,-13, -9,-24,-14,-18,  1,  2, -8,-36,-17,-13;
/M: SY='R';  M= -6, -7,-23,-10, -8,-13,-16,-10, -9,  1,-12, -6, -3,-18, -6,  3, -3, -1, -5,-19, -5, -9;
/M:         M=-12, -4,-15, -3, -4, -4,-20,-10,-13, -4, -6, -5, -7,-20, -9, -6, -9, -7, -9,-21, -2, -6;
/M: SY='T';  M= -8,  0,-22,  1,  1,-15,-19, -6,-10, -3, -9, -6, -2,-13, -3, -4, -2,  2, -7,-26, -6, -2;
/M: SY='B';  M=-10, 14,-23, 14,  4,-23, -7, -3,-26,  6,-23,-16, 13,-12,  0,  1, -2, -7,-23,-29,-15,  2;
/M: SY='G';  M= -5, -4,-26, -3, -4,-24, 11, -7,-25, -7,-22,-14,  0, -5, -4, -7,  0, -6,-20,-25,-17, -5;
/M: SY='N';  M= -7,  3,-23,  2, -3,-18,-10,  3,-17, -1,-15, -9,  5,-17, -3, -2,  0, -4,-13,-28, -9, -3;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='Y';  M=-10,-11,-20,-15,-13,  5,-20,  4, -5,-12, -5, -3, -7,-23,-11,-11, -8, -4, -6, -9, 16,-14;
/M: SY='V';  M= -5,-20,-19,-23,-17,  3,-23,-17, 11,-17,  8,  5,-17,-23,-17,-16, -9, -1, 14,-20,  1,-18;
/M: SY='K';  M=-11,  1,-30,  0, 11,-29,-20, -8,-30, 46,-29,-11,  1,-11, 10, 31, -9,-10,-21,-21,-11, 10;
/M: SY='D';  M=-11, 24,-25, 29, 10,-28, -7,  3,-29,  0,-27,-21, 18, -8,  0, -4,  5, -4,-25,-34,-16,  4;
/M: SY='L';  M=-10,-30,-20,-30,-21, 10,-30,-20, 21,-29, 45, 21,-29,-29,-20,-20,-28,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='S';  M= -3,  4,-15,  2,  1,-18,-10, -5,-20, -2,-18,-13,  7,-15,  0, -1,  9,  4,-15,-31,-14,  0;
/M: SY='R';  M= -6,-10,-23,-12, -6,-17,-18,-12,-11,  9,-12, -4, -6,-16, -1, 14, -5, -3, -5,-20,-10, -5;
/M: SY='L';  M= -4,-28,-15,-30,-23,  4,-29,-24, 22,-25, 26, 12,-26,-24,-23,-21,-19, -6, 21,-23, -5,-24;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='W';  M=-10,-18,-25,-22,-19,  9, -3,-16,-14,-16, -8, -8,-12,-24,-19,-15,-15,-14,-15, 18,  4,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='R';  M= -6, -3,-27, -2,  4,-24, -5, -8,-24,  7,-21,-14,  0,  4,  0, 10, -4, -9,-21,-24,-18,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D';  M= -8, 17,-24, 23,  7,-26, -7, -1,-24, -4,-23,-18, 11, -2,  1, -9,  6, -3,-22,-32,-16,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='L';  M= -9,-10,-26, -8,  2,-14,-22, -8, -4,-12,  4,  1,-11, -2, -2,-11,-12, -8, -9,-26,-11, -2;
/M: SY='S';  M=  0,  4,-14,  4,  3,-24, -6, -8,-24,  1,-26,-17,  6,-13,  2, -2, 15,  5,-16,-31,-16,  2;
/M: SY='N';  M= -9,  9,-23,  2, -2,-18,-10, -1,-17,  8,-18, -5, 16,-17,  1, 10,  0, -4,-16,-28,-12, -1;
/M: SY='V';  M=  2,-17,-12,-21,-20, -6,-24,-24, 13,-16,  0,  2,-15,-20,-19,-17,  4, 17, 24,-29,-10,-20;
/M: SY='I';  M= -4,-28,-16,-32,-26,  1,-30,-25, 29,-24, 20, 15,-25,-26,-22,-22,-16, -5, 28,-25, -5,-25;
/M: SY='I';  M= -7,-28,-20,-34,-26,  4,-33,-22, 30,-26, 22, 16,-22,-24,-20,-24,-19, -8, 22,-20,  1,-25;
/M: SY='I';  M= -5,-29,-20,-34,-28,  4,-33,-28, 34,-26, 19, 14,-25,-25,-24,-24,-17, -6, 33,-23, -3,-28;
/M: SY='D';  M=-18, 44,-24, 62, 18,-38,-10, -1,-38, -1,-29,-29, 18,-11,  0,-10,  2, -8,-28,-40,-20,  9;
/M: SY='D';  M=-15, 38,-26, 44,  9,-29, -6,  2,-32, -3,-27,-24, 25,-14, -2, -8,  2, -6,-27,-33,-17,  4;
/M: SY='S';  M= -5,  4,-12,  2, -1,-20,-11, -7,-21, -1,-22,-16, 10,-15, -1,  7, 14,  8,-14,-34,-17, -2;
/M: SY='P';  M=  2, -8,-27, -4,  3,-26,-11,-14,-19, -5,-24,-16, -7, 31, -5,-12,  2, -4,-19,-29,-23, -3;
/M: SY='D';  M= -8,  5,-23,  6, -1,-13,-15, -2,-16, -1,-14,-11,  3,-17, -2, -3, -2, -3,-13,-21,  0, -3;
/M: SY='S';  M=  2, -9,-11,-10, -5,-17,-17,-16, -7,  0,-15, -8, -6,-14, -8, -6,  4,  1,  3,-30,-15, -7;
/M: SY='W';  M= -4,-21,-23,-24,-20,  8,-14,-14,-13,-14,-11,-11,-20,-24,-17,-16,-15,-12,-13, 38, 20,-17;
/M: SY='R';  M= -5,-11,-25,-13, -4,-14,-19, -8, -9,  1, -4,  1, -9, -9, -2,  4, -9, -7, -9,-23, -9, -5;
/M: SY='M';  M=-10,-11,-19,-13,-10, -2,-16,-11, -9, -8,  0,  1,-10,-21, -8, -6,-11, -7, -9,-13, -1, -9;
/M: SY='H';  M= -9, 10,-17,  4,  3,-25,-11, 18,-22, -2,-22,-10, 17,-17, 14, -1,  2, -6,-25,-30, -9,  8;
/M: SY='P';  M= -7,-12,-33, -8,  1,-24,-16,-16,-18, -2,-23,-15,-12, 42, -6, -9, -7, -9,-22,-27,-22, -6;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D';  M=-10,  8,-22, 13, 13,-24,-12,  0,-23,  2,-20,-14,  3,  2,  5, -2, -2, -8,-22,-25,-12,  8; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N';  M= -7, 24,-20, 10, -3,-19,  0,  5,-20, -3,-25,-17, 39,-16, -3, -2,  9,  3,-24,-36,-18, -3;
/M: SY='A';  M=  5,-15,-10,-20,-17, -7,  1,-15,-11,-18, -3, -5,-11,-21,-16,-16, -4, -4, -7,-21,-10,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-29,-25,-35,-28,  4,-30,-26, 34,-27, 20, 15,-22,-24,-22,-25,-19, -9, 25,-19,  0,-28;
/M: SY='P';  M= -8,-14,-28,-14, -4, -9,-19, -7,-13, -4,-10, -6,-12,  6, -4, -6,-10, -7,-15,-16, -7, -5;
/M: SY='I';  M= -4,-27,-20,-31,-24, -2,-31,-26, 26,-23, 11, 10,-23,-12,-21,-23,-14, -6, 24,-24, -7,-25;
/M: SY='E';  M= -5, -4,-26, -1,  7,-22,-17, -4,-20,  5,-21,-12, -4,  6,  2,  0,  0, -4,-16,-27,-13,  3;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='P';  M= -4, -3,-18,  0,  0,-16, -5, -6,-14, -2,-15, -9, -4, 18, -3, -4, -1, -3,-14,-18,-13, -3; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S';  M= -3, -5,-22, -7, -3, -6,-11, -6,-16, -4,-17,-12, -1, -9, -6, -4,  3, -2,-13,-18, -1, -5;
/M: SY='W';  M=-16,-19,-30,-22,-19, 21,-23,  0, -9,-16, -8, -7,-15,-26,-14,-13,-17,-12,-14, 35, 33,-16;
/M: SY='Y';  M=-10,-16,-22,-19,-14, 17,-24, -1, -2,-13,  0,  0,-13,-23,-14,-12,-10, -6, -2, -7, 20,-14;
/M: SY='G';  M= -3, -2,-24, -2, -6,-18,  7,-13,-21, -8,-18,-13,  0, -9, -9,-10,  1, -5,-16,-25,-17, -8;
/M: SY='D';  M= -9, 19,-25, 22,  7,-25, -6, -4,-23, -3,-22,-18, 16,-12, -1, -7,  4, -3,-21,-32,-16,  2;
/M:         M= -5,-10,-20,-10, -4,-17,-13,-13,-13, -3,-14, -8, -8,  0, -7, -5, -3, -4,-11,-25,-12, -7;
/M: SY='N';  M= -6,  9,-23,  8,  3,-23, -5, -6,-22,  2,-21,-14, 10,-14, -1, -1,  5,  1,-17,-30,-16,  1;
/M: SY='D';  M=-18, 33,-26, 48, 16,-32,-13,  4,-35,  0,-27,-24, 13, -9,  0, -5, -1,-10,-27,-35,-14,  7;
/M: SY='B';  M= -8,  3,-19,  1, -3,-17,-14, -8,-14, -3,-14,-10,  3,-16, -3, -3,  0,  2,-11,-27,-10, -4;
/M: SY='E';  M=  1,  0,-21, -1,  6,-17,-11, -8,-15, -6,-14,-11,  3, -9,  1, -7,  4, -1,-13,-28,-15,  3;
/M: SY='L';  M= -5,-19,-20,-19,-12,  1,-23,-15,  8,-22, 24,  9,-18,-20,-15,-17,-17, -7,  3,-23, -5,-14;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='L';  M= -6,-16,-21,-17,-14, -2,-13,-11,  2,-14,  7,  3,-13,-14,-13,-13,-13, -8, -1,-17, -1,-15; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D';  M=-11,  6,-19,  8,  3,-19,-13,  3,-21, -1,-17,-11,  5,-15, -1, -1, -4, -6,-17,-28, -9,  0;
/M: SY='L';  M= -5,-24,-20,-27,-18,  3,-27,-19, 13,-20, 26, 11,-22,-25,-15,-12,-19, -6,  9,-20, -3,-17;
/M: SY='L';  M= -4,-19,-20,-22,-13, -8,-23,-17,  5, -7,  6,  5,-15,-19, -9, -3,-12, -6,  5,-22, -7,-13;
/M: SY='P';  M= -8, -4,-30,  2,  9,-25,-17,-10,-22,  3,-24,-17, -5, 25,  0, -1, -2, -6,-22,-28,-18,  2;
/M: SY='Y';  M=-13,-19,-24,-22,-15, 20,-26, -4,  0,-16,  3,  1,-15,-18,-14,-13,-12, -6, -4, -5, 21,-15;
/M: SY='L';  M= -6,-26,-19,-29,-19, 10,-27,-19, 16,-26, 35, 16,-25,-26,-18,-19,-22, -6,  9,-19,  0,-19;
/M: SY='E';  M= -9,  0,-23,  2, 19,-24,-20,  0,-19,  7,-15, -8, -2, -8, 10,  3, -4, -7,-19,-27,-12, 14;
/M: SY='S';  M=  0, -2,-21, -4,  1,-20, -5, -5,-17, -1,-19,-11,  2,-14, -1, -2,  6,  0,-13,-26,-12, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-21,-21,-22,-12, -2,-28,-17, 12,-16, 22, 11,-20,-23,-10,-12,-20, -9,  6,-21, -4,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	92 in 91 different sequences
Number of true positive hits	92 in 91 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	1
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	98.92 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info]	2
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	FCP1 homology
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

91 sequences

037R_FRG3G  (Q6GZT9), CNEP1_BOVIN (Q1RMV9), CNEP1_CAEBR (Q61C05),

CNEP1_CAEEL (Q20432), CNEP1_DROME (Q9VRG7), CNEP1_DROPS (Q29I63), 
CNEP1_HUMAN (O95476), CNEP1_MOUSE (Q3TP92), CNEP1_RAT   (Q3B7T6), 
CNEP1_XENLA (Q8JIL9), CNEP1_XENTR (Q28HW9), CNEPA_DANRE (Q5U395), 
CNEPB_DANRE (Q5U3T3), CPL1_ARATH  (Q5YDB6), CPL2_ARATH  (Q5YDB5), 
CPL3_ARATH  (Q8LL04), CPL4_ARATH  (Q00IB6), CPL5_ARATH  (F4JCB2), 
CTDP1_HUMAN (Q9Y5B0), CTDP1_MOUSE (Q7TSG2), CTDS1_HUMAN (Q9GZU7), 
CTDS1_MOUSE (P58466), CTDS2_HUMAN (O14595), CTDS2_MOUSE (Q8BX07), 
CTDSL_CHICK (Q9PTJ6), CTDSL_HUMAN (O15194), CTDSL_MOUSE (P58465), 
CTDS_DICDI  (Q9XYL0), CTL2A_DANRE (Q08BB5), CTL2A_XENLA (Q801R4), 
CTL2B_DANRE (A4QNX6), CTL2B_XENLA (Q3KQB6), CTSL2_CHICK (Q5F3Z7), 
CTSL2_DICDI (Q54GB2), CTSL2_HUMAN (Q05D32), CTSL2_MOUSE (Q8BG15), 
CTSL2_RAT   (Q5XIK8), CTSL2_XENTR (Q66KM5), FCP1_CAEEL  (Q95QG8), 
FCP1_ENCCU  (Q8SV03), FCP1_SCHPO  (Q9P376), FCP1_YEAST  (Q03254), 
HZG_DROME   (M9PFN0), NEM1_SCHPO  (O59718), NEM1_YEAST  (P38757), 
PSR1_YEAST  (Q07800), PSR2_YEAST  (Q07949), SCPL1_CAEEL (Q8T3G2), 
SCPL3_CAEEL (Q9N4V4), TI50A_DROME (Q9V9P3), TI50B_DROME (Q9W0S3), 
TI50C_DROME (Q9W4V8), TIM50_ARATH (Q8VYE2), TIM50_ASPFU (Q4WI16), 
TIM50_BOVIN (Q3SZB3), TIM50_CAEBR (Q61JS7), TIM50_CAEEL (Q22647), 
TIM50_CANAL (Q59W44), TIM50_CANGA (Q6FRX4), TIM50_CRYNB (P0CN67), 
TIM50_CRYNJ (P0CN66), TIM50_DANRE (Q6NWD4), TIM50_DEBHA (Q6BVY9), 
TIM50_EMENI (Q5B4P0), TIM50_EREGS (Q75A73), TIM50_GIBZE (Q4I099), 
TIM50_HUMAN (Q3ZCQ8), TIM50_KLULA (Q6CM45), TIM50_MOUSE (Q9D880), 
TIM50_NEUCR (Q874C1), TIM50_PHYIN (Q5S7T7), TIM50_PONAB (Q5RAJ8), 
TIM50_SCHPO (O13636), TIM50_USTMA (Q4PEW9), TIM50_YARLI (Q6CDV7), 
TIM50_YEAST (Q02776), UBCP1_BOVIN (Q2KJD7), UBCP1_CHICK (Q5ZJJ8), 
UBCP1_DANRE (Q6DI37), UBCP1_DROME (Q9XZ16), UBCP1_HUMAN (Q8WVY7), 
UBCP1_MOUSE (Q8BGR9), UBCP1_PONAB (Q5R4C4), UBCP1_RAT   (Q5FWT7), 
UBCP1_XENLA (Q641F1), UBCP1_XENTR (Q28EX9), UBCP_ARATH  (Q8W3M6), 
VF355_IIV3  (Q196V6), VF355_IIV6  (Q91FG9), YA22_SCHPO  (Q09695), 
YHM3_SCHPO  (O94336)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences

1 sequence

TIM50_DICDI (Q55C70)

PDB
[Detailed view]

21 PDB

1T9Z; 1TA0; 2GHQ; 2GHT; 2HHL; 2Q5E; 3EF0; 3EF1; 3L0B; 3L0C; 3L0Y; 3PGL; 3SHQ; 4QQF; 4XPZ; 4XQ0; 4YGY; 4YH1; 6DU3; 8UJL; 8UJM
» more