ID   ZF_HIT; MATRIX.
AC   PS51083;
DT   01-FEB-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger HIT-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5706942; R2=0.0090412; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=833.5309448; R2=2.8289084; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=656; H_SCORE=2689; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=435; H_SCORE=2064; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-10; D=-30; I=-30; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='S'; M=2,-8,-16,-7,-1,-19,-2,-11,-17,-6,-19,-12,-4,-16,-5,-12,7,-6,-13,-25,-15,-2;
MA   /M: SY='I'; M=-3,-28,-10,-28,-22,-4,-32,-27,27,-23,12,8,-27,-24,-22,-26,-16,-3,27,-27,-10,-22;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-25,-11,-8,-23,8,-9,-24,-5,-21,-14,0,-16,-5,-7,0,-9,-19,-24,-18,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-4,-23,-7,1,-21,-8,-10,-18,3,-18,-11,1,-16,0,-6,1,-5,-12,-27,-16,0;
MA   /I: I=-9; MD=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-9,5,-21,0,5,-17,-9,1,-19,3,-18,-11,13,-13,5,-2,3,-5,-16,-21,-7,4; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-5,-20,-1,6,-23,-18,-13,-19,-1,-19,-12,-7,-1,-1,-9,0,-3,-13,-29,-19,4;
MA   /M: SY='S'; M=4,-10,-15,-11,-7,-14,-6,-6,-19,-6,-18,-12,-4,-11,-6,-9,13,-1,-17,-20,-11,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-6,-24,-13,0,-23,-21,-10,-19,21,-13,-7,-3,-14,3,7,-4,-10,-14,-27,-15,1;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-27,-18,-27,-18,23,-26,16,-11,-28,-11,-10,-17,-27,-9,-19,-13,-16,-11,13,58,-18;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-2,-23,-10,1,-26,-16,-8,-23,18,-18,-11,6,-13,3,14,5,5,-18,-29,-20,1;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-30,82,-30,-39,-14,-30,-29,-9,-30,-9,-9,-30,-31,-30,-30,-11,-11,-10,-18,-16,-30;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-19,-20,-13,-12,-31,-21,-21,-18,-11,-20,-13,-17,38,-11,-19,-7,2,-8,-34,-25,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-9,-14,-16,-6,-22,-13,-9,-21,9,-16,-10,-2,-18,-1,12,-1,-6,-18,-27,-17,-5;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-2,-26,-3,-3,-20,5,-8,-25,-8,-23,-15,4,-16,-4,-9,2,-10,-21,-23,-15,-4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-15,-14,-14,-9,-13,-21,-19,1,-10,-1,0,-14,-18,-10,-13,-5,-3,3,-27,-15,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-16,-22,-21,-8,-16,-25,-9,-16,8,-8,-3,-10,-13,0,9,-10,-11,-15,-22,-8,-7;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-24,-16,-24,-18,15,-26,1,-5,-18,-7,-7,-16,-25,-13,-19,-10,-1,-4,1,31,-18;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='S'; M=8,-3,-3,-3,-4,-20,-2,-12,-19,-4,-19,-11,6,-12,-4,-12,33,10,-18,-28,-20,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-35,-8,-35,-27,-3,-36,-29,23,-21,27,15,-29,-27,-31,-24,-18,-7,19,-24,-10,-26;
MA   /M: SY='K'; M=3,-8,-22,-9,4,-26,-12,-12,-19,5,-19,-12,-7,-6,0,2,0,-6,-12,-31,-20,2;
MA   /M: SY='C'; M=0,-30,90,-30,-40,-20,-30,-30,-10,-30,-10,-10,-30,-30,-30,-30,-10,-10,-10,-20,-20,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-19,-18,-21,-15,10,-22,0,-8,-14,-8,-5,-10,-25,-9,-15,-7,-9,-9,-4,22,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-29,-7,7,-28,-16,-7,-27,26,-20,-10,4,-13,10,15,-1,-7,-20,-29,-19,7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; I=-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-7,-40,-7,-7;
MA   /M: SY='K'; M=-7,-12,-19,-16,-6,-18,-24,-16,-5,4,-3,-2,-7,-17,-4,-3,-3,2,-2,-27,-16,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,-10,0,-10,-20,80,-30,-10,-30,-20,10,-20,0,0,-10,-20,-30,-20,20,0;
MA   /M: SY='K'; M=-10,5,-27,-2,8,-27,-14,-6,-25,22,-21,-11,10,-13,9,7,4,-6,-19,-31,-19,8;
MA   /I: I=-6; MD=-22;
MA   /M: SY='E'; M=-6,5,-26,11,18,-24,-17,-8,-21,3,-22,-15,-1,-12,6,-3,2,-2,-16,-29,-19,13; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-22;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-4,-17,-4,2,-19,-17,-11,-13,-1,-10,-5,-1,-12,5,-2,3,8,-9,-21,-15,2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MD=-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-7,-19,-7,0,-16,-16,-7,-15,2,-11,-8,-4,-9,0,7,-4,-1,-12,-21,-13,-1; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='C'; M=0,-28,79,-28,-36,-20,-28,10,-11,-28,-11,-10,-27,-28,-28,-28,-9,-9,-10,-20,-18,-28;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=22(22); /POSITIVE=22(22); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=7; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=HIT-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9NWK9    , BCD1_HUMAN , T; Q3UFB2    , BCD1_MOUSE , T;
DR   Q5RF97    , BCD1_PONAB , T; O74906    , BCD1_SCHPO , T;
DR   P38772    , BCD1_YEAST , T; P46973    , HIT1_YEAST , T;
DR   Q9FHW2    , SWC6_ARATH , T; O59669    , VPS71_SCHPO, T;
DR   Q03433    , VPS71_YEAST, T; O36031    , YEKJ_SCHPO , T;
DR   Q24JY4    , ZNHI1_BOVIN, T; Q54NW0    , ZNHI1_DICDI, T;
DR   O43257    , ZNHI1_HUMAN, T; Q8R331    , ZNHI1_MOUSE, T;
DR   Q2TBW5    , ZNHI2_BOVIN, T; Q9UHR6    , ZNHI2_HUMAN, T;
DR   Q9QY66    , ZNHI2_MOUSE, T; Q2KIH1    , ZNHI3_BOVIN, T;
DR   Q15649    , ZNHI3_HUMAN, T; Q6UIM1    , ZNHI3_MACMU, T;
DR   Q9CQK1    , ZNHI3_MOUSE, T; Q6UIM2    , ZNHI3_PANTR, T;
DR   Q5T1V6    , DDX59_HUMAN, N; Q9DBN9    , DDX59_MOUSE, N;
DR   Q66HG7    , DDX59_RAT  , N; Q9C086    , IN80B_HUMAN, N;
DR   Q99PT3    , IN80B_MOUSE, N; Q3EBD3    , RH41_ARATH , N;
DR   Q0E2Z7    , RH41_ORYSJ , N;
3D   1X4S; 2N94; 2N95; 2YQQ; 6GEJ; 6GEN;
PR   PRU00453;
DO   PDOC51083;
//