PROSITE entry PS51070
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SHD |
| Accession [info] | PS51070 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-JAN-2005 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51070 |
| Associated ProRule [info] | PRU00403 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Stonin homology domain (SHD) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=149; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=144; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.2766134; R2=0.0074126; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=35566.0000000; R2=0.0000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1110; H_SCORE=35566; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=840; H_SCORE=35566; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='W'; M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10, 0,-30,-50,-30,200, 50,-10; /M: SY='P'; M= 0, 8,-17, 23, 21,-35,-10, -5,-28, 8,-17,-25, -7, 25, 0,-10, 7, -3,-25,-27,-17, 11; /M: SY='M'; M= -2,-20,-17,-30,-17, 19,-22, 0, 10, 3, 25, 31, -7,-37,-17, -7,-18, -5, 5,-18, 10,-17; /M: SY='M'; M= 10,-17,-20,-25, -2,-23,-20, 15, 2, 15, 10, 42, -3,-30, 13, 8,-17, 0, -8,-25,-10, 3; /M: SY='L'; M= -5,-13, -5,-13,-15, 17,-23,-15, 25,-20, 32, 15,-20,-33,-23,-17,-17, 3, 20,-23, 25,-15; /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20, 0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10, 0, 0, 0; /M: SY='H'; M= -2,-17,-28,-27, -9,-15,-18, 26, 19,-15, 2, 7, -5,-12, 11, -9,-10, -5, 4,-30, -7, -4; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='E'; M= 0, 5, -3, -3, 19,-22,-12, -8, 1, 5, -5, -2, 16,-10, 2,-18, -3, -7,-10,-31,-23, 14; /M: SY='K'; M= 0, 0,-30, 0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20, 0, 10, 0, 10, 0,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='K'; M= 0, 0,-30, 0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20, 0, 10, 0, 10, 0,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='N'; M= 0, 20,-20, 5, 5,-10, -5,-15,-10, 20,-20, 10, 39,-10, -5, -5, 0, 0,-20,-44,-25, 0; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -3,-23,-23,-40,-28, 21,-17,-13, 33, -8, 20, 14, -3,-35,-20,-18,-12, -5, 23,-20, 0,-28; /M: SY='M'; M= 10,-15,-20,-25,-13,-20,-20, 10, 7, 12, 15, 45, 3,-30, -7, -8,-10, 13, 3,-35,-10,-10; /M: SY='S'; M= 15, 0,-28, -3, -5,-18, 21,-18, -7, -3,-17,-12, 0,-10, -8,-13, 22, 7,-10,-25,-28,-10; /M: SY='Q'; M= 7, -3,-12, 0, 20,-23,-10, -5,-18, 5,-17,-15, -5, -2, 21, 0, 17, 5,-20,-20,-17, 18; /M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20, 0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10, 0, 0, 0; /M: SY='C'; M=-15,-20, 18,-28, -3, 4,-30, 14,-15,-15, -2, -8,-10,-15, 6, -3,-13,-15,-17,-17,-10, -1; /M: SY='W'; M=-50,-50,-20,-40,-10, 10, 10,-50,-30,-20,-20,-30,-70,-30,-10, 0,-30,-50,-30,200, 50,-10; /M: SY='G'; M= 0, 0,-35, -5, 0,-20, 34,-25,-15, 16,-20, 0, 0, 0,-10, -5, 0,-15,-25, -5,-20, -5; /M: SY='P'; M= -7,-15,-30, -7, 13,-32,-10, 2,-27, 18,-27,-25,-22, 84, 0, -5, -7, -3,-35,-27,-17, 3; /M: SY='I'; M= -8,-20, 28,-37,-20, -8,-18,-28, 40,-23, 15, 2, -3,-30,-20,-27,-13, -5, 25,-27,-23,-22; /M: SY='F'; M=-17,-27,-35,-32,-32, 59,-30,-22, 8,-13, 20,-12,-20,-35,-25, -7,-13,-10, 20, 10, 40,-32; /M: SY='V'; M= 5,-18,-15,-18,-25, 12,-28,-25, 35,-20, 17, 5,-20,-38,-28,-12,-12, 8, 40,-28, 15,-25; /M: SY='R'; M= -5,-10,-25, -5, 5,-10,-15,-15,-25, 25,-20, 10,-10, 0, 15, 46, -5,-20,-15,-10, -5, 5; /M: SY='L'; M= -5,-12, -5,-12,-15, 18,-22,-15, 25,-20, 33, 15,-20,-32,-22,-18,-18, 2, 20,-22, 25,-15; /M: SY='H'; M= -2,-13,-23,-15,-15, -5,-25, 20, 10,-18, 10, 10,-10,-15,-13,-17, -5, 10, 10,-38, 7,-13; /M: SY='D'; M= 0, 2,-30, 12, -8,-27, 8,-18, -9, -5,-12,-22,-10, 11,-15,-13, -5, -5, -9,-22,-12,-13; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='Q'; M= 5, -3,-20, -7, -5,-20, 9,-12, -8, -5,-10, -7, 0, -2, 16, -4, 2, 8,-12,-13,-12, 3; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='G'; M= 0, 10,-22, -2,-12,-17, 39,-17, -5, -5,-15,-10, 21,-13,-12,-15, 0, -7,-20,-13,-25,-12; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='P'; M= -5, -8, -8, -5, 0, -5, -8, 0, -3, -2, 2, -5,-13, 21, -5, -8, -8, 0, -8,-13, 2, -3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='V'; M= -5,-17,-30,-20,-25, 5,-23,-18, 22,-15, 15, 0,-13,-22,-15,-17, -5, 13, 28,-15, 20,-22; /M: SY='L'; M= -5,-13, -5,-13,-15, 17,-23,-15, 25,-20, 32, 15,-20,-33,-23,-17,-17, 3, 20,-23, 25,-15; /M: SY='Q'; M= -3,-15,-30,-10, 10,-15,-23, 0,-17, -3, -7,-10,-18, -5, 57, 22,-13, -3,-20, 5, 15, 25; /M: SY='L'; M= -5,-12, -5,-15,-10, 10,-20, -3, 18,-10, 35, 30,-15,-32,-18,-15,-20, 0, 8,-22, 20,-10; /M: SY='Y'; M=-32,-25,-45,-10,-17, 27,-27, -3, -2,-13, 33, -2,-35,-23,-13, -5,-20, -7, 10, 32, 75,-17; /M: SY='Y'; M=-20, 6,-34, 0,-15, 10,-15, -5, -5, -5, 4, -5, 21,-25,-10,-10,-10, 0, -5,-11, 23,-15; /M: SY='E'; M= 3, 10, -8, 25, 37,-40,-17, -5,-30, 10,-13,-15, -5, 2, 28, 0, -3,-12,-27,-18,-15, 35; /M: SY='Q'; M= 15, -5,-25, -5, 15,-22,-12,-10,-15, 10,-17, 3, -5, 0, 42, 15, -2, 0,-17,-23,-18, 22; /M: SY='G'; M= 0, 0,-37, -7,-10,-25, 57,-27,-13, 3,-20,-10, 0, -5,-15,-12, 0,-17,-27, 2,-25,-12; /M: SY='D'; M= -5, 21,-15, 41, 0,-16,-15,-15,-11,-10, 14, -6, -5,-20,-15,-15,-10, -5, -5,-30, 10, -5; /M: SY='E'; M= 10, 0,-10, 5, 34,-27,-12,-10,-20, 20,-13, 3, -5, 5, 12, -5, 3,-10,-17,-23,-22, 27; /M: SY='Q'; M= 5, -5,-25, -5, 20,-20,-15,-10,-20, 20,-20, 5, -5, 5, 41, 20, -5, -5,-25,-15,-10, 25; /M: SY='P'; M=-10,-20,-30,-10, 10,-40,-10, 10,-30, 10,-30,-40,-30,110, 0,-10,-10, 0,-40,-30,-20, 0; /M: SY='F'; M=-15,-27,-27,-47,-37, 75,-25,-27, 15,-13, 20,-12, -7,-37,-27,-15,-10,-15, 18, 0, 20,-37; /M: SY='Q'; M= 3,-10,-22, -8, 13,-20,-18, -7,-22, 12,-20, 0,-10, 0, 48, 38, -8,-10,-23,-10, -8, 23; /M: SY='E'; M= 0, 0, 10, 10, 60,-40,-20, 0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10, 0,-20,-30,-10,-20, 50; /M: SY='F'; M=-10,-17,-12,-27,-22, 35,-20,-17, 25,-18, 30, 8,-13,-32,-22,-20,-15, -5, 17,-15, 20,-22; /M: SY='P'; M= -3,-10,-20, -8, 10,-15,-15, -5,-12, 7, -7, -3,-15, 23, 14, 2,-10, -2,-20,-20, -2, 10; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 30,-10; /M: SY='Q'; M= 5, 7,-15, 19, 28,-37,-18, -5,-27, 5,-15,-15, -5, 0, 44, 10, -5, -7,-28,-17,-12, 33; /M: SY='P'; M= 5,-15,-28,-15, -2,-25, -7, -5, 0, 0,-13,-15,-15, 45, -2,-15, -5, 3, -7,-35,-23, -7; /M: SY='C'; M=-12,-12, 18,-12, -7, -8,-22,-20,-10,-12, 2,-13,-10,-15,-10,-15, 6, 10, -3,-13, -1,-10; /M: SY='Y'; M=-33,-25, -2,-17, -8, 1,-32, 23,-15,-17, 13, -5,-25,-15,-10, -7,-18,-15, -7, 8, 32,-10; /M: SY='S'; M= 3, -5,-13, 0, 13,-17,-10, -8,-20, 7,-18,-13, -7, -5, 7, 12, 18, -2,-15,-18,-15, 7; /M: SY='I'; M= -2,-15,-10,-20,-20, 12,-20,-18, 35,-20, 27, 12,-15,-33,-23,-20,-15, 3, 28,-25, 15,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-20, 0, 0,-10, 0,-10,-10, 0,-20,-20, 0,-10,-10,-10, 40, 20,-10,-30,-20,-10; /M: SY='E'; M= 0, 13, 0, 30, 47,-43,-17, -5,-33, 15,-10,-15, -5, 5, 12,-10, 0,-17,-27,-18,-17, 37; /M: SY='P'; M= -2,-15,-25,-18, -8,-25,-13, -5, 1, -3, -9,-17,-12, 46, -5,-20, -2, 13, -7,-35,-15,-10; /M: SY='R'; M= 0, -5,-28, -8, -8,-18, 8,-20,-15, 7,-15, 0, -2, -3, 2, 9, 3, -2,-12,-15,-13, -5; /M: SY='I'; M= 8,-10,-13,-10,-12, 7,-17,-17, 20,-15, 20, 13,-15,-27,-15,-15,-10, 5, 20,-30, 7,-12; /M: SY='Q'; M= 8, -8,-13, -5, 30,-32,-20, 0,-22, 5,-18,-10,-10, 2, 66, 20, -8, -5,-30,-10,-12, 42; /M: SY='N'; M= 13, 17,-18, 2, 0,-18, -5,-10, -5, 0,-17, 0, 36,-17, 18, -5, 0, 7,-15,-49,-32, 5; /M: SY='Y'; M=-35,-30,-53,-20,-25, 47,-30, -7, -8,-10, 28,-12,-33,-25,-15, -2,-18,-12, 10, 40, 76,-25; /M: SY='D'; M= 2, 38,-28, 68, 8,-40, -8,-18,-33, 0,-12,-28, 8,-10,-10,-10, 10, -3,-18,-38,-12, -2; /M: SY='Q'; M= 8,-12,-13,-10, 5,-13,-25,-15, 7, -5, -3, -5,-15,-17, 11, 0, -8, 0, 9,-20, -3, 8; /M: SY='F'; M= -6, -5,-33,-13,-18, 26,-15,-15, -3, -5, 5, -5, 7,-25,-10,-10, -5, -3, 3,-14, 11,-18; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='K'; M= -2, -5,-28, -2, 13,-10,-12,-18,-22, 33,-20, 15, -5, 5, 7, 27, -2,-15,-18,-15, -8, 8; /M: SY='I'; M= 0,-20,-20,-40,-30, 0,-10,-20, 60,-20, 20, 10, 0,-30,-20,-30,-10, 0, 40,-30,-10,-30; /M: SY='H'; M=-20,-23,-45,-28,-10, 4,-30, 96,-15,-17, -2, 10,-10, -3, -8,-10,-10,-20,-20,-35, 8,-10; /M: SY='T'; M= 10, 0,-20, -8,-15,-18,-15,-18, -2, -8, -5, -5, 8, -2, -2,-25, 25, 43, 5,-45,-12,-10; /M: SY='I'; M= 5,-18,-15,-20,-20, 5,-25,-12, 27,-10, 20, 20,-15,-38,-22,-10,-15, 5, 27,-28, 10,-20; /M: SY='K'; M= -2, -5,-28, -2, 13,-10,-12,-18,-22, 33,-20, 15, -5, 5, 7, 27, -2,-15,-18,-15, -8, 8; /M: SY='I'; M= -5,-15,-10,-25,-20, 10,-15,-15, 40,-20, 30, 15,-10,-30,-20,-25,-15, 0, 25,-25, 10,-20; /M: SY='Q'; M= 5, 7,-15, 20, 27,-37,-18, -5,-27, 5,-15,-15, -5, 0, 43, 10, -5, -7,-28,-17,-12, 32; /M: SY='Y'; M=-23,-25,-40,-23,-18, 23,-28, 23,-15, -7, 5, -3,-20,-15, -3, 15,-13,-20, -5, 3, 31,-15; /M: SY='V'; M= 7,-20,-20,-25,-30, 7,-25,-27, 45,-20, 13, 3,-15,-37,-27,-15,-10, 7, 47,-30, 5,-30; /M: SY='F'; M= 2,-13,-23,-20,-23, 21,-20,-23, 8,-10, 3,-10, -5,-23,-18,-15, 9, 15, 15,-25, 3,-23; /M: SY='Y'; M=-40,-30,-60,-10,-20, 30,-30, 0,-10,-10, 30,-10,-40,-20,-10, 0,-20,-10, 10, 50, 90,-20; /M: SY='K'; M= 2, 0,-28, -2, 10,-12,-12,-20,-15, 28,-15, 15, 2, 8, 0, 0, 5, 4,-13,-27,-10, 5; /M: SY='E'; M= 0, 0, 10, 10, 60,-40,-20, 0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10, 0,-20,-30,-10,-20, 50; /M: SY='K'; M= -3, -5,-27, -3, 12,-10,-13,-17,-23, 32,-20, 15, -5, 5, 8, 28, -3,-15,-17,-15, -7, 7; /M: SY='P'; M= -2,-15,-25,-10, -2,-13,-17,-12,-10, 10,-15, -5,-18, 18, 0, 17, -8, -7, -5,-20, -5, -5; /M: SY='G'; M= 0, 0,-35, -5, 0,-20, 36,-25,-15, 14,-20, 0, 0, 0,-10, -5, 0,-15,-25, -5,-20, -5; /M: SY='Y'; M=-17,-25,-40,-20,-25, 17,-25,-13, 21,-15, 22, -2,-25,-28,-18,-10,-15, -2, 28, 9, 44,-25; /M: SY='R'; M= -7,-18,-27,-12, 0,-20,-22, 28,-25, 0,-18, 2,-15, -3, 35, 46,-10,-20,-20,-14, -2, 10; /M: SY='P'; M= -5,-15,-28, -8, 8,-33, -8, 5,-25, 8,-28,-35,-23, 81, -2,-10, 2, 5,-33,-30,-20, -2; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='G'; M= 0, 0,-20, -5,-10,-15, 41,-15, -5, -5,-10,-10, 0, -5,-10,-10, 0,-10,-15, 5,-15,-10; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='Q'; M= 5, -5,-10, -5, 10,-15,-10, 0,-10, 0,-10, -5, -5, 0, 41, 15, -5, 0,-15, -5, -5, 20; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='I'; M= 3,-10,-10,-15,-15, 3,-10,-13, 26,-10, 8, 3, -5,-18,-13,-10, -5, 3, 23,-15, 0,-15; D=-3; /I: I=-3; MD=-7; /M: SY='T'; M= 5, 0,-10, -3, -5, -8, -5, -8, -3, -3, -5, -5, 3, -3, -3,-10, 15, 18, 0,-21, -8, -5; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7; /M: SY='R'; M= -3, -5,-13, -3, 3, -5, -8, -8,-13, 13,-10, 5, -5, 0, 8, 23, -3,-10, -8, -5, -3, 3; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='E'; M= -3, -3, 3, 0, 13, -5,-10, -3, -3, 0, 8, 2, -8, -5, 0, -8, -5, -5, -5, -8, 2, 10; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='F'; M= -3,-13,-13,-18,-18, 28,-15,-15, 10, -8, 8, -5, -8,-20,-15, -5, -5, -3, 15, -5, 10,-18; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='D'; M= 0, 13,-18, 20, -3,-20, 18,-13,-13, -3, -8,-13, 3, -5, -8, -8, 0, -8,-13, -8,-10, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='G'; M= 3, 0,-15, -3, -5,-10, 20,-10, -5, -3,-10,-10, 0, -5, -8, -8, 10, 0,-10, -5,-13, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='H'; M= -5, 8,-20, 18, 3,-21,-10, 30,-15, -5, -5, -3, 0, 0, -3, -5, -3, -8,-13,-23, -3, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='I'; M= -3, -8, -5,-13,-10, 5, -8, -8, 20,-10, 15, 8, -5,-15,-10,-13, -8, 0, 13,-13, 5,-10; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='T'; M= 3, 0,-13, -3, 0, -8, -8,-10, -5, 8, -5, 5, 3, 3, 0, -5, 5, 10, -3,-18, -5, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='K'; M= 0, 0,-15, 0, 10, -5, -5,-10,-10, 20,-10, 10, 0, 5, 0, 5, 0, -5,-10,-10, -5, 5; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='Y'; M=-13,-10,-15, -5, -8, 13,-13, -3, 3, -8, 18, 3,-15,-13, -8, -5,-10, -3, 5, 8, 31, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-7; /M: SY='G'; M= 0, 0,-35, -5, 0,-20, 36,-25,-15, 14,-20, 0, 0, 0,-10, -5, 0,-15,-25, -5,-20, -5; /M: SY='L'; M= -5,-10,-12,-10, -7, -4,-18, -7, 3,-10, 13, 0,-15, 12,-10,-20, -8, 12, -2,-30, 8, -8; /M: SY='P'; M= 5,-10,-20, -3, 20,-35,-10, 0,-23, 10,-20,-20,-18, 56, 7,-10, -3, -2,-25,-30,-25, 12; /M: SY='V'; M= 5,-17,-15,-17,-25, 13,-27,-25, 35,-20, 18, 5,-20,-37,-27,-13,-13, 7, 40,-27, 15,-25; /M: SY='E'; M= 12, -5, -7, 0, 24,-23,-17,-12, -6, 5, -5, -3,-10, -7, 6,-10, 0, -5, -1,-25,-18, 18; /M: SY='H'; M=-20,-20,-50,-20, 0,-30,-30,140,-20,-20,-10, 20,-10, 10, 0,-10,-10,-20,-30,-50, 0, 0; /M: SY='S'; M= 15, 0,-15, 0, 9,-22,-10,-13,-10, 2,-10, -5, 0, -3, 5,-15, 18, 15, -5,-35,-23, 7; /M: SY='P'; M= 15,-10,-30, -5, 5,-30, -5, -5,-15, 5,-20,-15,-15, 50, 5,-10, 0, 5,-15,-40,-30, 0; /M: SY='Q'; M= 5, 7,-15, 19, 28,-37,-18, -5,-27, 5,-15,-15, -5, 0, 44, 10, -5, -7,-28,-17,-12, 33; /M: SY='C'; M= -8,-15, 28,-20, -7,-13,-18,-23, -1,-10, -5, -8, -8,-20, -5, 5, 0, -7, -1,-20,-23,-10; /M: SY='E'; M= 5, 0, -5, 2, 24,-27,-15, -8,-17, 7,-10,-10, -2, 2, 7,-15, 15, 8,-15,-25,-17, 19; /M: SY='Q'; M= 10,-13,-20,-13, 7,-20,-23, -8, -5, -5,-12, -7,-13,-10, 52, 20,-10, 3,-10,-15, -5, 22; /M: SY='L'; M= 0,-15,-10,-17,-15, 8,-22, -8, 23,-10, 28, 25,-15,-35,-20,-13,-18, 2, 18,-25, 15,-15; /M: SY='F'; M=-10,-18,-13,-28,-23, 36,-20,-18, 25,-17, 30, 7,-12,-33,-23,-20,-15, -5, 17,-15, 20,-23; /M: SY='K'; M= 0, 0,-30, 0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20, 0, 10, 0, 10, 0,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='F'; M=-10,-18,-13,-28,-23, 35,-20,-18, 25,-17, 30, 7,-12,-33,-23,-20,-15, -5, 18,-15, 20,-23; /M: SY='G'; M= 0, 0,-40,-10,-20,-30, 80,-30,-10,-10,-20,-20, 0,-10,-20,-20, 0,-20,-30, 10,-30,-20; /M: SY='S'; M= 10, 0,-20, -2, -5,-12, -5,-12, -8, -2,-15,-15, 2, -8, -8,-15, 35, 27, -5,-35,-18,-10; /M: SY='T'; M= 5, -8,-15,-15,-15,-10,-20, -7, 8, -5, 15, 21, 0,-18, -8,-20, 0, 24, 7,-37, 0,-10; /M: SY='N'; M= 2, 30,-12, 8, -8,-10, 0,-10, -2, 0,-20, -5, 61,-25,-10,-18, 10, 12,-18,-60,-35,-10; /M: SY='Y'; M=-20,-22,-52, -7,-15, 17,-22, -5, -7, -7, 20, -5,-30,-17, -5, -3,-12, -5, 10, 25, 57,-15; /M: SY='H'; M= -2, 8,-22, 20, 18,-32,-15, 26,-25, 0,-13,-10, -2, 0, 0,-10, 8, -7,-22,-32,-13, 10; /M: SY='D'; M= -5, 32,-35, 62, 7,-45,-15, 21,-35, -5,-10,-17, 5, -5, -7,-10, -3,-13,-23,-43, -7, 0; /M: SY='F'; M=-10,-22,-20,-35,-25, 49,-25,-12, 8, -5, 25, 11,-10,-37,-22,-10,-15,-10, 7, -8, 20,-25; /M: SY='M'; M= -2, -7,-13, -7, 5, 0,-17,-10, 0, 1, 9, 12,-12,-12, 11, 0,-12, -3, -8,-17, 10, 8; /M: SY='D'; M= 8, 9,-22, 16, 2,-27,-13,-12,-17, -3,-13,-15, 2, -5, 16, -5, 12, 15,-12,-32,-12, 5; /M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30, 0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40; /M: SY='I'; M= 3,-12,-15,-17,-17, 5,-15,-18, 27,-15, 12, 2,-10,-27,-20,-17, 1, 8, 22,-28, 2,-20; /M: SY='T'; M= 3,-10,-27,-15,-18,-15,-25, 17, 5,-15, 0, 5, -3, -8, -8,-20, 5, 22, 10,-45, -2,-13; /M: SY='C'; M= 7, -5, 27,-13, -7,-23,-20,-28, -5,-13, -2, -3, 2,-10, -3,-22, 7, 22, 2,-42,-30, -5; /M: SY='V'; M= 7,-20,-20,-25,-30, 7,-25,-27, 45,-20, 13, 3,-15,-37,-27,-15,-10, 7, 47,-30, 5,-30; /M: SY='E'; M= 2, -2, 3, 5, 50,-38,-20, 0,-28, 15,-12,-10,-10, 8, 35, 0, -2,-15,-30,-10,-18, 48; /M: SY='D'; M= 0, 25,-10, 50, 35,-45,-15,-10,-35, 10,-10,-20, 0, 0, 5,-10, 0,-15,-25,-25,-15, 25; /M: SY='Q'; M= 5, -8,-10, -3, 9,-12,-15,-10,-10, 2, 0, 5,-12,-10, 10, 10, -5,-10, -5,-20, -8, 9; /M: SY='L'; M=-10,-10, 0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20, 0, 10,-20, 30,-10; /M: SY='F'; M= -5,-25,-25,-40,-25, 41,-25, -6, 5, 5, 20, 19, -5,-40,-20, -5,-15,-10, 5,-10, 10,-25; /M: SY='K'; M= 0, 12,-30, 22, 18,-20,-10,-20,-25, 30,-18, 8, 2, 5, -2, 5, 0,-10,-20,-25,-10, 8; /M: SY='C'; M=-12,-15, 38,-23,-10, 2,-22,-23, 20,-23, 25, 7,-12,-30,-20,-23,-17, -5, 10,-23, -3,-13; /M: SY='P'; M= -7,-15,-30, -7, 13,-32,-10, 2,-27, 18,-27,-25,-22, 85, 0, -5, -7, -3,-35,-27,-17, 3; /M: SY='V'; M= 22,-10,-25,-15,-15, -7,-10,-22, 25,-10, 3, 8, -5,-23, -8,-15, 0, 7, 28,-40,-20,-15; /M: SY='L'; M= 0,-10,-10,-12,-17, 7,-22,-17, 20,-17, 23, 10,-12,-25,-17,-20, -7, 15, 20,-30, 15,-15; /M: SY='R'; M= 0,-10,-20, -5, -5,-10,-10,-10,-20, 5,-20,-10,-10,-10, 10, 36, 14, -6,-10,-15,-10, -5; /M: SY='K'; M= 5, -5,-15, -7, 13,-23,-18, -5,-10, 17, -2, 17, 0, -5, 3, -8, 0, 5,-10,-28,-13, 10; /M: SY='P'; M= 5, 2,-27, 17, 2,-30,-10,-10,-25, 5,-17,-15,-10, 19, 8, 13, -2, -8,-15,-30,-17, 0; /M: SY='M'; M= 8, -2,-23, -2, 7, -5,-10,-18, -5, 15, -3, 17, -5, -5, -2, -3, -2, -2, -5,-28, -8, 2; /M: SY='P'; M= -3, -8,-20, -5, 5,-10,-10, -7,-10, 7, -7, -5,-13, 20, -8, -8, 2, 3,-15,-25, -5, -3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of true positive hits | 7 in 7 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 87.50 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SHD |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
7 sequences
STNB_CAEEL (P90761), STNB_DROME (Q24212), STON1_HUMAN (Q9Y6Q2), STON1_MOUSE (Q8CDJ8), STON2_HUMAN (Q8WXE9), STON2_MOUSE (Q8BZ60), STON2_RAT (D4AB66)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
RASF8_HUMAN (Q8NHQ8) |