Entry: PS51116

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] LAMININ_IVB
Accession [info] PS51116
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51115
Associated ProRule [info] PRU00462

Name and characterization of the entry

Description [info] Laminin IV type A domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=214;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=209;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2350960; R2=0.0123001; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-18557.11970; R2=56.41646; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=510; N_SCORE=8.5; H_SCORE=30807; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=347; N_SCORE=6.5; H_SCORE=1019; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='F'; M=-18,-23, -5,-30,-21, 34,-27,-16,-10,-14,  2, -3,-16,-29,-24,  3,-17,-10, -6, -8,  9,-21;
/M: SY='A'; M= 13,-20,-22,-26,-17,-12,-21,-24, 13,-18, -1,  1,-16,  0,-15,-23, -5, -3, 10,-23,-13,-19;
/M: SY='P'; M= -5, -6,-25, -5, -7, -8,-18,-11,-13,-12,-16,-12, -7, 16,-14,-16, -4, -3,-12,-25,-12,-11;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-29,-21,  6,-30,-22, 22,-27, 37, 16,-26,-27,-20,-20,-22, -3, 15,-22, -2,-21;
/M: SY='D'; M=-13, 23,-24, 28,  5,-23,-15, -6,-21, -2,-12,-15, 12,-15, -4, -7, -3, -1,-18,-33,-14,  0;
/M: SY='H'; M=-19, -7,-30, -7, -4, -7,-21, 63,-25, -9,-17, -3,  2,-11,  1,  2,-11,-17,-25,-24, 14, -5;
/M: SY='Y'; M=-17,-15,-28,-13, -3, 11,-27,  8, -5, -6,  2, -2,-16,-23, -4, -2,-17,-10,-12,  6, 40, -7;
/M: SY='V'; M= -5,-19,-19,-25,-19, -4,-29,-24, 18,-15, 11,  7,-17,-20,-17,-15, -8,  8, 19,-25, -6,-19;
/M: SY='Y'; M=-19,-21,-32,-21,-18, 16,-27, 14, -7,-10, -2, -2,-19,-28, -9, -4,-22,-14,-14, 34, 51,-16;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 18, 56,-31,-20,  1,-29, 10,-20,-18,  0, -1, 24,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 40;
/M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-19,-10,-19, -2,-20,-10,-10,-10,-10, -9,-10,-10,-19, 11,  5,  0,-21,-19,-10;
/M: SY='E'; M=-11,  8,-30, 17, 54,-29,-20,  0,-30, 12,-20,-19,  0, -2, 19,  6, -1,-10,-29,-29,-19, 36;
/M: SY='E'; M= -8, -3,-24,  1,  7, -9,-16, -7,-13, -3,-12,-10, -7,-16, -5, -3, -4, -7, -7,-20, -2,  0;
/M: SY='A'; M= 30,-12,-15,-18,-10,-19, -8,-19, -9, -7,-11, -9,-11, -3,-10,-11,  5,  1,  0,-22,-19,-11;
/M: SY='N'; M= -9,  9,-21,  6,  0,-21,-12,  1,-21,  5,-22,-14, 15,-16,  3, 12,  7,  5,-16,-32,-13,  0;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='L'; M= -7, -9,-16,-11, -2,  1,-19, -5, -4,-11,  5,  0, -8,-14, -3, -8, -4,  5, -5,-16, -1, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -4,-14,-12,-16,-19,-18, 25,-20,-23,-19,-10,-10, -8,-23,-18,-15, -5, -8,-16,-24,-21,-19;
/M: SY='Q'; M=-10, -8,-30, -7,  6,-29,-20,  3,-15,  2,-19, -5, -4,  6, 24,  6, -2, -8,-21,-24,-12, 13;
/M: SY='G'; M=  1, -8,-24,-11,-15,-22, 26,-16,-20,-15,-21,-11, -1,-10,-15,-17,  2, -9,-14,-26,-23,-15;
/M: SY='L'; M= -8,-21,  0,-21,-13, -2,-23,-17,  3,-21, 14,  3,-22,-27,-17,-18,-17, -9,  5,-23, -3,-16;
/M: SY='S'; M=  6, -4,-18, -3,  1,-22, -5,-13,-14, -5,-17,-11, -3,-13, -1, -9, 10,  2, -5,-29,-17,  0;
/M: SY='V'; M=  1,-23,-19,-24,-19,-10,-26,-25, 14,-10, -1,  3,-22, -8,-19,-15, -9, -4, 23,-27,-12,-20;
/M: SY='V'; M= -4,-20,-14,-23,-22,  0,-26,-22, 17,-20, 15,  7,-18,-27,-22,-17,-10,  4, 25,-28, -8,-22;
/M: SY='E'; M= -8, -7,-28, -3, 13,-23, -1,-10,-21, -2,-13,-11, -7, -9,  2,  0, -5,-11,-17,-25,-18,  6;
/M: SY='R'; M=-14, -1,-26, -2,  8,-21,-15,  0,-28, 19,-22,-14,  7,-16,  9, 44,  0, -5,-21,-26,-14,  5;
/M: SY='E'; M=-11, -7,-17, -5, 14,-19,-21, -9,-18, -5,-10,-10,-10,-10,  8, -8,-11,-12,-22, -6,-10, 12;
/M: SY='R'; M= -9,-14,-24,-14, -9,-12,-21, -7,-10, -3,-11, -7,-10,  0, -7,  6, -3,  2, -5,-23, -5,-11;
/M: SY='T'; M=  3,-14,-20,-19,-12, -1,-19,-13, -4,-16, -4, -5,-11,  0,-14,-17, -1,  6, -4,-22, -7,-14;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-25, -2, -1,-25, -3, -3,-14, -4,-19, -8, 12,-11, 11, -5,  1, -7,-18,-27,-17,  5;
/M: SY='D'; M= -7, 14,-28, 21,  5,-32,  1, -6,-30, -1,-25,-19,  5, -6,  4, -3,  1, -7,-24,-29,-19,  4;
/M: SY='R'; M=-13, -1,-27,  2, 17,-24,-17, 18,-28, 10,-21,-11,  3,-13, 16, 23,  0, -8,-24,-27, -8, 14;
/M: SY='T'; M= -6, -1,-23,  0,  5,-20,-18,-13,-13, -5,-14,-11, -3,  3,  0, -9,  5,  9,-12,-30,-15,  1;
/M: SY='P'; M= 10,-15,-28,-15, -4,-25,-15,-17,-10, -9,-17,-10,-14, 33, -2,-17, -3, -7,-14,-24,-21, -5;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='T'; M=  2,  5,-12,  2, -3,-17,-11,-14,-17, -9,-20,-16,  6,-10, -5,-10, 26, 33, -7,-35,-15, -4;
/M: SY='W'; M=-20,-37,-42,-40,-30, 28,-23,-27,-15,-23,-12,-15,-35,-30,-25,-20,-35,-25,-22,115, 30,-23;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -6,-16,-29,-13, -1,-18,-22,-19, -4,-13,-10, -8,-16, 30, -9,-18, -7, -4,-10,-28,-19, -8;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='V'; M= 18,-20,-12,-25,-21, -8,-19,-25, 13,-16,  2,  2,-19,-20,-20,-20, -1,  4, 25,-25,-13,-21;
/M: SY='R'; M=-17, -4,-28, -6,  2,-21,-18,  1,-25, 21,-18, -8,  5,-19, 14, 50, -8, -9,-21,-22,-11,  4;
/M: SY='V'; M=  6,-26,-12,-28,-25, -2,-25,-25, 21,-19, 14, 11,-26,-26,-23,-19,-11, -2, 33,-26, -9,-24;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-28,-10,  0,-22,-19,-11,-12, -5,-14, -7,-11, 19,  6, -3, -3, -5,-15,-27,-17,  0;
/M: SY='E'; M=-11, 10,-31, 21, 48,-31,-19, -3,-30,  6,-22,-21, -1, 11, 14, -4, -1,-10,-30,-31,-21, 30;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -7,-18,-29, 63,-17,-38,-18,-30,-20,  6,-20,-18,-18,  1,-18,-30,-22,-29,-18;
/M: SY='A'; M= 17, -4,-16, -9, -1,-23,  0,-13,-18, -7,-17,-12, -2,-11,  3,-11, 13,  7,-11,-25,-18,  1;
/M:         M= -8,-14,-26,-16, -7, -7, -5,-16, -5,-15, -8, -6,-11,-18,-12,-16, -7, -6, -5, -8, -3,-11;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 19,-22, -2,-23;
/M: SY='E'; M= -9, -1,-24,  1, 20,-21,-21, -7,-21, 12,-16,-12, -3,-10,  7, 15,  0,  2,-14,-27,-14, 12;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 71,-30,-21,  3,-29, 10,  1,-21,-30,-39,-20,-19, -9,  6,  5, 25,-30;
/M: SY='T'; M=  0, -3,-19,-10, -8, -8,-15, -7,-10,-12, -7, -7,  2, -8, -7,-11,  3,  9,-10,-26, -9, -8;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='V'; M= -3,-27,-15,-30,-27,  0,-30,-27, 33,-21, 12, 12,-23,-23,-23,-21,-12, -3, 38,-23, -6,-27; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='N'; M= -4, 17,-22, 16,  1,-25,  0, -6,-24, -6,-27,-21, 19, -2, -4,-10, 11,  3,-22,-35,-21, -2;
/M: SY='N'; M= -9, 29,-21, 22,  2,-22, -6,  2,-18, -4,-24,-15, 35,-16, -1, -6,  8, -1,-21,-38,-18,  0;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-37,-29,  5,-36,-29, 40,-28, 20, 17,-23,-24,-23,-26,-19, -8, 31,-21, -1,-29;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-38, -6,  9,-31,-20,-15,-21, -6,-28,-18,-16, 71,  0,-15, -8,-10,-30,-29,-27,  0;
/M: SY='R'; M=-10,-15,-24,-18,-10,  5,-23, -6,-10,  5, -8, -3,-11,-21, -4, 12,-11, -8, -6, -8, 11, -8;
/M: SY='S'; M= 11, -5,-16, -7, -5,-20,  0,-15,-19,-11,-24,-17,  1,  1, -6,-14, 23, 15,-11,-32,-20, -6;
/M: SY='M'; M= -9,-20,-20,-27,-17, -4,-22, -4, 17,-11, 17, 44,-20,-21,  2,-10,-17, -9, 10,-21, -2, -8;
/M: SY='D'; M=-14, 26,-30, 37, 26,-34,-14, -2,-33,  8,-27,-23, 12,  0,  6, -3, -1, -9,-29,-34,-20, 16;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 15,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-14,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21;
/M: SY='D'; M=-15, 35,-26, 42, 11,-27,-12,  1,-29, -2,-25,-23, 20,-13, -1, -8,  2, -1,-25,-32,-10,  5;
/M: SY='I'; M= -2,-28,-19,-33,-26,  1,-31,-27, 31,-25, 21, 14,-25,-25,-22,-23,-17, -6, 29,-23, -5,-26;
/M: SY='I'; M=  0,-26,-19,-31,-24,  0,-28,-22, 27,-22, 20, 19,-24,-24,-19,-21,-16, -6, 24,-23, -5,-23;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29,  1,-37,-29, 42,-28, 23, 18,-23,-23,-22,-27,-20, -8, 31,-22, -2,-29;
/M: SY='R'; M=-20, -9,-30, -9,  0,-20,-20, 12,-30, 25,-20, -9,  1,-20, 10, 61,-10,-11,-21,-21, -6,  0;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-31,-20,-19, 21,-28, 23, -4,-12, -1, -1,-19,-29, -9,-10,-21,-13,-13, 31, 64,-18;
/M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 22, 49,-33,-19,  2,-29,  9,-21,-18,  2, -3, 25,  1,  0,-10,-30,-29,-18, 37;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M=  0,-15,-30,-10, -2,-26,-16,-19,-18,-10,-25,-18,-14, 58, -9,-18,  0,  1,-21,-30,-26, -9;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-28, -2, 16,-32,-21,  4,-19,  8,-15, -3, -2,-11, 41, 13, -1, -5,-24,-22,-10, 28;
/M: SY='V'; M= -4,-11,-16,-10,-13, -8,-19,-10,  4,-16,  4,  5,-12,-22,-13,-15, -3, -1, 11,-30, -9,-13;
/M: SY='P'; M= -4,-13,-31, -9, -1,-26,-17,-16,-20, -1,-26,-17,-11, 47, -5, -6, -1, -1,-22,-29,-23, -6;
/M: SY='D'; M= -3,  4,-25,  9,  7,-20,  6,-12,-24, -8,-18,-16, -2,-14, -8,-13, -1,-10,-16,-26,-18,  0;
/M: SY='D'; M=-12, 16,-28, 20,  9,-30, -5,  5,-27, -3,-23,-13,  9, -7,  9, -6,  0, -6,-25,-30,-15,  9;
/M: SY='W'; M=-18,-37,-47,-37,-28,  8,-19,-29,-20,-19,-21,-20,-37,-29,-19,-19,-35,-27,-29,137, 27,-19;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-25,  7, 34,-26,-17, -8,-24,  5,-18,-17, -3,  3,  9, -4,  3,  0,-21,-28,-19, 21;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='N'; M= -3, 11,-20,  7, 14,-22,-11, -2,-17,  4,-19,-12, 15,-11,  8,  0,  4, -1,-17,-28,-15, 11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V'; M=  4,-25,-16,-28,-22, -3,-26,-24, 22,-20, 15, 10,-24,-24,-18,-20,-12, -4, 26,-24, -8,-21;
/M: SY='Q'; M=-10,-14,-24,-15,  0, -9,-26,-11, -1, -2, -4,  1,-12,-18,  4,  3, -9, -8,  1,-21, -6,  1;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-21,-31,-24,  0,-29,-21, 30,-23, 18, 22,-21,-23,-17,-21,-14, -5, 24,-24, -4,-22;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='T'; M= -4, -4,-17, -8, -9,-12,-21,-16,  0, -8, -6, -2, -5,-13, -6,-10,  5, 18,  4,-27, -9, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-13,-29,-26,  2,-29,-26, 27,-22, 19, 12,-28,-28,-26,-19,-14, -3, 37,-26, -7,-26; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='I'; M= -7,-13,-21,-16, -8,-11,-24,-12, 13,-11,  3,  6, -9,-17,  1,-11, -8, -6,  9,-21, -7, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-26, -9,  0,-18,-17, -1,-25, 23,-18, -9, -1,-10,  7, 54, -9, -9,-18,-18,-10, -1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-34, -9,  0,-26,-17,-17,-17, -9,-26,-17,-17, 77, -9,-17, -9, -9,-26,-26,-26, -9; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-18;
/M: SY='G'; M= -4,  0,-21,  2, -1,-22, 25, -9,-27, -5,-20,-15,  2,-12, -6, -3,  1,-10,-20,-19,-18, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-18; MD=-18; IM=-18; DM=-18;
/M: SY='P'; M= -7, -7,-24, -2,  6,-21,-17,-10,-12, -1,-16,-10,-10, 23,  1, -5, -5, -7,-12,-23,-16,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-15,-26,-22,  0,-24,-20, 23,-17,  8,  8,-20,-21,-19,-18, -9, -3, 27,-17,  0,-22; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='D'; M= -8, 16,-23, 23, 13,-26,-10, -5,-24, -2,-23,-20,  8,  9,  0, -8,  6, -1,-21,-31,-18,  6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='A'; M= 10,-10,-23,-11, -6,-24,  4,-16,-21, -7,-21,-14, -7, 10, -5, -9,  5, -2,-17,-25,-22, -7;
/M: SY='S'; M= -4,  3,-22,  7, 10,-23,-12,  6,-19, -7,-23,-15,  5, -5,  3, -9, 14,  2,-16,-35,-13,  5;
/M: SY='G'; M=  3, -5,-22, -4, -7,-25, 34,-15,-30,-14,-28,-19,  4,-15,-10,-15, 16, -1,-21,-28,-25, -8;
/M: SY='P'; M= -9,-13,-30,-10, -6,-18, -5, -2,-22, -9,-21,-13, -7, 21, -7, -5, -3, -8,-22,-26,-15, -9;
/M: SY='C'; M= -9,-16,100,-24,-21,-21,-27,-26,-29,-26,-21,-20,-17,-35,-24,-26, -6, -8,-12,-48,-29,-22;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='G'; M= 12, -4,-22, -5, -8,-24, 23,-16,-22,-13,-19,-14, -2,-14,-11,-17,  4, -9,-15,-22,-22,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='N'; M=-13, 22,-25, 19, 12,-24,-10, 22,-25, -1,-25,-16, 27, -7,  5, -2,  1, -7,-28,-34,-12,  7; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='T'; M=  7,-11, -7,-16,-11,-12,-17,-18, -7, -7, -4, -6, -9,-17,-10, -6,  4, 12,  1,-27,-13,-11;
/M: SY='I'; M= -4,-20,-11,-25,-18, -9,-27,-13, 10,-20,  3,  5,-16, -9,-15,-20,-10, -2,  8,-27, -8,-19;
/M: SY='P'; M= -4,-19,-35,-12, -3,-25,-19,-20,-16,-11,-22,-16,-19, 68,-11,-19, -8, -6,-23,-28,-26,-11;
/M: SY='D'; M=  2, 10,-21, 11,  4,-24, -9, -5,-23,  5,-24,-16,  8,-12,  4,  0,  8, -1,-17,-27,-12,  3;
/M: SY='D'; M=-15, 34,-26, 46, 11,-28,-12, -2,-31, -3,-25,-24, 13,-12, -2,-10,  4,  0,-23,-33,-10,  4;
/M: SY='D'; M=-15, 30,-28, 44, 19,-34,-13, -2,-32,  2,-24,-22, 12,-10,  6, -5,  1, -7,-25,-35,-17, 13;
/M: SY='R'; M= -9, -2,-23, -5,  2,-12,-15, -4,-20,  2,-19,-11,  5, -9,  7, 11,  4,  2,-18,-24,-10,  3;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-26, -3,  4,-19,-21, -6, -5, -3, -4,  1, -2,-15, 11, -4, -7, -7,-11,-25,-10,  7;
/M: SY='V'; M= -5,-14,-21,-18,-11,-13,-24,-15,  8, -5, -3,  7,-11,-17, -1, -8, -3,  1,  9,-25, -8, -7;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F'; M=  2,-20,-16,-26,-23, 14,-10,-23, -1,-20, -2, -3,-15,-23,-25,-19, -4,  1,  9,-15, -3,-23;
/M: SY='S'; M=  5, -7,-14,-12, -8, -7,-11,-12,-12, -7,-14, -6, -1,-14, -6, -3, 15, 15, -5,-27,-10, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='P'; M= -8,-11,-28, -7, -2,-17,-17, 11,-17,-10,-20,-11, -6, 18, -1,-11,  1, -4,-20,-24, -3, -5;
/M: SY='P'; M=  3, -8,-30, -2,  5,-28,-14,-16,-20, -7,-25,-19,-11, 48, -6,-17, -1, -6,-23,-29,-26, -3;
/M: SY='G'; M=  0,  0,-25, -1, -9,-21, 21, -3,-28, -9,-24,-16,  6,-18, -9, -7,  2,-10,-22,-21,-12,-10;
/M: SY='S'; M=  9, -1,-13, -4,  0,-19, -1,-14,-19, -9,-22,-16,  4,-10, -4,-11, 25, 20,-10,-33,-18, -2;
/M: SY='R'; M=-18, -9,-28,-10, -1,-19,-20, -2,-28, 27,-19,-10,  0,-19,  8, 63, -7, -5,-18,-21,-10, -1;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-23,-17,-13,  5,-24,  4,  1,-12, -5, -1,-11,-21, -5,-11, -3,  1, -3, -5, 27,-12;
/M: SY='V'; M=  5,-25,-15,-29,-24, -2,-25,-23, 23,-20, 15, 15,-24,-24,-20,-20,-12, -4, 29,-24, -8,-23;
/M: SY='V'; M= -5,-22,-19,-22,-14, -6,-28,-24, 17,-17,  8,  5,-22,-13,-18,-18,-10,  0, 22,-27,-10,-17;
/M: SY='L'; M=  1,-27,-16,-30,-22, 12,-25,-23, 15,-24, 24,  9,-25,-27,-24,-20,-17, -6, 17,-18, -2,-22;
/M: SY='P'; M= -9,-12,-32, -5,  1,-24,-19,-14,-15,-10,-15,-12,-13, 40, -2,-15, -7, -7,-21,-29,-21, -3;
/M: SY='R'; M=-12, -2,-27, -5, -2,-19,-17,  3,-19,  2,-17,-10,  6,  4,  1, 12, -4, -2,-20,-28,-13, -3;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-35, -2,  6,-30,-17,-17,-21, -7,-27,-20,-14, 62, -7,-17, -6, -9,-27,-30,-27, -4;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-33,-30,  0,-33,-30, 36,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 44,-27, -7,-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 18,-30,-20, 18,-30, 45, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,  9,-16,  4,-21;
/M: SY='E'; M= -8,  9,-28, 18, 55,-29,-18, -1,-29,  8,-21,-20,  1, -1, 18, -1,  3, -7,-28,-31,-20, 37;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-27, -2,  3,-26,-13,-14,-21,  0,-23,-17, -7, 25, -3, -4,  1, -2,-19,-28,-21, -3;
/M: SY='G'; M= -2, -3,-30,  0,-15,-31, 60,-18,-40,-18,-30,-21,  2,-19,-18,-19,  0,-19,-30,-22,-29,-16;
/M: SY='V'; M= -6,-13,-20,-17,-12,-11,-25,-17,  7,  0, -1,  5,-11,-21, -8, -4,-10, -4, 12,-25, -9,-11;
/M: SY='Q'; M= -4,  9,-20,  6,  5,-26,-12, -2,-17, -2,-22,-11, 12,-13, 16, -3, 12,  5,-16,-32,-15, 10;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='K'; M= -6,  1,-22,  0,  8,-22,-18, -2,-23, 16,-23,-12,  2,-10,  4,  8,  6,  9,-15,-27,-10,  6;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-19,-34,-27, 17,-32,-25, 26,-27, 25, 14,-26,-28,-26,-22,-20, -7, 25,-18,  2,-27;
/M: SY='R'; M=-18,  3,-30,  6,  3,-24,-20,  1,-25, 19,-20,-11,  3,-16,  5, 35, -9,-11,-18,-25,-10,  1;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 32,-28, 31, 18,-27,-27,-22,-23,-22, -8, 25,-22, -2,-25;
/M: SY='E'; M= -7, -2,-23, -2,  8,-13,-18, -1,-17,  4,-17,-10, -2,-12,  8,  0,  5,  6,-15,-17,  5,  7;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 58,-30,-20,  6,-30, 23,  6,-23,-30,-34,-20,-23,-10,  3,  1, 21,-27;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='P'; M= -2, -1,-11, -3, -3, -9, -7, -6, -4, -5,-10, -6,  3,  5, -4, -7,  4,  3, -5,-17,-10, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='Q'; M= -8,  0,-27,  2, 18,-29, -9,  0,-25, 11,-22,-10,  1,-10, 25, 13,  1, -8,-24,-23,-14, 21; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-18, -6,  0, -9,-14, -1,-14, 17,-10, -4, -3,-12,  3, 26, -8, -6,-10, -9,  1,  0; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Y'; M=-12, -9,-27,-10, -5,-10,-17,  6,-17,  1,-16, -8, -6, -5,  1,  3, -5,  1,-17,-12, 10, -5;
/M: SY='S'; M= -3, -4,-16, -2, -2,-21,  1,-14,-22,-10,-16,-14, -3, -8, -7, -8,  3, -3,-17,-29,-19, -6;
/M: SY='S'; M=  3,  0,-23, -3, -3,-26, 10,  0,-24, -9,-26,-15,  8, -6,  2,-10, 11, -3,-22,-29,-19, -2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -8,  0,-26,  4,  5,-18,  2, -4,-25, -3,-19,-15,  0,-16, -2,  0,  1, -7,-21,-20, -6,  0;
/M: SY='D'; M=  0,  8,-21, 10, 10,-24,-13,  4,-20, -4,-19,-13,  5,-12,  3, -8,  7,  1,-14,-31,-13,  6;
/M: SY='D'; M=-13, 14,-30, 23, 10,-30,-14,  2,-27, -1,-26,-18,  4,  8,  7, -5,  1, -7,-26,-30,-13,  7;
/M: SY='H'; M= -9, -4,-24, -4, -4,-20,-19, 17,-11, -9,-16, -5, -1, -5,  0, -8, -2, -7, -8,-31, -7, -4;
/M: SY='P'; M=  0, -5,-28,  1, 20,-28,-15,-11,-22, -2,-24,-18, -7, 30,  5,-11,  3, -5,-24,-30,-23, 10;
/M: SY='T'; M= -1, -2,-16, -5, -5,-17, -9,  1,-20, -6,-20,-13,  5,-13, -2,  0, 19, 21,-11,-32,-11, -5;
/M: SY='A'; M= 24,-10,-18,-12, -5,-23, -5,-18,-15,-10,-20,-15, -8, 17, -8,-18, 12,  2,-11,-28,-23, -8;
/M: SY='Y'; M= -4, -9,-21,-12, -8,  1,-17, 11,-13, -8,-12, -6, -5,-19, -1, -5,  2,  1,-12,-10, 17, -6;
/M: SY='I'; M=  3,-18,-18,-25,-20, -7,-24,-24, 19,-20,  2,  4,-13,-17,-16,-21,  1,  8, 19,-26, -9,-20;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 13,-30,-20, 19,-30, 48, 19,-30,-30,-21,-20,-30,-10, 10,-19,  1,-20;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-22,-36,-30,  0,-36,-30, 42,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 38,-24, -4,-30;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='V'; M=  3,-23,-15,-24,-24, -7, -9,-26, 10,-19,  4,  3,-21,-25,-24,-19, -6, -1, 24,-26,-13,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I'; M= -2,-23,-23,-30,-20, -5,-27,-17, 25,-19, 17, 24,-18,-19, -8,-19,-16, -9, 14,-20, -4,-16;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-31, -8,  2,-14,-22, 14,-22, 12,-18, -7, -5, -8, 10, 24,-10,-11,-22,-13,  9,  2;
/M: SY='V'; M= -7,-23, 12,-28,-25, -5,-31,-24, 10,-22, -1,  0,-20,-18,-22,-23,-10, -2, 14,-27, -6,-26;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-24,  8, 16,-23,-15, -5,-21,  9,-17,-13,  6,-11,  7,  3,  3, -3,-19,-30,-15, 12;
/M: SY='S'; M=  4, -3,-15, -4, -1,-17,-11,-12, -7,-10,-16, -9,  1,-14, -5,-12, 17,  7,  0,-34,-16, -3;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-19,-28,-20,  5,-28,-20, 19,-25, 33, 18,-24,-25,-18,-18,-19,  0, 13,-22, -2,-19;
/M: SY='E'; M=-14, 11,-33, 23, 25,-32,-17,  4,-30, -1,-26,-21,  1, 22,  4, -9, -4,-11,-30,-33,-19, 12;
/M: SY='I'; M=-11,-15,-25,-27,-22,  3,-27,-15, 26,-20, 12, 20, -6,-21,-14,-19,-15, -8, 12,-21, -1,-20;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-39,-29, 74,-29,-18,  2,-28, 11,  5,-20,-29,-37,-19,-20,-10,  1,  8, 28,-28;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='Q'; M= -4, -4, -9, -7,  1,-17,-15, -5, -6, -3, -9, -2, -2, -9, 15, -3,  3,  6, -8,-18, -7,  7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -4,  4,-22,  8, -7,-24, 36,-11,-30,-11,-22,-17,  4,-13,-11,-13,  0,-13,-22,-19,-20, -9; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -1,  7,-17,  9, -3,-21, 19, -8,-24, -8,-22,-16,  8,-11, -6,-10, 10, -2,-17,-24,-18, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='A'; M=  7,-10,-16,-10, -8,-13, -7, -8, -4,-11, -6, -5,-11, -6,-11,-14, -3, -5,  2,-22,-12,-11; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='A'; M=  8,-17,  8,-21,-15,-15,-19,-14, -6,-12, -5, -4,-15,-23,-11,-10, -5, -5,  5,-28,-14,-14;
/M: SY='A'; M= 22, -1,-12, -9, -6,-19, -6,-14,-13, -8,-16,-13,  3,-11, -4,-12, 18, 16, -6,-28,-17, -5;
/M: SY='N'; M=-11, 12,-25,  8, 11,-21,-15,  0,-15,  3,-13, -7, 15,-15,  9,  0, -3, -7,-20,-30,-14,  9;
/M: SY='Q'; M= -3, -6,-22, -6,  6,-22,-13, -8,-11, -4,-13, -6, -3,-13, 12, -5,  7,  0,-10,-28,-14,  8;
/M: SY='R'; M= -3,  0,-25, -1, -2,-19,-14, 15,-24,  6,-18,-10,  3,-17,  2, 19, -4, -9,-18,-21, -2, -3;
/M: SY='W'; M=-16,-22,-33,-22,-12, -5,-23, -7,-13, -3, -2, -3,-19,-24, -5,  7,-24,-16,-16, 28,  6, -8;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-24, 13, 23,-27,-16, -5,-26,  7,-21,-16,  3, -7, 11,  3,  5,  3,-20,-29,-16, 16;
/M: SY='E'; M= -7,  8,-21,  8, 20,-22,-18, -7,-19,  0,-15,-11,  3, -7,  8, -5,  8, 15,-16,-30,-14, 14;
/M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-33,-26, 62,-30, -6,  0,-23,  6,  0,-20,-30,-29,-16,-20,-10, -4, 17, 48,-26;
/M: SY='Q'; M= -9,  5,-27,  7, 29,-31,-19,  3,-20,  7,-19, -8,  4, -9, 33,  3,  0, -8,-24,-26,-15, 31;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-28, -8,  1,-19,-20, -2,-23, 22,-14, -7,  1,-19, 10, 46,-10, -9,-18,-22,-10,  2;
/M: SY='Y'; M=-19,-19,-29,-19,-18, 23,-29, 26, -2,-12,  2,  2,-18,-29, -9,-10,-20,-11,-11, 20, 68,-18;
/M: SY='R'; M=-14,  1,-28, -2,  3,-25,-10,  3,-27, 16,-23,-10, 11,-18, 17, 37, -3, -9,-25,-24,-13,  7;
/M: SY='C'; M= -9,-21,110,-30,-30,-18,-30,-30,-25,-29,-18,-18,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -5,-48,-28,-30;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='L'; M= -7,-15,-20,-17,-14, -5,-22,  3,  5,-13, 10,  6,-10,-23,-11, -5,-13, -8,  5,-24, -2,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-26,  8, 35,-27,-17, -4,-26, 10,-19,-16, -1, -5, 14,  5,  3, -3,-22,-27,-17, 24;
/M: SY='N'; M=-11,  2,-24, -3, -1,-10,-18,  9, -7, -9, -6, -4, 10,-19, -2, -5, -5, -6,-13,-26, -1, -3;
/M: SY='S'; M= 12, -6,-14, -8, -7,-13,  5,-11,-18,-12,-22,-16,  2,-14, -7,-13, 22,  8,-10,-26,-11, -7;
/M: SY='R'; M= -9,-10,-22, -9, -6,-13,-17, -6, -8, -7,  1, -1, -8,-20, -2,  4, -6, -2, -6,-26, -8, -5;
/M: SY='S'; M=  7, -9,-15,-12, -9,-11,-12,-10, -4,-11, -8, -2, -5,-17, -3,-12, 10,  6,  0,-26, -7, -6;
/M: SY='V'; M= -3,-14,-20,-15,-16, -6,-22,-15,  8,-14,  2,  5,-15,-11,-16,-16,-10, -5, 12,-24, -6,-17;
/M: SY='V'; M= -5,-21,-19,-24,-22,  3, -9,-18,  6,-20,  2,  5,-16,-24,-20,-18, -7, -5, 11,-19, -2,-22;
/M: SY='K'; M=-10, -4,-30, -6,  1,-24,-14,-12,-21, 23,-22, -9, -1, -3,  1, 15,-10,-10,-17,-23,-13,  0;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-19, -4, -3,-16,-17, -9,-10, -8, -9, -7, -3,-13,  3, -9,  6, 13, -8,-23, -5, -1;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-28, -8, -2,-24,-17,-15,-14, -4,-22,-13, -8, 32, -2,-11, -1, -2,-15,-29,-21, -4;
/M: SY='M'; M= -5,-20,-20,-24,-16,  3,-21,-13,  6,-14, 14, 16,-18,-17,-11, -7,-13, -4,  4,-20, -4,-14;
/M: SY='P'; M= -3, -1,-23, -3, -5,-18,-14,-15,-18, -9,-22,-17,  0, 13, -8,-13,  7, 13,-16,-18,-15, -7;
/M: SY='E'; M=-12, 15,-30, 25, 29,-30, -8, -4,-29,  1,-22,-17,  3,  0,  6, -7, -2,-11,-27,-31,-20, 17;
/M: SY='V'; M=  8,-17,-16,-19,-12,-12,-20,-22,  7,-10, -4, -1,-16,-14,-15,-15, -1,  1, 17,-27,-14,-14;
/M: SY='C'; M= -9,-21,110,-30,-30,-18,-30,-30,-25,-29,-18,-18,-21,-39,-30,-29,-10, -9, -5,-48,-28,-30;
/M: SY='R'; M= -5, -2,-26,  0, 18,-25,-17, -5,-24, 18,-21,-12, -1,-10, 12, 20,  0, -6,-18,-25,-14, 14;
/M: SY='N'; M=-13, 12,-27,  8,  1,-23, -9, -1,-24,  9,-24,-12, 17, -5,  1, 15, -3, -7,-24,-30,-17, -1;
/M: SY='L'; M=-13,-27,-25,-29,-22, 13,-32,-11, 21,-25, 31, 15,-25,-28,-17,-19,-25,-10,  9, -7, 21,-22;
/M: SY='I'; M=-11,-22,-26,-25,-22, -2,-33,-15, 28,-25, 20, 14,-18,-23,-17,-23,-19,-10, 18,-23, -1,-22;
/M: SY='F'; M=-13,-15,-11,-23,-20, 12,-20, -5, -2,-18, -4, -2, -7,-24,-19,-15,-12, -9, -4,-18,  3,-20;
/M: SY='S'; M=  6, -4,-14, -5, -3,-19, -6,-13,-14,-11,-25,-16,  4, -1, -3,-12, 29, 17, -8,-37,-19, -4;
/M: SY='I'; M= -6,-22,-21,-29,-23, -1,-27,-18, 27,-21, 18, 23,-17,-23,-15,-19,-16, -7, 20,-23, -4,-21;
/M: SY='S'; M= 12, -2,-12, -3, -1,-20, -2,-10,-20, -7,-27,-18,  7,-11,  0, -5, 33, 16,-10,-36,-19, -1;
/M: SY='A'; M= 33,-14,-11,-22,-14, -9, -8,-21, -4,-13, -6, -7,-12,-15,-15,-19,  6,  2,  7,-20,-14,-14;
/M: SY='L'; M= -6,-24,-21,-27,-18, 14,-26,-17,  9,-18, 23,  9,-22,-25,-18,-14,-20, -9,  5,-12,  7,-18;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-23,-31,-23,  3,-32,-23, 26,-24, 31, 17,-25,-26,-19,-16,-23, -9, 18,-21, -2,-23;
/M: SY='H'; M=-16, -2,-27, -4, -4,-11,-19, 63,-20,-11,-12, -1,  6,-21,  3, -4, -8,-13,-22,-23, 19, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 8 in 8 different sequences
Number of true positive hits 8 in 8 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Laminin IV type B
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
8 sequences

LAMB1_DROME (P11046), LAMB1_HUMAN (P07942), LAMB1_MOUSE (P02469), 
LAMB2_HUMAN (P55268), LAMB2_MOUSE (Q61292), LAMB2_RAT   (P15800), 
LAMB4_DANRE (Q8JHV6), LAMB4_HUMAN (A4D0S4)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission