Entry: PS51019

General information about the entry

Entry name [info] REELIN
Accession [info] PS51019
Entry type [info] MATRIX
Date [info] SEP-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2016 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51019
Associated ProRule [info] PRU00363

Name and characterization of the entry

Description [info] Reelin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=168;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=163;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2636361; R2=0.0198973; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=289; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=163; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F'; M= -1,-20,-20,-24,-18,  9,-23,-11,  5,-17,  4,  1,-16,-18,-16,-14, -8, -2,  5,-13,  8,-18;
/M: SY='A'; M=  9,-12,-18,-15,-13,-10,-11,-18, -1,-15,  3, -2,-13,-16,-14,-17, -3,  0,  2,-23,-10,-14;
/M: SY='V'; M= -3,-16, -2,-18,-15, -7,-24,-21,  0,-16,  4, -2,-17,-16,-17,-16,-10, -1,  5,-28,-12,-17;
/M: SY='A'; M=  4,-11,-20,-12, -9,-11, -3,-15, -7,-16,  1, -4,-11,-19,-13,-16, -5, -5, -2,-24,-13,-11;
/M: SY='V'; M=  0,-17,-19,-20,-16, -1,-22,-13,  6,-14,  4,  3,-16,-19,-13,-13, -7,  2,  8,-16,  4,-15;
/M: SY='A'; M=  5,-17,-15,-21,-17, -4,-15,-15,  4,-18,  4,  0,-15,-21,-15,-19, -6, -4,  4,-17,  1,-17;
/M:         M= -3,-16,-23,-14,-10, -3,-14,-17, -6,-16, -3, -6,-15, -3,-15,-17, -7, -6, -5,-16, -8,-13;
/M: SY='R'; M= -8,-17,-17,-17,-12,-14,-20,-17, -5, -3, -8, -3,-14, -3,-10,  3, -6, -2,  1,-27,-14,-13;
/M: SY='S'; M=  3, -4,-12, -8, -9, -9, -9, -9,-13,-13,-12, -9, -3,-18, -9,-13,  4,  2, -6,-25,-10, -9;
/M: SY='A'; M= 13, -7,-19,-13,-12,-19, 12,-15,-14,-13,-16, -9,  0,-14,-10,-14,  8, -3,-10,-25,-19,-11;
/M: SY='P'; M=  3,-14,-21,-13, -6,-13,-17,-11,-13, -6,-15,-11,-13, 13, -8,-11, -3, -4,-13,-18, -3, -9;
/M: SY='P'; M= -3,-11,-23,-11, -6,-10,-16,-14,-13, -8,-16,-10, -9, 13, -8, -7,  2,  2,-10,-25,-14, -8;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-22, -1,  7, -8,-12, -9,-16, -6,-14,-13,  3,-15, -4, -7,  1, -3,-14,-19,-10,  2;
/M: SY='G'; M=  2, -7,-21, -9,-11,-10, 12,-16,-20,-14,-12,-12, -3,-18,-14,-13,  1, -5,-14,-21,-14,-12;
/M: SY='Y'; M= -7,-16,-18,-19,-13,  1,-20,-10, -5, -4, -2, -1,-14,-22, -9, -3,-11, -5, -2,-11,  9,-12;
/M: SY='C'; M= -7,-20, 65,-26,-25,-14,-24,-27,-17,-25,-14,-13,-19,-26,-26,-25, -7, -7, -2,-41,-24,-26;
/M: SY='T'; M= -1,  5,-14,  3, -4,-19,-14,-14,-15, -8,-18,-14,  4, -6, -7,-11, 13, 18, -7,-33,-16, -6;
/M: SY='R'; M= -7, -8,-26,-12, -8,-19, -5,  2,-17,  2,-16, -4, -1,-18,  0, 12, -5, -8,-14,-20, -9, -6;
/M: SY='A'; M=  6, -9,-20,-13, -9,-16,-15,  6, -4, -9, -8,  3, -5,-16, -2, -9, -1, -5, -2,-25, -6, -7;
/M: SY='P'; M= -9,-15,-11,-13, -8,-21, -9,-18,-19,-14,-15,-13,-13, 20,-13,-14,-10,-10,-20,-30,-23,-12;
/M: SY='E'; M= -4, -5,-27, -4,  8,-24,-11, -4,-23,  3,-21,-13, -2,  5,  7,  6, -1, -5,-22,-24,-14,  5;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-21, -8, -9,-11,  3, -1,-16,-15,-10, -8,  1,-19,-10,-13,  1, -5,-12,-26,-10,-10;
/M: SY='Q'; M=  2, -7,-22, -9,  5,-18,-17,  2, -9, -6, -6,  3, -8, -9,  7, -8, -2, -3, -9,-25,-10,  5;
/M: SY='G'; M= -1, -8, -4,-12,-13,-21,  8,-17,-21,-12,-20,-14, -2,-11,-13,-12,  1, -5,-16,-29,-22,-14;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-24,  0, -5,-21,  2, -6,-21, -9,-21,-14,  2, -2, -6,-11,  2, -5,-17,-28,-17, -7;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -5, 11,-18, 15,  6,-21,  2,  3,-21, -3,-17,-13,  7, -8,  2, -6,  2, -5,-18,-21,-11,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='H'; M=  4, -6,-20, -7, -4,-19,  1,  8,-19, -7,-18, -9, -2,  1, -2, -7,  2, -4,-16,-22,-11, -5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='R'; M= -4, -6,-25,-10,-10,-19,  5,-11,-19,  3,-19,-10,  2,-19, -7,  9, -3, -7,-13,-22,-13,-10;
/M: SY='S'; M= -3, -2,-22,  0,  3,-21, -8,  3,-20, -5,-19,-12,  0, -8, -2, -3,  5, -2,-14,-30,-13, -1;
/M: SY='P'; M= -7,-11,-28, -9,  3,-22,-20,-11,-10, -4,-12, -5,-11, 15,  5, -5, -6, -6,-13,-26,-16,  2;
/M: SY='P'; M= -4,-12,-28,-10, -4,-25,  3,-12,-16,-10,-16, -7,-10,  6,  2,-12, -4,-10,-17,-24,-19, -2;
/M: SY='Q'; M= -8,  6,-25,  8,  8,-21,-18, -4,-14, -2,-13, -9,  3,-13, 10, -5,  0, -1,-15,-25, -8,  8;
/M: SY='S'; M=  2,  3,-14, -1, -5,-16,-10, -9,-11, -9,-17,-12,  7,-15, -7,-10, 15, 14, -3,-34,-15, -7;
/M: SY='N'; M= -1,  1,-22, -1,  3,-19, -5,-10,-16, -6,-14,-12,  4, -8, -4, -8,  3,  0,-14,-29,-18, -1;
/M: SY='F'; M= -3,-18,-23,-23,-16, 12,-22,-17, -1,-17, -2, -4,-13, -1,-18,-17, -8, -3, -4,-13,  2,-17;
/M: SY='P'; M= -4,-13,-27,-10, -2,-21,-17,-16,-12, -4,-20,-11,-10, 26, -5, -8,  1, -1,-12,-29,-19, -6;
/M: SY='Y'; M=-14,-22,-26,-23,-18, 13,-29,  4,  6,-20, 15,  7,-19,-19,-14,-15,-20, -9, -2, -6, 25,-18;
/M: SY='Q'; M= -8, -5,-24, -5,  2,-16,-19,  5,-14,  1,-13, -6, -1,-15,  6,  4,  2,  1,-13,-24, -2,  2;
/M: SY='I'; M= -5,-27,-21,-32,-26, -2,-32,-27, 35,-25, 13, 13,-20,-23,-21,-24,-11, -4, 31,-25, -5,-26;
/M: SY='T'; M=  4,  1,-19, -3,  2,-16,-16,-12, -8, -8,-10, -8,  0,-12, -4,-12,  6,  9, -5,-27,-12, -2;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-21, -8,-12,-19, 12,-20,-14,-15,-13,-10, -8,-15,-16,-17,  1, -2, -4,-26,-19,-14;
/M: SY='N'; M= -3, 14,-20, 13,  3,-24, -3, -5,-18, -6,-23,-16, 16,-14,  0, -9, 12,  1,-15,-35,-18,  1;
/M: SY='P'; M= -4, -8,-28, -5,  0,-27,-14,-15,-19, -3,-24,-15, -8, 32, -1,-10,  1,  1,-19,-29,-21, -2;
/M: SY='E'; M= -5,  7,-21,  7, 14,-23,-15, -7,-22,  8,-22,-13,  6, -9,  7,  1, 10, 10,-17,-30,-15, 10;
/M: SY='T'; M= -5,-10,-14,-14,-13, -6,-11, -8,-10,-11,-12, -7, -6,-19,-10,-11,  3,  8, -4,-21,  0,-12;
/M: SY='Y'; M=-15,-25,-24,-27,-24, 31,-30, -1,  9,-17,  6,  4,-22,-30,-21,-15,-18, -8,  7, 10, 46,-24;
/M: SY='K'; M= -7,-10,-23,-13,-11,-15,-13,-12, -6,  1,-11, -4, -6,-21, -8,  0, -8, -6,  1,-19,-10,-10;
/M: SY='P'; M=  0,-16,-32,-11, -2,-27,-13,-17,-19, -9,-24,-16,-15, 53, -7,-15, -4, -7,-23,-28,-26, -8;
/M: SY='G'; M= -2, -4,-30, -3,-10,-30, 56,-16,-38,-16,-29,-20,  3,-18,-15,-17,  0,-18,-30,-22,-28,-12;
/M: SY='Q'; M= -9,  8,-26, 11, 16,-29,-17,  6,-21,  2,-20,-10,  5,-10, 22,  0,  4, -1,-22,-29,-12, 18;
/M: SY='E'; M= -6, -3,-24, -3,  9,-23,-14, -8,-16,  0,-18, -9, -1, -1,  9,  0,  4,  3,-16,-28,-15,  8;
/M: SY='Y'; M=-14,-25,-26,-28,-24, 18,-32, -3, 18,-19, 12, 12,-22,-27,-16,-17,-20, -9,  8,  4, 38,-23;
/M: SY='R'; M= -7,  5,-24,  2,  6,-23,-11,  6,-25,  9,-22,-12,  9,-14,  7, 13,  3,  0,-20,-28,-11,  5;
/M: SY='V'; M= -2,-29,-14,-30,-28,  0,-26,-28, 28,-22, 13, 11,-28,-29,-27,-21,-13, -3, 40,-27, -9,-28;
/M: SY='T'; M=  2, -2,-14, -5, -7,-14,-15,-11,-10,-11,-11, -9, -1,-14, -6,-11, 15, 22, -1,-32,-12, -7;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-33,-24,  4,-33,-24, 31,-29, 32, 18,-24,-25,-19,-24,-22, -8, 19,-21, -1,-24;
/M: SY='S'; M= -2, -5,-19, -6, -2,-15,-11, -4,-15, -3,-17,-10,  1,-15,  2,  0, 12,  7,-10,-26, -7, -1;
/M: SY='G'; M=  9, -9,-19,-11,-14,-26, 34,-19,-29,-16,-25,-18, -3, -9,-15,-19,  6, -7,-20,-24,-26,-15;
/M: SY='S'; M= -4, -4,-23, -6, -3,-11,-15, -2,-16, -5,-18,-11,  1, -5, -4, -7,  3,  0,-13,-20, -8, -4;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P'; M= -5, -2,-22, -2,  3,-20,-13, -8,-18,  3,-21,-13,  3,  7,  2,  5,  6,  4,-16,-27,-16,  1; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -3, -3,-17, -3,  0,-15, -4, -9,-12, -4,-15,-10, -1,  9, -5, -7,  2,  1,-10,-20,-14, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='D'; M= -4,  4,-17,  5, -2,-15,-12, -3, -9, -6, -9, -5,  2,-12, -2, -8,  3,  2, -6,-24, -8, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='Y'; M= -8,-12,-20,-13, -8,  1,-20, -4, -5, -3, -6, -3,-11,-18, -7, -3, -6,  0, -3, -4, 11, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-38,-28, 64,-29,-17,  5,-27, 13,  8,-20,-29,-33,-19,-20,-10,  2,  5, 26,-27;
/M: SY='R'; M=-11, -3,-26, -2,  0,-22,-16, -7,-21, 15,-18,-10,  0,-16,  4, 28, -4, -5,-14,-24,-12,  0;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-28, -8,-14,-29, 57,-14,-38,-18,-29,-19,  1,-18,-16,-18,  3,-16,-28,-22,-27,-15;
/M: SY='F'; M=-16,-29,-21,-37,-28, 55,-31,-19,  9,-28, 15,  5,-22,-29,-33,-20,-20, -9,  7,  2, 24,-28;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-18,-26,-19,  9,-26,-16, 11,-19, 21, 16,-20,-24,-16,-12,-15,  2,  9,-18,  2,-18;
/M: SY='L'; M= -8,-29, -8,-32,-24,  3,-31,-24, 23,-28, 30, 16,-27,-29,-22,-22,-22, -8, 19,-24, -4,-24;
/M: SY='Q'; M= -3, -7,-23, -9,  6,-23,-21, -7, -5, -4, -8, -1, -6,-12, 19, -5,  0,  1, -9,-24,-11, 12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='A'; M= 28,-10,-13,-16,-10,-16,  3,-17,-10,-11, -9, -8, -9, -7,-11,-17,  6,  0, -3,-19,-17,-11; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='R'; M=-13,-10,-21, -9,  0, -7,-18, -5,-12,  6,  1, -2, -7,-17,  0, 24,-12, -8,-10,-16, -5, -2; D=-12;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='K'; M= -3,  2,-18,  2,  4,-12,-12, -4,-13,  6,-11, -7, -1,-10,  2,  2, -4, -5,-10,-14, -3,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-21,  0,  7,-19,  3,  0,-22, -4,-17,-13,  2,-10, -1, -5,  0, -6,-19,-15,-12,  3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D'; M= -5, 13,-24, 15, 13,-24, -3, -4,-27, -1,-23,-19, 12,-11,  3, -2,  7, -2,-23,-31,-18,  8;
/M: SY='N'; M= -9,  7,-25,  1, -3,-22, -6, -4,-21,  4,-24,-14, 16, -6, -2,  6,  2,  0,-21,-29,-16, -4;
/M: SY='D'; M= -3, -1,-25,  2,  2,-20,-11,-13,-13, -7,-11,-10, -3, -3, -5,-10, -2, -4,-12,-28,-16, -3;
/M: SY='A'; M=  1, -8,-21,-10, -9,-19, -4,-15, -8, -8,-14, -8, -4,-10, -8,-10,  1, -4, -2,-28,-17, -9;
/M: SY='G'; M= -4,  1,-24,  1, -3,-21,  6, -2,-23, -8,-19,-12,  4,-16, -2, -6,  2, -7,-18,-27,-15, -3;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-17, -7, -6,-21,  2,-15,-22, -4,-23,-14, -2, -5, -5, -8,  7,  1,-16,-27,-18, -6;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-27,  1,  8,-13,-14, -8,-18, -5,-17,-14, -2, -2,  0, -7, -2, -7,-18,-18,-10,  4;
/M:         M= -5, -6,-25, -7,  0,-14,-14, -9,-12, -6,-13, -9, -6,-15, -3, -5, -4, -3,-10,-11, -8, -2;
/M: SY='G'; M= -4, -3,-24, -2, -7,-17,  3,-13,-18, -9,-16,-12, -4,-18, -6, -9, -2, -8,-13,-15,-13, -6;
/M: SY='P'; M= -4, -7,-24, -7, -7,-15,-15, -6, -9,-13,-15, -9, -6,  2, -7,-15,  2,  0, -8,-26, -9, -9;
/M: SY='A'; M=  1,-16,-22,-17,-11, -1, -9,-16, -7,-15, -5, -2,-14, -5,-14,-17, -7, -8, -5,-19, -9,-12;
/M: SY='G'; M= -3,  1,-23,  0, -7,-22, 15,-13,-22,-10,-18,-14,  5,-17, -9,-10,  3, -4,-17,-27,-19, -8;
/M: SY='N'; M= -7,  0,-23,  0, -7,-17, -6,-12,-18, -7,-15,-13,  2,-15, -8, -3,  2,  2,-13,-20,-13, -8;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='F'; M= -9,-15,-14,-21,-15, 29,-17,-12, -1,-12,  2, -1,-10,-16,-17, -6, -9, -4, -1,  3, 11,-15; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='Q'; M= -7,  2,-21,  5,  9,-22, -9, -2,-17,  3,-13, -7,  0, -7, 14,  3, -1, -5,-16,-20,-11, 11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='L'; M=-10, -9,-21, -9, -7,  0,-21,-10,  4,-15,  7,  1, -8,-14,-11,-14,-11, -7, -1,-20, -3,-10; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M:         M=  0, -9,-19,-11, -6, -7,-12,-10, -3, -9, -6, -2, -7,-10, -5, -9,  0, -3, -3,-19, -6, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='D'; M= -8,  7,-25,  9,  3,-24,-11, -2,-16, -4,-20,-12,  6, -9,  6, -7,  3, -3,-15,-29,-12,  3;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-24,  9,  7,-21,-10, -6,-17, -6,-13,-12,  3,-11,  2, -9,  0, -4,-16,-28,-12,  4;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-23, -1,  5,-20,-15, -4,-14, -3,-10, -7, -2,-13,  4, -4,  1,  0,-12,-27,-11,  4;
/M: SY='E'; M=-10,  0,-27,  3,  8,-17,-20,-10,-12, -5, -3, -7, -5, -9,  0, -8,-11,-10,-15,-20,-11,  4;
/M: SY='T'; M= -7, -7,  1,-13,-13, -7,-18,-16,-10,-14, -4, -5, -5,-21,-12,-11,  0, 13, -4,-28,-10,-13;
/M: SY='Q'; M= -7, -5,-18, -9, -4,-23, -6,-10,-18,  0,-18, -8,  0,-15,  6,  4,  3,  5,-15,-25,-14,  0;
/M: SY='F'; M=-12,-10, -4,-14, -7,  7,-16,-13,-16,-12,-10, -8, -7,-17,-12,-12, -8, -9,-14,-19, -5, -8;
/M: SY='P'; M= -8,  0, -8, -1,  0,-22,-16, -7,-18, -6,-19, -7, -1,  3, -1,-10,  2,  1,-16,-33,-17, -2;
/M: SY='S'; M= -5,  3,-23,  2, -2,-14,  0,-12,-19,-11,-19,-15,  4, -9, -7,-13,  5,  0,-16,-26,-14, -5;
/M: SY='N'; M= -7,  5,-18,  0, -5,-20, -8, -7,-15, -2,-19, -9, 11,-11, -3,  0,  1, -3,-14,-30,-16, -5;
/M: SY='C'; M=  0,-12, 40,-18,-12,-20,-18,-13,-22,-14,-16,-13,-12,-25, -9,-15, -4, -7,-11,-33,-17,-11;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-18, -7, -6,-22,-11,-14,-10,-12,-18,-11, -3,  8, -6,-15, -1, -6,-12,-31,-20, -8;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-16, -2, -8,-15,-12, -6, -9,-10,-16,-11, 10,-13, -8,-10, 11, 10, -3,-34,-15, -8;
/M: SY='A'; M= 16,-10,-15,-16,-11,-15, -9, -3, -6,-13, -8, -2, -7,-15, -8,-15,  6,  3,  1,-26,-11,-11;
/M: SY='V'; M=  5,-22,-15,-26,-21, -3,-24,-24, 15,-12,  4,  6,-21,-23,-20,-15, -8, -1, 26,-24, -9,-21;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -4,  1,-16,-14, -8,-17, -3,-18,-11,  3,-11, -1, -1, 19, 24, -9,-32,-12, -1;
/M: SY='H'; M=-14,  4,-29,  4, 11,-22,-18, 56,-26, -1,-20, -6,  9,-15, 14,  1, -5,-14,-28,-27,  7, 10;
/M: SY='S'; M= 12, -5,-15, -9, -6,-18,-11,-16,-11, -5,-16,-11, -3, -8, -5, -9, 14, 14, -3,-29,-15, -6;
/M: SY='N'; M= -8, 12,-22,  8,  1,-21,-12, -2,-16, -1,-21,-14, 17,-11, -1, -2,  7,  4,-15,-33,-14, -2;
/M: SY='T'; M= -4,  2,-23,  2,  2,-21,-13, -5,-19, -2,-18,-13,  2,  0, -3, -5,  4,  5,-14,-30,-15, -2;
/M: SY='R'; M= -8, -2,-22, -6, -1,-11,-11, -8,-16,  0,-11, -9,  5,-17, -3,  8,  0,  0,-14,-26,-11, -3;
/M: SY='P'; M=-10,  0,-30,  8,  6,-27,-16,-10,-25,  5,-24,-17, -4, 20, -1,  5, -4, -7,-22,-29,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-11, -6,-28, -6,  3,-23,-21,-10,-23, 32,-19, -5, -4, -9,  5, 27,-10, -6,-16,-21,-10,  3;
/M: SY='T'; M= -6,  0,-20, -4,  1,-19,-20, -9,-12, -2,-10, -6,  0,-13,  9, -1,  6, 17,-10,-27,-10,  4;
/M: SY='R'; M= -8,  2,-25,  2, 10,-22,-11,  4,-24,  5,-20,-12,  4,-13, 10, 12,  2, -1,-21,-25,-10,  8;
/M: SY='I'; M= -3,-28,-20,-34,-27,  0,-32,-27, 35,-25, 19, 16,-24,-24,-22,-24,-16, -6, 32,-23, -5,-27;
/M: SY='Q'; M= -3,  2,-22,  1,  8,-25,-16,  0,-19,  4,-19,-10,  2,-10, 13,  0,  8,  7,-16,-28,-11, 10;
/M: SY='F'; M=-10,-29,-17,-33,-27, 29,-30,-21, 17,-24, 19, 13,-25,-29,-28,-19,-19, -7, 20,-12,  9,-26;
/M: SY='F'; M=-10,-10,-22,-13,-11,  8,-21,-12, -3,-14, -3,  1, -8,-16,-13,-13, -6,  0, -3,-12,  3,-11;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='V'; M= -6,-10,-21,-15,-12,-13,-25,-18,  7, -3, -5,  1, -7,-17, -8, -8, -4,  5, 10,-26, -8,-11;
/M: SY='A'; M= 41,-11,-13,-19,-10,-20, -3,-20,-10,-10,-12,-10,-11, -2,-10,-20,  8,  0, -1,-22,-21,-10;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-40, -7,  1,-30,-20,-19,-21,-10,-30,-20,-18, 86,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30, -9;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P'; M=  2, -2,-22,  1, 10,-23,-12,-10,-18,  3,-20,-14, -2, 11,  2, -5,  3, -3,-16,-25,-18,  5; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='D'; M=  1,  8,-21,  9,  0,-22, -4, -9,-19, -7,-21,-17,  6, -1, -6,-12,  7,  0,-15,-28,-16, -4; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-24,-11,-12,-11, 19,-16,-22,-14,-13,-11, -5,-19,-14,-13, -1, -8,-16,-19,-13,-13;
/M: SY='S'; M= -1, -7,-12, -8, -4,-18,-15,-12,-12, -8,-17,-11, -3, -5, -4, -8, 12, 10, -5,-33,-16, -5;
/M: SY='G'; M= -4,  1,-30,  4, -9,-31, 49,-15,-39,-12,-30,-21,  4,-17,-14,-15,  0,-17,-30,-24,-27,-11;
/M: SY='C'; M=-11, -2, 45, -7, -7,-24,-22, -3,-28,-14,-21,-16, -1,-26, -5,-14, -4, -8,-19,-40,-19, -6;
/M: SY='V'; M=  0,-28,-15,-31,-29, -1,-31,-29, 32,-22, 11, 11,-26,-26,-26,-22,-11, -1, 42,-27, -8,-29;
/M: SY='Q'; M= -5,-11,-21,-14, -7,-13,-21,-10,  0, -5, -4,  0, -6,-19,  3, -3, -2, -1,  0,-23, -5, -4;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-21,-37,-28, 53,-31,-21, 11,-30, 20,  7,-23,-29,-33,-21,-22,-10,  7, -1, 19,-28;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-23,-12, -6,-12,-19, -7,-10, 10, -8,  2, -4,-19, -1, 18, -7, -3, -6,-22, -6, -5;
/M: SY='A'; M= 44,-12, -5,-21,-12,-19, -3,-21, -8,-11, -9, -9,-12,-13,-12,-20,  8,  0,  3,-22,-20,-12;
/M: SY='T'; M=  1, -2,-12,-10,-10,-11,-14,-17,-10,-10,-11, -6,  0,-11, -8,-10, 19, 37, -2,-30,-11, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-28,-17,-33,-28,  2,-31,-29, 32,-23, 12, 11,-25,-25,-26,-23,-12, -4, 37,-24, -6,-28;
/M: SY='V'; M=  7,-20,-14,-23,-20, -5,-22,-20, 12,-12,  1,  4,-19,-22,-17,-15, -4,  2, 23,-21, -3,-19;
/M: SY='Q'; M=-11,  0,-28,  2, 21,-27,-21, 10,-20,  9,-15, -5, -2,-11, 29,  5, -4, -8,-24,-22, -6, 24;
/M: SY='H'; M= -5,  2,-23, -1,  0,-22, -8,  9,-24,  7,-23,-10,  7,-15,  2,  9,  5, -1,-18,-28,-10,  0;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-30,-10, -4, -9, -3, -4,-23,  5,-18,-11, -6,-13, -2, 11, -9,-12,-21,-10,  3, -5;
/M: SY='Q'; M= -5, -2,-25, -3, -2,-17,-16, -5,-11, -1,-12, -6, -2,-16,  1, -2, -4, -5, -9,-23, -6, -2;
/M: SY='V'; M= -2,-22,-21,-25,-17, -8,-29,-23, 23,-16,  6,  8,-19,-20,-13,-18,-10, -3, 24,-25, -8,-17;
/M: SY='W'; M=-19,-29,-32,-33,-26, 37,-28,-11, -2,-21, -1, -4,-25,-29,-23,-18,-24,-15, -9, 50, 42,-24;
/M: SY='W'; M=-19,-32,-34,-37,-28, 38,-24,-20,-11,-23, -7,-10,-27,-29,-27,-19,-26,-18,-16, 73, 29,-23;
/M: SY='V'; M=  0,-17,-17,-20,-11,-11,-23,-15,  9, -7,  3, 11,-18,-20, -5, -9, -8, -3, 15,-25, -9, -8;
/M: SY='D'; M=-12, 22,-29, 32,  9,-34,  8, -7,-37,  5,-30,-23, 10,-12, -2, -4,  0,-11,-27,-31,-20,  3;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='D'; M= -6,  3,-20,  7,  3,-17,-17, -7, -3, -9, -8, -7, -2,-12, -5,-12, -2, -5, -1,-26,-10, -2; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -4, -6,-26, -3, -4,-25, 28,-13,-29,-10,-24,-17, -2,  4, -9,-11, -1,-12,-24,-21,-23, -8; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='S'; M=  5, -8,-20,-11, -8,-11, -6,-15,-13,-10,-19,-12, -1, -1,-10,-11,  9,  1, -9,-27,-15,-10;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-20,-26,-17,  1,-29,-20, 17,-22, 29, 13,-24,-25,-15,-15,-20, -6, 12,-22, -4,-17;
/M: SY='T'; M=  3, -8,-17,-12, -8,-12,-16,-18,-10, -7,-15,-10, -4, -1, -9, -8, 11, 18, -4,-27,-13, -9;
/M: SY='K'; M= -6,-11,-22,-12, -4,-18,-23,-14, -6, 11, -8, -1,-10,-17,  2,  4, -6, -2,  1,-24, -9, -1;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-28, -5,  4,-24,-18, -8,-15,  9,-17, -7, -4, -5,  8, 12, -6, -7,-13,-25,-14,  4;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-26,-20, -1,-27,-21, 19,-22, 14, 11,-19, -9,-18,-20,-16, -6, 13,-24, -7,-21;
/M: SY='C'; M= -1,-16, 68,-23,-23,-17,-24,-25,-19,-22,-11,-13,-16,-32,-23,-24, -8, -8, -4,-40,-23,-23;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-26,  0, 23,-20,-19, -7,-18,  2,-13,-12, -6, -2,  7,  2, -3, -7,-17,-26,-15, 14;
/M: SY='Q'; M=-11, -4,-30, -1, 13,-27,-17,  3,-19,  3,-16, -7, -4,  0, 17,  5, -5,-10,-22,-25,-12, 13;
/M: SY='D'; M= -8,  6,-24,  8,  4,-18, -2, -9,-22, -2,-19,-14,  4,-15, -4, -6,  0, -7,-16,-27,-15,  1;
/M: SY='A'; M=  4, -8,-21,-10, -9,-17,-12,-17, -7,-11,-10, -6, -8,  1,-10,-12,  1,  4, -4,-27,-16,-11;
/M: SY='D'; M= -5, 11,-21, 12, -1,-21,-14,-12,-17, -8,-18,-16,  6,  0, -8,-12,  7, 10,-11,-34,-17, -5;
/M: SY='A'; M=  5, -9,-21,-10, -5,-10,-12,-15,-13, -9,-11, -9, -9, -2, -8,-13, -1,  0, -9,-21,-11, -7;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E'; M=  1, -2,-24,  0,  7,-22,-16,-12,-14,  2,-15,-11, -5, -1, -2, -4, -2, -5,-10,-28,-17,  1;
/M: SY='A'; M=  9,  1,-22,  1, -1,-25, -1,-13,-21, -3,-20,-15,  1,  1, -6,-10,  3, -4,-16,-27,-20, -4;
/M: SY='T'; M=  3,-10,-18,-13, -8,-13,-13,-16, -7,-11, -9, -6,-10, -5, -9,-13,  5, 12, -1,-25,-10, -9;
/M: SY='Q'; M=  0,  1,-19, -1,  4,-23,-16, -8,-13, -1,-15, -8, -1,-12, 11, -4,  8, 10, -9,-28,-13,  8;
/M: SY='E'; M= -5,  0,-27,  4,  6,-21,-14, -1,-20, -1,-20,-13, -3,  2,  1, -7, -2, -8,-18,-25,-11,  3;
/M: SY='P'; M= -9,-10,-32, -4, 11,-23,-20,-11,-20,  2,-21,-13,-11, 34,  0, -6, -5, -6,-23,-26,-17,  3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2016_05 which contains 551'193 sequence entries.


Total number of hits 25 in 25 different sequences
Number of true positive hits 25 in 25 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Reelin
Version [info] 3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
25 sequences

DFP11_HYPCU (O96382    ), DFP11_SAMRI (Q765V4    ), DFP1_ANTMY  (Q0Q029    ), 
DFP1_LONON  (Q5MGQ0    ), DFP2_ANTMY  (P0C963    ), DFP3_ANTMY  (Q0Q028    ), 
DFP_BOMMO   (Q008X1    ), DFP_DROME   (Q9V3Y3    ), DFP_LOCMI   (Q25313    ), 
DFP_MANSE   (Q86RS3    ), FRRS1_BOVIN (A2VE04    ), FRRS1_DANRE (A4QP81    ), 
FRRS1_DROME (Q8MSU3    ), FRRS1_HUMAN (Q6ZNA5    ), FRRS1_MOUSE (Q8K385    ), 
FRRS1_XENLA (Q6INU7    ), RELN_HUMAN  (P78509    ), RELN_MOUSE  (Q60841    ), 
RELN_RAT    (P58751    ), SPON1_BOVIN (Q9GLX9    ), SPON1_CHICK (Q9W770    ), 
SPON1_HUMAN (Q9HCB6    ), SPON1_MOUSE (Q8VCC9    ), SPON1_RAT   (P35446    ), 
SPON1_XENLA (P35447    )
» more

PDB
[Detailed view]
3 PDB

2ZOT; 2ZOU; 3COO

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission