Entry: PS51029

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MADF
Accession [info] PS51029
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51029
Associated ProRule [info] PRU00372

Name and characterization of the entry

Description [info] MADF domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=87;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=87;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1081318; R2=0.0117999; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1155.94842; R2=29.50716; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=627; N_SCORE=8.5; H_SCORE=17149; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=453; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14641; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -1, -3,-14, -1,  9,-15,-16, -8,-18,  7,-10, -1, -4, -6, 15, 13, -4,-10,-15,-19, -9,  9;
/M: SY='F'; M=-12,-18,-12,-26,-22, 45,-23,-17, 16,-16, 31,  6,-15,-34,-23,-17,-16, -7, 12,-11, 27,-22;
/M: SY='I'; M= -1,-18,-12,-33,-26,  3,-14,-20, 49,-20, 21, 10, -5,-31,-21,-26,-11,  1, 34,-28, -3,-26;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-14,  9, 19,-26,-15, -1,-22,  6,-12, -7, -1, -3, 15,  3,  0, -9,-19,-20,-13, 17;
/M: SY='L'; M=  5, -6, -9, -6,  4, -8,-15,-10,  2, -3,  8,  7, -8,-15,  0,-12, -4,  1,  0,-26, -5,  3;
/M: SY='Y'; M= -9,-23,-33,-19,-25, 16,-26,-17, 23,-15, 19, -1,-23,-31,-20, -9,-14,  1, 31, -2, 34,-25;
/M: SY='R'; M=  1, -8,-22, -4, 11,-17,-13, -6,-22, 16,-18,  3, -8,  0, 18, 26,  0,-13,-17,-16,-11, 11;
/M: SY='Q'; M=  0,  2,-16,  4,  9,-19,-12, -7,-18,  8,-14, -3,  2, -5, 11,  9,  1, -6,-16,-24,-13,  8;
/M: SY='H'; M=-11, -8,-29, -8, -1, -8,-20, 21,-15, -2, -5,  1, -2,-10, 10,  9, -8, -9,-14,-17,  6,  2;
/M: SY='P'; M= -6,-14,-26, -5, 11,-35,-11,  5,-27,  9,-25,-29,-22, 74,  6, -4, -6, -1,-33,-27,-17,  4;
/M: SY='C'; M= -6,-14, 51,-20, -2,-12,-22,-30,  1,-15,  1, -7, -9,-24,-14,-15, -7, -6,  1,-24,-27, -7;
/M: SY='L'; M= -8,-12, -5,-16,-15, 17,-19,-13, 28,-20, 35, 17,-16,-30,-20,-21,-18,  0, 16,-22, 22,-15;
/M: SY='W'; M=-44,-42,-35,-29,-15, 20, -6,-31,-21,-16,  0,-22,-56,-27,-11,  0,-25,-33,-13,136, 63,-15;
/M: SY='D'; M= -1, 35,-20, 46,  5,-31, -9,-11,-23,  1,-13,-13, 27,-14, -5, -9, -1, -4,-20,-45,-19,  0;
/M: SY='R'; M= -1,-10,-24, -8, -2,-15,-14, -3,-12,  4,-12, -4,-10,  8,  6, 10, -1, -2,-10,-22, -7, -2;
/M: SY='Q'; M=  2,  0,-23, -1, -3,-14,-11, -7,-13,  3,-12, -2,  5, -8,  6,  6,  5,  3,-10,-28,-11, -1;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='H'; M= -6,  5,-18,  8,  0,-20,-15, 23,-12, -7, -3,  1,  4, -9, -6,-10, -5, -6,-14,-35, -7, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='P'; M= -3, -7,-21, -1,  8,-23,-10, -2,-19,  8,-16,-15,-11, 33,  2, -2, -2, -4,-20,-24,-13,  3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='D'; M= -2, 11,-21, 15,  0,-15, -4,-10,-15, -1, -8, -9,  9,-13, -5, -8, -1, -6,-14,-26,-10, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='Y'; M=-23,-21,-41,-16,-15, 22,-21,  6,-10, -7, 12, -8,-21,-17,-10, -4, -9,-10, -1, 13, 40,-16;
/M: SY='R'; M= -3, -9,-20, -9, -2, -7,-10,-10,-13,  6,-10,  2, -7,-10,  7, 17, -5,-11,-10,-14, -5, -2;
/M: SY='N'; M= -2, 13,-15, 12,  1,-16, -9, -9,-13,  3,-12, -4, 18,-14, -4, -3,  1, -2,-14,-35,-15, -3;
/M: SY='K'; M=  0, -4,-23, -5,  2,-13,-10, -9,-14, 11,-13,  3, -1, -2,  5, 10,  0, -5,-12,-23,-11,  1;
/M: SY='E'; M=  5,  0,-17,  6, 13,-24,-14, -7,-15,  6,-11, -7, -4,  4,  9, -4,  3,  1,-13,-27,-14, 11;
/M: SY='M'; M= -2, -8,-14, -6, -3, -6,-17,-12, -4, -2,  1,  2, -7,-14,  1,  1, -6, -3, -1,-19,  0, -3;
/M: SY='R'; M= -4,-11,-21, -9, -3, -7,-16,-14,-14, 11,-11,  5, -9, -8,  8, 27, -5,-11, -6,-14, -3, -1;
/M: SY='Q'; M=  2,  3,-22,  6,  6,-20,-11, -3,-16,  5,-11, -3,  1, -4,  7,  1,  1, -4,-14,-27,-13,  5;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-16,  6, 14,-23,-14, -5,-20, 10,-14, -4, -2,  2, 13,  9,  0, -8,-18,-23,-14, 12;
/M: SY='A'; M= 18, -6,-21, -9, -8, -7, -6,-19,  7, -6,  0,  5, -4,-18, -2,-12,  2,  5, 10,-34,-19, -8;
/M: SY='W'; M=-39,-39,-24,-32,-13, 17, -1,-36,-18,-17, -4,-20,-54,-28,-11, -3,-24,-35,-17,134, 48,-12;
/M: SY='E'; M=  4,  3,-17,  7, 10,-22, -8,-11,-15,  5,-11, -5, -2, -6, 10,  1,  1, -5,-13,-23,-14,  9;
/M: SY='E'; M=  4, -5,-13, -1, 18,-20,-13, -7,-16,  9,-10,  0, -7, -4, 17,  8, -1, -8,-15,-17,-12, 17;
/M: SY='I'; M=  2,-18,-17,-29,-24,  5,-17,-17, 42,-16, 21, 13, -8,-32,-21,-21,-12,  2, 32,-28,  1,-24;
/M: SY='A'; M= 16, -3,-20, -4, -3,-15, -1,-18,  0, -4, -7, -2, -4,-14, -2,-11,  8,  5,  3,-29,-21, -5;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-18,  4,  9,-21,-10, -7,-11,  5, -9, -2,  0, -6,  6, -1,  0, -4,-12,-26,-14,  6;
/M: SY='E'; M=  3,  2,-11,  6, 17,-22,-15,-10,-14,  9, -9, -2, -2, -5,  7, -2,  0, -6,-12,-24,-14, 13;
/M: SY='L'; M= -5,-15, -8,-20,-16, 14,-21,-12, 19,-14, 25, 12,-14,-29,-18,-16,-14,  0, 15,-20, 14,-16;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M=  0,  6,-24, -3, -1,-23, 22,-12,-13,  2,-18, -7, 14, -9,  0, -6, -2,-10,-25,-17,-24, -1;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L'; M= -3,-11,-10,-12, -9, -1,-17,-16,  9,-10, 12,  4,-11,-21,-10,-13, -8,  1,  8,-17,  6,-10;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='S'; M=  8,  8,-24, 12, -1,-25, -6,-12,-14, -1,-12,-13,  4,  3, -3,-13, 14, 13, -9,-37,-18, -4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='I'; M=  7,-10,-19,-13,-11,-10, -8,-17, 13, -6, -2,  0, -7,-14,-11,-11, -3,  1, 12,-27,-11,-12;
/M: SY='E'; M=  2,  4,-16, 12, 17,-28,-13, -8,-21,  8,-12, -9, -3,  4, 10,  0,  2, -5,-17,-23,-14, 13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-17,  6,  7,-18,-14, -4,-13,  2, -5, -4, -3, -6,  2, -7,  0, -3,-11,-26, -9,  5;
/M: SY='C'; M= -6,-13, 33,-21,-12, -5,-23,-26, 15,-19, 10,  0, -7,-28,-20,-18,-11, -1, 12,-27,-13,-15;
/M: SY='K'; M=  0, -8,-18, -7,  8, -8,-14,-13,-12, 12, -7,  5, -9, -6,  4,  8, -3, -9, -8,-16, -5,  5;
/M: SY='R'; M=  2, -7,-17, -7,  4,-12,-14,-13,-10, 10, -8,  7, -6, -8,  5, 12, -1, -6, -7,-19, -9,  3;
/M: SY='R'; M=  0, -9,-20, -6,  5,-14,-15,-13,-19, 16,-17,  6, -8, -1, 15, 29, -3,-11,-12,-17,-10,  6;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='W'; M=-31,-38,-21,-36,-16, 12, -2,-34, -4,-18, -3,-13,-45,-30,-14, -8,-23,-30, -7,109, 33,-16;
/M: SY='K'; M=  0,  1,-23, -2,  4,-10,-11,-10,-13, 14,-13,  6,  7, -6,  5,  7,  1, -2,-14,-26,-10,  2;
/M: SY='N'; M=  4,  7,-18, -2, -2,-14, -6, -8, -4,  1,-13, -2, 19,-13,  0,-10,  6,  6,-11,-37,-20, -2;
/M: SY='L'; M= -5,-11, -8,-13,-11, 11,-19, -5, 18,-13, 30, 21,-15,-29,-17,-17,-17,  0, 10,-24, 18,-11;
/M: SY='R'; M= -7,-17,-22,-10, -7, -9,-19, -5,-22,  8,-14,  4,-17,-10, 21, 57, -9,-23, -8, -7,  0, -1;
/M: SY='D'; M=  0, 10,-12, 17, -1,-19,-13,-17,-15, -3, -6,-11,  4,-11, -5,-11,  4,  4, -8,-30,-10, -4;
/M: SY='Q'; M=  0, -5,-13, -5,  1,-14,-11,-11,-15,  2,-13, -5, -3,-10, 11, 10,  1, -3,-13,-15,-11,  3;
/M: SY='Y'; M=-31,-28,-48,-21,-24, 44,-29, -8, -5,-10, 27, -9,-30,-26,-15, -3,-17,-11, 10, 32, 67,-24;
/M: SY='R'; M= -2,-10,-22, -9, -7,-10,-14,  1, -9,  0, -8,  3, -7,-12,  3, 16, -3, -7, -4,-21, -4, -5;
/M: SY='R'; M= -2,-10,-22, -5,  0,-13,-16, -8,-18, 10,-15,  3,-10, -7, 15, 33, -3,-13,-10,-13, -6,  3;
/M: SY='E'; M= -1, -7,-11, -2, 25,-19,-18, -2,-16,  7, -4, -5,-11, -2, 15, -5, -2, -9,-15,-10, -4, 22;
/M: SY='L'; M= -7,-12,-14,-14, -6,  8,-20,-10,  3, -4, 10,  7,-11,-19, -6, -1,-10, -6,  2,-15, 10, -7;
/M: SY='R'; M=  0, -5,-20, -5,  1,-12,-13, -8,-13, 11,-11,  9, -2, -7,  7, 18, -4, -9,-10,-23,-10,  1;
/M: SY='R'; M= -1, -9,-22, -7,  1,-12,-14, -8,-14,  9,-12,  5, -9, -6, 13, 23, -4,-10,-10,-15, -5,  4;
/M: SY='I'; M=  1,-12,-19,-14, -9, -5,-14,-10,  8, -5,  3,  5, -9,-19, -5, -6, -6, -2,  7,-18, -2, -9;
/M: SY='Q'; M= -1, -5,-17, -5,  3,-15,-13, -4, -9,  3, -7,  1, -3, -5,  9,  6, -4, -6,-11,-23, -9,  4;
/M: SY='K'; M=  1, -3,-19, -4,  4,-13,-12, -8,-10,  5, -8,  0, -1, -5,  5,  1,  1,  0, -9,-24, -8,  3;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='Q'; M=  0, -4,-19, -3, -1,-10, -1,  0, -8, -2, -6, -2, -5, -7,  2,  0,  0, -5, -9,-10, -5, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='G'; M=  2, -1,-18, -2,  0,-15,  5, -8, -7,  1, -9, -6, -1,  0, -3, -7,  3, -2,-10,-16,-12, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E'; M=  1,  2,-13,  3,  4,-17, -1,-13,-11,  2,-10, -7,  2, -5,  1, -5,  1, -3,-12,-18,-13,  2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K'; M= -2, -3,-16, -1,  0,-13, -6,-10, -7,  1, -4, -4, -6,  0, -3, -5, -2, -1, -9,-18, -5, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Y'; M= -6, -9,-19, -9, -1,  0,-15, -9, -7,  1, -1, -4, -7, -5, -1, -3, -3, -3, -5, -9,  5, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Q'; M=  1, -6,-18, -7,  2,-14, -7, -7, -9,  3, -9, -4, -5,  4,  5,  0, -2, -3,-11,-21,-11,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-19, -4,  1,-16, -8, -9, -8,  2,-12,-10, -5, 11, -2, -7,  6,  5,-10,-27,-14, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='K'; M= -2, -7,-19, -6,  3,-14,-15, -8,-14,  9,-10,  2, -7,  0,  4,  7,  1, -2,-10,-19, -6,  1;
/M: SY='W'; M=-27,-30,-20,-26,-13, 15, -7,-28,-10,-14,  1,-12,-38,-24,-11, -3,-19,-23, -9, 78, 33,-13;
/M: SY='W'; M=-14,-14,-19, -8,  1, -3,-13,-15,-17,  0, -7,-13,-19, -3,  0,  2, -7,-13,-14, 16,  9, -2;
/M: SY='Y'; M=-23,-24,-36,-21,-18, 28,-24,  5, -5,-12, 18, -4,-24,-22,-12, -7,-14,-11,  2, 17, 43,-18;
/M: SY='F'; M=-10,-16,-25,-18,-16, 27,-21,-14, -2, -8, 12, -7,-13,-21,-12, -9, -6, -5,  5, -4, 20,-17;
/M: SY='E'; M=  0,  7,-19, 16, 18,-26,-11, -7,-23, 12,-13, -6, -1,  2,  8,  3, -1,-10,-21,-22,-12, 13;
/M: SY='E'; M=  2, -3,-21,  1,  8,-17,-14, -1,-13,  5, -8,  0, -6, -4,  6,  3,  1, -4,-11,-24, -8,  5;
/M: SY='M'; M= -2,-13, -5,-18, -9, -1,-21,  3, 11, -3, 24, 29, -8,-31,-14,-11,-17, -1,  3,-25,  6,-10;
/M: SY='D'; M=  0, -1,-21,  4,  3,-15, -9, -5,-14,  2, -8, -5, -6, -8,  0,  0,  3, -5,-12,-18, -7,  0;
/M: SY='F'; M=-21,-30,-26,-47,-37, 89,-28,-30,  0,-11, 19,-18,-13,-39,-28,-10,-11,-20,  9, 15, 30,-37;
/M: SY='L'; M= -4,-11, -9,-14,-11, 10,-17, -8, 17,-11, 29, 22,-13,-28,-16,-17,-15,  2,  9,-23, 17,-11;
/M: SY='Q'; M= -1,  1,-22,  9,  7,-20,-13, -7,-18,  4, -9, -6, -7, -2, 10,  8, -3, -7,-13,-20, -5,  6;
/M: SY='P'; M=  2,  6,-18, 12, 10,-28,-11, -6,-18,  4,-14,-13,  0, 13,  4, -7,  1, -1,-18,-32,-17,  6;
/M: SY='H'; M= -5,-13,-25,-14, -7, -4,-17, 10,  0, -7,  0,  0, -9,-11, -8, -8, -5, -5,  0,-21,  0, -9;
/M: SY='I'; M= -1, -8,-18,-10, -8, -2,-13,-12, 10, -7,  9,  2, -7,-18,-10,-13, -5, -1,  7,-21,  1, -9;
/M: SY='Q'; M=  3, -2,-20,  1,  5,-20, -9, -8,-13,  3,-11, -5, -4,  0,  7,  1,  3,  0,-12,-24,-11,  4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 1
Number of true positive hits 1
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MADF
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
1 sequence

ADF1_DROME  (P05552)

			
		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission