Entry: PS51089

General information about the entry

Entry name [info] HP
Accession [info] PS51089
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51089
Associated ProRule [info] PRU00595

Name and characterization of the entry

Description [info] Headpiece (HP) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=66;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=61;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8546170; R2=0.0116594; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=480.57922; R2=21.89870; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=570; N_SCORE=10.0; H_SCORE=13904; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=399; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9196; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-22, -1,  4,-13,-17, -6,-13, -4,-10, -4, -4,-11,  0, -5,  0, -1,-10,-26, -9,  2;
/M: SY='E'; M= -7, -6,-21, -5,  2,-13,-17,-10,-10, -7, -4, -5, -7, -9, -5, -8, -5, -1,-11,-23, -7, -2;
/M:         M= -6, -8,-16, -7,  0,-21, -5,-15,-17, -7,-17,-12, -5, -4, -7, -7, -1, -6,-14,-29,-19, -5;
/M:         M= -6, -4,-17, -8, -4,-14,-14, -3,-15, -4,-11, -8,  0,-12,  0, -2, -3, -2,-15,-23, -5, -3;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-26, -6,  4,-25,-14,-11,-19, 11,-19, -9, -4, -1,  7,  5, -2,  1,-16,-24,-14,  4;
/M: SY='T'; M= -5,-13,-23,-19,-12, -6,-22,-17,  3,-10, -4, -1,-10,-16, -9,-10, -3,  7,  2,-16, -2,-12;
/M: SY='Y'; M=-19,-23,-27,-26,-22, 40,-30,  6,  1,-17,  5,  1,-20,-27,-19,-14,-20,-10, -6, 17, 55,-22;
/M: SY='P'; M= -7,-10,-31, -4,  0,-26,-17,-17,-20, -8,-27,-19,-10, 53, -7,-13,  1,  3,-23,-31,-24, -7;
/M: SY='Y'; M=-12,-22,-24,-22,-17, 14,-27,  0,  4,-13, 15,  5,-21,-28,-12, -7,-19, -9, -2,  2, 34,-17;
/M: SY='E'; M= -4, 11,-25, 19, 35,-28,-15, -1,-27,  2,-19,-18,  2, -5, 10, -5,  3, -5,-23,-31,-18, 22;
/M: SY='R'; M=-10,-11,-23,-11,  2,-11,-23, -7, -5,  0, -3,  5,-11,-18,  5,  6, -9, -8, -3,-23, -8,  3;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 48, 20,-30,-30,-20,-20,-29,-10, 12,-20,  0,-20;
/M: SY='M'; M= -8,-14,-23,-19,-11,-11,-25,-14,  4,  1,  3,  9,-11,-19, -4,  2,-13, -6,  4,-22, -6, -9;
/M: SY='T'; M=  2, -2,-19, -7, -3,-18,-14, -5,-10, -3,-13, -7,  1,-15, -1, -5,  4,  6, -5,-27,-12, -2;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='K'; M= -8,  3,-23,  3,  4,-23,-15, -9,-22, 13,-20,-12,  1, -9,  5, 12,  2,  7,-15,-26,-12,  4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='S'; M=  5,  1,-18, -4, -3,-19, -8,-10,-14, -7,-20,-12,  6,  6, -2,-10, 12, 10,-13,-30,-18, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='S'; M= -1,  1,-16,  0,  1,-14,-11, -6,-11, -1,-12, -9,  2, -9, -1,  0,  4,  2, -8,-21, -9, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='D'; M= -7, 10,-19, 12, 11,-19, -2, -1,-18,  2,-16,-10,  9, -8,  4,  0, -1, -7,-17,-21,-13,  7; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-26,-24,-14, -3,-27,-19,  8,-20, 24,  8,-25,  0,-15,-15,-23,-10, -1,-22, -8,-16;
/M: SY='P'; M= -5,-22,-32,-15, -7,-23,-21,-22, -9,-13,-19,-13,-22, 58,-14,-20,-10, -8,-12,-29,-25,-14;
/M: SY='E'; M=  0, -1,-24,  0, 13,-20,-15,-10,-21,  2,-20,-15, -1,  6,  1, -3,  4,  2,-18,-27,-17,  6;
/M: SY='G'; M= -7, 12,-29, 18,  0,-32, 34,-11,-38,-11,-29,-23,  9,-15, -9,-14,  2,-14,-29,-28,-25, -5;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-29, 36,-23, 14, 16,-26,-26,-25,-23,-14, -4, 41,-26, -6,-29;
/M: SY='D'; M=-19, 48,-29, 65, 20,-38,-10,  1,-38,  0,-30,-29, 22,-10,  0, -9,  1, -9,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-29,-15, -7,-11,-21,-11,-13, -1,-15, -7,-13, 20, -8,  2, -9, -7,-12,-23,-12,-10;
/M: SY='T'; M=  3, -5,-10,-11, -7,-14,-16,-16,-12, -4,-10, -7, -3,-13, -5, -4, 11, 21, -5,-28,-12, -6;
/M: SY='R'; M=-15, -4,-22, -7,  1,-23,-20, -2,-26, 27,-22, -9,  3,-18,  7, 42, -9,-10,-19,-23,-10,  1;
/M: SY='R'; M=-13,-18,-25,-18, -8, -7,-25,-12, -6,  5, 12,  5,-15,-23, -5, 18,-20,-10, -5,-20, -5, -8;
/M: SY='E'; M=-11, 11,-30, 21, 56,-30,-20,  5,-30,  9,-20,-19,  1, -1, 19,  0,  0,-10,-30,-30,-18, 37;
/M: SY='T'; M=  0,-10,-19,-15,-10, -6,-19,-14, -3, -7, -3, -2, -6,-18, -9, -1, -2,  2,  1,-23, -9,-10;
/M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15, 17,-27, 41, -8,-10, -5,  0,-12,-27, -5, -7,-17,-13,-15, 14, 64,-15;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S'; M=  7,  1,-12, -2, -2,-18, -5, -8,-18, -9,-25,-17,  9, -8, -2,-10, 30, 22,-10,-37,-17, -3;
/M: SY='D'; M=-10, 23,-27, 33, 16,-31,-12,  2,-30, -1,-25,-21,  9, -2,  3, -7,  3, -6,-24,-35,-17,  8;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-26, 17, 29,-26,-17, -6,-21,  1,-16,-16,  0, -8,  7, -6,  1, -7,-17,-31,-17, 18;
/M: SY='D'; M=-14, 26,-29, 40, 37,-34,-16, -1,-32,  4,-23,-23,  8, -6, 10, -5,  0,-10,-27,-34,-19, 24;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-19,  0,-29, 10,  0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,  0, 11, 32,-30;
/M: SY='Q'; M= -7, -5,-25, -4, 12,-23,-20,  0,-15,  8,-13, -3, -5,-13, 16,  7, -4, -6,-13,-23, -9, 13;
/M: SY='E'; M= -1,  3,-22,  5, 15,-20,-14, -5,-21,  1,-17,-14,  0,-10,  4, -2,  5,  0,-16,-28,-13,  9;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-18,-27,-21, -7,-27,-25, 19,-12,  5,  6,-19,-21,-18,-14, -9, -2, 25,-24, -9,-21;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 62,-30,-20,  5,-30, 19,  6,-22,-30,-34,-20,-22,-10,  3,  2, 22,-27;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-25, -2, -8,-29, 35,-14,-34, -5,-28,-18,  5,-17, -8, -9,  1,-14,-26,-24,-24, -8;
/M: SY='M'; M=-10,-21, -8,-29,-20, -4,-24, -9, 16,-11, 13, 40,-19,-22, -6,-12,-18,-10, 10,-23, -4,-14;
/M: SY='T'; M=  5,  0,-14, -3,  3,-18,-12,-14,-17, -6,-20,-15,  2, -4, -2, -9, 22, 25, -9,-33,-16,  0;
/M: SY='R'; M=-14,-10,-29,-11, -1,-16,-23, -8,-19, 26,-17, -6, -5,-13,  3, 34,-12,-10,-13,-18, -6, -2;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-23,  7, 21,-23,-12, -1,-21, -1,-20,-14,  2, -8,  9, -6,  9, -1,-19,-29,-13, 15;
/M: SY='E'; M=  0,  5,-26,  9, 39,-27,-16, -4,-22,  4,-17,-16, -1, -4, 14, -4,  3, -7,-22,-28,-19, 26;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-22,-38,-29, 72,-30,-17,  0,-28, 10,  0,-21,-30,-36,-19,-21,-11, -1, 15, 33,-29;
/M: SY='Y'; M= -9,  0,-25,  1, -2, -4,-17,  5,-13, -5,-11, -9, -3,-19, -1, -8, -5, -5,-15, -6, 22, -3;
/M: SY='K'; M=  5, -1,-23, -4,  6,-26,-12, -7,-23, 19,-22,-11,  2,-11,  8, 15,  1, -5,-16,-23,-15,  7;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-21,-27,-17,  3,-27,-14, 16,-22, 35, 24,-24,-25,-10,-16,-23, -7,  7,-20, -1,-13;
/M: SY='P'; M= -3,-17,-35,-10,  0,-29,-18,-19,-20, -5,-28,-18,-17, 69, -8,-16, -8, -9,-25,-28,-27, -8;
/M: SY='K'; M=  0, -7,-23, -9,  0,-20,-13,-14,-16,  8,-11, -7, -6, -9, -1,  3, -3, -1,-11,-23,-13, -1;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-24, -3,  7,-28,-20, -9,-30, 44,-28,-10, -1,-13,  8, 33,-10,-10,-20,-21,-11,  7;
/M: SY='Q'; M=-13, -4,-29, -4, 11,-31,-20,  4,-24, 19,-20, -5,  0,-14, 36, 31, -3, -7,-25,-20,-10, 22;
/M: SY='N'; M=-10, 16,-23, 10,  2,-21,-13, -1,-13,  0,-16, -9, 19,-17,  4, -1,  0, -2,-15,-32,-14,  2;
/M: SY='N'; M=-11, 13,-27, 11, 13,-26,-12,  1,-23, 11,-20, -9, 14,-13, 12,  8, -2, -8,-24,-28,-15, 13;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-27,-15,  4,-27,-16, 16,-24, 33, 17,-24,-25,-13,-18,-22, -9,  8,-20, -2,-15;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 48,-29,-10,  0,-11, 10, 34,-10,-10,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='K'; M=-10, -5,-27, -7,  2,-23,-21, -7,-19, 30,-21, -5, -3,-14,  5, 24, -8, -6,-12,-22, -8,  2;
/M: SY='K'; M= -2,  3,-25,  5, 17,-29,-15, -5,-25, 18,-23,-13,  1, -9, 15, 11,  2, -5,-20,-25,-15, 15;
/M: SY='L'; M= -4,-16,-20,-19,-13, -2,-23,-11,  0, -5,  5,  3,-13,-23,-12, -2,-13, -7,  5,-21, -4,-13;
/M: SY='G'; M= -7, -2,-29, -2, -7,-23, 21, -6,-30, -2,-23,-14,  2,-18, -4, -5, -4,-14,-25,-20,-14, -6;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 15,-30,-20, 19,-30, 47, 19,-29,-30,-21,-20,-29,-10,  9,-18,  2,-21;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-39,-30, 78,-30,-18,  0,-29, 10,  0,-20,-30,-39,-20,-20,-10,  0, 11, 32,-30;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_08 which contains 320'201 sequence entries.


Total number of hits 33 in 33 different sequences
Number of true positive hits 33 in 33 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] HP
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
33 sequences

ABLM1_HUMAN (O14639), ABLM1_MOUSE (Q8K4G5), ABLM2_HUMAN (Q6H8Q1), 
ABLM2_MOUSE (Q8BL65), ABLM2_RAT   (Q6KC51), ABLM3_HUMAN (O94929), 
ABLM3_MOUSE (Q69ZX8), AVIL_HUMAN  (O75366), AVIL_MOUSE  (O88398), 
AVIL_RAT    (Q9WU06), DEMA_BOVIN  (Q08DM1), DEMA_HUMAN  (Q08495), 
DEMA_MOUSE  (Q9WV69), DEMA_PONAB  (Q5R4B6), QUAI_DROME  (Q23989), 
SVIL_BOVIN  (O46385), SVIL_HUMAN  (O95425), SVIL_MOUSE  (Q8K4L3), 
TALB_DICDI  (Q54K81), VILB_DICDI  (P36418), VILD_DICDI  (Q8WQ85), 
VILI1_ARATH (O81643), VILI2_ARATH (O81644), VILI3_ARATH (O81645), 
VILI4_ARATH (O65570), VILI5_ARATH (Q9LVC6), VILI_BOVIN  (Q3SZP7), 
VILI_CHICK  (P02640), VILI_HUMAN  (P09327), VILI_MOUSE  (Q62468), 
VILI_PIG    (Q29261), VILL_HUMAN  (O15195), VILL_MOUSE  (Q91YD6)
» More

PDB
[Detailed view]
33 PDB

1QQV; 1QZP; 1UJS; 1UNC; 1UND; 1VII; 1WY3; 1WY4; 1YRF; 1YRI; 1YU5; 1YU7; 1YU8; 1ZV6; 2F4K; 2JM0; 2K6M; 2K6N; 2L3X; 2PPZ; 2RJV; 2RJW; 2RJX; 2RJY; 3MYA; 3MYC; 3MYE; 3NKJ; 3TJW; 3TRV; 3TRW; 4CZ3; 4CZ4
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission