Entry: PS50993

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NIDOGEN_G2
Accession [info] PS50993
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50993
Associated ProRule [info] PRU00348

Name and characterization of the entry

Description [info] Nidogen G2 beta-barrel domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=226;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=221;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2014532; R2=0.0164333; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7375.53353; R2=53.90611; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=384; N_SCORE=8.5; H_SCORE=31310; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=262; N_SCORE=6.5; H_SCORE=21499; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M=  0, -8,-25, -9,  7,-21, -9,-13, -6, -9,-11, -6, -5,-11,  3,-13,  1, -7, -8,-25,-15,  3;
/M: SY='P'; M= -1,-19,-36,-11, -1,-29,-17,-20,-19,-10,-27,-19,-19, 75,-10,-20, -7, -9,-26,-29,-29,-10;
/M: SY='Q'; M=-11,-12,-26,-13, -2,-19,-25,  5, -4, -2, -3,  4, -9,-19, 16,  6,-10,-10, -6,-23, -4,  5;
/M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10, -3,-21, -7, -3,-31, 23,-21,-11,  0,-20,  6, 57, -9,-11,-21,-20,-13, -3;
/M: SY='V'; M=  4,-21,-15,-24,-21, -1,-23,-18, 16,-17,  1,  3,-19,-23,-19,-18, -3,  0, 23,-20,  2,-21;
/M: SY='N'; M= -2, 11,-19,  1, -2,-19, -8, -2,-21,  5,-23,-15, 23,-17,  1, 15,  9,  5,-18,-31,-16, -2;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M= -1,  0,-20, -1,  5,-25,-12, -8,-22, 14,-27,-13,  4,-10, 11,  7, 15,  8,-15,-29,-14,  8;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-14,-31,-28, 11,-29,-23, 24,-21, 16, 17,-27,-29,-26,-19,-15, -4, 34,-22, -2,-26;
/M: SY='T'; M= -2, -6,-19, -9,  0,-14,-19,-15, -6, -5, -8, -6, -4,-12, -4, -8,  8, 13, -4,-29,-11, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-11, -3,-22, -6, -5, -8,-19, -3, -7,  1,-11, -7,  4,-22, -5,  9, -5, -5, -3,-21,  0, -7;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-23,-31,-24, -1,-31,-25, 31,-26, 18, 13,-19,-22,-18,-24,-12, -4, 22,-24, -4,-24;
/M: SY='N'; M=-12, 16,-23,  1, -8, -5,-12, -1, -9, -5,-17,-11, 32,-21, -7,  1,  0, -4,-17,-29,-10, -8;
/M: SY='V'; M= -6, -9,-22, -6,-13,-19,  1,-18,-11, -4,-14, -8, -9,-21,-14, -2, -6, -9,  2,-26,-17,-14;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-14, -7, -5,-11,  9, -6, -9, -8, -3, -2, -4,-10,  1, -6, -4, -8,-10,-11, -8, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='W'; M= -8, -4,-19, -3,  7,-10,-11,  8,-13, -1,-11, -6, -5, -8,  8, -2, -7, -9,-16, 12,  2,  8; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='F'; M= -3,-11, -9,-14,-11,  9,-13,-11,  6,-12,  1,  1, -7,-12,-12,-10, -1,  0,  8,-10,  0,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -5,  0,-20, -1, -1,-18,  4, -5,-15, -4,-18,-11,  4, 14,  1, -7, -1, -6,-19,-18,-15, -1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -5,-18,-19,-18, -9, -7,-24,-17, 14,-12,  3, 10,-18, -7,-11,-15,-10, -5, 16,-24,-10,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M=  1, -8,-21, -7,  5,-18,-19, -4,-10, -7,-12, -8,-10,  0, -5,-11,  0,  1, -4,-29,-13, -1;
/M: SY='F'; M= -1,-18,-20,-25,-18, 19,-21,-20, -1,-20, -3, -5,-13, -7,-21,-19, -2,  3, -1,-14,  1,-19;
/M: SY='E'; M= -7, -2,-25,  1,  4,-18,  3,-13,-19,-12, -4,-10, -5,-16, -8,-13, -6, -6,-16,-26,-16, -2;
/M: SY='B'; M= -4, 18,-24, 15,  7,-24,-12, -5,-16,  2,-20,-14, 17,-13, -1, -5,  0, -6,-17,-31,-16,  2;
/M: SY='T'; M=  9,-14,-16,-23,-18, -8,-22,-24, 12,-17,  1,  1,-12,-15,-15,-19,  3, 15, 14,-25, -9,-18;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-26, 24, 15,-19,-15, -4,-27,  2,-22,-18,  6,-11,  5, -4,  2, -6,-22,-28,-11, 11;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 44, 19,-30,-30,-21,-20,-27, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='H'; M=-15,  1,-27, -2,  1,-20,-19, 51,-19, -7,-11,  0,  8,-19, 15, -1, -8,-14,-24,-28,  5,  6;
/M: SY='S'; M= 14, -4,-16, -8, -4,-23,  5,-12,-19, -8,-21,-13,  1,-11,  2,-11, 18,  9,-12,-28,-19, -1;
/M: SY='Y'; M=-16,-16,-26,-18,-14, 21,-27,  8, -4,-10, -3, -1,-14,-24, -3, -8,-12, -2,-10, 12, 49,-11;
/M: SY='V'; M=  4,-25,-18,-28,-26, -7,-14,-27, 19,-21,  4,  5,-21,-24,-24,-22, -8, -5, 27,-25,-12,-26;
/M: SY='V'; M=  1,-18,-10,-20,-20, -6,-23,-24, 12,-16, -1,  0,-16,-22,-20,-16,  5, 16, 28,-31,-11,-20;
/M: SY='T'; M= -2,  1,-17, -2, -7,-17, -3,-10,-13,-10,-13,  0,  1,-13, -5,-11, 11, 12, -8,-31,-14, -6;
/M: SY='S'; M=  0,  7,-15,  3,  4,-18, -9, -8,-14, -6,-21,-15, 14,-13, -2, -7, 19, 12, -9,-36,-18,  1;
/M: SY='D'; M= -6, 16,-28, 26, 20,-31,-13,  6,-29, -2,-23,-20,  4,  4,  3, -9, -1,-10,-26,-32,-17, 11;
/M: SY='G'; M= -3, -5,-30, -6,-14,-29, 48,-16,-34,-16,-30,-20,  5, -4,-16,-17,  0,-16,-30,-24,-29,-16;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-23, -5, -1,-19,-15, -3,-24, 15,-21,-13,  9,-17,  4, 39,  3,  4,-17,-27,-13, -1;
/M: SY='T'; M= 10, -4,-16, -8,-10,-15,-15,-19, -1,-13, -8, -7, -6,-14,-12,-17,  8, 11,  6,-28,-14,-12;
/M: SY='Y'; M=-17,-19,-29,-22,-19, 23,-26, 12, -8,-14, -5, -4,-17,-26,-13,-12,-16, -6,-13, 29, 46,-18;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-13, -9, -7,-13,-17,-16,-14, -5,-14,-11,  1,-11, -6,  0, 19, 38, -4,-30,-11, -7;
/M: SY='A'; M= 24,-13,-13,-20,-14,-13,-12,-21,  2,-14, -6, -5,-10,-14,-13,-19,  9,  7, 10,-25,-15,-14;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-26,-37,-29,  1,-37,-29, 43,-29, 23, 19,-23,-23,-21,-27,-20, -9, 30,-21, -1,-29;
/M: SY='S'; M=  1,  9,-15,  4,  0,-20, -3, -4,-21, -2,-29,-19, 21,-14,  1,  3, 26, 11,-16,-37,-19,  0;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='H'; M=-11,  7,-27,  2,  0,-22,-14, 21,-23,  0,-25,-12, 15,  6,  0, -2, -1, -3,-25,-31, -9, -2;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-32,-26,  4,-32,-26, 31,-26, 27, 16,-28,-28,-24,-22,-20, -6, 31,-24, -4,-26;
/M: SY='P'; M= -6,-12,-31, -5,  6,-27,-17,-16,-20, -8,-27,-19,-11, 55, -5,-15,  1,  0,-24,-31,-25, -3;
/M: SY='P'; M=  0, -5,-27, -2, 15,-27,-15, -8,-22,  2,-22,-15, -5, 16,  9,  1,  3, -5,-22,-27,-20, 10;
/M: SY='S'; M=  4,  4,-20,  6,  8,-26,-10, -9,-21, -4,-23,-16,  2,  2,  5, -9, 14,  7,-16,-31,-19,  6;
/M: SY='L'; M= -1,-28,-16,-29,-22,  4,-27,-23, 19,-25, 33, 14,-28,-28,-22,-20,-20, -6, 20,-23, -5,-22;
/M: SY='G'; M= 13,-10,-25,-13,-17,-27, 52,-20,-32,-17,-25,-17, -3,-17,-17,-20,  3,-15,-22,-20,-27,-17;
/M: SY='H'; M= -4, -8,-25, -9, -2,-17,-17,  7,-18, -2,-18, -9, -4,  0,  5,  3,  2,  1,-17,-21, -1, -2;
/M: SY='A'; M=  9, -4,-20, -2, -1,-21,-10,-12,-14,-10,-12,-11, -4,  0, -1,-13,  7,  0,-12,-29,-17, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='R'; M=-15,-12,-28,-12,  1,-18,-22, -2,-16, 11, -4,  0, -7,-20, 16, 33,-12,-10,-16,-20, -8,  6;
/M: SY='P'; M=-10,-22,-27,-20,-11, -3,-25,-20, -3,-11, -2, -3,-21, 18,-16,-13,-16, -9, -4,-21,-10,-15;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-18,-29,-22,  3,-29,-21, 23,-23, 26, 20,-24,-25,-18,-19,-17, -1, 20,-23, -3,-21;
/M: SY='V'; M=  0,-18,-17,-21,-15, -3,-24,-14,  8,-15,  8,  4,-18,-22, -9,-14, -8,  3, 11,-18,  2,-13;
/M: SY='P'; M= -3,-19,-25,-18,-12,-15,-22,-22,  6,-17,-11, -5,-14, 18,-13,-20,  0, -1,  3,-30,-17,-16;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-33,-25, 12,-33,-25, 27,-27, 21, 13,-19,-22,-21,-23,-16, -1, 17,-17,  3,-25;
/M: SY='G'; M= -4,-18,-28,-19,-21,-16, 31,-21,-13,-24, -4, -5,-10,-22,-20,-21,-10,-16,-12,-20,-19,-21;
/M: SY='G'; M=  6, -1,-21, -8,-13,-22, 28,-16,-26,-13,-22,-16,  6,-16,-13,-15,  8,  3,-18,-25,-22,-13;
/M: SY='T'; M= -5,-16,-22,-18,-13,-11,-25,-22,  3,-16, -3, -3,-15, 12,-15,-18, -3, 13,  3,-28,-13,-16;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-36,-27, 10,-34,-24, 34,-26, 22, 22,-22,-24,-21,-24,-20, -9, 23,-18,  2,-26;
/M: SY='G'; M= -1,-14,-29,-14,-17,-12, 25, -9,-23,-15,-19,-13, -9,-11,-15,-17, -5,-14,-21, -7,  2,-18;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L'; M=  0,-22,-17,-26,-17,  2,-23,-18, 12,-22, 30, 16,-22,-23,-15,-18,-16, -1,  7,-21, -4,-16;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-19,-35,-26, 58,-29,-20,  2,-27, 13,  2,-19,-27,-33,-19,-16, -2,  1,  0, 20,-26;
/M: SY='A'; M= 44, -9,-10,-17, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-13,-11, -7,-10, -9,-19, 14,  3, -1,-23,-20, -9;
/M: SY='K'; M=-12, -2,-26,  0,  2,-22,-21,-11,-18, 23,-15, -7, -4,-16,  1, 19,-11, -9,-10,-24,-10,  0;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-24,  4, 25,-22,-19,-10,-17, -1,-17,-15, -5,  4,  4, -7,  5,  3,-14,-31,-18, 14;
/M: SY='Q'; M= -5,-10,-21,-13, -5,-16,-22,-12, -1, -4, -5,  0, -8,-16,  6, -5,  1,  4, -1,-25, -9,  0;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-29,  2, -5,-31, 28,-12,-32,-11,-29,-18,  1, -4, -2,-13,  4,-11,-27,-26,-25, -4;
/M: SY='P'; M= -7, -1,-32,  2, 10,-29, 12,-11,-29, -7,-27,-20,  2, 15, -4,-12, -2,-12,-30,-28,-26,  2;
/M: SY='A'; M= 20, -6,-12,-14,-11, -6, -7,-15, -8,-12,-13,-10,  0,-16,-12,-15, 11,  3, -1,-25,-13,-11;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='M'; M= -4,-17,-23,-20, -9, -4,-25,-12,  9, -8,  7, 10,-17,-20, -9,-11,-14, -8,  7,-16,  3,-10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F'; M=-17,-26,-22,-31,-26, 50,-30, -7,  4,-21,  6,  1,-21,-30,-28,-16,-19, -9,  4, 11, 42,-26;
/M: SY='Q'; M= -1,  0,-20, -1,  9,-29,-12, -1,-19,  0,-22, -9,  4,-10, 28,  0, 18,  9,-19,-29,-14, 18;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-30,-21, 12,-31,-15, 21,-27, 39, 17,-27,-29,-19,-20,-27,-10,  9,-13, 12,-21;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-10, -9, -9,-11,-17,-19,-11,-10,-13,-11,  1,-10, -9,-10, 23, 46, -1,-31,-11, -9;
/M: SY='G'; M= -1, -3,-29, -6,-17,-29, 61,-16,-37,-17,-30,-20,  8,-20,-17,-17,  1,-17,-30,-23,-29,-17;
/M: SY='G'; M= 12,-10,-25,-12,-18,-28, 53,-20,-33,-18,-25,-18, -2,-18,-18,-20,  2,-15,-23,-20,-28,-18;
/M: SY='K'; M= -4,-10,-19, -9, -1,-14,-21,-16, -6,  3, -7, -4, -9,-16, -6, -2, -1,  3,  2,-28,-11, -3;
/M: SY='F'; M=-17,-29,-20,-37,-29, 63,-30,-17,  4,-27,  9,  1,-21,-30,-36,-19,-19, -9,  6,  6, 29,-29;
/M: SY='N'; M= -4,  6,-18, -1, -1,-20,-13, -7,-14,  2,-20,-10, 13,-15,  5, -1, 10, 11,-10,-31,-14,  2;
/M: SY='H'; M=-14, -4,-27, -4,  3,-23,-17, 33,-27,  8,-21, -7,  5,-17, 16, 26, -1, -9,-23,-26, -2,  6;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-23,  8, 16,-23,-20,  8,-19, -2,-16,-10,  1,-11,  9, -4,  2,  4,-15,-30,-10, 12;
/M: SY='T'; M= 10, -8,-10,-12,-11,-12,-13,-19, -4,-12,-13, -9, -5,-15,-11,-14, 19, 21,  8,-32,-15,-11;
/M: SY='Q'; M= -4, -3,-25, -3, 14,-19,-19,  1,-18,  4,-15, -8, -4,-12, 18,  5,  0, -2,-19,-16,  0, 15;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-18,-31,-25,  3,-30,-22, 28,-23, 27, 22,-27,-27,-21,-20,-20, -6, 27,-24, -4,-24;
/M: SY='E'; M=-10,  1,-25,  2, 19,-25,-20, 10,-23,  6,-18, -9,  1,-10, 19, 10,  2,  3,-22,-26, -9, 18;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-23,-37,-29, 63,-31,-15,  6,-27, 10,  3,-20,-29,-33,-20,-20,-10,  2,  9, 34,-29;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-20,  4, 11,-19,-15,  2,-18, -7,-11,-11,  0,-11,  1, -9,  5,  3,-14,-30,-12,  6;
/M: SY='T'; M= -1, -3,-18, -8, -5,-19, -7,-15,-17, -9,-18,-12, -1,  0, -1,-10, 14, 24,-12,-29,-16, -4;
/M: SY='G'; M= -4, -2,-29, -5,-15,-28, 50, -2,-36,-16,-29,-18,  9,-20,-14,-15,  0,-17,-30,-24,-23,-15;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M=-12, -1,-30,  6, 29,-14,-12,  3,-23,  1,-16,-15, -5,-11,  7, -5, -5,-11,-25,-12,  6, 17;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-25, -8,  1, -9,-21, -6, -6,  0, -5, -4, -2,-17, -2,  2, -6, -5, -9,-20,  1, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-18,-33,-25, 26,-30,-22, 17,-28, 30, 12,-27,-30,-28,-20,-23, -8, 17,-14,  6,-25;
/M: SY='T'; M=-10,-10, -5,-13, -9,-12,-23,  1,-13, -5,-11, -5, -7,-21, -1,  2, -2,  7, -6,-22,  1, -7;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-24,-35,-26,  1,-32,-20, 36,-23, 23, 30,-22,-22,-15,-22,-20, -9, 24,-21, -1,-23;
/M: SY='T'; M= -5, 11,-19,  8,  2,-22,-14,-10,-22,  7,-22,-15, 10,-11, -1,  1, 11, 18,-14,-31,-14,  0;
/M: SY='Q'; M=-11,  0,-30,  0, 17,-37,-20, 22,-21,  7,-20,  0,  1,-11, 53,  9, -1,-11,-30,-21, -6, 35;
/M: SY='Q'; M= -6, -7,-23, -9,  3,-20,-24,-12, -4,  2,-10, -2, -7,-13,  9, -2, -1,  4, -3,-25,-10,  6;
/M: SY='F'; M=  7,-20,-19,-27,-20, 28,-18, -9, -4,-17,  0, -4,-16,-22,-20,-17, -8, -6, -3,  4, 24,-20;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-23, 10, 14,-24,-14, -5,-27,  7,-23,-17,  5,-11,  6, 14,  9,  4,-19,-31,-16,  9;
/M: SY='G'; M= -3,-10,-30,-10,-17,-29, 57,-17,-39,-13,-29,-19,  0,-20,-16, -7, -1,-19,-29,-20,-27,-17;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-20,  4,-30,-20, 19,-21, 32, 15,-25,-28,-18,-10,-23, -9, 14,-21, -3,-20;
/M: SY='D'; M=-14, 35,-24, 38,  6,-27, -9, -1,-23, -3,-24,-21, 26,-16, -4, -8,  2, -5,-18,-39,-19,  1;
/M: SY='P'; M= -4,-13,-25,-11, -2,-14,-19,-13, -4,-11,-15, -9,-11, 12, -7,-15,  3, -1, -5,-25, -9, -7;
/M: SY='D'; M=-19, 14,-34, 23,  9,-23,-16, 18,-32, -6,-24,-19,  2,-16,  0, -9,-11,-17,-30,  5,  1,  4;
/M: SY='D'; M= -9, 19,-29, 25,  8,-32, 21, -7,-36, -7,-29,-23, 14,-14, -5,-11,  1,-13,-30,-31,-24,  1;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-23,-14, -8, -5,-23, 10, -3,-10, -2,  2,-11,-22,  5, -7, -7, -6, -5,-13, 15, -3;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 19,-30,-20, 17,-30, 45, 17,-29,-30,-23,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='T'; M=  2, -4,-17, -9, -7,-12,-13,-12, -8, -7, -3, -5,  1,-17, -7, -7,  4,  6, -6,-28,-12, -7;
/M: SY='I'; M= -4,-23,-20,-26,-22, -4,-14,-24, 16,-24, 11,  7,-18,-24,-20,-21, -9, -5, 16,-25, -9,-22;
/M: SY='D'; M=-13, 20,-28, 28, 12,-32,-14,  8,-33, 15,-29,-18, 10,-11,  5,  6,  0, -8,-24,-32,-11,  8;
/M: SY='M'; M= -7,-20,-19,-28,-21, -1,-27,-18, 21,-18, 16, 24,-18,-20,-13,-17,-11,  5, 17,-23, -3,-18;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-22, -4,  6, -7,-20,  2,-14,  1,-13, -8,  1,-15, -3, -2, -2,  0,-10,-25, -5,  1;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-21,-35,-28, 14,-34,-26, 30,-27, 23, 15,-25,-26,-25,-24,-20, -7, 26,-18,  2,-28;
/M: SY='S'; M= -5,  5,-21,  4, 12,-17,-11,  0,-22,  2,-23,-17, 11,-13,  5,  5, 13,  3,-19,-28, -8,  7;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-26, -9,  4,-15,-21,  2,-14,  7,-10,  3, -6,-16, 16, 17, -6, -2,-15,-16,  2,  8;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-31,-26,  4,-31,-26, 29,-25, 27, 15,-29,-29,-25,-21,-19, -5, 31,-25, -5,-26;
/M: SY='P'; M=-10,-21,-37,-13, -3,-25,-21,-20,-15,-13,-20,-15,-21, 74,-11,-20,-13,-10,-25,-29,-26,-11;
/M: SY='E'; M=  5,  2,-22,  2, 11,-18,-13, -6,-19, -3,-17,-12, -1,-11, 11, -7,  5, -4,-17,-23,-12, 11;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-21,-30,-24, -2,-30,-26, 31,-25, 14, 12,-19,-22,-20,-23,-10, -3, 26,-25, -5,-24;
/M: SY='P'; M=  5,-15,-27,-14, -6,-23, -4,-16,-15,-12,-12, -9,-14, 20, -4,-16, -6, -9,-17,-23,-21, -6;
/M: SY='A'; M= 20, -8,-19,-10,  2,-17, -9,-11,-14, -7,-15,-13, -8,  2, -4,-15,  6, -1,-11,-19, -9, -3;
/M: SY='D'; M=-10,  8,-29, 12, -1,-27,  6,-10,-27, -2,-21,-16,  6, -3, -7, -8, -5,-11,-24,-29,-20, -5;
/M: SY='A'; M= 12,  0,-19,  0,  0,-14,  3,-13,-21,-10,-17,-16, -2,-13, -9,-15,  6, -4,-14,-23,-16, -4;
/M: SY='E'; M= -6,  7,-20, 10, 14,-22,-17,-11,-19,  3,-18,-15,  1, -9,  1, -4,  8, 10,-11,-32,-15,  7;
/M: SY='V'; M=  2,-28,-14,-29,-24,  1,-27,-25, 22,-23, 22, 11,-28,-28,-24,-20,-15, -4, 30,-25, -7,-24;
/M: SY='H'; M=-12, -8,-24,-13,-10,-13,-25, 23, -6, -9, -8,  0, -1,-17, -2,  1, -4,  3, -7,-26,  3,-10;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-35,-28, 12,-34,-27, 32,-27, 23, 15,-25,-26,-25,-24,-19, -7, 27,-19,  1,-28;
/M: SY='D'; M=-12, 10,-30, 17, 16,-32,-17, -7,-27,  6,-25,-17,  1, 14,  9, -3, -1, -3,-25,-30,-18, 11;
/M: SY='D'; M=-18, 34,-32, 51, 15,-38,-12, -5,-35, -2,-30,-28, 11, 13, -2,-12, -2,-10,-30,-38,-22,  5;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14,  0,-13,  1,  0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21;
/M: SY='T'; M= -1, -2,-18, -3,  6,-21,-16,-10,-15,  1,-18,-10,  0,-11,  7, -2, 13, 14, -8,-30,-14,  7;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-28, 11, 44,-28,-21, -2,-21,  6,-16,-14, -4, -5, 20, -1, -1, -9,-21,-29,-17, 32;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-22, -1,  5, -7,-20,  3,-11,-10, -4, -6, -7,-17, -6,-11, -8, -9, -7,-24, -5, -1;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 15,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21;
/M: SY='V'; M= -8,-13,-20,-17,-15, -9,-25,  6,  2,-11, -4,  2, -9,-20,-10, -4, -4,  5,  8,-28, -2,-15;
/M: SY='R'; M=-16,-10,-29,-11, -1, -5,-23,  4,-17, 12,-14, -4, -7,-19, 14, 20,-11,-10,-18, -5, 15,  5;
/M: SY='T'; M= -2,  1,-17, -1,  9,-18,-15,-11,-19, -1,-18,-15,  2, -9,  1,  1, 17, 23,-11,-31,-15,  5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='G'; M= -5, -8,-23, -8,-11,-21, 33,-11,-28, -4,-21,-13,  0,-15, -9,  5, -2,-13,-21,-15,-19,-11; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P'; M=-10, -6,-33,  1,  3,-29,-16,-13,-25,  3,-29,-19, -7, 41, -3,  0, -3, -6,-25,-30,-23, -3;
/M: SY='G'; M=  0, -1,-25,  2,-11,-29, 44,-15,-35,-15,-30,-21,  5,-17,-13,-17,  9,-10,-25,-27,-27,-12;
/M: SY='Q'; M=-10,-14,-25,-14, -2,-13,-26, -6,  2, -3, -5,  2,-12,-19,  9,  1, -9, -8,  1,-17,  2,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24,  6,-33,-24, 29,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24;
/M: SY='T'; M=-11, -9,-21,-14, -7,  2,-23, -7,-13,  1,-10, -6, -6,-17, -1,  7, -1, 11,-10,-13,  8, -5;
/M: SY='S'; M= 24, -4,-10, -9, -5,-19, -3,-15,-15,-10,-19,-15,  1,-10, -5,-14, 25, 16, -5,-31,-19, -5;
/M: SY='H'; M= -4,-11,-21,-11,-11,-12, -6,  4,-12, -6,-16, -7, -5,-20, -8, -7,  2, -4, -4,-22,  1,-11;
/M: SY='S'; M=  9,  6,-15,  8,  4,-25, -3, -8,-22, -7,-26,-18,  8,-10,  5, -9, 26, 10,-14,-35,-19,  4;
/M: SY='T'; M= 13, -5,-10,-13,-11,-13,-14,-20, -7,-11,-10, -9, -4,-12,-11,-13, 17, 29,  4,-29,-14,-11;
/M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-13, -3, -7,-22,  9,-20,  9, -9, -3, -4,-21,  8, 32,-12,-11,-17,-17,  0,  0;
/M: SY='S'; M= -5,  6,-20,  8,  7,-20,-11, -5,-20, -2,-17,-15,  8,-14,  1,  3, 11,  2,-16,-33,-16,  3;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-22,-33,-27, 49,-31,-12,  9,-23,  8,  3,-21,-29,-29,-18,-19, -9,  7,  7, 35,-27;
/M: SY='T'; M= -5, -5,-17,-13,-11, -9,-20,-15, -2,-10, -3, -4,  0,-16, -8, -4,  5, 18, -1,-28, -9,-11;
/M: SY='V'; M= -6,-26,-19,-28,-24, -2,-31,-10, 25,-22, 12, 12,-22,-26,-21,-19,-15, -6, 29,-27, -2,-24;
/M: SY='D'; M=-13, 10,-25, 13,  8,-22,-17, -4,-23,  6,-16, -8,  3,-13,  3, 13, -1,  3,-16,-29,-13,  4;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='Q'; M= -6,  0,-17, -1,  5,-14,-11, -3, -5, -2,-10, -5,  3,  5,  6, -5, -2, -4,-11,-16, -9,  4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='N'; M=  5,  4,-17, -2, -6,-21,  3, -8,-15, -8,-22,-13, 13,-16, -2, -9, 13,  2,-11,-32,-19, -4;
/M: SY='Q'; M=-12,-15,-26,-16, -6,-15,-26,  3, -1, -4,  0,  5,-10,-21,  8,  8,-12,-10, -2,-23, -4, -2;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-16, -7, -8,-14,-16,-16,-10,-10,-16,-12,  2,  2,-10,-11, 14, 26, -4,-32,-15,-10;
/M: SY='Y'; M= -5,-19,-26,-22,-17, -2,-23, 13,  0,-17,  0,  2,-15,-23,-10,-15,-15,-12, -2,  1, 15,-16;
/M: SY='S'; M=  0, -8,-21, -8, -6,-20, -3,-13,-15, -8,-23,-14,  0,  0, -4, -5, 16,  5,-11,-32,-19, -7;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-26,-24,-20, 21,-29,  8,  8,-15, 15, 13,-22,-29,-11,-12,-22,-10, -2, 11, 50,-19;
/M: SY='T'; M= -6, -1,-20, -5,  0,-20,-17,  4,-19,  0,-17, -8,  2,-13, 12,  7, 10, 16,-14,-28, -8,  5;
/M: SY='V'; M= -9,-31, -4,-34,-29,  1,-29,-29, 10,-24,  4,  0,-30,-30,-25,-23,-21,-11, 14, 14, -1,-26;
/M: SY='D'; M=-16, 28,-27, 31, 11,-23,-12,  5,-28,  3,-24,-20, 22,-15,  2,  3, -1, -7,-26,-28, -7,  6;
/M: SY='Q'; M=-13,  0,-30,  0, 14,-34,-20, 35,-23,  4,-20,  0,  3,-13, 46,  7, -3,-13,-30,-23, -2, 29;
/M: SY='T'; M= -5,  9,-18,  5,  1,-21,-14, -7,-19, -1,-20,-14, 11,-12,  5,  2, 14, 19,-14,-32,-14,  2;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30,  0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30;
/M: SY='T'; M= -7, -7,-18,-13, -6, -4,-22,-14,-10, -3, -6, -4, -6,-15, -2, -4,  2, 19, -6,-21, -4, -3;
/M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 50,-30,  4,  0,-18,  4,  0,-20,-30,-22,-14,-20,-10, -6, 22, 60,-24;
/M: SY='E'; M=-14, 17,-30, 26, 34,-34,-17,  2,-30,  9,-23,-17,  6, -7, 23,  7, -1,-10,-29,-29,-17, 28;
/M: SY='E'; M=  1,  0,-26,  3, 20,-29,  8, -7,-28, -2,-23,-16,  0, -9,  9, -7,  5, -8,-25,-26,-21, 15;
/M: SY='C'; M= -1,-16, 84,-26,-24,-19,-25,-27,-24,-24,-17,-17,-16,-32,-24,-26, -3,  0, -7,-43,-26,-24;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='E'; M=  1, -6,-17, -5,  6,-14,-11, -8,-12, -2, -9, -8, -6,  4,  0,  0,  0, -2,-11,-20,-13,  1; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='H'; M= -9,  4,-20,  3,  6,-17, -1, 22,-22,  0,-17, -9, 10,-12,  4,  5, -2, -9,-21,-21, -5,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='R'; M= -8,  2,-28,  4, 11,-27,-16, -2,-27, 20,-21,-12,  1,-13, 14, 30, -4, -9,-21,-23,-13, 10;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-24,-10, -5, -8,  6, -2,-24, -8,-16,-11, -3,-17, -9, -3, -2, -6,-18,-19, -9, -7;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-24,-16,-12,  0,-22,-17, -1,-14,  6, -1,-15, -8,-14, -8,-14, -9, -3,-19, -6,-14;
/M: SY='A'; M= 10,  0,-23,  0,  8,-25,-12, -8,-15, -3,-14, -4, -6,  0,  7,-10,  0, -7,-14,-25,-17,  7;
/M: SY='P'; M= -7,-19,-27,-18,-12,-15,-12,-19, -4,-12, -8, -5,-15,  9,-13, -9, -7, -7, -4,-26,-17,-15;
/M: SY='P'; M= -7, -6,-30, -2,  2,-17,-18,-12,-20, -1,-21,-14, -9, 25,  0, -8, -7, -9,-22,-22,-15,  0;
/M: SY='D'; M= -4,  4,-21,  7, -2,-16,-16,  2,-13,-13, -2, -7, -2,-17, -6,-13, -2, -1,-10,-30, -8, -5;
/M: SY='T'; M= -2, -6,-17, -5,  6,-16,-20,-15, -7, -1,-12, -8, -7,-13, -4, -6,  6, 10,  3,-30,-14,  1;
/M: SY='Q'; M= -7,  2,-23, -1, 10,-24,-16,  1,-11,  1,-15,  1,  4,-13, 22, -1,  3, -4,-15,-28,-13, 16;
/M: SY='Q'; M=-10,-10,-25,-14, -4,-16,-24,  7, -3, -3, -2,  9, -7,-16, 10, -3, -8, -4, -7,-23, -2,  2;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-20,-27,-17,  4,-29,-18, 17,-25, 37, 17,-27,-28,-13,-17,-24, -9, 12,-21, -2,-15;
/M: SY='H'; M=-11, -1,-25, -3,  3,-23,-18, 19,-27, 18,-24, -9,  4,-14,  7, 19, -1, -2,-19,-26, -4,  3;
/M: SY='V'; M= 12,-24,-14,-29,-24, -6,-24,-27, 23,-19,  7,  7,-22,-22,-22,-22, -7, -2, 32,-25,-11,-24;
/M: SY='S'; M= -1, 12,-17, 15,  5,-25, -7, -9,-25,  0,-28,-20, 10,-10,  0, -5, 22, 13,-15,-36,-18,  2;
/M: SY='R'; M= -7, -4,-22, -4,  1,-21,-12, 10,-26, 10,-25,-13,  5,-15,  6, 24, 10,  0,-17,-29,-10,  1;
/M: SY='I'; M=  0,-28,-21,-34,-28, -2,-32,-29, 36,-24, 13, 13,-22,-22,-22,-25,-13, -5, 34,-24, -6,-28;
/M: SY='F'; M= -5,  0,-20, -7, -3,  9,-14, -3,-13,-10,-13,-11,  8,-19, -9,-10,  2, -2,-14,-15,  6, -6;
/M: SY='A'; M= 13,-16,-12,-19,-14, -9,-14,-20,  4,-17,  2, -1,-14,-19,-14,-17,  5,  3, 12,-28,-13,-14;
/M: SY='D'; M= -1,  0,-22,  4,  1,-18, -8,-14,-11,-12, -2, -8, -8,-17, -9,-15, -7, -8, -6,-27,-15, -4;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-23,-21, 37,-30, 14,  0,-13,  1,  0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 27, 73,-21;
/M: SY='N'; M= -7, 16,-19, 13,  3,-19,-11, -5,-12, -5,-19,-14, 19,-18, -5, -8,  6,  0, -8,-36,-18, -1;
/M: SY='P'; M=-10,  3,-30,  9, 18,-30,-19, -8,-24,  5,-24,-16, -3, 19,  9, -3, -1, -1,-24,-29,-19, 12;
/M: SY='E'; M=-12,  8,-27, 15, 17,-25,-17, -5,-21,  4,-19,-15,  4,-11,  5,  8,  1, -6,-17,-30,-15,  9;
/M: SY='E'; M= -2, 11,-27, 19, 46,-30,-16, -3,-28,  6,-20,-20,  1, -2, 14, -4,  1, -9,-26,-30,-20, 30;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-27, -2, 12,-27,  4, -7,-28,  5,-21,-14, -1,-12,  8, 10, -1,-11,-23,-23,-19,  9;
/M: SY='A'; M= 16, -9,-14,-18,-16,-12,-15,-19,  5,-13, -5, -3, -4,-17,-14,-17,  3,  5, 11,-27,-14,-16;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-18,-30,-22,  8,-30,-22, 22,-28, 40, 18,-30,-30,-22,-20,-25, -8, 20,-22, -2,-22;
/M: SY='R'; M=-16, -3,-29, -6, -3,-21, -5, -1,-30, 19,-23,-13,  9,-20,  5, 48, -6,-10,-23,-23,-14, -3;
/M: SY='F'; M=-18,-26,-23,-34,-26, 50,-30, -9,  7,-23, 10,  9,-20,-28,-26,-17,-20,-10,  2,  8, 36,-25;
/M: SY='G'; M= 16, -7,-22,-11, -6,-28, 19,-14,-24, -3,-21,-12, -4,-13,  0, -9,  2,-10,-17,-20,-21, -3;
/M: SY='M'; M=  5,-23,-18,-29,-20, -2,-22,-17, 18,-19, 20, 23,-22,-22,-14,-19,-15, -7, 15,-21, -6,-18;
/M: SY='T'; M= -6,  0,-19, -6, -6,-13,-16,  4,-11, -3, -9, -1,  6,-16, -2, -3,  3,  9,-10,-29, -7, -5;
/M: SY='N'; M=  4, 19,-15,  6, -3,-19, -3, -3,-17, -5,-24,-17, 31,-15, -3, -6, 18, 12,-17,-36,-19, -3;
/M: SY='H'; M=  1, -5,-21, -8, -1,-12,-13,  6,-20,  3,-19, -9,  0,-14,  4,  0,  5, -2,-15,-23, -5,  1;
/M: SY='I'; M=  7,-23,-20,-31,-22, -4,-24,-22, 24,-21, 15, 16,-20,-20,-16,-22,-12, -6, 19,-21, -6,-21;
/M: SY='G'; M=  0,-11,-20,-12,-13,-20, 10,-17,-12,-13,-15, -8, -7,-19, -7,-13,  5,  1, -3,-26,-18,-10;
/M: SY='P'; M= -7,-12,-24,-14, -8,-16,-23,-18, -6,  0,-13, -7,-10,  9, -8,  0, -2,  9, -4,-26,-13,-11;
/M: SY='E'; M= -2, -6,-21, -5,  5,-20,  3,-15,-15, -9,-16,-12, -6,-14, -7,-12,  5,  0, -6,-29,-19, -1;
/M: SY='D'; M=-11,  7,-28, 15, 14,-27, -6, -9,-25,  0,-21,-17, -1, -2, -1, -2, -3,-10,-19,-30,-20,  5;
/M: SY='G'; M= -9,  6,-26,  6,  2,-26,  8, -6,-25, -2,-22,-14,  8,-17,  2,  1, -1,-10,-20,-27,-19,  1;
/M: SY='S'; M= -5, -5,-23, -1,  1,-12, -6,-14,-16,-11,-18,-14, -5, -2,-10,-14,  4, -3,-10,-28,-15, -5;
/M: SY='N'; M=  2,  7,-16, -1, -6,-17, -7, -6,-13, -2,-20,-13, 18,-18, -4,  2, 11,  3, -8,-33,-17, -6;
/M: SY='P'; M=  5,-15,-27,-13, -6,-25, -4,-17,-15,-10,-19,-11,-14, 24, -5,-16, -3, -8,-14,-25,-23, -7;
/M: SY='C'; M= -9, -5, 46, -5, -4,-25,-21,-18,-29,-16,-24,-21, -9,-12,-13,-20, -1, -6,-18,-42,-26, -9;
/M: SY='P'; M=  5,  0,-25,  2,  5,-24,-13,-13,-16, -6,-19,-15, -3, 16, -6,-14,  0, -5,-14,-30,-22, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 9 in 9 different sequences
Number of true positive hits 8 in 8 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 88.89 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Nidogen G2 beta-barrel
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
8 sequences

HMCN1_HUMAN (Q96RW7), HMCN2_HUMAN (Q8NDA2), HMCN2_MOUSE (A2AJ76), 
NID1_HUMAN  (P14543), NID1_MOUSE  (P10493), NID2_HUMAN  (Q14112), 
NID2_MOUSE  (O88322), NID2_RAT    (B5DFC9)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

SYL_SALAI   (A8LX93)

		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

1GL4; 1H4U

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission