PROSITE entry PS51076
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MH2 |
| Accession [info] | PS51076 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2005 CREATED;
01-FEB-2005 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51075 |
| Associated ProRule [info] | PRU00439 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MAD homology domain 2 (MH2) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=195; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=190; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0543103; R2=0.0147846; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20; /M: SY='C'; M= 0,-18, 79,-27,-25,-19,-18,-27,-24,-26,-15,-16,-18,-33,-25,-27, -7, -9, -9,-41,-27,-25; /M: SY='S'; M= 3, -1,-16, -3, 0,-21, -6, -4,-19, -2,-24,-12, 5,-12, 4, -4, 20, 11,-11,-32,-14, 2; /M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-35,-29, 1,-35,-29, 39,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-18, -6, 35,-24, -4,-29; /M: SY='A'; M= 18,-15,-15,-22,-14, -8,-15,-20, 4,-14, -4, -2,-12,-16,-11,-18, 3, 3, 9,-21, -9,-13; /M: SY='Y'; M=-17,-20,-27,-20,-20, 25,-29, 13, 2,-11, 0, 0,-20,-29,-12,-11,-16, -6, -4, 21, 66,-20; /M: SY='Y'; M=-20,-27,-31,-30,-25, 40,-28, -2, -4,-18, -1, -4,-24,-30,-21,-15,-24,-14,-11, 49, 55,-23; /M: SY='E'; M=-10, 9,-30, 19, 58,-31,-20, 1,-29, 10,-20,-19, 0, -1, 22, 1, 0,-10,-30,-29,-19, 40; /M: SY='L'; M=-11,-16,-24,-15, 0, -5,-25, -4, 1,-10, 19, 13,-17,-20, -4, -5,-19,-11, -4,-23, -4, -3; /M: SY='N'; M= -9, 25,-24, 19, 2,-25, 2, 0,-27, 4,-28,-20, 30,-17, -1, 4, 4, -4,-26,-33,-19, 0; /M: SY='T'; M= -4, -1,-16, -7, -7,-15,-17, -7, -8, -6,-11, -6, 3,-17, -2, -2, 5, 11, -3,-30,-11, -5; /M: SY='R'; M=-17, -9,-30, -9, 3,-23,-21, -1,-24, 24,-19, -6, -2,-15, 17, 49, -9,-10,-19,-20,-10, 6; /M: SY='V'; M= -3,-27,-15,-29,-26, -3,-30,-27, 27,-17, 9, 10,-26,-27,-23,-18,-12, -3, 39,-27, -8,-25; /M: SY='G'; M= 5,-10,-26,-12,-17,-27, 49,-18,-32,-14,-25,-13, -2,-18,-15,-17, 1,-15,-23,-21,-26,-16; /M: SY='E'; M= -7, 5,-28, 11, 37,-28,-18, -3,-29, 16,-21,-17, 0, -6, 14, 13, -2, -9,-25,-27,-17, 25; /M: SY='A'; M= 7,-12,-17,-18,-10, -9,-18,-16, -3, -8, 2, 1,-11,-16, -6, -7, -2, 7, 1,-22, -9, -8; /M: SY='F'; M=-12,-24,-13,-30,-23, 43,-27,-11, -3,-18, 2, -2,-18,-28,-26,-15,-16, -9, -2, 5, 29,-23; /M: SY='H'; M= -2, -3,-16, -5, 1,-20,-17, 12,-24, 8,-20, -9, -1,-13, 2, 2, -3, -8,-17,-25, -6, 1; /M: SY='V'; M= 10,-17,-11,-20,-13,-11,-18,-19, 1, -9, -2, -2,-16,-20,-13, -6, -2, -2, 13,-26,-14,-14; /M: SY='S'; M= 0, -6,-18, -5, -3,-19,-11, -9,-14, -5,-19,-11, -3, -4, -2, -6, 8, 2, -8,-29,-13, -4; /I: I=-9; MD=-19; /M: SY='S'; M= 4, 0,-18, -1, 3,-18, -5, -6,-18, -4,-19,-13, 3,-11, 3, -5, 12, 2,-13,-26,-14, 3; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='P'; M= -7,-10,-27, -8, -3,-22,-12,-12,-17, -7,-20,-13, -8, 31, -4, -8, -1, 1,-18,-27,-19, -6; D=-9; /I: I=-9; DM=-19; /M: SY='S'; M= 1, -5,-12,-10, -9, -9,-14, -8, -9,-10,-15,-10, 2,-16, -8, -9, 14, 13, -2,-29, -9, -9; /M: SY='V'; M= -5,-28,-16,-32,-26, 5,-31,-22, 26,-24, 18, 13,-24,-27,-23,-22,-17, -6, 27,-23, -2,-26; /M: SY='T'; M= -5, -9,-15,-14,-14, -6,-24,-19, 4,-17, 4, -1, -8,-18,-13,-16, 1, 17, 6,-27, -6,-15; /M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-28, -2,-34,-29, 37,-24, 13, 13,-22,-23,-23,-25,-14, -4, 35,-25, -5,-28; /M: SY='D'; M=-18, 32,-28, 42, 11,-18,-10, -3,-31, -5,-23,-23, 15,-14, -6,-11, -2,-10,-25,-30,-12, 3; /M: SY='G'; M= -3,-10,-30, -9,-18,-23, 54,-14,-35,-18,-26,-17, -2,-21,-17,-18, -2,-18,-28,-14,-16,-18; /M: SY='F'; M=-10, -9,-23, -9,-13, 16,-10, -7,-12,-16, -8, -9, -7,-22,-16,-15, -5, -7,-11, -7, 15,-14; /M: SY='T'; M= -5,-10,-17,-13,-11, -5,-24,-19, 3,-13, 3, 1,-11,-17,-13,-13, -1, 15, 8,-27, -7,-12; /M: SY='D'; M=-10, 22,-22, 32, 7,-30,-10, -8,-28, -6,-23,-22, 8, 1, -5,-13, 0, -5,-23,-35,-20, 0; /M: SY='P'; M= -5,-11,-30, -7, 3,-28,-10,-12,-20, -6,-25,-15, -9, 35, 1,-12, 1, -4,-23,-28,-22, 0; /I: I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='S'; M= 0, -7,-15, -8, -7, -7, 8,-14,-19,-14,-20,-15, 1,-16,-11,-13, 14, 2,-12,-26,-14, -8; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='B'; M= -5, 16,-17, 16, 1,-20, 6, -1,-22, -5,-21,-16, 16,-11, -3, -7, 9, 1,-18,-26,-15, -1; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='G'; M= -3, 0,-19, 1, 0,-19, 15, -8,-22, -1,-19,-12, 2, -5, -4, -3, 1, -7,-17,-17,-15, -2; D=-10; /I: I=-10; DM=-21; /M: SY='N'; M= -5, 13,-17, 9, 2,-22, -4, -5,-20, -3,-21,-12, 16,-15, -2, -6, 6, 1,-17,-33,-18, 0; /M: SY='R'; M=-13, -9,-23,-10, -5,-21, -3, -7,-30, 15,-22,-13, 0,-19, 1, 40, -4, -7,-20,-23,-15, -5; /M: SY='F'; M=-16,-27,-19,-36,-27, 49,-30,-19, 9,-28, 15, 6,-20,-27,-30,-20,-19, -7, 5, -2, 19,-27; /M: SY='C'; M= -4,-13, 60,-19,-20,-21, -8,-22,-29,-22,-24,-20, -9,-29,-20,-20, 4, -4,-13,-42,-27,-20; /M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-26,-19, 11,-28,-19, 16,-28, 40, 15,-25,-28,-20,-20,-25, -9, 8,-20, 0,-19; /M: SY='G'; M= -1, -6,-19, -9,-17,-26, 45,-17,-33,-16,-25,-18, 3,-21,-16,-14, 1,-14,-25,-24,-26,-17; /M: SY='Q'; M= -4,-14,-24,-16, -6,-13,-12, -3, -7,-12, 3, 5,-11,-19, 7, -9, -9, -8,-11,-17, -6, 1; /M: SY='L'; M=-12,-25,-17,-26,-16, 14,-28,-15, 8,-23, 26, 10,-24,-24,-15,-17,-22,-10, 2,-14, 6,-15; /M: SY='S'; M= 1, 10,-18, 9, 5,-22, -6, -6,-20, -6,-24,-18, 14, -6, 0, -9, 18, 7,-17,-36,-19, 2; /M: SY='N'; M= -6, 24,-19, 11, -1,-18, -1, 3,-18, -4,-24,-17, 39,-18, -2, -4, 12, 4,-23,-37,-18, -1; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='V'; M= -6,-14,-13,-11,-10,-14,-23,-20, 1,-13, -7, -6,-16, 5,-16,-17, -8, -5, 8,-30,-17,-14; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='N'; M=-10, 11,-22, 1, -4,-16, -8, 17,-14, -6,-17, -3, 21,-18, 2, -4, 2, -1,-18,-29, -6, -2; D=-14; /I: I=-14; DM=-29; /M: SY='R'; M=-18, -7,-28, -9, 0,-20,-19, -2,-27, 27,-20,-10, 2,-19, 8, 58, -8, -9,-19,-21,-10, 0; /M: SY='N'; M= -5, 17,-19, 15, 3,-22, -6, -2,-22, -4,-25,-19, 20,-12, -1, -5, 16, 9,-18,-36,-17, 0; /M: SY='E'; M= 2, 4,-22, 7, 15,-27,-10, -2,-23, -2,-22,-15, 2, -2, 11, -7, 11, 1,-20,-30,-17, 12; /M: SY='T'; M= 3, -5,-16, -9, -1,-18,-17, -6,-12, 0,-10, -6, -4,-14, 1, -3, 2, 5, -7,-26,-11, 0; /M: SY='V'; M= 2,-18,-16,-24,-20, -7,-24,-24, 18,-19, 2, 3,-13,-18,-17,-20, 2, 10, 21,-28, -9,-20; /M: SY='E'; M= -7, 3,-28, 8, 28,-25,-18, -2,-25, 11,-21,-14, -1, -5, 16, 5, 0, -8,-24,-24,-12, 21; /M: SY='R'; M=-10, 1,-25, -2, 5,-21,-14, -5,-18, 14,-16, -6, 5,-16, 4, 15, -6, -7,-14,-26,-13, 4; /M: SY='V'; M= 6,-16,-14,-23,-19, -7,-23,-24, 13,-17, 2, 3,-14,-17,-17,-18, 2, 15, 19,-26,-10,-19; /M: SY='R'; M=-19, -8,-30, -8, 1,-21,-20, 4,-30, 30,-21,-10, 0,-19, 10, 62,-10,-11,-21,-20, -9, 1; /M: SY='R'; M= -6, -7,-24, -9, -2,-18,-14, -4,-16, 8,-12, -5, 0,-17, 3, 18, -3, -6,-13,-24,-11, -1; /M: SY='H'; M= -8, -3,-24, -4, 2,-19,-18, 34,-21, 2,-17, -5, 2,-15, 4, 1, -3, -5,-17,-27, 2, 0; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-30, 4,-38,-29, 45,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-28,-19, -9, 30,-19, 1,-29; /M: SY='G'; M= 3,-11,-27,-12,-19,-28, 56,-20,-33,-18,-26,-17, -3,-20,-17,-19, 0,-17,-23,-21,-27,-18; /M: SY='K'; M=-12, 5,-21, 7, 6,-21,-18, -4,-25, 15,-19,-12, 0,-15, 3, 10, -8,-10,-19,-23, -7, 4; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='V'; M= -5,-28,-19,-32,-28, 4,-32,-28, 32,-24, 13, 12,-24,-26,-25,-23,-14, -5, 35,-24, -4,-28; /M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -7, 5,-23,-22, 3,-15, 12,-12, -2, -3,-15, 16, 17, -7, -7,-15,-22, -7, 9; /M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22, 14,-30,-20, 22,-28, 38, 19,-26,-28,-21,-21,-26, -9, 12,-18, 2,-22; /M: SY='T'; M= -5, -2,-21, -2, -2,-10,-15, -5,-15, 1,-15,-11, -3,-15, -3, -4, 4, 7,-10,-17, 6, -4; /M: SY='Y'; M=-12,-15,-16,-19,-14, 3,-23, -1, -3, -3, 1, 8,-13,-24, -7, 0,-15, -8, -5, -8, 18,-12; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='D'; M= -9, 1,-18, 4, -2,-12,-16, -5, -6, 0, -6, -4, -3,-13, -5, -1, -7, -6, -2,-20, -6, -4; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='E'; M= -4, 8,-18, 12, 17,-19, 0, -4,-19, -1,-14,-13, 2, -5, 3, -5, 1, -5,-16,-19,-14, 10; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='B'; M= 1, 2,-23, 2, 2,-24, -2,-11,-19, -4,-18,-13, 1, -7, -1, -9, 1, -3,-15,-27,-18, 1; /M: SY='G'; M= -4, 0,-29, 3,-12,-30, 49,-15,-36,-15,-27,-18, 3,-18,-14,-17, -1,-17,-28,-24,-26,-13; /M: SY='D'; M= -7, 16,-25, 17, 16,-27, 2, 2,-29, -2,-25,-20, 17,-11, 2, -6, 6, -5,-27,-32,-19, 9; /M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-29, 0,-32,-29, 33,-23, 14, 12,-27,-27,-27,-22,-13, -3, 42,-27, -7,-29; /M: SY='W'; M=-17,-29,-34,-32,-24, 23,-23,-19,-10,-17, -7, -8,-26,-27,-20,-15,-25,-16,-15, 67, 26,-19; /M: SY='I'; M= 6,-23,-19,-28,-21, -5,-19,-23, 18,-22, 15, 9,-21,-22,-18,-22,-12, -7, 16,-22, -8,-21; /M: SY='Y'; M=-12, -5,-26, -5, 7,-10,-22, 1,-16, 5,-12, -5, -6,-13, 6, 7, -4, 1,-15,-14, 8, 5; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='C'; M= -5, 5, 21, -7,-12,-16,-14, -9,-18, -8,-19,-15, 14,-25,-11, -4, -1, -4,-13,-36,-19,-12; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M=-14,-16,-23,-18,-11, 1,-22, -7, -5, -4, 9, 2,-12,-24, -7, 12,-16, -6, -5,-14, 5,-11; D=-13; /I: I=-13; DM=-27; /M: SY='S'; M= 8, -6,-13, -8, -8,-19, 12,-13,-20,-13,-23,-13, 2,-14, -7,-14, 20, 6,-12,-28,-18, -8; /M: SY='D'; M= -6, 22,-23, 27, 12,-30, -9, -5,-29, 8,-26,-20, 13,-11, 2, -1, 3, -4,-22,-32,-18, 7; /M: SY='H'; M= -4, -8, -7,-12,-10, -5,-16, 6,-11,-12,-13, -5, -3,-20, -5,-11, 6, 3, -8,-22, 6, -9; /M: SY='P'; M= 5,-11,-25,-10, -5,-22,-10,-17,-14, -9,-21,-14, -7, 27, -9,-15, 4, 0,-13,-30,-22, -9; /M: SY='I'; M= -5,-29,-20,-34,-29, 0,-35,-29, 39,-25, 14, 15,-23,-25,-24,-25,-15, -5, 38,-25, -5,-29; /M: SY='F'; M=-19,-27,-21,-35,-28, 66,-29,-13, 1,-26, 8, 0,-19,-30,-34,-18,-19, -9, 1, 8, 32,-28; /M: SY='V'; M= -3,-29, -5,-31,-29, -2,-32,-30, 29,-22, 9, 9,-27,-27,-28,-22,-12, -3, 41,-30,-10,-30; /M: SY='Q'; M=-10, 7,-27, 4, 12,-31,-17, 5,-21, 13,-22, -6, 9,-12, 34, 11, 1, -4,-26,-23,-10, 23; /M: SY='S'; M= 9, -1, -7, -2, -2,-20, 3,-11,-21,-11,-29,-20, 8,-12, -2,-11, 35, 17,-11,-39,-21, -2; /M: SY='P'; M= -5,-16,-29,-15,-10,-13,-11,-15,-14, -7,-16,-11,-14, 12,-10, -8, -7, -4,-15, -8, -6,-13; /M: SY='Y'; M= -5, -1,-20, -8,-10, 1,-14, -3,-11, -6,-13, -9, 6,-19, -9, -7, 3, 7,-11,-15, 9,-10; /M: SY='L'; M= -6,-18, 6,-21,-12, -1,-24,-17, -3,-21, 13, 1,-17,-25,-13,-17,-13, -5, -3,-26, -8,-12; /M: SY='D'; M=-12, 30,-26, 31, 7,-29, -2, 0,-29, -2,-29,-23, 28, -8, 1, -7, 5, -5,-29,-33,-20, 4; /M: SY='H'; M=-13, 0,-27, -1, 1,-14,-18, 9,-17, 1,-13, -7, 4,-10, 4, 8, -7, -9,-20,-19, 2, 0; /M: SY='E'; M= -9, -1,-26, -3, 7,-20,-19, -1,-11, -2,-14, -5, 3, 1, 5, -3, -3, -4,-16,-28,-13, 4; /M: SY='N'; M= -2, 5,-22, 3, 3,-16,-10, 7,-17, -5,-15, -9, 8,-14, 0, -6, 1, -5,-17,-26, -6, 1; /M: SY='G'; M= -3, -1,-12, -3, -7,-25, 21,-14,-28,-10,-25,-17, 5,-17, -8,-12, 5, -6,-21,-29,-23, -8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='R'; M=-12,-17,-25,-21,-14, 4,-16,-14,-10, -1, -9, -4,-11,-21,-11, 10,-11, -7, -6, -2, 0,-13; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='H'; M= 1, -9,-22,-11, -4,-16,-16, 5,-10,-10,-10, -5, -5, -1, -3,-10, 1, 0,-10,-26, -8, -6; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='P'; M= -9,-14,-28,-11, -7,-14,-16,-14, -6,-13, -2, -4,-14, 14, -8,-15,-12, -9,-12,-23,-12, -9; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='G'; M= 0, -4,-21, -7,-10,-17, 6,-14,-15, -8,-11, -9, 0,-18,-10, -7, 0, -2, -9,-25,-16,-11; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='T'; M= 0, 0,-16, -2, -1,-14,-15,-11,-12, 2, -9, -8, -2,-10, -4, -1, 3, 11, -7,-20, -7, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='V'; M= -1,-24,-14,-26,-25, -3,-28,-23, 24,-19, 7, 8,-22,-26,-24,-19, -8, 1, 37,-29, -9,-25; /M: SY='H'; M=-12,-13, 8,-18,-16,-11,-23, 18,-11,-18, -8, -2, -7,-25,-11,-12,-10,-10, -7,-31, -2,-16; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 8,-29,-17, -8,-29, 40,-26, -9, 0,-12, 12, 32, -9,-10,-21,-20,-11, 9; /M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-34,-28, 5,-33,-26, 34,-25, 21, 18,-26,-26,-23,-23,-18, -6, 31,-23, -3,-27; /M: SY='P'; M=-11,-13,-30,-12, -6, -7,-21, -6,-12, -8,-14, -7,-11, 22, -5,-10, -9, -5,-18,-15, 1, -8; /M: SY='P'; M= -7, -5,-32, -2, 1,-28, -7, -8,-23, -7,-28,-18, -1, 40, -2,-13, -1, -7,-28,-31,-24, -3; /M: SY='G'; M= -3, -2,-21, -5, -7,-25, 22, -8,-27, -8,-22,-11, 3,-17, -5, -9, 0,-11,-22,-25,-20, -6; /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='C'; M= 0,-10, 7,-15,-11,-10,-13,-14,-19, -6,-18,-13, -8,-14,-12,-11, -1, -2,-12,-23, -7,-12; /M: SY='S'; M= 2, -3, -3, -8, -7,-15,-12,-11,-14, -8,-19,-13, 4,-16, -4, -8, 16, 11, -8,-31,-11, -6; /M: SY='L'; M= -7,-25,-19,-30,-23, 5,-29,-19, 23,-24, 24, 18,-22,-24,-18,-21,-20, -8, 15,-17, 3,-22; /M: SY='K'; M=-10, 0,-23, -2, 6,-27,-19, -9,-29, 41,-28,-11, 2,-13, 7, 29, -8, -7,-19,-22,-11, 6; /M: SY='V'; M= 2,-26,-18,-31,-25, -1,-29,-27, 28,-23, 17, 11,-23,-24,-22,-23,-13, -3, 29,-24, -7,-25; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 79,-30,-20, 1,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 1, 9, 29,-30; /M: SY='D'; M=-16, 39,-28, 48, 15,-34, -3, 0,-35, 0,-29,-26, 24,-12, 0, -6, 2, -8,-30,-37,-21, 8; /M: SY='M'; M=-11, -9,-21,-17,-15, 7,-20, -2, 3,-12, 5, 13, -2,-23, -9,-10,-11, -5, -3,-17, 7,-12; /M: SY='R'; M= -9, 5,-28, 4, 18,-28,-16, 0,-26, 19,-23,-12, 6,-11, 18, 23, -2, -8,-24,-25,-14, 17; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='K'; M= -7, -6,-25, -5, 11,-21,-21, -7,-12, 12, -8, -2, -7,-12, 11, 7, -8, -9,-12,-21,-10, 11; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='F'; M= -8,-21, -7,-29,-21, 39,-23,-15, -7,-21, -1, -5,-15,-26,-26,-15, -9, -4, -4, -3, 17,-22; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='A'; M= 10, -7,-17,-11, -2,-17,-11, -1,-17, 1,-16, -7, -5,-14, 4, -3, 2, -5,-13,-19, -6, 1; /M: SY='Q'; M= -4, -1,-22, -2, 10,-25,-16, 3,-18, 3,-17, -8, 1,-12, 18, 3, 6, 1,-17,-27,-11, 13; /M: SY='L'; M= -6,-10,-21,-13, -4, -8,-19, -9, 2,-14, 13, 7, -7,-20, 0,-11,-10, -6, -5,-25, -8, -2; /M: SY='L'; M=-10,-24,-23,-27,-16, 0,-29,-16, 17,-18, 28, 19,-22,-25, -9,-12,-22, -9, 9,-21, -2,-14; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='N'; M= 2, 5,-17, 1, 7,-18, -8, 1,-17, 3,-17,-11, 10,-11, 6, 6, 5, 0,-16,-23,-12, 5; D=-2; /I: I=-2; MD=-5; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-22, 1, 7,-22,-14, -1,-18, 7,-12, -6, 0,-12, 18, 15, -2, -5,-17,-20,-10, 11; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: SY='S'; M= 3, -5,-17, -6, 5,-18,-11, -5,-14, -7,-12, -9, -2,-10, -1, -7, 6, -1,-12,-29,-14, 1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='V'; M= -1,-19,-14,-21,-15, -4,-20,-17, 0,-11, -1, 0,-16,-13,-15, -8, -7, -2, 5,-20, -8,-15; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='N'; M= -1, 5,-22, -2, -1,-19,-11, 5,-17, 2,-18,-10, 13,-13, 2, 6, 2, -2,-16,-28,-12, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='D'; M= -8, 10,-26, 14, 11,-26,-15, 7,-26, 7,-20,-12, 4,-12, 7, 8, -2, -6,-20,-28,-11, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='G'; M= 6, -7,-23, -9, -6,-23, 9, -5,-23,-10,-20,-13, -3, -2, -6,-11, 3, -3,-18,-24,-17, -7; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='Y'; M=-10,-12,-21,-14,-14, 12,-10, -4, -8,-12, -6, -4, -9,-17,-12,-11, -8, -4, -8, -3, 16,-13; D=-2; /I: I=-2; DM=-5; /M: SY='E'; M= -9, 1,-29, 6, 18,-25,-19, -2,-18, -1,-19,-13, -1, 10, 6, -5, -2, -6,-20,-30,-16, 10; /M: SY='A'; M= 2, 1,-19, 1, -3,-16, -2, -8,-20, -9,-14,-13, -2,-16, -9,-10, 0, -3,-12,-25,-13, -7; /M: SY='V'; M= 2,-19,-16,-22,-16, -9,-20,-18, 6, -8, 1, 6,-17,-18,-12, -4, -5, 0, 15,-26,-11,-15; /M: SY='D'; M=-15, 8,-28, 13, 2,-12,-12, 4,-22, -1,-17,-12, 3,-17, 1, 1, -5, -8,-20,-16, 7, 0; /M: SY='E'; M= -9, 7,-22, 10, 12,-28, -4, -4,-29, 3,-24,-16, 6,-12, 10, 6, 5, -4,-24,-29,-18, 10; /M: SY='L'; M=-10,-27,-24,-26,-16, 0,-27,-18, 12,-22, 29, 15,-26, -6,-15,-16,-24,-10, 2,-22, -6,-17; /M: SY='T'; M= -6, -6,-22, -8, 3,-11,-18, -7,-13, -2,-10, -7, -4,-15, 0, 2, 1, 6,-11,-15, -2, 0; /M: SY='R'; M=-10, 1,-26, 1, 2,-22,-18, -6,-24, 20,-18,-10, 2,-15, 3, 26, -5, -2,-16,-24,-11, 1; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='M'; M=-12,-17,-26,-20,-12, 2,-18, -2, -2, -9, 2, 13,-15,-12, -3, -9,-15,-11, -7,-12, 7, -8; /M: SY='C'; M=-10,-16, 78,-25,-25, -8,-27,-23,-24,-25,-16,-16,-14,-34,-26,-24, -5, -2, -9,-39,-18,-25; /M: SY='T'; M= -5,-10, -2,-18,-15, 0,-22,-19, -5,-15, -2, -4, -7,-19,-15,-13, 3, 16, -1,-26, -7,-15; /M: SY='I'; M= -5,-24,-20,-29,-23, -2,-29,-24, 28,-23, 13, 14,-18,-22,-18,-22, -9, -1, 24,-25, -5,-23; /M: SY='R'; M= -8, -9,-27,-11, 0,-22,-17, -3,-26, 23,-19, -9, -2,-17, 10, 50, -6, -8,-17,-20,-12, 1; /M: SY='I'; M= -5,-27,-20,-33,-26, 0,-30,-21, 32,-21, 17, 26,-23,-23,-18,-21,-16, -6, 29,-23, -4,-24; /M: SY='S'; M= 16, -2,-10, -3, -2,-20, 0,-12,-18,-10,-27,-18, 7,-10, -2,-12, 35, 17, -8,-37,-20, -2; /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 64,-30,-19, 4,-29, 18, 6,-22,-30,-35,-20,-22,-10, 2, 3, 23,-27; /M: SY='V'; M= 5,-24, 6,-27,-26, -7,-22,-28, 13,-20, 1, 1,-24,-28,-26,-21, -5, -1, 31,-31,-15,-26; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 1, 12,-30,-20,-10,-30, 49,-30,-10, 0,-10, 10, 29,-10,-10,-20,-20,-10, 11; /M: SY='G'; M= 2, -5,-26, -4,-14,-29, 52,-17,-35,-17,-29,-20, 2,-18,-16,-18, 5,-13,-25,-24,-27,-15; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='W'; M=-16,-31,-37,-32,-25, 17,-13,-24,-15,-19,-13,-14,-28,-25,-20,-17,-28,-22,-21, 93, 21,-19; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='G'; M= 3, -6,-24, -8,-15,-25, 51,-16,-31,-15,-25,-17, 3,-17,-15,-16, 2,-14,-24,-19,-25,-15; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='P'; M= 7, -5,-20, -3, 5,-21, -6,-11,-16, -1,-15,-11, -6, 8, -1, -6, 0, -6,-13,-20,-17, 1; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='D'; M= -8, 13, -9, 19, 14,-23,-13, -2,-23, -1,-17,-16, 3, -9, 1, -6, 0, -5,-16,-28,-14, 7; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='Y'; M=-16,-16,-24,-16,-16, 23,-24, 15, 0, -8, 0, 0,-16,-23, -8, -8,-16, -8, -8, 23, 63,-16; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='H'; M= -6, -5,-22, -5, 0,-19,-13, 10,-19, 1,-19, -9, -1, 9, 3, 6, 0, -4,-18,-22, -9, -1; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='R'; M=-17, -4,-27, -5, 4,-20,-17, 1,-27, 25,-20,-10, 4,-17, 9, 53, -7, -9,-20,-21,-10, 3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='Q'; M= -6, 3,-25, 0, 10,-29,-14, 3,-18, 8,-19, -6, 6, -8, 31, 6, 2, -5,-23,-23,-12, 20; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M= -9, 15,-21, 16, -1,-14,-13,-10,-18, -7,-18,-15, 9,-14, -7,-10, 7, 9,-13,-30,-11, -4; /M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-28, 2,-34,-24, 35,-24, 17, 18,-24,-25,-22,-23,-17, -6, 32,-21, 1,-27; /M: SY='T'; M= -4, -2,-18, -8, -8,-12,-20,-11, -6, -5, -5, -3, -1,-15, -7, -7, 2, 14, -2,-28, -8, -8; /M: SY='S'; M= -2, 8,-19, 9, 11,-23, -5, -5,-24, -1,-26,-19, 12,-11, 5, 1, 19, 7,-19,-35,-19, 7; /M: SY='T'; M= -2, -6, 21,-14,-12,-15,-20,-19,-16,-15,-14,-12, -5,-18,-10,-14, 12, 26, -5,-35,-16,-11; /M: SY='P'; M= -9,-19,-38, -9, 0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18, 84, -9,-19, -7, -8,-29,-31,-29, -9; /M: SY='C'; M= -7,-22, 80,-30,-29,-15,-29,-29,-13,-27,-11,-10,-22,-36,-28,-27,-10, -8, 5,-43,-24,-29; /M: SY='W'; M=-18,-38,-48,-38,-28, 8,-19,-29,-20,-19,-21,-20,-37,-29,-19,-19,-35,-27,-29,139, 27,-19; /M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-35,-27, 12,-34,-26, 32,-28, 21, 14,-22,-24,-23,-24,-18, -5, 23,-18, 2,-27; /M: SY='E'; M= -2, 1,-26, 7, 38,-24,-19, -5,-20, 2, -9,-12, -5, -6, 13, -5, -3, -9,-21,-27,-17, 26; /M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-26, 1,-32,-27, 31,-25, 22, 14,-24,-25,-22,-23,-16, -3, 28,-24, -4,-26; /M: SY='H'; M=-12,-12,-24,-13,-10,-11,-24, 27, -5, -9, -5, 3, -6,-21, -3, -2, -9, -8, -3,-25, 6,-10; /M: SY='L'; M=-11,-14,-21,-20,-15, 5,-24,-13, 10,-22, 24, 9, -8,-26,-13,-15,-19, -8, 0,-22, -2,-14; /M: SY='H'; M=-11, 4,-21, -2, -7,-14,-14, 31,-12,-10,-13, -4, 15,-22, -4, -6, -3, -7,-11,-33, -2, -7; /M: SY='G'; M= -5, -9,-23,-11,-11,-17, 1,-11,-11, -8,-14, -8, -2,-15,-12, -3, -4, -8, -4,-27,-17,-13; /M: SY='P'; M= 12,-13,-26,-13, -4,-24,-12,-16,-16, -5,-19,-14,-12, 33, -8,-13, -3, -6,-16,-25,-22, -8; /M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-25,-16, 3,-25,-10, 9,-13, 25, 21,-21,-25,-10, -5,-22,-10, 3,-16, 4,-14; /M: SY='Q'; M= -5, 15,-26, 21, 14,-35,-13, 3,-26, 5,-23,-13, 6,-10, 23, -1, 3, -7,-24,-28,-14, 18; /M: SY='W'; M=-14,-28,-33,-31,-21, 10,-17,-16, -3,-18, 3, 8,-26,-25,-15,-17,-26,-18,-10, 46, 14,-16; /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-30,-21, 6,-30,-17, 21,-23, 34, 21,-25,-27,-16,-14,-25,-10, 12,-18, 2,-20; /M: SY='D'; M=-14, 33,-29, 46, 15,-35,-12, -3,-36, 10,-28,-24, 13,-11, 2, 2, -2, -9,-26,-34,-18, 8; /M: SY='E'; M= -3, 1,-24, 2, 15,-26,-13, -6,-24, 12,-25,-15, 3, -3, 11, 8, 8, 0,-20,-29,-17, 12; /M: SY='V'; M= -5,-17,-18,-19,-17, -9,-25,-20, 10, -1, -1, 3,-15,-24,-15, -1,-10, -4, 21,-27,-10,-17; /M: SY='L'; M= -9,-25,-13,-29,-21, 8,-29,-20, 16,-27, 34, 16,-24,-27,-19,-20,-21, -3, 9,-21, -1,-20; /M: SY='P'; M= -9, -5,-26, -6, 0,-20,-19, 1,-18, 0,-20, -9, -2, 9, 6, -1, 0, 5,-19,-24, -8, 1; /M: SY='Q'; M= -5, -2,-14, -4, 4,-22,-20, -6,-15, -5,-14, -8, -3, -7, 12, -7, 0, 1,-16,-25,-10, 7; /M: SY='M'; M= -8,-19,-22,-26,-19, -4,-24,-12, 20,-16, 12, 30,-16,-13, -9,-16,-13, -5, 12,-24, -5,-16; /M: SY='G'; M= -5, -4,-29, -3, -1,-28, 14,-12,-28, -5,-28,-17, 1, 10, -3,-10, 1, -8,-27,-26,-24, -3; /M: SY='S'; M= 0, 0,-20, 0, 2,-21,-11, -9,-17, 1,-20,-12, 4,-10, 2, 2, 12, 3,-12,-31,-16, 1; /I: I=-8; MD=-16; /M: SY='P'; M= -7,-12,-19,-10, -5,-15,-17,-10,-13,-11,-14,-11,-11, 26, -9,-12, -4, -3,-15,-26,-16,-10; D=-8; /I: I=-8; MD=-16; /M: M= -4, -7,-20, -8, -7,-10, -9, -3, -7,-11, -4, -4, -5, -5, -7,-10, -4, -5, -8,-20, -6, -8; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='V'; M= -6, -8,-19,-13,-11, -7,-18, -4, -1, -6, -6, -1, -2,-16, -9, -2, -4, -1, 2,-24, -6,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -8, -5,-30, 1, 10,-23,-17, -8,-20, -1,-22,-16, -7, 28, 0, -4, -3, -7,-22,-25,-15, 2; D=-8; /I: I=-8; DM=-16; /M: SY='P'; M= -9,-24, 2,-26,-18, -9,-28,-24, 2,-22, -2, -3,-20, 6,-19,-22,-15,-10, -3,-28,-15,-21; /M: SY='S'; M= 3, 3,-16, 0, -3,-19, -5, -9,-16, -7,-19,-14, 9,-13, -3, -9, 18, 13,-11,-33,-16, -3; /M: SY='S'; M= 3, 3,-17, 0, -3,-22, 3,-10,-21, -9,-28,-19, 12, -2, -4, -9, 23, 11,-16,-35,-21, -4; /M: SY='V'; M= -6,-20,-18,-22,-17, -6,-23,-13, 9, -9, 4, 12,-15,-23,-11, 0, -7, -3, 15,-26, -8,-15; /M: SY='S'; M= 1, 0,-16, -2, 0,-11, -9,-11,-18,-10,-23,-17, 6, -4, -5,-11, 22, 15,-12,-32,-15, -3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of true positive hits | 44 in 44 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MH2 |
| Version [info] | 2 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
44 sequences
DAF14_CAEEL (F5GUE5), DAF3_CAEEL (Q95QI7), DAF8_CAEEL (Q21733), MAD_DROME (P42003), SMA2_CAEEL (Q02330), SMA3_CAEEL (P45896), SMA4_CAEEL (P45897), SMAD1_BOVIN (Q1JQA2), SMAD1_COTJA (Q9I962), SMAD1_DANRE (Q9I8V2), SMAD1_HUMAN (Q15797), SMAD1_MOUSE (P70340), SMAD1_RAT (P97588), SMAD2_BOVIN (Q1W668), SMAD2_DANRE (Q9I9P9), SMAD2_HUMAN (Q15796), SMAD2_MOUSE (Q62432), SMAD2_PONAB (Q5R7C0), SMAD2_RAT (O70436), SMAD3_CHICK (P84023), SMAD3_HUMAN (P84022), SMAD3_MOUSE (Q8BUN5), SMAD3_PIG (P84024), SMAD3_RAT (P84025), SMAD4_BOVIN (Q1HE26), SMAD4_HUMAN (Q13485), SMAD4_MOUSE (P97471), SMAD4_PIG (Q9GKQ9), SMAD4_RAT (O70437), SMAD5_CHICK (Q56I99), SMAD5_DANRE (Q9W7E7), SMAD5_HUMAN (Q99717), SMAD5_MOUSE (P97454), SMAD5_PONAB (Q5R6H7), SMAD5_RAT (Q9R1V3), SMAD6_CHICK (Q9W734), SMAD6_HUMAN (O43541), SMAD6_MOUSE (O35182), SMAD7_HUMAN (O15105), SMAD7_MOUSE (O35253), SMAD7_RAT (O88406), SMAD9_HUMAN (O15198), SMAD9_MOUSE (Q9JIW5), SMAD9_RAT (O54835)» more
|
| PDB [Detailed view] |
22 PDB
1DD1; 1DEV; 1G88; 1KHU; 1KHX; 1MJS; 1MK2; 1MR1; 1U7F; 1U7V; 1YGS; 3DIT; 3GMJ; 5C4V; 5XOC; 5XOD; 5ZOJ; 5ZOK; 6M64; 6ZVQ; 7CD1; 7CO1 » more |