Entry: PS51074

General information about the entry

Entry name [info] ZF_DPH
Accession [info] PS51074
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51074
Associated ProRule [info] PRU00456

Name and characterization of the entry

Description [info] Zinc finger DPH-type profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=57;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=52;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5419047; R2=0.0187807; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=539.03896; R2=21.33766; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=451; N_SCORE=11.0; H_SCORE=7303; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; N_SCORE=6.5; H_SCORE=5041; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-10; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F'; M= -7,-19,-17,-21,-20,  2,-10,-16, -3,-20, -9, -6,-14,-25,-19,-22, -9, -7, -1,-11, -1,-20;
/M: SY='Y'; M= -8,-18,-17,-17,-13,  0,-24, -2, -5,-15, -1, -4,-14,-23,-11,-16,-11,-12, -6,-14,  9,-14;
/M: SY='D'; M= -8, 16,-25, 27, 15,-26,-13,-11,-23, -5,-26,-19,  1,-12,  1,-11,  2, -6,-21,-34,-24,  8;
/M: SY='E'; M= -8, -5,-27,  0, 18,-20,-24, -8,-10, -3,-13, -8, -8,-15,  6, -9, -4, -6, -5,-28,-15, 14;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-13,-27,-21, -1,-31,-21, 21,-21,  8,  6,-24,-24,-18,-25,-15, -5, 21,-23, -4,-20;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-23,  8, 16,-25,-15, -2,-25,  4,-25,-16,  5,-13,  6, -1,  7, -2,-21,-29,-17, 12;
/M: SY='L'; M= -9,-31,-13,-31,-23, -4,-36,-26, 18,-17, 24, 12,-25,-27,-18,-18,-16, -9, 11,-25,-12,-23;
/M: SY='E'; M=-11, 17,-32, 26, 28,-29,-15, -5,-27,  4,-30,-21,  4,-11,  9, -5,  1, -8,-22,-34,-23, 20;
/M: SY='D'; M=-14, 23,-31, 38, 22,-29,-14,-10,-28, -6,-33,-24,  3, -4,  3,-15, -1,-10,-24,-37,-27, 13;
/M: SY='F'; M=-14,-28,-15,-29,-24, 21,-30,-16,  4,-18, 10, 18,-21,-29,-15,-17,-14,-11, -1, -6,  5,-20;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-29,  8, 23,-24,-18, -7,-21,  5,-22,-13,  0,-12, 10, -4,  3, -2,-14,-28,-18, 19;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='Y'; M=-15,-25,-19,-25,-21, 17,-19, -8, -7,-21, -8, -4,-22,-29,-17,-21,-17,-15, -8, 13, 20,-21; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='D'; M= -9, 11,-26, 15, 12,-26,-13, -6,-21, -4,-25,-18,  9,-11,  1, -8,  3, -3,-18,-34,-21,  7;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-29,  3, 18,-24,-13, -5,-25,  2,-23,-15, -3, -8,  9, -4, -2,-10,-17,-26,-14, 14;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-31, 18, 15,-28,  4, -8,-30, -5,-32,-23,  2,-13,  3,-11,  1, -9,-23,-29,-24, 10;
/M: SY='E'; M= -8, -4,-24, -2,  7,-21,-18,-12,-14,  2,-11, -5, -4,-15,  2, -6,  0, -2,-10,-27,-18,  5;
/M: SY='E'; M=-12,  1,-25,  3,  8,-21,-13, -7,-23, -2,-22,-14, -2,-17,  4, -6, -5,-11,-19,-22,-16,  6;
/M: SY='T'; M=  0, -8,-13, -6, -5,-19,-11,-17,-11, -8,-13, -8, -5,-14, -7,-14,  7,  8, -6,-26,-19, -6;
/M: SY='Y'; M=-19,-32,-18,-32,-26, 34,-30, -5, -3,-25,  0, -2,-28,-35,-21,-26,-21,-18, -8, 19, 35,-26;
/M: SY='F'; M=-10,-21,-16,-20,-18, 12,-25, -7, -2,-18, -2, -2,-17,-25,-15,-19, -8, -5, -4, -8, 12,-18;
/M: SY='Y'; M=-14,-25,-18,-26,-14, 10,-29,  1, -6,-10, -3,  1,-18,-25, -7,-11,-16,-14, -5, -1, 27,-14;
/M: SY='P'; M= -9, -6,-24,  1, -5,-23,-16,-13,-24,-10,-25,-17, -7, 21, -7,-17, -2, -3,-18,-30,-18, -6;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-30,-15, -5,-35,-20,-10,-30,  4,-25,-15,-10, 27,  0, 14,-10,-10,-25,-35,-25, -5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-29, -9,-14,-29, 47,-17,-37,-16,-36,-25,  0,-18,-11,-16,  1,-17,-28,-21,-27,-13;
/M: SY='D'; M=-11, 11,-26, 19,  2,-18,  0, -7,-24,-13,-29,-22,  3,-16, -7,-18, -1,-11,-22,-28,-17, -3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M:         M= -9,-11,-24,-13, -8,-12, -5,-10,-19, -4,-17,-12, -6,-20, -7, -5, -5, -8,-16,-18, -8, -9;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-19,-30,-28, 51,-31, -6,  0,-28,  0, -1,-28,-38,-26,-28,-20,-19, -8, 10, 35,-28;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-19, -4,  6,-21,-20,-10,-10, -2,-13, -7, -5,-15,  3, -8, -1, -4, -6,-29,-16,  5;
/M: SY='I'; M= -9,-32,-12,-32,-27,  4,-32,-27, 21,-24, 19, 10,-28,-28,-24,-26,-19, -8, 17,-20, -6,-27;
/M: SY='T'; M=  0, -4,-16, -4, -4,-23,-12,-14,-18, -4,-17,-12,  3, -2, -5,-10, 14, 17,-13,-29,-21, -4;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-28, -2, 18,-24,-22,-10,-18,  8,-14, -9, -7,-10,  7, -2, -2, -8,-12,-29,-18, 14;
/M: SY='D'; M=-11, 19,-31, 28, 27,-29,-12, -4,-28,  1,-31,-21,  8,-11,  9, -6,  4, -7,-24,-34,-23, 20;
/M: SY='D'; M=-11, 13,-27, 23, 16,-24,-17, -8,-20, -5,-22,-16,  0,-13,  2,-12, -3, -9,-17,-32,-21, 10;
/M: SY='L'; M= -7,-27, -9,-27,-19, -5,-31,-22,  7,-16, 17, 10,-22,-25,-10,-16,-13, -8,  3,-20, -8,-18;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-29,  3, 11,-22,-10, -7,-24, -3,-23,-15, -4,-13,  5, -5, -5,-12,-19,-25,-15,  8;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-31, 10, 22,-27,-13, -3,-26,  4,-24,-15,  7,-13, 13, -1,  2, -6,-21,-29,-19, 18;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -5,-10,-25, -8, -6,-14,  7, -6,-23,-13,-24,-17, -6,-16, -9,-16, -4,-13,-17,-18, -6, -8;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-27,  3, 18,-19,-19, -5,-19,  0,-20,-12, -3,-14,  9, -5,  2, -2,-13,-23,-10, 15;
/M: SY='V'; M= -6,-10,-19, -6, -3,-16,-20,-20,  3,-13, -5, -4,-13,-18,-10,-20, -9, -4,  7,-30,-17, -6;
/M: SY='I'; M= -7,-31, -2,-31,-27, -3,-36,-28, 28,-25, 16,  9,-30,-27,-25,-28,-19, -8, 25,-26, -7,-27;
/M: SY='V'; M=  6,-24,-10,-24,-16, -9,-20,-20,  4,-15,  0, -1,-21,-11,-14,-20, -6, -1, 10,-24, -8,-16;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='Q'; M= -6, -6,-21, -5,  8,-24,-17, -9,-16,  1,-16, -6, -6, -8, 13, -2, -2, -5, -9,-25,-15, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M=  0,-30, 90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
/M: SY='P'; M= -4, -3,-25,  3, -2,-30,  0,-14,-27, -8,-28,-17, -3, 10, -3,-14,  2, -7,-21,-31,-25, -3;
/M: SY='S'; M=  8, -4,-14, -3, -1,-15, -3,-12,-18, -5,-19,-12,  0,-13, -4,-12, 22,  4,-16,-26,-17, -2;
/M: SY='C'; M= -1,-28, 80,-29,-37,-21,-29,-28,-12,-26,-11,-10,-28,-29,-27,-23,-10,-10,-12,-21,-20,-28;
/M: SY='S'; M=  7, -3,-11, -3, -3,-13, -3,-10,-18, -3,-18, -9,  6,-12, -3,-12, 34,  9,-18,-26,-16, -3;
/M: SY='L'; M= -8,-36,-10,-36,-27, -2,-36,-28, 19,-19, 32, 16,-27,-28,-19,-20,-15, -8, 11,-22,-11,-27;
/M: SY='W'; M=-11,-25,-11,-25,-20, -7,-25,-21, -4,-16, -4,  1,-22,-18,-15,-20,-10, -5, -3,  5, -6,-19;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-11,-24,-22, -6,-34,-28, 24,-23, 16,  8,-25,-25,-22,-26,-16, -6, 21,-28,-12,-23;
/M: SY='K'; M=-12, -8,-25,-11,  6,-20,-22, -6,-24, 14,-19,-10, -7,-17,  7,  9, -6, -8,-18,-13, -9,  5;
/M: SY='V'; M= -2,-29,-10,-29,-21, -8,-30,-28, 24,-19, 13, 10,-26,-22,-19,-26,-14, -1, 28,-28,-11,-21;
/M: SY='I'; M=-11,-14,-13,-17,-14,-14,-27,-19,  3, -9,  0, -1,-11,-23,-12,-13,-11, -6,  2,-24,-14,-14;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-22,-23,-15, 15,-27,  7,-13,-14,-12, -8,-17,-19, -8,-14,-15,-14,-12,  0, 30,-14;
/M: SY='D'; M= -9,  9,-26, 14,  8,-19, -8, -6,-23, -7,-26,-18,  5,-15,  1,-13,  1, -7,-19,-27,-14,  5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 40 in 40 different sequences
Number of true positive hits 40 in 40 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] ZN_FING
Feature description [info] DPH-type
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
40 sequences

DJC24_BOVIN (Q0VBY7), DJC24_HUMAN (Q6P3W2), DJC24_MOUSE (Q91ZF0), 
DPH3B_HUMAN (Q9H4G8), DPH3_ASHGO  (Q74Z32), DPH3_ASPFU  (Q4WPU8), 
DPH3_BOVIN  (Q1LZC9), DPH3_CAEEL  (Q21102), DPH3_CANGA  (Q6FXS6), 
DPH3_CRIGR  (Q6VUC1), DPH3_CRYNB  (P0CN23), DPH3_CRYNJ  (P0CN22), 
DPH3_DEBHA  (Q6BTW5), DPH3_DROME  (Q9VGQ9), DPH3_EMENI  (P0C0V4), 
DPH3_ENCCU  (Q8STR6), DPH3_GIBZE  (Q4I9U7), DPH3_HUMAN  (Q96FX2), 
DPH3_KLULA  (Q6CMG4), DPH3_MACFA  (Q4R312), DPH3_MOUSE  (Q8K0W9), 
DPH3_NEUCR  (Q7SC15), DPH3_PONAB  (Q5R7N8), DPH3_SCHPO  (Q9UT33), 
DPH3_USTMA  (Q4P8G2), DPH3_YARLI  (Q6C0G3), DPH3_YEAST  (Q3E840), 
DPH4_ASHGO  (Q752D7), DPH4_ASPFU  (Q4WPF7), DPH4_CANAL  (Q5AD49), 
DPH4_CANGA  (Q6FWM1), DPH4_DEBHA  (Q6BPC1), DPH4_DICDI  (Q54CI5), 
DPH4_EMENI  (P0C0V5), DPH4_GIBZE  (Q4I7G0), DPH4_KLULA  (Q6CUQ9), 
DPH4_NEUCR  (Q7SEK8), DPH4_SCHPO  (Q9UUG3), DPH4_YARLI  (Q6C6T1), 
DPH4_YEAST  (P47138)
» More

PDB
[Detailed view]
8 PDB

1WGE; 1YOP; 1YWS; 2JR7; 2L6L; 4D4O; 4D4P; 4X33

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission