Due to maintenance work, this service will not be available Thursday September 18th between 1pm and 4pm CEST.
Entry: PS51101

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PTS_EIIB_TYPE_4
Accession [info] PS51101
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00795
Associated ProRule [info] PRU00424

Name and characterization of the entry

Description [info] PTS_EIIB type-4 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=166;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=161;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0512714; R2=0.0125248; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7725.29335; R2=61.44142; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=795; N_SCORE=12.0; H_SCORE=51594; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=356; N_SCORE=6.5; H_SCORE=29537; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M= -8,-15,-28,-17,-20, -5, 20, -3,-15,-15,-10,  3,-10,-23,-13,-15,-10,-15,-15, -5, 10,-18;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-26, -2,  3,-23,-20, 14,-26, 23,-23, -8,  2,-12,  6, 14, -4,  1,-18,-25, -3,  3;
/M: SY='M'; M=-13, -1,-25, -2,-10,-12,-22, -7,  9,-12,  5, 23, -8,-17, -5,-15,-14,-10,  3,-26, -6, -9;
/M: SY='K'; M=-12, 23,-27, 21,  9,-29,-12, -2,-29, 24,-30,-17, 23,-13,  5, 12, -2, -7,-25,-30,-15,  7;
/M: SY='I'; M=-12,-30,-28,-40,-30, 19,-38,-28, 38,-30, 18, 15,-20,-22,-25,-28,-20,-10, 23,-13,  7,-30;
/M: SY='K'; M=  4,-12,-20,-14, -7,-18,-18,-15,-11, 15,-13, -5,-10,-17, -4, 15, -5, -5,  2,-22,-12, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23,  2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20,  4,  0, 15,-23,-17,-16;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-24,-37,-30,  0,-37,-30, 44,-27, 17, 17,-23,-23,-23,-27,-17, -7, 36,-23, -3,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='D'; M= -6, 27,-21, 38, 11,-31, -5, -5,-31, -5,-30,-25, 15,-10,  0,-10, 18,  4,-21,-40,-20,  5;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-19,-32,-25,  5,-32,-25, 30,-27, 31, 17,-28,-28,-23,-22,-21, -7, 27,-23, -3,-25;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30,  0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30;
/M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23,  2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20,  4,  0, 15,-23,-17,-16;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='R'; M=  4,-11,-21,-14, -6,-19,-17,-14,-12, 16,-14, -6, -9,-17, -3, 17, -5, -5,  0,-22,-12, -6;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='T'; M=  0, -9,-10,-16,-16, -7,-23,-23,  2,-13, -4, -4, -9,-16,-16,-13, 11, 35, 15,-30,-10,-16;
/M: SY='K'; M=-10, 12,-27,  6,  7,-27,-14, -4,-27, 35,-30,-13, 18,-13,  7, 21, -4, -7,-23,-26,-13,  7;
/M: SY='E'; M=  7,  3,-21,  4, 28,-23,-15, -9,-21,  1,-15,-15, -2, -5,  6, -7,  7,  5,-16,-28,-18, 17;
/M: SY='T'; M=  0, -6,-10,-14,-14, -8,-22,-22, -1,-12, -6, -6, -6,-14,-14,-12, 14, 39, 11,-30,-10,-14;
/M: SY='Q'; M= -6,  9,-23,  5,  8,-28,-11,  0,-23, 16,-28,-12, 16,-12, 17,  9,  8, -1,-23,-29,-15, 13;
/M: SY='P'; M= 11,-19,-24,-18,-10,-20,-16,-22, -5,-12,-14,-10,-19, 31,-15,-20, -4, -5, -2,-27,-22,-15;
/M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 15,  2,-22, -5,  5,-22, 12,-30,-18, 46,-18,  2,  7,  5, -2,-28,-35,-18,  2;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 36,-23,-10,  0,-17, 10, 58,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 37,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30,  0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='S'; M=  1, 15,-16, 21,  6,-26, -3, -7,-26, -7,-30,-23, 13,-10,  0,-10, 28, 11,-16,-40,-20,  3;
/M: SY='D'; M=-17, 35,-30, 49, 20,-40,-13,  3,-34,  3,-27,-21, 14,-10, 18, -4,  0,-10,-30,-34,-17, 19;
/M: SY='E'; M=  1, -4,-25, -2, 19, -9,-18,  1,-16, -1,-11,-11, -9,-12,  4, -8, -4, -8,-17, -9, 11, 10;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-13,-30,-27,  3,-30,-27, 27,-23, 22, 13,-30,-30,-27,-20,-16, -3, 38,-27, -7,-27;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='T'; M=  7, -2,-19, -8,  1,-24,-15,-11,-17,  9,-17, -8, -2,-10, 10,  2,  6, 11,-11,-23,-12,  6;
/M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 55, 14,-34, -7,  3,-34,  0,-30,-27, 32,-13,  0, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  7;
/M: SY='E'; M=  3, 13,-21, 16, 19,-25,-13, -9,-23, -1,-18,-18,  3, -7,  2, -9,  7,  6,-16,-30,-18, 10;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-27,-22, 14,-30,-10, 16,-21, 25, 11,-27,-30,-19,-17,-22, -8, 13, -7, 22,-22;
/M: SY='R'; M=-17,-16,-27,-16, -6,-11,-23, -6,-15, 12,  1, -1, -9,-23,  1, 42,-16,-10,-11,-20, -7, -6;
/M: SY='K'; M= -1,  0,-19, -2,  2,-22,-14,-12,-22, 17,-25,-13,  3,-10,  2,  8, 12, 13,-12,-29,-13,  2;
/M: SY='R'; M=-11,-10,-25,-14, -6,-16,-24,-14, -8, 12,-11, -4, -4,-15, -1, 20, -5,  4, -4,-22, -8, -6;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-17,-30,-23,  7,-30,-23, 23,-27, 38, 17,-30,-30,-23,-20,-24, -7, 22,-23, -3,-23;
/M: SY='I'; M=-13,-30,-25,-38,-28, 27,-35,-25, 28,-30, 24, 14,-22,-25,-26,-25,-22,-10, 16,-11,  9,-28;
/M: SY='K'; M= -8, -4,-26, -2, 13,-24,-22,-12,-17, 25,-19, -8, -6,-12,  4, 12, -8, -8, -7,-25,-12,  9;
/M: SY='Q'; M=-10, -6,-27, -9,  8,-28,-20,  7, -8,  4, -8, 18, -6,-13, 42,  4, -6,-10,-18,-20, -7, 25;
/M: SY='A'; M= 38,-15,-10,-22,-15,-15, -7,-22, -1,-12, -5, -5,-15,-15,-15,-20,  5,  0, 12,-22,-18,-15;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='P'; M= -4,-14,-31, -7,  0,-27,-14,-17,-20,-10,-30,-20,-11, 59, -7,-17,  5, -1,-24,-33,-27, -7;
/M: SY='G'; M= -3,  5,-27, -1,-14,-27, 49,-11,-34,-14,-30,-20, 18,-20,-14,-14,  3,-14,-30,-26,-27,-14;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-19,-33,-28,  2,-33,-28, 34,-25, 23, 15,-27,-27,-25,-23,-18, -5, 34,-25, -5,-28;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-25, 21, 11,-31,-12, -7,-31, 20,-30,-19,  9,-10,  5,  8,  5, -3,-21,-31,-15,  8;
/M: SY='A'; M= 35,-16,-10,-23,-16,-14, -9,-23,  2,-13, -4, -4,-16,-16,-16,-20,  4,  0, 15,-23,-17,-16;
/M: SY='N'; M= -6, 18,-19,  9,  0,-20, -5, 25,-22, -5,-28,-15, 33,-17,  2, -3, 14,  1,-24,-38,-11,  0;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-22,-35,-27,  0,-31,-21, 36,-21, 18, 30,-22,-22,-16,-21,-18, -8, 29,-22, -2,-24;
/M: SY='P'; M=  8,  4,-22,  6,  0,-25,-11,-15,-20, -8,-20,-17, -3, 14, -8,-15,  5,  6,-14,-29,-20, -5;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-24,-26,-21, -9,-29,-27, 19,-19,  0,  3,-25,  9,-21,-22,-12, -5, 21,-28,-14,-24;
/M: SY='N'; M=  7, 21,-17, 17,  2,-24, -2, -4,-22, -5,-25,-20, 23,-13, -2, -9, 15,  3,-18,-35,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-13, 15,-30, 21, 13,-33,-17, -7,-33, 35,-30,-16,  6,-10,  7, 18, -7,-10,-23,-26,-13, 10;
/M: SY='M'; M=-13,-23, 13,-33,-25, 20,-25,-13,  2,-21,  7, 23,-20,-28,-19,-18,-18,-10,  2,-18,  2,-21;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-19,-35,-30,  0,-35,-30, 39,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 41,-25, -5,-30;
/M: SY='E'; M=-15, 18,-30, 28, 34,-31,-17,  0,-33, 12,-23,-21,  6, -8, 11, 14, -2,-10,-28,-31,-18, 21;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-32,-27,  0,-29,-21, 31,-19, 15, 27,-25,-25,-19,-19,-15, -5, 33,-25, -5,-24;
/M: SY='Y'; M=  3,-21,-19,-23,-21,  9,-23, -5,  7,-13,  1,  1,-21,-25,-16,-15,-10, -5, 11,  0, 28,-21;
/M: SY='K'; M=-10,  9,-28,  5, 10,-30,-15, -1,-25, 29,-28,-10, 14,-12, 18, 19, -3, -8,-25,-25,-12, 14;
/M: SY='D'; M= -8, 32,-21, 37,  9,-29, -5, -1,-29, -3,-30,-25, 26,-12,  0, -8, 15,  2,-24,-40,-20,  5;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-30, -5,  6,-31,-16, -9,-20, -4,-27,-14, -7, 38, 14, -9,  4, -4,-26,-29,-22,  7;
/M: SY='R'; M=-15,  6,-28, 13,  4,-22,-19, -7,-22, 13,-10,-10,  0,-17,  0, 17,-11,-10,-17,-26,-11,  1;
/M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-32,-25, 47,-30,-11,  6,-25, 20,  6,-23,-30,-27,-18,-23,-10,  1,  6, 33,-25;
/M: SY='G'; M=  8,  3,-25,  5, -9,-30, 36,-16,-33,-13,-25,-20,  2,-15,-13,-18,  2,-13,-23,-24,-25,-11;
/M: SY='B'; M=-13, 37,-25, 35, 19,-28, -7,  5,-28,  2,-28,-23, 35,-13,  4, -3,  5, -5,-30,-38,-20, 12;
/M: SY='N'; M= -5,  8,-18,  2,  5,-16,-16, -8, -9, -4,-14,-11, 12,-15, -4, -7,  6, 10, -5,-33,-15,  1;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 39,-25,-10,  0,-15, 10, 52,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='Y'; M=  4,-20,-23,-20,-16, -2,-21,-10,  0,-12, -7, -4,-20,  1,-15,-17, -8, -5,  2, -9, 11,-18;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-33,-23,  5,-31,-18, 29,-25, 34, 29,-25,-25,-15,-21,-25,-10, 16,-20,  0,-21;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-18,-34,-26, 61,-28,-20, -2,-26,  6, -2,-16,-26,-34,-18,-11,  3,  0,  1, 21,-26;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-25, 18, 19,-27,-18, -8,-27, 15,-23,-17,  4, -8,  5,  5,  2,  4,-20,-29,-15, 12;
/M: SY='N'; M= -8, 10,-18, -2, -8, -9,-14, -6, -6,-11, -1, -6, 19,-21, -8, -8,  0,  8,-11,-32,-12, -8;
/M: SY='P'; M= -7,-23,-31,-16, -9,-21,-23,-23, -5,-13,-18,-11,-23, 53,-16,-20,-10, -7, -5,-30,-24,-16;
/M: SY='D'; M=-11, 18,-25, 24, 22,-30,-17, -3,-26,  2,-21,-16,  6, -8, 15, -3,  5,  4,-23,-31,-15, 19;
/M: SY='B'; M=-15, 45,-25, 44, 10,-30, -5,  5,-30,  0,-30,-25, 41,-15,  0, -5,  5, -5,-30,-40,-20,  5;
/M: SY='V'; M= -5,-28,-15,-30,-25,  3,-28,-20, 25,-21, 24, 24,-28,-28,-20,-18,-18, -5, 29,-25, -5,-23;
/M: SY='L'; M=  3,-16,-21,-19, -9, -9,-20,-17, -2, -1, 13,  4,-16,-20, -9, -5,-15, -8, -1,-20, -7, -9;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 41,-25,-10,  0,-15, 10, 48,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='C'; M= -8,-27, 25,-30,-25, -2,-30,-25,  7,-28, 19,  5,-27,-33,-25,-23,-19, -8, 13,-32,-12,-25;
/M: SY='V'; M= -6,-30,-13,-33,-30, 25,-30,-27, 21,-23, 10,  7,-27,-30,-33,-20,-13, -3, 35,-18,  2,-30;
/M: SY='E'; M=  0, 18,-26, 27, 33,-31,-13, -4,-29,  3,-21,-21,  4, -5,  7, -7,  2, -8,-24,-31,-20, 20;
/M: SY='G'; M= 11,  4,-24,  6, -7,-29, 30,-15,-31,-12,-24,-19,  2,-15,-12,-18,  3,-11,-21,-25,-25,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F'; M= -8,-30,-15,-33,-28, 27,-30,-25, 19,-25, 19,  9,-27,-30,-31,-20,-17, -5, 26,-16,  4,-28;
/M: SY='D'; M= -8, 25,-24, 37, 23,-31, -9, -3,-31, -1,-28,-25, 12, -8,  5, -8, 12, -1,-24,-38,-20, 14;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-37,-30, 17,-35,-28, 33,-27, 15, 13,-23,-25,-27,-25,-17, -7, 30,-17,  3,-30;
/M: SY='D'; M= -6, 11,-23, 17,  4,-26,-13,-12,-24, -7,-25,-21,  3, 14, -5,-12, 11, 11,-19,-35,-20, -2;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-25, 11, 35,-28,-15, -5,-28, 14,-25,-18,  2, -5, 13,  4,  7, -3,-23,-30,-18, 24;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='N'; M=-12, 30,-25, 25, 10,-30, -8,  8,-24,  3,-27,-16, 33,-15, 18,  1,  5, -5,-30,-34,-17, 14;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-38,-30,  0,-38,-30, 45,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 35,-22, -2,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G'; M=  5, -5,-21, -5,-11,-25, 38,-15,-31,-15,-30,-20,  5,-15,-11,-15, 18, -2,-21,-29,-25,-11;
/M: SY='M'; M=-10,-25,-23,-33,-23,  2,-28,-14, 29,-20, 26, 39,-22,-22,-10,-18,-22,-10, 16,-20,  0,-18;
/M: SY='A'; M= 35,-10,-16,-17,-13,-23, 21,-20,-19,-13,-16,-13, -7,-13,-13,-20,  7, -6, -9,-20,-23,-13;
/M: SY='F'; M=  1,-17,-19,-24,-17, 25,-18,  9,-10,-19, -3, -3,-10,-21,-19,-15, -8, -9, -7, -9, 12,-17;
/M: SY='N'; M= -3, 10,-18,  4,  0,-20, -5, -1,-22,  3,-28,-18, 23,-15,  2, 12, 19,  7,-19,-35,-18,  0;
/M: SY='A'; M= 24,-12,-15,-18, -8,-20,-12,-15, -3, -8, -8, -3,-12,-15,  2,-13,  3, -2,  5,-22,-15, -3;
/M: SY='G'; M= -6,  8,-30, 15, -8,-33, 45,-14,-40,-14,-30,-23,  6,-17,-14,-17,  0,-17,-30,-26,-27,-11;
/M: SY='R'; M=-13, -7,-28,-10,  0,-20,-20, -5,-19, 31,-16,  5, -4,-15,  8, 34,-12,-10,-14,-20, -8,  3;
/M: SY='V'; M= -3,-14,-16,-16,-13,-12,-25,-21,  2,  4, -7, -1,-14,-19,-13, -2, -3,  9, 17,-27,-10,-13;
/M: SY='M'; M= -8,-21,-20,-23,-13, -6,-25,-11, 13,-14, 17, 22,-21,-23,  1,-11,-16, -8, 10,-22, -5, -6;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='T'; M= -6,  3,-19, -4, -8, -3,-14,  2,-12, -8,-16,-12, 11,-19, -5, -8, 10, 13,-13,-16, 13, -8;
/M: SY='N'; M=-10, 18,-25,  9,  9,-29,-11,  5,-22, 15,-27,-11, 27,-15, 21, 10,  2, -5,-28,-29,-15, 15;
/M: SY='A'; M= 26,-12,-10,-16,-12,-15, -7,-19, -3,-12,-11, -8, -9,-15,-12,-17, 14,  6,  9,-29,-18,-12;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28,  2,-35,-28, 37,-27, 24, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 31,-23, -3,-28;
/M: SY='A'; M= 31, -5,-10,-10, -5,-20,  0,-15,-15,-10,-20,-15,  0,-10, -5,-15, 24, 10, -5,-30,-20, -5;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-20,-32,-25,  3,-30,-20, 29,-23, 27, 27,-25,-25,-18,-20,-21, -8, 24,-22, -2,-22;
/M: SY='G'; M= -2,  7,-24, 12, -4,-29, 30,-12,-34,-12,-30,-22,  8,-15, -9,-15, 12, -5,-24,-31,-25, -7;
/M: SY='E'; M=-10,  5,-30, 11, 42,-35,-20,  5,-25, 10,-20,-11,  0, -5, 38,  5,  0,-10,-30,-25,-15, 40;
/M: SY='L'; M=  5, -9,-18,-11,  4,-11,-19,-15, -6,-11,  6, -3,-11,-14, -6,-13, -2,  6, -4,-25,-11, -1;
/M: SY='D'; M=-15, 29,-30, 44, 41,-35,-15,  0,-35,  5,-25,-25, 10, -5, 10, -5,  0,-10,-30,-35,-20, 26;
/M: SY='A'; M= 24,-20,-15,-27,-20,-10,-17,-25, 14,-17,  2,  2,-17,-17,-17,-22, -2, -2, 19,-22,-13,-20;
/M: SY='K'; M=  0,  7,-25, 10,  5,-28,-13, -8,-28, 19,-23,-15,  2,-12,  3, 17, -3, -8,-18,-25,-15,  3;
/M: SY='A'; M= 20, -1,-16, -5, 11,-21,-11,-14,-16, -4,-13,-13, -5, -7, -1,-11,  9,  9, -9,-25,-18,  5;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25, 43,-30,-20, 10,-30, 31, 10,-25,-30,-30,-20,-25,-10,  5, -6, 14,-25;
/M: SY='Y'; M=-15, -2,-27,  3, -3, -7,-23, -4,-11,  1,  1, -3, -9,-20, -6, -4,-16,-10,-11,-14, 10, -6;
/M: SY='A'; M= 21, -3,-20, -6, 12,-25,-10,-13,-20,  9,-17,-12, -5, -8,  2, -3,  3, -5,-12,-22,-18,  7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='Q'; M=-10,  9,-28,  5, 13,-33,-15,  5,-22, 17,-25, -7, 14,-12, 34, 12,  0, -8,-28,-25,-12, 23;
/M: SY='E'; M= 17,  1,-21,  2, 28,-25,-11, -9,-21,  1,-15,-15, -5, -5,  6, -9,  5, -5,-16,-25,-20, 17;
/M: SY='R'; M=  1,  8,-23, -1,  0,-22,-10, -4,-23, 17,-23,-13, 16,-15,  3, 19,  0, -5,-19,-26,-15,  0;
/M: SY='G'; M= -6, -7,-30, -7,-14,-27, 42, 17,-37,-17,-27,-14,  3,-20,-11,-14, -3,-20,-30,-23,-15,-14;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 37,-27, 23, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='R'; M=-13, -1,-30,  2, 19,-27,-20, -5,-30, 34,-25,-12,  0,-11, 12, 35, -8,-10,-22,-22,-12, 14;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-21,-35,-28, 22,-33,-25, 27,-28, 23, 13,-25,-27,-27,-23,-20, -8, 22,-15,  5,-28;
/M: SY='F'; M=-18, -1,-25,  1,  3, 25,-23,-10,-17,-13, -7,-12, -6,-18,-16,-13,-10,-10,-14,-11,  6, -4;
/M: SY='A'; M= 17,-21,-13,-29,-21, 15,-16,-22,  3,-19,  1, -2,-18,-21,-24,-20, -4, -3, 12,-13, -2,-21;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5, 10,-30,-20,  5,-25, 20,-20, -5,  0,-15, 36, 39, -5,-10,-25,-20,-10, 21;
/M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10,  0,-13, 10, 42,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='P'; M=  4,-18,-33,-12, -2,-28,-15,-20,-18,-10,-25,-18,-18, 66,-10,-20, -5, -8,-23,-28,-28,-10;
/M: SY='B'; M= -6, 25,-19, 24,  4,-24, -7, -4,-24, -5,-26,-21, 23,-12, -2, -8, 16, 13,-19,-38,-18,  1;
/M: SY='D'; M=-17, 38,-30, 55, 32,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 14, -7,  6, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 19;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-20,  0,  5,-25,-10,-10,-25, 21,-30,-15,  5,-10,  5, 11, 14,  4,-15,-30,-15,  5;
/M: SY='R'; M=-15,-11,-33, -8,  2,-25,-20, -9,-27, 23,-25,-13, -6, 16,  4, 33,-10,-10,-23,-23,-16, -1;
/M: SY='V'; M= 10,-25,-12,-28,-23, -2,-23,-25, 18,-20, 15,  8,-25,-25,-23,-20,-10, -2, 29,-25,-10,-23;
/M: SY='N'; M= -6, 20,-21, 20,  9,-29, -7,  2,-24, -1,-28,-17, 22,-12, 14, -3, 15,  2,-24,-35,-18, 12;
/M: SY='M'; M= -8,-25,-18,-30,-22,  3,-25,-13, 22,-18, 27, 37,-25,-25,-13,-15,-21, -8, 19,-22, -2,-17;
/M: SY='D'; M=-15, 18,-25, 25,  2,-22,-15,  0,-13, -5, -7, 11,  2,-15,  0,-10, -9,-10,-12,-31,-11,  1;
/M: SY='E'; M=-12, 13,-32, 25, 38,-32,-18, -4,-30,  3,-25,-22,  0, 17,  9, -7, -2,-10,-30,-32,-22, 22;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 36,-30, 34, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 21,-20,  0,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='K'; M=  3, -2,-26, -4,  8,-30,-16, -7,-23, 28,-23, -8, -2,-10, 18, 14, -3, -8,-18,-20,-12, 13;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='H'; M=  4, -1,-18, -8,-10,-15,-13, 21, -9,-10,-13, -4,  7,-20, -6,-10, -1, -6, -4,-30, -5,-10;
/M: SY='K'; M=-11,-11,-27,-14, -9,  4, -4,-15,-23, 10,-18, -9, -6,-18,-12,  4,-11,-12,-16,-11, -2, -9;
/M: SY='N'; M=-12, 25,-20,  7, -6,  2, -6,  4,-16, -6,-21,-16, 43,-22, -9, -4,  4, -2,-24,-29, -9, -6;
/M: SY='E'; M=-10, 13,-25,  9, 24,-20,-14,  3,-16,  3,-14, -3, 14,-10, 10, -2, -1, -7,-21,-31,-16, 17;
/M: SY='L'; M=  3, -9,-18,-16,-13, -4,-16,-13,  4,-19, 18,  4, -4,-23,-13,-15,-12, -5, -2,-25, -9,-13;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 10 in 10 different sequences
Number of true positive hits 10 in 10 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] V_Lesaux
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PTS EIIB type-4
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
10 sequences

PTFB_BACSU  (P26380), PTNAB_ECO57 (P69799), PTNAB_ECOL6 (P69798), 
PTNAB_ECOLI (P69797), PTNAB_SHIFL (P69800), PTNAB_STRP6 (Q5XAF5), 
PTPB1_ECOLI (P42909), PTPB2_ECOLI (P42904), PTRB_KLEPN  (P37081), 
Y801_STRP6  (Q5XCC7)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1BLE; 1NRZ; 1VSQ; 2JZH; 2JZN; 2JZO

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission