ID TAFH; MATRIX. AC PS51119; DT 01-MAY-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE TAFH/NHR1 domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=98; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=93; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8619466; R2=0.0130077; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8079.7114258; R2=9.9848614; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=626; H_SCORE=14330; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=357; H_SCORE=11644; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='A'; M=18,-13,-18,-19,-7,-16,-12,-11,-3,-9,2,8,-13,-15,5,-12,-3,-5,-3,-20,-11,-1; MA /M: SY='R'; M=-12,-4,-30,0,15,-25,-1,-4,-32,13,-22,-15,0,-14,7,28,-5,-12,-25,-23,-18,8; MA /M: SY='N'; M=-10,14,-22,3,0,-17,-12,3,-10,-5,-8,-6,25,-20,9,-3,-2,-5,-20,-31,-13,4; MA /M: SY='V'; M=-2,-24,-12,-26,-23,0,-28,-26,19,-20,15,8,-24,-26,-23,-18,-8,9,30,-28,-8,-23; MA /M: SY='K'; M=-1,0,-21,0,5,-25,-11,-10,-25,22,-30,-15,5,-10,5,11,13,4,-15,-29,-15,5; MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='C'; M=-10,-22,55,-30,-25,-8,-28,-21,-7,-25,5,8,-22,-33,-21,-23,-17,-10,-1,-36,-16,-23; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,5,-25,-20,-5,-30,41,-25,-10,0,-15,10,48,-10,-10,-20,-20,-10,5; MA /M: SY='K'; M=-12,10,-27,4,5,-25,-14,-1,-27,30,-28,-13,19,-15,7,29,-4,-7,-23,-26,-13,5; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='A'; M=21,-6,-15,-12,-11,-20,12,-18,-19,-12,-18,-14,-2,-12,-11,-16,14,9,-9,-25,-20,-11; MA /M: SY='T'; M=8,3,-14,-9,-10,-13,-11,-10,-7,-8,-9,0,7,-14,-6,-10,9,17,-5,-28,-13,-8; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='I'; M=-8,-23,-25,-29,-19,-9,-33,-21,29,-19,9,13,-18,-20,-5,-19,-13,-8,21,-22,-5,-14; MA /M: SY='Q'; M=-10,2,-30,4,25,-35,-20,1,-25,23,-23,-8,0,-8,35,14,-3,-10,-27,-22,-12,30; MA /M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-35,-25,43,-30,-20,11,-30,31,11,-25,-30,-29,-20,-25,-10,5,-6,14,-25; MA /M: SY='S'; M=20,-5,-14,-9,-8,-22,16,-15,-21,-12,-24,-17,1,-12,-8,-15,22,5,-11,-29,-22,-8; MA /M: SY='N'; M=-5,6,5,-3,-2,-23,-14,-6,-20,-6,-22,-13,12,-17,7,-6,11,10,-17,-35,-17,2; MA /M: SY='E'; M=-8,11,-24,18,19,-27,-11,-3,-29,6,-25,-20,8,-10,7,10,11,0,-21,-33,-18,12; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='L'; M=-5,-17,-21,-19,-18,-7,6,-18,3,-20,7,3,-12,-18,-16,-18,-12,-11,0,-16,-10,-18; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='G'; M=2,-2,-16,-2,-3,-20,14,-10,-22,-1,-24,-14,4,-10,-3,-4,14,1,-14,-24,-17,-3; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='Q'; M=-8,2,-23,4,24,-29,-16,6,-18,8,-16,-4,0,-6,38,6,0,-8,-23,-18,-10,31; D=-5; MA /I: I=-5; MD=-25; MA /M: SY='P'; M=1,-4,-12,-2,0,-13,-4,-8,-11,-5,-16,-11,-1,16,-2,-8,11,4,-10,-19,-13,-2; D=-5; MA /I: I=-5; MI=-25; IM=-25; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-8,-13,-33,-8,1,-27,-20,-18,-21,3,-27,-16,-13,53,-6,-8,-5,-1,-23,-28,-23,-6; MA /M: SY='E'; M=-10,4,-32,14,47,-30,-20,-4,-28,6,-22,-20,-4,19,14,-4,-2,-10,-30,-30,-22,29; MA /M: SY='V'; M=-4,-24,-16,-29,-25,-2,-29,-23,27,-19,11,18,-22,-23,-20,-19,-9,4,31,-26,-6,-24; MA /M: SY='G'; M=8,-3,-22,-3,4,-26,23,-13,-28,-10,-25,-18,1,-12,-5,-13,11,-5,-21,-27,-24,-1; MA /M: SY='E'; M=-1,3,-27,6,32,-30,-17,-4,-25,16,-21,-13,-2,-5,20,5,-1,-8,-23,-25,-16,26; MA /M: SY='R'; M=-15,17,-25,6,0,-20,-9,5,-25,14,-25,-15,32,-20,5,33,1,-5,-25,-31,-15,0; MA /M: SY='V'; M=0,-30,-10,-30,-30,0,-30,-30,30,-20,10,10,-30,-30,-30,-20,-10,0,50,-30,-10,-30; MA /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,57,-10,-10,-20,-20,-10,3; MA /M: SY='T'; M=9,-1,-16,-6,4,-19,-15,-15,-16,3,-15,-12,-2,-8,-2,-4,10,19,-8,-26,-14,1; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='V'; M=-2,-30,-14,-32,-30,0,-32,-30,34,-22,12,12,-28,-28,-28,-22,-12,-2,46,-28,-8,-30; MA /M: SY='Q'; M=-10,-12,-25,-11,8,-15,-25,-6,-3,-9,13,6,-14,-18,16,-6,-14,-10,-11,-22,-7,12; MA /M: SY='E'; M=-3,6,-24,5,12,-28,8,-4,-27,-3,-26,-17,11,-12,10,-5,11,-3,-25,-30,-21,11; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='V'; M=-6,-28,18,-30,-27,-2,-30,-27,12,-26,15,6,-28,-32,-27,-22,-16,-6,23,-32,-12,-27; MA /M: SY='N'; M=-8,34,-21,31,6,-26,-3,2,-26,-2,-30,-23,35,-14,0,-6,14,2,-25,-40,-20,3; MA /M: SY='G'; M=21,-8,-18,-12,-12,-24,27,-18,-24,-14,-22,-16,-2,-14,-12,-18,13,-3,-14,-24,-24,-12; MA /M: SY='N'; M=-3,9,-19,2,1,-21,-11,-8,-21,11,-26,-15,15,-12,1,5,13,13,-15,-31,-15,1; MA /M: SY='I'; M=-8,-30,-23,-36,-28,2,-36,-28,39,-28,25,18,-24,-24,-22,-26,-20,-8,30,-22,-2,-28; MA /M: SY='E'; M=-3,5,-21,8,30,-23,-15,-7,-23,1,-20,-18,2,-5,8,-5,14,11,-18,-32,-18,19; MA /M: SY='A'; M=12,-21,-21,-25,-17,-13,-21,-25,11,-17,-3,-1,-19,5,-17,-22,-6,-4,12,-25,-15,-19; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40; MA /M: SY='E'; M=-12,16,-30,28,54,-32,-18,0,-32,8,-22,-22,3,-2,17,-2,0,-10,-30,-32,-20,35; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='H'; M=-11,-7,9,-12,-10,-17,-22,10,-24,-5,-17,-10,-2,-21,-5,7,0,7,-14,-32,-8,-10; MA /M: SY='D'; M=-6,2,-20,6,-1,-17,-13,-9,-16,-6,-9,-11,1,-17,-3,1,6,1,-11,-32,-13,-3; MA /M: SY='R'; M=1,-6,-25,-9,1,-24,-15,-9,-25,28,-21,-10,-2,-14,5,33,-5,-8,-15,-20,-12,1; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='Q'; M=-13,-4,-30,-2,16,-16,-23,11,-16,4,-14,-4,-6,-14,29,1,-6,-10,-24,-6,16,21; MA /M: SY='E'; M=-12,-4,-27,1,23,-21,-22,-5,-20,12,-15,-11,-5,-12,8,22,-5,-8,-13,-26,-15,14; MA /M: SY='A'; M=18,-8,-19,-9,10,-17,-13,-14,-10,-8,0,-7,-11,-11,-3,-14,-2,-5,-7,-23,-16,4; MA /M: SY='L'; M=-8,-23,-20,-28,-20,3,-30,-22,21,-26,29,13,-21,-23,-18,-20,-16,3,13,-22,-2,-20; MA /M: SY='N'; M=-10,33,-22,17,2,-22,-3,7,-22,8,-30,-18,50,-18,2,5,7,-2,-28,-37,-18,2; MA /M: SY='F'; M=7,-16,-15,-21,-14,10,-14,-17,-4,-19,3,-4,-11,-19,-16,-17,3,2,-1,-20,-4,-14; MA /M: SY='P'; M=1,-9,-24,-5,0,-25,-9,-15,-20,-10,-30,-20,-4,37,-5,-15,17,6,-19,-35,-25,-5; MA /M: SY='P'; M=-10,-25,-31,-19,-9,-11,-25,-20,-1,-19,7,-1,-25,34,-15,-20,-19,-10,-11,-25,-16,-15; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,11,-31,-20,5,-25,19,-20,-5,0,-15,37,38,-5,-10,-25,-20,-10,21; MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; MA /M: SY='Y'; M=-18,-19,5,-23,-21,22,-28,14,-12,-19,-5,-4,-15,-30,-18,-15,-16,-12,-11,-2,35,-21; MA /M: SY='L'; M=-5,-30,-15,-30,-25,5,-30,-25,25,-25,31,15,-30,-30,-25,-20,-21,-5,29,-25,-5,-25; MA /M: SY='V'; M=-4,-30,-19,-34,-30,0,-34,-30,39,-24,14,14,-26,-26,-26,-24,-14,-4,41,-26,-6,-30; MA /M: SY='P'; M=-8,-18,-38,-10,-4,-30,-1,-20,-24,-12,-30,-20,-16,66,-12,-20,-8,-12,-30,-28,-30,-12; MA /M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28,63,-30,-20,5,-30,20,5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,2,3,23,-28; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20; MA /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,50,-30,-10,0,-10,10,30,-10,-10,-20,-20,-10,10; MA /M: SY='K'; M=2,6,-23,-1,2,-24,-11,-6,-23,21,-24,-12,12,-14,3,18,-1,-5,-18,-25,-15,2; MA /M: SY='S'; M=6,9,-12,4,0,-20,0,-6,-20,-8,-30,-20,21,-12,0,-8,33,16,-14,-40,-20,0; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-21,-32,-24,6,-32,-24,29,-28,36,18,-28,-28,-22,-22,-24,-8,22,-22,-2,-24; MA /M: SY='P'; M=6,-19,-28,-16,-7,-23,-17,-22,-9,-12,-18,-13,-19,46,-13,-20,-5,-6,-9,-28,-24,-13; MA /M: SY='L'; M=9,-24,-17,-27,-17,0,-20,-20,10,-24,31,10,-24,-24,-17,-20,-17,-7,7,-20,-6,-17; MA /M: SY='L'; M=-8,-30,-18,-30,-22,8,-30,-22,22,-28,40,18,-30,-30,-22,-20,-25,-8,20,-22,-2,-22; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,9,-29,-20,5,-25,21,-20,-5,0,-15,33,42,-5,-10,-25,-20,-10,19; MA /M: SY='R'; M=-15,-5,-30,-5,11,-31,-20,5,-25,19,-20,-5,0,-15,37,38,-5,-10,-25,-20,-10,21; MA /M: SY='E'; M=3,-7,-22,-5,19,-15,-19,-11,-10,-7,4,-5,-12,-12,1,-11,-7,-8,-11,-25,-14,10; MA /M: SY='L'; M=-8,-25,-21,-29,-21,5,-31,-22,23,-27,34,15,-23,-25,-18,-21,-20,-1,13,-22,-2,-21; MA /M: SY='L'; M=-12,-25,-29,-21,-14,2,-27,-11,3,-19,14,3,-25,8,-15,-18,-21,-10,-7,-12,8,-17; MA /M: SY='H'; M=3,12,-19,7,-2,-21,-10,15,-21,-7,-19,-12,13,-14,-2,-9,6,5,-16,-31,-9,-3; MA /M: SY='C'; M=-4,-12,12,-14,-9,-15,-18,-17,-15,-6,-8,-8,-9,-22,-9,-8,1,0,-7,-33,-15,-9; MA /M: SY='A'; M=27,-4,-18,-8,10,-26,-8,-11,-16,-2,-14,-10,-6,-8,8,-11,6,-4,-12,-22,-18,9; MA /M: SY='R'; M=-2,-13,-21,-14,-6,-14,-16,-9,-15,4,-5,-5,-6,-19,-1,24,-3,-3,-9,-23,-11,-6; MA /M: SY='F'; M=4,-25,-15,-31,-23,23,-23,-22,9,-23,14,4,-22,-25,-26,-20,-13,-5,13,-13,3,-23; MA /M: SY='I'; M=6,-18,-21,-28,-21,-7,-26,-25,22,-21,6,6,-13,-15,-15,-23,-4,7,16,-22,-7,-21; MA /M: SY='Q'; M=-10,12,-28,9,22,-31,-15,3,-24,17,-25,-11,15,-10,26,10,0,-8,-28,-27,-15,24; MA /M: SY='Q'; M=-8,-2,-30,-2,11,-38,-1,4,-24,4,-22,-4,0,-12,43,4,0,-12,-30,-20,-14,27; MA /M: SY='S'; M=-2,-1,5,-9,-12,-16,-14,-13,-7,-15,-18,-11,10,-19,-9,-15,12,4,-6,-37,-17,-12; MA /M: SY='P'; M=6,-12,-24,-12,-2,-24,-17,-15,-11,4,-17,-7,-12,9,2,-5,-4,-6,-7,-24,-17,-1; MA /M: SY='Q'; M=3,-14,-25,-14,-1,-21,-18,-10,-8,-8,-3,-2,-14,7,10,-10,-7,-8,-14,-22,-14,3; MA /M: SY='Q'; M=-10,-4,-32,-2,16,-38,-20,4,-20,6,-22,-4,-4,12,45,4,-2,-10,-30,-22,-14,29; MA /M: SY='Y'; M=-13,-17,-30,-15,-11,1,-25,-1,-9,-10,-13,-9,-17,17,-10,-14,-10,0,-16,-2,25,-15; MA /M: SY='V'; M=-4,-17,-21,-15,-7,-14,-21,-14,1,-13,0,1,-15,-4,0,-12,-4,-3,2,-27,-12,-5; MA /M: SY='S'; M=7,-5,-19,-8,-5,-19,-12,8,-18,-10,-19,-11,-1,3,-4,-12,10,10,-13,-29,-10,-6; MA /M: SY='B'; M=-10,9,-25,9,1,-25,-16,-5,-13,-4,-19,-11,8,-2,5,-7,-1,-5,-13,-32,-17,3; MA /M: SY='H'; M=-11,0,-21,-8,-9,-9,-17,17,-5,-12,1,8,7,-21,-4,-8,-7,-1,-10,-29,-2,-8; MA /M: SY='E'; M=-3,-3,-24,2,19,-23,1,-11,-21,-5,-19,-15,-4,-11,0,-9,4,-6,-14,-29,-20,9; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=13(13); /POSITIVE=13(13); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=TAFH/NHR1; CC /VERSION=5; DR Q5F3B1 , MTG16_CHICK, T; O75081 , MTG16_HUMAN, T; DR O54972 , MTG16_MOUSE, T; O43439 , MTG8R_HUMAN, T; DR O70374 , MTG8R_MOUSE, T; Q9IAB2 , MTG8R_XENLA, T; DR Q06455 , MTG8_HUMAN , T; Q61909 , MTG8_MOUSE , T; DR Q92750 , TAF4B_HUMAN, T; G5E8Z2 , TAF4B_MOUSE, T; DR O61707 , TAF4_CAEEL , T; P47825 , TAF4_DROME , T; DR O00268 , TAF4_HUMAN , T; 3D 2H7B; 2KNH; 2P6V; 2PP4; 5ECJ; 6MZC; 6MZD; 6MZL; 6MZM; 7EDX; 7EG7; 7EG8; 3D 7EG9; 7EGA; 7EGB; 7EGC; 7EGD; 7EGE; 7EGF; 7EGG; 7EGI; 7EGJ; 7ENA; 7ENC; 3D 8GXQ; 8GXS; 8WAK; 8WAL; 8WAN; 8WAO; 8WAP; 8WAQ; 8WAR; 8WAS; PR PRU00440; DO PDOC51119; //