Entry: PS51076

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MH2
Accession [info] PS51076
Entry type [info] MATRIX
Date [info] FEB-2005 (CREATED); FEB-2005 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51075
Associated ProRule [info] PRU00439

Name and characterization of the entry

Description [info] MAD homology domain 2 (MH2) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=195;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=190;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0543103; R2=0.0147846; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=436; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=301; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='C'; M=  0,-18, 79,-27,-25,-19,-18,-27,-24,-26,-15,-16,-18,-33,-25,-27, -7, -9, -9,-41,-27,-25;
/M: SY='S'; M=  3, -1,-16, -3,  0,-21, -6, -4,-19, -2,-24,-12,  5,-12,  4, -4, 20, 11,-11,-32,-14,  2;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-35,-29,  1,-35,-29, 39,-26, 20, 16,-25,-25,-24,-25,-18, -6, 35,-24, -4,-29;
/M: SY='A'; M= 18,-15,-15,-22,-14, -8,-15,-20,  4,-14, -4, -2,-12,-16,-11,-18,  3,  3,  9,-21, -9,-13;
/M: SY='Y'; M=-17,-20,-27,-20,-20, 25,-29, 13,  2,-11,  0,  0,-20,-29,-12,-11,-16, -6, -4, 21, 66,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-27,-31,-30,-25, 40,-28, -2, -4,-18, -1, -4,-24,-30,-21,-15,-24,-14,-11, 49, 55,-23;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 19, 58,-31,-20,  1,-29, 10,-20,-19,  0, -1, 22,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 40;
/M: SY='L'; M=-11,-16,-24,-15,  0, -5,-25, -4,  1,-10, 19, 13,-17,-20, -4, -5,-19,-11, -4,-23, -4, -3;
/M: SY='N'; M= -9, 25,-24, 19,  2,-25,  2,  0,-27,  4,-28,-20, 30,-17, -1,  4,  4, -4,-26,-33,-19,  0;
/M: SY='T'; M= -4, -1,-16, -7, -7,-15,-17, -7, -8, -6,-11, -6,  3,-17, -2, -2,  5, 11, -3,-30,-11, -5;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-30, -9,  3,-23,-21, -1,-24, 24,-19, -6, -2,-15, 17, 49, -9,-10,-19,-20,-10,  6;
/M: SY='V'; M= -3,-27,-15,-29,-26, -3,-30,-27, 27,-17,  9, 10,-26,-27,-23,-18,-12, -3, 39,-27, -8,-25;
/M: SY='G'; M=  5,-10,-26,-12,-17,-27, 49,-18,-32,-14,-25,-13, -2,-18,-15,-17,  1,-15,-23,-21,-26,-16;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-28, 11, 37,-28,-18, -3,-29, 16,-21,-17,  0, -6, 14, 13, -2, -9,-25,-27,-17, 25;
/M: SY='A'; M=  7,-12,-17,-18,-10, -9,-18,-16, -3, -8,  2,  1,-11,-16, -6, -7, -2,  7,  1,-22, -9, -8;
/M: SY='F'; M=-12,-24,-13,-30,-23, 43,-27,-11, -3,-18,  2, -2,-18,-28,-26,-15,-16, -9, -2,  5, 29,-23;
/M: SY='H'; M= -2, -3,-16, -5,  1,-20,-17, 12,-24,  8,-20, -9, -1,-13,  2,  2, -3, -8,-17,-25, -6,  1;
/M: SY='V'; M= 10,-17,-11,-20,-13,-11,-18,-19,  1, -9, -2, -2,-16,-20,-13, -6, -2, -2, 13,-26,-14,-14;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-18, -5, -3,-19,-11, -9,-14, -5,-19,-11, -3, -4, -2, -6,  8,  2, -8,-29,-13, -4;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='S'; M=  4,  0,-18, -1,  3,-18, -5, -6,-18, -4,-19,-13,  3,-11,  3, -5, 12,  2,-13,-26,-14,  3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -7,-10,-27, -8, -3,-22,-12,-12,-17, -7,-20,-13, -8, 31, -4, -8, -1,  1,-18,-27,-19, -6; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='S'; M=  1, -5,-12,-10, -9, -9,-14, -8, -9,-10,-15,-10,  2,-16, -8, -9, 14, 13, -2,-29, -9, -9;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-16,-32,-26,  5,-31,-22, 26,-24, 18, 13,-24,-27,-23,-22,-17, -6, 27,-23, -2,-26;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-15,-14,-14, -6,-24,-19,  4,-17,  4, -1, -8,-18,-13,-16,  1, 17,  6,-27, -6,-15;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-28, -2,-34,-29, 37,-24, 13, 13,-22,-23,-23,-25,-14, -4, 35,-25, -5,-28;
/M: SY='D'; M=-18, 32,-28, 42, 11,-18,-10, -3,-31, -5,-23,-23, 15,-14, -6,-11, -2,-10,-25,-30,-12,  3;
/M: SY='G'; M= -3,-10,-30, -9,-18,-23, 54,-14,-35,-18,-26,-17, -2,-21,-17,-18, -2,-18,-28,-14,-16,-18;
/M: SY='F'; M=-10, -9,-23, -9,-13, 16,-10, -7,-12,-16, -8, -9, -7,-22,-16,-15, -5, -7,-11, -7, 15,-14;
/M: SY='T'; M= -5,-10,-17,-13,-11, -5,-24,-19,  3,-13,  3,  1,-11,-17,-13,-13, -1, 15,  8,-27, -7,-12;
/M: SY='D'; M=-10, 22,-22, 32,  7,-30,-10, -8,-28, -6,-23,-22,  8,  1, -5,-13,  0, -5,-23,-35,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -5,-11,-30, -7,  3,-28,-10,-12,-20, -6,-25,-15, -9, 35,  1,-12,  1, -4,-23,-28,-22,  0;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S'; M=  0, -7,-15, -8, -7, -7,  8,-14,-19,-14,-20,-15,  1,-16,-11,-13, 14,  2,-12,-26,-14, -8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='B'; M= -5, 16,-17, 16,  1,-20,  6, -1,-22, -5,-21,-16, 16,-11, -3, -7,  9,  1,-18,-26,-15, -1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-19,  1,  0,-19, 15, -8,-22, -1,-19,-12,  2, -5, -4, -3,  1, -7,-17,-17,-15, -2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='N'; M= -5, 13,-17,  9,  2,-22, -4, -5,-20, -3,-21,-12, 16,-15, -2, -6,  6,  1,-17,-33,-18,  0;
/M: SY='R'; M=-13, -9,-23,-10, -5,-21, -3, -7,-30, 15,-22,-13,  0,-19,  1, 40, -4, -7,-20,-23,-15, -5;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-19,-36,-27, 49,-30,-19,  9,-28, 15,  6,-20,-27,-30,-20,-19, -7,  5, -2, 19,-27;
/M: SY='C'; M= -4,-13, 60,-19,-20,-21, -8,-22,-29,-22,-24,-20, -9,-29,-20,-20,  4, -4,-13,-42,-27,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-26,-19, 11,-28,-19, 16,-28, 40, 15,-25,-28,-20,-20,-25, -9,  8,-20,  0,-19;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-19, -9,-17,-26, 45,-17,-33,-16,-25,-18,  3,-21,-16,-14,  1,-14,-25,-24,-26,-17;
/M: SY='Q'; M= -4,-14,-24,-16, -6,-13,-12, -3, -7,-12,  3,  5,-11,-19,  7, -9, -9, -8,-11,-17, -6,  1;
/M: SY='L'; M=-12,-25,-17,-26,-16, 14,-28,-15,  8,-23, 26, 10,-24,-24,-15,-17,-22,-10,  2,-14,  6,-15;
/M: SY='S'; M=  1, 10,-18,  9,  5,-22, -6, -6,-20, -6,-24,-18, 14, -6,  0, -9, 18,  7,-17,-36,-19,  2;
/M: SY='N'; M= -6, 24,-19, 11, -1,-18, -1,  3,-18, -4,-24,-17, 39,-18, -2, -4, 12,  4,-23,-37,-18, -1;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='V'; M= -6,-14,-13,-11,-10,-14,-23,-20,  1,-13, -7, -6,-16,  5,-16,-17, -8, -5,  8,-30,-17,-14; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='N'; M=-10, 11,-22,  1, -4,-16, -8, 17,-14, -6,-17, -3, 21,-18,  2, -4,  2, -1,-18,-29, -6, -2; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-18, -7,-28, -9,  0,-20,-19, -2,-27, 27,-20,-10,  2,-19,  8, 58, -8, -9,-19,-21,-10,  0;
/M: SY='N'; M= -5, 17,-19, 15,  3,-22, -6, -2,-22, -4,-25,-19, 20,-12, -1, -5, 16,  9,-18,-36,-17,  0;
/M: SY='E'; M=  2,  4,-22,  7, 15,-27,-10, -2,-23, -2,-22,-15,  2, -2, 11, -7, 11,  1,-20,-30,-17, 12;
/M: SY='T'; M=  3, -5,-16, -9, -1,-18,-17, -6,-12,  0,-10, -6, -4,-14,  1, -3,  2,  5, -7,-26,-11,  0;
/M: SY='V'; M=  2,-18,-16,-24,-20, -7,-24,-24, 18,-19,  2,  3,-13,-18,-17,-20,  2, 10, 21,-28, -9,-20;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-28,  8, 28,-25,-18, -2,-25, 11,-21,-14, -1, -5, 16,  5,  0, -8,-24,-24,-12, 21;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-25, -2,  5,-21,-14, -5,-18, 14,-16, -6,  5,-16,  4, 15, -6, -7,-14,-26,-13,  4;
/M: SY='V'; M=  6,-16,-14,-23,-19, -7,-23,-24, 13,-17,  2,  3,-14,-17,-17,-18,  2, 15, 19,-26,-10,-19;
/M: SY='R'; M=-19, -8,-30, -8,  1,-21,-20,  4,-30, 30,-21,-10,  0,-19, 10, 62,-10,-11,-21,-20, -9,  1;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-24, -9, -2,-18,-14, -4,-16,  8,-12, -5,  0,-17,  3, 18, -3, -6,-13,-24,-11, -1;
/M: SY='H'; M= -8, -3,-24, -4,  2,-19,-18, 34,-21,  2,-17, -5,  2,-15,  4,  1, -3, -5,-17,-27,  2,  0;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-30,  4,-38,-29, 45,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-28,-19, -9, 30,-19,  1,-29;
/M: SY='G'; M=  3,-11,-27,-12,-19,-28, 56,-20,-33,-18,-26,-17, -3,-20,-17,-19,  0,-17,-23,-21,-27,-18;
/M: SY='K'; M=-12,  5,-21,  7,  6,-21,-18, -4,-25, 15,-19,-12,  0,-15,  3, 10, -8,-10,-19,-23, -7,  4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-19,-32,-28,  4,-32,-28, 32,-24, 13, 12,-24,-26,-25,-23,-14, -5, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -7,  5,-23,-22,  3,-15, 12,-12, -2, -3,-15, 16, 17, -7, -7,-15,-22, -7,  9;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-32,-22, 14,-30,-20, 22,-28, 38, 19,-26,-28,-21,-21,-26, -9, 12,-18,  2,-22;
/M: SY='T'; M= -5, -2,-21, -2, -2,-10,-15, -5,-15,  1,-15,-11, -3,-15, -3, -4,  4,  7,-10,-17,  6, -4;
/M: SY='Y'; M=-12,-15,-16,-19,-14,  3,-23, -1, -3, -3,  1,  8,-13,-24, -7,  0,-15, -8, -5, -8, 18,-12;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='D'; M= -9,  1,-18,  4, -2,-12,-16, -5, -6,  0, -6, -4, -3,-13, -5, -1, -7, -6, -2,-20, -6, -4; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='E'; M= -4,  8,-18, 12, 17,-19,  0, -4,-19, -1,-14,-13,  2, -5,  3, -5,  1, -5,-16,-19,-14, 10; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='B'; M=  1,  2,-23,  2,  2,-24, -2,-11,-19, -4,-18,-13,  1, -7, -1, -9,  1, -3,-15,-27,-18,  1;
/M: SY='G'; M= -4,  0,-29,  3,-12,-30, 49,-15,-36,-15,-27,-18,  3,-18,-14,-17, -1,-17,-28,-24,-26,-13;
/M: SY='D'; M= -7, 16,-25, 17, 16,-27,  2,  2,-29, -2,-25,-20, 17,-11,  2, -6,  6, -5,-27,-32,-19,  9;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-15,-32,-29,  0,-32,-29, 33,-23, 14, 12,-27,-27,-27,-22,-13, -3, 42,-27, -7,-29;
/M: SY='W'; M=-17,-29,-34,-32,-24, 23,-23,-19,-10,-17, -7, -8,-26,-27,-20,-15,-25,-16,-15, 67, 26,-19;
/M: SY='I'; M=  6,-23,-19,-28,-21, -5,-19,-23, 18,-22, 15,  9,-21,-22,-18,-22,-12, -7, 16,-22, -8,-21;
/M: SY='Y'; M=-12, -5,-26, -5,  7,-10,-22,  1,-16,  5,-12, -5, -6,-13,  6,  7, -4,  1,-15,-14,  8,  5;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='C'; M= -5,  5, 21, -7,-12,-16,-14, -9,-18, -8,-19,-15, 14,-25,-11, -4, -1, -4,-13,-36,-19,-12; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-14,-16,-23,-18,-11,  1,-22, -7, -5, -4,  9,  2,-12,-24, -7, 12,-16, -6, -5,-14,  5,-11; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='S'; M=  8, -6,-13, -8, -8,-19, 12,-13,-20,-13,-23,-13,  2,-14, -7,-14, 20,  6,-12,-28,-18, -8;
/M: SY='D'; M= -6, 22,-23, 27, 12,-30, -9, -5,-29,  8,-26,-20, 13,-11,  2, -1,  3, -4,-22,-32,-18,  7;
/M: SY='H'; M= -4, -8, -7,-12,-10, -5,-16,  6,-11,-12,-13, -5, -3,-20, -5,-11,  6,  3, -8,-22,  6, -9;
/M: SY='P'; M=  5,-11,-25,-10, -5,-22,-10,-17,-14, -9,-21,-14, -7, 27, -9,-15,  4,  0,-13,-30,-22, -9;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-20,-34,-29,  0,-35,-29, 39,-25, 14, 15,-23,-25,-24,-25,-15, -5, 38,-25, -5,-29;
/M: SY='F'; M=-19,-27,-21,-35,-28, 66,-29,-13,  1,-26,  8,  0,-19,-30,-34,-18,-19, -9,  1,  8, 32,-28;
/M: SY='V'; M= -3,-29, -5,-31,-29, -2,-32,-30, 29,-22,  9,  9,-27,-27,-28,-22,-12, -3, 41,-30,-10,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,  7,-27,  4, 12,-31,-17,  5,-21, 13,-22, -6,  9,-12, 34, 11,  1, -4,-26,-23,-10, 23;
/M: SY='S'; M=  9, -1, -7, -2, -2,-20,  3,-11,-21,-11,-29,-20,  8,-12, -2,-11, 35, 17,-11,-39,-21, -2;
/M: SY='P'; M= -5,-16,-29,-15,-10,-13,-11,-15,-14, -7,-16,-11,-14, 12,-10, -8, -7, -4,-15, -8, -6,-13;
/M: SY='Y'; M= -5, -1,-20, -8,-10,  1,-14, -3,-11, -6,-13, -9,  6,-19, -9, -7,  3,  7,-11,-15,  9,-10;
/M: SY='L'; M= -6,-18,  6,-21,-12, -1,-24,-17, -3,-21, 13,  1,-17,-25,-13,-17,-13, -5, -3,-26, -8,-12;
/M: SY='D'; M=-12, 30,-26, 31,  7,-29, -2,  0,-29, -2,-29,-23, 28, -8,  1, -7,  5, -5,-29,-33,-20,  4;
/M: SY='H'; M=-13,  0,-27, -1,  1,-14,-18,  9,-17,  1,-13, -7,  4,-10,  4,  8, -7, -9,-20,-19,  2,  0;
/M: SY='E'; M= -9, -1,-26, -3,  7,-20,-19, -1,-11, -2,-14, -5,  3,  1,  5, -3, -3, -4,-16,-28,-13,  4;
/M: SY='N'; M= -2,  5,-22,  3,  3,-16,-10,  7,-17, -5,-15, -9,  8,-14,  0, -6,  1, -5,-17,-26, -6,  1;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-12, -3, -7,-25, 21,-14,-28,-10,-25,-17,  5,-17, -8,-12,  5, -6,-21,-29,-23, -8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='R'; M=-12,-17,-25,-21,-14,  4,-16,-14,-10, -1, -9, -4,-11,-21,-11, 10,-11, -7, -6, -2,  0,-13; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='H'; M=  1, -9,-22,-11, -4,-16,-16,  5,-10,-10,-10, -5, -5, -1, -3,-10,  1,  0,-10,-26, -8, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='P'; M= -9,-14,-28,-11, -7,-14,-16,-14, -6,-13, -2, -4,-14, 14, -8,-15,-12, -9,-12,-23,-12, -9; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-21, -7,-10,-17,  6,-14,-15, -8,-11, -9,  0,-18,-10, -7,  0, -2, -9,-25,-16,-11; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-16, -2, -1,-14,-15,-11,-12,  2, -9, -8, -2,-10, -4, -1,  3, 11, -7,-20, -7, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='V'; M= -1,-24,-14,-26,-25, -3,-28,-23, 24,-19,  7,  8,-22,-26,-24,-19, -8,  1, 37,-29, -9,-25;
/M: SY='H'; M=-12,-13,  8,-18,-16,-11,-23, 18,-11,-18, -8, -2, -7,-25,-11,-12,-10,-10, -7,-31, -2,-16;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  8,-29,-17, -8,-29, 40,-26, -9,  0,-12, 12, 32, -9,-10,-21,-20,-11,  9;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-34,-28,  5,-33,-26, 34,-25, 21, 18,-26,-26,-23,-23,-18, -6, 31,-23, -3,-27;
/M: SY='P'; M=-11,-13,-30,-12, -6, -7,-21, -6,-12, -8,-14, -7,-11, 22, -5,-10, -9, -5,-18,-15,  1, -8;
/M: SY='P'; M= -7, -5,-32, -2,  1,-28, -7, -8,-23, -7,-28,-18, -1, 40, -2,-13, -1, -7,-28,-31,-24, -3;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-21, -5, -7,-25, 22, -8,-27, -8,-22,-11,  3,-17, -5, -9,  0,-11,-22,-25,-20, -6;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='C'; M=  0,-10,  7,-15,-11,-10,-13,-14,-19, -6,-18,-13, -8,-14,-12,-11, -1, -2,-12,-23, -7,-12;
/M: SY='S'; M=  2, -3, -3, -8, -7,-15,-12,-11,-14, -8,-19,-13,  4,-16, -4, -8, 16, 11, -8,-31,-11, -6;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-19,-30,-23,  5,-29,-19, 23,-24, 24, 18,-22,-24,-18,-21,-20, -8, 15,-17,  3,-22;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-23, -2,  6,-27,-19, -9,-29, 41,-28,-11,  2,-13,  7, 29, -8, -7,-19,-22,-11,  6;
/M: SY='V'; M=  2,-26,-18,-31,-25, -1,-29,-27, 28,-23, 17, 11,-23,-24,-22,-23,-13, -3, 29,-24, -7,-25;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 79,-30,-20,  1,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  1,  9, 29,-30;
/M: SY='D'; M=-16, 39,-28, 48, 15,-34, -3,  0,-35,  0,-29,-26, 24,-12,  0, -6,  2, -8,-30,-37,-21,  8;
/M: SY='M'; M=-11, -9,-21,-17,-15,  7,-20, -2,  3,-12,  5, 13, -2,-23, -9,-10,-11, -5, -3,-17,  7,-12;
/M: SY='R'; M= -9,  5,-28,  4, 18,-28,-16,  0,-26, 19,-23,-12,  6,-11, 18, 23, -2, -8,-24,-25,-14, 17;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='K'; M= -7, -6,-25, -5, 11,-21,-21, -7,-12, 12, -8, -2, -7,-12, 11,  7, -8, -9,-12,-21,-10, 11; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F'; M= -8,-21, -7,-29,-21, 39,-23,-15, -7,-21, -1, -5,-15,-26,-26,-15, -9, -4, -4, -3, 17,-22; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='A'; M= 10, -7,-17,-11, -2,-17,-11, -1,-17,  1,-16, -7, -5,-14,  4, -3,  2, -5,-13,-19, -6,  1;
/M: SY='Q'; M= -4, -1,-22, -2, 10,-25,-16,  3,-18,  3,-17, -8,  1,-12, 18,  3,  6,  1,-17,-27,-11, 13;
/M: SY='L'; M= -6,-10,-21,-13, -4, -8,-19, -9,  2,-14, 13,  7, -7,-20,  0,-11,-10, -6, -5,-25, -8, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-23,-27,-16,  0,-29,-16, 17,-18, 28, 19,-22,-25, -9,-12,-22, -9,  9,-21, -2,-14;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='N'; M=  2,  5,-17,  1,  7,-18, -8,  1,-17,  3,-17,-11, 10,-11,  6,  6,  5,  0,-16,-23,-12,  5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-22,  1,  7,-22,-14, -1,-18,  7,-12, -6,  0,-12, 18, 15, -2, -5,-17,-20,-10, 11; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='S'; M=  3, -5,-17, -6,  5,-18,-11, -5,-14, -7,-12, -9, -2,-10, -1, -7,  6, -1,-12,-29,-14,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='V'; M= -1,-19,-14,-21,-15, -4,-20,-17,  0,-11, -1,  0,-16,-13,-15, -8, -7, -2,  5,-20, -8,-15; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N'; M= -1,  5,-22, -2, -1,-19,-11,  5,-17,  2,-18,-10, 13,-13,  2,  6,  2, -2,-16,-28,-12, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-26, 14, 11,-26,-15,  7,-26,  7,-20,-12,  4,-12,  7,  8, -2, -6,-20,-28,-11,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='G'; M=  6, -7,-23, -9, -6,-23,  9, -5,-23,-10,-20,-13, -3, -2, -6,-11,  3, -3,-18,-24,-17, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='Y'; M=-10,-12,-21,-14,-14, 12,-10, -4, -8,-12, -6, -4, -9,-17,-12,-11, -8, -4, -8, -3, 16,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-29,  6, 18,-25,-19, -2,-18, -1,-19,-13, -1, 10,  6, -5, -2, -6,-20,-30,-16, 10;
/M: SY='A'; M=  2,  1,-19,  1, -3,-16, -2, -8,-20, -9,-14,-13, -2,-16, -9,-10,  0, -3,-12,-25,-13, -7;
/M: SY='V'; M=  2,-19,-16,-22,-16, -9,-20,-18,  6, -8,  1,  6,-17,-18,-12, -4, -5,  0, 15,-26,-11,-15;
/M: SY='D'; M=-15,  8,-28, 13,  2,-12,-12,  4,-22, -1,-17,-12,  3,-17,  1,  1, -5, -8,-20,-16,  7,  0;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-22, 10, 12,-28, -4, -4,-29,  3,-24,-16,  6,-12, 10,  6,  5, -4,-24,-29,-18, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-24,-26,-16,  0,-27,-18, 12,-22, 29, 15,-26, -6,-15,-16,-24,-10,  2,-22, -6,-17;
/M: SY='T'; M= -6, -6,-22, -8,  3,-11,-18, -7,-13, -2,-10, -7, -4,-15,  0,  2,  1,  6,-11,-15, -2,  0;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-26,  1,  2,-22,-18, -6,-24, 20,-18,-10,  2,-15,  3, 26, -5, -2,-16,-24,-11,  1;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='M'; M=-12,-17,-26,-20,-12,  2,-18, -2, -2, -9,  2, 13,-15,-12, -3, -9,-15,-11, -7,-12,  7, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-16, 78,-25,-25, -8,-27,-23,-24,-25,-16,-16,-14,-34,-26,-24, -5, -2, -9,-39,-18,-25;
/M: SY='T'; M= -5,-10, -2,-18,-15,  0,-22,-19, -5,-15, -2, -4, -7,-19,-15,-13,  3, 16, -1,-26, -7,-15;
/M: SY='I'; M= -5,-24,-20,-29,-23, -2,-29,-24, 28,-23, 13, 14,-18,-22,-18,-22, -9, -1, 24,-25, -5,-23;
/M: SY='R'; M= -8, -9,-27,-11,  0,-22,-17, -3,-26, 23,-19, -9, -2,-17, 10, 50, -6, -8,-17,-20,-12,  1;
/M: SY='I'; M= -5,-27,-20,-33,-26,  0,-30,-21, 32,-21, 17, 26,-23,-23,-18,-21,-16, -6, 29,-23, -4,-24;
/M: SY='S'; M= 16, -2,-10, -3, -2,-20,  0,-12,-18,-10,-27,-18,  7,-10, -2,-12, 35, 17, -8,-37,-20, -2;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 64,-30,-19,  4,-29, 18,  6,-22,-30,-35,-20,-22,-10,  2,  3, 23,-27;
/M: SY='V'; M=  5,-24,  6,-27,-26, -7,-22,-28, 13,-20,  1,  1,-24,-28,-26,-21, -5, -1, 31,-31,-15,-26;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  1, 12,-30,-20,-10,-30, 49,-30,-10,  0,-10, 10, 29,-10,-10,-20,-20,-10, 11;
/M: SY='G'; M=  2, -5,-26, -4,-14,-29, 52,-17,-35,-17,-29,-20,  2,-18,-16,-18,  5,-13,-25,-24,-27,-15;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='W'; M=-16,-31,-37,-32,-25, 17,-13,-24,-15,-19,-13,-14,-28,-25,-20,-17,-28,-22,-21, 93, 21,-19; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='G'; M=  3, -6,-24, -8,-15,-25, 51,-16,-31,-15,-25,-17,  3,-17,-15,-16,  2,-14,-24,-19,-25,-15; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='P'; M=  7, -5,-20, -3,  5,-21, -6,-11,-16, -1,-15,-11, -6,  8, -1, -6,  0, -6,-13,-20,-17,  1; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='D'; M= -8, 13, -9, 19, 14,-23,-13, -2,-23, -1,-17,-16,  3, -9,  1, -6,  0, -5,-16,-28,-14,  7; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='Y'; M=-16,-16,-24,-16,-16, 23,-24, 15,  0, -8,  0,  0,-16,-23, -8, -8,-16, -8, -8, 23, 63,-16; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='H'; M= -6, -5,-22, -5,  0,-19,-13, 10,-19,  1,-19, -9, -1,  9,  3,  6,  0, -4,-18,-22, -9, -1; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='R'; M=-17, -4,-27, -5,  4,-20,-17,  1,-27, 25,-20,-10,  4,-17,  9, 53, -7, -9,-20,-21,-10,  3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='Q'; M= -6,  3,-25,  0, 10,-29,-14,  3,-18,  8,-19, -6,  6, -8, 31,  6,  2, -5,-23,-23,-12, 20; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='D'; M= -9, 15,-21, 16, -1,-14,-13,-10,-18, -7,-18,-15,  9,-14, -7,-10,  7,  9,-13,-30,-11, -4;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-21,-34,-28,  2,-34,-24, 35,-24, 17, 18,-24,-25,-22,-23,-17, -6, 32,-21,  1,-27;
/M: SY='T'; M= -4, -2,-18, -8, -8,-12,-20,-11, -6, -5, -5, -3, -1,-15, -7, -7,  2, 14, -2,-28, -8, -8;
/M: SY='S'; M= -2,  8,-19,  9, 11,-23, -5, -5,-24, -1,-26,-19, 12,-11,  5,  1, 19,  7,-19,-35,-19,  7;
/M: SY='T'; M= -2, -6, 21,-14,-12,-15,-20,-19,-16,-15,-14,-12, -5,-18,-10,-14, 12, 26, -5,-35,-16,-11;
/M: SY='P'; M= -9,-19,-38, -9,  0,-29,-19,-19,-20,-10,-30,-20,-18, 84, -9,-19, -7, -8,-29,-31,-29, -9;
/M: SY='C'; M= -7,-22, 80,-30,-29,-15,-29,-29,-13,-27,-11,-10,-22,-36,-28,-27,-10, -8,  5,-43,-24,-29;
/M: SY='W'; M=-18,-38,-48,-38,-28,  8,-19,-29,-20,-19,-21,-20,-37,-29,-19,-19,-35,-27,-29,139, 27,-19;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-35,-27, 12,-34,-26, 32,-28, 21, 14,-22,-24,-23,-24,-18, -5, 23,-18,  2,-27;
/M: SY='E'; M= -2,  1,-26,  7, 38,-24,-19, -5,-20,  2, -9,-12, -5, -6, 13, -5, -3, -9,-21,-27,-17, 26;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-20,-32,-26,  1,-32,-27, 31,-25, 22, 14,-24,-25,-22,-23,-16, -3, 28,-24, -4,-26;
/M: SY='H'; M=-12,-12,-24,-13,-10,-11,-24, 27, -5, -9, -5,  3, -6,-21, -3, -2, -9, -8, -3,-25,  6,-10;
/M: SY='L'; M=-11,-14,-21,-20,-15,  5,-24,-13, 10,-22, 24,  9, -8,-26,-13,-15,-19, -8,  0,-22, -2,-14;
/M: SY='H'; M=-11,  4,-21, -2, -7,-14,-14, 31,-12,-10,-13, -4, 15,-22, -4, -6, -3, -7,-11,-33, -2, -7;
/M: SY='G'; M= -5, -9,-23,-11,-11,-17,  1,-11,-11, -8,-14, -8, -2,-15,-12, -3, -4, -8, -4,-27,-17,-13;
/M: SY='P'; M= 12,-13,-26,-13, -4,-24,-12,-16,-16, -5,-19,-14,-12, 33, -8,-13, -3, -6,-16,-25,-22, -8;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-22,-25,-16,  3,-25,-10,  9,-13, 25, 21,-21,-25,-10, -5,-22,-10,  3,-16,  4,-14;
/M: SY='Q'; M= -5, 15,-26, 21, 14,-35,-13,  3,-26,  5,-23,-13,  6,-10, 23, -1,  3, -7,-24,-28,-14, 18;
/M: SY='W'; M=-14,-28,-33,-31,-21, 10,-17,-16, -3,-18,  3,  8,-26,-25,-15,-17,-26,-18,-10, 46, 14,-16;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-30,-21,  6,-30,-17, 21,-23, 34, 21,-25,-27,-16,-14,-25,-10, 12,-18,  2,-20;
/M: SY='D'; M=-14, 33,-29, 46, 15,-35,-12, -3,-36, 10,-28,-24, 13,-11,  2,  2, -2, -9,-26,-34,-18,  8;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-24,  2, 15,-26,-13, -6,-24, 12,-25,-15,  3, -3, 11,  8,  8,  0,-20,-29,-17, 12;
/M: SY='V'; M= -5,-17,-18,-19,-17, -9,-25,-20, 10, -1, -1,  3,-15,-24,-15, -1,-10, -4, 21,-27,-10,-17;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-13,-29,-21,  8,-29,-20, 16,-27, 34, 16,-24,-27,-19,-20,-21, -3,  9,-21, -1,-20;
/M: SY='P'; M= -9, -5,-26, -6,  0,-20,-19,  1,-18,  0,-20, -9, -2,  9,  6, -1,  0,  5,-19,-24, -8,  1;
/M: SY='Q'; M= -5, -2,-14, -4,  4,-22,-20, -6,-15, -5,-14, -8, -3, -7, 12, -7,  0,  1,-16,-25,-10,  7;
/M: SY='M'; M= -8,-19,-22,-26,-19, -4,-24,-12, 20,-16, 12, 30,-16,-13, -9,-16,-13, -5, 12,-24, -5,-16;
/M: SY='G'; M= -5, -4,-29, -3, -1,-28, 14,-12,-28, -5,-28,-17,  1, 10, -3,-10,  1, -8,-27,-26,-24, -3;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-20,  0,  2,-21,-11, -9,-17,  1,-20,-12,  4,-10,  2,  2, 12,  3,-12,-31,-16,  1;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='P'; M= -7,-12,-19,-10, -5,-15,-17,-10,-13,-11,-14,-11,-11, 26, -9,-12, -4, -3,-15,-26,-16,-10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M:         M= -4, -7,-20, -8, -7,-10, -9, -3, -7,-11, -4, -4, -5, -5, -7,-10, -4, -5, -8,-20, -6, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='V'; M= -6, -8,-19,-13,-11, -7,-18, -4, -1, -6, -6, -1, -2,-16, -9, -2, -4, -1,  2,-24, -6,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -8, -5,-30,  1, 10,-23,-17, -8,-20, -1,-22,-16, -7, 28,  0, -4, -3, -7,-22,-25,-15,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -9,-24,  2,-26,-18, -9,-28,-24,  2,-22, -2, -3,-20,  6,-19,-22,-15,-10, -3,-28,-15,-21;
/M: SY='S'; M=  3,  3,-16,  0, -3,-19, -5, -9,-16, -7,-19,-14,  9,-13, -3, -9, 18, 13,-11,-33,-16, -3;
/M: SY='S'; M=  3,  3,-17,  0, -3,-22,  3,-10,-21, -9,-28,-19, 12, -2, -4, -9, 23, 11,-16,-35,-21, -4;
/M: SY='V'; M= -6,-20,-18,-22,-17, -6,-23,-13,  9, -9,  4, 12,-15,-23,-11,  0, -7, -3, 15,-26, -8,-15;
/M: SY='S'; M=  1,  0,-16, -2,  0,-11, -9,-11,-18,-10,-23,-17,  6, -4, -5,-11, 22, 15,-12,-32,-15, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 41 in 41 different sequences
Number of true positive hits 41 in 41 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MH2
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
41 sequences

MAD_DROME   (P42003), SMA2_CAEEL  (Q02330), SMA3_CAEEL  (P45896), 
SMA4_CAEEL  (P45897), SMAD1_BOVIN (Q1JQA2), SMAD1_COTJA (Q9I962), 
SMAD1_DANRE (Q9I8V2), SMAD1_HUMAN (Q15797), SMAD1_MOUSE (P70340), 
SMAD1_RAT   (P97588), SMAD2_BOVIN (Q1W668), SMAD2_DANRE (Q9I9P9), 
SMAD2_HUMAN (Q15796), SMAD2_MOUSE (Q62432), SMAD2_PONAB (Q5R7C0), 
SMAD2_RAT   (O70436), SMAD3_CHICK (P84023), SMAD3_HUMAN (P84022), 
SMAD3_MOUSE (Q8BUN5), SMAD3_PIG   (P84024), SMAD3_RAT   (P84025), 
SMAD4_BOVIN (Q1HE26), SMAD4_HUMAN (Q13485), SMAD4_MOUSE (P97471), 
SMAD4_PIG   (Q9GKQ9), SMAD4_RAT   (O70437), SMAD5_CHICK (Q56I99), 
SMAD5_DANRE (Q9W7E7), SMAD5_HUMAN (Q99717), SMAD5_MOUSE (P97454), 
SMAD5_PONAB (Q5R6H7), SMAD5_RAT   (Q9R1V3), SMAD6_CHICK (Q9W734), 
SMAD6_HUMAN (O43541), SMAD6_MOUSE (O35182), SMAD7_HUMAN (O15105), 
SMAD7_MOUSE (O35253), SMAD7_RAT   (O88406), SMAD9_HUMAN (O15198), 
SMAD9_MOUSE (Q9JIW5), SMAD9_RAT   (O54835)
» More

PDB
[Detailed view]
13 PDB

1DD1; 1DEV; 1G88; 1KHU; 1KHX; 1MJS; 1MK2; 1MR1; 1U7F; 1U7V; 1YGS; 3DIT; 3GMJ
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission