![]() |
|
| Entry: PS51037 |
| General information about the entry | |
|---|---|
| Entry name | YEATS |
| Accession number | PS51037 |
| Entry type | MATRIX |
| Date | NOV-2004 (CREATED); NOV-2004 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE). |
| PROSITE Documentation | PDOC51037 |
| Associated ProRule | PRU00376 |
| Name and characterization of the entry | |
| Description | YEATS domain profile. |
| Matrix / Profile | /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=109;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=104;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.0450764; R2=0.0095835; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=778; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=570; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-6; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z
/I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='T'; M= 8, -6,-23,-10, -7, -4,-13,-18, 0, 1, -7, -3, -1,-10, -4,-10, 13, 15, 3,-30,-10, -8;
/M: SY='V'; M= -3,-17,-12,-20,-15, 10,-22,-23, 8, -2, 2, 3,-12,-22,-10, 9, -9, -8, 14,-17, 2,-15;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-27, 2, 1,-18,-15, -7,-26, 12,-18,-10,-12, 20, 9, 27, -8,-14,-19,-14, -3, 0;
/M: SY='I'; M= -3,-19,-17,-30,-27, 19,-19,-21, 39,-19, 22, 6,-10,-33,-23,-21,-12, 0, 32,-23, 8,-27;
/M: SY='V'; M= 2,-14,-21,-16, -9, 0,-19,-25, 18, 0, 0, 5,-13,-21,-16, -7, -7, -2, 20,-15, 1,-13;
/M: SY='V'; M= -4,-14,-28,-19,-24, 1,-13,-18, 20,-15, 13, 0, -9,-20,-14,-20, -4, 12, 21,-17, 13,-21;
/M: SY='G'; M= 2, -1,-31, -6, -6,-29, 40,-20,-10, -6,-16,-15, -2, -8, 5, -9, -3,-14,-24, -1,-22, -2;
/M: SY='N'; M= -2, 5, 14, -7, 3,-22,-17, -6,-11, -7,-14, -6, 22,-14, 20, -4, -5, 5,-20,-38,-28, 9;
/M: SY='T'; M= 4, -7,-25, -8, -9,-13,-18, 1, -4, -6, -5, 2, -2,-10, 1, -2, 4, 9, 3,-33, -7, -6;
/M: SY='A'; M= 19, -5,-25,-10,-11,-12, -2,-17, 12, -4, -3, 7, 1,-21, -7,-12, 4, 7, 12,-37,-23,-12;
/M: SY='F'; M= -6,-15,-17,-19, -8, 10,-19,-15, 2, -1, 5, 2,-10,-17, 1, 7, -8,-10, 2,-13, 4, -6;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-23,-11, 1,-13,-17, -4, -8, 0, -5,-10,-17, 17, 4, -3,-12, -2,-12,-10, 4, 0;
/I: I=-12; MD=-25;
/M: SY='I'; M= -4,-12,-13,-18,-14, 9, -6,-10, 10, -5, 7, 3, -5,-17, -7, 0, -7, -7, 7, -7, 2,-13; D=-12;
/I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E'; M= 0, -1, -7, 1, 14,-11, -7, -4,-10, 10, -7, -1, -4, 6, 2, -3, 3, -3,-11,-11, -7, 9; D=-12;
/I: I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M= 1, 0,-17, 5, 9,-16,-11, -3, -8, 6, -5, 1, -5, 2, 1, -4, -3, -5, -8,-21, -7, 5; D=-12;
/I: I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M= 3, -7, -1, -5, 18,-27,-15,-11,-20, 8,-15, -9, -9, 17, 13, -1, 0, -3,-19,-24,-22, 14;
/M: SY='D'; M= 0, 2,-20, 8, 3,-23,-14,-10,-17, 5,-15,-11, -1, 8, 6, 7, -4, -4,-13,-29,-13, 2;
/M: SY='P'; M= -2,-13,-20,-10, 5,-16,-15, -6, -3, 1, -4,-11,-17, 25, -5,-12, -6, -2, -7,-23, -6, -1;
/M: SY='D'; M= -1, 10,-20, 17, 11,-28,-12, -3,-24, 9,-17, -9, 6, 8, 5, 4, -3, -9,-21,-32,-17, 7;
/M: SY='G'; M= 1, -6,-30, -5, -8,-20, 13,-14, -7, -3, -7, -8, -7, -6, -6,-11, -2, -3,-10,-11, -9, -8;
/I: I=-10; MD=-22;
/M: SY='P'; M= -2, -2,-17, -1, 7,-22, -5, 2,-12, 4,-12, -9, -3, 20, 4, -7, -2, -2,-17,-21,-13, 5; D=-10;
/I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M= -2, 10,-20, 17, 4,-19, 1, -9,-15, 1, -8,-13, 4, -2, -4, -9, 0, -5,-14,-16, -7, 0; D=-10;
/I: I=-10; DM=-22;
/M: SY='L'; M= -3, -6,-14, -5, -5, 5,-16, -9, 0, -2, 9, 4, -6,-20, -8, -4, -8, -5, 2,-14, 7, -6; D=-10;
/I: I=-10; DM=-22;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-24,-13, -1,-12,-16, 19, -9, -4, -2, -4,-17, 25, -4,-10, -9, -2,-16,-29, -3, -4;
/M: SY='T'; M= 2, -9,-15,-14,-10,-12,-18,-15, 2, -6, 5, 6, -6,-14, -6,-18, 3, 19, 5,-19, 0, -7;
/M: SY='H'; M=-16,-19,-39,-15, -2,-21,-24, 69,-23, -5,-13, 7,-16, 12, 8, 16,-10,-20,-23,-27, 3, -1;
/M: SY='E'; M= 0, -3, -2, 0, 15,-21,-17,-13,-19, 8,-12, -4, -6, -3, 14, 7, 1, -4,-17,-20,-14, 14;
/M: SY='W'; M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10, 0,-30,-50,-30,200, 50,-10;
/M: SY='T'; M= 8, -4,-22, -9,-10,-16, -6,-13, -4, -1, -4, 3, 1, -9, 1,-10, 11, 19, -3,-31,-12, -6;
/M: SY='V'; M= 7,-19,-11,-25,-24, 1,-23,-22, 36,-15, 12, 9,-12,-36,-23,-14,-11, 5, 37,-31, -3,-25;
/M: SY='Y'; M=-20,-16,-31, -8, -3, 24,-25,-10,-13, -1, 14,-11,-20,-17, -8, -6,-11,-14, -2, 14, 37, -6;
/M: SY='I'; M= 1,-17,-13,-20,-23, 12,-23,-21, 37,-20, 22, 9,-16,-35,-25,-17,-13, 5, 35,-27, 13,-23;
/M: SY='R'; M= -4,-15,-11,-10, -5, -7,-19,-15,-13, 3, -9, 1,-15,-13, 11, 32, -6,-13, -3,-11, -1, -2;
/M: SY='G'; M= 0, -9, -6,-14, -8,-20, 14,-16, -3, -6, -5, -5, -7, -3,-13,-15, -4, -6,-13,-17,-22,-11;
/M: SY='P'; M= -5, -8,-19, -9, -4, -9, -6, -9, 1, -4, 1, -5,-10, 11,-10,-14,-10, -2, -7,-23, -2, -7;
/M: SY='D'; M= -3, 16, -6, 30, 8,-32,-10,-17,-26, -1,-10,-15, 2,-10, 5, 3, -4,-10,-19,-25,-14, 6;
/I: I=-9; MD=-19;
/M: SY='D'; M= 0, 4,-12, 10, 2,-15, -6, -4,-11, 1, -6, -8, -1, 7, 4, 1, -3, -2,-10,-17, -7, 1; D=-9;
/I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='D'; M= -1, 9,-20, 10, 10,-25, 5, -4,-18, 8,-15, -8, 7, 3, -3, -9, 1, -8,-23,-23,-18, 5; D=-9;
/I: I=-9; DM=-19;
/M: SY='E'; M= 3, -2, -3, 2, 25,-24, -7, -8,-13, 6, -5, -6, -8, -2, 5,-12, 1, -7,-14,-14,-14, 20; D=-9;
/I: I=-9; DM=-19;
/M: SY='D'; M= 1, 18,-23, 35, -4,-26,-13,-17,-12, -4, -6,-15, 3, -9, -9, -6, -2, -1, -2,-33, -7, -8; D=-9;
/I: I=-9; DM=-19;
/M: SY='I'; M= -4,-10,-15,-12, -5, -9,-12, -8, 13, -5, 9, 2,-10, 2,-10,-16,-10, -2, 4,-24, -2, -9; D=-9;
/I: I=-9; DM=-19;
/M: SY='S'; M= 15, -3,-21, -2, 4,-19, -5,-10,-10, 1,-15,-10, -3, 5, 4, -9, 18, 13, -8,-33,-23, 0; D=-9;
/I: I=-9; DM=-19;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-26, -2, -1,-11,-19, -1,-16, 2, -4, -5,-15, 1, 4, 10, -3, -5, -7,-12, 8, -1;
/M: SY='F'; M=-17,-27,-17,-40,-29, 44,-22,-26, 16,-15, 17, -9,-14,-34,-23,-15,-13,-13, 17, 11, 18,-30;
/M: SY='V'; M= 0,-20,-18,-26,-28, 26,-25,-25, 33,-18, 18, 1,-15,-37,-27,-15,-12, 2, 35,-21, 14,-28;
/M: SY='K'; M= 1, 2,-18, 9, 15,-21,-13,-13,-22, 16,-15, -3, -3, 1, 6, 8, 7, -4,-16,-22,-12, 10;
/M: SY='K'; M= -1, -4,-27, -2, 11,-10,-11,-17,-21, 29,-20, 11, -4, 3, 5, 23, 2,-11,-17,-17, -9, 6;
/M: SY='V'; M= 4,-20, 2,-23,-25, 4,-29,-31, 35,-21, 10, -1,-17,-38,-28,-13,-11, 6, 41,-29, 0,-27;
/M: SY='T'; M= 4,-10,-19,-15,-13,-12,-19,-20, 7,-10, -1, -2, -5,-12, 3,-11, 3, 19, 11,-23, -3, -7;
/M: SY='F'; M=-27,-30,-40,-37,-33, 77,-30,-20, -3,-10, 23,-17,-20,-33,-23, -7,-13,-17, 10, 23, 50,-33;
/M: SY='H'; M= -7, -8,-32,-10, 5, -7,-19, 25,-13, 9,-10, 11, -3, -1, -1, -1, -5,-11,-15,-26, -1, 2;
/M: SY='L'; M= -7,-12, -3,-14,-12, 15,-19, -8, 22,-16, 37, 23,-17,-31,-19,-19,-19, 0, 11,-22, 23,-12;
/M: SY='H'; M=-16,-15,-46,-13, 0,-29,-26,118,-20,-17,-11, 14, -8, 7, -1,-10, -5,-16,-28,-48, -2, -1;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-19, 6, 23,-36,-12, 1,-28, 13,-21,-25,-16, 54, 3, -8, -1, -5,-31,-25,-18, 13;
/M: SY='S'; M= 7, 2,-21, 3, -5,-16, -8,-13,-12, -2,-14,-14, 2, -7, -4, -7, 27, 21, -6,-33,-15, -8;
/M: SY='F'; M=-21,-27,-31,-40,-34, 76,-28,-23, 4,-12, 23,-13,-14,-36,-26,-11,-12,-15, 12, 10, 36,-34;
/I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= 3, -9,-23, -7, 6,-24, -7, -4,-13, 6,-15,-13,-11, 31, 1, -8, -1, 2,-18,-29,-18, 1;
/M: SY='N'; M= -3, 15,-17, 1, -6, -8, -8, 0, -5, -1,-11, 1, 35,-20, -3, -8, 0, 4,-15,-44,-17, -6;
/I: I=-15; MD=-32;
/M: SY='P'; M=-11,-11,-30, 1, 4,-28,-13, 12,-26, 4,-18,-25,-21, 59, 1, 0, -9, -6,-27,-21, -5, -2; D=-15;
/I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='I'; M= 0, -6,-19,-11, -9, -2,-16,-18, 9, 2, 0, 9, 0,-16, -8, -2, -5, 2, 8,-29, -3,-10;
/M: SY='R'; M= -7,-19,-22,-12,-10, -8,-22, 1,-15, 1,-11, 2,-18,-13, 19, 50,-10,-20, -3,-11, 2, -3;
/M: SY='V'; M= 6, -8,-20, -7,-12, -9,-20,-18, 6, -4, -2, 1, -8,-20, -9, -1, 2, 9, 14,-29, -3,-12;
/M: SY='V'; M= 0,-18,-12,-24,-18, 16,-22,-21, 18,-11, 11, 0,-12,-30,-18,-13, -7, -1, 21,-19, 3,-20;
/M: SY='T'; M= -1, 4,-21, 5, 2,-18,-17, -5,-12, 2, -7, -3, 5, -6, 0, -8, 4, 7, -8,-30, -6, 1;
/M: SY='D'; M= 5, 9,-21, 19, 8,-26, -7,-16,-18, 4,-12,-11, -1, -6, 2, -4, 7, 0,-12,-26,-14, 4;
/I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P'; M= -4,-16,-28,-11, 4,-24,-12, 8,-21, 4,-19,-23,-21, 59, 5, -3, -6, -1,-26,-28,-14, 0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0;
/M: SY='F'; M=-24,-30,-37,-41,-36, 84,-30,-23, -2,-10, 22,-18,-17,-36,-26, -8,-12,-18, 10, 19, 43,-36;
/M: SY='E'; M= 0, -4, -8, -1, 28,-21,-17, -6,-23, 14,-13, -6, -5, 0, 24, 9, -1,-13,-23,-13,-13, 27;
/M: SY='I'; M= -2,-16, -3,-25,-22, 4,-19,-21, 36,-20, 21, 8, -9,-30,-20,-23,-11, 5, 28,-28, 1,-21;
/M: SY='T'; M= 3, 5,-20, 2, 1,-23, -7, -6,-10, 1, -9, -3, 9, -4, -2,-16, 7, 10,-10,-35,-15, 1;
/M: SY='E'; M= 0, -1, 3, 6, 42,-31,-20, -4,-23, 15,-10, -8, -6, 2, 15, -1, -2,-17,-21,-14,-17, 35;
/M: SY='Q'; M= 4,-11,-20,-15, -5,-16,-18, -4, 3, -6, -5, -2, -5,-10, 14, 0, 1, 8, 2,-27, -8, 1;
/M: SY='G'; M= -1, -1,-36,-10,-19,-25, 71,-28, -7,-11,-14,-16, -2,-12,-20,-20, -2,-18,-26, 7,-24,-19;
/M: SY='W'; M=-40,-41,-24,-33, -9, 4, 12,-42,-26,-17,-17,-26,-57,-25, -4, 0,-25,-41,-28,158, 40, -8;
/M: SY='G'; M= 2, -1,-35, -9,-16,-24, 61,-26, -7, -9,-15,-15, -2,-12,-17,-19, 3,-13,-23, 1,-25,-17;
/M: SY='E'; M= 0, 5, -3, 14, 41,-39, -1, -7,-27, 13,-12,-14, -6, 5, 10,-12, 0,-19,-29, -9,-21, 33;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30, 0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='P'; M= -3, 2,-14, 9, 20,-29,-12, -3,-20, 8,-13,-18, -4, 23, 2,-12, 0, -5,-23,-24,-15, 12;
/M: SY='I'; M= 4,-17,-17,-25,-20, 6,-19,-11, 28, -9, 20, 20, -9,-33,-18,-15,-13, 1, 22,-27, 2,-20;
/M: SY='Q'; M= 1, -4,-19, -6, 3,-13,-11,-13,-10, 5, -9, -5, -2, -1, 8, 1, -2, -3,-10,-21,-11, 4;
/M: SY='I'; M= 2,-19,-19,-35,-27, 0,-14,-17, 50,-16, 20, 14, -4,-32,-20,-23,-12, 1, 36,-29, -5,-27;
/M: SY='Q'; M= 1, -5,-22, -3, 9,-19,-17, 0,-12, 10,-11, 5, -6, -4, 12, 8, -3, -6,-12,-22, -9, 9;
/M: SY='I'; M= 0,-17, 4,-25,-18, 1,-20,-21, 31,-17, 18, 10,-10,-32,-20,-19,-13, 1, 25,-28, -4,-19;
/M: SY='Y'; M=-18,-21,-39,-22,-15, 29,-26, 6,-10, -5, 9, -5,-16,-15, -4, -3, -9, -9, -3, 3, 31,-14;
/M: SY='F'; M=-22,-25,-35,-30,-29, 59,-28,-18, -1,-11, 23,-11,-18,-29,-20,-10,-11, -8, 10, 12, 43,-28;
/M: SY='M'; M= 1,-15,-24,-19,-12, -3,-19, -1, 9, -3, 2, 11, -8,-18, -2, 2, -7, -3, 9,-26, -2,-10;
/M: SY='D'; M= -1, 19,-20, 33, 17,-36, -8, -3,-27, 5,-14,-16, 7, 3, 3, -8, 0, -9,-25,-31,-17, 11;
/M: SY='K'; M= 2, 6,-22, 3, 9,-19, -1, -5,-13, 10,-15, 1, 10, -1, -3, -8, 2, -4,-18,-31,-20, 3;
/I: I=-14; MD=-29;
/M: SY='G'; M= 7, -1,-19, -4, -4,-14, 12,-16, -3, -1, -7, -2, -2, -6, -5,-11, 5, 2, -6,-16,-15, -5; D=-14;
/I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G'; M= 0, -2,-17, -5, 0,-25, 18,-16,-16, 0,-18,-14, 0, -1, 2, 0, 2,-10,-22,-13,-24, -1;
/M: SY='E'; M= 2, -3,-15, 0, 17,-24,-15, -6,-16, 14,-12, -1, -4, 7, 7, 1, -1, -4,-17,-24,-14, 12;
/M: SY='K'; M= 2,-10,-25,-12, -5, -3,-13, -9, -2, 6, -9, 3, -6,-11, -4, 6, 5, -3, 0,-23, -8, -8;
/M: SY='P'; M= 2,-10,-25, -9, 0,-17,-11, -2, -8, 4,-13, -7,-10, 21, -3, -5, 3, 4,-10,-30,-13, -5;
/M: SY='I'; M= 1,-17,-19,-29,-25, 9,-18,-20, 34,-16, 15, 3, -5,-26,-13,-20, -7, 7, 27,-27, 0,-22;
/M: SY='T'; M= 6, 1,-17, 1, 0,-15,-11,-11, -7, -2, -9, -8, 3, -6, 4, -5, 8, 10, -8,-32,-13, 0;
/M: SY='H'; M=-17,-20,-34,-22,-12, 3,-25, 53, 1,-17, 10, 11,-14,-12, -9, -9,-13,-13, -5,-24, 16,-12;
/M: SY='Y'; M=-10, -4,-30, 4, -6, 0,-18,-11, -3, -4, 9, -8,-10,-19,-10,-11, -6, -7, 2, -6, 17,-10;
/M: SY='H'; M=-14,-18,-26,-20,-12, 9,-25, 38, 7,-19, 17, 13,-15,-17,-14,-15,-14, -9, 1,-25, 19,-12;
/M: SY='H'; M= -2, 3,-22, 3, -2,-18,-16, 11,-12, -2,-10, 0, 7, -9, 3, 1, 0, -1,-11,-36,-10, -1;
/M: SY='F'; M=-12,-19, -7,-27,-20, 37,-23,-19, 11,-14, 22, -3,-16,-21,-22,-16,-14, -7, 9,-12, 17,-21;
/M: SY='R'; M= -1, -4,-21, -1, 1,-10,-16, -6,-14, 4,-10, -3, -4, -9, 10, 13, 0, -5,-10,-21, -5, 2;
/M: SY='L'; M= -1, -5,-12, -3, 1, -8, -8,-13, 2, -9, 9, 1,-12,-16, 2,-10,-10, -2, -4,-17, 4, 3;
/M: SY='D'; M= -3, 8,-27, 22, 3,-21,-16, 9,-15, -5, -6,-12, -3,-10, -8,-11, 3, -6, -9,-30, -4, -3;
/M: SY='P'; M= 5, -4,-22, 3, 10,-24,-11, 0,-18, 5,-14, -8, -9, 12, 11, 3, 3, -3,-16,-27,-15, 8;
/M: SY='Y'; M=-16,-11,-31, 1, -2, 6,-23, -8,-12, -3, 11,-10,-20,-14, -5, -3, -8, -7, 0, 7, 33, -5;
/M: SY='A'; M= 7, -3,-26, -3, -2,-27, 6, -4, -7, -1, -8, -2, -4, 0, -5,-14, -2, -3,-10,-26,-20, -4;
/M: SY='H'; M= -4, -5,-10, -8, -7,-14,-20, 5, 2, -8, -5, 0, 3,-17, -5, -2, -6, -5, 1,-34,-11, -7;
/M: SY='D'; M= 4, 9,-21, 14, 3,-27, -6,-13,-12, 0,-11,-12, 4, 1, 2, -6, 1, -2,-11,-32,-18, 0;
/I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
|
| Numerical results | |
|
|
| Comments | |
|
|
| Cross-references | |
| UniProtKB/Swiss-Prot | True positive hits:AF9_ASHGO (Q755P0), AF9_ASPFU (Q4WPM8), AF9_CANAL (Q59LC9), AF9_CANGA (Q6FXM4), AF9_CRYNB (P0CM09), AF9_CRYNJ (P0CM08), AF9_EMENI (Q5BC71), AF9_GIBZE (Q4I7S1), AF9_HUMAN (P42568), AF9_KLULA (Q6CIV8), AF9_MOUSE (A2AM29), AF9_NEUCR (Q7RZK7), AF9_SCHPO (Q10319), AF9_USTMA (Q4PFI5), AF9_YARLI (Q6CF24), AF9_YEAST (P53930), ENL_HUMAN (Q03111), SAS5_YEAST (Q99314), TAF14_SCHPO (O94436), TAF14_YEAST (P35189), YETS2_HUMAN (Q9ULM3), YETS2_MOUSE (Q3TUF7), YETS4_HUMAN (O95619), YETS4_MOUSE (Q9CR11)Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits: [Clustal format, color, condensed view]
[Clustal format, color]
[Clustal format, plain text]
[Fasta format]
|
| PDB [Detailed view] |
2L7E; 3FK3; 3QRL; 3RLS; |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)