PROSITE entry PS51097
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | PTS_EIIA_TYPE_5 |
| Accession [info] | PS51097 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-APR-2005 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00528 |
| Associated ProRule [info] | PRU00420 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | PTS_EIIA type-5 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=114; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=109; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0281332; R2=0.0132197; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7950.9570312; R2=11.4022903; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1360; H_SCORE=23458; N_SCORE=20.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=339; H_SCORE=11816; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='M'; M= -7,-20,-12,-27,-21, -4,-25,-18, 13,-14, 4, 17,-18,-21,-13,-15,-10, 0, 13,-15, -4,-17; /M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-28,-20, -2,-31,-22, 23,-15, 17, 15,-19,-22,-15,-15,-17, -5, 17,-22, -3,-19; /M: SY='Y'; M=-18,-25,-31,-28,-23, 26,-29, 1, 3,-16, 4, 4,-24,-29,-15,-15,-24,-13, -6, 35, 51,-21; /M: SY='E'; M=-10, 6,-17, 4, 18,-27,-18, -1,-24, 8,-21,-12, 7,-12, 18, 9, 1, -1,-23,-29,-15, 18; /M: SY='S'; M= 18, 1,-11, -7, -6,-17, -6,-14,-14, -9,-17,-14, 6,-11, -6,-12, 21, 21, -6,-31,-17, -6; /M: SY='R'; M= -7, -4,-19, -9, -5,-17,-20,-12,-14, 10,-15, -7, 0,-15, -1, 14, 3, 14, -4,-26,-11, -4; /M: SY='V'; M= -6,-30,-18,-35,-30, 11,-33,-29, 33,-25, 13, 12,-25,-27,-28,-23,-15, -5, 37,-21, -1,-30; /M: SY='T'; M= -5, -7,-11,-13, -9,-13,-23,-16, -5, -6, -4, -3, -6,-16, -3, -7, 2, 17, -1,-27,-10, -6; /M: SY='A'; M= 11, -1,-20, -2, 6,-25, -4, -9,-22, 3,-20,-14, 0,-11, 4, 3, 9, -2,-15,-26,-18, 4; /M: SY='I'; M= -8,-29,-26,-35,-28, -1,-30,-28, 38,-28, 18, 16,-21,-23,-22,-27,-18, -9, 27,-22, -4,-28; /M: SY='G'; M= -1,-10,-30,-10,-19,-29, 64,-19,-39,-17,-29,-19, 0,-20,-18,-14, -1,-19,-29,-20,-29,-19; /M: SY='A'; M= 5, -4,-23, -4, -1,-20,-12, -9,-16, -1,-18,-12, -2, 4, -1, -7, 4, -2,-15,-24,-12, -2; /M: SY='E'; M=-11, -1,-26, 0, 12,-10,-14, 0,-15, -7, -9, -8, 0,-14, 2, -8, -5, -9,-17,-23, -7, 7; /M: SY='A'; M= 37,-14,-11,-21,-15,-17, -1,-22, -4,-13, -7, -7,-13,-15,-15,-20, 5, -1, 8,-22,-19,-15; /M: SY='A'; M= 6,-11,-21,-13, 2,-16,-19,-12, -1,-10, 1, 0,-10,-14, 5,-12, -3, -3, -5,-23,-11, 3; /M: SY='D'; M=-12, 25,-26, 36, 12,-27,-13, -2,-29, -1,-21,-21, 9,-12, 0, -5, 2, -4,-21,-31,-12, 5; /M: SY='F'; M= -5,-17,-22,-22,-18, 19,-16,-16, -2,-20, 2, 3,-14,-14,-20,-18,-10, -7, -3,-13, 2,-18; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='L'; M= -2,-18,-16,-20,-14, -1,-20,-16, 13,-16, 18, 8,-15,-18,-12,-14,-11, -4, 7,-18, -4,-14; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='E'; M= 0, 10,-23, 14, 19,-28, -6, -8,-27, 4,-23,-19, 4, -8, 4, -4, 8, -1,-20,-30,-19, 11; /M: SY='E'; M=-12, 17,-29, 26, 29,-31,-12, -4,-27, 1,-21,-19, 5, -7, 9, -6, 0, -7,-24,-31,-18, 19; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='N'; M= -7, 4,-28, -1, -2,-26, 8, -7,-26, 10,-26,-10, 11, -9, 0, 3, -3,-10,-24,-25,-18, -1; /M: SY='M'; M= -8,-22,-20,-31,-23, -1,-25,-11, 25,-15, 17, 40,-20,-21, -9,-15,-16, -5, 19,-22, -2,-17; /M: SY='L'; M= -5,-29,-19,-32,-25, 9,-30,-24, 25,-26, 28, 14,-26,-27,-23,-22,-20, -7, 23,-21, -2,-25; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='I'; M= -7,-30,-25,-37,-30, 0,-37,-30, 45,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 35,-23, -3,-30; /M: SY='L'; M= -8,-21,-18,-26,-19, 11,-28,-21, 11,-24, 26, 9,-20,-24,-19,-18,-14, 8, 7,-20, 0,-19; /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20, 0,-30, 10, 0,-20,-30,-40,-20,-20,-10, 0, 10, 30,-30; /M: SY='G'; M= -3, 7,-28, 9, -5,-30, 30,-12,-35, -4,-28,-20, 7,-16, -9, -7, 0,-14,-26,-25,-23, -7; /M: SY='E'; M=-11, 21,-28, 27, 30,-31, -9, 0,-30, 5,-25,-21, 13, -8, 12, -2, 3, -7,-28,-33,-19, 21; /M: SY='G'; M= -5, 5,-24, 1, -3,-24, 10,-12,-26, -2,-24,-17, 9, -7, -7, -6, 5, 4,-21,-28,-20, -5; /M: SY='A'; M= 34,-13,-11,-20,-14,-17, -2,-21, -5,-13, -9, -7,-12,-15,-14,-19, 8, 0, 7,-23,-19,-14; /M: SY='P'; M= -8,-16,-34,-10, -2,-26,-20,-20,-18,-10,-26,-18,-16, 69,-10,-18, -4, 3,-24,-30,-26,-10; /M: SY='D'; M= -8, 25,-28, 37, 22,-34,-12, -4,-32, 4,-25,-22, 8, -1, 5, -7, 0, -9,-26,-33,-20, 13; /M: SY='D'; M= -1, 14,-25, 20, 20,-29,-14, -8,-26, 3,-21,-19, 3, 0, 3, -7, 3, -1,-21,-30,-19, 11; /M: SY='L'; M=-10,-29,-13,-31,-22, 7,-31,-22, 21,-30, 42, 18,-28,-29,-21,-22,-27,-10, 11,-22, -2,-22; /M: SY='A'; M= 14, -7,-20,-11, 1,-22,-11,-11,-17, 8,-14, -9, -5,-13, 3, 9, 1, -4,-11,-22,-15, 1; /M: SY='D'; M=-13, 28,-28, 40, 27,-35,-13, 0,-33, 3,-26,-22, 11, -8, 13, -5, 5, -6,-28,-35,-19, 20; /M: SY='Y'; M=-13,-22,-25,-24,-22, 16,-30, 4, 11,-17, 3, 4,-18,-26,-15,-15,-14, -7, 6, 2, 38,-22; /M: SY='C'; M= 6,-15, 66,-23,-21,-21,-13,-25,-25,-22,-20,-18,-13,-28,-21,-25, 2, -4, -9,-40,-27,-21; /M: SY='Y'; M=-10,-27,-19,-28,-26, 20,-30,-12, 16,-19, 11, 7,-26,-30,-24,-17,-16, -5, 21, -5, 25,-26; /M: SY='I'; M= -4,-20,-23,-26,-18, -4,-26,-21, 21,-21, 14, 9,-13,-20,-14,-19,-10, -4, 12,-24, -5,-18; /M: SY='H'; M=-14,-11,-29,-13, -5,-16,-26, 36, -3,-13, -2, 7, -4,-19, 10, -7,-13,-14,-11,-24, 7, -1; /M: SY='E'; M= -9, 8,-20, 8, 11,-27, -9, -6,-27, 10,-25,-17, 8, -7, 5, 5, 1, -4,-23,-30,-18, 7; /M: SY='H'; M=-13, -8,-24,-13, -7, 4,-23, 6, -7,-11, -8, -4, -2,-14,-10, -6, -7, -5, -7,-21, 1,-10; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='D'; M= -4, 4,-25, 6, 1,-26, 2, -7,-26, 1,-25,-15, 4, -7, 2, -5, 4, -3,-21,-25,-14, 1; /M: SY='P'; M=-10, -8,-32, -3, 14,-20,-21,-12,-16, -5,-20,-15, -8, 34, 0,-12, -5, -6,-23,-27,-19, 5; /M: SY='L'; M= -2,-17,-18,-20,-15, -5,-21,-17, 8,-13, 11, 4,-13,-23,-14, -9, -9, -3, 9,-26, -9,-15; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= -8, 10,-25, 12, 16,-28,-15, 4,-22, 4,-22,-13, 8,-10, 16, 0, 6, -2,-21,-30,-13, 15; /M: SY='G'; M= -4, -3,-28, 0, 7,-27, 16,-10,-29, -2,-19,-14, -2,-14, 0, -3, -3,-13,-24,-23,-20, 3; /M: SY='S'; M= 3, 2,-18, -1, -4,-12, -7, -7,-14,-10,-16,-12, 4,-16, -9,-12, 7, 3, -7,-28,-13, -6; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M=-11,-29,-24,-33,-23, 11,-32,-24, 25,-28, 28, 14,-25,-18,-22,-23,-23, -9, 15,-18, 1,-24; /M: SY='Q'; M= -1, -8,-23,-11, -3,-19,-14, -5,-11, 4, -7, 1, -6,-16, 6, 0, -6, -6, -9,-22, -9, 2; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= 2, -9,-28, -5, 4,-24,-17,-16,-17, 3,-18,-12,-11, 22, -4, -8, -6, -7,-15,-26,-20, -2; /M: SY='G'; M= -2, -5,-30, -4,-16,-31, 60,-18,-40,-15,-30,-20, 1,-19,-17,-17, 0,-19,-30,-21,-28,-16; /M: SY='D'; M= -8, 23,-25, 32, 9,-31, -6, -4,-27, -4,-21,-16, 9,-12, 3,-10, 4, -6,-21,-33,-17, 6; /M: SY='T'; M= -4,-11,-17,-12, -8,-12,-19, -2, -4, -9, -6, 1, -7,-18, -5, -6, 4, 7, 4,-30, -8, -7; /M: SY='L'; M= -7,-29,-21,-33,-23, 13,-31,-23, 24,-28, 34, 16,-26,-27,-22,-22,-24, -9, 16,-18, 1,-23; /M: SY='T'; M= -2, -5,-17,-12, -9,-10,-20,-15, 1, -8, -4, -1, -2,-16,-10,-10, 2, 13, 4,-28,-10,-10; /M: SY='I'; M=-10,-30,-24,-36,-27, 13,-35,-26, 33,-29, 25, 16,-24,-25,-24,-25,-21, -9, 23,-17, 3,-27; /M: SY='G'; M= 1, 17,-25, 18, -3,-29, 21, -9,-31, -9,-26,-21, 15,-15, -9,-13, 4,-10,-25,-30,-23, -6; /M: SY='G'; M= -8, 5,-30, 10, 10,-31, 17, -8,-33, -4,-27,-20, 5, -6, 0, -5, -1,-13,-29,-27,-23, 4; /M: SY='Q'; M= -5, -1,-23, -3, 8,-22,-19, 10,-13, -3,-14, -5, 1,-12, 13, -4, 2, 3,-13,-27, -7, 9; /M: SY='T'; M= -4, 6,-13, 5, -2,-22,-14, -3,-23, -2,-20,-15, 5, -8, -3, 2, 6, 7,-16,-32,-15, -4; /M: SY='Y'; M=-14,-22,-18,-26,-22, 37,-28, 4, -2,-16, 1, -2,-19,-29,-19,-14,-17, -9, -7, 17, 54,-22; /M: SY='T'; M= -8,-12,-24,-11, -1,-13,-23,-12, -7, -5, -5, -5,-12, 0, -2, -5, -5, 4, -6,-23, -7, -3; /M: SY='I'; M= -3,-29,-23,-36,-29, -1,-34,-29, 40,-26, 15, 15,-22,-22,-22,-26,-15, -6, 34,-23, -4,-29; /M: SY='T'; M= 1, -1,-13, -8, -9,-10,-19,-19, -8,-12, -3, -7, -3,-13,-11,-12, 11, 34, -1,-29,-10,-10; /M: SY='A'; M= 28,-11,-16,-18, -7, -9, -9,-15, -9, -7, -6, -7,-11,-13, -9,-15, 1, -3, -3,-15, -7, -8; /M: SY='V'; M= 2,-29,-12,-30,-29, -1,-29,-29, 29,-20, 10, 10,-27,-27,-27,-21,-10, -1, 44,-28,-10,-29; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='D'; M= -3, 7,-24, 13, 13,-28, -2, -8,-28, 0,-27,-20, 4, -2, 1, -3, 10, -2,-22,-32,-21, 6; /M: SY='V'; M= 1,-18,-16,-20,-14, -3,-16,-19, 5,-13, 3, 4,-16,-21,-16,-14, -5, 0, 13,-24, -9,-15; /M: SY='V'; M= 24,-20,-10,-25,-20,-10,-15,-25, 10,-15, 0, 0,-20,-20,-20,-20, 0, 0, 26,-25,-15,-20; /M: SY='Q'; M=-11, 5,-28, 3, 17,-23,-17, 0,-21, 5,-18,-11, 7,-13, 18, 7, -2, -5,-25,-15,-11, 17; /M: SY='Q'; M= -3, 1,-22, 2, 6,-22,-14, -6,-19, 6,-16, -7, 0,-12, 7, 6, 4, 0,-14,-27,-13, 6; /M: SY='N'; M= -6, 31,-19, 14, -1,-20, -3, 5,-19, 2,-28,-18, 48,-18, -1, 0, 9, 2,-26,-37,-19, -1; /M: SY='L'; M=-10,-29,-19,-31,-21, 13,-29,-19, 19,-28, 42, 21,-29,-29,-21,-19,-27, -9, 12,-19, 1,-21; /M: SY='R'; M= -9, -6,-23, -6, -4,-14,-14,-10,-15, 2,-11, -6, -5,-18, 1, 10, -5, -2, -9,-22,-10, -2; /M: SY='E'; M= 0, 13,-21, 15, 19,-26, -5, -5,-26, -2,-24,-20, 11, -8, 4, -7, 14, 3,-21,-34,-20, 12; /M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-33,-23, 7,-32,-21, 28,-29, 40, 23,-27,-27,-19,-22,-27,-10, 15,-20, 0,-22; /M: SY='G'; M= 3,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20, 1,-19,-28,-20,-29,-19; /M: SY='H'; M=-20, 0,-30, 0, 0,-20,-20,100,-30,-10,-20, 0, 10,-20, 10, 0,-10,-20,-30,-30, 20, 0; /M: SY='V'; M= 3,-24, -9,-30,-24, -5,-26,-25, 22,-22, 9, 10,-20,-23,-20,-22, -9, -4, 24,-26, -9,-23; /M: SY='T'; M= 3, -5,-10,-13,-13, -9,-20,-21, -4,-11, -7, -7, -5,-13,-13,-12, 15, 40, 7,-29,-11,-13; /M: SY='L'; M= -9,-31,-23,-33,-25, 5,-32,-25, 28,-28, 30, 16,-28,-27,-22,-23,-24,-10, 20,-11, 0,-25; /M: SY='R'; M= -1,-13,-20,-15,-10, -9,-19,-10, -5, 2,-11, -5, -9,-19, -6, 5, -1, -2, 2,-18, 0,-10; /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-39,-29, 72,-29,-20, 1,-29, 11, 1,-20,-29,-38,-20,-19,-10, 1, 7, 26,-29; /M: SY='D'; M=-10, 33,-24, 36, 8,-29, -9, -2,-28, 2,-26,-22, 24,-13, -1, -5, 5, 1,-23,-36,-18, 4; /M: SY='G'; M= -2, -2,-29, -2,-13,-29, 48,-16,-36,-16,-30,-21, 5,-11,-15,-17, 3,-14,-29,-25,-28,-14; /M: SY='A'; M= 18, -5,-18, -5, 3,-21, -9,-15,-14, -5,-14,-12, -6, -4, -5,-12, 6, -1, -7,-27,-18, -1; /M: SY='T'; M= -8, 1,-22, 0, -3,-19,-19,-13,-11, -1,-14, -9, -1, -2, -5, -6, -2, 4, -6,-30,-14, -5; /M: SY='E'; M= -3, 0,-23, 0, 14,-23,-18, -1,-16, 1,-17,-10, -1, -3, 8, -4, 2, 0,-14,-28,-14, 10; /M: SY='A'; M= 19, -6,-21, -7, -2,-25, -8,-16,-18, -1,-21,-15, -6, 11, -5,-11, 6, -2,-12,-26,-21, -5; /M: SY='E'; M=-10, 2,-19, 8, 28,-24,-20, -6,-25, 3,-16,-16, -3, -2, 7, 2, -2, -5,-22,-30,-18, 17; /M: SY='L'; M=-14,-20,-23,-20,-15, 12,-26, -8, 3,-20, 20, 10,-19,-18,-16,-11,-21,-11, -2,-17, 2,-16; /M: SY='P'; M= -1, -8,-29, -3, 5,-25,-16,-14,-18, -7,-21,-13,-11, 40, -4,-15, -2, -3,-20,-29,-23, -2; /M: SY='G'; M= -1, -7,-26, -9,-18,-26, 52,-19,-32,-18,-26,-17, 2,-20,-18,-18, 2,-12,-23,-23,-26,-18; /M: SY='T'; M= 8, -1,-15, -8, -5,-16, -7,-16,-12,-10,-14,-12, 3,-11, -7,-12, 15, 20, -6,-29,-15, -6; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-35,-26, 3,-34,-25, 36,-27, 27, 21,-25,-25,-21,-24,-21, -8, 26,-22, -2,-26; /M: SY='H'; M=-16,-11, -1,-13,-12, -3,-24, 35,-19,-10,-14, -5, -7,-26, -5, -8,-11,-12,-18,-12, 28,-12; /M: SY='L'; M= -2,-28,-16,-30,-24, 3,-28,-23, 23,-23, 27, 17,-27,-27,-22,-20,-18, -5, 26,-24, -5,-23; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='E'; M= 1, 3,-12, 3, 12,-24,-14, -9,-21, -2,-20,-15, 1,-10, 7, -5, 12, 9,-15,-31,-17, 9; /M: SY='G'; M= 3, -5,-28, -3, -3,-29, 17,-16,-29, 1,-26,-17, -3, 0, -7, -7, -2,-12,-23,-23,-23, -6; /M: SY='E'; M=-10, -1,-32, 2, 14,-30,-14, 0,-26, 12,-26,-13, 0, 14, 12, 3, -5,-10,-27,-26,-16, 11; /M: SY='P'; M= -1,-10,-27, -7, 8,-21,-18,-11,-15, -1,-18,-10,-10, 15, 5, -7, -2, -6,-14,-25,-17, 5; /M: SY='L'; M=-10,-26,-28,-24,-14, -6,-27,-19, 8,-21, 16, 9,-25, 15,-15,-20,-21,-10, -2,-24,-11,-17; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='P'; M= -6,-13,-33, -6, 3,-26,-19,-16,-16, -5,-20,-14,-15, 45, -3,-13, -8, -9,-20,-28,-22, -3; /M: SY='E'; M= -5, -3,-23, -2, 5,-17,-20,-12, -9, -1, -5, -5, -6,-14, 0, -3, -4, -2, -7,-26,-12, 2; /M: SY='I'; M=-11,-27,-26,-31,-22, 8,-32,-17, 21,-25, 16, 10,-21,-11,-21,-22,-19,-10, 13,-19, 1,-24; /M: SY='K'; M= -1, 5,-22, 6, 10,-26,-15,-10,-22, 13,-21,-13, 1,-10, 4, 3, 3, 1,-13,-27,-15, 7; /M: SY='I'; M= 2,-18,-21,-22,-13,-11,-25,-21, 11,-16, 1, 2,-16, -6,-11,-18, -6, 1, 11,-25,-11,-13; /M: SY='G'; M= -3, -2,-29, -2,-15,-29, 54, -9,-38,-17,-29,-19, 6,-19,-15,-17, 0,-18,-30,-23,-26,-15; /M: SY='S'; M= 10, 5,-16, 5, 0,-24, -1,-11,-21, -8,-23,-17, 5,-11, 0,-11, 20, 10,-13,-32,-19, 0; /M: SY='T'; M= -6,-12,-15,-18,-13, -7,-24,-20, 2,-12, -1, -2,-10,-19,-13,-13, -4, 10, 4,-15, -6,-13; /M: SY='I'; M=-11,-30,-26,-38,-28, 13,-36,-26, 36,-30, 26, 17,-22,-24,-23,-26,-22,-10, 21,-16, 4,-28; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of true positive hits | 2 in 2 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | PTS EIIA type-5 |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
2 sequences
PTHA_ECOLI (P05706), PTHA_SHIFL (P59784)
|