Entry: PS51062

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RUNT
Accession [info] PS51062
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51062
Associated ProRule [info] PRU00399

Name and characterization of the entry

Description [info] Runt domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=129;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=124;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1084349; R2=0.0112895; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-9178.87229; R2=41.94451; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=567; N_SCORE=8.5; H_SCORE=23856; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=389; N_SCORE=6.5; H_SCORE=7138; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M= -3,  8,-15,  0, -9,-27, -8, -7,-20, -6,-19,-11, 23,-18, -4,-13, 21, 11,-17,-36,-18, -6;
/M: SY='M'; M=-16,-37,-18,-43,-29, 23,-37,-22, 21,-30, 23, 28,-31,-34,-23,-29,-26,-11, 15,-11,  7,-27;
/M: SY='V'; M= -7,-28,-19,-30,-21,-12,-34,-13, 21,-18,  3,  9,-20,-26, -9,-23,-18, -7, 23,-27, -6,-15;
/M: SY='E'; M=-12, 17,-32, 28, 44,-36,-24, -2,-38, 13,-32,-24,  4,-10, 16,  0, -6,-10,-32,-34,-22, 35;
/M: SY='Q'; M= -1,-20,-23,-23, -8,-22,-26,-13, -1, -2, -5,  9,-14,-21, 12, -1, -9, -7,  1,-21,-10,  0;
/M: SY='Q'; M=-15,-22,-24,-22, -9,-13,-31,-13,  1, -8, 16, 16,-21,-26, 19,-13,-17,-10, -5,-17,-10,  1;
/M: SY='P'; M=  7,-10,-24, -7, -1,-36,-12, -9,-26,  1,-28,-15, -6, 22, 15,-12, 10, -2,-22,-29,-20,  7;
/M: SY='E'; M=  5, 13,-27, 25, 29,-36,-16, -9,-31, -1,-30,-23,  3,-10,  6,-11, -1, -7,-24,-36,-23, 21;
/M: SY='H'; M=-17,-14,-33,-16, -8, -5,-23, 43,-29, -8,-27,-13, -7, 12, -1,-11,-13,-17,-29,-19, 22, -8;
/M: SY='P'; M= 10,-17,-28,-14, -9,-32,-13, -4,-24, -9,-31,-20,-12, 44, -7,-22, -3, -8,-21,-35,-20, -9;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-28,-11,-17,-39, 43,-14,-34,  4,-35,-25, -1,-16, -7,-12,  1,-15,-33,-30,-26,-10;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-24, 11, 40,-27,-27, -6,-31,  4,-24,-17,  0,-10, 11, -3, -1,  7,-21,-30,-20, 33;
/M: SY='L'; M=-20,-40,-20,-40,-30, 10,-40,-30, 20,-30, 50, 30,-40,-40,-20,-30,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='V'; M=  4,-23,-16,-20, -1,-19,-32,-26, 10,-16, -6, -1,-19,-21,-13,-20,-13, -3, 20,-30,-14, -4;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-34,-13,  7,-36,-24,  1,-34, 42,-29,-17, -4,-19, 23, 45, -4,-10,-30,-27,-14, 10;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7,-10,-23,-14,-17,-16, -7,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 29, 41, -6,-33,-20, -7;
/M: SY='D'; M= -3, 14,-24, 24,  5,-37,  4,-10,-36, -4,-34,-27, 10,-11,  0,-14, 21,  2,-30,-40,-24,  7;
/M: SY='S'; M=  7,  6,-12,  3, -8,-32,  0, -7,-30,  0,-32,-20, 19,-12,  0,-10, 44, 17,-22,-40,-20,  0;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-40,-30,-20,100,-10,-30,-10,-10,-30,-40,-30,-10;
/M: SY='N'; M= -9, 24,-20, 10, -4,-26, -5,  9,-27, -3,-34,-17, 48,-20, -2,-10, 11,  0,-26,-31, -5, -3;
/M: SY='F'; M=-21,-40,-20,-46,-34, 46,-40,-23, 21,-36, 14,  9,-36,-36,-36,-34,-30,-16, 11, -7, 19,-36;
/M: SY='L'; M=-10,-37,-19,-37,-27,  4,-34,-29, 16,-27, 40, 24,-36,-36,-19,-29,-24, -9,  9,-21,-11,-27;
/M: SY='C'; M=-13,-30, 84,-37,-27, -3,-30,-16,-17,-27,-17,-14,-20,-37,-24,-31,-13,-13,-10,-30,  2,-27;
/M: SY='S'; M=  7,  0,-10, -3,-10,-27, -6,-13,-24, -3,-24,-17,  7,-10, -3,-10, 41, 29,-14,-37,-20, -3;
/M: SY='A'; M= 28,-28,-11,-28,-18,-20,-17,-28, 10,-18, -5,  0,-19,-19,-18,-24, -3, -1, 18,-29,-16,-18;
/M: SY='L'; M=-20,-40,-20,-40,-30, 10,-40,-30, 20,-30, 50, 30,-40,-40,-20,-30,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-40,-30,-20,100,-10,-30,-10,-10,-30,-40,-30,-10;
/M: SY='N'; M=  4,  8,-19, -2, -1,-35, -8, -4,-25, 15,-29,-17, 20,-13,  3,  0, 15,  6,-20,-34,-20,  0;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,-10,  0,-10,-20,100,-40,  0,-30,-10, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-40,-30, 20,  0;
/M: SY='W'; M=-30,-50,-50,-50,-30, 10,-30,-30,-30,-30,-20,-10,-40,-40,-10,-30,-40,-30,-30,150, 20,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='C'; M=  2,-13, 49,-17,-18,-26,-13,-18,-26,-13,-26,-20, -3,-23,-13,-23, 25,  7,-16,-44,-24,-13;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-40,  0, 10,-30,  0,-40,-20, 70,-20,  0,-10, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,-10, 10,-40,-20,  0,-30, 60,-30,-20,  0,-10, 20, 30,  0,-10,-30,-30,-20, 10;
/M: SY='S'; M=  6,  0,-10, -4,-10,-26, -9,-14,-21, -4,-21,-16,  6,-10, -4,-10, 37, 33,-11,-36,-20, -4;
/M: SY='L'; M=-23,-40,-20,-43,-30, 30,-40,-24, 14,-33, 38, 21,-40,-40,-26,-30,-30,-13,  4,-11,  4,-33;
/M: SY='P'; M=-10,-14,-37, -7, -1,-40,-20,-11,-30, -1,-34,-21,-14, 68, 13,-18, -7,-10,-30,-31,-24,  4;
/M: SY='V'; M= -6,-20,-21,-19, -4,-17,-19,-21,  4,-16, -4,  6,-16,-23,-10,-21,-16, -8,  7,-27,-14, -2;
/M: SY='A'; M= 33,-20,-19,-17,-10,-33, -6,-20,-16,-10,-26,-16,-13, 22,-10,-23,  4, -3, -9,-33,-23,-10;
/M: SY='F'; M=-30,-40,-20,-50,-30, 80,-40,-10,  0,-40, 10,  0,-40,-40,-40,-30,-30,-20,-10, 10, 40,-40;
/M: SY='K'; M=-13, -9,-30,-16,  1,-17,-23,  6,-24, 37,-24,-14, -6,-16, 11, 18, -6,-13,-24,-16,  9,  1;
/M: SY='V'; M=  0,-40,-10,-40,-30,-10,-40,-40, 40,-30, 10, 10,-30,-30,-30,-30,-20,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='V'; M= -1,-40,-11,-40,-31, -9,-40,-40, 41,-30, 11, 11,-30,-30,-30,-31,-21, -1, 49,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 24,-23,-13,-23,-16,-18,-12,-21, -4,-14, -1,  0,-16,-19,-11,-21,  4,  0,  0,-29,-17,-14;
/M: SY='L'; M=-20,-40,-20,-40,-30, 10,-40,-30, 20,-30, 50, 30,-40,-40,-20,-30,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='G'; M=  5,  0,-23,  1,-14,-34, 27,-19,-27,-14,-28,-23,  1,-14,-13,-21,  7,  5,-22,-33,-26,-11;
/M: SY='E'; M=-13, 11,-35, 26, 30,-38,-22, -8,-37, -1,-35,-28, -1, 22,  6,-14, -7,-10,-33,-38,-25, 23;
/M: SY='V'; M= -4,-36,-15,-37,-27, -9,-36,-36, 23,-27,  3,  4,-27,-29,-24,-27,-17,  3, 32, -5, -7,-26;
/M: SY='P'; M= -8,-16,-37,-10,-10,-40, -5,-17,-32, -2,-39,-29,-14, 66, -7,-22, -7,-12,-32,-37,-29, -9;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-40, 80, 20,-50,-10,-10,-40,-10,-40,-40, 20,-10,  0,-20,  0,-10,-40,-50,-30, 10;
/M: SY='G'; M= -3,  4,-27, -1,-21,-40, 57,-11,-37,-14,-40,-27, 20,-20,-14,-24,  3,-14,-37,-33,-27,-14;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='M'; M=-12,-23,-23,-21, -1, -2,-34,-13,  1,-16,  8, 13,-21,-27, -6,-17,-20,-10,  2,-17,  2, -3;
/M: SY='V'; M=  0,-40,-10,-40,-30,-10,-40,-40, 40,-30, 10, 10,-30,-30,-30,-30,-20,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='T'; M=  4,  0,-10, -6,-10,-24,-11,-16,-19, -6,-19,-14,  4,-10, -6,-10, 33, 37, -9,-34,-20, -6;
/M: SY='I'; M= -7,-40,-17,-40,-37, -3,-40,-40, 47,-30, 17, 17,-30,-30,-30,-37,-27, -7, 43,-30,-10,-30;
/M: SY='W'; M= -9,-27,-32,-33,-14,-11,-24,-14,-15, -3, -9, 10,-20,-27,  0, -2,-17,-14,-15, 28, -1, -9;
/M: SY='A'; M= 42,-21,  9,-23,-13,-29, -4,-21,-11,-13,-20,-11,-11,-14,-13,-23,  7, -1, -1,-33,-21,-13;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-30,-40, 80,-20,-40,-20,-40,-30,  0,-20,-20,-30,  0,-20,-40,-30,-30,-20;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-40,  0, 10,-30,  0,-40,-20, 70,-20,  0,-10, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-40, 80, 20,-50,-10,-10,-40,-10,-40,-40, 20,-10,  0,-20,  0,-10,-40,-50,-30, 10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-30,  0,-40, 10,-30,-20,  0,-10, 20,  0,-10,-10,-30,-30,-20, 50;
/M: SY='N'; M=-10, 28,-23, 11,  3,-40, -6,  7,-30, 17,-37,-20, 50,-17,  6,  2,  7, -3,-30,-37,-20,  3;
/M: SY='Y'; M=-16,-27, -8,-26,-19,  8,-27,  1,-17,-19,-20,-12,-20,  6,-13,-20,-16,-16,-16, -8, 31,-19;
/M: SY='C'; M= -4,-22, 91,-29,-24,-23,-22,-24,-23,-22,-23,-20,-12,-32,-22,-32,  7, -2,-13,-47,-27,-22;
/M: SY='A'; M= 26,-10,-19, -7,  8,-31,  2,-14,-23, -6,-26,-16, -6,-11, -3,-16,  3, -6,-14,-30,-21,  6;
/M: SY='E'; M=-12, 16,-32, 29, 54,-33,-27, -2,-40,  7,-32,-23,  3,-10, 17, -3, -8,-10,-32,-33,-22, 44;
/M: SY='L'; M=-11,-40,-16,-40,-30,  1,-40,-34, 29,-30, 32, 21,-36,-36,-24,-30,-26, -6, 28,-24,-10,-30;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-39,-19,  1,-31,-29,  0,-39, 34,-30,-20, -9,-27, 11, 64, -9,-10,-30,-30,-11,  1;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-40,  0, 10,-30,  0,-40,-20, 70,-20,  0,-10, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E'; M=  4, -7,  0,-10,  6,-13,-19,-10,-21,-10,-21,-14, -2,-20, -7,-17, -5, -7,-16,-28,-12,  1;
/M: SY='T'; M= -1,  0,-16, -8, -4,-27,-17,-13,-19, 12,-19,-15,  2,-10,  0,  2, 19, 28,-12,-32,-20, -3;
/M: SY='A'; M= 36,-14,-10,-17,-10,-27, -6,-20,-10,-10,-17,-10, -7,-10,-10,-17, 13, 14,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='K'; M=  1,-15,-19,-19, -6,-27,-24,-16, -4,  9,-12, -5,-10,-16,  5, -3, -2,  2,  2,-27,-15, -3;
/M: SY='M'; M= -7,-33,-17,-40,-23, -3,-33,-19, 26,-23, 24, 53,-23,-30, -9,-23,-20, -7, 22,-16, -3,-16;
/M: SY='K'; M=-13,  0,-30,-10,  7,-31,-20, 29,-33, 43,-30,-17,  3,-13, 17, 21, -3,-13,-33,-30, -8,  7;
/M: SY='N'; M=-11, 23,-25,  7, -1,-36, -9,  6,-33,  9,-36,-20, 43,-22,  3, 13,  7, -1,-29,-37,-17,  0;
/M: SY='Q'; M=-12,  8,-32, 12, 20,-42,-18,  7,-32, 15,-23, -6,  3,-10, 59,  5,  0,-10,-32,-16,-13, 35;
/M: SY='V'; M=  0,-40,-10,-40,-30,-10,-40,-40, 40,-30, 10, 10,-30,-30,-30,-30,-20,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 50,-20,-10,-20,-10,-30,  0,-20,-10,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='K'; M=-14, -4,-34,-14,  6,-36,-24,  0,-34, 47,-30,-20, -4,-18, 16, 47, -4,-10,-30,-30,-16,  6;
/M: SY='F'; M=-30,-40,-20,-50,-30, 80,-40,-10,  0,-40, 10,  0,-40,-40,-40,-30,-30,-20,-10, 10, 40,-40;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-40,  0, 10,-30,  0,-40,-20, 70,-20,  0,-10, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-40, 80, 20,-50,-10,-10,-40,-10,-40,-40, 20,-10,  0,-20,  0,-10,-40,-50,-30, 10;
/M: SY='L'; M=-20,-40,-20,-40,-30, 10,-40,-30, 20,-30, 50, 30,-40,-40,-20,-30,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-30,-40,-20,-50,-30, 80,-40,-10,  0,-40, 10,  0,-40,-40,-40,-30,-30,-20,-10, 10, 40,-40;
/M: SY='V'; M=  0,-40,-10,-40,-30,-10,-40,-40, 40,-30, 10, 10,-30,-30,-30,-30,-20,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-30,-40, 80,-20,-40,-20,-40,-30,  0,-20,-20,-30,  0,-20,-40,-30,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,-10,-30,  0,-10,-30,  0,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 50, 20,-20,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-30,-40, 80,-20,-40,-20,-40,-30,  0,-20,-20,-30,  0,-20,-40,-30,-30,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-30,-40, 80,-20,-40,-20,-40,-30,  0,-20,-20,-30,  0,-20,-40,-30,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-13, -3,-33,-13,  7,-37,-23,  0,-33, 51,-30,-20, -3,-16, 17, 42, -3,-10,-30,-30,-17,  7;
/M: SY='S'; M=  4,  0,-16, -3, -4,-33, -6, -7,-30, 17,-30,-20,  7,-10,  6,  2, 36, 11,-23,-37,-20,  3;
/M: SY='F'; M=-30,-40,-20,-50,-30, 80,-40,-10,  0,-40, 10,  0,-40,-40,-40,-30,-30,-20,-10, 10, 40,-40;
/M: SY='T'; M= -6,  0,-16,-10, -7,-17,-20, 15,-19, -7,-16,-10,  3,-13, -4, -7, 11, 30,-12,-30, -8, -7;
/M: SY='L'; M=-20,-40,-20,-40,-30, 10,-40,-30, 20,-30, 50, 30,-40,-40,-20,-30,-30,-10, 10,-20,-10,-30;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-10, -9,-10,-21,-17,-19,-13, -9,-13,-11,  1,-10, -9,-10, 24, 46, -3,-31,-20, -9;
/M: SY='I'; M=-10,-40,-20,-40,-40,  0,-40,-40, 50,-30, 20, 20,-30,-30,-30,-40,-30,-10, 40,-30,-10,-30;
/M: SY='T'; M= -4,-17,-11,-24,-19, -3,-29,-24,  6,-20, -1, -3,-14,-20,-20,-19,  1, 26, 13,-24, -9,-20;
/M: SY='I'; M= -6,-40,-16,-40,-36, -4,-40,-40, 46,-30, 16, 16,-30,-30,-30,-36,-26, -6, 44,-30,-10,-30;
/M: SY='H'; M= -3,-21,-21,-27,-14, 17,-21, 23,-16,-17,-13, -6,-14,-24,-13,-16,-11,-14,-16,-12, 22,-17;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7,-10,-23,-14,-17,-16, -7,-16,-13,  3,-10, -7,-10, 29, 41, -6,-33,-20, -7;
/M: SY='N'; M=  9,  7,-17, -1, -7,-25, -4,  0,-21, -6,-29,-14, 25,-17, -4,-13, 12,  0,-17,-29, -6, -6;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-40,-30,-20,100,-10,-30,-10,-10,-30,-40,-30,-10;
/M: SY='P'; M= -8,-24,-28,-23,-16,-23,-26,-20, -5,-16,-11,  6,-20, 37,-10,-26,-12, -4, -5,-29,-18,-13;
/M: SY='Q'; M=-10, -9,-27,-12,  8,-28,-23,  4,-16,  8, -6, 20, -6,-16, 50,  1, -6,-10,-18,-10, -7, 26;
/M: SY='V'; M= -3,-40,-13,-40,-33, -7,-40,-40, 43,-30, 13, 13,-30,-30,-30,-33,-23, -3, 47,-30,-10,-30;
/M: SY='A'; M= 50,-20,-10,-20,-10,-30,  0,-20,-10,-10,-20,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-10, -9,-10,-21,-17,-19,-13, -9,-13,-11,  1,-10, -9,-10, 24, 46, -3,-31,-20, -9;
/M: SY='Y'; M=-14,-33,-24,-33,-23, 26,-33,  3,  4,-23, -4,  3,-23,-30,-16,-16,-20,-14,  7,  6, 54,-23;
/M: SY='H'; M= -1,  3,-23, -6,  0,-29,-11, 25,-30, 16,-30,-16, 12,-14,  7,  3,  7, -6,-27,-33, -9,  1;
/M: SY='R'; M=-14,  7,-31, -6,  3,-36,-18,  3,-34, 30,-33,-20, 16,-21, 10, 35, -1, -7,-30,-33,-16,  3;
/M: SY='A'; M= 36,-26,-10,-26,-16,-24,-12,-26,  4,-16,-11, -4,-16,-16,-16,-23,  1,  0, 14,-30,-17,-16;
/M: SY='I'; M=-10,-40,-20,-40,-40,  0,-40,-40, 50,-30, 20, 20,-30,-30,-30,-40,-30,-10, 40,-30,-10,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,-10, 10,-40,-20,  0,-30, 60,-30,-20,  0,-10, 20, 30,  0,-10,-30,-30,-20, 10;
/M: SY='V'; M= -1,-40,-11,-40,-31, -9,-40,-40, 41,-30, 11, 11,-30,-30,-30,-31,-21, -1, 49,-30,-10,-30;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-20,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-20,-10;
/M: SY='V'; M=  0,-40,-10,-40,-30,-10,-40,-40, 40,-30, 10, 10,-30,-30,-30,-30,-20,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-40, 80, 20,-50,-10,-10,-40,-10,-40,-40, 20,-10,  0,-20,  0,-10,-40,-50,-30, 10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-30,-40, 80,-20,-40,-20,-40,-30,  0,-20,-20,-30,  0,-20,-40,-30,-30,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,-10,-40,-20,-20,-30,-10,-40,-30,-20,100,-10,-30,-10,-10,-30,-40,-30,-10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='E'; M=-13, 22,-33, 37, 48,-36,-24, -3,-40,  4,-33,-26,  6,-10, 14, -6, -7,-10,-33,-36,-23, 38;
/M: SY='P'; M=  7,-20,-31,-13,-10,-37,-14,-20,-24,-10,-34,-24,-17, 68,-10,-27, -4, -7,-21,-37,-27,-10;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-40,-20,  0,-30,-30,  0,-40, 30,-30,-20,-10,-30, 10, 70,-10,-10,-30,-30,-10,  0;
/M: SY='R'; M= -8,-16,-26,-20,-14,-21,-24,-14,-11,  4,-16, -8,-10,-24, -4, 15,  2, -1, -7,-33,-13, -9;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 12 in 12 different sequences
Number of true positive hits 12 in 12 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Runt
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
12 sequences

LOZEN_DROME (Q9W349), RUNT_DROME  (P22814), RUNT_MANSE  (Q25520), 
RUNX1_HUMAN (Q01196), RUNX1_MOUSE (Q03347), RUNX1_RAT   (Q63046), 
RUNX1_XENLA (Q6PF39), RUNX2_HUMAN (Q13950), RUNX2_MOUSE (Q08775), 
RUNX2_RAT   (Q9Z2J9), RUNX3_HUMAN (Q13761), RUNX3_MOUSE (Q64131)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

RUNX2_HORSE (Q9XSB7)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission