Entry: PS51065

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NHR
Accession [info] PS51065
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51065
Associated ProRule [info] PRU00400

Name and characterization of the entry

Description [info] Neuralized homology repeat (NHR) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=158;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=153;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2954926; R2=0.0192815; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10342.14388; R2=37.52312; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=322; N_SCORE=8.5; H_SCORE=14827; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=5.4; H_SCORE=14827; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M= -1, -5,-26, -5, -3,-21,-12,-13,-16, -3,-14, -9, -5, 12, -6, -5, -4, -4,-15,-27,-18, -6;
/M: SY='L'; M= -6,-15,-21,-18,-10, -3,-19, -3,  2,-17, 15,  9,-14,-22, -8,-13,-13, -5, -1,-21,  0,-10;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-26, -5,  9,-21,-19, -5,-22, 12,-16,-10, -3,-10,  9, 28, -2, -2,-16,-25,-13,  7;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-27, 69,-29,-20, -2,-25,  8, -1,-20,-29,-36,-17,-21,-11, -2, 13, 27,-27;
/M: SY='H'; M=-16, -1,-27, -2, -2,-17,-19, 74,-23,-12,-14,  0,  8,-20,  6, -3, -7,-15,-24,-30, 13, -2;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M:         M= -9, -4,-14, -4, -2,-18,-19, -5,-15, -8,-14,-10, -2,  0, -1, -8, -2,  0,-16,-28,-10, -3;
/M: SY='V'; M= -6,-14,-11,-18,-16, -5,-23,-12, -1, -7, -5, -3,-10,-23,-12,  1, -4,  4,  6,-20,  1,-16;
/M: SY='H'; M= -6, -7,  3,-11, -8,-18,-20, 23,-21, -7,-16, -7, -3,-21, -5, -6, -4, -6,-13,-32, -4, -8;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-28, -8,-16,-30, 58,-17,-37,-17,-29,-19,  1,-18,-13,-17,  4,-16,-28,-22,-28,-14;
/M: SY='K'; M=  2, -1,-14, -3,  0,-25, -7, -9,-25, 10,-24,-14,  3,-14,  3, 10,  7, -2,-16,-28,-17,  1;
/M: SY='N'; M=-11, 21,-22,  9,  0,-19, -8, 18,-19, -2,-21,-12, 35,-19,  5,  1,  4, -2,-25,-34,-11,  2;
/M: SY='V'; M=  5,-26,-18,-32,-26, -4,-29,-28, 31,-22, 10, 10,-22,-22,-22,-24,-10, -4, 33,-24, -8,-26;
/M: SY='R'; M= -8, -9,-21,-12, -7,-14,-20, -2,-11,  0, -9, -4, -4,-18,  0, 12,  1,  6, -5,-26, -7, -6;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-31,-20, 27,-28, 40, 23,-27,-27,-18,-21,-26,-10, 16,-20,  0,-21;
/M: SY='S'; M= -5,  1,-19,  0, -5,-10, -8,-11,-13,-13,-11,-11,  2,-16, -9,-13,  8,  7,-10,-27, -9, -7;
/M: SY='B'; M= -9, 17,-27, 17,  9,-26,-12,  5,-24,  3,-23,-16, 17, -4,  4, -1, -1, -7,-25,-32,-15,  5;
/M: SY='D'; M= -8, 20,-20, 24,  9,-30,  5, -4,-31, -5,-28,-22, 16,-13,  0, -9,  8, -5,-26,-35,-22,  4;
/M: SY='G'; M= -8, -3,-24, -8,-10,-21, 12, -4,-29, -3,-24,-15,  6,-21, -4,  7, -5,-13,-26, -9,-14, -8;
/M: SY='R'; M=-10, -4,-20, -9, -5,-11,-19,-10,-18,  8,-13, -9,  1,-16, -2, 22,  3, 14,-10,-24, -9, -5;
/M: SY='T'; M= -1,-12,-15,-16,-11, -8,-21,-18,  2,-11,  0,  0,-10,-17,-11, -7,  3, 15,  9,-28,-10,-12;
/M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20,  8,  0,  5,-21,-19,-12;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-13,-12, -6,-10,-20, -9,-12,  0, -9, -5, -6,-17, -3,  5,  1,  9, -7,-21, -2, -6;
/M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11, -1,-18,-21, -1,-27, 27,-16, -8, -2,-21,  8, 65,-11,-10,-18,-20, -9, -1;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-25, -7, -3,-13,-17, -2,-14, -1,-14, -7, -3, -9, -1,  4, -5, -6,-11,-23, -8, -4;
/M: SY='E'; M=  5,  0,-21, -3,  8,-23,-13, -2,-17,  4,-16, -8,  1,-11,  8,  0,  4,  0,-13,-26,-13,  8;
/M: SY='S'; M=  9, -4,-11, -6, -6,-22,  6,-13,-22,-10,-26,-18,  4, -6, -6,-11, 21,  8,-14,-33,-22, -6;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='E'; M=  0,  0,-12,  2,  4,-11, -4, -5,-10, -1, -5, -6, -1, -7, -1,  1, -1, -3, -8,-13, -8,  1; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-19,-24,-23,-29,-24, 56,-29,-10,  0,-24,  9,  0,-19,-29,-29,-17,-20,-10, -3,  9, 36,-25;
/M: SY='N'; M=  2, 11,  4,  1, -4,-21, -3, -2,-22, -9,-25,-18, 20,-19, -6,-10, 11,  0,-19,-37,-20, -5;
/M: SY='H'; M=-16, 15,-28, 15,  9,-29,-15, 33,-28,  4,-24,-10, 17,-15, 19,  8, -2,-11,-29,-30, -5, 12;
/M: SY='G'; M= 19,-10, -7,-15,-16,-25, 29,-20,-26,-16,-21,-16, -5,-17,-16,-20,  5, -9,-15,-24,-25,-16;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-32,-25,  7,-33,-21, 29,-26, 29, 16,-26,-27,-21,-22,-23, -8, 21,-17,  6,-25;
/M: SY='V'; M=  1,-23, -3,-26,-26, -4,-27,-28, 18,-18,  4,  4,-23,-26,-26,-19, -4,  8, 36,-31,-11,-26;
/M: SY='F'; M=-16,-29, -6,-37,-29, 53,-30,-21,  3,-29, 12,  4,-22,-30,-34,-21,-20,-10,  4, -3, 17,-28;
/M: SY='S'; M=  5, -4,-12, -7, -6,-14, -9,-14,-11,-13,-15,-12,  2,-12, -5,-12, 26, 22, -4,-35,-15, -6;
/M: SY='N'; M= -2, 10,-22,  7, 12,-24, -6,  1,-24,  2,-23,-16, 15,-12,  6,  4,  8, -1,-22,-31,-17,  8;
/M: SY='R'; M=-16, -2,-29, -1, 12,-24,-19,  6,-29, 24,-21,-11,  4,-15, 13, 44, -7,-10,-23,-23,-11,  9;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-38, -9,  2,-30,-19,-19,-20, -9,-29,-20,-19, 83, -9,-19, -9,-10,-29,-30,-29, -8;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-31,-23,  7,-31,-23, 26,-28, 39, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 19,-22, -2,-23;
/M: SY='R'; M= -6,-12,-11,-14, -3,-18,-19,-11,-18,  5,-14, -9, -9,-20,  2, 15, -7, -8,-11,-13,-11, -2;
/M: SY='P'; M= -9, -3,-30,  1, -3,-24,-21,-15, -8, -5,-17,-10, -6, 18, -6,-12, -8, -8,-10,-29,-18, -7;
/M: SY='G'; M= -4,  5,-27,  4, -6,-26, 31, -8,-32, -9,-26,-18, 10,-18, -7, -9,  1,-13,-27,-24,-20, -7;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-27, 12, 38,-26,-20,  1,-22,  4,-15,-14, -2, -7, 14, -1, -1, -8,-21,-30,-16, 25;
/M: SY='L'; M= -7,-16,-21,-18,-11, -9,-23,-16,  4, -9,  5,  2,-12,-15, -8, -6, -8,  0,  4,-25, -9,-11;
/M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-37,-30, 45,-31,-24, 16,-27, 13,  6,-23,-29,-34,-21,-18, -7, 18, -6, 14,-30;
/M: SY='E'; M= -6, -7,-13, -7, 11,-13,-21, -9,-11, -6, -4, -4, -8,-14,  3, -6, -4, -5,-11,-26,-12,  7;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 21, 16,-26,-26,-24,-24,-17, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='R'; M=-10, -5,-27, -5, 10,-23,-20, -6,-21, 25,-18, -6, -4,-14,  9, 29, -8, -9,-14,-22,-11,  8;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-36,-28,  4,-35,-28, 38,-27, 22, 17,-24,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-22, -2,-28;
/M: SY='D'; M= -8, 12,-18, 17, 16,-24,-17, -7,-21, -4,-15,-15,  3,-11,  2, -9,  2,  2,-16,-33,-16,  9;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-26,  1, 13,-21,-17, -7,-25, 18,-21,-12, -1,-11,  8, 18, -1, -5,-19,-23,-12, 10;
/M: SY='V'; M= -6,-15,-20,-19,-14, -8,-25,-14,  8, -6,  4,  6,-12,-21,-12, -8,-10, -3, 12,-26, -6,-14;
/M: SY='N'; M= -7,  8,-23,  5,  8,-21, -8, -5,-13, -4,-17,-11, 11,-15,  2, -6,  1, -5,-12,-31,-17,  5;
/M: SY='N'; M=-11,  5,-19,  5,  4,-24,-12, -6,-23,  1,-20,-14,  7, -7,  3,  7,  1, -1,-21,-30,-17,  2;
/M: SY='G'; M= -6, -7,-19,-11, -8,-19,  3, -9,-19,  0,-14, -3, -2,-19, -1,  1, -6,-10,-16,-22,-12, -5;
/M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-36,-27, 15,-22,-21,-17,-17,-16,-16,-34,-29,-18,-14,-35,-25,-25,117, 35,-20;
/M: SY='S'; M= 11, -2, -2, -7, -3,-21, -6,-14,-18, -5,-22,-15,  3,-14, -5,-10, 15,  6, -9,-32,-19, -4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-29,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20,  0,-20,-19,-20,  2,-18,-29,-21,-30,-19;
/M: SY='S'; M=  6, -6, -3, -9, -9,-20,  0,  1,-21,-14,-21,-13,  1,-16, -7,-13, 14,  5,-11,-33,-15, -9;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-33,-24,  5,-32,-22, 31,-27, 34, 24,-26,-26,-19,-22,-24, -9, 19,-21, -1,-23;
/M: SY='R'; M= -3, -5,-24, -3, 12,-22,-10, -6,-24, 10,-19,-13, -2,-13,  5, 21,  1, -6,-16,-25,-16,  7;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-25, 17,-31,-23, 23,-27, 27, 15,-25,-27,-24,-22,-21, -8, 18,-16,  3,-25;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= -1,-28,-14,-31,-26, 10,-28,-26, 22,-23, 18, 10,-27,-28,-27,-20,-15, -4, 30,-22, -3,-26;
/M: SY='T'; M= -1, -4,-12,-13,-12, -8,-22,-20, -4,-13, -3, -6, -4,-12,-11,-12, 13, 41,  2,-29, -9,-12;
/M: SY='S'; M=  8,  3, -9, -1, -1,-21, -8,-12,-20, -6,-19,-15,  3,-12, -2, -8, 14, 12,-11,-31,-18, -2;
/M: SY='L'; M= -5,-16,  6,-19,-14, -8,-24,-11, -2,-18, 10,  3,-15,-25,-14,-17,-15, -9, -1,-29, -9,-15;
/M: SY='D'; M= -2, 24,-17, 26,  5,-28, -7, -4,-27, -1,-25,-21, 18,-14, -2, -4,  8, -3,-21,-35,-19,  1;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='P'; M= -9,-20,-36,-11, -2,-25,-20,-19,-15,-11,-21,-15,-20, 74,-10,-19,-11, -9,-25,-27,-25,-10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='S'; M=  4,  5,-11,  5,  8,-21, -1, -7,-20, -4,-19,-14,  4, -9,  2, -8,  9,  0,-15,-26,-17,  5; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='E'; M= -7, -4,-22, -4,  1,-17,-12,-10, -9, -5, -9, -3, -4,-10, -2, -3, -2, -1, -6,-26,-13, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='L'; M= -3,-20,-21,-22,-18, -2,-22,-20, 13,-19, 17,  8,-18,-22,-16,-18,-13, -5, 10,-21, -4,-18;
/M: SY='R'; M= -6, -5,-25, -4,  2,-19,-12, -4,-20,  0,-19,-12, -1,  0,  0,  7,  2, -4,-16,-27,-15, -1;
/M: SY='P'; M= -4,-17,-25,-17,-10, -4,-18,-17, -5,-14, -3, -3,-15,  7,-14,-13, -9, -5, -6,-22,-10,-13;
/M: SY='S'; M=  4, -7,-17, -7, -6,-19, -7,-15,-17, -7,-21,-15, -3,  6, -8,-11,  7, -1,-13,-29,-19, -8;
/M: SY='A'; M=  8, -1,-13, -3, -4,-22, -3,-13,-19, -6,-17,-13,  0,-10, -5, -8,  8,  3,-12,-29,-18, -5;
/M: SY='L'; M= -7,-22,-14,-25,-16,  3,-26,-19, 12,-22, 23, 12,-20,-24,-16,-18,-14, -1,  9,-24, -4,-16;
/M: SY='P'; M=  0,-11,-30, -7, -2,-27,-12,-15,-18, -6,-22,-11,-12, 41, -5,-15, -5, -7,-21,-27,-23, -6;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='T'; M= -3, -4, -7, -8, -3, -6,-14,-10, -9, -1, -7, -4, -3, -6, -5, -4,  0,  6, -6,-17, -7, -4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='F'; M=-14,-14,-23,-18,-16, 19,-20, -6, -5,-12,  0,  3,-11,-20,-15, -6,-12, -6, -6, -7, 15,-16;
/M: SY='A'; M= 16, -5,-17, -7, -9,-18, -8,-17, -6,-12,-11, -8, -6,-10,-10,-17,  7,  0,  1,-28,-17,-10;
/M: SY='C'; M= -1,-12,  7,-14,-13,-14,-15,-19,-11,-18, -7, -9,-10,-10,-14,-18,  2,  5, -6,-33,-17,-14;
/M: SY='P'; M= -5, -9,-31, -4, -3,-25,  0,-10,-21,-12,-24,-16, -8, 20, -9,-16, -3,-10,-21,-20,-19, -8;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-19, 24,  4,-20,-13, -5,-22, -6,-18,-18, 11,-15, -5, -9,  0, -4,-18,-30,-12, -1;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-21,-20,-14,  1,-24,-17, 10,-20, 25,  9,-21,-25,-16,-16,-18, -6,  6,-20,  0,-15;
/M: SY='V'; M=  0,-18,-17,-19,-15, -6,-23,-21,  6,-13,  5,  1,-19,-22,-16,-10, -8,  2, 15,-17, -8,-16;
/M: SY='N'; M= -9,  7,-24,  3,  0,-12, -7, -5,-18, -4,-15,-11, 10,-17, -4, -4,  0, -2,-18,-19, -8, -2;
/M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-13, -7,-13,-20,  0, -7,  2,  0,  6, -9,-21,  2, 14,-14,-11, -7,-22, -5, -5;
/M: SY='N'; M= -6,  4,-26,  3, -4,-24,  9, -9,-26, -3,-25,-17, 10, -3, -6, -3,  4, -4,-23,-30,-21, -6;
/M: SY='G'; M= -5, -6,-26, -5, -2,-22, 15, -2,-24,-12,-19,-13, -1, -8, -8,-13,  0, -9,-20,-27,-18, -6;
/M: SY='F'; M= -9,-13, -9,-18,-15, 10,-17,-10,-11,-14, -8, -6, -7,-23,-12,-10, -2,  1, -9, -9,  8,-13;
/M: SY='W'; M=-13,-24,-34,-25,-15, -1,-21,-16,-13,-14,-10,-10,-24,-23,-12,-12,-21,-11,-16, 60, 11,-11;
/M: SY='V'; M=  8,-20,-15,-26,-21, -3,-21,-21, 15,-16,  6,  9,-18,-22,-18,-16, -7, -3, 22,-24, -9,-20;
/M:         M= -7,-16,-17,-17, -9, -4,-15,-14, -7, -7, -8, -5,-13,-14,-10, -8, -9, -8, -4,-18, -3,-11;
/M: SY='A'; M=  4,-12,-13,-14, -7,-10,-12,-14,-10,-12, -9, -7, -9, -6, -9,-13,  3,  0, -7,-25,-11, -9;
/M:         M= -9, -7,-21,-10, -4,-15,-20, -7, -7,  0, -5, -2, -5,-18, -1, -1,-10, -8, -8,-22, -5, -4;
/M: SY='D'; M=-10,  0,-25,  5, -1,-14,-16, -5,-13,-10,-12,-11, -5, -4, -7,-13, -2, -1,-12,-24, -3, -5;
/M:         M= -6,-13,-20,-12, -3,-14, -7,-14,-14, -7,-11, -9, -9, -8, -8, -5, -6, -9,-12,-22,-12, -7;
/M: SY='E'; M= -4,  2,-16,  1,  3,-16, -7, -2,-22, -5,-19,-13,  3,-16,  1, -4,  1, -6,-17,-26,-13,  2;
/M:         M= -6, -7,-22, -9, -7, -3,-20, -6, -7,-10,  0, -4, -7,-15,-10, -9, -9, -4, -7,-20, -1, -9;
/M: SY='L'; M= -4, -9,-17,-11, -5, -9,-15,-11, -3,-14,  5,  4, -9,-20, -4,-13, -9, -8, -5,-24, -9, -5;
/M: SY='N'; M=-13, 11,-29, 11,  7,-25, -6,  2,-28,  5,-26,-18, 15, -6,  2,  9, -3,-10,-28,-23,-15,  3;
/M: SY='Q'; M= -1, -5,-23, -5,  7,-23,-12, -7,-15,  0,-13, -7, -3, -9, 11, -1,  2, -4,-14,-26,-15,  8;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='L'; M= -5, -9,-18,-13, -9, -7,-12, -9, -2, -6,  3,  2, -5,-11, -6,  2, -9, -4, -4,-18, -8, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -3, -3,-12, -1,  8,-11, -8, -7, -6,  1, -7, -5, -5, -2, -1, -3, -2, -2, -3,-14, -9,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='G'; M=  1, -3,-27, -4,-13,-28, 46,-14,-34,-13,-28,-18,  6,-18,-11,-13,  3,-14,-27,-24,-26,-12;
/M: SY='B'; M= -8, 28,-22, 28,  7,-28, -9, -1,-25, -2,-25,-20, 23,-12,  4, -6, 10,  5,-22,-36,-18,  6;
/M: SY='I'; M= -8,-21,-27,-24,-14,-10,-24,-18, 10, -9,  3,  4,-14,-15,-10,  1,-13, -9,  7,-22, -8,-16;
/M: SY='I'; M= -7,-20,-21,-22,-12, -3,-28,-20, 19,-20, 16,  8,-17,-22,-15,-18,-13, -6, 16,-26, -7,-15;
/M: SY='G'; M=  2, -8,-19, -9,-13,-21, 21,-12,-28,-12,-22,-16, -3,-18,-12,-10,  1, -7,-20,-14,-15,-13;
/M: SY='F'; M=-11,-23,-20,-27,-20, 19,-28,-17, 15,-22, 19, 12,-19,-26,-21,-18,-18, -8, 12,-15,  5,-20;
/M: SY='W'; M= -7,-17,-26,-19,-12, -5,-10,-13, -9, -9, -8, -1,-14,-20, -8, -6,-10, -7, -8,  5,  1,-10;
/M: SY='V'; M= -5,-23,-19,-24,-16, -5,-27,-20, 12,-10,  9,  6,-20,-24,-15,  0,-13, -6, 18,-24, -8,-17;
/M: SY='T'; M= -5, 12,-19,  6, -3,-19,-11, -9,-16, -3,-18,-12, 12, -9, -6, -7,  7, 13,-12,-32,-15, -5;
/M: SY='A'; M=  5, -1,-22,  1,  0,-23, -9, -2,-19, -3,-19,-13, -2, -4, -3, -4,  3, -4,-12,-29,-15, -3;
/M: SY='N'; M=  3,  5,-21,  2,  0,-23, -6, -4,-23,  7,-23,-14,  9,-14,  0,  8,  7,  0,-16,-28,-15, -1;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7,-17,-26, 45,-18,-30,-16,-24,-16,  1,-19,-17,-15,  0,-13,-22,-23,-25,-17;
/M: SY='D'; M= -9,  9,-26, 14, 14,-24, -8, -7,-25, -2,-21,-16,  3, -5,  1, -5,  3, -1,-21,-24,-16,  7;
/M: SY='L'; M= -3,-25,-18,-26,-18,  1,-26,-19, 14,-21, 29, 12,-25,-27,-15,-14,-19, -7, 14,-22, -5,-17;
/M: SY='H'; M= -9,-14,-25,-16, -9, -5,-18,  7, -7, -8, -9, -2, -8,-14, -8, -3, -8,-10, -5,-21, -1,-11;
/M: SY='Y'; M=-12,-23,-25,-27,-20, 16,-29, -2,  9,-18, 11,  7,-17,-25,-16,-10,-18,-10,  4, -7, 19,-20;
/M: SY='Y'; M=-11,-16,-25,-18,-12,  5,-13, -6,-10,-10, -5, -2,-12,-22,-11, -5,-10, -7, -9, -2,  8,-12;
/M: SY='I'; M= -6,-20,-17,-24,-17, -7,-28,-17, 17,-17,  6,  6,-16,-17,-16,-18,-13, -7, 17,-27, -8,-19;
/M: SY='N'; M=-10, 25,-22, 15,  1,-21,  1,  2,-21, -2,-23,-17, 36,-19, -3, -1,  4, -4,-24,-35,-19, -1;
/M: SY='G'; M=  1,  1,-23, -1, -4,-25, 20,-11,-26,-11,-24,-17,  8,-10, -6,-13, 10, -4,-22,-29,-23, -5;
/M: SY='S'; M= -3, -5,-22, -6, -3,-16, -3,-11,-14, -8,-10, -9, -2,-16, -5, -7,  1,  0,-11,-24,-11, -5;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-26, 13,  3,-24,-10, -7,-18, -6,-14,-11,  5, -6,  0, -8, -3, -7,-18,-30,-16,  0;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='Q'; M=  4, -5,-17, -7,  1,-23,-14, -4,-14,  4,-14, -3, -5, -8, 11,  1, -2, -7,-12,-21,-11,  5; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-20,-16, -1,-17,-15, 13,-15, 14, 11,-15,-18,-12,-10,-12, -4, 11,-16, -4,-15; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -4, -7,-24, -9, -5,-13, 12, -8,-20,-11,-15, -9, -1,-17,-10,-10, -2, -7,-15,-22,-14, -8;
/M: SY='V'; M= -3,-15,-14,-15,-10, -8,-24,-17,  1,-11, -3, -1,-16,-14, -7,-13, -9, -6,  6,-24,-10, -8;
/M: SY='A'; M=  8, -9,-17,-14,-11, -3,-15, -9, -6,-13,  1, -1, -7,-18,-11,-11, -2,  1, -3,-22, -6,-11;
/M: SY='A'; M= 10,-13, -6,-18,-16, -9, -1,-11,-14,-13,-12, -9,-10,-20,-15,-13,  0, -4, -5,-19, -6,-16;
/M: SY='T'; M= -5,-12,-21,-13,-13,-12,-18,-13,  0,-12, -5, -3,-10, -9,-12,-11, -2,  4,  4,-28,-11,-14;
/M: SY='D'; M= -7, 11,-27, 14, -1,-28,  9, -8,-29, -4,-26,-20, 10, -6, -6, -3,  1, -9,-23,-30,-22, -5;
/M: SY='V'; M= -3,-12,-20,-14,-12,-11,-17,-15,  3,-10,  2,  3,-10,-20, -7, -8, -6, -1,  5,-26,-10,-10;
/M: SY='P'; M=  1,-10,-25, -7, -4,-22,-11,-12,-17,-10,-20,-15, -8, 26, -8,-13,  3,  0,-15,-30,-21, -8;
/M: SY='Q'; M= -9,  0,-26,  1,  3,-22,-17, -2,-16,  2,-13, -8,  1, -4,  5,  4, -5, -7,-17,-27,-13,  3;
/M: SY='P'; M=-12, -2,-31,  2,  6,-24,-19,  1,-17, -4,-17,-11, -2, 17,  2, -6, -7, -8,-22,-29,-14,  2;
/M: SY='V'; M= -6,-28,-10,-29,-23,  2,-29,-24, 20,-21, 24, 14,-28,-29,-23,-18,-19, -6, 25,-26, -6,-23;
/M: SY='W'; M=-18,-26,-38,-26,-21, 13,-19, -3,-14,-13,-13,-10,-24,-22,-14,-11,-25,-19,-21, 65, 39,-18;
/M: SY='A'; M= 19,-14,-17,-19,-12,-15, -6,-17, -6,-11, -5, -1,-13, -5,-11,-13,  0,  0, -1,-22,-16,-12;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-16,-23,-23,  5,-28,-22, 19,-21, 16,  8,-24,-27,-23,-19,-14, -4, 26,-23, -2,-23;
/M: SY='V'; M= -6,-25,-18,-29,-23, 14,-27,-21, 14,-18, 11,  8,-21,-25,-22,-11,-13, -3, 19,-18,  0,-23;
/M: SY='D'; M=-16, 36,-29, 49, 19,-35,-11, -2,-34, -1,-29,-27, 17,  0,  1, -9,  2, -8,-29,-38,-21,  9;
/M: SY='L'; M= -3,-26,-18,-28,-22,  2,-22,-23, 18,-25, 27, 12,-25,-27,-21,-20,-17, -6, 17,-24, -6,-22;
/M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-20,-17, 18,-28, 17, -1, -7,  1,  4,-17,-28, -7, -2,-19,-11, -8, 14, 56,-17;
/M: SY='G'; M= -2,-12,-30,-12,-21,-25, 59,-18,-33,-20,-26,-17, -2,-21,-19,-20, -2,-19,-26,-17,-23,-21;
/M: SY='Q'; M= -2,  1,-22, -3,  2,-24, -7, -6,-19,  5,-21, -9,  6,-10,  9,  3,  8,  1,-17,-28,-15,  5;
/M: SY='C'; M= -3,-13, 36,-20,-20,-15,-20,-19,-14,-20,-13,-11,-11,-25,-19,-20,  2, 10, -1,-37,-17,-20;
/M: SY='M'; M= -3,-10,-20,-14, -3,-12,-22,-13,  1, -5,  0,  4, -9,-17, -4, -4, -6,  0,  3,-25,-10, -4;
/M: SY='Q'; M= -2, -5,-24, -6, -1,-22,  1, -8,-20, -1,-17, -8, -3,-15,  9, -2,  0, -8,-17,-22,-14,  4;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-17,-26,-25, -3,-29,-27, 28,-21, 10,  9,-22,-25,-23,-22,-10, -3, 34,-27, -8,-25;
/M: SY='Q'; M= -5,  1,-23,  1,  8,-25,-12, -7,-22,  3,-21,-13,  1, -5, 11,  4,  9,  9,-18,-28,-15,  9;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-23,-32,-24,  2,-31,-23, 29,-25, 20, 18,-22,-18,-18,-23,-17, -7, 20,-22, -3,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-16,-25,-18,  5,-29,-18, 16,-21, 17,  8,-18,-25,-18,-19,-15, -3, 12,-19,  3,-19;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-24, 10,  1,-25,  4, -3,-26, -7,-23,-18,  9, -7, -4, -8,  7, -2,-22,-32,-18, -2;
/M: SY='S'; M=  3, -6,-22, -6,  1,-22,  3,-10,-22, -5,-22,-14, -2, -4,  1, -5,  9,  1,-18,-24,-15,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 35 in 14 different sequences
Number of true positive hits 35 in 14 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 6
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NHR
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
14 sequences

NEU1B_HUMAN (A8MQ27), NEU1B_MOUSE (Q0MW30), NEUL1_HUMAN (O76050), 
NEUL1_MOUSE (Q923S6), NEUL2_HUMAN (Q9BR09), NEUL2_MOUSE (Q9D0S4), 
NEUL3_HUMAN (Q96EH8), NEUL3_MOUSE (Q8CJC5), NEUL3_RAT   (Q5M870), 
NEUL4_HUMAN (Q96JN8), NEUL4_MOUSE (Q5NCX5), NEUL4_XENTR (A1L0Y2), 
NEUR_DROME  (P29503), NEUR_DROVI  (Q24746)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

2E63; 2YUE; 4KG0

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission