ID   SERTA; MATRIX.
AC   PS51053;
DT   01-JAN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   SERTA domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0283349; R2=0.0138353; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2580.4648438; R2=2.0314844; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; H_SCORE=3531; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=324; H_SCORE=3239; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-20,-30,-19,-12,4,-28,0,3,-13,3,2,-19,-8,-3,-12,-17,-10,-8,0,29,-11;
MA   /M: SY='R'; M=1,-6,-20,-11,-2,-12,-15,-10,-17,5,-16,-9,-2,-14,5,7,5,5,-12,-21,-8,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-4,-21,1,8,-13,-20,-12,-6,-11,3,-5,-9,-16,-5,-12,-4,-4,-3,-30,-13,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-1,-2,-24,-2,15,-19,-19,1,-17,1,-14,-8,-5,-11,19,-3,1,-1,-18,-16,0,16;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-27,-7,3,-23,-17,0,-27,21,-22,-10,2,-17,17,48,-1,-5,-20,-23,-12,6;
MA   /M: SY='Q'; M=0,-5,-23,-6,7,-27,-16,-3,-15,5,-13,-3,-4,-13,25,3,2,-4,-17,-23,-11,16;
MA   /M: SY='S'; M=4,-3,-18,-6,-2,-20,-11,1,-21,4,-21,-12,2,-13,1,6,13,9,-12,-29,-11,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,5,-35,-25,36,-30,34,20,-25,-25,-20,-25,-25,-10,21,-20,0,-25;
MA   /M: SY='F'; M=-14,-27,-21,-30,-20,28,-29,-17,7,-22,28,10,-23,-29,-22,-8,-24,-10,3,-11,8,-20;
MA   /M: SY='B'; M=-16,22,-27,22,6,-23,-12,7,-25,5,-24,-16,21,-17,9,9,-1,-7,-26,-26,-6,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-23,-33,-23,4,-31,-18,30,-25,33,30,-24,-24,-15,-21,-24,-10,16,-20,0,-21;
MA   /M: SY='S'; M=7,-3,9,-4,-4,-20,-4,-13,-21,-13,-29,-20,6,-14,-4,-13,33,16,-10,-41,-21,-4;
MA   /M: SY='L'; M=0,-26,-17,-29,-20,3,-24,-19,17,-23,31,19,-26,-26,-17,-19,-20,-7,15,-22,-4,-19;
MA   /M: SY='M'; M=-13,-7,-23,-5,-4,-1,-23,5,-4,-13,3,7,-10,-20,-9,-12,-13,-10,-2,-23,0,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-29,-18,-30,-22,7,-29,-19,22,-26,39,24,-29,-29,-19,-19,-25,-8,16,-22,-2,-20;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-2,-27,0,13,-21,-19,19,-21,6,-19,-7,0,-13,22,3,-1,-8,-23,-18,6,16;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-6,-26,-10,-6,-5,-19,12,-18,4,-8,-5,5,-23,-1,26,-11,-10,-17,-21,-1,-6;
MA   /M: SY='S'; M=-7,-14,-1,-20,-16,-2,-22,-2,-2,-21,-9,-4,-6,-21,-13,-18,2,-2,-2,-28,-3,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-7,-27,-4,-3,-14,-22,6,-16,5,-1,-1,-6,-21,0,17,-15,-11,-13,-24,-4,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,5,-30,11,5,-31,-3,-4,-23,-3,-20,-6,-1,3,12,-8,-4,-12,-24,-27,-18,8;
MA   /I: I=-15; MD=-32;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-18,-15,-7,-8,-19,-12,4,-12,8,4,-16,0,-3,-10,-12,-6,0,-18,-8,-6; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='S'; M=0,-8,-17,-9,-6,-17,-13,-14,-13,-5,-20,-13,-2,-3,-5,0,16,14,-4,-33,-17,-7;
MA   /M: SY='E'; M=0,7,-27,14,49,-28,-17,-3,-27,7,-18,-18,-2,-2,15,-3,2,-8,-25,-28,-20,32;
MA   /M: SY='P'; M=0,-17,-31,-12,-2,-27,-18,-17,-13,-8,-21,-13,-17,49,-3,-16,-6,-7,-17,-27,-24,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-4,17,-18,14,1,-17,-5,1,-21,-6,-27,-19,22,-15,-1,-7,19,6,-19,-32,-9,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-11,-9,-13,-4,-17,-23,0,-24,13,-17,-8,-5,-23,10,36,-10,-10,-19,-18,-1,-1;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-7,-30,-7,2,-22,-20,13,-30,27,-22,-8,2,-18,10,53,-10,-12,-22,-22,-5,2;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-15,-6,-5,-14,-11,5,-14,-13,-13,-9,2,-15,-3,-10,18,14,-9,-34,-9,-5;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,0,-30,-21,6,-30,-21,13,-30,40,14,-29,-31,-21,-21,-27,-10,7,-24,-4,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-30,-27,-38,-30,0,-38,-30,47,-28,18,18,-22,-22,-22,-28,-18,-8,33,-22,-2,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-2,8,0,-3,-10,-17,-12,9,-14,-10,-18,-11,18,-23,-8,-10,1,-5,-11,-35,-13,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-10,40,-20,20,0,-20,0,10,-20,0,-30,-20,60,-20,0,0,10,0,-30,-40,-20,0;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-7,-13,-15,-13,-6,-21,-17,-2,-12,2,4,-7,-14,-10,-11,8,34,3,-27,-7,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-29,-21,10,-29,-13,19,-23,34,20,-27,-29,-18,-17,-25,-9,13,-14,10,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-7,-8,-9,1,-26,-21,-5,-28,23,-22,-10,-3,-19,12,36,-8,-10,-20,-24,-13,5;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,6,-26,-20,3,-27,24,-20,-7,0,-17,25,52,-7,-10,-23,-20,-10,12;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-37,-27,3,-37,-27,41,-30,29,20,-23,-23,-20,-27,-23,-10,24,-20,0,-27;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,12,-29,12,15,-35,-16,19,-24,5,-23,-7,12,-13,38,5,0,-10,-30,-27,-9,26;
MA   /M: SY='E'; M=7,5,-24,7,15,-27,-2,-8,-26,2,-19,-17,0,-9,2,-1,2,-8,-19,-26,-20,8;
MA   /M: SY='E'; M=3,5,-24,11,40,-27,-14,-5,-25,4,-20,-18,0,-3,12,-5,8,-4,-22,-30,-20,26;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-27,-22,-32,-22,5,-30,-17,27,-24,34,32,-25,-25,-14,-20,-25,-10,15,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-7,-24,-9,3,-19,-19,-11,-15,12,-14,-8,-4,-13,2,18,-3,0,-10,-23,-12,1;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-13,-26,-14,-1,-20,-19,-6,-9,-1,-4,4,-11,-1,13,3,-9,-9,-14,-22,-12,5;
MA   /M: SY='E'; M=7,8,-24,12,28,-29,-12,-5,-24,2,-18,-16,0,-6,12,-7,3,-7,-21,-27,-19,20;
MA   /M: SY='G'; M=10,-5,-25,-8,-7,-26,15,-15,-25,-3,-24,-16,1,2,-9,-11,1,-9,-20,-24,-23,-9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=10(10); /POSITIVE=10(10); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SERTA;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9BXL8    , CDCA4_HUMAN, T; Q9CWM2    , CDCA4_MOUSE, T;
DR   Q9UHV2    , SRTD1_HUMAN, T; Q9JL10    , SRTD1_MOUSE, T;
DR   Q14140    , SRTD2_HUMAN, T; Q9JJG5    , SRTD2_MOUSE, T;
DR   Q9UJW9    , SRTD3_HUMAN, T; Q9ERC3    , SRTD3_MOUSE, T;
DR   Q9NUC0    , SRTD4_HUMAN, T; A7DTG3    , SRTD4_MOUSE, T;
PR   PRU00396;
DO   PDOC51053;
//