Entry: PS51115

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] LAMININ_IVA
Accession [info] PS51115
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51115
Associated ProRule [info] PRU00458

Name and characterization of the entry

Description [info] Laminin IV type A domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=176;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=171;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.6271324; R2=0.0219473; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8609.00572; R2=26.79977; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; N_SCORE=10.0; H_SCORE=17614; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=223; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14559; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -7, -5,-26, -6, -1,-20,-10, -5,-12, -3,-14, -3, -3, -9,  4, -3, -3, -5,-12,-25,-12,  1;
/M: SY='D'; M=-10, 10,-24, 14,  2,-20, -9, -5,-19, -7,-13,-10,  4,-13, -2, -7,  0, -2,-16,-29,-12,  0;
/M: SY='M'; M= -6, -8,-23,-10, -9,-10,-14,-11, -4, -7, -3,  3, -7,-11, -9, -8,-10, -7, -4,-22, -9,-10;
/M: SY='E'; M= -7,  2,-26,  3,  7,-19,-12, -4,-20, -3,-17,-13,  1, -9,  2, -3, -2, -7,-18,-18,-12,  4;
/M: SY='G'; M= -5, -4,-27, -2, -5,-25, 16,-13,-26, -9,-23,-16, -2, -2, -9,-12,  0, -8,-20,-25,-20, -8;
/M: SY='W'; M=-16,-34,-34,-36,-27, 24,-26,-26, -2,-23, -1, -6,-31,-28,-25,-20,-29,-19, -7, 67, 20,-22;
/M: SY='T'; M= -5, -9,-23,-12, -5,-13,-19, -3,-12,  0,-13, -6, -6,-17, -1,  0, -3,  1, -8,-11, -2, -4;
/M: SY='L'; M= -2,-19,-21,-21,-14, -8,-15,-18,  5,-16, 12,  6,-16,-21,-10,-12,-11, -4,  4,-22, -9,-13;
/M: SY='T'; M=  0, -8,-16,-11, -6,-12,-19,-15, -2, -8, -5, -1, -8,-16, -6, -8,  4, 12,  5,-28,-11, -7;
/M: SY='N'; M= -4, 17,-22, 16,  6,-25, -5, -1,-23, -1,-25,-17, 18,-12,  5, -5, 10,  1,-22,-31,-15,  5;
/M: SY='L'; M= -4,-11,-21,-11,-11,-11,-18,-14,  0,-10,  3,  1,-10,-18,-10, -4, -7, -4,  3,-26,-11,-12;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-26,  6,  7,-24, -5, -7,-21,  0,-19,-13,  2,-10,  3, -4,  1, -3,-19,-25,-13,  5;
/M: SY='G'; M= -4, -7,-24, -7, -9,-20, 12,-12,-19, -8,-16, -6, -4,-18, -6, -4, -1, -9,-11,-24,-17, -8;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='S'; M= -3, -3,-17, -4, -2,-17,-10,-10,-14, -2,-17,-11,  1, -3, -1,  2,  9,  9, -9,-26,-14, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -5, -6,-26, -5,  4,-21,-16, -7,-16,  2,-17, -9, -4,  2,  4,  1, -1, -3,-15,-26,-14,  2;
/M:         M= -1, -6,-21, -7, -1,-14,-19, -7, -6, -7, -8, -4, -6,-14, -2, -6, -2, -2, -1,-26,-10, -2;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-29,  1,  2,-25,-14,-15,-18, -6,-23,-16, -6, 28, -6,-12,  0, -1,-18,-31,-22, -5;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='V'; M= -2,-16,-19,-17,-13, -7,-17,-16,  4,-13,  1,  0,-14,-16,-12,-14, -7, -4,  8,-20, -7,-13; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='E'; M= -5,  0,-23,  2, 13,-22,-17, -2,-14,  0,-15, -8, -2, -4, 11, -4,  1, -3,-14,-26,-12, 12; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='W'; M= -9,-18,-29,-18,-11, -2,-14,-14,-10,-13, -5, -5,-16, -9,-10,-12,-14,-11,-13,  6,  1,-10;
/M: SY='N'; M= -3,  2,-22,  2, -1,-20, -4, -2,-19, -5,-20,-13,  6,-12, -2, -5,  6, -3,-14,-30,-15, -2;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-22, -3,  4,-20,-15, -8,-15, -4,-18,-11, -1,  4,  1, -8,  6,  4,-13,-29,-15,  2;
/M: SY='N'; M= -5,  7,-21,  5,  3,-20, -7,  1,-21, -4,-20,-14, 11,-10, -1, -4,  8,  5,-18,-31,-13,  0;
/M: SY='S'; M= -7,  3,-24,  3, -2,-23, -3, -5,-22, -5,-21,-14,  5, -6,  0, -2,  6,  1,-19,-28,-15, -2;
/M: SY='Q'; M= -7, -7,-20,-10, -4,-15,-14, -6, -9, -5, -4,  0, -4,-17,  1, -2, -9, -8,-10,-24,-10, -3;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-21, -4,  2,-16,-13, -8,-11, -4,-10, -4, -3,-15,  1, -5,  1, -2, -8,-27,-12,  1;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-21,-32,-24,  6,-30,-22, 27,-25, 24, 16,-24,-25,-20,-22,-19, -8, 20,-18,  1,-24;
/M: SY='S'; M=  2,  2,-18,  2, -5,-17, -6,-13,-13,-10,-12,-10, -1,-16, -8,-12,  6,  2, -5,-30,-15, -6;
/M: SY='F'; M= -7,-18,-22,-22,-18, 16,-21,-13,  1,-17,  4,  0,-14,-16,-19,-15,-12, -6,  0,-11,  8,-18;
/M: SY='S'; M= -2,  1,-21,  0,  3,-22, -8, -9,-17, -2,-19,-12,  4,-12,  5, -1, 10,  7,-14,-29,-15,  4;
/M: SY='S'; M=  3, -1,-19, -3, -2,-14, -8, -5,-14, -8,-10, -8,  2,-15, -5, -8,  4,  1,-11,-28,-12, -4;
/M:         M= -9, -5,-23, -6, -3, -2,-18, -7,-13, -9, -9, -8, -4,-10, -6, -6, -3, -1,-11,-21, -4, -5;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-27,  9, 18,-27, -4,  1,-28,  1,-22,-15,  2, -4,  7,  0,  2, -8,-24,-29,-18, 11;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='H'; M= -6, -4,-20, -8, -6, -6,-16,  2, -5, -7, -8, -1,  0,-11, -2, -7, -4, -4, -7,-18,  0, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-19,-11, -4, -5,-16, -2, -8, -4, -5, -2, -6, -9,  1,  3, -4, -4, -8,-17, -4, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -3,  0,-15,  1,  0,-10, -9, -7, -7, -4, -4, -5, -1, -6, -3, -5, -3, -4, -7,-17, -8, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='A'; M=  2, -8,-14, -9, -4, -9, -8, -8, -7, -5, -6, -5, -5, -8, -4, -1,  1,  0, -4,-17, -7, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-22,  7, 13,-22, -7,  5,-22, -2,-18,-13,  3, -2,  4, -3,  3, -4,-20,-26,-13,  7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='P'; M=  0, -7,-22, -5, -2,-20,-12,-13,-15, -7,-18,-12, -6, 18, -6,-12,  5,  5,-12,-28,-18, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='Y'; M= -7,-22,-22,-24,-20, 13,-24,-11,  6,-16,  5,  1,-19,-21,-18,-14,-15, -7,  5,  3, 18,-19; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='Y'; M=-18,-21,-28,-21,-18, 29,-29, 10, -1,-12, -1, -1,-20,-28,-13,-12,-18, -9, -7, 25, 61,-18;
/M: SY='W'; M=-14,-33,-36,-36,-27, 24,-22,-25,-10,-22, -7,-11,-30,-28,-23,-20,-28,-20,-16, 83, 23,-21;
/M: SY='Q'; M=  0,-11,-22,-12, -5,-20,-14,-13,-10,  0,-13, -6, -8, -6,  1,  1,  0, -2, -6,-26,-14, -3;
/M: SY='L'; M= 14,-20,-17,-24,-15, -7,-17,-20,  5,-18, 15,  5,-20,-14,-14,-17,-11, -6,  5,-21,-11,-15;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-36,-10, -2,-27,-15,-19,-19,-11,-27,-18,-17, 72,-10,-19, -6, -8,-27,-30,-28,-10;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-24,  6, 13,-22,-15, -5,-19,  1,-16,-13,  0, -4,  6, -5,  2, -3,-17,-25,-11,  9; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='Q'; M= -3, -5,-23, -5,  2,-22,-11, -5,-16,  5,-18, -8, -2, -7, 10,  4,  2, -2,-14,-23,-11,  5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-20,-30,-24, 48,-27, -8,  4,-21,  9,  4,-19,-27,-26,-15,-18, -8,  2,  9, 34,-23; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-20,-21,-11,  0,-22,-14,  7,-17, 27, 11,-20,-23, -9,-11,-20, -6,  1,-19, -2,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-26, -7,-16,-26, 57,-14,-35,-17,-27,-18,  4,-18,-16,-16,  0,-17,-27,-20,-26,-16; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='B'; M=-14, 37,-24, 37,  8,-29, -8,  3,-26,  1,-27,-22, 33,-16,  1, -4,  3, -5,-25,-38,-19,  4;
/M: SY='Q'; M=-11, -5,-28, -6,  6,-24,-20,  2,-19, 19,-15, -2, -3,-14, 20, 19, -7, -9,-19,-21, -6, 12;
/M: SY='L'; M= -7,-23,-18,-24,-18,  1,-26,-20, 12,-16, 16,  8,-20,-25,-16, -8,-12,  0, 15,-24, -5,-18;
/M: SY='T'; M=  0, -5,-17, -8, -8,-10,-14,-12, -9, -9, -8, -6, -3,-12, -8, -9,  7, 12, -5,-25, -7, -8;
/M: SY='S'; M= 20, -4,-12, -7, -5,-19,  3,-13,-17,-11,-23,-16,  2,-11, -5,-14, 26, 11, -8,-30,-17, -5;
/M: SY='Y'; M=-17,-20,-29,-20,-21, 26,-20, 12, -3,-12, -2, -2,-18,-29,-13,-12,-18,-11, -9, 22, 63,-21;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-29, -7,-18,-25, 56,-14,-35,-17,-28,-19,  5,-21,-17,-17,  0,-17,-29,-19,-22,-18;
/M: SY='G'; M= -2,-10,-28,-10,-11,-27, 36,-13,-30,-12,-21,-13, -2,-19, -4, -8, -1,-14,-24,-21,-22, -8;
/M: SY='K'; M=-10, -2,-24, -4, -1, -5,-19, -4,-15,  1,-13, -9,  0,-12, -2,  0, -4, -2,-14,-18,  1, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-29,-20, 10,-29,-17, 18,-27, 40, 19,-27,-29,-18,-19,-25, -9,  9,-17,  4,-19;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-23, -8, -2,-16,-19,  4,-17,  8,-16, -7,  0,-16,  3, 15,  0,  3,-12,-23, -2, -1;
/M: SY='Y'; M=-13,-23,-23,-28,-22, 41,-27, -2,  1,-19,  7,  1,-19,-28,-22,-15,-17, -8, -3, 12, 44,-22;
/M: SY='T'; M= -3,  2,-20, -1,  2,-19,-15,-12,-18,  5,-17,-11,  1, -9, -1, -1,  6, 14,-11,-27,-12,  0;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-19,-30,-23,  8,-29,-22, 22,-24, 20, 13,-23,-26,-21,-20,-16, -5, 21,-20,  0,-23;
/M: SY='R'; M= -8, -8,-23, -9, -4, -8,-18, -1,-15,  1,-14, -8, -4,-17,  0,  7, -1, -1,-12,-13,  1, -3;
/M: SY='Y'; M=-10,-17,-24,-20,-15, 14,-19, -5, -2,-15, -3, -3,-14,-24,-14,-13,-11, -7, -2,  3, 21,-15;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-22,  8, 10,-17,-17, -6,-16, -2,-15,-12, -1, -7, -1, -4,  2,  1,-11,-26,-10,  4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-21, -7, -7,-17,  0,-13,-13, -8,-12, -9, -4,  3, -8, -7, -2, -4,-12,-22,-16, -9; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-19, -9, -8,-18, 10, -7,-22,-10,-16,-11, -1,-18, -5, -7,  0, -6,-17,-24,-15, -7;
/M: SY='D'; M=-10,  5,-28, 11,  3,-26,  4, -6,-27, -3,-24,-17,  2, -6, -5, -2, -2,-10,-21,-27,-17, -3;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-22, -7, -1,-19, -3, -7,-21,  3,-18, -8,  0,-15,  2, 10,  4,  2,-15,-24,-12, -1;
/M: SY='D'; M= -6,  0,-26,  2, -1,-25,  1, -7,-22, -5,-22,-13,  1,  1, -4, -7,  0, -6,-18,-29,-19, -4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L'; M= -5,-16,-21,-16,-12, -6,-16,-14,  2,-16,  9,  4,-15,-13,-10,-13,-10, -3, -1,-21, -5,-12; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M:         M= -5, -6,-13, -7,  0, -2,-12, -1, -3, -6, -2,  0, -4, -6, -3, -6, -3, -2, -4,-14, -3, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S'; M= -4, -6,-23, -5, -4,-17, -6, -9,-16, -8,-20,-12, -1,  0, -3, -9,  7,  0,-14,-26,-12, -5;
/M: SY='E'; M= -2, -1,-23,  0,  1,-21,-11, -3,-16,  1,-16,-10, -2,-13, -1,  0, -2, -6,-10,-26,-11, -1;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-30, -4,  6,-25,-16,-11,-18, -4,-22,-15,-12, 41, -1,-12, -5, -8,-23,-25,-19,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D'; M=-14, 28,-20, 39, 12,-29,-11, -1,-27, -1,-19,-17, 11,-11,  4, -7, -1, -8,-21,-31,-15,  8; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-31,-28,  2,-32,-27, 31,-23, 17, 13,-28,-28,-27,-21,-15, -3, 40,-25, -5,-28;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-23,-27,-18, -6,-30,-21, 23,-17, 11, 11,-17,-21,-10,-14,-12, -4, 18,-23, -5,-16;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-24,-30,-21,  4,-27,-23, 23,-27, 31, 15,-24,-25,-19,-22,-23,-10, 13,-20, -2,-21;
/M: SY='E'; M= -9, -2,-25, -1, 12,-20,-18, -3,-17,  5,-15, -7, -3,-12,  9,  4, -2, -2,-13,-25,-10, 10;
/M: SY='G'; M=  0, -7,-28, -8,-16,-28, 55,-11,-37,-16,-29,-18,  3,-19,-16,-16,  1,-17,-28,-22,-25,-16;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='N'; M=  4, 10,-20,  2, -2,-22,  8, -1,-22, -3,-23,-15, 19,-15, -2, -4,  6, -4,-20,-27,-18, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='G'; M= -6,  9,-24,  7, -4,-25, 16, -1,-27, -6,-22,-15, 14,-16, -2, -5,  2, -8,-24,-27,-18, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='M'; M= -6,-12,-18,-15,-10, -3,-16,-10,  3, -7,  6,  7, -9,-13, -7, -5,-10, -5,  0,-15, -2,-10; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='R'; M= -1, -6,-15, -7, -1,-12,-11, -6, -9,  4, -8, -4, -3,-10,  3, 10,  0,  0, -6,-16, -8,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-20,-28,-20,  3,-28,-17, 25,-23, 27, 19,-21,-22,-15,-19,-20, -8, 17,-19, -1,-19; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='S'; M= -1, -4,-15, -6, -3,-13,-14, -5, -6, -7,-10, -5, -1,-12, -3, -6,  8,  8, -2,-27, -9, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='Y'; M= -7,-15,-19,-18,-13,  0,-22,  5,  3,-15,  5,  4,-11,-20, -9,-10, -9, -2,  2,-17,  7,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -8,-10,-25, -9, -3,-14,-18,  5,-16,  3,-16, -8, -6, -2, -1,  7, -4, -5,-14,-17,  0, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='M'; M= -5,-14,-23,-16, -7, -6,-20,  0,  1,-13,  3,  5,-12,-16, -6,-12, -9, -6, -2,-19,  2, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -8, -8,-25, -8, -2,-10,-20, -6,-11, -1,-11, -6, -7, -9, -3,  2, -4, -3,-10,-18, -4, -4;
/M: SY='A'; M= 13, -6,-20, -8,  4,-21, -7,-12,-15, -6,-14,-11, -4,-10,  2, -9,  6, -1,-12,-19,-15,  3;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-28,  2,  9,-22,-20, -8,-16, -4,-15,-11, -7,  9,  6, -9, -3, -3,-18,-22,-11,  6;
/M:         M= -3, -9,-25,-11, -7, -8,  0, -8,-18,-12,-17,-12, -4, -1,-10,-11,  0, -5,-17,-21,-10, -9;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M:         M= -9,-10,-24,-12, -7,-11,-16, -4, -7, -8, -5, -4, -4, -7, -4, -4, -7, -5,-10,-15, -6, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='P'; M= -7, -7,-27, -2,  3,-21,-11, -8,-18, -6,-21,-15, -8, 33, -3,-11, -2, -5,-20,-23,-15, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='M'; M= -8, -8,-19,-10, -7, -5,-13,  0, -5, -7, -4,  1, -5, -3, -2, -5, -7, -4, -8,-14,  0, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='P'; M= -7, -4,-21, -2, -1,-15, -9, -4,-13, -4,-12, -9, -3,  7, -2, -2, -3, -5,-13,-20,-11, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-14,  1,  3,-16,-12,-11,-10, -8,-11,-10, -3,  2, -5,-10,  2,  2, -9,-25,-14, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='R'; M=-12,  5,-28,  6,  8,-22, -4,  4,-26,  3,-21,-14,  8,-11,  5, 10, -2, -9,-25,-24,-11,  5; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='H'; M=-11, -2,-26, -1,  8,-22,-15, 13,-20,  1,-15, -6,  0,-14, 13,  6, -2, -5,-19,-25, -5,  8;
/M: SY='E'; M= -3, -3,-22, -2,  4,-21,-11,-10,-16, -5,-16,-11, -3, -2, -1, -8,  3,  2,-11,-29,-16,  0;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-24,-10, -5, -7,-18,  1, -8, -1, -9, -3, -1,-20, -3,  2, -7, -7, -7,-20,  1, -5;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-23, -2,  5,-16,-18, -7,-14, -2,-13,-10, -1, -9,  1, -1,  1,  5,-10,-26,-10,  2;
/M: SY='Y'; M=-10,-19,-22,-23,-20,  9,-22,-10,  9,-15,  2,  5,-14,-26,-15,-12,-12, -7, 10,-12, 11,-19;
/M: SY='T'; M= -1,-11,-19,-14, -7,-15,-20,-16, -2, -5, -7, -3, -9,-10, -4, -7,  2,  7,  3,-27,-12, -6;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='F'; M=-10,-22,-17,-27,-20, 14,-28,-15, 13,-20, 12,  8,-17,-24,-20,-15,-15, -5, 12,-17,  3,-20; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='R'; M=-12, -7,-26, -6,  5,-20,-18, -5,-21, 19,-17, -8, -3, -8,  9, 32, -7, -7,-16,-21,-11,  4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='L'; M= -8,-16,-17,-17, -6,  5,-22,-10,  8,-15, 14,  8,-15,-17,-11,-12,-13, -6,  5,-16,  0, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-18, -6,  1, -5,-13, -6, -7, -3, -7, -5, -3,-10, -4, -3, -5, -5, -7,-11, -4, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-28,  3, 16,-14,-14,  6,-22, -4,-16,-13, -1, -7,  2, -5, -5, -9,-23,-15, -5,  8; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-25,  0, 10,-18,-10, -4,-21,  1,-18,-13,  2,-13,  5,  3,  0, -4,-20,-18,-10,  7;
/M: SY='H'; M= -8, -4,-25, -8, -5, -2,-12,  8,-18, -8,-14, -9,  2,-20, -5, -5, -7, -9,-18, -6,  3, -6;
/M: SY='W'; M=-11,-13,-30,-13, -8, -3,-18,-12,-17, -7,-15,-12,-13,-11, -8, -5,-11, -6,-17, 17,  4, -8;
/M: SY='B'; M=-11,  7,-26,  7,  3,-22, -9,  3,-19, -1,-18,-11,  7,-16,  6,  2,  0, -6,-18,-26, -8,  3;
/M: SY='H'; M=-10, -4,-24, -4,  2, -9,-18, 10,-20,  0,-16,-10, -1,-13,  1,  7, -1, -2,-17,-20,  2,  0;
/M: SY='E'; M= -4, -4,-25, -2,  3,-20, -8, -4,-18, -6,-19,-13, -2,  1, -2, -7,  3, -3,-16,-27,-13, -1;
/M: SY='S'; M= -1,  2,-23,  3, -4,-18,-12, -8,-19, -9,-20,-16, -1,-11, -7,-13,  4,  2,-14, -6, -9, -5;
/M: SY='G'; M= -6, -6,-28, -5, -1,-24, 15, -2,-30, -2,-25,-15,  1,-10, -2,  4,  0,-11,-25,-23,-16, -3;
/M: SY='P'; M= -6, -6,-26, -4,  0,-20,-15, -9,-16,  2,-17,-10, -4,  5,  2,  3, -4, -6,-15,-25,-14, -1;
/M: SY='P'; M=  1, -9,-26, -7,  2,-25,-15,-13,-18, -5,-23,-15, -8, 31, -2,-10,  4,  2,-18,-29,-21, -2;
/M: SY='V'; M=  7,-22,-15,-25,-20, -6,-22,-22, 14,-16,  9,  5,-19,-23,-18,-14, -8, -3, 21,-25,-10,-19;
/M: SY='T'; M= -3,  6,-17,  4,  2,-20,-13,-11,-19, -3,-21,-16,  7, -6,  0, -3, 17, 22,-12,-33,-15,  0;
/M: SY='R'; M=-14, -7,-29, -6,  5,-20,-17,  1,-28, 21,-20,-11, -1,-13,  8, 43, -6, -8,-20,-21, -9,  3;
/M: SY='E'; M= -4,  0,-24,  2, 17,-10,-16, -8,-19,  0,-11,-12, -3,-12,  0, -4, -2, -7,-16,-23,-11,  9;
/M: SY='D'; M=-14, 11,-28, 17, 15,-23,-15, 15,-23, -3,-17, -8,  4,-13, 11, -5, -5,-11,-23,-27, -6, 12;
/M: SY='F'; M=-13,-27,-20,-33,-24, 36,-29,-17, 11,-26, 24, 14,-23,-27,-25,-18,-21, -6,  6, -7, 13,-23;
/M: SY='M'; M= -9,-21,-21,-26,-16, -2,-24, -9, 15,-14, 22, 34,-20,-22, -3,-10,-19, -7,  8,-21, -2,-10;
/M: SY='M'; M= -4,-11,-20,-15,-10,-12,-15, -9, -2, -3, -2, 13, -9,-17, -2, -1, -3,  0,  0,-25, -9, -7;
/M: SY='V'; M=  9,-23,-16,-26,-20, -6,-22,-25, 15,-19, 10,  5,-22,-16,-20,-21, -8, -1, 20,-24,-11,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-20,-28,-18,  7,-28,-18, 16,-26, 43, 17,-27,-29,-17,-14,-26, -9,  7,-21, -1,-18;
/M: SY='A'; M= 13, -5,-17, -9, -4,-17, -9, -6,-13, -6,-13, -9, -3,-14,  1, -6,  9,  3, -8,-24,-10, -2;
/M: SY='N'; M=-10, 29,-23, 26,  7,-25, -3,  3,-26, -1,-26,-20, 31,-15,  0, -2,  7, -3,-26,-37,-19,  3;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-22,-30,-21,  2,-31,-22, 24,-23, 29, 15,-24,-26,-17,-16,-21, -7, 18,-22, -3,-20;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-24, 14, 12,-24,-16,  3,-23,  0,-16,-13,  4,-11,  5, -3,  2,  4,-18,-30,-11,  8;
/M: SY='A'; M=  6, -3,-20, -6, -3,-17, -8,  5,-14, -7,-15, -9,  0,-15, -3, -7,  3, -3,-10,-24, -6, -4;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-36,-27,  7,-35,-27, 36,-28, 25, 17,-24,-25,-23,-25,-21, -8, 26,-20,  0,-27;
/M: SY='L'; M=-12,-20,-23,-22,-14,  5,-26,-11,  3, -9, 17,  9,-18,-24, -9, -2,-18, -7, -1,-14,  7,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-27,-35,-27, -1,-31,-27, 37,-26, 18, 16,-20,-22,-20,-24,-19,-10, 24,-21, -3,-27;
/M: SY='R'; M=-14, -9,-29,-10,  1,-21,-20, -3,-25, 25,-17, -7, -3,-18, 12, 47,-10,-10,-19,-16, -9,  4;
/M: SY='A'; M= 25,-10,-16,-17,-13,-19,  8,-13,-13,-13,-12, -8, -7,-14,-11,-18,  6, -1, -6,-22,-17,-13;
/M: SY='T'; M= -1, -6,-15,-12,-10, -5,-16,-16, -8,-12, -9, -7, -2,-11,-10,-10, 12, 22, -2,-27, -9,-10;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='Y'; M=-16,-18,-27,-19,-18, 25,-24, 13, -4,-10, -2, -2,-16,-24,-11, -8,-16, -8,-10, 19, 58,-18; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='N'; M= -4,  0,-16, -4, -6, -7, -2,  0,-13, -7,-13, -8,  6,-14, -4, -6,  2, -2,-11,-12, -5, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-21,  0,  3,-24, -1,-10,-22, -5,-23,-15,  3, -4,  4, -7, 12,  8,-18,-29,-19,  3;
/M: SY='Q'; M= -4, -1,-23, -1,  2,-19,-14, -1,-14, -4,-13, -6, -2,-11,  3, -6,  0, -2,-11,-25, -8,  2;
/M: SY='Q'; M= -7, -6,-22, -7,  1,-18,-17, -6,-16,  2,-14, -4, -5, -6,  8,  5, -2, -2,-15,-22, -8,  3;
/M: SY='A'; M=  4, -7,-20, -9, -6,-18, -1,-12,-14, -7,-10, -6, -4,-16, -2, -5,  4, -1,-10,-26,-15, -5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E'; M=  1,  0,-21,  0, 12,-22,-15, -8,-13, -2,-14,-10, -2, -7,  7, -6,  4,  0,-11,-24,-14,  9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='S'; M=  8,-11,-14,-14,-11,-10, -4,-18, -6,-14, -9, -8, -7,-16,-13,-15, 10,  9,  3,-26,-14,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-23,-10, -9,-11, -8, -4,-12, -4,-13, -8, -1,-19, -5,  4,  0, -2, -9,-21, -3, -9;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-23,-29,-18,  3,-28,-22, 23,-27, 34, 16,-24,-25,-18,-21,-24,-10, 12,-21, -2,-19;
/M: SY='S'; M= -1,  1,-16,  2,  1,-17,-11, -9,-15, -7,-17,-13,  2,-15, -2, -7, 11,  3, -9,-30,-13, -1;
/M: SY='D'; M= -7, 16,-25, 19, 11,-27, -1, -3,-27, -1,-25,-19, 14,-13,  2, -4,  5, -5,-23,-31,-18,  6;
/M: SY='V'; M= -1,-29,-16,-32,-28,  2,-31,-28, 31,-23, 16, 12,-26,-26,-26,-23,-14, -4, 37,-25, -6,-28;
/M: SY='S'; M=  1,  2,-18,  0,  2,-18, -7, -4,-17, -7,-18,-12,  5,-14, -1, -6, 13,  7,-11,-31,-13,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-26,-13,  5,-27,-15, 15,-21, 33, 23,-25,-25,-12,-16,-24,-10,  7,-17, -1,-13;
/M: SY='D'; M= -6, 14,-25, 21, 17,-24,-10, -6,-24, -3,-19,-18,  4,-10,  2, -9,  3, -2,-19,-29,-15,  9;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='T'; M=  4,-12,-13,-15,-13, -9,-16,-18,  4,-14, -6, -3, -8,-16,-12,-14,  9, 12, 11,-28,-10,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='A'; M= 35, -8,-11,-15, -9,-19,  5,-18,-12,-10,-12,-11, -7, -8, -9,-17, 10,  2, -4,-20,-19, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M= -4,-11,-20,-12, -8,-14,-13, -7, -8, -8,-12, -6, -8,-17, -7, -3,  1,  1,  0,-22, -8, -9;
/M: SY='P'; M= -9, -5,-31,  1,  2,-27,-13,-11,-23, -3,-26,-18, -7, 35, -5, -7, -2, -4,-23,-30,-22, -4;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-23,  0,  1,-20,  4, -2,-23, -5,-20,-14,  3,-15, -2, -5,  5, -3,-18,-23,-10, -2;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='A'; M=  4, -6,-21, -7, -4,-18, -3,-11,-17, -8,-15,-12, -4,  2, -7, -9,  3,  0,-13,-24,-16, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-16, -1, -1,-16, -9,-12,-13, -2,-13,-10, -1, -6, -3, -6,  6, 10, -8,-23,-12, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-26, -5, -9,-23, 18,-10,-24,-11,-17,-13, -1,-12, -9, -8, -1, -9,-20,-25,-19, -9;
/M:         M=  0,-10,-24,-10, -4,-18, -9, -8,-14, -5,-11, -8, -8, -2, -6, -5, -4, -5,-12,-24,-13, -7;
/M: SY='P'; M= -4,-12,-27,-11, -5,-21,-15, -7,-12, -7,-17, -9, -9, 16, -4, -8, -2, -3,-13,-28,-15, -7;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='A'; M= 34,-10,-11,-17, -8,-17, -4,-17, -8, -9, -8, -8, -9,-11, -8,-15,  9,  2,  0,-21,-17, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-15;
/M: SY='S'; M=  6, -8,-16,-10, -7,-11,-10, -8,-10,-10, -9, -8, -5,-10, -7,-10,  7,  7, -6,-20, -7, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='W'; M= -5, -8,-29, -7,  2,-13, -9,-14,-17,-10,-12,-13,-10,-14, -5,-13, -8,-10,-18,  8, -7, -1;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-14,-29,-26, -1,-30,-27, 29,-20, 12, 14,-27,-27,-25,-20,-12, -3, 41,-28, -8,-26;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-30, 18, 57,-28,-20, -1,-28,  8,-17,-18, -1, -1, 18, -1, -1,-10,-28,-30,-19, 38;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-25, -4,  7,-21,-21,  3,-12,  3,-10, -2, -2,-15, 14,  5, -4, -5,-12,-25, -9, 10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 33 in 24 different sequences
Number of true positive hits 33 in 24 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Laminin IV type A
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
24 sequences

EPI1_CAEEL  (Q21313), LAM2_CAEEL  (Q18823), LAMA1_HUMAN (P25391), 
LAMA1_MOUSE (P19137), LAMA2_HUMAN (P24043), LAMA2_MOUSE (Q60675), 
LAMA3_HUMAN (Q16787), LAMA3_MOUSE (Q61789), LAMA5_HUMAN (O15230), 
LAMA5_MOUSE (Q61001), LAMA_DROME  (Q00174), LAMC1_DANRE (Q1LVF0), 
LAMC1_DROME (P15215), LAMC1_HUMAN (P11047), LAMC1_MOUSE (P02468), 
LAMC1_XENTR (A0JP86), LAMC2_HORSE (Q8HZI9), LAMC2_HUMAN (Q13753), 
LAMC2_MOUSE (Q61092), LAMC3_HUMAN (Q9Y6N6), LAMC3_MOUSE (Q9R0B6), 
PGBM_HUMAN  (P98160), PGBM_MOUSE  (Q05793), UNC52_CAEEL (Q06561)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission