ID   SAP_A; MATRIX.
AC   PS51110;
DT   01-APR-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Saposin A-type domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2327433; R2=0.0107069; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=586; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=371; N_SCORE=6.2; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-30,-45,-25,-15,-10,-20,-25,-20,-15,-25,-20,-30,30,-15,-20,-25,-20,-30,59,0,-15;
MA   /M: SY='T'; M=0,-15,-10,-20,-20,-5,-25,-25,10,-15,0,0,-15,-20,-20,-15,5,25,25,-30,-10,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-9,-17,-14,-7,-10,-23,-14,-3,-12,6,1,-9,-16,1,-9,1,20,-3,-25,-7,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,3,-23,7,-3,-21,5,-12,-27,-11,-28,-22,3,-15,-6,-13,14,0,-20,-8,-14,-4;
MA   /M: SY='S'; M=0,-8,-21,-6,0,-21,-11,-10,-14,-10,-17,-11,-3,8,4,-10,14,5,-14,-32,-18,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-15,-25,-15,-5,-10,-25,-15,-5,10,10,5,-15,-20,-5,5,-20,-10,-5,-20,-5,-5;
MA   /M: SY='A'; M=20,4,-16,2,5,-22,-9,-14,-18,-6,-15,-15,-2,-9,-4,-14,9,7,-9,-27,-18,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='A'; M=35,-7,-10,-14,-8,-19,-3,-18,-12,-10,-14,-12,-4,-10,-8,-17,18,11,-2,-26,-19,-8;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-3,-30,-3,7,-34,-2,-1,-27,13,-24,-7,0,-13,29,16,-3,-12,-27,-20,-14,17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,55,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='E'; M=11,3,-23,6,36,-27,-13,-7,-23,3,-17,-17,-3,-3,10,-7,3,-7,-20,-27,-20,23;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-30,-15,-35,-30,40,-30,-25,15,-25,10,5,-25,-30,-35,-20,-15,-5,25,-10,10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-18,-38,-44,-38,-28,10,-22,-28,-12,-22,-6,-12,-38,-30,-20,-20,-38,-26,-22,115,24,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-12,-2,-30,-2,16,-36,-20,8,-22,14,-20,-2,0,-12,50,22,-2,-10,-28,-20,-10,32;
MA   /M: SY='S'; M=1,16,-16,17,4,-24,-2,-5,-24,-7,-30,-22,19,-11,0,-9,28,11,-17,-40,-20,2;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-30,-17,-30,-23,7,-30,-23,23,-27,36,17,-30,-30,-23,-20,-23,-7,24,-23,-3,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-12,3,-30,8,33,-28,-20,-3,-30,27,-23,-15,0,-7,15,21,-5,-10,-25,-25,-15,23;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,0,-20,-5,5,-25,-20,-5,-15,0,-15,-5,0,-10,25,0,10,20,-15,-25,-10,15;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-2,-21,-15,-21,-16,-1,-21,-19,10,-22,18,6,-18,-24,-16,-17,-5,1,12,-28,-8,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-13,17,-30,24,20,-40,-17,7,-27,7,-23,-10,7,-10,39,3,0,-10,-30,-27,-13,30;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-10,-30,-10,-10,-25,25,-10,-35,5,-25,-15,0,-20,-5,25,-5,-15,-25,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='A'; M=50,-10,-10,-20,-10,-20,0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20,10,0,0,-20,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,30,15,-30,-30,-25,-20,-20,-5,30,-25,-5,-25;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-30,-5,-5,-30,25,-15,-35,15,-30,-15,0,-15,-5,5,-5,-15,-25,-20,-20,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-19,-24,-19,-6,-8,-26,-9,6,-16,25,13,-19,-23,9,-9,-19,-10,-4,-20,-4,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='E'; M=-9,7,-24,5,24,-19,-17,-1,-15,1,-12,-2,5,-9,9,-3,0,0,-18,-30,-14,16;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='G'; M=2,1,-21,-2,-10,-25,35,-12,-30,-14,-30,-20,12,-16,-10,-14,16,-3,-23,-30,-25,-10;
MA   /M: SY='H'; M=-15,0,-30,0,5,-25,-20,45,-30,20,-25,-5,5,-15,10,15,-10,-15,-25,-25,5,5;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-25,-25,-20,-15,-15,-25,-25,5,-15,-10,-5,-25,30,-20,-20,-10,-5,10,-30,-20,-20;
MA   /M: SY='G'; M=8,-7,-20,-12,-15,-21,28,-20,-25,-15,-20,-15,-2,-15,-15,-17,9,7,-15,-23,-21,-15;
MA   /M: SY='A'; M=35,-16,-10,-23,-16,-14,-9,-23,2,-13,-4,-4,-16,-16,-16,-20,4,0,15,-23,-17,-16;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=21(14); /POSITIVE=20(13); /UNKNOWN=1(1); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Saposin A-type;
CC   /VERSION=4;
DR   P15781    , PSPB_BOVIN , T; P17129    , PSPB_CANLF , T;
DR   P07988    , PSPB_HUMAN , T; P50405    , PSPB_MOUSE , T;
DR   P15285    , PSPB_RABIT , T; P22355    , PSPB_RAT   , T;
DR   Q6NUJ1    , SAPL1_HUMAN, T; Q8C1C1    , SAPL1_MOUSE, T;
DR   P26779    , SAP_BOVIN  , T; O13035    , SAP_CHICK  , T;
DR   P07602    , SAP_HUMAN  , T; Q61207    , SAP_MOUSE  , T;
DR   P10960    , SAP_RAT    , T;
DR   E7E2N8    , GILT_CARAU , ?;
PR   PRU00414;
DO   PDOC51110;
//