PROSITE entry PS50986

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	MANSC
Accession [info]	PS50986
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2004 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50986
Associated ProRule [info]	PRU00341

Name and characterization of the entry

Description [info]

MANSC domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0287468; R2=0.0064691; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6125.4892578; R2=2.2362728; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=846; H_SCORE=8017; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=537; H_SCORE=7326; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A';  M= 12,-17,-15,-19,-18,-12,  1,-22, -1,-17, -4, -4,-14,-20,-18,-19,  2, -2,  9,-26,-17,-18;
/M: SY='L';  M= -8,-20,-19,-22,-16,  4,-24, -2,  6,-17, 14, 10,-17,-25,-14,-12,-14, -7,  7,-22,  1,-16;
/M: SY='E';  M= -7, -9,-31, -4, 17,-21,-20,-12,-17, -1,-15,-10,-13, 15,  1, -8, -9,-10,-19,-15,-15,  8;
/M: SY='B';  M= -6, 21,-21, 21,  2,-19, -5, -5,-22, -7,-20,-18, 18,-15, -6,-10,  7,  1,-19,-33,-16, -2;
/M: SY='F';  M=  1,-16,-16,-23,-17, 11,-20,-18,  0,-14, -2,  0,-12,-19,-17, -9, -1,  7,  6,-18, -2,-17;
/M: SY='V';  M=  2,-21, -5,-27,-24, -7,-22,-27, 15,-21,  2,  3,-18,-22,-21,-22, -5,  4, 21,-28,-11,-24;
/M: SY='I';  M= -9,-17,-29,-19,-16,-12,-14,-20, 11,-21,  6,  4,-14,-10,-10,-21,-14,-12,  1,-22,-10,-15;
/M: SY='R';  M=-11, 10,-20, 13,  7,-28,-10, -3,-30,  9,-23,-17,  7,-16,  7, 19, -3, -9,-23,-29,-17,  5;
/M: SY='T';  M= -1,  2,-19, -1, -9,-18, -6,-18,-12,-13,-13,-11,  1,-13,-11,-15,  9, 18, -6,-29,-14,-10;
/M: SY='E';  M= -8,  7,-27, 10, 24,-31,-10, -2,-28, 12,-24,-14,  5, -9, 19,  7,  3, -7,-26,-27,-17, 21;
/M: SY='E';  M=  1,  6,-21,  8, 15,-26,-13, -6,-21,  0,-18,-14,  2, -9, 10, -5,  9,  3,-17,-30,-16, 12;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-17, -1,  5,-25, -8, -4,-20, -1,-25,-13,  6,-11, 18,  2, 24, 11,-16,-32,-16, 11;
/M: SY='V';  M= -5,-23,  6,-27,-20,  1,-27,-19,  3,-19,  7,  2,-20,-27,-17,-14,-14, -7,  8,-22, -3,-19;
/M: SY='S';  M= 13, -4,-16, -6, -4,-23,  9,-13,-22, -7,-24,-15,  2,-12, -1,-10, 20,  6,-13,-29,-20, -3;
/M: SY='E';  M=  0, -5,-21, -8,  2,-17,-19,-11, -3,  0, -7, -1, -4,-15,  0, -5, -5, -6, -1,-26,-12,  1;
/M: SY='G';  M= -2,-12,-29,-13,-21,-20, 61,-20,-36,-21,-26,-18, -2,-21,-22,-20, -2,-19,-27,-17,-25,-21;
/M: SY='A';  M= 12,-13,-22,-18, -6,-16,-11,-17, -3, -6, -4, -3,-10,-15, -7, -7, -5, -7, -2,-21,-13, -8;
/M: SY='R';  M= -7, -3,-20, -5,  2,-18,-17, -9,-21, 10,-18,-12,  1,-13,  2, 21,  8, 16,-12,-27,-12,  1;
/M: SY='F';  M=-13,-21,-24,-25,-22, 32, -8, -8, -8,-21, -1, -4,-14,-26,-23,-16,-12, -9, -9,  3, 25,-22;
/M: SY='L';  M= -8, -8,-21,-12,-11, -5,-11, -9, -3,-12,  8,  0, -2,-23,-11,-10, -9, -6, -8,-22, -4,-11;
/M: SY='E';  M= -9,  4,-30,  9, 12,-30, 10, -7,-32,  0,-26,-19,  4, -3,  3,  1, -2,-13,-29,-27,-22,  6;
/M: SY='P';  M= 13, -5,-23, -4,  2,-26, -3,-15,-20, -8,-23,-17, -6, 18, -5,-16,  8, -2,-17,-29,-23, -3;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='A';  M=  6,-12,-24,-12,  0,-19,-12,-18, -5,-11,-12, -8,-10,  6, -7,-17,  0, -5, -5,-27,-18, -6;
/M: SY='H';  M= -5,  0,-25,  1,  6,-19, -3,  8,-23, -5,-19,-11,  0,-14,  5, -7,  2, -3,-21,-20, -2,  4;
/M: SY='T';  M=  2,-13,-13,-16,-10, -7,-21,-20,  3,-14,  3, -1,-13,-18,-14,-14,  3, 15, 12,-28,-11,-12;
/M: SY='R';  M= -1, -5,-22, -7, -5, -9,-13,-10,-17, -2,-14,-12, -1, -8, -6,  6,  2, -2,-13,-24,-11, -7;
/M: SY='T';  M= -4, -7,-22, -8, -6,-16, -5,-11,-20, -3,-21,-14, -2, -2, -6,  0,  9, 10,-14,-23, -9, -8;
/M: SY='L';  M=-10,-22,-28,-23,-14, -4,-16,-16, -2,-15,  3,  1,-19,-17, -6,-10,-17,-12, -6,  1, -3,-10;
/M: SY='E';  M=-13, -6,-33, -2, 20,-20,-16, -1,-25,  2,-19,-14, -9,-13,  9,  3,-10,-15,-25,  7, -6, 14;
/M: SY='D';  M= -9, 26,-26, 34, 21,-34,-11,  0,-30,  2,-25,-20, 14, -9, 13, -5,  5, -6,-26,-34,-18, 17;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='V';  M= -6,-24,-20,-26,-19, -2,-28,-24, 16,-17,  9,  5,-23,-24,-19,-13,-13, -2, 20,-12, -4,-19;
/M: SY='R';  M=  6, -3,-21,-10, -4,-20, -6, -6,-18,  5,-16, -7,  3,-15,  3, 14,  1, -3,-13,-23,-15, -2;
/M: SY='A';  M= 29, -5,-13,-10, -7,-18, -4,-16,-11,-12, -8,-10, -6,-12, -8,-17, 10,  2, -3,-26,-18, -8;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E';  M= -5,  6,-20,  8, 13,-22,-13, -5,-20, -2,-17,-14,  6,-11,  7, -1, 11,  6,-17,-32,-16, 10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D';  M= -9, 16,-23, 23,  9,-24, -8, -9,-24, -7,-16,-18,  5,-12, -4,-11,  5,  5,-17,-33,-17,  3;
/M: SY='E';  M=  0, -2,-24,  0,  7,-26,-13,-10,-21,  3,-22,-14, -2,  7,  6, -3,  7, -1,-18,-29,-18,  5;
/M: SY='A';  M= 22,  4,-13, -6, -5,-19, -2,-10,-15, -5,-19,-14, 11,-13, -5, -8, 15,  6,-10,-29,-19, -5;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='N';  M=-12, 28,-23, 24,  4,-24, -7, 27,-27, -4,-28,-17, 33,-17,  2, -3,  7, -5,-28,-38,-11,  2;
/M: SY='V';  M= -1,-26,-14,-28,-23,  5,-27,-24, 19,-23, 23, 11,-26,-27,-23,-19,-15,  0, 24,-24, -5,-23;
/M: SY='A';  M= 17,-18,-15,-26,-17,  4,-14,-15,  3,-15,  4,  8,-17,-19,-15,-18, -6, -4,  6,-14, -1,-16;
/M: SY='W';  M=-12,-32,-28,-36,-27, 12,-30,-27, 17,-26, 15,  7,-29,-28,-24,-22,-26,-13, 11, 23,  8,-25;
/M: SY='W';  M=-12,-31,-24,-35,-29, 26,-26,-23,  7,-21,  4,  7,-28,-29,-26,-19,-22,-12, 10, 28, 13,-25;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='E';  M= -8, 12,-17, 19, 25,-20,-10,  1,-19,  4,-13,-12,  3, -2, 11, -1,  0, -6,-17,-19,-11, 18; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='F';  M=-12,-20,-20,-23,-14, 20,-26,-11,  0,-19, 16,  4,-16,-24,-18,-10,-14,  0, -1,-15,  6,-15;
/M: SY='R';  M=-12,  1,-30,  3, 19,-28,-18, -2,-27, 19,-24,-13,  3,  1, 15, 21, -5, -9,-26,-25,-16, 15;
/M: SY='G';  M=  0, -7,-27, -7, -1,-26,  6, -4,-28,  4,-24,-14, -2, -3, -3,  3, -1,-10,-22,-24,-17, -3;
/M: SY='T';  M= -8,  1,-23,  1, -4,-20, -7,-11,-17, -1,-15, -4, -1, -8, -4, -1,  1,  4,-12,-27,-14, -5;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P';  M= -1, -6,-16, -5, -4,-13,  2, -9,-11, -8,-12, -9, -3, 15, -6,-10,  0, -4,-12,-17,-14, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='N';  M=  1,  3,-11, -2, -5, -8, -1, -3,-10, -2,-10, -8,  8,-10, -3, -1,  3,  3, -9,-13, -4, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y';  M=-19,-24,-27,-27,-24, 42,-31,  4,  4,-17,  5,  2,-20,-29,-20,-15,-20,-10, -4, 20, 59,-24;
/M: SY='L';  M=-12,-20,-24,-21,-11, -3,-27,  4,  7,-21, 26, 14,-18,-25, -3,-13,-22,-12, -2,-22,  2, -8;
/M: SY='F';  M= -3,-26,-18,-34,-26, 30,-27,-22, 15,-24, 10,  8,-20,-25,-27,-21,-14, -7, 16,-10,  8,-26;
/M: SY='N';  M=-13, 14,-24, 10,  4, -9,-14, -2,-22,  5,-21,-15, 17,-17,  0,  5, -1, -6,-22,-25, -9,  2;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P';  M= -5,-14,-25,-15, -9,-16,-10,-16, -6,-15, -6, -3,-11,  6, -6,-15, -2,  0, -9,-26,-15, -9;
/M: SY='S';  M= -2, -4,-23, -6, -4,-13,-12,  2,-18,  1,-21,-12,  3, -4, -2,  3,  4, -1,-16,-20,  0, -5;
/M: SY='E';  M=-10,  3,-30,  5, 18,-27,-16, -5,-25,  9,-26,-18,  5, 17,  5,  6, -1, -7,-27,-30,-20, 10;
/M: SY='E';  M=-10, 10,-30, 17, 32,-35, -8,  1,-29,  5,-23,-15,  3, -7, 25, -1,  0,-11,-30,-27,-18, 28;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A';  M= 10,-11,-14,-16,-13,-12,-14,-16, -1, -9, -5, -4, -6,-20,-12, -6,  3,  1,  8,-28,-14,-13;
/M: SY='C';  M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='K';  M=-11, -8,-30, -6,  7,-22,-22, -4,-19, 14,-13, -6, -8,  4,  6, 10,-12,-11,-19,-23,-11,  5;
/M: SY='F';  M= -9,-25,-26,-27,-17, 23,-24,-20, -4,-22,  2, -4,-21, 12,-24,-20,-16, -9, -8,-11,  0,-20;
/M: SY='A';  M=  9,-10,-19,-16, -8, -6,-16,-16,-13,  7,-12, -7, -8,-15, -8,  1, -2,  1, -4,-17, -7, -8;
/M: SY='P';  M=-13,-14,-31,-11, -2,-20,-21,-12,-18,  8,-14, -9,-11, 18, -2, 17,-11, -7,-18,-24,-15, -5;
/M: SY='R';  M= -1, -6,-21,-10, -4,-17,-17,  7,-17,  7,-12, -3, -3,-15,  0,  8, -2,  2,-11,-24, -5, -3;
/M: SY='E';  M= -4,  1,-25,  3, 10,-25, -8, -1,-24,  9,-22,-13,  0,-12,  3,  4,  1, -7,-16,-27,-14,  6;
/M: SY='G';  M= -2, -3,-25, -5,-10,-25, 27,-13,-29,-10,-27,-18,  7, -7,-10, -8,  7, -4,-24,-27,-24,-11;
/M: SY='Y';  M= -9,-20,-21,-23,-18, 18,-23, -7,  5,-19,  7,  6,-15,-23,-15,-15, -8, -3,  1, -8, 19,-17;
/M: SY='T';  M= -7, -4,-21,-10, -8,-14,-17,-10, -6, -3,-13, -4,  3, -8, -5,  3,  4,  7, -5,-29,-13, -8;
/M: SY='S';  M=  7,  9,-13,  2, -2,-19, -2, -7,-18, -7,-26,-18, 20,-13, -2, -8, 27, 17,-13,-37,-19, -2;
/M: SY='Y';  M= -8,-17,-25,-19,-12, 13,-24,  7,  1,-10,  4,  8,-18,-24, -7,-11,-16, -9, -6,  7, 41,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	15 in 15 different sequences
Number of true positive hits	15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	MANSC
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

15 sequences

K0319_HUMAN (Q5VV43), K0319_MOUSE (Q5SZV5), K0319_RAT   (P0CI71),

K319L_HUMAN (Q8IZA0), K319L_MOUSE (Q8K135), K319L_PONAB (Q5RFR6), 
LRP11_HUMAN (Q86VZ4), LRP11_MOUSE (Q8CB67), MANS1_HUMAN (Q9H8J5), 
MANS1_MACFA (Q95KG7), MANS1_MOUSE (Q9CR33), MANS4_HUMAN (A6NHS7), 
MANS4_MOUSE (Q3UU94), SPIT1_HUMAN (O43278), SPIT1_MOUSE (Q9R097)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

2 PDB

2MSX; 5H7V