ID HTH_HXLR; MATRIX. AC PS51118; DT 01-APR-2005 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE HxlR-type HTH domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=99; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=94; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1077032; R2=0.0123771; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9160.4521484; R2=3.5806754; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=638; H_SCORE=11445; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=355; H_SCORE=10432; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='C'; M=-4,-16,77,-23,-17,-20,-26,-25,-22,-23,-16,-16,-16,-30,-21,-25,-7,-9,-9,-42,-26,-19; MA /M: SY='P'; M=-4,-11,-30,-5,3,-27,-8,-16,-22,-9,-29,-20,-9,47,-6,-16,5,-2,-24,-32,-26,-4; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='V'; M=-5,-23,-17,-27,-22,9,-25,-21,15,-15,4,10,-19,-24,-20,-15,-8,-2,21,-21,-2,-21; MA /M: SY='E'; M=-10,4,-30,10,38,-30,-9,-1,-30,9,-21,-16,0,-6,18,8,-1,-11,-29,-26,-19,27; MA /M: SY='H'; M=-5,-11,-21,-12,-3,-4,-20,2,-8,-7,-6,-4,-9,-19,-6,-1,-3,-2,-3,-20,2,-6; MA /M: SY='T'; M=16,-10,-10,-18,-15,-11,-16,-22,0,-12,-5,-5,-10,-15,-15,-16,10,22,12,-27,-13,-15; MA /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-29,-21,13,-29,-21,16,-22,32,14,-27,-29,-22,-16,-23,-8,14,-18,1,-21; MA /M: SY='D'; M=-3,16,-23,21,21,-28,-10,-4,-28,6,-26,-20,11,-8,6,-2,9,-2,-22,-33,-19,14; MA /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-22,-14,-1,-28,-6,14,-21,22,11,-22,-26,-16,-16,-19,-9,14,-25,-2,-16; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-23,-35,-28,2,-35,-28,38,-27,24,17,-25,-25,-23,-25,-20,-7,31,-23,-3,-28; MA /M: SY='G'; M=-2,-2,-27,-1,-14,-29,49,-18,-36,-16,-27,-20,2,-18,-16,-18,3,-10,-26,-24,-26,-15; MA /M: SY='G'; M=-2,1,-26,0,-2,-28,31,-12,-33,-4,-29,-19,8,-15,-7,-8,5,-10,-26,-26,-24,-4; MA /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,45,-10,-10,-20,-20,-10,6; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='K'; M=-5,3,-24,0,1,-25,-4,-10,-26,21,-27,-14,8,-12,1,11,3,1,-19,-26,-15,1; MA /M: SY='M'; M=-4,-19,-12,-23,-21,-11,3,-19,0,-20,0,8,-14,-23,-17,-19,-8,-9,2,-25,-14,-20; MA /M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-29,-20,5,-30,-20,19,-23,37,16,-26,-28,-18,-12,-25,-9,12,-21,-2,-20; MA /M: SY='I'; M=-7,-30,-24,-36,-29,1,-36,-29,41,-27,21,17,-24,-24,-23,-26,-18,-7,33,-23,-3,-29; MA /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22,13,-31,-21,22,-30,44,19,-28,-29,-21,-21,-28,-10,12,-18,2,-22; MA /M: SY='Y'; M=-16,-18,-6,-20,-16,-1,-26,7,-13,-6,-10,-6,-15,-28,-9,5,-15,-11,-8,0,19,-16; MA /M: SY='H'; M=-3,-4,-23,-3,13,-13,-19,16,-16,-6,-12,-8,-4,-13,1,-7,-2,-5,-12,-26,-4,6; MA /M: SY='L'; M=-2,-27,-19,-29,-19,6,-26,-19,16,-26,41,19,-27,-27,-18,-19,-24,-9,9,-20,-3,-18; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; MA /M: SY='F'; M=-11,-16,-4,-22,-15,12,-21,-12,-1,-7,0,5,-11,-19,-13,-1,-12,-8,-1,-11,2,-14; D=-6; MA /I: I=-6; DM=-29; MA /M: SY='D'; M=-16,20,-28,28,19,-18,-16,4,-29,3,-22,-19,10,-12,2,-3,-4,-10,-25,-28,-10,11; MA /M: SY='G'; M=-1,-9,-30,-9,-17,-30,61,-19,-39,-13,-30,-19,0,-19,-17,-15,-1,-19,-29,-20,-28,-17; MA /M: SY='T'; M=-6,-8,-23,-9,-2,-21,-21,-15,-13,7,-18,-8,-8,7,1,0,0,10,-8,-26,-14,-2; MA /M: SY='R'; M=-14,-7,-28,-8,1,-20,-21,7,-21,25,-15,1,-3,-16,6,27,-13,-11,-16,-21,-4,2; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='F'; M=-15,-21,-18,-30,-24,52,-27,-16,-3,-23,4,-3,-15,-25,-29,-16,-10,5,-1,2,25,-24; MA /M: SY='G'; M=1,4,-21,0,-6,-25,21,-10,-28,-4,-30,-19,15,-15,-6,-7,15,-1,-22,-31,-22,-6; MA /M: SY='E'; M=-11,13,-30,22,45,-34,-19,2,-29,9,-21,-17,3,-4,27,1,0,-10,-30,-29,-18,36; MA /M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-33,-23,16,-32,-22,24,-30,39,18,-27,-28,-22,-22,-27,-10,13,-17,3,-23; MA /M: SY='R'; M=-4,-4,-23,-8,-1,-19,-17,-9,-19,18,-14,-8,0,-15,1,21,-4,-1,-13,-23,-11,-1; MA /M: SY='R'; M=-17,0,-29,3,9,-23,-19,-2,-30,22,-21,-13,2,-15,9,45,-6,-6,-21,-24,-12,6; MA /M: SY='A'; M=3,-8,-20,-15,-10,-12,-18,-15,-2,-4,0,-1,-3,-17,-8,-4,-5,0,-2,-24,-10,-10; MA /M: SY='I'; M=-11,-27,-16,-34,-25,3,-32,-18,28,-24,24,26,-22,-24,-15,-22,-22,-10,16,-19,2,-22; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='P'; M=-7,-16,-34,-9,-3,-26,-6,-17,-20,-10,-26,-17,-15,64,-10,-17,-7,-10,-26,-25,-26,-10; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='G'; M=-7,0,-25,-3,-10,-14,17,-10,-23,-5,-20,-8,6,-18,-10,-8,-2,-10,-20,-22,-15,-9; MA /M: SY='I'; M=-9,-29,-11,-38,-30,-2,-38,-30,39,-29,14,14,-21,-24,-22,-29,-18,-9,28,-25,-5,-30; MA /M: SY='T'; M=2,-3,-14,-6,-5,-16,-13,-16,-15,-10,-20,-15,1,3,-6,-11,23,32,-7,-34,-16,-6; MA /M: SY='Q'; M=-11,0,-28,0,17,-31,-20,13,-22,8,-19,-5,1,-11,36,13,0,-4,-25,-23,-8,25; MA /M: SY='K'; M=-12,-4,-31,-3,7,-28,-20,-9,-29,39,-28,-11,-3,1,7,31,-10,-10,-21,-21,-13,6; MA /M: SY='M'; M=-8,-16,-18,-26,-18,-2,-21,-7,15,-11,13,40,-15,-18,-4,-11,-11,4,9,-22,-2,-11; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='T'; M=14,-7,-11,-14,-11,-13,-13,-19,-5,-12,-11,-9,-4,-12,-10,-15,17,23,4,-29,-14,-11; MA /M: SY='Q'; M=-2,-4,-22,-6,7,-20,-16,-4,-12,-3,-5,-4,-2,-15,14,1,-1,-4,-15,-25,-12,10; MA /M: SY='R'; M=-9,-4,-24,-5,6,-26,-17,-1,-22,11,-20,-8,1,-14,24,26,5,3,-19,-24,-11,13; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='R'; M=-16,-6,-30,-6,5,-25,-20,-1,-29,32,-22,-9,0,-16,17,53,-9,-10,-21,-20,-10,7; MA /M: SY='E'; M=-2,3,-26,6,36,-26,-17,-1,-20,5,-14,-6,-4,-5,18,-3,-1,-9,-21,-26,-16,27; MA /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-19,8,-29,-19,16,-26,45,18,-28,-29,-18,-13,-29,-10,8,-20,-1,-19; MA /M: SY='E'; M=-9,4,-27,12,45,-27,-21,-3,-21,6,-16,-14,-4,-5,18,-1,-1,-9,-20,-29,-18,31; MA /M: SY='Q'; M=5,-1,-20,-4,10,-26,-14,-6,-18,1,-17,-9,-1,-9,18,0,9,7,-15,-25,-14,14; MA /M: SY='D'; M=-12,25,-23,33,6,-27,-11,7,-25,-5,-24,-19,16,-15,-3,-9,5,-4,-17,-38,-14,1; MA /M: SY='G'; M=-2,-8,-29,-8,-11,-28,53,-16,-34,-16,-25,-14,-1,-18,-14,-17,-1,-18,-27,-21,-27,-12; MA /M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-35,-26,14,-34,-25,29,-29,29,16,-25,-26,-24,-24,-23,-9,21,-17,3,-26; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-21,-35,-29,11,-34,-27,33,-27,19,14,-25,-26,-26,-24,-18,-7,30,-19,1,-29; MA /M: SY='H'; M=-13,23,-25,19,10,-24,-9,32,-27,-2,-26,-15,30,-16,5,-2,4,-7,-29,-36,-8,6; MA /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,0,-20,-20,0,-30,30,-20,-10,0,-20,10,70,-10,-10,-20,-20,-10,0; MA /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,2,12,-21,-21,-10,-7,-1,-12,-7,-5,-12,5,-7,-1,-5,-4,-29,-13,8; MA /M: SY='V'; M=1,-21,-17,-20,-13,-9,-23,-22,11,-14,-1,4,-21,-8,-17,-17,-5,-2,22,-29,-14,-16; MA /M: SY='Y'; M=-17,-22,-27,-22,-21,25,-30,10,5,-13,7,3,-22,-30,-13,-12,-20,-9,-1,18,61,-21; MA /M: SY='P'; M=-6,-5,-29,-2,1,-26,-13,-6,-21,-5,-29,-18,1,39,-4,-11,4,-2,-25,-33,-22,-5; MA /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,0,18,-24,-20,5,-14,-1,-15,-7,-4,-12,16,-3,2,-5,-11,-29,-11,17; MA /M: SY='V'; M=-4,-13,-15,-14,-19,-7,-26,-24,15,-16,2,2,-16,-22,-21,-18,-3,9,27,-30,-10,-21; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='P'; M=-9,-18,-33,-11,2,-22,-22,-19,-11,-11,-16,-12,-20,52,-10,-17,-11,-9,-16,-29,-23,-7; MA /M: SY='R'; M=-15,-3,-30,-3,5,-25,-20,8,-30,36,-25,-9,1,-15,10,39,-10,-11,-21,-21,-6,5; MA /M: SY='V'; M=-3,-26,-13,-26,-26,-3,-29,-14,22,-19,6,9,-25,-29,-25,-17,-10,-3,40,-30,-6,-26; MA /M: SY='E'; M=-10,5,-30,13,49,-26,-22,-4,-21,5,-15,-15,-2,-2,15,-4,-2,-10,-23,-29,-18,32; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20; MA /M: SY='S'; M=2,-2,-3,-4,1,-20,-9,-11,-22,-5,-25,-18,4,-13,-1,-1,24,15,-11,-36,-18,-1; MA /M: SY='L'; M=-9,-28,-19,-28,-19,8,-28,-19,17,-29,44,17,-27,-29,-19,-19,-25,-8,9,-21,-1,-19; MA /M: SY='T'; M=2,0,-10,-8,-8,-12,-17,-18,-12,-10,-13,-12,2,-10,-8,-10,23,45,-2,-32,-12,-8; MA /M: SY='E'; M=-4,6,-30,15,36,-30,-17,-6,-27,3,-22,-20,-3,16,9,-7,-1,-9,-27,-30,-22,21; MA /M: SY='R'; M=-7,-14,-24,-17,-8,-1,-21,-2,-12,4,-2,-1,-10,-21,-6,11,-13,-9,-9,-14,4,-8; MA /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20; MA /M: SY='R'; M=-14,-2,-28,-1,16,-22,-20,-3,-28,21,-20,-13,0,-12,10,38,-4,-3,-20,-24,-13,11; MA /M: SY='S'; M=5,6,-17,8,9,-25,-8,-7,-21,-4,-23,-16,5,-9,8,-7,20,10,-15,-33,-18,9; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-19,-31,-23,7,-31,-23,25,-28,38,18,-29,-29,-22,-21,-25,-8,21,-22,-2,-23; MA /M: SY='Q'; M=-10,-8,-25,-9,6,-6,-21,-3,-9,-2,-10,-1,-6,-14,10,-4,-3,-6,-13,-15,3,8; MA /M: SY='P'; M=5,-10,-31,-5,1,-28,-8,-17,-21,-9,-24,-18,-12,46,-8,-18,-3,-8,-23,-27,-26,-6; MA /M: SY='I'; M=0,-24,-21,-28,-21,-5,-29,-25,23,-14,10,9,-20,-21,-18,-17,-13,-6,23,-23,-7,-21; MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-21,-34,-26,14,-33,-25,28,-28,29,16,-26,-27,-24,-23,-22,-8,22,-18,2,-26; MA /M: SY='D'; M=-4,2,-24,5,3,-22,-19,-10,-6,-8,-5,-5,-6,-15,3,-11,-6,-7,-5,-27,-12,3; MA /M: SY='A'; M=15,-6,-19,-8,10,-20,-13,-6,-10,-4,-9,-4,-9,-11,2,-11,1,-5,-5,-25,-15,6; MA /M: SY='M'; M=-10,-25,-20,-30,-20,5,-25,-10,20,-20,34,41,-25,-25,-10,-15,-25,-10,10,-20,0,-15; MA /M: SY='C'; M=-4,-12,23,-18,-12,-17,-21,0,-18,-8,-13,-1,-11,-24,-3,-10,-8,-10,-12,-27,-7,-8; MA /M: SY='E'; M=-1,9,-26,13,21,-32,-14,-4,-26,13,-22,-14,2,-8,17,3,0,-8,-22,-26,-16,19; MA /M: SY='W'; M=-19,-39,-47,-39,-29,10,-21,-29,-16,-21,-12,-16,-39,-30,-20,-20,-39,-28,-26,131,27,-20; MA /M: SY='G'; M=5,-13,-28,-15,-20,-25,47,-21,-25,-20,-21,-14,-4,-19,-19,-21,-1,-16,-19,-20,-25,-20; MA /M: SY='D'; M=-5,11,-25,17,17,-28,-7,-6,-26,6,-21,-12,3,-9,4,-3,1,-7,-20,-30,-17,10; MA /M: SY='E'; M=-4,1,-24,1,4,-18,-10,-4,-14,-3,-9,-4,-1,-15,4,-7,-3,-7,-15,-22,-7,4; MA /M: SY='Y'; M=-17,-9,-29,-14,-13,14,-21,13,-10,-10,-10,-6,-3,-25,-4,-8,-14,-11,-18,18,36,-10; MA /M: SY='L'; M=-4,-20,-7,-23,-18,-9,-8,-19,-3,-17,10,5,-17,-25,-16,-13,-15,-11,-2,-24,-12,-18; MA /M: SY='E'; M=-8,6,-30,13,23,-30,-7,-7,-28,-2,-26,-21,2,18,3,-9,1,-8,-28,-32,-24,11; MA /M: SY='Q'; M=-13,-10,-30,-7,6,-24,-21,3,-18,4,-15,-6,-8,7,14,13,-8,-10,-20,-24,-12,7; MA /M: M=-8,-13,-27,-12,-1,-18,-15,-5,-4,-12,-7,-3,-12,-4,-4,-13,-9,-10,-4,-26,-12,-4; MA /M: SY='D'; M=-12,6,-25,13,13,-14,-18,-1,-15,-5,-7,-6,-3,-14,1,-9,-4,-7,-16,-23,-1,7; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=18(18); /POSITIVE=18(18); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=A??P?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH hxlR-type; CC /VERSION=6; DR P42406 , HXLR_BACSU , T; Q93K57 , MALR_FUSMR , T; DR O27346 , Y1285_METTH, T; P72979 , Y1512_SYNY3, T; DR P9WMG2 , Y3095_MYCTO, T; P9WMG3 , Y3095_MYCTU, T; DR P0A649 , Y3122_MYCBO, T; Q9Z9W1 , Y655_HALH5 , T; DR Q58335 , Y925_METJA , T; P96673 , YDEP_BACSU , T; DR O31494 , YDZF_BACSU , T; O31679 , YKVN_BACSU , T; DR O34844 , YODB_BACSU , T; O34533 , YTCD_BACSU , T; DR P0ACN2 , YTFH_ECOLI , T; P0ACN3 , YTFH_SHIFL , T; DR O32238 , YVAP_BACSU , T; P37486 , YYBR_BACSU , T; 3D 2HZT; 4A5M; 4A5N; 5HS7; 5HS8; 5HS9; 7BZD; 7BZE; 7BZG; PR PRU00435; DO PDOC51118; //