PROSITE entry PS51065
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NHR |
| Accession [info] | PS51065 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2005 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51065 |
| Associated ProRule [info] | PRU00400 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Neuralized homology repeat (NHR) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=158; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=153; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2954926; R2=0.0192815; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=322; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=162; N_SCORE=5.4; MODE=1; TEXT='RR'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -1, -5,-26, -5, -3,-21,-12,-13,-16, -3,-14, -9, -5, 12, -6, -5, -4, -4,-15,-27,-18, -6; /M: SY='L'; M= -6,-15,-21,-18,-10, -3,-19, -3, 2,-17, 15, 9,-14,-22, -8,-13,-13, -5, -1,-21, 0,-10; /M: SY='R'; M=-12, -6,-26, -5, 9,-21,-19, -5,-22, 12,-16,-10, -3,-10, 9, 28, -2, -2,-16,-25,-13, 7; /M: SY='F'; M=-19,-29,-22,-37,-27, 69,-29,-20, -2,-25, 8, -1,-20,-29,-36,-17,-21,-11, -2, 13, 27,-27; /M: SY='H'; M=-16, -1,-27, -2, -2,-17,-19, 74,-23,-12,-14, 0, 8,-20, 6, -3, -7,-15,-24,-30, 13, -2; /I: I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: M= -9, -4,-14, -4, -2,-18,-19, -5,-15, -8,-14,-10, -2, 0, -1, -8, -2, 0,-16,-28,-10, -3; /M: SY='V'; M= -6,-14,-11,-18,-16, -5,-23,-12, -1, -7, -5, -3,-10,-23,-12, 1, -4, 4, 6,-20, 1,-16; /M: SY='H'; M= -6, -7, 3,-11, -8,-18,-20, 23,-21, -7,-16, -7, -3,-21, -5, -6, -4, -6,-13,-32, -4, -8; /M: SY='G'; M= 0, -8,-28, -8,-16,-30, 58,-17,-37,-17,-29,-19, 1,-18,-13,-17, 4,-16,-28,-22,-28,-14; /M: SY='K'; M= 2, -1,-14, -3, 0,-25, -7, -9,-25, 10,-24,-14, 3,-14, 3, 10, 7, -2,-16,-28,-17, 1; /M: SY='N'; M=-11, 21,-22, 9, 0,-19, -8, 18,-19, -2,-21,-12, 35,-19, 5, 1, 4, -2,-25,-34,-11, 2; /M: SY='V'; M= 5,-26,-18,-32,-26, -4,-29,-28, 31,-22, 10, 10,-22,-22,-22,-24,-10, -4, 33,-24, -8,-26; /M: SY='R'; M= -8, -9,-21,-12, -7,-14,-20, -2,-11, 0, -9, -4, -4,-18, 0, 12, 1, 6, -5,-26, -7, -6; /M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22, 7,-31,-20, 27,-28, 40, 23,-27,-27,-18,-21,-26,-10, 16,-20, 0,-21; /M: SY='S'; M= -5, 1,-19, 0, -5,-10, -8,-11,-13,-13,-11,-11, 2,-16, -9,-13, 8, 7,-10,-27, -9, -7; /M: SY='B'; M= -9, 17,-27, 17, 9,-26,-12, 5,-24, 3,-23,-16, 17, -4, 4, -1, -1, -7,-25,-32,-15, 5; /M: SY='D'; M= -8, 20,-20, 24, 9,-30, 5, -4,-31, -5,-28,-22, 16,-13, 0, -9, 8, -5,-26,-35,-22, 4; /M: SY='G'; M= -8, -3,-24, -8,-10,-21, 12, -4,-29, -3,-24,-15, 6,-21, -4, 7, -5,-13,-26, -9,-14, -8; /M: SY='R'; M=-10, -4,-20, -9, -5,-11,-19,-10,-18, 8,-13, -9, 1,-16, -2, 22, 3, 14,-10,-24, -9, -5; /M: SY='T'; M= -1,-12,-15,-16,-11, -8,-21,-18, 2,-11, 0, 0,-10,-17,-11, -7, 3, 15, 9,-28,-10,-12; /M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20, 8, 0, 5,-21,-19,-12; /M: SY='T'; M= -5, -9,-13,-12, -6,-10,-20, -9,-12, 0, -9, -5, -6,-17, -3, 5, 1, 9, -7,-21, -2, -6; /M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11, -1,-18,-21, -1,-27, 27,-16, -8, -2,-21, 8, 65,-11,-10,-18,-20, -9, -1; /M: SY='R'; M= -9, -7,-25, -7, -3,-13,-17, -2,-14, -1,-14, -7, -3, -9, -1, 4, -5, -6,-11,-23, -8, -4; /M: SY='E'; M= 5, 0,-21, -3, 8,-23,-13, -2,-17, 4,-16, -8, 1,-11, 8, 0, 4, 0,-13,-26,-13, 8; /M: SY='S'; M= 9, -4,-11, -6, -6,-22, 6,-13,-22,-10,-26,-18, 4, -6, -6,-11, 21, 8,-14,-33,-22, -6; /I: I=-12; MD=-25; /M: SY='E'; M= 0, 0,-12, 2, 4,-11, -4, -5,-10, -1, -5, -6, -1, -7, -1, 1, -1, -3, -8,-13, -8, 1; D=-12; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='F'; M=-19,-24,-23,-29,-24, 56,-29,-10, 0,-24, 9, 0,-19,-29,-29,-17,-20,-10, -3, 9, 36,-25; /M: SY='N'; M= 2, 11, 4, 1, -4,-21, -3, -2,-22, -9,-25,-18, 20,-19, -6,-10, 11, 0,-19,-37,-20, -5; /M: SY='H'; M=-16, 15,-28, 15, 9,-29,-15, 33,-28, 4,-24,-10, 17,-15, 19, 8, -2,-11,-29,-30, -5, 12; /M: SY='G'; M= 19,-10, -7,-15,-16,-25, 29,-20,-26,-16,-21,-16, -5,-17,-16,-20, 5, -9,-15,-24,-25,-16; /M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-32,-25, 7,-33,-21, 29,-26, 29, 16,-26,-27,-21,-22,-23, -8, 21,-17, 6,-25; /M: SY='V'; M= 1,-23, -3,-26,-26, -4,-27,-28, 18,-18, 4, 4,-23,-26,-26,-19, -4, 8, 36,-31,-11,-26; /M: SY='F'; M=-16,-29, -6,-37,-29, 53,-30,-21, 3,-29, 12, 4,-22,-30,-34,-21,-20,-10, 4, -3, 17,-28; /M: SY='S'; M= 5, -4,-12, -7, -6,-14, -9,-14,-11,-13,-15,-12, 2,-12, -5,-12, 26, 22, -4,-35,-15, -6; /M: SY='N'; M= -2, 10,-22, 7, 12,-24, -6, 1,-24, 2,-23,-16, 15,-12, 6, 4, 8, -1,-22,-31,-17, 8; /M: SY='R'; M=-16, -2,-29, -1, 12,-24,-19, 6,-29, 24,-21,-11, 4,-15, 13, 44, -7,-10,-23,-23,-11, 9; /M: SY='P'; M= -8,-19,-38, -9, 2,-30,-19,-19,-20, -9,-29,-20,-19, 83, -9,-19, -9,-10,-29,-30,-29, -8; /M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-31,-23, 7,-31,-23, 26,-28, 39, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 19,-22, -2,-23; /M: SY='R'; M= -6,-12,-11,-14, -3,-18,-19,-11,-18, 5,-14, -9, -9,-20, 2, 15, -7, -8,-11,-13,-11, -2; /M: SY='P'; M= -9, -3,-30, 1, -3,-24,-21,-15, -8, -5,-17,-10, -6, 18, -6,-12, -8, -8,-10,-29,-18, -7; /M: SY='G'; M= -4, 5,-27, 4, -6,-26, 31, -8,-32, -9,-26,-18, 10,-18, -7, -9, 1,-13,-27,-24,-20, -7; /M: SY='E'; M= -9, 5,-27, 12, 38,-26,-20, 1,-22, 4,-15,-14, -2, -7, 14, -1, -1, -8,-21,-30,-16, 25; /M: SY='L'; M= -7,-16,-21,-18,-11, -9,-23,-16, 4, -9, 5, 2,-12,-15, -8, -6, -8, 0, 4,-25, -9,-11; /M: SY='F'; M=-13,-30,-19,-37,-30, 45,-31,-24, 16,-27, 13, 6,-23,-29,-34,-21,-18, -7, 18, -6, 14,-30; /M: SY='E'; M= -6, -7,-13, -7, 11,-13,-21, -9,-11, -6, -4, -4, -8,-14, 3, -6, -4, -5,-11,-26,-12, 7; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28, 2,-34,-28, 36,-26, 21, 16,-26,-26,-24,-24,-17, -6, 35,-24, -4,-28; /M: SY='R'; M=-10, -5,-27, -5, 10,-23,-20, -6,-21, 25,-18, -6, -4,-14, 9, 29, -8, -9,-14,-22,-11, 8; /M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-36,-28, 4,-35,-28, 38,-27, 22, 17,-24,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-22, -2,-28; /M: SY='D'; M= -8, 12,-18, 17, 16,-24,-17, -7,-21, -4,-15,-15, 3,-11, 2, -9, 2, 2,-16,-33,-16, 9; /M: SY='K'; M= -5, 0,-26, 1, 13,-21,-17, -7,-25, 18,-21,-12, -1,-11, 8, 18, -1, -5,-19,-23,-12, 10; /M: SY='V'; M= -6,-15,-20,-19,-14, -8,-25,-14, 8, -6, 4, 6,-12,-21,-12, -8,-10, -3, 12,-26, -6,-14; /M: SY='N'; M= -7, 8,-23, 5, 8,-21, -8, -5,-13, -4,-17,-11, 11,-15, 2, -6, 1, -5,-12,-31,-17, 5; /M: SY='N'; M=-11, 5,-19, 5, 4,-24,-12, -6,-23, 1,-20,-14, 7, -7, 3, 7, 1, -1,-21,-30,-17, 2; /M: SY='G'; M= -6, -7,-19,-11, -8,-19, 3, -9,-19, 0,-14, -3, -2,-19, -1, 1, -6,-10,-16,-22,-12, -5; /M: SY='W'; M=-20,-35,-45,-36,-27, 15,-22,-21,-17,-17,-16,-16,-34,-29,-18,-14,-35,-25,-25,117, 35,-20; /M: SY='S'; M= 11, -2, -2, -7, -3,-21, -6,-14,-18, -5,-22,-15, 3,-14, -5,-10, 15, 6, -9,-32,-19, -4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-19,-30, 67,-20,-39,-20,-30,-20, 0,-20,-19,-20, 2,-18,-29,-21,-30,-19; /M: SY='S'; M= 6, -6, -3, -9, -9,-20, 0, 1,-21,-14,-21,-13, 1,-16, -7,-13, 14, 5,-11,-33,-15, -9; /M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-33,-24, 5,-32,-22, 31,-27, 34, 24,-26,-26,-19,-22,-24, -9, 19,-21, -1,-23; /M: SY='R'; M= -3, -5,-24, -3, 12,-22,-10, -6,-24, 10,-19,-13, -2,-13, 5, 21, 1, -6,-16,-25,-16, 7; /M: SY='L'; M= -8,-29,-20,-33,-25, 17,-31,-23, 23,-27, 27, 15,-25,-27,-24,-22,-21, -8, 18,-16, 3,-25; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -1,-28,-14,-31,-26, 10,-28,-26, 22,-23, 18, 10,-27,-28,-27,-20,-15, -4, 30,-22, -3,-26; /M: SY='T'; M= -1, -4,-12,-13,-12, -8,-22,-20, -4,-13, -3, -6, -4,-12,-11,-12, 13, 41, 2,-29, -9,-12; /M: SY='S'; M= 8, 3, -9, -1, -1,-21, -8,-12,-20, -6,-19,-15, 3,-12, -2, -8, 14, 12,-11,-31,-18, -2; /M: SY='L'; M= -5,-16, 6,-19,-14, -8,-24,-11, -2,-18, 10, 3,-15,-25,-14,-17,-15, -9, -1,-29, -9,-15; /M: SY='D'; M= -2, 24,-17, 26, 5,-28, -7, -4,-27, -1,-25,-21, 18,-14, -2, -4, 8, -3,-21,-35,-19, 1; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='P'; M= -9,-20,-36,-11, -2,-25,-20,-19,-15,-11,-21,-15,-20, 74,-10,-19,-11, -9,-25,-27,-25,-10; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='S'; M= 4, 5,-11, 5, 8,-21, -1, -7,-20, -4,-19,-14, 4, -9, 2, -8, 9, 0,-15,-26,-17, 5; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='E'; M= -7, -4,-22, -4, 1,-17,-12,-10, -9, -5, -9, -3, -4,-10, -2, -3, -2, -1, -6,-26,-13, -2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='L'; M= -3,-20,-21,-22,-18, -2,-22,-20, 13,-19, 17, 8,-18,-22,-16,-18,-13, -5, 10,-21, -4,-18; /M: SY='R'; M= -6, -5,-25, -4, 2,-19,-12, -4,-20, 0,-19,-12, -1, 0, 0, 7, 2, -4,-16,-27,-15, -1; /M: SY='P'; M= -4,-17,-25,-17,-10, -4,-18,-17, -5,-14, -3, -3,-15, 7,-14,-13, -9, -5, -6,-22,-10,-13; /M: SY='S'; M= 4, -7,-17, -7, -6,-19, -7,-15,-17, -7,-21,-15, -3, 6, -8,-11, 7, -1,-13,-29,-19, -8; /M: SY='A'; M= 8, -1,-13, -3, -4,-22, -3,-13,-19, -6,-17,-13, 0,-10, -5, -8, 8, 3,-12,-29,-18, -5; /M: SY='L'; M= -7,-22,-14,-25,-16, 3,-26,-19, 12,-22, 23, 12,-20,-24,-16,-18,-14, -1, 9,-24, -4,-16; /M: SY='P'; M= 0,-11,-30, -7, -2,-27,-12,-15,-18, -6,-22,-11,-12, 41, -5,-15, -5, -7,-21,-27,-23, -6; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='T'; M= -3, -4, -7, -8, -3, -6,-14,-10, -9, -1, -7, -4, -3, -6, -5, -4, 0, 6, -6,-17, -7, -4; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='F'; M=-14,-14,-23,-18,-16, 19,-20, -6, -5,-12, 0, 3,-11,-20,-15, -6,-12, -6, -6, -7, 15,-16; /M: SY='A'; M= 16, -5,-17, -7, -9,-18, -8,-17, -6,-12,-11, -8, -6,-10,-10,-17, 7, 0, 1,-28,-17,-10; /M: SY='C'; M= -1,-12, 7,-14,-13,-14,-15,-19,-11,-18, -7, -9,-10,-10,-14,-18, 2, 5, -6,-33,-17,-14; /M: SY='P'; M= -5, -9,-31, -4, -3,-25, 0,-10,-21,-12,-24,-16, -8, 20, -9,-16, -3,-10,-21,-20,-19, -8; /M: SY='D'; M= -9, 20,-19, 24, 4,-20,-13, -5,-22, -6,-18,-18, 11,-15, -5, -9, 0, -4,-18,-30,-12, -1; /M: SY='L'; M= -9,-20,-21,-20,-14, 1,-24,-17, 10,-20, 25, 9,-21,-25,-16,-16,-18, -6, 6,-20, 0,-15; /M: SY='V'; M= 0,-18,-17,-19,-15, -6,-23,-21, 6,-13, 5, 1,-19,-22,-16,-10, -8, 2, 15,-17, -8,-16; /M: SY='N'; M= -9, 7,-24, 3, 0,-12, -7, -5,-18, -4,-15,-11, 10,-17, -4, -4, 0, -2,-18,-19, -8, -2; /M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-13, -7,-13,-20, 0, -7, 2, 0, 6, -9,-21, 2, 14,-14,-11, -7,-22, -5, -5; /M: SY='N'; M= -6, 4,-26, 3, -4,-24, 9, -9,-26, -3,-25,-17, 10, -3, -6, -3, 4, -4,-23,-30,-21, -6; /M: SY='G'; M= -5, -6,-26, -5, -2,-22, 15, -2,-24,-12,-19,-13, -1, -8, -8,-13, 0, -9,-20,-27,-18, -6; /M: SY='F'; M= -9,-13, -9,-18,-15, 10,-17,-10,-11,-14, -8, -6, -7,-23,-12,-10, -2, 1, -9, -9, 8,-13; /M: SY='W'; M=-13,-24,-34,-25,-15, -1,-21,-16,-13,-14,-10,-10,-24,-23,-12,-12,-21,-11,-16, 60, 11,-11; /M: SY='V'; M= 8,-20,-15,-26,-21, -3,-21,-21, 15,-16, 6, 9,-18,-22,-18,-16, -7, -3, 22,-24, -9,-20; /M: M= -7,-16,-17,-17, -9, -4,-15,-14, -7, -7, -8, -5,-13,-14,-10, -8, -9, -8, -4,-18, -3,-11; /M: SY='A'; M= 4,-12,-13,-14, -7,-10,-12,-14,-10,-12, -9, -7, -9, -6, -9,-13, 3, 0, -7,-25,-11, -9; /M: M= -9, -7,-21,-10, -4,-15,-20, -7, -7, 0, -5, -2, -5,-18, -1, -1,-10, -8, -8,-22, -5, -4; /M: SY='D'; M=-10, 0,-25, 5, -1,-14,-16, -5,-13,-10,-12,-11, -5, -4, -7,-13, -2, -1,-12,-24, -3, -5; /M: M= -6,-13,-20,-12, -3,-14, -7,-14,-14, -7,-11, -9, -9, -8, -8, -5, -6, -9,-12,-22,-12, -7; /M: SY='E'; M= -4, 2,-16, 1, 3,-16, -7, -2,-22, -5,-19,-13, 3,-16, 1, -4, 1, -6,-17,-26,-13, 2; /M: M= -6, -7,-22, -9, -7, -3,-20, -6, -7,-10, 0, -4, -7,-15,-10, -9, -9, -4, -7,-20, -1, -9; /M: SY='L'; M= -4, -9,-17,-11, -5, -9,-15,-11, -3,-14, 5, 4, -9,-20, -4,-13, -9, -8, -5,-24, -9, -5; /M: SY='N'; M=-13, 11,-29, 11, 7,-25, -6, 2,-28, 5,-26,-18, 15, -6, 2, 9, -3,-10,-28,-23,-15, 3; /M: SY='Q'; M= -1, -5,-23, -5, 7,-23,-12, -7,-15, 0,-13, -7, -3, -9, 11, -1, 2, -4,-14,-26,-15, 8; /I: I=-6; MD=-13; /M: SY='L'; M= -5, -9,-18,-13, -9, -7,-12, -9, -2, -6, 3, 2, -5,-11, -6, 2, -9, -4, -4,-18, -8, -9; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='E'; M= -3, -3,-12, -1, 8,-11, -8, -7, -6, 1, -7, -5, -5, -2, -1, -3, -2, -2, -3,-14, -9, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-13; /M: SY='G'; M= 1, -3,-27, -4,-13,-28, 46,-14,-34,-13,-28,-18, 6,-18,-11,-13, 3,-14,-27,-24,-26,-12; /M: SY='B'; M= -8, 28,-22, 28, 7,-28, -9, -1,-25, -2,-25,-20, 23,-12, 4, -6, 10, 5,-22,-36,-18, 6; /M: SY='I'; M= -8,-21,-27,-24,-14,-10,-24,-18, 10, -9, 3, 4,-14,-15,-10, 1,-13, -9, 7,-22, -8,-16; /M: SY='I'; M= -7,-20,-21,-22,-12, -3,-28,-20, 19,-20, 16, 8,-17,-22,-15,-18,-13, -6, 16,-26, -7,-15; /M: SY='G'; M= 2, -8,-19, -9,-13,-21, 21,-12,-28,-12,-22,-16, -3,-18,-12,-10, 1, -7,-20,-14,-15,-13; /M: SY='F'; M=-11,-23,-20,-27,-20, 19,-28,-17, 15,-22, 19, 12,-19,-26,-21,-18,-18, -8, 12,-15, 5,-20; /M: SY='W'; M= -7,-17,-26,-19,-12, -5,-10,-13, -9, -9, -8, -1,-14,-20, -8, -6,-10, -7, -8, 5, 1,-10; /M: SY='V'; M= -5,-23,-19,-24,-16, -5,-27,-20, 12,-10, 9, 6,-20,-24,-15, 0,-13, -6, 18,-24, -8,-17; /M: SY='T'; M= -5, 12,-19, 6, -3,-19,-11, -9,-16, -3,-18,-12, 12, -9, -6, -7, 7, 13,-12,-32,-15, -5; /M: SY='A'; M= 5, -1,-22, 1, 0,-23, -9, -2,-19, -3,-19,-13, -2, -4, -3, -4, 3, -4,-12,-29,-15, -3; /M: SY='N'; M= 3, 5,-21, 2, 0,-23, -6, -4,-23, 7,-23,-14, 9,-14, 0, 8, 7, 0,-16,-28,-15, -1; /M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7,-17,-26, 45,-18,-30,-16,-24,-16, 1,-19,-17,-15, 0,-13,-22,-23,-25,-17; /M: SY='D'; M= -9, 9,-26, 14, 14,-24, -8, -7,-25, -2,-21,-16, 3, -5, 1, -5, 3, -1,-21,-24,-16, 7; /M: SY='L'; M= -3,-25,-18,-26,-18, 1,-26,-19, 14,-21, 29, 12,-25,-27,-15,-14,-19, -7, 14,-22, -5,-17; /M: SY='H'; M= -9,-14,-25,-16, -9, -5,-18, 7, -7, -8, -9, -2, -8,-14, -8, -3, -8,-10, -5,-21, -1,-11; /M: SY='Y'; M=-12,-23,-25,-27,-20, 16,-29, -2, 9,-18, 11, 7,-17,-25,-16,-10,-18,-10, 4, -7, 19,-20; /M: SY='Y'; M=-11,-16,-25,-18,-12, 5,-13, -6,-10,-10, -5, -2,-12,-22,-11, -5,-10, -7, -9, -2, 8,-12; /M: SY='I'; M= -6,-20,-17,-24,-17, -7,-28,-17, 17,-17, 6, 6,-16,-17,-16,-18,-13, -7, 17,-27, -8,-19; /M: SY='N'; M=-10, 25,-22, 15, 1,-21, 1, 2,-21, -2,-23,-17, 36,-19, -3, -1, 4, -4,-24,-35,-19, -1; /M: SY='G'; M= 1, 1,-23, -1, -4,-25, 20,-11,-26,-11,-24,-17, 8,-10, -6,-13, 10, -4,-22,-29,-23, -5; /M: SY='S'; M= -3, -5,-22, -6, -3,-16, -3,-11,-14, -8,-10, -9, -2,-16, -5, -7, 1, 0,-11,-24,-11, -5; /M: SY='D'; M= -6, 10,-26, 13, 3,-24,-10, -7,-18, -6,-14,-11, 5, -6, 0, -8, -3, -7,-18,-30,-16, 0; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='Q'; M= 4, -5,-17, -7, 1,-23,-14, -4,-14, 4,-14, -3, -5, -8, 11, 1, -2, -7,-12,-21,-11, 5; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='L'; M= -6,-18,-15,-20,-16, -1,-17,-15, 13,-15, 14, 11,-15,-18,-12,-10,-12, -4, 11,-16, -4,-15; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='G'; M= -4, -7,-24, -9, -5,-13, 12, -8,-20,-11,-15, -9, -1,-17,-10,-10, -2, -7,-15,-22,-14, -8; /M: SY='V'; M= -3,-15,-14,-15,-10, -8,-24,-17, 1,-11, -3, -1,-16,-14, -7,-13, -9, -6, 6,-24,-10, -8; /M: SY='A'; M= 8, -9,-17,-14,-11, -3,-15, -9, -6,-13, 1, -1, -7,-18,-11,-11, -2, 1, -3,-22, -6,-11; /M: SY='A'; M= 10,-13, -6,-18,-16, -9, -1,-11,-14,-13,-12, -9,-10,-20,-15,-13, 0, -4, -5,-19, -6,-16; /M: SY='T'; M= -5,-12,-21,-13,-13,-12,-18,-13, 0,-12, -5, -3,-10, -9,-12,-11, -2, 4, 4,-28,-11,-14; /M: SY='D'; M= -7, 11,-27, 14, -1,-28, 9, -8,-29, -4,-26,-20, 10, -6, -6, -3, 1, -9,-23,-30,-22, -5; /M: SY='V'; M= -3,-12,-20,-14,-12,-11,-17,-15, 3,-10, 2, 3,-10,-20, -7, -8, -6, -1, 5,-26,-10,-10; /M: SY='P'; M= 1,-10,-25, -7, -4,-22,-11,-12,-17,-10,-20,-15, -8, 26, -8,-13, 3, 0,-15,-30,-21, -8; /M: SY='Q'; M= -9, 0,-26, 1, 3,-22,-17, -2,-16, 2,-13, -8, 1, -4, 5, 4, -5, -7,-17,-27,-13, 3; /M: SY='P'; M=-12, -2,-31, 2, 6,-24,-19, 1,-17, -4,-17,-11, -2, 17, 2, -6, -7, -8,-22,-29,-14, 2; /M: SY='V'; M= -6,-28,-10,-29,-23, 2,-29,-24, 20,-21, 24, 14,-28,-29,-23,-18,-19, -6, 25,-26, -6,-23; /M: SY='W'; M=-18,-26,-38,-26,-21, 13,-19, -3,-14,-13,-13,-10,-24,-22,-14,-11,-25,-19,-21, 65, 39,-18; /M: SY='A'; M= 19,-14,-17,-19,-12,-15, -6,-17, -6,-11, -5, -1,-13, -5,-11,-13, 0, 0, -1,-22,-16,-12; /M: SY='V'; M= -6,-24,-16,-23,-23, 5,-28,-22, 19,-21, 16, 8,-24,-27,-23,-19,-14, -4, 26,-23, -2,-23; /M: SY='V'; M= -6,-25,-18,-29,-23, 14,-27,-21, 14,-18, 11, 8,-21,-25,-22,-11,-13, -3, 19,-18, 0,-23; /M: SY='D'; M=-16, 36,-29, 49, 19,-35,-11, -2,-34, -1,-29,-27, 17, 0, 1, -9, 2, -8,-29,-38,-21, 9; /M: SY='L'; M= -3,-26,-18,-28,-22, 2,-22,-23, 18,-25, 27, 12,-25,-27,-21,-20,-17, -6, 17,-24, -6,-22; /M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-20,-17, 18,-28, 17, -1, -7, 1, 4,-17,-28, -7, -2,-19,-11, -8, 14, 56,-17; /M: SY='G'; M= -2,-12,-30,-12,-21,-25, 59,-18,-33,-20,-26,-17, -2,-21,-19,-20, -2,-19,-26,-17,-23,-21; /M: SY='Q'; M= -2, 1,-22, -3, 2,-24, -7, -6,-19, 5,-21, -9, 6,-10, 9, 3, 8, 1,-17,-28,-15, 5; /M: SY='C'; M= -3,-13, 36,-20,-20,-15,-20,-19,-14,-20,-13,-11,-11,-25,-19,-20, 2, 10, -1,-37,-17,-20; /M: SY='M'; M= -3,-10,-20,-14, -3,-12,-22,-13, 1, -5, 0, 4, -9,-17, -4, -4, -6, 0, 3,-25,-10, -4; /M: SY='Q'; M= -2, -5,-24, -6, -1,-22, 1, -8,-20, -1,-17, -8, -3,-15, 9, -2, 0, -8,-17,-22,-14, 4; /M: SY='V'; M= -2,-24,-17,-26,-25, -3,-29,-27, 28,-21, 10, 9,-22,-25,-23,-22,-10, -3, 34,-27, -8,-25; /M: SY='Q'; M= -5, 1,-23, 1, 8,-25,-12, -7,-22, 3,-21,-13, 1, -5, 11, 4, 9, 9,-18,-28,-15, 9; /M: SY='I'; M= -8,-27,-23,-32,-24, 2,-31,-23, 29,-25, 20, 18,-22,-18,-18,-23,-17, -7, 20,-22, -3,-23; /M: SY='L'; M= -9,-21,-16,-25,-18, 5,-29,-18, 16,-21, 17, 8,-18,-25,-18,-19,-15, -3, 12,-19, 3,-19; /M: SY='D'; M= -6, 8,-24, 10, 1,-25, 4, -3,-26, -7,-23,-18, 9, -7, -4, -8, 7, -2,-22,-32,-18, -2; /M: SY='S'; M= 3, -6,-22, -6, 1,-22, 3,-10,-22, -5,-22,-14, -2, -4, 1, -5, 9, 1,-18,-24,-15, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 35 in 14 different sequences |
| Number of true positive hits | 35 in 14 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 6 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NHR |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
14 sequences
NEU1B_HUMAN (A8MQ27), NEU1B_MOUSE (Q0MW30), NEUL1_HUMAN (O76050), NEUL1_MOUSE (Q923S6), NEUL2_HUMAN (Q9BR09), NEUL2_MOUSE (Q9D0S4), NEUL3_HUMAN (Q96EH8), NEUL3_MOUSE (Q8CJC5), NEUL3_RAT (Q5M870), NEUL4_HUMAN (Q96JN8), NEUL4_MOUSE (Q5NCX5), NEUL4_XENTR (A1L0Y2), NEUR_DROME (P29503), NEUR_DROVI (Q24746)» more
|
| PDB [Detailed view] |
3 PDB
2E63; 2YUE; 4KG0 |