ID HTH_ICLR; MATRIX. AC PS51077; DT 01-FEB-2005 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE IclR-type HTH domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=58; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0114145; R2=0.0185352; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2753.4482422; R2=2.7931035; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=502; H_SCORE=4156; N_SCORE=11.3; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=243; H_SCORE=3432; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='V'; M=-2,-17,-13,-22,-21,-7,-24,-17,16,-16,2,6,-12,-23,-16,-15,-6,-1,22,-29,-9,-20; MA /M: SY='Q'; M=-2,-1,-25,-3,7,-29,-15,-1,-20,9,-22,-8,2,-3,22,5,4,-1,-21,-25,-13,14; MA /M: SY='S'; M=10,-5,-15,-8,-8,-18,0,-7,-15,-12,-20,-13,1,-11,-7,-13,18,9,-6,-32,-16,-8; MA /M: SY='L'; M=-2,-24,-18,-28,-21,0,-27,-22,20,-23,23,13,-22,-22,-20,-20,-16,-5,19,-24,-6,-21; MA /M: SY='D'; M=-7,10,-24,15,15,-22,-14,-5,-20,-3,-16,-15,3,-11,0,-8,2,-2,-15,-31,-15,7; MA /M: SY='R'; M=-16,-2,-29,-2,4,-24,-19,-2,-28,30,-21,-10,2,-17,10,47,-9,-10,-20,-22,-11,4; MA /M: SY='A'; M=27,-12,-15,-18,-14,-18,8,-20,-10,-14,-11,-8,-9,-14,-13,-19,7,-1,-1,-23,-19,-14; MA /M: SY='L'; M=-10,-26,-22,-31,-21,15,-27,-18,18,-25,29,20,-24,-26,-19,-19,-23,-10,10,-16,3,-20; MA /M: SY='R'; M=1,-2,-23,-3,4,-23,-12,-7,-19,7,-16,-8,-1,-13,7,12,1,-2,-14,-24,-14,5; MA /M: SY='I'; M=-4,-28,-16,-33,-26,0,-32,-26,30,-26,21,15,-24,-25,-22,-24,-18,-7,26,-24,-5,-26; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-31,-21,14,-30,-19,20,-28,39,18,-27,-28,-19,-20,-27,-10,10,-17,3,-20; MA /M: SY='D'; M=-7,11,-25,14,14,-25,-11,-3,-22,2,-18,-12,6,-12,10,-1,0,-6,-21,-28,-15,12; MA /M: SY='L'; M=4,-18,-20,-21,-14,-1,-19,-6,2,-16,8,4,-15,-21,-10,-14,-8,-4,0,-12,5,-13; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-33,-25,24,-31,-21,20,-27,28,14,-26,-29,-26,-21,-23,-8,16,-12,9,-25; MA /M: SY='A'; M=14,-6,-16,-10,-5,-16,-4,-14,-11,-11,-9,-9,-4,-14,-7,-14,7,3,-5,-24,-14,-6; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='E'; M=-8,3,-25,5,15,-20,-12,-4,-23,7,-20,-14,2,-11,6,3,1,-4,-19,-21,-12,10; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='N'; M=-2,2,-22,0,1,-18,-8,4,-16,-4,-14,-9,5,-12,0,-4,1,-4,-14,-26,-10,-1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-21; MA /M: SY='P'; M=-6,-4,-19,-2,-3,-19,-5,-8,-19,-2,-18,-12,-4,3,-5,-1,-5,-7,-15,-15,-13,-6; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=-5,1,-23,1,0,-22,7,-1,-26,-1,-20,-13,5,-14,-1,4,2,-6,-20,-25,-15,-1; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='G'; M=-2,-7,-26,-5,-1,-23,7,-11,-23,-7,-22,-14,-5,5,-6,-7,1,-6,-19,-21,-19,-5; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='L'; M=1,-21,-5,-24,-17,-3,-23,-16,7,-21,12,4,-20,-24,-17,-19,-12,-6,8,-19,-5,-17; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-21; MA /M: SY='S'; M=0,-3,-19,-6,-7,-20,6,-14,-23,-6,-23,-16,4,-10,-6,-2,15,13,-14,-29,-18,-8; MA /M: SY='L'; M=-3,-23,-17,-26,-20,2,-27,-22,14,-23,15,6,-21,-14,-19,-22,-15,-7,10,-21,-4,-21; MA /M: SY='T'; M=6,-3,-17,-7,-4,-17,-7,-13,-16,-3,-16,-10,-2,-12,-5,-4,10,13,-8,-25,-12,-5; MA /M: SY='E'; M=-6,9,-26,15,27,-28,-17,-1,-23,3,-17,-12,0,-6,14,-3,0,-5,-21,-29,-16,20; MA /M: SY='L'; M=-7,-29,-22,-33,-24,4,-32,-23,30,-27,32,20,-25,-25,-19,-23,-23,-9,20,-21,-2,-24; MA /M: SY='A'; M=26,-9,-9,-15,-9,-18,-4,-13,-10,-12,-13,-8,-5,-13,-6,-16,13,3,-3,-27,-17,-8; MA /M: SY='E'; M=-3,4,-26,7,23,-27,-13,-2,-26,11,-20,-14,2,-9,12,8,0,-7,-22,-26,-16,17; MA /M: SY='R'; M=1,-7,-21,-10,-1,-16,-17,-11,-9,1,-5,-4,-4,-16,0,3,-3,-1,-7,-24,-12,-1; MA /M: SY='L'; M=4,-17,-15,-21,-15,-1,-19,-19,6,-19,9,4,-14,-19,-14,-17,-1,6,8,-24,-7,-15; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=-2,0,-28,0,-6,-29,36,-12,-33,-9,-27,-16,4,-16,-7,-10,1,-14,-26,-24,-24,-7; MA /M: SY='L'; M=-7,-27,-18,-32,-23,4,-30,-19,25,-25,28,23,-25,-25,-17,-21,-22,-9,17,-20,0,-22; MA /M: SY='P'; M=0,-2,-26,-2,-2,-24,-7,-5,-21,-9,-26,-17,3,25,-6,-13,5,0,-21,-32,-21,-6; MA /M: SY='R'; M=-9,-4,-26,-5,0,-20,-19,-9,-18,17,-15,-6,-1,-10,3,19,-7,-4,-14,-24,-11,0; MA /M: SY='S'; M=12,-3,-14,-4,-1,-21,1,-12,-19,-9,-25,-17,4,-6,-2,-11,27,15,-11,-34,-20,-2; MA /M: SY='T'; M=6,0,-13,-7,-4,-15,-13,-15,-15,-5,-16,-13,2,-10,-5,-4,19,29,-6,-30,-14,-4; MA /M: SY='V'; M=7,-22,-9,-26,-22,-4,-23,-25,14,-20,12,5,-21,-23,-21,-20,-7,3,23,-26,-10,-22; MA /M: SY='H'; M=-16,-10,-26,-11,-9,2,-23,32,-12,-8,-7,-1,-4,-23,0,0,-10,-9,-15,-9,27,-8; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='R'; M=-12,-4,-25,-7,-2,-18,-14,-3,-23,18,-18,-10,5,-18,4,40,-4,-5,-15,-23,-12,-2; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='L'; M=-11,-26,-20,-30,-22,7,-31,-11,21,-26,29,19,-23,-26,-17,-20,-24,-10,11,-18,6,-21; MA /M: SY='L'; M=-7,-28,-16,-30,-22,8,-29,-21,19,-27,37,18,-28,-28,-20,-20,-24,-7,14,-21,-2,-21; MA /M: SY='Q'; M=-7,0,-24,-2,2,-21,-14,1,-18,4,-17,-7,4,-11,8,8,0,0,-17,-26,-10,4; MA /M: SY='T'; M=1,-2,-14,-7,-9,-11,-12,-16,-9,-11,-10,-8,-1,-14,-11,-12,11,22,-1,-29,-12,-9; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-20,7,-25,-17,18,-26,42,25,-27,-28,-17,-18,-27,-10,9,-20,-1,-18; MA /M: SY='E'; M=-2,-11,-22,-11,3,-16,-23,-12,-3,-1,-6,-2,-12,-16,2,-2,-5,-5,2,-24,-10,2; MA /M: SY='E'; M=-6,3,-24,4,16,-21,-16,-1,-20,4,-17,-10,2,-11,12,5,4,-1,-18,-25,-9,13; MA /M: SY='H'; M=-7,-9,-15,-10,3,-15,-19,7,-14,-6,-7,-1,-8,-17,2,-5,-8,-10,-14,-20,-5,2; MA /M: SY='G'; M=-3,0,-28,0,-4,-28,37,-12,-34,-9,-27,-19,6,-16,-10,-9,1,-13,-27,-24,-25,-7; MA /M: SY='Y'; M=-16,-25,-24,-29,-23,33,-29,-7,6,-18,11,8,-22,-28,-20,-14,-21,-10,2,9,34,-22; MA /M: SY='V'; M=-2,-28,-16,-30,-26,4,-30,-26,26,-23,20,12,-26,-27,-25,-21,-15,-3,31,-24,-5,-26; MA /M: SY='E'; M=-2,1,-22,2,10,-20,-13,-6,-19,0,-15,-11,0,-11,3,1,5,3,-14,-27,-12,5; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='R'; M=-10,-6,-24,-7,4,-15,-18,-3,-18,7,-15,-7,-2,-10,13,17,-1,-4,-16,-20,-8,8; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='D'; M=-8,16,-22,19,4,-23,-13,-4,-16,-4,-16,-13,10,-14,-1,-8,1,-2,-12,-32,-14,1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='P'; M=2,-4,-18,-3,1,-24,-2,-10,-21,-5,-22,-15,-4,10,-4,-11,1,-5,-18,-27,-20,-3; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-22; MA /M: SY='E'; M=-4,8,-15,11,16,-17,-9,3,-15,1,-11,-9,4,-5,8,-2,1,-4,-15,-19,-9,12; D=-4; MA /I: I=-4; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; MA /M: SY='B'; M=-2,10,-17,10,2,-19,-1,-3,-20,-3,-17,-14,9,-11,-2,-5,6,0,-15,-26,-14,-1; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='G'; M=-8,-1,-28,0,0,-27,15,-4,-30,5,-25,-14,3,-15,-2,4,-4,-14,-24,-22,-17,-2; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-22; MA /M: SY='R'; M=-7,-7,-23,-11,-7,-13,-14,-7,-14,7,-11,-4,-3,-19,-3,11,-5,-3,-10,-18,-5,-6; MA /M: SY='Y'; M=-17,-24,-30,-26,-22,34,-28,6,-3,-15,-1,-3,-22,-29,-16,-13,-21,-12,-10,38,61,-21; MA /M: SY='R'; M=-2,-10,-15,-13,-8,-13,-17,-1,-10,-4,-11,-5,-5,-18,-1,4,3,2,-5,-24,-4,-6; MA /M: SY='L'; M=-7,-27,-18,-29,-21,4,-30,-21,19,-26,31,13,-26,-20,-19,-21,-22,-7,12,-21,-1,-21; MA /M: SY='G'; M=-1,-10,-28,-11,-19,-25,53,-20,-34,-19,-25,-18,-2,-19,-19,-19,1,-11,-25,-16,-25,-19; MA /M: SY='P'; M=-4,-17,-25,-17,-9,-11,-22,-16,-1,-14,-1,-2,-15,12,-11,-15,-8,-1,-5,-24,-10,-13; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; PP /PROMOTED_BY: PS51078; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=35(35); /POSITIVE=35(35); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=14; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH iclR-type; CC /VERSION=8; DR P0ACN6 , ALLR_ECO57 , T; A1A8H2 , ALLR_ECOK1 , T; DR Q0TKD5 , ALLR_ECOL5 , T; P0ACN5 , ALLR_ECOL6 , T; DR P0ACN4 , ALLR_ECOLI , T; Q1RF28 , ALLR_ECOUT , T; DR Q765S0 , ALLR_KLEPN , T; Q57S48 , ALLR_SALCH , T; DR Q5PCF5 , ALLR_SALPA , T; Q8Z8R2 , ALLR_SALTI , T; DR Q8ZR86 , ALLR_SALTY , T; B0R9X6 , ARCR_HALS3 , T; DR A1B8Z4 , BHCR_PARDP , T; P15360 , GYLR_STRCO , T; DR P22866 , GYLR_STRGR , T; P16528 , ICLR_ECOLI , T; DR P17430 , ICLR_SALTY , T; P37728 , KDGR_DICCH , T; DR P76268 , KDGR_ECOLI , T; P42968 , KIPR_BACSU , T; DR P77569 , MHPR_ECOLI , T; Q52154 , PCAR_PSEPU , T; DR O83046 , PCAU_ACIAD , T; Q43992 , POBR_ACIAD , T; DR P77732 , RHMR_ECOLI , T; Q0K846 , SAUR_CUPNH , T; DR Q9R9U0 , SRPS_PSEPU , T; Q6XL52 , TSAQ_COMTE , T; DR Q93PU6 , TTGV_PSEPT , T; D4GP42 , XACR_HALVD , T; DR P77300 , XYNR_ECOLI , T; P44996 , Y1032_HAEIN, T; DR P71977 , Y1719_MYCTU, T; P37671 , YIAJ_ECOLI , T; DR P39360 , YJHI_ECOLI , T; DR A0A1L9WLK0, AACUS_ASPA1, N; M2YJ20 , AFLJ_DOTSN , N; DR O42716 , AFLS_ASPPU , N; A0A411PQN9, AGN9_PAEDI , N; DR P0CU73 , CLAA_PASFU , N; A5HWA8 , EFL2_CAEEL , N; DR Q0CCY2 , GEDD_ASPTN , N; A0A5B8YU39, GME69_PESMI, N; DR C8VQ72 , MDPA_EMENI , N; E1ACR3 , NOTR_ASPSM , N; DR A0A2I1C3U1, NSRH_ASPN1 , N; M1WG94 , PIG10_CLAP2, N; DR M2YMT1 , PK81J_PSEFD, N; Q4WQZ4 , TPCD_ASPFU , N; 3D 2XRN; 2XRO; PR PRU00393; DO PDOC00807; //