Entry: PS51030

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NUCLEAR_REC_DBD_2
Accession [info] PS51030
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2004 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00031
Associated ProRule [info] PRU00407

Name and characterization of the entry

Description [info] Nuclear hormone receptors DNA-binding domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=76;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=71;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4627326; R2=0.0106523; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=798.07642; R2=27.86681; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=567; N_SCORE=8.5; H_SCORE=11360; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=380; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11360; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -8, -4,-23, -4, -4,-20,-12,-10,-18, -7,-19,-12,  0, -4, -4,-10,  0, -2,-14,-28,-17, -5;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-26, -5,  6,-23,-12, -4,-21,  3,-19,-11, -2,-10,  3, -3,  1, -6,-15,-27,-16,  5;
/M:         M= -7,-12,-19,-14, -8,-16,-21,-10, -9, -3, -7, -5, -7,-11, -6, -8, -6, -5, -7,-27,-13, -8;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='A'; M=  5,-14,-15,-14, -4,-19,-17,-15, -9, -2, -6, -1,-12,-13,  1, -6,  0, -2, -3,-26,-16, -3;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-10,-30,-23, -7,-32,-30, 32,-23, 13,  9,-30,-23,-23,-30,-20, -3, 36,-30,-10,-23;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-25, -3, -7,-24, 21, -9,-31,-10,-30,-21,  2,-16, -8,-12,  4,-11,-25,-24,-21, -8;
/M: SY='D'; M= -9, 11,-26, 15,  7,-27, -9, -8,-26,  1,-27,-18,  6,-13,  2, -1,  0, -6,-22,-33,-22,  4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -7, -9,-25, -8, -2,-26,-14,-11,-22,  2,-20,-13, -6,  7, -2, -3, -2, -6,-17,-30,-20, -2;
/M: SY='A'; M= 18,-14, -8,-14, -9,-20, -3,-16,-13, -7,-14,-11, -9, -9, -9,-11, 10,  1, -6,-28,-18, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S'; M=  1, -5,-11, -6, -8,-14,-12, -5,-14,-11,-15,-11,  1,-16, -9,-13,  8,  5,-11,-25,-12, -8;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-22, -9,-10,-27, 26,-15,-31,-10,-29,-21,  0,-18,-10,-11,  2,-11,-23,-23,-24,-10;
/M: SY='Y'; M=-12,-16,-20,-19,-11, -1,-24, -4,-10, -3, -6, -4,-10,-22, -6, -6, -8,-11,-10,-15,  5,-11;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='H'; M=-19,  4,-30, -8,  0,-14,-17, 28,-29, -5,-28,-19, 17,-20,  1,  3, -7,-16,-29,-23, 11,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-29,-20,-30,-22, 35,-29, 12, -8,-22, -8, -8,-22,-32,-15,-22,-20,-20,-10, 16, 57,-22;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -5,-16,-29, 50,-18,-37,-18,-38,-28,  3,-19,-17,-18,  2,-17,-29,-23,-29,-16;
/M: SY='V'; M=  9,-25, -8,-25,-18,-11,-18,-25, 12,-17,  1,  1,-24,-18,-17,-22,-10, -1, 20,-28,-13,-17;
/M: SY='L'; M= -7,-21,-17,-20,-15, -8,-26,-15,  0,-14,  1,  1,-17,-12,-12,-16,-10, -7, -1,-22,-10,-14;
/M: SY='S'; M= 14,-12, -2,-12, -9,-18, -9,-17,-10, -8,-10, -7, -6,-13, -8,-13, 18, 10, -6,-28,-19, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='N'; M=-12,  2,-25, -2,  0,-18,-12, -1,-22, -1,-20,-13, 11,-18, -2, -1,  0, -7,-21,-27,-12, -2;
/M: SY='G'; M= 18,-14,-16,-14,-14,-25, 29,-19,-25,-14,-25,-20, -8,-15,-14,-14,  6, -9,-16,-25,-25,-14;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='K'; M= -1, -4,-18,-11,  2,-26,-16,-13,-22, 27,-17,-10, -3,-12,  2,  7,  4, -5,-15,-30,-20,  2;
/M: SY='A'; M=  8,-18,-12,-18,-15,-17,  1,-20, -9,-13, -9, -1,-11,-16,-10,-14,  3, -1, -4,-23,-19,-13;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-30,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-30,-30, 60,-30,-10,  0,-30,  0,  0,-30,-40,-30,-30,-20,-20,-10, 10, 30,-30;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-29,-19,  0,-29,-19, -1,-30, 21,-20,-10,  0,-19,  9, 44, -8,-10,-29,-29,-19,  0;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-30,-19,  1,-30,-20,  0,-30, 20,-20,-10,  1,-20, 10, 48, -9,-10,-30,-30,-20,  1;
/M: SY='T'; M=  5,-13, -8,-14,-10,-17,-15,-18, -6, -9, -7, -3, -5,-13, -9,-12,  9, 21,  0,-24,-17,-10;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-11,-29,-22, -4,-32,-25, 22,-20, 12,  9,-26,-24,-20,-25,-17, -4, 24,-24, -7,-21;
/M: SY='M'; M= -5,-21,-14,-22,-14,-10,-26,-15,  1,-11,  1,  2,-16,-21, -9,-10, -9, -2,  2,-19,-10,-13;
/M: SY='N'; M= -7, -2,-24, -4,  2,-22,-10, -8,-19,  2,-16, -8,  5,-15,  1, -3,  3, -4,-16,-28,-18,  1;
/M: SY='K'; M=-12,  7,-29, -2,  5,-28, -8, -3,-30, 19,-25,-15, 15,-14,  4,  9,  2, -7,-24,-29,-19,  4;
/M: SY='K'; M= -8,-13,-21,-18, -6,-16,-23, -9,-12,  6, -5, -2, -7,-18,  0,  5, -5, -6,-11,-24,-10, -6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='K'; M= -9, -3,-22, -7,  0,-19,-16, -6,-17,  3,-16, -9,  2,-16,  1,  0,  0, -1,-13,-26,-13,  0;
/M: SY='Y'; M=-17,-27,-20,-27,-20, 24,-28,  7, -7,-19, -7, -7,-20,-27,-14,-20,-17,-17, -9,  8, 44,-20;
/M: SY='K'; M= -3, -9,-18,-11, -2,-19,-18,-10,-13,  2,-13, -7, -5,-14, -2, -3, -1,  2, -7,-26,-14, -2;
/M: SY='C'; M=  1,-29, 85,-29,-38,-20,-29,-29,-10,-29,-10,-10,-29,-29,-29,-29, -9,-10,-10,-21,-20,-29;
/M: SY='K'; M= -8,-10,-24,-15, -2,-21,-19, -8,-19, 12,-14, -6, -4,-14,  4, 11, -2, -7,-17,-24,-14, -1;
/M:         M= -7,-11,-20,-15, -8, -7,-12, -4,-19,  0,-15, -9, -6,-21, -5,  0, -5,-11,-17,-18, -4, -7;
/M: SY='N'; M=-11,  8,-27,  5,  2,-24, -1, -4,-27, -2,-26,-16, 15,-17, -1, -6,  4, -6,-24,-25,-19,  0;
/M: SY='N'; M=-10,  6,-30,  0,  0,-29,  8, -7,-32,  3,-30,-20, 15,-13, -1, -2,  2, -9,-26,-28,-23, -1;
/M: SY='N'; M=-13, 10,-28,  6,  5,-24,-11, -1,-25,  4,-24,-14, 16,-14,  4,  0,  2, -5,-22,-31,-18,  4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='C'; M= -1,-30, 86,-30,-40,-17,-30,-29,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-19,-18,-30;
/M:         M= -9,-11,-22, -9, -2,-12,-22,-10,-10, -8,-11, -8, -9,-12, -5,-12, -6, -5, -7,-23, -7, -4;
/I:         I=-3; MD=-13;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-15,-18,-14, -9,-29,-22, 16,-17,  6,  4,-19,-22,-16,-21,-13, -4, 16,-28,-13,-15; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='N'; M= -9, 11,-19, 12,  3,-23, -9, -7,-21, -5,-24,-16, 13,-15, -3,-10,  6,  1,-19,-31,-21,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-13;
/M: SY='K'; M= -7, -6,-20,-11, -1,-18,-17, -6,-19, 13,-16, -9, -3,-14,  0,  2,  0, -4,-14,-24,-11, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-13;
/M:         M= -6, -5,-22, -5, -2,-17,-12, -6,-16, -5,-17,-11, -2,-10, -4, -9,  0, -4,-12,-25,-12, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-13;
/M:         M= -6, -9,-20,-11, -8,-11, -9, -7,-14, -7,-14, -8, -3,-17, -6, -9,  0, -3,-12,-20, -9, -8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-13;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-26,-16, -1,-26,-18, -1,-23, 13,-17, -9, -1,-15,  5, 27, -7, -7,-21,-28,-16, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-13;
/M: SY='N'; M= -9, -7,-10,-12,-11,-19,-17, -7,-16, -6,-16,-10,  4,-11, -7, -6, -3, -4,-14,-28,-13, -9;
/M: SY='K'; M= -3,-14,-18,-18, -8,-12,-19,-12,-11,  2, -8, -4, -8,-17, -4,  0, -4, -5, -8,-23,-10, -7;
/M: SY='C'; M=  0,-29, 84,-29,-38,-20,-30,-29,-11,-26,-10,-10,-29,-29,-28,-28,-10,-10,-10,-20,-20,-28;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-29,-14,  5,-30,-20, -3,-30, 22,-20, -8,  0,-14, 17, 34, -5, -9,-26,-28,-18,  7;
/M: SY='A'; M=  4,-15,-14,-16, -8, -7, -9, -1,-17, -6,-15,-11,-10,-17, -6,-10,  2, -8,-13,-16,  4, -8;
/M: SY='C'; M= -1,-30, 85,-30,-40,-19,-30,-30,-11,-30,-10,-10,-30,-30,-40,-30,-11,-10,-11,-14,-18,-30;
/M: SY='R'; M=-10,-11,-29,-20, -1,-29,-21, -1,-27, 18,-18, -9, -1,-20,  8, 46,-10,-10,-27,-30,-20, -1;
/M: SY='F'; M=-17,-31,-18,-31,-25, 33,-32, -8,  1,-23,  6,  4,-26,-33,-18,-23,-19,-17, -6,  5, 26,-24;
/M: SY='Q'; M= -8,  0,-27, -3, 11,-26,-18, -3,-25, 15,-19, -8,  1,-13, 16,  9,  0, -7,-18,-27,-16, 12;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-30,-10,  9,-29,-20, -8,-29, 41,-19, -9,  1,-12, 12, 20, -1,-10,-20,-29,-19, 10;
/M: SY='C'; M=  0,-29, 85,-29,-38,-20,-29,-39,-10,-29,-10,-10,-28,-29,-29,-29, -8, -9,-10,-20,-20,-29;
/M: SY='L'; M= -9,-33,-13,-33,-26,  2,-32,-23, 17,-22, 21, 11,-27,-28,-21,-23,-19,-10, 12,-19, -3,-26;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-27,  2, 13,-25,-17, -5,-23, 10,-20,-11,  1,-14, 10,  4,  0, -7,-18,-29,-18, 11;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V'; M=  4,-24,-11,-24,-14,-11,-22,-24, 12,-14,  5,  7,-22,-18,-13,-20, -9, -3, 18,-27,-13,-14;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 58,-20,-40,-19,-40,-30,  0,-20,-19,-19,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='M'; M=-10,-31,-10,-31,-21,  0,-31,-21, 12,-12, 21, 46,-21,-21, -3,-12,-11,-10, 11,-12,-10,-12;
/M: SY='K'; M=-12,  6,-26,  1,  2,-24,-16, -6,-21, 10,-19,-12, 10,-16,  2,  5,  0, -3,-18,-31,-19,  1;
/M: SY='P'; M= -5,-17,-21,-16, -7,-21,-22,-14,-16, -1,-12, -8,-14,  5, -3, -4, -6, -7,-11,-27,-15, -6;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-29,  6, 13,-26,-12, -6,-24,  3,-24,-16,  4, -9,  4, -4,  0, -6,-18,-30,-19, 10;
/M: SY='A'; M= 11,-12,-12,-13, -7,-20, -7,-14,-13, -6,-13, -9, -7, -8, -7,-11,  6, -1, -7,-28,-17, -8;
/M: SY='V'; M= -4,-24,-13,-26,-19, -7,-29,-23, 16,-16,  6,  5,-21,-21,-17,-18,-13,  0, 18,-26,-10,-19;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-28, -3,  8,-25,-15, -4,-26,  8,-20, -7,  0,-14, 20,  9, -2, -8,-20,-24,-14, 11;
/M:         M= -8, -8,-21,-10, -4,-16,-15, -3,-19, -4,-17, -9, -3, -9, -2, -6, -3, -6,-15,-23,-11, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 462 in 462 different sequences
Number of true positive hits 460 in 460 different sequences
Number of 'unknown' hits 2 in 2 different sequences
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 7
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DNA_BIND
Feature description [info] Nuclear receptor
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
460 sequences

7UP1_DROME  (P16375), 7UP2_DROME  (P16376), ANDR_CANFA  (Q9TT90), 
ANDR_CROCR  (Q8MIK0), ANDR_EULFC  (O97776), ANDR_HUMAN  (P10275), 
ANDR_LITCT  (Q7T1K4), ANDR_MACFA  (O97952), ANDR_MACMU  (Q6QT55), 
ANDR_MOUSE  (P19091), ANDR_PANTR  (O97775), ANDR_PAPHA  (O97960), 
ANDR_PIG    (Q9GKL7), ANDR_RABIT  (P49699), ANDR_RAT    (P15207), 
CNR14_CAEEL (P41830), COT1_BOVIN  (Q9TTR8), COT1_HUMAN  (P10589), 
COT1_MOUSE  (Q60632), COT2_BOVIN  (Q9TTR7), COT2_CHICK  (Q90733), 
COT2_HUMAN  (P24468), COT2_MOUSE  (P43135), COT2_RAT    (O09018), 
E75BA_DROME (P17672), E75BB_DROME (P13055), E75BC_DROME (P17671), 
E75_CHOFU   (O01639), E75_GALME   (P50239), E75_MANSE   (Q08893), 
E75_METEN   (O77245), E78C_DROME  (P45447), ECR_AEDAE   (P49880), 
ECR_BOMMO   (P49881), ECR_CHITE   (P49882), ECR_DROME   (P34021), 
ECR_HELVI   (O18473), ECR_LUCCU   (O18531), ECR_MANSE   (P49883), 
EGON_DROME  (P15370), ERR1_CANFA  (Q6QMY5), ERR1_HUMAN  (P11474), 
ERR1_MOUSE  (O08580), ERR1_RAT    (Q5QJV7), ERR2_HUMAN  (O95718), 
ERR2_MOUSE  (Q61539), ERR2_RAT    (P11475), ERR3_HUMAN  (P62508), 
ERR3_MOUSE  (P62509), ERR3_PONAB  (Q5RAM2), ERR3_RAT    (P62510), 
ESR1_ASPUN  (Q91424), ESR1_BOVIN  (P49884), ESR1_CHICK  (P06212), 
ESR1_DANRE  (P57717), ESR1_FELCA  (Q53AD2), ESR1_HORSE  (Q9TV98), 
ESR1_HUMAN  (P03372), ESR1_ICTPU  (Q9YHZ7), ESR1_MESAU  (Q9QZJ5), 
ESR1_MICUN  (P57753), ESR1_MOUSE  (P19785), ESR1_ONCMY  (P16058), 
ESR1_OREAU  (P50240), ESR1_ORENI  (Q9YH33), ESR1_ORYLA  (P50241), 
ESR1_PAGMA  (O42132), ESR1_PIG    (Q29040), ESR1_RAT    (P06211), 
ESR1_SALSA  (P50242), ESR1_SHEEP  (P49885), ESR1_SPAAU  (Q9PVZ9), 
ESR1_TAEGU  (Q91250), ESR1_XENLA  (P81559), ESR21_CARAU (Q9W669), 
ESR22_CARAU (Q9IAL9), ESR2_ANGJA  (O13012), ESR2_BOVIN  (Q9XSB5), 
ESR2_CALJA  (Q95171), ESR2_CHICK  (Q9PTU5), ESR2_COTJA  (O93511), 
ESR2_HUMAN  (Q92731), ESR2_ICTPU  (Q9IAK1), ESR2_MICUN  (P57781), 
ESR2_MOUSE  (O08537), ESR2_ONCMY  (P57782), ESR2_ORENI  (Q9YH32), 
ESR2_PIG    (Q9XSW2), ESR2_RAT    (Q62986), ESR2_SHEEP  (Q9TU15), 
ESR2_SPAAU  (Q9W6M2), ESR2_STUVU  (Q9PVE2), ESR3_MICUN  (P57783), 
FTF1B_DROME (Q05192), FTZF1_BOMMO (P49867), FTZF1_DROME (P33244), 
GAG_AVIER   (P03373), GCNFA_DANRE (Q9PU65), GCNFB_DANRE (Q4V8R7), 
GCR_AOTNA   (P79686), GCR_CALJA   (Q6XLJ0), GCR_CAVPO   (P49115), 
GCR_HUMAN   (P04150), GCR_MOUSE   (P06537), GCR_ONCMY   (P49843), 
GCR_PAROL   (O73673), GCR_PIG     (Q9N1U3), GCR_PONAB   (Q5R9P5), 
GCR_RABIT   (P59667), GCR_RAT     (P06536), GCR_SAGOE   (P79269), 
GCR_SAIBB   (O13186), GCR_SAISC   (O46567), GCR_SHEEP   (P35547), 
GCR_TUPBE   (Q95267), GCR_XENLA   (P49844), HNF4A_HUMAN (P41235), 
HNF4A_MOUSE (P49698), HNF4A_RAT   (P22449), HNF4A_XENLA (Q91766), 
HNF4B_XENLA (P79926), HNF4G_HUMAN (Q14541), HNF4G_MOUSE (Q9WUU6), 
HNF4_DROME  (P49866), HR38_BOMMO  (P49870), HR38_DROME  (P49869), 
HR3_DROME   (P31396), HR3_GALME   (P49868), HR3_MANSE   (Q08882), 
HR4_DROME   (Q9W539), HR78_DROME  (Q24142), HR96_DROME  (Q24143), 
KNIR_DROME  (P10734), KNIR_DROVI  (Q24753), KNRL_DROME  (P13054), 
MCR_AOTNA   (Q3YC04), MCR_HUMAN   (P08235), MCR_MOUSE   (Q8VII8), 
MCR_ONCMY   (Q9IAC6), MCR_RAT     (P22199), MCR_SAIBB   (Q4JM28), 
MCR_SAISC   (Q9N0W8), MCR_TUPBE   (Q29131), MCR_XENLA   (Q91573), 
N2C1A_XENLA (Q6GN21), N2C1B_XENLA (Q66J63), N2F1A_DANRE (Q06725), 
N2F1B_DANRE (Q6PH18), NH100_CAEEL (O17611), NH103_CAEEL (O16359), 
NH106_CAEEL (O16966), NH108_CAEEL (O45449), NH111_CAEEL (O45521), 
NH115_CAEEL (O16662), NH121_CAEEL (Q9TZ99), NH124_CAEEL (O16391), 
NH125_CAEEL (O17082), NH127_CAEEL (O18087), NH130_CAEEL (O16963), 
NH133_CAEEL (O16354), NH134_CAEEL (O16361), NH136_CAEEL (O01930), 
NH150_CAEEL (O17573), NH153_CAEEL (O01929), NH154_CAEEL (O01931), 
NH164_CAEEL (O17657), NH167_CAEEL (O17683), NH169_CAEEL (O17706), 
NH174_CAEEL (O17748), NH197_CAEEL (O17931), NH199_CAEEL (O17934), 
NH213_CAEEL (O18048), NH217_CAEEL (O02305), NH218_CAEEL (O18086), 
NH268_CAEEL (O17930), NHR10_CAEEL (P41999), NHR11_CAEEL (Q23294), 
NHR12_CAEEL (Q21701), NHR13_CAEEL (Q9N4Q7), NHR14_CAEEL (O02151), 
NHR16_CAEEL (Q27521), NHR18_CAEEL (O16360), NHR19_CAEEL (Q09528), 
NHR1_CAEEL  (Q21878), NHR1_ONCVO  (Q25604), NHR20_CAEEL (Q09565), 
NHR22_CAEEL (Q09587), NHR23_CAEEL (P41828), NHR25_CAEEL (Q19345), 
NHR28_CAEBR (A8XNK6), NHR28_CAEEL (Q17905), NHR2_CAEEL  (Q10902), 
NHR31_CAEEL (Q18192), NHR34_CAEEL (Q21006), NHR35_CAEEL (Q17771), 
NHR3_CAEEL  (Q9XTJ4), NHR40_CAEEL (Q22127), NHR41_CAEEL (Q9N4B8), 
NHR42_CAEEL (O76828), NHR44_CAEEL (Q22555), NHR47_CAEEL (Q17370), 
NHR48_CAEEL (Q94407), NHR49_CAEEL (O45666), NHR4_CAEEL  (O45436), 
NHR51_CAEEL (O17927), NHR52_CAEEL (O17928), NHR53_CAEEL (O17933), 
NHR54_CAEEL (O45460), NHR55_CAEEL (O16962), NHR57_CAEEL (O16425), 
NHR59_CAEEL (Q9TXJ1), NHR5_CAEEL  (Q9NA51), NHR61_CAEEL (O62389), 
NHR62_CAEEL (O02279), NHR64_CAEEL (O44960), NHR65_CAEEL (O45907), 
NHR67_CAEEL (Q9XVV3), NHR69_CAEEL (P91829), NHR6_CAEEL  (P41829), 
NHR71_CAEEL (Q9GTD4), NHR75_CAEEL (O16604), NHR77_CAEEL (O02316), 
NHR79_CAEEL (O18141), NHR7_CAEEL  (Q20765), NHR85_CAEEL (Q9XUK7), 
NHR86_CAEEL (Q965W2), NHR89_CAEEL (O02235), NHR8_CAEEL  (Q9XYB7), 
NHR90_CAEEL (O17025), NHR91_CAEEL (Q9U2R6), NHR96_CAEEL (Q95X91), 
NHR97_CAEEL (Q9BJK5), NHR98_CAEEL (Q966I0), NHR9_CAEEL  (Q23489), 
NR1D1_BOVIN (Q08E02), NR1D1_HUMAN (P20393), NR1D1_MOUSE (Q3UV55), 
NR1D1_RAT   (Q63503), NR1D1_SHEEP (B3SV56), NR1D2_HUMAN (Q14995), 
NR1D2_MOUSE (Q60674), NR1D2_RAT   (Q63504), NR1H2_BOVIN (Q5BIS6), 
NR1H2_HUMAN (P55055), NR1H2_MOUSE (Q60644), NR1H2_RAT   (Q62755), 
NR1H3_BOVIN (Q5E9B6), NR1H3_HUMAN (Q13133), NR1H3_MOUSE (Q9Z0Y9), 
NR1H3_RAT   (Q62685), NR1H4_BOVIN (Q3SZL0), NR1H4_HUMAN (Q96RI1), 
NR1H4_MOUSE (Q60641), NR1H4_RAT   (Q62735), NR1I2_HUMAN (O75469), 
NR1I2_MACMU (Q8SQ01), NR1I2_MOUSE (O54915), NR1I2_RAT   (Q9R1A7), 
NR1I3_CALUR (P62044), NR1I3_HUMAN (Q14994), NR1I3_MACMU (Q8MIM3), 
NR1I3_MOUSE (O35627), NR1I3_PANTR (A2T7D9), NR1I3_PHOSI (P62045), 
NR1I3_RAT   (Q9QUS1), NR2C1_BOVIN (A0JNE3), NR2C1_HUMAN (P13056), 
NR2C1_MACFA (Q95K90), NR2C1_MOUSE (Q505F1), NR2C1_PONAB (Q5RCZ5), 
NR2C1_RAT   (Q8VIJ4), NR2C1_XENTR (Q28CK1), NR2C2_HUMAN (P49116), 
NR2C2_MOUSE (P49117), NR2C2_RAT   (P55094), NR2E1_CHICK (Q91379), 
NR2E1_HUMAN (Q9Y466), NR2E1_MOUSE (Q64104), NR2E1_ORYLA (Q9YGL3), 
NR2E1_XENLA (P70052), NR2E3_BOVIN (Q9TTF0), NR2E3_HUMAN (Q9Y5X4), 
NR2E3_MOUSE (Q9QXZ7), NR2F5_DANRE (Q06726), NR2F6_HUMAN (P10588), 
NR2F6_MOUSE (P43136), NR2F6_RAT   (O09017), NR4A1_BOVIN (Q0V8F0), 
NR4A1_CANFA (P51666), NR4A1_HUMAN (P22736), NR4A1_MOUSE (P12813), 
NR4A1_RAT   (P22829), NR4A1_XENLA (Q04913), NR4A2_BOVIN (Q08E53), 
NR4A2_HUMAN (P43354), NR4A2_MOUSE (Q06219), NR4A2_PONAB (Q5R5Y4), 
NR4A2_RAT   (Q07917), NR4A2_XENTR (A4IIG7), NR4A3_HUMAN (Q92570), 
NR4A3_MOUSE (Q9QZB6), NR4A3_RAT   (P51179), NR5A2_CHICK (O42101), 
NR5A2_HUMAN (O00482), NR5A2_MOUSE (P45448), NR5A2_RAT   (Q9QWM1), 
NR6A1_HUMAN (Q15406), NR6A1_MOUSE (Q64249), NR6A1_PIG   (A0P8Z4), 
NR6A1_XENLA (P70033), NR6A1_XENTR (Q66JK1), ODR7_CAEEL  (P41933), 
PPARA_CANFA (Q95N78), PPARA_CAVPO (O35507), PPARA_HUMAN (Q07869), 
PPARA_MOUSE (P23204), PPARA_PHACI (Q8HYL6), PPARA_RAT   (P37230), 
PPARA_XENLA (P37232), PPARD_CANFA (Q0ZAQ8), PPARD_HUMAN (Q03181), 
PPARD_MOUSE (P35396), PPARD_XENLA (P37233), PPARG_BOVIN (O18971), 
PPARG_CANFA (Q4U3Q4), PPARG_CRIGR (P57797), PPARG_HUMAN (P37231), 
PPARG_MACMU (O18924), PPARG_MOUSE (P37238), PPARG_PIG   (O62807), 
PPARG_RABIT (O19052), PPARG_RAT   (O88275), PPARG_XENLA (P37234), 
PRGR_ATEPA  (A7XW25), PRGR_CANFA  (Q9GLW0), PRGR_CEBAP  (A7XW16), 
PRGR_CHICK  (P07812), PRGR_CHLAE  (A7X8C9), PRGR_COLGU  (A7X8D2), 
PRGR_GORGO  (A7X8B7), PRGR_HUMAN  (P06401), PRGR_HYLLA  (A7X8C2), 
PRGR_MACSY  (A7X8C4), PRGR_MOUSE  (Q00175), PRGR_PANPA  (A7X8B5), 
PRGR_PANTR  (A7X8B3), PRGR_PAPAN  (A7X8C7), PRGR_PITIR  (A7XW20), 
PRGR_PONPY  (A7X8B9), PRGR_RABIT  (P06186), PRGR_RANDY  (Q8AYI2), 
PRGR_RAT    (Q63449), PRGR_SHEEP  (Q28590), PRGR_TRAOB  (A7X8D4), 
RARAA_DANRE (Q90271), RARAB_DANRE (Q7ZTI3), RARA_CANFA  (Q5FBR4), 
RARA_CHICK  (Q90966), RARA_HUMAN  (P10276), RARA_MOUSE  (P11416), 
RARA_NOTVI  (P18514), RARA_TAKRU  (Q9W5Z3), RARA_XENLA  (P51126), 
RARB_CHICK  (P22448), RARB_COTJA  (Q9W6B3), RARB_HUMAN  (P10826), 
RARB_MOUSE  (P22605), RARB_NOTVI  (P18515), RARGA_DANRE (Q91392), 
RARGB_DANRE (A2T928), RARG_HUMAN  (P13631), RARG_MOUSE  (P18911), 
RARG_NOTVI  (P18516), RARG_XENLA  (P28699), RORA_HUMAN  (P35398), 
RORA_MOUSE  (P51448), RORB_HUMAN  (Q92753), RORB_MOUSE  (Q8R1B8), 
RORB_RAT    (P45446), RORG_HUMAN  (P51449), RORG_MOUSE  (P51450), 
RORG_PONAB  (Q5RAP4), RXRAA_DANRE (A2T929), RXRAB_DANRE (Q90415), 
RXRA_HUMAN  (P19793), RXRA_MOUSE  (P28700), RXRA_RAT    (Q05343), 
RXRA_XENLA  (P51128), RXRBA_DANRE (Q7SYN5), RXRBB_DANRE (Q90417), 
RXRB_CANFA  (Q5TJF7), RXRB_HUMAN  (P28702), RXRB_MOUSE  (P28704), 
RXRB_RAT    (P49743), RXRGA_DANRE (Q90416), RXRGB_DANRE (Q6DHP9), 
RXRG_BOVIN  (Q0VC20), RXRG_CHICK  (P28701), RXRG_HUMAN  (P48443), 
RXRG_MOUSE  (P28705), RXRG_PIG    (Q0GFF6), RXRG_PONAB  (Q5REL6), 
RXRG_RAT    (Q5BJR8), RXRG_XENLA  (P51129), RXR_BIOGL   (Q8T5C6), 
RXR_LYMST   (Q5I7G2), SHR2_STRPU  (Q26622), STF1_BOVIN  (Q04752), 
STF1_HORSE  (Q9GKL2), STF1_HUMAN  (Q13285), STF1_MACEU  (Q95L87), 
STF1_MOUSE  (P33242), STF1_PIG    (P79387), STF1_RAT    (P50569), 
THAA_DANRE  (Q98867), THAA_PAROL  (Q91241), THAA_XENLA  (P15204), 
THAB_PAROL  (Q91242), THAB_XENLA  (P18115), THA_APTPA   (O42295), 
THA_CAIMO   (Q90382), THA_CHICK   (P04625), THA_HIPHI   (Q9W6N4), 
THA_HUMAN   (P10827), THA_LITCT   (Q02777), THA_MOUSE   (P63058), 
THA_NECMA   (O57606), THA_PIG     (O97716), THA_PYGAD   (O42450), 
THA_RAT     (P63059), THA_SALSA   (Q9W785), THA_SHEEP   (Q28570), 
THBA_XENLA  (P18117), THBB_XENLA  (P18119), THB_CAIMO   (P68305), 
THB_CHICK   (P68306), THB_DANRE   (Q9PVE4), THB_HUMAN   (P10828), 
THB_LITCT   (Q02965), THB_MOUSE   (P37242), THB_PAROL   (Q91279), 
THB_RAT     (P18113), THB_SHEEP   (Q28571), TLL_DROME   (P18102), 
TLL_DROVI   (O16845), USP_BOMMO   (P49700), USP_CHOFU   (O76202), 
USP_DROME   (P20153), USP_MANSE   (P54779), VDRA_DANRE  (Q9PTN2), 
VDRB_DANRE  (Q1L673), VDR_BOVIN   (Q28037), VDR_CHICK   (O42392), 
VDR_COTJA   (P49701), VDR_HUMAN   (P11473), VDR_MOUSE   (P48281), 
VDR_PIG     (A3RGC1), VDR_RAT     (P13053), VDR_SAGOE   (Q95MH5), 
VDR_XENLA   (O13124)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
7 sequences

ESR1_ANOCA  (Q9YHT3), ESR1_MACMU  (P49886), ESR2_MACMU  (Q9TTE5), 
PRGR_MACEU  (P79373), THA_ELECQ   (Q9PUA8), THA_ONCMY   (Q9W6I9), 
THA_SPAAU   (O57568)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences
2 sequences

TRX_DROME   (P20659), TRX_DROVI   (Q24742)

		
PDB
[Detailed view]
57 PDB

1A6Y; 1BY4; 1CIT; 1DSZ; 1GA5; 1GDC; 1GLU; 1HCP; 1HCQ; 1HLZ; 1HRA; 1KB2; 1KB4; 1KB6; 1LAT; 1LO1; 1R0N; 1R0O; 1R4I; 1R4O; 1R4R; 1RGD; 1RXR; 1YNW; 2A66; 2C7A; 2EBL; 2ENV; 2FF0; 2GDA; 2HAN; 2NLL; 3CBB; 3DZU; 3DZY; 3E00; 3FYL; 3G6P; 3G6Q; 3G6R; 3G6T; 3G6U; 3G8U; 3G8X; 3G97; 3G99; 3G9I; 3G9J; 3G9M; 3G9O; 3G9P; 3M9E; 4AA6; 4HN5; 4HN6; 4IQR; 4NQA
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission