ID   ZF_SIAH; MATRIX.
AC   PS51081;
DT   01-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger SIAH-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3849263; R2=0.0085326; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4587.2543945; R2=2.9152544; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=776; H_SCORE=6849; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=483; H_SCORE=5995; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=14,-3,-10,-7,0,-19,-8,-13,-18,-2,-20,-14,1,-11,-1,-7,17,9,-9,-29,-17,-1;
MA   /M: SY='V'; M=4,-22,-18,-26,-21,-5,-17,-23,16,-21,9,7,-18,-22,-18,-21,-7,-3,18,-25,-10,-21;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-13,-23,-15,-3,-10,-22,-8,-3,-4,3,3,-11,-16,-2,-1,-10,-6,-4,-22,-7,-3;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-28,-11,-32,-28,21,-29,-24,18,-24,10,6,-24,-28,-29,-21,-13,-4,26,-17,3,-28;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-16,-31,-11,-2,-26,-16,-18,-18,-9,-25,-16,-15,57,-8,-15,-2,-4,-22,-29,-25,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-19,107,-28,-29,-21,-24,-29,-31,-28,-21,-20,-18,-38,-28,-27,-9,-11,-11,-47,-29,-29;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-9,-28,-8,-1,-25,-9,-12,-23,11,-22,-12,-6,9,0,10,-3,-7,-19,-24,-18,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-12,3,-25,-5,-10,5,-17,24,-11,-9,-13,-7,13,-23,-6,-7,-6,-8,-18,-11,23,-10;
MA   /M: SY='A'; M=25,-5,-12,-12,-7,-20,-7,-14,-13,-5,-14,-11,-3,-13,-4,-8,10,5,-5,-25,-17,-6;
MA   /M: SY='K'; M=0,-3,-19,-5,1,-21,-12,-3,-18,3,-19,-9,-1,-6,-1,-1,2,0,-13,-28,-13,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-11,-25,-13,-8,5,-18,15,-13,-9,-7,-4,-6,-21,-7,-7,-9,-9,-14,-6,18,-9;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-10,-30,-10,-19,-29,65,-19,-39,-17,-29,-19,0,-20,-18,-15,-1,-19,-29,-20,-29,-19;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-19,113,-29,-29,-20,-28,-29,-29,-29,-19,-19,-19,-38,-29,-29,-9,-9,-9,-48,-29,-29;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-17,-9,-3,-19,-15,-13,-15,-2,-13,-8,-6,0,-3,-4,2,7,-11,-27,-15,-4;
MA   /M: SY='E'; M=1,-3,-23,-1,11,-21,-14,-6,-16,0,-14,-10,-5,-12,1,-6,-1,-7,-11,-21,-12,6;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-22,-12,-6,-9,-20,-11,-11,7,-13,-5,-1,-16,-3,10,1,6,-7,-21,-4,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-24,-20,-29,-23,13,-29,-20,16,-23,15,9,-20,-20,-22,-19,-14,1,15,-18,3,-23;
MA   /M: SY='P'; M=3,-11,-22,-12,-7,-17,-13,-10,-12,-12,-16,-11,-8,16,-10,-15,4,3,-9,-28,-15,-10;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-19,-17,21,-29,21,-2,-10,0,1,-17,-28,-7,-7,-18,-10,-9,17,62,-16;
MA   /M: SY='A'; M=4,-7,-15,-11,-9,-14,2,-4,-19,-12,-16,-10,-4,-17,-6,-13,3,-1,-13,-21,-8,-8;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-22,17,16,-26,-10,-3,-25,5,-21,-16,14,-13,5,0,0,-6,-24,-32,-17,10;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-9,-26,-9,4,-19,-22,-9,-11,14,-9,0,-7,-15,6,14,-9,-8,-8,-23,-9,4;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-1,-22,0,1,-17,-16,-9,-15,-4,-10,-10,-3,-7,-4,-4,2,2,-11,-28,-13,-2;
MA   /I: I=-5; MD=-27;
MA   /M: SY='E'; M=4,1,-22,2,9,-21,-8,-11,-21,0,-20,-16,0,-10,1,-7,6,0,-16,-15,-14,5; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-29,14,49,-28,-20,-1,-27,10,-18,-17,-1,-3,18,3,-2,-10,-27,-28,-18,34;
MA   /M: SY='E'; M=-1,0,-25,1,15,-26,-17,-7,-21,14,-17,-10,-3,-10,11,9,-3,-7,-16,-24,-14,13;
MA   /M: SY='A'; M=7,-5,-19,-6,1,-19,-11,-12,-9,-7,-10,-8,-7,-14,-2,-9,3,0,-3,-27,-15,-1;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-6,-27,-4,6,-21,-14,-10,-15,-1,-15,-8,-5,8,0,-1,-3,-6,-16,-27,-17,1;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-19,-14,-24,-20,33,-27,21,-10,-20,-3,-2,-12,-28,-19,-13,-17,-13,-11,-1,34,-20;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='R'; M=7,-5,-18,-6,3,-19,-7,-8,-20,8,-17,-11,-1,-11,2,14,5,-1,-12,-22,-14,1; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-16,-30,-9,-1,-21,-16,-16,-13,-9,-19,-13,-16,64,-9,-16,-9,-8,-21,-23,-22,-9; D=-5;
MA   /I: I=-5; MD=-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-12,10,-16,-15,3,-18,-4,-3,-12,-3,-2,-12,-19,-11,-12,-6,-2,-1,-7,14,-14; D=-5;
MA   /I: I=-5; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
MA   /M: SY='F'; M=-8,-8,-14,-10,-5,3,-16,-5,-8,-5,-4,-4,-5,-15,-5,1,-3,-1,-6,-14,2,-5; D=-5;
MA   /I: I=-5; DM=-25;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-17,-28,-15,-8,-5,-17,-13,-13,-13,-18,-12,-14,28,-12,-15,-3,-5,-15,-21,-9,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-9,-16,55,-22,-15,-12,-28,-17,-16,-20,-11,-8,-17,-29,-17,-22,-11,-10,-8,-32,-11,-17;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-17,-34,-11,-3,-27,-10,-18,-20,-9,-26,-18,-16,63,-10,-15,-7,-9,-25,-27,-27,-10; D=-3;
MA   /I: I=-3; MD=-17;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-24,-5,-11,-18,19,-16,-20,-12,-18,-13,-1,-18,-14,-12,0,-10,-13,-23,-18,-13; D=-3;
MA   /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='S'; M=1,-5,-1,-5,-3,-17,-14,-14,-14,-10,-12,-11,-5,-10,-6,-11,6,2,-8,-31,-17,-5; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='N'; M=-5,10,-23,11,4,-25,10,-6,-27,-2,-25,-18,12,-14,-3,-3,6,-5,-21,-29,-20,1; D=-3;
MA   /I: I=-3; DM=-17;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,103,-29,-29,-12,-29,-28,-27,-29,-18,-18,-19,-38,-29,-28,-9,-9,-9,-45,-25,-29;
MA   /M: SY='N'; M=-1,6,-22,0,-4,-23,8,-6,-24,1,-24,-15,15,-16,-4,1,5,-3,-20,-28,-18,-5;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-14,-27,-31,-29,-23,26,-25,-9,-4,-17,-4,-6,-25,-23,-19,-16,-22,-14,-9,48,39,-21; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=7,-8,-19,-12,-3,-18,-15,-5,-10,-4,-11,-5,-6,-14,8,-3,5,4,-7,-22,-8,2;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-26,-8,-16,-28,56,-18,-36,-18,-30,-20,2,-18,-16,-18,8,-12,-26,-24,-28,-16;
MA   /M: SY='S'; M=5,-6,-13,-7,-7,-14,-5,-11,-16,-11,-16,-12,-3,-12,-9,-10,9,1,-9,-28,-14,-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-17,-22,-19,-12,2,-25,-8,5,-14,7,3,-18,-18,-10,-14,-11,-1,2,-10,14,-12;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='K'; M=5,1,-21,1,4,-23,-8,-6,-21,6,-20,-13,1,-6,1,1,4,-3,-14,-26,-15,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='D'; M=-2,8,-21,11,4,-18,-13,-7,-15,-6,-9,-10,2,-13,-1,-8,0,-2,-12,-26,-11,1; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-30,-22,-31,-23,6,-28,-24,19,-26,29,12,-29,-28,-22,-21,-24,-10,15,-4,0,-22;
MA   /I: I=-6; MD=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-13,-25,-13,-9,0,-22,-4,-2,-7,-1,3,-14,-15,-7,-9,-13,-8,-5,-1,15,-10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=1,4,-23,4,6,-26,-3,-4,-24,0,-23,-15,4,-6,2,-3,6,-3,-19,-29,-17,3;
MA   /M: SY='H'; M=-20,-2,-29,-2,-2,-15,-21,94,-28,-11,-18,0,8,-21,7,-1,-11,-19,-28,-28,21,-2;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-26,-15,-30,-22,25,-28,-17,9,-25,23,8,-23,-28,-23,-19,-20,-6,5,-9,13,-22;
MA   /M: SY='M'; M=0,-8,-15,-12,-4,-14,-19,-10,-8,-2,-4,1,-8,-16,-3,-1,-4,1,-5,-24,-9,-4;
MA   /M: SY='A'; M=4,-2,-21,-3,-2,-20,-10,-7,-16,-3,-13,-9,-3,-9,-5,-5,1,0,-10,-27,-14,-5;
MA   /M: SY='E'; M=-4,2,-23,2,6,-23,-8,-6,-21,1,-18,-11,3,-12,5,3,5,4,-17,-28,-15,5;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-29,-1,0,-20,-19,95,-29,-10,-20,0,9,-20,9,-1,-9,-19,-29,-30,18,0;
MA   /M: SY='K'; M=-1,0,-24,-1,3,-23,-7,-5,-22,10,-22,-11,3,-8,1,2,1,-6,-17,-25,-13,1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=42(42); /POSITIVE=39(39); /UNKNOWN=3(3); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=SIAH-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q10L91    , DIS1_ORYSJ , T; Q7ZW16    , RNF41_DANRE, T;
DR   Q9H4P4    , RNF41_HUMAN, T; Q8BH75    , RNF41_MOUSE, T;
DR   Q5R7T5    , RNF41_PONAB, T; P61092    , SIA1A_MOUSE, T;
DR   Q06985    , SIA1B_MOUSE, T; A8X679    , SIAH1_CAEBR, T;
DR   Q965X6    , SIAH1_CAEEL, T; Q7ZVG6    , SIAH1_DANRE, T;
DR   Q8IUQ4    , SIAH1_HUMAN, T; Q920M9    , SIAH1_RAT  , T;
DR   Q7SYL3    , SIAH2_DANRE, T; O43255    , SIAH2_HUMAN, T;
DR   Q06986    , SIAH2_MOUSE, T; Q8R4T2    , SIAH2_RAT  , T;
DR   Q9I8X5    , SIAH2_XENLA, T; Q84K34    , SIL10_ARATH, T;
DR   Q9FM14    , SIL11_ARATH, T; P93748    , SINA1_ARATH, T;
DR   Q9M2P4    , SINA2_ARATH, T; Q84JL3    , SINA3_ARATH, T;
DR   Q9STN8    , SINA4_ARATH, T; Q8S3N1    , SINA5_ARATH, T;
DR   Q8T3Y0    , SINAL_DROME, T; P61093    , SINA_DROER , T;
DR   P21461    , SINA_DROME , T; P29304    , SINA_DROVI , T;
DR   Q8I147    , SINA_DROWI , T; Q86MW9    , SINA_SCHMA , T;
DR   Q9C6H4    , SINL1_ARATH, T; Q9C6H3    , SINL2_ARATH, T;
DR   Q9C6H2    , SINL3_ARATH, T; Q9C9M0    , SINL4_ARATH, T;
DR   Q7XA77    , SINL5_ARATH, T; Q9FKD9    , SINL6_ARATH, T;
DR   Q9FKD7    , SINL7_ARATH, T; Q9FKD6    , SINL8_ARATH, T;
DR   Q9FKD5    , SINL9_ARATH, T;
DR   Q8IW03    , SIAH3_HUMAN, N; Q93WE4    , SINA6_ARATH, N;
DR   Q2TBT8    , RN151_BOVIN, ?; Q2KHN1    , RN151_HUMAN, ?;
DR   Q9CQ29    , RN151_MOUSE, ?;
3D   1K2F; 2A25; 2AN6; 4C9Z; 4CA1; 4I7B; 4I7C; 4I7D; 4X3G; 5H9M; 5WZZ; 8HEO;
PR   PRU00455;
DO   PDOC51081;
//