Entry: PS51068

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] FPG_CAT
Accession [info] PS51068
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00956
Associated ProRule [info] PRU00392

Name and characterization of the entry

Description [info] Formamidopyrimidine-DNA glycosylase catalytic domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=113;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=108;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2397677; R2=0.0172019; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2795.91440; R2=28.63294; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=423; N_SCORE=8.5; H_SCORE=13218; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=306; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11558; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M= -9,-21,-38,-12, -2,-28,-21,-21,-16,-11,-27,-18,-21, 80,-12,-20,-10, -9,-24,-30,-28,-12;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-23,-25,-20, -1, -3,-20,  4,-27, 28, 10,-22,-27,-20,-20,-22,-13, -1,-20, -8,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-40, -7,  1,-30,-20,-19,-21,-10,-30,-20,-18, 86,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30, -9;
/M: SY='E'; M= -8,  5,-28, 13, 43,-26,-12, -4,-27,  4,-17,-17, -1, -4, 12, -4,  1, -7,-26,-29,-19, 28;
/M: SY='V'; M= -1,-29,  0,-30,-30, -1,-30,-30, 25,-21,  9,  8,-29,-31,-30,-21,-11, -1, 44,-31,-11,-30;
/M: SY='E'; M=-11,  4,-29,  9, 38,-25,-20,  1,-27,  9,-19,-16, -1, -6, 14,  8, -1, -5,-26,-21,-14, 25;
/M: SY='T'; M= -4, -7,-15,-13,-12, -9,-22,-15, -3, -8, -3, -3, -6,-16,-11, -8,  5, 24,  4,-28, -8,-12;
/M: SY='V'; M= -2,-15,-11,-21,-21,  3,-24,-22, 10,-17,  1,  0,-12,-23,-21,-16, -1, 11, 19,-26, -7,-21;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-17,-12, -6,-19,-13,  1,-22,  9,-15, -7, -4,-20,  0, 27, -8,-10,-15,-24,-10, -6;
/M: SY='R'; M=-13, -3,-28, -3,  6,-21,-18, 13,-26, 16,-18, -9,  3,-17,  9, 36, -7,-10,-21,-24, -8,  4;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-25, -9,-11,-18, 24,-16,-25,-10,-17,-13, -3,-18,-13,-11, -1, -6,-19,-21,-17,-12;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-32,-24,  6,-32,-24, 29,-28, 37, 18,-28,-28,-22,-22,-25, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-22,  4, 12,-23,-12, -4,-21,  6,-20,-14,  8,-12,  8,  8,  7,  0,-18,-29,-16, 10;
/M: SY='P'; M= -5, -7,-31, -3, 10,-26,-17,-10,-20,  0,-21,-15, -8, 29,  0, -4, -5, -7,-22,-27,-20,  2;
/M: SY='H'; M=-13,-16,-23,-18,-13,  5,-24, 12, -7, -8,  1,  1,-11,-23, -9,  1,-13, -7, -5,-14, 11,-12;
/M: SY='V'; M= -4,-27,-10,-30,-25,  2,-29,-23, 22,-23, 22, 16,-27,-28,-22,-20,-17, -3, 27,-26, -6,-24;
/M:         M= -1,-13,-20,-14, -4,-14,-12,-16, -5, -9, -1, -2,-12,-14, -7,-10, -6, -4, -3,-25,-13, -6;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-30, -1, -8,-29, 35, -9,-33,-11,-27,-17,  6, -9, -6,-13, -1,-15,-29,-25,-24, -7;
/M: SY='R'; M= -3, -8,-26,-10,  2,-20,-12, -8,-19, 10,-13, -5, -5,-15, 11, 12, -6, -9,-16,-19,-10,  6;
/M: SY='T'; M= -6,-10,-19,-14, -8,-11,-23,-16, -4, -2, -7, -3, -9,-13, -5,  1,  0, 13,  3,-25, -8, -7;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-22,-35,-27,  6,-32,-27, 32,-26, 19, 14,-23,-24,-23,-25,-17, -7, 27,-20, -2,-27;
/M: SY='K'; M= -4, -7,-22, -7, -1,-18,-16,-12,-10,  4,-12, -6, -7,-16, -4,  0, -3,  0, -1,-26,-11, -3;
/M: SY='R'; M= -5,  2,-23,  2,  1,-24, -5, -5,-25,  4,-22,-13,  4,-13,  4,  9,  5,  3,-17,-27,-15,  2;
/M: SY='V'; M=  1,-23, -7,-26,-25, -9, -7,-26,  8,-22,  0,  1,-19,-25,-24,-22, -8, -6, 17,-26,-14,-25;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='E'; M= -5, -7,-19, -5,  6,-13,-21,-11,  0, -4, -5, -3,-10,-13, -3, -6, -4, -3,  5,-24,-11,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='V'; M= -1,-20,-15,-21,-16, -3,-23,-19, 16,-13,  8,  6,-18,-20,-15, -9,-10, -4, 21,-20, -7,-16; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='R'; M=-11, -7,-17,-10, -6, -9, -8, -4,-16,  4,-10, -6, -1,-17, -4, 16, -7, -7,-12,-18, -7, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-20, -7, -4,-10,-14,  2,-13, -1,-10, -7,  1,-16,  0,  9, -3, -3,-12, -8, -1, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-8;
/M: SY='P'; M=  1, -9,-24, -6, -1,-21,-10,-10,-16, -6,-18,-13, -9, 34, -6,-10, -3, -6,-17,-22,-18, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='V'; M= -2, -5,-16, -5, -7,-10,-13,-11, -1, -3, -3, -1, -5,-13, -6, -2, -4, -4,  2,-18, -8, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='L'; M= -2,-14,-17,-17,-10, -3,-16, -9,  1, -7, 10,  6,-11,-17, -8, -5,-11, -6, -1,-17, -4,-10; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='R'; M=-12, -5,-23, -5, -2,-12,-18,  2,-12,  6, -6, -4, -3,-17,  1, 17, -9, -7,-10,-18, -2, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M:         M= -9, -6,-25, -8, -5, -6,-15,-10,-14, -5,-15,-12, -2, -2, -7, -3, -6, -7,-15, -3, -5, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-8;
/M: SY='P'; M= -5, -8,-29, -7, -8,-18, -4,-15,-18, -8,-20,-14, -7,  5,-10,-11, -6, -8,-17,-10,-13,-10;
/M: SY='D'; M= -6,  1,-23,  4, -4,-14, -8,-12,-12,-13,-14,-11, -2, -8,-10,-15,  3, -3, -9,-29,-13, -8;
/M: SY='P'; M= -4,-14,-25,-11, -7,-18,-16,-17,-10, -9,-18,-11,-10, 22, -9,-10,  1, -2, -8,-30,-19,-10;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-26,  5, 12,-26,-13, -6,-22,  5,-22,-15,  1,  3,  7, -1,  3, -4,-20,-27,-15,  9;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-26,  9, 10,-21,-14, -4,-21,  3,-17,-13,  3, -9,  4, -1, -3, -8,-19,-25,-11,  7;
/M: SY='F'; M=-11,-19,-21,-24,-15, 29,-26,-17,  5,-22, 15,  3,-14,-25,-22,-17,-17, -8,  1,-11,  7,-17;
/M: SY='A'; M=  1,-10,-21,-12, -3,-17,-19, -9, -3, -6, -4, -1, -9,-13,  1, -9, -4, -4, -2,-25,-10, -2;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-23, -3,  9,-22,-15, -7,-18,  2,-17,-11, -5,  2,  1, -3, -2, -5,-15,-25,-15,  4;
/M: SY='R'; M= -4, -9,-23,-11, -3,-10,-14, -7,-11, -4, -3, -2, -6,-18,  1,  4, -7, -7,-11,-21, -8, -2;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-20,-27,-17,  5,-26,-19, 16,-24, 30, 13,-23,-24,-17,-19,-18, -6, 10,-21, -3,-17;
/M: SY='T'; M= -2, -9,-21,-14, -7, -7,-18,-13, -6, -8, -8, -5, -5, -9, -6, -8,  1,  6, -5,-24, -8, -7;
/M: SY='G'; M= -3,  1,-28, -1, -9,-30, 41,-10,-33,-12,-29,-18, 10,-18, -5,-12,  4,-13,-29,-25,-25, -7;
/M: SY='Q'; M= -2, -4,-21, -4,  8,-24,-12,  1,-21,  3,-18, -9, -1,-13, 16,  6,  3, -4,-19,-23,-10, 11;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-22,-15, -9, -7,-24,-11, -6,  1, -4, -2, -9,-16, -5,  8, -6,  5, -2,-19, -1, -9;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-26,-34,-28,  5,-33,-22, 29,-25, 11, 10,-23,-24,-21,-24,-19,-10, 22, -2,  6,-27;
/M: SY='L'; M= -7,-11,-23,-12, -7, -9,-17,-12, -1,-12,  4,  0, -9,-19, -6, -7, -7, -2, -3,-22, -5, -8;
/M: SY='S'; M=  3,  2,-21,  2,  5,-26,  2, -8,-24,  0,-24,-15,  4,-11,  6, -3, 11,  1,-18,-28,-18,  5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='V'; M= -2,-25,-16,-30,-24, -1,-27,-25, 17,-21, 11,  9,-24,-23,-20,-21,-14, -3, 18,-10, -4,-22;
/M: SY='Q'; M= -6, -1,-23,  0,  4,-24, -3, -6,-21, -1,-17,-11,  2,-14,  6,  2,  2, -5,-18,-27,-15,  5;
/M: SY='R'; M=-12, -9,-24,-11, -4,-17,-19, -6,-21, 17,-16, -9, -1,-19,  3, 45, -4, -2,-10,-23,-11, -4;
/M: SY='R'; M=-18,-11,-29,-11, -2,-16,-21,  7,-23, 19,-11, -5, -3,-21,  6, 49,-13,-11,-17,-21, -6, -2;
/M: SY='G'; M= 14,-10,-24,-13,-17,-27, 50,-20,-31,-17,-24,-17, -3,-17,-17,-20,  3,-14,-21,-20,-27,-17;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Y'; M=-17,-13,-28,-13, -7, 19,-26, 13, -9, -4, -6, -4,-12,-24, -7, -5,-15,-10,-14, 10, 47, -9;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-30,-21,  8,-28,-21, 21,-30, 46, 19,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 11,-20, -1,-21;
/M: SY='L'; M=-13,-28,-23,-33,-24, 22,-30,-21, 16,-26, 26, 13,-24,-27,-22,-18,-24, -9,  8, -5,  8,-23;
/M: SY='L'; M= -7,-26,-20,-33,-24, 17,-27,-19, 18,-25, 22, 15,-22,-25,-21,-21,-20, -9, 11,-13,  6,-23;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-27,  1,  6,-11,-19,  6,-20,  1,-14,-11, -3,-13,  1,  7, -6, -6,-17,-18,  3,  1;
/M: SY='L'; M=-11,-24,-13,-29,-22, 24,-28,-20,  8,-26, 25,  8,-21,-27,-24,-19,-18, -2,  6,-15,  5,-22;
/M: SY='D'; M= -5, 14,-24, 20, 10,-29,  1, -6,-29, -3,-25,-20,  8, -9,  0, -8,  7, -2,-22,-32,-20,  5;
/M: SY='D'; M= -5,  5,-25,  6,  1,-23,-11, -6,-21, -3,-20,-15,  5,  6, -3, -4,  1, -1,-19,-31,-18, -2;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M: SY='G'; M=  1,  2,-16,  3, -4,-17, 12, -8,-17, -6,-15,-12,  3, -1, -6, -9,  0, -7,-14,-17,-15, -6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-8;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-21, -9,-10,-15,  4,-14,-17, -8, -9, -8, -7,-16,-11,-11, -5, -8,-13,-20,-10,-11;
/M: SY='A'; M=  6, -9,-18,-11,-10,-12,-14,-17, -6,-11,-11, -9, -9,-17,-11,-13,  4,  5,  2,-13, -8,-11;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-23,-28,-18,  1,-28,-18, 17,-23, 28, 18,-24,-19,-12,-18,-22,-10,  7,-16, -2,-16;
/M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-24,-17, -6,-23,-17, 15,-15,  9,  7,-17,-22,-15,-11,-14, -8, 14,-24, -6,-18;
/M: SY='V'; M=  1,-17,-13,-20,-16, -6,-18,-19,  6,-17, -5,  0,-12,-15,-12,-17,  3,  1, 11,-28,-11,-15;
/M: SY='H'; M=-17, -2,-28, -2, -2,-19,-20, 84,-26, -9,-19, -1,  7,-20,  7,  1, -8,-17,-24,-30, 15, -2;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-30,-21, 15,-23,-20, 13,-28, 38, 14,-26,-28,-22,-20,-25,-10,  6,-16,  1,-21;
/M: SY='G'; M= -8, -8,-30, -8, -7,-27, 32,-11,-35, -1,-26,-16,  0,-18, -5, 12, -3,-16,-27,-21,-22, -8;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-22,-28,-18, -3,-20, -2, 16,-10, 15, 52,-20, -9, -1,-11,-19,-10,  6,-21, -3,-10;
/M: SY='S'; M=  1,  4,-17,  6, 13,-22, -9, -9,-22,  0,-25,-18,  6, -8,  4, -5, 22, 14,-15,-35,-18,  9;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='S'; M= -4, -4,-21, -5,  2,-17,-11, -6,-21,  8,-23,-11,  2,-13,  9,  8, 10,  2,-16,-24,-10,  5;
/M: SY='F'; M=-15,-26,-26,-30,-23, 27,-24,-13,  5,-20, 14,  6,-22,-27,-21,-16,-22,-12, -1,  8, 22,-22;
/M: SY='R'; M=-12,-10,-24,-11, -1,-11,-18, -6,-14,  5, -6, -1, -5,-18,  3, 20, -6, -3,-12,-21, -7, -1;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-32,-25, 10,-31,-24, 20,-24, 18,  9,-27,-22,-23,-21,-22,-10, 16, -3,  4,-24;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M:         M= -8, -5,-21, -7, -3, -6,-19, -3, -4, -8, -1, -1, -4,-19, -5, -8, -8, -6, -4,-21, -2, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='P'; M= -1, -3,-24, -1,  9,-26,-10,-11,-21, -3,-23,-16, -4, 22,  1,-10,  1, -3,-22,-28,-22,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='E'; M=  0, -4,-22, -3,  5,-21,-10, -7,-18, -2,-14,-10, -4, -2,  1, -4,  2, -2,-15,-26,-15,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='E'; M= -9, 10,-27, 15, 17,-28, -5, -5,-28,  3,-24,-19,  6,  1,  4, -2,  2, -7,-25,-29,-20, 10; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-19, -2,  2,-13,-11, -4,-17, -5,-14,-11, -2,-10, -2, -6,  3,  1,-13,-21, -5, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='P'; M= -1, -6,-26, -5,  3,-22,-13,-13,-18,  1,-18,-12, -7, 14, -2, -6, -1, -2,-17,-22,-17,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='P'; M= -1,-12,-23,-11, -3, -9,-16,-12, -7, -7, -7, -7,-12,  2, -7, -9, -6, -5, -7,-18, -6, -7; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-15,  0,  6,-22,-11, -2,-22,  4,-19,-12,  3,-10,  3,  5,  0, -2,-18,-26,-14,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='K'; M= -8, -4,-25, -5,  0,-17,-16, -5,-16,  9,-13, -7, -3, -1,  0,  4, -8, -7,-15,-21, -7, -2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='H'; M= -8, -1,-24, -3, -4,-20, -3, 42,-24, -6,-19, -6,  6,-17,  1, -2, -5,-13,-20,-25,  1, -5; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='D'; M= -3,  5,-19,  7,  1,-18,-12,  2,-17, -6,-14,-11,  0, -1, -4, -9,  1,  4,-12,-25,-10, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='H'; M=-14, -5,-23, -4, -1,-10,-16, 33,-19, -2,-12, -4,  0, -6,  4,  8, -8,-11,-18,-18,  4, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='V'; M= -3,-23,-15,-25,-22,  3,-26,-12, 17,-17,  7,  7,-21,-24,-20,-15,-11, -4, 25,-18,  4,-22; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='L'; M= -8, -8,-21, -7, -8, -7,-21,-13,  1, -9,  5,  1, -9,-18, -9, -3,-10, -3,  2,-23, -7,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='F'; M= -7,-15,-22,-17, -8, 15,-24,-16,  2,-18,  8,  0,-14,-19,-16,-16,-13, -8, -1,-12,  2,-12; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M:         M= -7,-13,-24,-13, -6, -9,-15, -2, -9, -7, -8, -3,-11,-11, -5, -5, -9, -8, -6,-12, -2, -7; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='F'; M=-11, -9,-21,-11,-10,  7,-19,-12, -5,-12,  2,  1,-10,-16,-11,-11,-11, -5, -5,-17, -1,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='A'; M=  3, -1,-20, -2,  2,-16, -7,-11,-13, -7,-10,-10,  0,-12, -4,-10,  2, -1,-11,-25,-14, -1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='B'; M= -5, 17,-23, 17,  4,-25, -5, -6,-23, -4,-24,-19, 15,  2, -3, -8,  6,  1,-22,-33,-20,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-28, -4, -9,-28, 33,-11,-33, -6,-27,-17,  3,-14, -9, -5,  1,-13,-25,-24,-23,-10;
/M: SY='N'; M=  1,  0,-21, -3, -2,-17, -7, -7,-16, -4,-14, -9,  2,-15, -3, -4,  2,  0,-12,-23,-13, -3;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-22,  2, 10,-20,-21,-10,-11, -1, -7, -7, -6,-14,  3, -2, -5, -4, -8,-27,-13,  6;
/M: SY='L'; M= -3,-27,-20,-29,-21,  3,-28,-22, 20,-26, 31, 15,-26,-21,-19,-21,-21, -8, 15,-22, -5,-21;
/M: SY='R'; M=-13,-13, -9,-16,-11,-15,-18, -6,-15,  2,-13, -7, -6,-23, -3, 19, -8, -8, -9,-21, -8, -9;
/M: SY='F'; M=-20,-23,-25,-27,-21, 43,-29, -1, -4,-13,  3, -1,-17,-29,-20, -3,-19,-10, -6, 12, 43,-21;
/M: SY='N'; M=-10, -6,-23,-12,-11, -2,-18, -4, -7, -7,-10, -7,  2,-23, -9, -2, -8, -6, -6, -6, -1,-10;
/M: SY='D'; M=-19, 40,-29, 58, 17,-35,-12, -2,-34, -3,-21,-25, 14,-12, -1,-11, -3,-10,-26,-38,-18,  8;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-26,-11, -3,-20,-20,-11, -9, -8,-16, -8,-11, 19, -4, -9,  0,  1, -8,-29,-17, -6;
/M: SY='R'; M=-16,-11,-26,-11, -3,-18,-19, -4,-23, 22,-18, -9, -2,-20,  5, 54, -6, -7,-12,-23,-11, -3;
/M: SY='R'; M= -8, -8,-24, -9, -2,-20,-18, -8,-19, 17,-19, -9, -2,-13,  4, 29, -1,  0,-10,-24,-12, -1;
/M: SY='F'; M=-19,-26,-21,-34,-21, 67,-29,-18, -4,-24,  6, -2,-18,-27,-33,-15,-18,-10, -3,  5, 24,-23;
/M: SY='G'; M= -1,-12,-29,-13,-20,-25, 57,-20,-31,-21,-21,-15, -3,-21,-20,-20, -3,-19,-24,-20,-26,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 515 in 515 different sequences
Number of true positive hits 515 in 515 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 4
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 99.23 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
515 sequences

END8B_MYCBO (P64157), END8B_MYCTO (P9WNC0), END8B_MYCTU (P9WNC1), 
END8B_STRCO (O86820), END8_CITK8  (A8AJA5), END8_CROS8  (A7MQW6), 
END8_ECO24  (A7ZJ95), END8_ECO27  (B7ULJ5), END8_ECO45  (B7MFX3), 
END8_ECO55  (B7LAC0), END8_ECO57  (Q8X9C6), END8_ECO7I  (B7NMR0), 
END8_ECO81  (B7MPL0), END8_ECO8A  (B7M5M8), END8_ECOBW  (C4ZWI9), 
END8_ECODH  (B1X6P5), END8_ECOHS  (A7ZXX5), END8_ECOK1  (A1A8X0), 
END8_ECOL5  (Q0TJX8), END8_ECOL6  (Q8FJU5), END8_ECOLC  (B1IY15), 
END8_ECOLI  (P50465), END8_ECOLU  (B7N9V3), END8_ECOSE  (B6I7Y5), 
END8_ECOSM  (B1LLF1), END8_ECOUT  (Q1REK9), END8_ENT38  (A4W871), 
END8_KLEP3  (B5XZD9), END8_KLEP7  (A6T6E8), END8_PECAS  (Q6D7H0), 
END8_PECCP  (C6DCC8), END8_SALA4  (B5EZF2), END8_SALAR  (A9MJM8), 
END8_SALCH  (Q57RM1), END8_SALDC  (B5FNF0), END8_SALEP  (B5QWF8), 
END8_SALG2  (B5R679), END8_SALHS  (B4TBC8), END8_SALNS  (B4SZD3), 
END8_SALPA  (Q5PCL7), END8_SALPB  (A9MTR2), END8_SALPC  (C0PWD7), 
END8_SALPK  (B5BC82), END8_SALSV  (B4TQ44), END8_SALTI  (Q8Z8D2), 
END8_SALTS  (E1W9M1), END8_SALTY  (P0CL05), END8_SHIB3  (B2TU97), 
END8_SHIBS  (Q324J6), END8_SHIDS  (Q32IL9), END8_SHIF8  (Q0T6V4), 
END8_SHIFL  (Q83LZ7), END8_SHISS  (Q3Z489), FPG1_MYCTO  (P9WNC2), 
FPG1_MYCTU  (P9WNC3), FPG_ACAM1   (B0C5D4), FPG_ACIAD   (Q6FE90), 
FPG_ACIBS   (B0VRV3), FPG_ACIC1   (A0LV85), FPG_ACICJ   (A5FZ95), 
FPG_ACIET   (B9ME52), FPG_ACIF2   (B7J8I7), FPG_ACIF5   (B5ENT6), 
FPG_ACISJ   (A1W4G6), FPG_ACTP2   (A3N3S8), FPG_ACTP7   (B3GZD6), 
FPG_ACTPJ   (B0BU16), FPG_ACTSZ   (A6VKA1), FPG_AERHH   (A0KEN2), 
FPG_AERS4   (A4STD1), FPG_AGRT5   (Q8UIH4), FPG_AGRVS   (B9JZF5), 
FPG_ALBFT   (Q21XW7), FPG_ALCBS   (Q0VLB7), FPG_ALKEH   (Q0A598), 
FPG_ALTMD   (B4S2C6), FPG_ANAVT   (Q3MDP1), FPG_ARATH   (O80358), 
FPG_AROAE   (Q5P728), FPG_AZOC5   (A8IQM5), FPG_BACAN   (Q81L04), 
FPG_BACC1   (Q72ZF1), FPG_BACCR   (Q817G5), FPG_BACCZ   (Q633L1), 
FPG_BACFI   (P19210), FPG_BACHD   (Q9K855), FPG_BACHK   (Q6HCU5), 
FPG_BACLD   (Q65G93), FPG_BACSK   (Q5WEG7), FPG_BACSU   (O34403), 
FPG_BARBK   (A1UU20), FPG_BARHE   (Q6G4T2), FPG_BARQU   (Q6G0L3), 
FPG_BART1   (A9IN26), FPG_BAUCH   (Q1LTS6), FPG_BDEBA   (Q6ML45), 
FPG_BEII9   (B2IE81), FPG_BORA1   (Q2KYB7), FPG_BORPA   (Q7W185), 
FPG_BORPD   (A9I6Y3), FPG_BORPE   (Q7VUG7), FPG_BRADU   (Q89WC9), 
FPG_BRASB   (A5E887), FPG_BRASO   (A4YJG9), FPG_BREBN   (C0Z7Z0), 
FPG_BRUA1   (B2S9T2), FPG_BRUA2   (Q2YQP8), FPG_BRUAB   (Q57A83), 
FPG_BRUC2   (A9MAB2), FPG_BRUMB   (C0RG65), FPG_BRUME   (Q8YED2), 
FPG_BRUO2   (A5VTD0), FPG_BRUSU   (Q8FXR6), FPG_BURA4   (B1YN48), 
FPG_BURCA   (Q1BTH0), FPG_BURCH   (A0KAM1), FPG_BURCJ   (B4EAR7), 
FPG_BURM1   (A9AEZ2), FPG_BURM9   (A2S6C0), FPG_BURMA   (Q62FC7), 
FPG_BURMS   (A1UZN2), FPG_BURP0   (A3NRA1), FPG_BURP1   (Q3JW82), 
FPG_BURP6   (A3N5K5), FPG_BURP8   (B2JCP3), FPG_BURPP   (B2SXG9), 
FPG_BURPS   (Q63XL4), FPG_BURS3   (Q39CU4), FPG_BURTA   (Q2T1B3), 
FPG_BURVG   (A4JHZ1), FPG_BURXL   (Q145W8), FPG_CARHZ   (Q3ABL4), 
FPG_CAUCN   (B8GVY4), FPG_CAUCR   (Q9A259), FPG_CAUSK   (B0T7D1), 
FPG_CELJU   (B3PG51), FPG_CHESB   (Q11AV8), FPG_CHLAA   (A9WDC2), 
FPG_CHLAD   (B8G9X1), FPG_CHRVO   (Q7NQS5), FPG_CITK8   (A8ARM2), 
FPG_COLP3   (Q48AD4), FPG_CORA7   (C3PH91), FPG_CORDI   (Q6NGH4), 
FPG_COREF   (Q8FP17), FPG_CORGB   (A4QFD9), FPG_CORGL   (Q8NNV7), 
FPG_CORJK   (Q4JUY8), FPG_CORU7   (B1VG60), FPG_CROS8   (A7MQ97), 
FPG_CUPNH   (Q0KEP4), FPG_CUPPJ   (Q476F5), FPG_CUPTR   (B2AGU2), 
FPG_CYAA5   (B1WTF7), FPG_CYAP8   (B7K1T1), FPG_DECAR   (Q479M6), 
FPG_DEIRA   (Q9RX22), FPG_DESAD   (C6BUX8), FPG_DESHD   (B8FU83), 
FPG_DESHY   (Q24XW2), FPG_DESPS   (Q6APT2), FPG_DESRM   (A4J4X3), 
FPG_DESVH   (Q726D5), FPG_DICNV   (A5EXK6), FPG_DINSH   (A8LNK8), 
FPG_ECO24   (A7ZTI6), FPG_ECO27   (B7ULJ0), FPG_ECO45   (B7MFJ6), 
FPG_ECO55   (B7L758), FPG_ECO57   (P64148), FPG_ECO5E   (B5YWD3), 
FPG_ECO7I   (B7NPE1), FPG_ECO81   (B7N2X1), FPG_ECO8A   (B7M4B9), 
FPG_ECOBW   (C4ZXM7), FPG_ECODH   (B1X969), FPG_ECOHS   (A8A697), 
FPG_ECOK1   (A1AHG8), FPG_ECOL5   (Q0TBH4), FPG_ECOL6   (Q8FC87), 
FPG_ECOLC   (B1IZF8), FPG_ECOLI   (P05523), FPG_ECOLU   (B7NET9), 
FPG_ECOSE   (B6I3L2), FPG_ECOSM   (B1LK72), FPG_ECOUT   (Q1R4V8), 
FPG_EDWI9   (C5B9D8), FPG_ENT38   (A4W514), FPG_ENTFA   (Q837G3), 
FPG_ERWT9   (B2VF70), FPG_ERYLH   (Q2N7Y8), FPG_ESCF3   (B7LVJ6), 
FPG_EXIS2   (B1YKA0), FPG_EXISA   (C4L470), FPG_FRASN   (A8L594), 
FPG_FRATT   (Q5NGY3), FPG_GEODF   (B9M5V2), FPG_GEOKA   (Q5KWC3), 
FPG_GEOMG   (Q39WD1), FPG_GEOSL   (Q74EG5), FPG_GEOUR   (A5G7Q9), 
FPG_GLOVI   (Q7NFW7), FPG_GLUDA   (A9HI30), FPG_GLUOX   (Q5FN17), 
FPG_HAEDU   (Q7VN67), FPG_HAEI8   (Q4QLW2), FPG_HAEIE   (A5UDC3), 
FPG_HAEIG   (A5UI87), FPG_HAEIN   (P44948), FPG_HAEPS   (B8F586), 
FPG_HAHCH   (Q2SPF3), FPG_HALHL   (A1WZG2), FPG_HELMI   (B0TER7), 
FPG_HERA2   (A9B0X2), FPG_HERAR   (A4G916), FPG_HISS1   (Q0I0X6), 
FPG_HISS2   (B0UUX0), FPG_IDILO   (Q5QZC1), FPG_JANMA   (A6T2R7), 
FPG_JANSC   (Q28JI5), FPG_KINRD   (A6W7S6), FPG_KLEP3   (B5XTG8), 
FPG_KLEP7   (A6TFM6), FPG_LACAC   (Q5FIV8), FPG_LACDA   (Q1G9A3), 
FPG_LACDB   (Q049F3), FPG_LACGA   (Q041U1), FPG_LACH4   (A8YWE6), 
FPG_LACJO   (Q74IB5), FPG_LACLA   (Q9CIK4), FPG_LACLC   (P42371), 
FPG_LACPL   (Q88WV4), FPG_LACS1   (Q1WUN7), FPG_LACSS   (Q38VS5), 
FPG_LARHH   (C1DBB4), FPG_LEGPA   (Q5X7I9), FPG_LEGPH   (Q5ZY18), 
FPG_LEGPL   (Q5WYY6), FPG_LEIXX   (Q6AFJ3), FPG_LEPCP   (B1Y3P5), 
FPG_LISIN   (Q92BF1), FPG_LISMF   (Q71ZA3), FPG_LISMO   (Q8Y6W7), 
FPG_MAGSM   (A0L837), FPG_MANSM   (Q65R59), FPG_MARAV   (A1U749), 
FPG_MARMS   (A6VSY6), FPG_METC4   (B7KN75), FPG_METCA   (Q602J1), 
FPG_METEP   (A9W8R7), FPG_METFK   (Q1H3I3), FPG_METNO   (B8IIZ9), 
FPG_METPB   (B1ZGU8), FPG_METRJ   (B1LWY6), FPG_METS4   (B0UR68), 
FPG_METSB   (B8EKR5), FPG_MIMIV   (Q5UQ00), FPG_MOOTA   (Q2RHE9), 
FPG_MYCA1   (A0QJ66), FPG_MYCA9   (B1MDL2), FPG_MYCBO   (P64151), 
FPG_MYCBP   (A1KMR9), FPG_MYCBT   (C1AG40), FPG_MYCGE   (P55825), 
FPG_MYCGI   (A4TE57), FPG_MYCLB   (B8ZRZ2), FPG_MYCLE   (O69470), 
FPG_MYCMM   (B2HJJ6), FPG_MYCMO   (Q6KHS0), FPG_MYCPA   (Q73VL9), 
FPG_MYCPN   (P75402), FPG_MYCPU   (Q98QQ1), FPG_MYCS2   (A0QV21), 
FPG_MYCSJ   (A3PXU1), FPG_MYCSK   (A1UED7), FPG_MYCSS   (Q1BAM5), 
FPG_MYCTA   (A5U6T0), FPG_MYCUA   (A0PQ49), FPG_MYCVP   (A1T737), 
FPG_NEIG1   (Q5F8Z9), FPG_NEIMA   (P57014), FPG_NEIMB   (P55044), 
FPG_NITEC   (Q0AD66), FPG_NITEU   (Q82S12), FPG_NITMU   (Q2YBI1), 
FPG_NITOC   (Q3J7U5), FPG_NITWN   (Q3SWN3), FPG_NOCFA   (Q5YS09), 
FPG_NOCSJ   (A1SLU7), FPG_NOSP7   (B2J5G0), FPG_NOSS1   (Q8YP80), 
FPG_NOVAD   (Q2GAT0), FPG_OCEIH   (Q8EPE6), FPG_OLICO   (B6JCQ7), 
FPG_PARDP   (A1BAN2), FPG_PARL1   (A7HZC4), FPG_PARUW   (Q6MCT3), 
FPG_PASMU   (P57910), FPG_PECAS   (Q6DAV4), FPG_PECCP   (C6DIB8), 
FPG_PEDPA   (Q03GC2), FPG_PELCD   (Q3A3F2), FPG_PELPD   (A1AV29), 
FPG_PELTS   (A5D0T6), FPG_PHEZH   (B4RC43), FPG_PHODP   (Q8VW76), 
FPG_PHOLL   (Q7MY36), FPG_PHOPR   (Q6LVN0), FPG_POLNA   (A1VKP2), 
FPG_POLNS   (B1XS61), FPG_POLSJ   (Q12DZ5), FPG_PROM0   (A3PB53), 
FPG_PROM1   (A2C0H4), FPG_PROM2   (A8G2Y9), FPG_PROM4   (A9BDY5), 
FPG_PROM5   (A2BUV8), FPG_PROM9   (Q31CK0), FPG_PROMA   (Q7VDK6), 
FPG_PROMH   (B4F0X6), FPG_PROMM   (Q7V8Y5), FPG_PROMP   (Q7V2X4), 
FPG_PROMS   (A2BPD1), FPG_PROMT   (Q46H41), FPG_PSE14   (Q48CK1), 
FPG_PSEA6   (Q15ZV5), FPG_PSEA7   (A6UYG0), FPG_PSEA8   (B7V2S0), 
FPG_PSEAB   (Q02U58), FPG_PSEAE   (Q9L7T2), FPG_PSEE4   (Q1IGF3), 
FPG_PSEF5   (Q4K4A5), FPG_PSEFS   (C3K3N6), FPG_PSEMY   (A4Y028), 
FPG_PSEP1   (A5WAF9), FPG_PSEPF   (Q3K566), FPG_PSEPG   (B0KN79), 
FPG_PSEPK   (Q88CQ5), FPG_PSEPW   (B1J2M4), FPG_PSESM   (Q88AH6), 
FPG_PSEU2   (Q4ZM34), FPG_PSEU5   (A4VRM9), FPG_PSYA2   (Q4FUU7), 
FPG_PSYIN   (A1SR12), FPG_RALME   (Q1LRP7), FPG_RALPJ   (B2UES0), 
FPG_RALSO   (Q8Y2D7), FPG_RHIE6   (B3PZ93), FPG_RHIEC   (Q2KDA9), 
FPG_RHIL3   (Q1MMD9), FPG_RHILO   (Q98BG6), FPG_RHILW   (B5ZYK9), 
FPG_RHIME   (Q59752), FPG_RHISN   (C3MCY7), FPG_RHOCS   (B6IVU4), 
FPG_RHOE4   (C0ZXQ5), FPG_RHOOB   (C1B2Q5), FPG_RHOP2   (Q2J2I0), 
FPG_RHOP5   (Q07UF4), FPG_RHOPA   (Q6NDM1), FPG_RHOPB   (Q21CD4), 
FPG_RHOPS   (Q13EN7), FPG_RHOPT   (B3Q620), FPG_RHORT   (Q2RMQ2), 
FPG_RHOS1   (A3PFL2), FPG_RHOS4   (Q3IY64), FPG_RHOS5   (A4WVR6), 
FPG_RHOSK   (B9KQJ9), FPG_RHOSR   (Q0S2E0), FPG_RICAE   (C3PLF5), 
FPG_RICB8   (A8GXR0), FPG_RICBR   (Q1RJY6), FPG_RICCK   (A8EZP5), 
FPG_RICCN   (Q92GT4), FPG_RICFE   (Q4UMW5), FPG_RICM5   (A8F2H0), 
FPG_RICPU   (C4K2K4), FPG_RICRO   (B0BUU0), FPG_RICRS   (A8GTA0), 
FPG_ROSCS   (A7NQM8), FPG_ROSDO   (Q16DL0), FPG_ROSS1   (A5UUN1), 
FPG_RUEPO   (Q5LWT9), FPG_RUEST   (Q1GC55), FPG_RUTMC   (A1AW02), 
FPG_SACD2   (Q21EE3), FPG_SACEN   (A4FMJ7), FPG_SALA4   (B5EXE0), 
FPG_SALAI   (A8M661), FPG_SALAR   (A9MKN9), FPG_SALCH   (Q57IA7), 
FPG_SALDC   (B5FM59), FPG_SALEP   (B5R5F9), FPG_SALG2   (B5RGF2), 
FPG_SALHS   (B4T9C0), FPG_SALNS   (B4SXD7), FPG_SALPA   (Q5PC09), 
FPG_SALPB   (A9MVN0), FPG_SALPC   (C0Q1W8), FPG_SALPK   (B5BI09), 
FPG_SALSV   (B4TZX7), FPG_SALTI   (Q8Z2H2), FPG_SALTO   (A4X4F8), 
FPG_SALTY   (O54326), FPG_SERMA   (Q9X981), FPG_SERP5   (A8GLE2), 
FPG_SHEAM   (A1S1S3), FPG_SHEB2   (B8EDQ9), FPG_SHEB5   (A3CYP7), 
FPG_SHEB8   (A6WUE9), FPG_SHEB9   (A9KW47), FPG_SHEDO   (Q12SR9), 
FPG_SHEHH   (B0TN04), FPG_SHELP   (A3QJA8), FPG_SHEON   (Q8E8D9), 
FPG_SHEPA   (A8HA27), FPG_SHEPW   (B8CVD1), FPG_SHESA   (A0L2N2), 
FPG_SHESM   (Q0HDC3), FPG_SHESR   (Q0HPK4), FPG_SHESW   (A1RE25), 
FPG_SHEWM   (B1KL38), FPG_SHIB3   (B2TTU9), FPG_SHIBS   (Q31UZ1), 
FPG_SHIDS   (Q329M2), FPG_SHIF8   (Q0SYG3), FPG_SHIFL   (P64149), 
FPG_SHISS   (Q3YVZ7), FPG_SINMW   (A6UFF8), FPG_SODGM   (Q2NQU4), 
FPG_SOLUE   (Q01RU9), FPG_SPHAL   (Q1GN82), FPG_SPHWW   (A5VG06), 
FPG_STRA1   (Q3K028), FPG_STRA3   (P64152), FPG_STRA5   (P64153), 
FPG_STRAW   (Q82JU0), FPG_STRCO   (Q9ZBQ6), FPG_STRGG   (B1VYY1), 
FPG_STRM5   (B4SRN0), FPG_STRMK   (B2FU49), FPG_STRMU   (P55045), 
FPG_STRP1   (Q9A131), FPG_STRP3   (P0DB14), FPG_STRP6   (Q5XDE4), 
FPG_STRP8   (Q8P250), FPG_STRPM   (Q48UU6), FPG_STRPN   (Q97R61), 
FPG_STRPQ   (P0DB15), FPG_STRR6   (Q8DQ33), FPG_STRT1   (Q5M0P0), 
FPG_STRT2   (Q5M576), FPG_SYMTH   (Q67R59), FPG_SYNEL   (P95744), 
FPG_SYNP6   (Q08079), FPG_SYNPX   (Q7U4V2), FPG_SYNWW   (Q0AVE3), 
FPG_SYNY3   (P74290), FPG_TERTT   (C5BLG1), FPG_THEEB   (P59065), 
FPG_THEFY   (Q47S77), FPG_THERP   (B9L1Z5), FPG_THET2   (Q72HN2), 
FPG_THET8   (O50606), FPG_THICR   (Q31EB2), FPG_THIDA   (Q3SLR9), 
FPG_THISH   (B8GUQ6), FPG_TRIEI   (Q117D2), FPG_UREPA   (Q9PQ76), 
FPG_VARPS   (C5CYZ1), FPG_VESOH   (A5CX90), FPG_VIBC3   (A5F407), 
FPG_VIBCB   (A7MSN3), FPG_VIBCH   (Q9KVC5), FPG_VIBCM   (C3LQI3), 
FPG_VIBF1   (Q5E8M1), FPG_VIBFM   (B5FFG1), FPG_VIBPA   (Q87T81), 
FPG_VIBSL   (B7VHK6), FPG_VIBVU   (Q8DDY4), FPG_VIBVY   (Q7MPS3), 
FPG_WOLPM   (Q73G10), FPG_WOLPP   (B3CM71), FPG_WOLTR   (Q5GS47), 
FPG_WOLWR   (C0R4I6), FPG_XANAC   (Q8PEQ4), FPG_XANC5   (Q3BM92), 
FPG_XANC8   (Q4UNU6), FPG_XANCB   (B0RZ50), FPG_XANCP   (Q8P3C4), 
FPG_XANOM   (Q2P8V2), FPG_XANOP   (B2STU3), FPG_XANOR   (Q5H667), 
FPG_XANP2   (A7IKJ3), FPG_XYLFA   (P64154), FPG_XYLFT   (P64155), 
FPG_YERE8   (A1JHR7), FPG_YERP3   (A7FCT7), FPG_YERPA   (Q1C270), 
FPG_YERPB   (B2JYN6), FPG_YERPE   (Q8ZJP0), FPG_YERPG   (A9R677), 
FPG_YERPN   (Q1CD05), FPG_YERPP   (A4TSD4), FPG_YERPS   (Q66GD3), 
FPG_YERPY   (B1JQX0), FPG_ZYMMO   (Q9X3X1), NEIL1_HUMAN (Q96FI4), 
NEIL1_MOUSE (Q8K4Q6), NEIL2_BOVIN (Q6IE77), NEIL2_HUMAN (Q969S2), 
NEIL2_MOUSE (Q6R2P8), NEIL2_PONAB (Q5RAJ7), NEIL3_BOVIN (Q3MHN7), 
NEIL3_HUMAN (Q8TAT5), NEIL3_MOUSE (Q8K203)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
4 sequences

END8A_MYCBO (P64159), END8A_MYCTO (P9WNB8), END8A_MYCTU (P9WNB9), 
YL720_MIMIV (Q5UNW7)
» More

PDB
[Detailed view]
32 PDB

1EE8; 1K3W; 1K3X; 1K82; 1KFV; 1NNJ; 1PJI; 1PJJ; 1PM5; 1Q39; 1Q3B; 1Q3C; 1TDH; 1TDZ; 1XC8; 2EA0; 2OPF; 2OQ4; 2XZF; 2XZU; 3A42; 3A45; 3A46; 3C58; 3TWK; 3TWL; 3TWM; 3VK7; 3VK8; 3W0F; 4NRV; 4NRW
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission