ID ITAM_2; MATRIX. AC PS51056; DT 01-JAN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE ITAM motif hantavirus type profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=24; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=22; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3976821; R2=0.0112796; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1511.6481934; R2=0.7098765; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1029; H_SCORE=2242; N_SCORE=13.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=453; H_SCORE=1833; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='W'; M=-15,-19,-40,-19,-9,-11,-20,-20,-25,16,-25,-15,-19,-20,-5,6,-25,-20,-25,62,9,-5; MA /M: SY='R'; M=14,-10,-20,-15,-5,-20,-10,-10,-20,11,-15,-10,-5,-15,0,26,0,-5,-10,-20,-15,-5; MA /M: SY='G'; M=-10,-10,-30,-10,-10,-25,26,-10,-35,4,-25,-15,0,-20,-5,24,-5,-15,-25,-20,-20,-10; MA /M: SY='C'; M=-10,-25,52,-30,-25,-5,-30,-25,-6,-30,14,-1,-25,-35,-25,-25,-20,-10,0,-35,-15,-25; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='T'; M=0,0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,0,-10,-10,-10,20,50,0,-30,-10,-10; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='N'; M=0,19,-15,10,0,-20,0,0,-20,-5,-30,-20,34,-15,0,-5,25,10,-20,-40,-20,0; MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,29,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,31,-25,-5,-25; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,40,-25,-10,0,-15,10,51,-10,-10,-20,-20,-10,5; MA /M: SY='S'; M=10,0,-10,0,0,-20,0,-10,-20,-10,-30,-20,10,-10,0,-10,40,20,-10,-40,-20,0; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25,56,-30,-1,0,-20,5,0,-20,-30,-25,-15,-20,-10,-5,20,54,-25; MA /M: SY='I'; M=-5,-30,-20,-35,-30,0,-35,-30,40,-25,15,15,-25,-25,-25,-25,-15,-5,40,-25,-5,-30; MA /M: SY='G'; M=-5,-20,-25,-20,-20,-11,21,-20,-11,-25,9,-1,-15,-25,-20,-20,-15,-15,-11,-20,-15,-20; MA /M: SY='L'; M=-5,-15,-15,-20,-15,0,-25,-20,5,-20,21,5,-15,-20,-15,-15,-6,19,5,-25,-5,-15; MA /M: SY='M'; M=-5,-25,-15,-30,-25,0,-25,-15,25,-15,15,34,-25,-25,-15,-15,-15,-5,31,-25,-5,-20; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='C'; M=-5,-10,57,-20,-20,-15,-25,-25,-20,-20,-15,-15,-10,-25,-20,-20,5,19,-5,-40,-20,-20; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=18(18); /POSITIVE=18(18); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=V_Lesaux; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=ITAM; CC /VERSION=5; DR Q9E006 , GP_ANDV , T; P0DTJ0 , GP_BCCV , T; DR Q806Y7 , GP_DOBV , T; P28728 , GP_HANTB , T; DR P16493 , GP_HANTH , T; P16853 , GP_HANTL , T; DR P08668 , GP_HANTV , T; Q83887 , GP_NYV , T; DR P27315 , GP_PHV , T; P21400 , GP_PUUMG , T; DR P41265 , GP_PUUMK , T; P41266 , GP_PUUMP , T; DR P27312 , GP_PUUMS , T; P33455 , GP_SEOU8 , T; DR P28729 , GP_SEOUR , T; P17880 , GP_SEOUS , T; DR Q89905 , GP_SINV , T; P0DTJ1 , GP_TULV , T; PR PRU00379; DO PDOC51055; //