Entry: PS51087

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] APAG
Accession [info] PS51087
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51087
Associated ProRule [info] PRU00412

Name and characterization of the entry

Description [info] ApaG domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=125;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=120;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1620402; R2=0.0129421; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-2921.75461; R2=43.95188; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=9.0; H_SCORE=20285; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=336; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11802; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M= -7, -6,-21,-10, -7,-15,-16, -8,-10,  4,-13,  1, -1, -8, -2,  8,  0,  3, -6,-28,-12, -6;
/M: SY='A'; M=  7, -2,-17, -7, -4,-14,-16,-15, -4,-11, -4, -6, -3,-14, -9,-14,  2,  7,  0,-27,-13, -7;
/M: SY='T'; M= -3, -4,-19, -7, -5,-15,-16,-15,-12, -7,-12,-10, -1,  3, -7, -9,  9, 16,-10,-31,-15, -7;
/M: SY='T'; M= -2, -2,-18, -5, -6,-16,-16,-16,-10, -9,-16,-11,  0, -4, -6, -7, 15, 22, -5,-32,-14, -8;
/M: SY='P'; M= -9, -3,-29, -2,  1,-17, -7, -4,-21, -4,-24,-16,  2, 14, -4, -5, -1, -7,-24,-22, -8, -4;
/M: SY='D'; M=-15, 24,-26, 30,  9,-21,-13, -2,-29,  4,-24,-19, 15,-14,  2,  2,  0, -7,-24,-30,-12,  5;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-37,-29, 10,-36,-28, 38,-28, 19, 16,-23,-24,-24,-26,-19, -8, 29,-18,  2,-29;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-12,  3, 15,-24,-20, -7,-24,  4,-18,-14,  0,-11,  9,  8,  3,  7,-18,-29,-15, 11;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='T'; M=  7, -2,-13, -6, -1,-18,-12,-13,-13, -8,-17,-12,  0,-11,  0, -9, 21, 22, -4,-32,-15,  0;
/M: SY='V'; M=  5,-28,-12,-30,-28, -2,-27,-29, 27,-20,  9,  9,-27,-27,-27,-21, -9, -1, 42,-28,-10,-28;
/M: SY='Q'; M= -5, -8,-22, -9,  1,-18,-20,-11, -6,  1, -9, -3, -6,-14,  7, -2,  1,  1, -5,-26,-10,  4;
/M: SY='P'; M= -2,-14,-21,-13, -9,-17,-19,-20, -7,-12,-17,-11,-12, 23,-13,-16,  6, 12, -2,-32,-19,-13;
/M: SY='R'; M=-11,-16,-22,-19,-10,  4,-24, -4, -3, -7, -5, -2,-10,-21,-10,  5, -7, -6,  2,-20,  0,-12;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-20, 35,-29, 20, -3,-14,  0,  0,-17,-29,-14,-11,-19,-11,-10, 20, 64,-20;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-21,-33,-25,  4,-31,-22, 30,-26, 31, 22,-26,-26,-20,-21,-22, -8, 23,-22, -2,-23;
/M: SY='P'; M=-10, -1,-34,  8, 20,-31, -9,-11,-28,  1,-27,-20, -6, 32,  1, -9, -5,-11,-29,-29,-24,  9;
/M: SY='E'; M=  2,  0,-23,  2, 24,-24,-14,  5,-19,  0,-15, -6, -2, -8, 12, -5,  3, -6,-18,-28,-14, 17;
/M: SY='Q'; M=-11, -3,-29, -2, 18,-32,-21,  5,-18,  8,-13, -1, -3,-12, 42, 12, -4,-10,-25,-21,-10, 30;
/M: SY='S'; M=  8,  1,-12,  2,  7,-21, -2, -9,-21, -8,-29,-20,  9, -9,  2, -9, 36, 17,-12,-39,-20,  4;
/M: SY='S'; M= -1, 10,-20,  9, -1,-21,-11, -9,-16, -4,-19,-15,  9,-13, -3, -3, 11,  5,-11,-32,-16, -3;
/M: SY='P'; M=-10,-18,-35,-11, -1,-27,-21,-16,-16, -5,-24,-14,-17, 57, -3, -9, -9, -9,-21,-28,-24, -6;
/M: SY='D'; M=-12, 18,-26, 20, 17,-23,-13, 14,-25,  0,-23,-16, 16,-13, 10, -3,  2, -7,-26,-27, -4, 12;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='E'; M= -8, 14,-24, 18, 23,-27,-11, -1,-24,  2,-23,-18, 11,  3, 10, -4,  5, -4,-25,-30,-18, 16; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -7,  5,-26,  7,  8,-26,  5,  6,-26, -5,-24,-15,  8, -2,  4, -7,  2, -9,-26,-27,-16,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-15,-12,-12,-13, -6,-14,-23,  6,-19,  9,-15, -6, -7,-23,  3, 25,-10,-10,-12,-20,  1, -5;
/M: SY='Y'; M=-19,-16,-29,-17,-14, 21,-28, 25, -5, -9, -4,  0,-15,-27, -3, -8,-17,-11,-14, 17, 61,-12;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-33,-27, 19,-27,-25, 14,-23, 12,  5,-27,-29,-28,-20,-17, -7, 20,  1,  4,-26;
/M: SY='F'; M=-20,-33,-29,-40,-30, 60,-27,-23, -6,-27,  1, -6,-26,-30,-34,-20,-26,-16, -9, 51, 30,-27;
/M: SY='A'; M= 24, -9,-15,-17,-10,-18, -1,-15,-12, -6,-11, -4, -7,-13, -7, -7,  7,  3, -4,-22,-16, -9;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T'; M= -9, -3, -4,-11, -9, -7,-20,-13,-18,  1,-15,-11,  2,-18, -8,  6,  3, 15,-10,-26, -9, -9;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30,  0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-20,-10, -5,-15,-21,-12,-17, 11,-15, -9, -2,-15, -2, 24,  3, 17, -6,-25,-10, -5;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-38,-29,  1,-38,-29, 45,-29, 23, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 29,-21, -1,-29;
/M: SY='E'; M= -8, -2,-25, -1, 15,-18,-21, -5,-16,  6,-15,-10, -2,-10,  8,  4,  2,  4,-15,-22, -5, 10;
/M: SY='N'; M=-10, 34,-20, 15, -2,-18, -2,  9,-16, -1,-25,-12, 52,-20,  0, -1,  7, -1,-26,-38,-18, -1;
/M: SY='T'; M= -1,  1,-17, -7, -7,-11,-14,-11, -8, -6, -4, -6,  7,-18, -7, -7,  3,  8, -8,-29,-12, -7;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-24,  2, -8,-27, 31,-15,-32, -8,-28,-19,  4,-15,-10,-11,  8, -4,-22,-27,-23, -9;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M= -3,  9,-22, 11, 13,-27, -3, -3,-26,  0,-26,-18, 11,-11,  9,  0, 15,  2,-22,-33,-19, 11;
/M: SY='D'; M= -3,  3,-20,  5, -2,-20,-17, -3,-13, -4,-12, -8, -2,-16, -2, -7,  2,  2, -5,-30,-11, -3;
/M: SY='P'; M= 10,-13,-21,-13, -7,-20,-13,-19,-11,-11,-19,-13,-11, 25,-10,-17,  7,  5, -7,-29,-22,-10;
/M: SY='A'; M= 17,-21, -3,-28,-21,-10,-17,-26,  4,-18, -4, -4,-20,-21,-19,-22, -5, -5, 12, -9,-11,-20;
/M: SY='Q'; M=-12, -2,-30, -2, 14,-34,-20,  4,-24, 23,-22, -4,  0,-12, 40, 25, -4,-10,-26,-20,-10, 26;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-16,-24,-16,-11, -5,-27,-15, 11,-15, 18, 13,-17,-22,-10, -8,-18, -9,  6,-23, -5,-12;
/M: SY='S'; M=  9,  2,-15,  0,  3,-21,  2,-10,-21, -8,-26,-18,  9,-10, -1,-10, 26, 12,-14,-35,-20,  1;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H'; M=-20, -5,-30, -5, -5, -7,-23, 80,-22,-10,-15,  0,  2,-23,  5, -3,-13,-17,-25,-15, 35, -5;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-23,-16, -8,-13,-24,-10,  1, -4,  0,  3, -7,-20,  3,  6, -8, -2, -1,-24, -8, -4;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='T'; M= -3, -6,-13,-16,-14,  1,-23,-21, -2,-14, -5, -6, -4,-13,-14,-13, 11, 37,  3,-25, -5,-14;
/M: SY='D'; M=-11, 37,-23, 43, 11,-31, -5,  0,-31, -2,-30,-25, 28,-13,  0, -7, 11, -1,-26,-40,-20,  5;
/M: SY='G'; M= 15,-13,-21,-16,-13,-16, 16,-13,-16,-14,-10, -8, -9,-18, -9,-17, -2,-10,-12,-15,-10,-12;
/M: SY='N'; M=-10, 18,-24, 16,  8,-23,-11, -2,-22,  7,-20,-15, 20,-15,  1,  1,  2, -4,-21,-33,-16,  5;
/M: SY='G'; M= -1, -8,-30, -7,-13,-30, 62,-18,-39,-17,-29,-20,  0,-18,-17,-18,  0,-19,-30,-21,-29,-15;
/M: SY='K'; M=-12,  4,-28,  6, 13,-29,-19, -4,-27, 25,-24,-11,  2,-11, 16, 23, -3, -3,-21,-24,-12, 14;
/M: SY='V'; M= -4,-18,-17,-18,-11, -9,-26,-20,  9, -7,  3,  4,-19,-22,-10, -9, -8, -1, 20,-27,-10,-10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-25, 12, 29,-17,-17, -2,-24,  1,-19,-16,  7, -8, 10, -3,  3, -2,-23,-28,-13, 20;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-26, 10, 38,-20,-21, -2,-23,  4,-16,-16, -2, -5, 11, -3,  2,  2,-22,-25, -9, 24;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30,  0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30;
