Entry: PS50986

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MANSC
Accession [info] PS50986
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50986
Associated ProRule [info] PRU00341

Name and characterization of the entry

Description [info] MANSC domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0287468; R2=0.0064691; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4280.04615; R2=18.78462; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=846; N_SCORE=8.5; H_SCORE=17260; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=537; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14367; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 12,-17,-15,-19,-18,-12,  1,-22, -1,-17, -4, -4,-14,-20,-18,-19,  2, -2,  9,-26,-17,-18;
/M: SY='L'; M= -8,-20,-19,-22,-16,  4,-24, -2,  6,-17, 14, 10,-17,-25,-14,-12,-14, -7,  7,-22,  1,-16;
/M: SY='E'; M= -7, -9,-31, -4, 17,-21,-20,-12,-17, -1,-15,-10,-13, 15,  1, -8, -9,-10,-19,-15,-15,  8;
/M: SY='B'; M= -6, 21,-21, 21,  2,-19, -5, -5,-22, -7,-20,-18, 18,-15, -6,-10,  7,  1,-19,-33,-16, -2;
/M: SY='F'; M=  1,-16,-16,-23,-17, 11,-20,-18,  0,-14, -2,  0,-12,-19,-17, -9, -1,  7,  6,-18, -2,-17;
/M: SY='V'; M=  2,-21, -5,-27,-24, -7,-22,-27, 15,-21,  2,  3,-18,-22,-21,-22, -5,  4, 21,-28,-11,-24;
/M: SY='I'; M= -9,-17,-29,-19,-16,-12,-14,-20, 11,-21,  6,  4,-14,-10,-10,-21,-14,-12,  1,-22,-10,-15;
/M: SY='R'; M=-11, 10,-20, 13,  7,-28,-10, -3,-30,  9,-23,-17,  7,-16,  7, 19, -3, -9,-23,-29,-17,  5;
/M: SY='T'; M= -1,  2,-19, -1, -9,-18, -6,-18,-12,-13,-13,-11,  1,-13,-11,-15,  9, 18, -6,-29,-14,-10;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-27, 10, 24,-31,-10, -2,-28, 12,-24,-14,  5, -9, 19,  7,  3, -7,-26,-27,-17, 21;
/M: SY='E'; M=  1,  6,-21,  8, 15,-26,-13, -6,-21,  0,-18,-14,  2, -9, 10, -5,  9,  3,-17,-30,-16, 12;
/M: SY='S'; M=  1, -1,-17, -1,  5,-25, -8, -4,-20, -1,-25,-13,  6,-11, 18,  2, 24, 11,-16,-32,-16, 11;
/M: SY='V'; M= -5,-23,  6,-27,-20,  1,-27,-19,  3,-19,  7,  2,-20,-27,-17,-14,-14, -7,  8,-22, -3,-19;
/M: SY='S'; M= 13, -4,-16, -6, -4,-23,  9,-13,-22, -7,-24,-15,  2,-12, -1,-10, 20,  6,-13,-29,-20, -3;
/M: SY='E'; M=  0, -5,-21, -8,  2,-17,-19,-11, -3,  0, -7, -1, -4,-15,  0, -5, -5, -6, -1,-26,-12,  1;
/M: SY='G'; M= -2,-12,-29,-13,-21,-20, 61,-20,-36,-21,-26,-18, -2,-21,-22,-20, -2,-19,-27,-17,-25,-21;
/M: SY='A'; M= 12,-13,-22,-18, -6,-16,-11,-17, -3, -6, -4, -3,-10,-15, -7, -7, -5, -7, -2,-21,-13, -8;
/M: SY='R'; M= -7, -3,-20, -5,  2,-18,-17, -9,-21, 10,-18,-12,  1,-13,  2, 21,  8, 16,-12,-27,-12,  1;
/M: SY='F'; M=-13,-21,-24,-25,-22, 32, -8, -8, -8,-21, -1, -4,-14,-26,-23,-16,-12, -9, -9,  3, 25,-22;
/M: SY='L'; M= -8, -8,-21,-12,-11, -5,-11, -9, -3,-12,  8,  0, -2,-23,-11,-10, -9, -6, -8,-22, -4,-11;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-30,  9, 12,-30, 10, -7,-32,  0,-26,-19,  4, -3,  3,  1, -2,-13,-29,-27,-22,  6;
/M: SY='P'; M= 13, -5,-23, -4,  2,-26, -3,-15,-20, -8,-23,-17, -6, 18, -5,-16,  8, -2,-17,-29,-23, -3;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='A'; M=  6,-12,-24,-12,  0,-19,-12,-18, -5,-11,-12, -8,-10,  6, -7,-17,  0, -5, -5,-27,-18, -6;
/M: SY='H'; M= -5,  0,-25,  1,  6,-19, -3,  8,-23, -5,-19,-11,  0,-14,  5, -7,  2, -3,-21,-20, -2,  4;
/M: SY='T'; M=  2,-13,-13,-16,-10, -7,-21,-20,  3,-14,  3, -1,-13,-18,-14,-14,  3, 15, 12,-28,-11,-12;
/M: SY='R'; M= -1, -5,-22, -7, -5, -9,-13,-10,-17, -2,-14,-12, -1, -8, -6,  6,  2, -2,-13,-24,-11, -7;
/M: SY='T'; M= -4, -7,-22, -8, -6,-16, -5,-11,-20, -3,-21,-14, -2, -2, -6,  0,  9, 10,-14,-23, -9, -8;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-28,-23,-14, -4,-16,-16, -2,-15,  3,  1,-19,-17, -6,-10,-17,-12, -6,  1, -3,-10;
/M: SY='E'; M=-13, -6,-33, -2, 20,-20,-16, -1,-25,  2,-19,-14, -9,-13,  9,  3,-10,-15,-25,  7, -6, 14;
/M: SY='D'; M= -9, 26,-26, 34, 21,-34,-11,  0,-30,  2,-25,-20, 14, -9, 13, -5,  5, -6,-26,-34,-18, 17;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-20,-26,-19, -2,-28,-24, 16,-17,  9,  5,-23,-24,-19,-13,-13, -2, 20,-12, -4,-19;
/M: SY='R'; M=  6, -3,-21,-10, -4,-20, -6, -6,-18,  5,-16, -7,  3,-15,  3, 14,  1, -3,-13,-23,-15, -2;
/M: SY='A'; M= 29, -5,-13,-10, -7,-18, -4,-16,-11,-12, -8,-10, -6,-12, -8,-17, 10,  2, -3,-26,-18, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-20,  8, 13,-22,-13, -5,-20, -2,-17,-14,  6,-11,  7, -1, 11,  6,-17,-32,-16, 10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M= -9, 16,-23, 23,  9,-24, -8, -9,-24, -7,-16,-18,  5,-12, -4,-11,  5,  5,-17,-33,-17,  3;
/M: SY='E'; M=  0, -2,-24,  0,  7,-26,-13,-10,-21,  3,-22,-14, -2,  7,  6, -3,  7, -1,-18,-29,-18,  5;
/M: SY='A'; M= 22,  4,-13, -6, -5,-19, -2,-10,-15, -5,-19,-14, 11,-13, -5, -8, 15,  6,-10,-29,-19, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N'; M=-12, 28,-23, 24,  4,-24, -7, 27,-27, -4,-28,-17, 33,-17,  2, -3,  7, -5,-28,-38,-11,  2;
/M: SY='V'; M= -1,-26,-14,-28,-23,  5,-27,-24, 19,-23, 23, 11,-26,-27,-23,-19,-15,  0, 24,-24, -5,-23;
/M: SY='A'; M= 17,-18,-15,-26,-17,  4,-14,-15,  3,-15,  4,  8,-17,-19,-15,-18, -6, -4,  6,-14, -1,-16;
/M: SY='W'; M=-12,-32,-28,-36,-27, 12,-30,-27, 17,-26, 15,  7,-29,-28,-24,-22,-26,-13, 11, 23,  8,-25;
/M: SY='W'; M=-12,-31,-24,-35,-29, 26,-26,-23,  7,-21,  4,  7,-28,-29,-26,-19,-22,-12, 10, 28, 13,-25;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E'; M= -8, 12,-17, 19, 25,-20,-10,  1,-19,  4,-13,-12,  3, -2, 11, -1,  0, -6,-17,-19,-11, 18; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F'; M=-12,-20,-20,-23,-14, 20,-26,-11,  0,-19, 16,  4,-16,-24,-18,-10,-14,  0, -1,-15,  6,-15;
/M: SY='R'; M=-12,  1,-30,  3, 19,-28,-18, -2,-27, 19,-24,-13,  3,  1, 15, 21, -5, -9,-26,-25,-16, 15;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-27, -7, -1,-26,  6, -4,-28,  4,-24,-14, -2, -3, -3,  3, -1,-10,-22,-24,-17, -3;
/M: SY='T'; M= -8,  1,-23,  1, -4,-20, -7,-11,-17, -1,-15, -4, -1, -8, -4, -1,  1,  4,-12,-27,-14, -5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -1, -6,-16, -5, -4,-13,  2, -9,-11, -8,-12, -9, -3, 15, -6,-10,  0, -4,-12,-17,-14, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='N'; M=  1,  3,-11, -2, -5, -8, -1, -3,-10, -2,-10, -8,  8,-10, -3, -1,  3,  3, -9,-13, -4, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-27,-27,-24, 42,-31,  4,  4,-17,  5,  2,-20,-29,-20,-15,-20,-10, -4, 20, 59,-24;
/M: SY='L'; M=-12,-20,-24,-21,-11, -3,-27,  4,  7,-21, 26, 14,-18,-25, -3,-13,-22,-12, -2,-22,  2, -8;
/M: SY='F'; M= -3,-26,-18,-34,-26, 30,-27,-22, 15,-24, 10,  8,-20,-25,-27,-21,-14, -7, 16,-10,  8,-26;
/M: SY='N'; M=-13, 14,-24, 10,  4, -9,-14, -2,-22,  5,-21,-15, 17,-17,  0,  5, -1, -6,-22,-25, -9,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-25,-15, -9,-16,-10,-16, -6,-15, -6, -3,-11,  6, -6,-15, -2,  0, -9,-26,-15, -9;
/M: SY='S'; M= -2, -4,-23, -6, -4,-13,-12,  2,-18,  1,-21,-12,  3, -4, -2,  3,  4, -1,-16,-20,  0, -5;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-30,  5, 18,-27,-16, -5,-25,  9,-26,-18,  5, 17,  5,  6, -1, -7,-27,-30,-20, 10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 17, 32,-35, -8,  1,-29,  5,-23,-15,  3, -7, 25, -1,  0,-11,-30,-27,-18, 28;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A'; M= 10,-11,-14,-16,-13,-12,-14,-16, -1, -9, -5, -4, -6,-20,-12, -6,  3,  1,  8,-28,-14,-13;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K'; M=-11, -8,-30, -6,  7,-22,-22, -4,-19, 14,-13, -6, -8,  4,  6, 10,-12,-11,-19,-23,-11,  5;
/M: SY='F'; M= -9,-25,-26,-27,-17, 23,-24,-20, -4,-22,  2, -4,-21, 12,-24,-20,-16, -9, -8,-11,  0,-20;
/M: SY='A'; M=  9,-10,-19,-16, -8, -6,-16,-16,-13,  7,-12, -7, -8,-15, -8,  1, -2,  1, -4,-17, -7, -8;
/M: SY='P'; M=-13,-14,-31,-11, -2,-20,-21,-12,-18,  8,-14, -9,-11, 18, -2, 17,-11, -7,-18,-24,-15, -5;
/M: SY='R'; M= -1, -6,-21,-10, -4,-17,-17,  7,-17,  7,-12, -3, -3,-15,  0,  8, -2,  2,-11,-24, -5, -3;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-25,  3, 10,-25, -8, -1,-24,  9,-22,-13,  0,-12,  3,  4,  1, -7,-16,-27,-14,  6;
/M: SY='G'; M= -2, -3,-25, -5,-10,-25, 27,-13,-29,-10,-27,-18,  7, -7,-10, -8,  7, -4,-24,-27,-24,-11;
/M: SY='Y'; M= -9,-20,-21,-23,-18, 18,-23, -7,  5,-19,  7,  6,-15,-23,-15,-15, -8, -3,  1, -8, 19,-17;
/M: SY='T'; M= -7, -4,-21,-10, -8,-14,-17,-10, -6, -3,-13, -4,  3, -8, -5,  3,  4,  7, -5,-29,-13, -8;
/M: SY='S'; M=  7,  9,-13,  2, -2,-19, -2, -7,-18, -7,-26,-18, 20,-13, -2, -8, 27, 17,-13,-37,-19, -2;
/M: SY='Y'; M= -8,-17,-25,-19,-12, 13,-24,  7,  1,-10,  4,  8,-18,-24, -7,-11,-16, -9, -6,  7, 41,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 15 in 15 different sequences
Number of true positive hits 15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MANSC
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
15 sequences

K0319_HUMAN (Q5VV43), K0319_MOUSE (Q5SZV5), K0319_RAT   (P0CI71), 
K319L_HUMAN (Q8IZA0), K319L_MOUSE (Q8K135), K319L_PONAB (Q5RFR6), 
LRP11_HUMAN (Q86VZ4), LRP11_MOUSE (Q8CB67), MANS1_HUMAN (Q9H8J5), 
MANS1_MACFA (Q95KG7), MANS1_MOUSE (Q9CR33), MANS4_HUMAN (A6NHS7), 
MANS4_MOUSE (Q3UU94), SPIT1_HUMAN (O43278), SPIT1_MOUSE (Q9R097)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission