ID CUT; MATRIX. AC PS51042; DT 01-NOV-2004 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE CUT domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=88; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=83; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9848237; R2=0.0174026; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5883.5385742; R2=6.7435899; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=346; H_SCORE=8217; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=202; H_SCORE=7246; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='N'; M=-6,15,-25,9,4,-24,-6,-2,-14,-4,-19,-12,20,-15,6,-7,2,-6,-19,-30,-17,4; MA /M: M=-5,-3,-25,-3,-3,-13,-1,-10,-17,-8,-14,-6,-3,-16,-3,-6,-2,-9,-14,-22,-11,-4; MA /M: SY='Q'; M=-2,10,-24,10,9,-30,-13,-2,-21,5,-19,-10,6,-12,18,0,2,-6,-21,-27,-14,14; MA /M: SY='V'; M=-3,-17,-20,-17,-13,-7,-22,-17,4,-11,-4,-2,-14,-8,-13,-13,-1,3,7,-24,-5,-14; MA /M: SY='S'; M=-1,-1,-22,0,1,-18,-1,-10,-21,-3,-16,-13,-1,-14,-4,-8,5,2,-15,-23,-9,-2; MA /M: SY='B'; M=-5,15,-24,13,5,-26,0,-4,-24,1,-22,-13,13,-13,3,-5,2,-4,-21,-29,-18,4; MA /M: SY='N'; M=-9,9,-24,6,2,-15,-1,-1,-17,-7,-13,-8,13,-18,-3,-8,-1,-7,-19,-26,-9,-1; MA /M: SY='E'; M=-6,0,-8,2,20,-25,-19,-9,-24,1,-20,-16,-3,-3,7,-4,5,4,-19,-32,-18,13; MA /I: I=-30; MD=-32; MA /M: SY='E'; M=1,1,-22,2,13,-19,-15,-8,-8,-5,-9,-3,-4,-9,2,-10,0,-5,-8,-25,-13,7; D=-30; MA /I: I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='L'; M=-10,-15,-23,-18,-8,-3,-25,-13,8,-13,22,12,-12,-23,-10,-11,-19,-9,0,-23,-5,-9; MA /M: SY='D'; M=-15,25,-26,30,3,-25,-15,-4,-14,-6,-15,-9,13,-15,-5,-12,-4,-8,-12,-35,-15,-2; MA /M: SY='T'; M=-1,1,-12,-8,-9,-3,-14,-14,-12,-11,-14,-12,7,-13,-10,-10,19,31,-6,-29,-9,-9; MA /M: SY='Q'; M=4,-8,-20,-10,2,-17,-17,-8,-9,-2,-9,-4,-8,-14,8,-5,1,0,-6,-21,-7,4; MA /M: SY='E'; M=-9,-4,-26,-2,15,-13,-14,1,-21,2,-14,-9,-3,-12,6,-1,-3,-8,-19,-23,-8,11; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-38,-29,10,-37,-28,40,-29,21,17,-22,-23,-23,-27,-20,-9,27,-17,3,-29; MA /M: SY='A'; M=14,-14,-14,-18,-15,-5,-14,-12,-1,-12,-7,-5,-12,-18,-13,-15,6,5,7,-17,3,-15; MA /M: SY='R'; M=-10,4,-26,8,13,-27,-15,8,-27,10,-24,-13,5,-12,16,17,5,-5,-23,-29,-12,13; MA /M: SY='R'; M=-15,-2,-29,-4,5,-19,-18,5,-26,12,-20,-12,4,-17,9,30,-6,-6,-23,-11,-7,5; MA /M: SY='V'; M=-6,-26,-10,-30,-26,-5,-33,-28,26,-17,7,9,-22,-25,-22,-19,-14,-6,30,-27,-8,-26; MA /M: SY='R'; M=-12,-6,-27,-6,4,-23,-21,-7,-23,28,-17,-6,-3,-15,11,31,-8,-5,-17,-21,-9,6; MA /M: SY='E'; M=-13,12,-28,20,32,-29,-18,11,-29,6,-21,-16,5,-7,17,4,0,-6,-27,-30,-13,23; MA /M: SY='E'; M=-9,-13,-23,-11,8,-6,-27,-14,2,-10,4,0,-15,-16,-3,-12,-11,-8,2,-23,-8,2; MA /M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-24,-11,4,-27,-14,14,-22,37,23,-25,-25,-12,-16,-25,-10,6,-21,-2,-11; MA /M: SY='K'; M=-7,-6,-25,-9,3,-18,-23,-15,-6,10,-13,-5,-4,-11,0,1,-2,2,-5,-25,-10,0; MA /M: SY='R'; M=-5,-3,-23,0,10,-21,-17,-8,-18,9,-17,-11,-3,-14,2,15,0,-4,-9,-28,-15,5; MA /M: SY='H'; M=-3,1,-25,-4,-2,-15,-15,30,-19,0,-18,-6,7,-18,6,-1,-4,-9,-20,-18,9,0; MA /M: SY='N'; M=-4,6,-11,0,-6,-24,8,-9,-27,-4,-29,-19,15,-7,-7,-8,6,-4,-24,-33,-23,-7; MA /M: SY='I'; M=-9,-29,-26,-37,-28,1,-36,-26,42,-27,21,23,-22,-22,-19,-26,-20,-9,29,-21,-1,-27; MA /M: SY='G'; M=1,-2,-22,-2,-6,-25,17,-12,-26,-12,-30,-20,8,3,-8,-14,16,1,-22,-32,-25,-8; MA /M: SY='Q'; M=-10,-3,-31,-1,17,-39,-20,6,-20,7,-21,-3,-3,4,50,6,-1,-10,-30,-21,-13,33; MA /M: SY='R'; M=8,-9,-20,-14,-5,-19,-13,-10,-20,11,-15,-10,-4,-15,0,28,1,0,-10,-21,-14,-5; MA /M: SY='I'; M=-6,-17,-19,-21,-16,-4,-25,-17,15,-19,14,8,-12,-24,-11,-16,-11,-4,12,-26,-7,-15; MA /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29,74,-30,-20,2,-30,14,2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,1,7,27,-29; MA /M: SY='A'; M=32,-10,-17,-16,-14,-24,25,-20,-21,-14,-17,-14,-6,-14,-14,-20,6,-7,-11,-20,-24,-14; MA /M: SY='E'; M=-12,6,-28,11,20,-28,-20,3,-25,17,-21,-12,1,-11,12,12,-5,-10,-19,-27,-12,15; MA /M: SY='H'; M=-11,-11,-23,-10,-3,-8,-24,12,-8,-1,-9,-2,-9,-20,-4,1,-8,-5,-2,-19,8,-5; MA /M: SY='V'; M=4,-25,-18,-29,-25,0,-27,-21,23,-19,7,7,-22,-23,-21,-21,-10,-4,27,-17,3,-25; MA /M: SY='L'; M=-4,-27,-19,-30,-20,12,-26,-19,15,-26,38,18,-26,-27,-19,-19,-24,-9,8,-17,0,-19; MA /M: SY='G'; M=-5,11,-12,1,-12,-23,23,-9,-28,-12,-27,-19,23,-20,-12,-12,6,-3,-25,-32,-24,-12; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='R'; M=-14,-16,-6,-17,-8,-13,-24,-12,-15,7,0,-2,-12,-24,-5,21,-16,-10,-9,-24,-10,-8; MA /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-5,-13,-17,-10,-25,-17,7,-10,-3,-10,35,28,-7,-37,-17,-3; MA /M: SY='Q'; M=-10,-3,-31,-1,17,-39,-20,6,-20,7,-21,-3,-3,4,50,6,-1,-10,-30,-21,-13,33; MA /M: SY='G'; M=0,-9,-27,-10,-19,-27,57,-20,-36,-19,-27,-19,0,-19,-19,-19,3,-10,-26,-21,-27,-19; MA /M: SY='T'; M=0,-10,-17,-14,-10,-9,-13,-14,-9,-13,-10,-3,-6,-15,-6,-12,12,15,-5,-12,-7,-8; MA /M: SY='L'; M=-7,-29,3,-30,-24,3,-30,-24,16,-27,28,11,-29,-31,-24,-21,-21,-7,20,-27,-7,-24; MA /M: SY='S'; M=13,-4,5,-6,-5,-20,-3,-14,-20,-12,-26,-19,4,-13,-5,-14,30,14,-9,-38,-21,-5; MA /M: SY='D'; M=-15,28,-30,43,42,-35,-15,0,-35,5,-25,-25,9,-5,11,-5,0,-10,-30,-35,-20,26; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,25,-30,45,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,13,-20,0,-22; MA /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,9,-29,-17,20,-27,46,26,-29,-29,-17,-19,-29,-10,10,-20,0,-19; MA /M: SY='R'; M=3,-6,-21,-12,-6,-17,-13,-9,-12,3,-15,-9,3,-16,-1,16,3,-2,-8,-25,-14,-6; MA /M: SY='R'; M=-16,-5,-31,-7,0,-20,-18,5,-28,24,-24,-11,1,-18,6,33,-12,-13,-23,-4,-3,1; MA /M: SY='P'; M=-9,-12,-34,-6,5,-27,-20,-17,-21,-2,-26,-17,-13,57,-5,-11,-5,-2,-25,-29,-24,-4; MA /M: SY='K'; M=-11,1,-30,3,19,-29,-20,-7,-30,41,-27,-12,0,-9,12,27,-8,-10,-22,-22,-12,15; MA /M: SY='P'; M=-12,-3,-35,7,3,-30,-18,-7,-24,-8,-28,-20,-8,54,-7,-16,-5,-6,-27,-32,-23,-5; MA /M: SY='W'; M=-18,-35,-44,-34,-24,12,-21,-27,-17,-19,-18,-17,-33,-6,-21,-20,-31,-23,-26,95,18,-19; MA /M: SY='D'; M=-6,12,-22,13,5,-28,-3,2,-26,0,-26,-16,12,-12,7,-3,12,2,-21,-32,-15,6; MA /M: SY='K'; M=-2,-10,-26,-12,-2,-20,-21,-15,-10,10,-10,-3,-9,-2,1,1,-8,-4,-9,-22,-11,-1; MA /M: SY='L'; M=-1,-19,-18,-19,-8,-3,-21,-16,7,-18,19,10,-18,-21,-11,-15,-10,-4,6,-25,-8,-10; MA /M: SY='T'; M=-3,3,-17,-2,-1,-19,-12,-9,-20,7,-22,-14,9,-13,0,9,15,18,-12,-31,-14,-1; MA /I: I=-30; MD=-32; MA /M: SY='Q'; M=-8,-4,-21,0,6,-18,-15,-5,-12,1,-10,-6,-5,4,8,3,-5,-6,-12,-19,-11,6; D=-30; MA /I: I=-30; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='K'; M=-5,1,-20,-5,-2,-18,-15,-9,-17,12,-19,-5,5,-13,1,9,7,11,-11,-28,-11,-1; MA /M: SY='G'; M=-3,-11,-28,-10,-9,-22,38,-17,-27,-18,-13,-12,-6,-19,-14,-17,-6,-17,-22,-21,-23,-12; MA /M: SY='R'; M=-17,-13,-31,-13,-3,-16,-21,-7,-25,24,-16,-9,-7,-20,4,44,-15,-12,-19,-1,-5,-2; MA /M: SY='E'; M=-7,1,-23,7,21,-22,-13,-11,-16,-2,-14,-13,-5,-10,0,-8,0,-2,-9,-30,-18,11; MA /M: SY='P'; M=-1,-3,-20,-9,-9,-16,-14,-12,-6,-9,-14,-3,1,7,-8,-12,3,7,-6,-31,-17,-9; MA /M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-31,-25,49,-30,-7,4,-23,15,4,-22,-30,-26,-17,-22,-10,-1,11,41,-25; MA /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-14,-5,-7,-22,1,-12,2,-12,-3,-5,-19,7,17,-5,-7,-10,-19,-3,-1; MA /M: SY='R'; M=-11,-10,-27,-12,-2,-19,-18,-3,-23,25,-16,-2,-3,-18,7,47,-9,-9,-15,-20,-10,0; MA /M: SY='M'; M=-10,-22,-22,-32,-22,0,-24,-6,26,-14,20,53,-20,-20,-4,-14,-20,-10,14,-20,0,-14; MA /M: SY='R'; M=-11,-11,-29,-14,-3,-8,-20,5,-19,6,-15,-6,-7,-19,11,16,-10,-12,-19,0,6,3; MA /M: SY='N'; M=-5,10,-23,0,-3,-18,-5,-2,-16,1,-14,-10,20,-19,1,5,-1,-6,-19,-29,-15,-2; MA /M: SY='W'; M=-20,-35,-35,-40,-30,45,-25,-25,-10,-25,-5,-10,-30,-30,-30,-20,-30,-20,-15,81,30,-25; MA /M: SY='L'; M=-5,-27,-20,-30,-20,6,-27,-19,20,-27,40,21,-27,-27,-17,-20,-25,-9,11,-20,-2,-19; MA /M: SY='N'; M=-7,16,-10,16,11,-28,-10,-1,-25,-2,-26,-18,17,-13,10,-5,12,0,-23,-36,-19,10; MA /M: SY='D'; M=-15,16,-26,26,7,-20,-18,-6,-15,-9,-1,-5,0,-16,-4,-12,-11,-10,-14,-31,-12,2; MA /M: SY='P'; M=-9,1,-31,11,7,-29,-16,-13,-21,-7,-26,-20,-6,37,-6,-15,-1,-6,-21,-34,-24,-2; MA /M: SY='E'; M=-7,9,-27,11,30,-29,-14,0,-24,4,-24,-16,9,2,19,-1,6,-4,-27,-31,-19,24; MA /M: SY='A'; M=6,2,-20,0,0,-14,-10,-11,-15,-8,-17,-14,3,-3,-8,-13,6,-1,-10,-28,-16,-4; MA /M: SY='I'; M=-4,-9,-23,-9,-1,-15,-25,-17,9,-11,-2,0,-12,-16,-5,-15,-7,-7,9,-27,-11,-4; MA /M: SY='R'; M=-10,-8,-28,-6,1,-20,-18,-6,-20,10,-13,-6,-6,-2,2,26,-9,-9,-16,-24,-13,-1; MA /M: SY='B'; M=-2,7,-23,7,3,-19,-13,-6,-15,0,-8,-6,4,-15,-2,-1,-5,-7,-13,-28,-14,0; MA /M: SY='L'; M=2,-10,-20,-10,-2,-10,-18,-14,-4,-12,11,-1,-13,-18,-8,-9,-9,-6,-4,-24,-10,-5; MA /M: SY='I'; M=-7,-16,-16,-21,-17,-10,-28,-20,14,-14,6,8,-14,-20,-12,-13,-14,-9,9,-24,-7,-17; MA /M: SY='Y'; M=-10,-5,-13,-3,-7,-9,-18,-7,-18,-5,-16,-13,-7,-21,-7,-8,-4,-5,-15,-1,7,-8; MA /M: SY='K'; M=-13,-6,-27,-6,3,-11,-23,-9,-10,7,-4,0,-8,-16,2,5,-13,-10,-11,-20,-5,3; MA /M: SY='Q'; M=-9,-4,-26,-3,7,-19,-21,-7,-7,1,-3,3,-7,-14,10,-2,-8,-8,-11,-25,-9,8; MA /M: SY='E'; M=-6,4,-30,10,23,-31,-11,-6,-28,7,-23,-17,-2,8,10,1,-2,-10,-26,-27,-20,15; MA /M: SY='R'; M=-5,-8,-25,-7,6,-19,-17,-8,-17,10,-12,-5,-6,-5,3,14,-4,-6,-14,-25,-13,3; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=43(23); /POSITIVE=43(23); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=V_Lesaux; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3; CC /FT_KEY=DNA_BIND; /FT_DESC=CUT; CC /VERSION=6; DR Q9BL02 , CUT_CAEEL , T; P10180 , CUT_DROME , T; DR P39881 , CUX1_CANLF , T; P39880 , CUX1_HUMAN , T; DR P53564 , CUX1_MOUSE , T; P53565 , CUX1_RAT , T; DR O14529 , CUX2_HUMAN , T; P70298 , CUX2_MOUSE , T; DR Q22811 , HM21_CAEEL , T; Q19720 , HM38_CAEEL , T; DR Q22812 , HM39_CAEEL , T; Q9UBC0 , HNF6_HUMAN , T; DR O08755 , HNF6_MOUSE , T; P70512 , HNF6_RAT , T; DR O95948 , ONEC2_HUMAN, T; Q6XBJ3 , ONEC2_MOUSE, T; DR O60422 , ONEC3_HUMAN, T; Q8K557 , ONEC3_MOUSE, T; DR Q9NJB5 , ONEC_DROME , T; Q01826 , SATB1_HUMAN, T; DR Q60611 , SATB1_MOUSE, T; Q9UPW6 , SATB2_HUMAN, T; DR Q8VI24 , SATB2_MOUSE, T; 3D 1S7E; 1WH6; 1WH8; 1WIZ; 1X2L; 1YSE; 2CSF; 2D5V; 2O49; 2O4A; 6LFF; PR PRU00374; DO PDOC51042; //