/M: SY='R'; M= -6, -4,-25, -6,  8,-24,-18, -3,-22, 12,-17, -8, -1,-13, 18, 25,  1,  1,-18,-23,-12, 11;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -2,-11,-27, -7, 10,-21,-19,-13,-14, -3,-12,-11,-13, 17, -3, -5, -6, -8,-13,-27,-19,  2;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-27,  4, 31,-23,-22, -3,-18,  5,-10, -9, -6,-10, 16,  5, -5, -9,-18,-26,-14, 23;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-28, -3, 17,-25,-21,  4,-18,  5,-16, -3, -2,-11, 41,  5, -1, -6,-25,-19, -7, 30;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='V'; M= -9,-16,-21,-19,-14, -6,-25,-17,  6, -5,  8,  5,-12,-23,-12,  2,-13, -3,  9,-24, -7,-14;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='S'; M= 10, -1,-20, -2,  2,-25, -8, -9,-21,  3,-23,-14,  0, -4,  6,  1, 11,  1,-14,-28,-18,  3;
/M: SY='P'; M= -8,-16,-36, -8,  1,-29,-18,-18,-21, -3,-30,-19,-15, 68, -7,-13, -5, -7,-27,-30,-27, -7;
/M: SY='G'; M= -2, -4,-29, -5,-10,-29, 55,-16,-38,-15,-29,-20,  4,-18,-14,-16,  1,-18,-30,-22,-28,-12;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-27,  9, 27,-30,-17,  0,-24,  8,-19,-12,  0, -7, 24,  7,  1, -5,-24,-26,-15, 25;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T'; M=  7, -6,-15, -9,  2,-17,-17,-15, -7, -7,-10, -7, -7,-12, -1,-10,  8, 12,  2,-28,-14,  0;
/M: SY='F'; M=-20,-24,-25,-29,-24, 52,-29,  6, -2,-20,  4,  0,-18,-29,-24,-14,-19,-11, -6, 16, 50,-24;
/M: SY='E'; M= -9,  3,-27,  5, 27,-28,-20, -2,-24, 13,-19,-11,  0, -7, 23, 10,  1,  0,-23,-25,-14, 25;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T'; M= -1, 10,-13,  5, -3,-17,-12,-12,-17, -8,-19,-16, 11,-11, -5, -9, 22, 31, -9,-35,-15, -4;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  1,-12,-12,-15,-19,-16, 32, -8,-30,-20,-22,-15, -4,-22,-19,-19, -3,-16,-22,-21,-17,-19;
/M: SY='C'; M=  5,-16, 25,-23,-21,-11,-23,-26, -3,-18, -7, -7,-16,-24,-21,-20,  1, 11, 12,-34,-17,-21;
/M: SY='P'; M= -5,-17,-22,-17,-13, -9,-23,-18,  1,-14,-10, -6,-15, 10,-14,-17,  0,  8,  4,-24, -6,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24, 15,-32,-23, 24,-29, 37, 17,-27,-28,-23,-22,-25, -9, 16,-18,  2,-24;
/M: SY='D'; M= -7, 15,-24, 18,  9,-28, -4, -5,-26, -4,-26,-19, 11, -3,  4, -8,  9,  2,-23,-33,-20,  6;
/M: SY='T'; M= 10, -5,-10,-14,-12,-11,-17,-21, -6,-11, -8, -8, -5,-12,-12,-13, 15, 34,  5,-28,-12,-12;
/M: SY='P'; M= -5,-11,-27, -7,  2,-21,-17,-15,-17, -7,-18,-14, -9, 30, -5, -8,  3,  3,-18,-31,-20, -3;
/M: SY='S'; M= -1,-11,-18,-13, -8, -9,-16,-15, -5,-14,-11, -7, -6, -5, -5,-13, 11,  9, -3,-29,-12, -7;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='T'; M= -8,-10,-22,-15,-10, -9,-23,  0, -2, -8, -8, -1, -5,-17, -2, -3,  1,  7, -1,-21,  3, -8;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='Q'; M=-12,-10,-29, -9,  9,-13,-23, -3,-14,  1,-13, -6,-11,-16, 17,  3, -9,-11,-16,  1,  1, 13;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='H'; M=-12, -3,-23, -6, -4,-13,-20, 29,-21,  1,-17, -6,  2,-17,  2,  7,  0,  4,-17,-22,  9, -4;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 35,-30, 16,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 75,-21;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='H'; M=-13, -2,-27,  1,  8,-14,-15, 13,-21, -2,-15, -8, -2,-16,  6,  3, -6,-12,-18,-23, -4,  6;
/M: SY='F'; M=-14,-24, -8,-34,-25, 33,-25,-11,  7,-20, 12, 27,-20,-26,-20,-16,-19,-10,  4,-10, 10,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-20,-21,-20,-10, -1,-18,-18,  9,-17, 11,  8,-19,-22,-15,-16,-14, -8, 10,-22, -7,-12;
/M: SY='B'; M=  0,  7,-23,  6, -5,-20,  5, -6,-24, -5,-21,-16,  7,-16, -6, -4,  4, -3,-18,-23,-10, -7;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-28, 15, 31,-20,-17, -6,-26,  0,-19,-19, -2,  4,  4, -8, -2, -9,-24,-27,-16, 18;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-27, 22, 14,-25,-10, -4,-28,  3,-27,-22, 13,-12,  3, -3,  4, -5,-25,-17,-14,  9;
/M: SY='G'; M= -1, -3,-28, -1,-14,-30, 54,-17,-38,-17,-30,-21,  3,-18,-16,-18,  4,-15,-28,-24,-28,-15;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-24, -2, 14,-23,-20,-10,-15, 11,-17, -9, -3,-10,  9,  3,  1,  0,-11,-26,-13, 11;
/M: SY='H'; M= -8,-12,-24,-11, -3,-15,-22,  4, -7,-10, -9, -5, -8,  0, -5, -7, -3, -1, -6,-29, -8, -7;
/M: SY='F'; M=-13,-28,-19,-38,-28, 70,-27,-20, -1,-28,  8, -1,-19,-28,-37,-20,-17, -9,  0,  7, 25,-28;
/M: SY='D'; M= -8, 21,-23, 24, 18,-28,-10, -1,-26,  0,-25,-20, 17,-10,  9, -4, 11,  3,-23,-35,-18, 13;
/M: SY='V'; M= 11,-25,-12,-29,-25, -5,-24,-28, 22,-19,  6,  6,-25,-25,-25,-21, -6, -1, 37,-27,-11,-25;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-27,  3,  8,-22,-18,-10,-15, -2,-14, -7, -5,  7,  0, -4, -4, -4,-15,-28,-16,  2;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30;
/M: SY='P'; M=  5,-16,-32,-12, -2,-28,-15,-19,-18, -6,-25,-17,-16, 59, -9,-17, -5, -8,-22,-27,-26, -9;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-32, -6,  9,-26,-19,-15,-18, -3,-22,-16,-14, 44, -4, -7, -7, -8,-20,-28,-24, -1;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-22,-11, -7,-10,-17,  5,-14,  0,-12, -6, -4,-20, -1, 15,  2, -1, -8,-22,  1, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-18, 20,-28, 47, 24,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='A'; M= 13,  8,-20,  9,  5,-24,-10,-12,-15, -7,-15,-14,  0,-10, -4,-15,  5, -3, -9,-29,-18,  0;
/M: SY='V'; M=  6,-15,  0,-20,-17,-11,-17,-20,  3,-16, -6,  0,-11,-20,-14,-18,  7,  6, 12,-32,-14,-16;
/M: SY='P'; M= -4,-12,-35, -8, -1,-28,-16,-17,-19, -9,-28,-19,-10, 68, -9,-18, -6, -8,-27,-30,-28, -9;
/M: SY='R'; M= -9,-11,-26,-12, -9,-14, -3,-11,-19, -1,-12, -9, -8, -8, -8,  4, -6, -1,-15,-17, -5,-10;
/M: SY='L'; M=  2,-10,-20,-14,-14, -2,-12,-19, -2,-19,  4, -2,-11,-19,-16,-18, -5,  1, -1,-21, -8,-15;
/M: SY='L'; M=-11,-16,-25,-15,  1, -6,-27,-14,  2, -7, 17,  5,-17,-20, -5, -2,-19,-10, -3,-22, -6, -3;
/M: SY='H'; M=-15, -5,-26, -6, -3,-18,-21, 45,-22,  2,-17, -3,  2,-19,  4, 12, -7, -8,-16,-27,  5, -3;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 190 in 190 different sequences
Number of true positive hits 190 in 190 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] ApaG
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
190 sequences

APAG_ACIF2  (B7J8G8), APAG_ACIF5  (B5ENR7), APAG_ACISJ  (A1W2Y8), 
APAG_AGRT5  (Q8UI68), APAG_AGRVS  (B9JQX3), APAG_ANAD2  (B8JAJ1), 
APAG_ANADE  (Q2IGT4), APAG_ANASK  (B4UHA8), APAG_AROAE  (Q5P714), 
APAG_AZOC5  (A8ILE7), APAG_AZOSB  (A1K3W2), APAG_AZOVD  (C1DIX0), 
APAG_BDEBA  (Q6MK56), APAG_BEII9  (B2III9), APAG_BORBR  (Q7WEL1), 
APAG_BORPA  (Q7W393), APAG_BORPE  (Q7VU61), APAG_BRADU  (Q89VE6), 
APAG_BRASB  (A5EA34), APAG_BRASO  (A4Z2J6), APAG_BRUA1  (B2S946), 
APAG_BRUA2  (Q2YPH0), APAG_BRUAB  (Q57F54), APAG_BRUC2  (A9M7Z1), 
APAG_BRUMB  (C0RH21), APAG_BRUME  (Q8YFA4), APAG_BRUSI  (B0CJT2), 
APAG_BRUSU  (Q8G2L5), APAG_CAUCR  (Q9A655), APAG_CHRSD  (Q1QZ30), 
APAG_CHRVO  (Q7NW07), APAG_CITK8  (A8ALQ0), APAG_CROS8  (A7MIB1), 
APAG_DECAR  (Q47AB8), APAG_DEIRA  (Q9RXS8), APAG_ECO24  (A7ZHE3), 
APAG_ECO27  (B7UI98), APAG_ECO45  (B7MAH5), APAG_ECO55  (B7L4H3), 
APAG_ECO57  (P62674), APAG_ECO5E  (B5YZ88), APAG_ECO7I  (B7NHF6), 
APAG_ECO81  (B7MNQ9), APAG_ECO8A  (B7M0E7), APAG_ECOBW  (C4ZPX6), 
APAG_ECODH  (B1XC51), APAG_ECOHS  (A7ZW02), APAG_ECOK1  (A1A799), 
APAG_ECOL5  (Q0TLT7), APAG_ECOL6  (P62673), APAG_ECOLC  (B1IRC6), 
APAG_ECOLI  (P62672), APAG_ECOLU  (B7N7S5), APAG_ECOSE  (B6HZ31), 
APAG_ECOSM  (B1LFY6), APAG_ECOUT  (Q1RGE7), APAG_EDWI9  (C5B7P0), 
APAG_ENT38  (A4W6F6), APAG_ERWT9  (B2VGP5), APAG_ESCF3  (B7LVU4), 
APAG_KLEP3  (B5Y1Z5), APAG_MAGSA  (Q2VZE7), APAG_MARMM  (Q0ASF3), 
APAG_METC4  (B7L060), APAG_METCA  (Q60C69), APAG_METEP  (A9VZN6), 
APAG_METFK  (Q1GXY8), APAG_METNO  (B8IN72), APAG_METPB  (B1ZJ42), 
APAG_METRJ  (B1LXV0), APAG_METS4  (B0UC46), APAG_METSB  (B8ELJ0), 
APAG_NITEC  (Q0AHS7), APAG_NITEU  (Q82UC1), APAG_NITMU  (Q2Y6G0), 
APAG_OCHA4  (A6WVX4), APAG_OLICO  (B6JD70), APAG_PARL1  (A7HQ48), 
APAG_PECAS  (Q6D0D9), APAG_PECCP  (C6DEY7), APAG_PHOLL  (Q7N8V8), 
APAG_PHOPR  (Q6LV42), APAG_PROMH  (B4F2I3), APAG_PSEA7  (A6UZ95), 
APAG_PSEA8  (B7V4H7), APAG_PSEAB  (Q02TH2), APAG_PSEAE  (Q9I5U6), 
APAG_PSEE4  (Q1IG21), APAG_PSEF5  (Q4K4X4), APAG_PSEFS  (C3K328), 
APAG_PSEMY  (A4XZJ5), APAG_PSEP1  (A5VXJ4), APAG_PSEPF  (Q3K5T1), 
APAG_PSEPG  (B0KJ92), APAG_PSEPK  (Q88QT7), APAG_PSEPW  (B1JE08), 
APAG_PSESM  (Q88A47), APAG_RALSO  (Q8XVF3), APAG_RHIE6  (B3PNM4), 
APAG_RHIEC  (Q2KCU6), APAG_RHILO  (Q98BB4), APAG_RHILW  (B5ZNW9), 
APAG_RHIME  (Q92S97), APAG_RHISN  (C3MFB9), APAG_RHOCS  (B6IPQ9), 
APAG_RHOPA  (Q6N0J2), APAG_RHOPT  (B3QCE1), APAG_SALA4  (B5F770), 
APAG_SALAR  (A9MQG3), APAG_SALCH  (Q57TH1), APAG_SALDC  (B5FI33), 
APAG_SALEP  (B5R1S7), APAG_SALG2  (B5RGC1), APAG_SALHS  (B4TJ46), 
APAG_SALNS  (B4T6L5), APAG_SALPA  (Q5PDE0), APAG_SALPB  (A9MYM3), 
APAG_SALPK  (B5BL26), APAG_SALSV  (B4TWT5), APAG_SALTI  (Q8Z9J8), 
APAG_SALTY  (Q56017), APAG_SERP5  (A8G9N9), APAG_SHEB2  (B8EB36), 
APAG_SHEB5  (A3D187), APAG_SHEB8  (A6WK58), APAG_SHEB9  (A9L437), 
APAG_SHEDO  (Q12K58), APAG_SHEFN  (Q07YJ7), APAG_SHEHH  (B0TV51), 
APAG_SHELP  (A3QBA2), APAG_SHEON  (Q8EB92), APAG_SHEPA  (A8H0V1), 
APAG_SHEPC  (A4Y434), APAG_SHEPW  (B8CSX6), APAG_SHESA  (A0L065), 
APAG_SHESH  (A8FRV1), APAG_SHESM  (Q0HLT3), APAG_SHESR  (Q0HS05), 
APAG_SHESW  (A1RMU9), APAG_SHEWM  (B1KGH8), APAG_SHIB3  (B2U258), 
APAG_SHIBS  (Q326I3), APAG_SHIDS  (Q32K44), APAG_SHIF8  (Q0T8E5), 
APAG_SHIFL  (P62675), APAG_SHISS  (Q3Z5V9), APAG_SINMW  (A6U5R0), 
APAG_SODGM  (Q2NVX7), APAG_STRMK  (B2FPG4), APAG_THIDA  (Q3SGR3), 
APAG_VIBC3  (A5F8N1), APAG_VIBCB  (A7MWC5), APAG_VIBCH  (Q9KUS3), 
APAG_VIBCM  (C3LRH3), APAG_VIBPA  (Q87ST7), APAG_VIBTL  (B7VIE1), 
APAG_VIBVU  (Q8DED1), APAG_VIBVY  (Q7MP87), APAG_WOLPM  (Q73G26), 
APAG_WOLWR  (C0R462), APAG_XANAC  (Q8PP26), APAG_XANC5  (Q3BX83), 
APAG_XANC8  (Q4UR38), APAG_XANCB  (B0RUI4), APAG_XANCP  (Q8PCE4), 
APAG_XANOM  (Q2NZI3), APAG_XANOP  (B2SPT2), APAG_XANOR  (Q5GWB8), 
APAG_XANP2  (A7ICI5), APAG_XYLF2  (B2I5R5), APAG_XYLFA  (Q9PBJ5), 
APAG_XYLFM  (B0U354), APAG_XYLFT  (Q87C84), APAG_YERE8  (A1JJF3), 
APAG_YERP3  (A7FMC2), APAG_YERPA  (Q1C0H6), APAG_YERPB  (B2K486), 
APAG_YERPE  (Q8ZIK6), APAG_YERPG  (A9QZZ1), APAG_YERPN  (Q1CMT3), 
APAG_YERPP  (A4TQD9), APAG_YERPS  (Q66EQ9), APAG_YERPY  (B1JKY4), 
FBX3_BOVIN  (A6H7H7), FBX3_HUMAN  (Q9UK99), FBX3_MOUSE  (Q9DC63), 
FBX3_RAT    (D4ABP9), PDIP2_HUMAN (Q9Y2S7), PDIP2_MOUSE (Q91VA6), 
SKI16_ARATH (Q9LND7)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission