Entry: PS51127

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BIG1
Accession [info] PS51127
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51127
Associated ProRule [info] PRU00445

Name and characterization of the entry

Description [info] Big-1 (bacterial Ig-like domain 1) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=103;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=103;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.4456511; R2=0.0206623; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6092.71751; R2=10.57815; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=245; N_SCORE=8.5; H_SCORE=9964; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=32; N_SCORE=4.1; H_SCORE=6378; MODE=1; TEXT='R?';
/DEFAULT: B1=*; E1=*; MM=*; II=*;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=-85; E0=*; BM=-1; BD=-42;
/M: SY='Q'; M= -2,-30,-16,  9,-33, -3, 13,  7,  4,-30,-21,-13,-28, 18,-14,  1,  0, 14,-33,-26; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M= 12,-18,-41, -1,-17,-35,-23, 14,-31,  9,-10,-30,-35,-28,-30, -2,  9, 16,-22,-19; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-17,-31, 10,  2,-34,-27,-13,-32, -9, -8,-22,  3,-28,  8,-14,  7, 24,  4,-33,-26; M0=-9;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='L'; M= -5,-24,-50,-44, 15,-42,-31, 17,-40, 25,-11,-39,-42,-35,-38, -5,-26,-15,-28,-25; M0=-20;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='Q'; M=  9,-30,-16,  1,-32,-27,-13, -1,  3, -7,-21,  3,-28, 18,-14, 15,  1, -1,-32,-26; M0=-6;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 19,-25,-20,-14,-26,-28,-15, -2,  2,-25,-17,  6,  1,  7,-17,-18,  9, 14,-29,-23; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='S'; M=  6,-27, 15,-15,-29, -1,-17, -2,-14,-27,-19,-17,  1,-13,-18, 17, 14, -1,-31,-26; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='K'; M=  0,-32,  1,  1,-35, -5,-13,-32, 22, -7,-22,  5, 10, -9,-14, 12,-16,-28,-33,-27; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='D'; M=  6,-32, 20,-13,  4,  6,-17,-34,-13,-34,-25, 18,-30,-13,-18, -1, 15,-30,-36,-30; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='E'; M=-17,-32, 11, 12,-35,  9,-13,-32, -9, -6,-23, 11, -2,  8,-14,  7,  9,-28,-33,-27; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M= 17,-27,-55,-50,  2,-49,-41, 26,-47,-23,-20,-46,-49,-45,-47,-41,  1, 19,-39,-35; M0=-25;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M= -1,-17,-40,-34,-17,-34,-23, 21, -1,  4, -9,-30, -1,-27,-29, -3, 15, 14,-22,-19; M0=-10;
/I:         MM=-1; MI=-93; MD=-41; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 31,-28,-48,-47,-49,  7,-42,-46,-44,-49,-40,-37,-39,-41,  5,  1,-26,  0,-52,-50; M0=-26;
/I:         MM=-1; MI=-92; MD=-39; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6;
/M: SY='N'; M=-32,-47, 28,-17,  8,-33,-28,-51,-30,-51,-44, 29,-39,-25,-38,-30, 12,-46,-50,-40; M0=-26;
/I:         MM=0; MI=-91; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-8; DD=-12;
/M: SY='N'; M= -1,-46,-14,  3,-50, 26,-25,-48,  4,-47,-39, 26,-37,-21,-29,-28,-30,-43,-49,-41; M0=-21;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6;
/M: SY='N'; M=-16,-30,-15,  4,-33, -2,-13,-31,  3, -6,-21, 17,-27,  8,  2,-15, 15, 15,-32,-26; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-15; DD=-6;
/M: SY='D'; M=  7,-35, 28, 11,-39, -4,-17,-36,-14,-36, 13,-15,-31,-13,-20,-20, 15,-32,-38,-31; M0=-14;
/I:         MM=-44; MI=-38; MD=-2; IM=-10; II=-10; DM=-4; DD=-22;
/M: SY='V'; M=-14,-13,-33,-32,-16,-27,-27,  7,-30, -8, -7,-28,-30,-29,-29,-22,-15, 34,-26,-22; M0=-17;
/I:         MM=0; MI=-68; MD=-78; IM=-9; II=-11; DM=-42; DD=-1;
/M: SY='G'; M=-20,-22,-27,-29,-37, 37,-29,-41,-33,-41,-36,-27,-28,-31,-32,-22,-24,-33,-32,-36; M0=-26;
/I:         MM=0; MI=-68; MD=-78; IM=-9; II=-11; DM=-30; DD=-2;
/M: SY='R'; M= -8,-21, -4, 18,-26,-16, -4,-23,  2,-22,-13, -3,-18,  1, 20, 13, -8,-18,-24,-17; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-73; MD=-83; IM=-9; II=-11; DM=-1; DD=-47;
/M: SY='A'; M= 20,-22,-24, -2,-22,-30,-17,  2,-17,  2, 10,-20,  9,  6,-20,  5,  2,-17,-26,-21; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M= -3,-20,-29,-23,-20, -2,-19, 17,-21,-19,-12,  3,-32,  5,-23,  6, 17,  9,-24,  8; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-25,-34,-28,-22,-37,-35,-22,-35,-14,-36,-28,-24,-36,  8,  2, -1, 33,-32,-37, 18; M0=-19;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='L'; M=-38,-34,-62,-56,-24,-56,-45, 13,-53, 23, 23,-53,-53,-46,-50,-48,-37, 13,-38, 17; M0=-30;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-17,-32,  4,  1,-35,-27,-14,-33,  9,-32,-23,-13,-28, 15,-15,  7, 26,-28,-34,  7; M0=-12;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 25,-19,-45,-38, 12,-37,-26,  5,-34, -2,-11,-33,-37,-31,-33, -3,-20, 15,-25,-21; M0=-16;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-17,-31,-16, 10,-33,-27,-14,  0,  3, -7,-22,  5,-28,  8,-14,-16, 29,-26,-33,-26; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=-40,-35,-66,-63,-32,-62,-59,-10,-62, 11,-19,-61,-59,-57,-61,-57,-40, 35,-49,-47; M0=-39;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='K'; M=  9,-30,-16,  3,-33,-27,-13,-30, 20, -6, 10,-13,-28, 14,  2,-16,  7, -1,-32,-26; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='D'; M=-39,-59, 39,-18,-61,-36,-31,-61,  9,-59,-54,  3,-42,-28,-43,-35,-40,-55,-61,-50; M0=-34;
/I:         MM=-2; MI=-93; MD=-31; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M= -1,-30,  4, 11,  1,  6,-12, -3,  5,-30,-21,  7,  0,  7,-13,-14, 15,-26,-32,-25; M0=-6;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-3; DD=-26;
/M: SY='N'; M=-17,-32,  1, 13,  0,  5,-14,-33,  3,-32,-23, 20,-28, -9,-15, 11,-17,-28,-34, 16; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='G'; M=-35,-48, 12,-20,-60, 31,-32,-59,-37,-59,-52,  3,-42,-29,-46, 13,-37,-52,-60,-51; M0=-30;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M=-20,-35,  3,-12,-38,-29, 11,-35, 15,-35,-26, 32,-30,-12,-17,-19, -1,  7,-36,-30; M0=-15;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='P'; M=  6,-32,-28, -2,-44,  9,-33,-41,-34,  3,-36,-29, 34,-31,-38,-27,-28,-36,-47,-42; M0=-19;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M=-37,-32,-63,-58,-30,-59,-52, 24,-56, 15,-18,-56,-56, 14,-55,-52,-37, 21,-45,-43; M0=-32;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 25,-35,-16,  3,-39,-29,-17,-36,  3,-36,-27, 17, 12,-12,-18, -1,-20,-32,-38,-31; M0=-14;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M=-38,-59, 22,  1,-60, 23,-30,-60,-34,-58,-52, 25,-42,  7,-44,-34,-39,-54,-60,-49; M0=-30;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='Q'; M=  7,-26,-19,  0,-27,-28, 13, -2,  9,  1,-17,-16,-29, 22,-17,-18, -1, 12,-29,-24; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='E'; M= -3,-32,-15, 21,-35,-27,-13,-32,  5,-32, 10, 13, 14, -9,-14,-16, 14,-28,-33,-27; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=-35,-31,-62,-60,-39, -5,-59,  6,-59,-27,-26,-55,-56,-58,-60,-49,-35, 37,-55,-50; M0=-36;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M= -1,-25,-22,-16,-26,-29,-17,-22,-15,-24,-17,  2,-30,  7,-19,  6, 29,  5,-29,  7; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='F'; M=-50,-43,-72,-67, 41,-70,-49,  9,-65,  8,-13,-65,-61,-52,-59,-64,-48,-26,-37,-33; M0=-41;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=  7,-31,  3,-15,-36,-29,-18,-33,-15, -6,-25, 12,-31,-14,-20, 19, 22,-29,-37,-30; M0=-12;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=  0,-17,-42,-36,-17,-34,-23,  3,-32,  8, 12,-31,-35,-28,-30, -4, 17, 20,-22, 10; M0=-13;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='P'; M= -3,-30,-16,-10,-33, -1,-13,-30,  4, -7,-21, 11, 17,  8,-14,  6,  9,  6,-32,-26; M0=-6;
/I:         MM=-2; MI=-93; MD=-33; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M= -2,-30,-14, 10,-33,-25,-12,-30, -8,  2,-21, 17,  3,  7,-13, 16,  4,-26,-32,-25; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-5;
/M: SY='G'; M=  2,-34, 21,-28,-56, 28,-37,-54,-41,-56,-47,-29,-39,-35,-46, 10,-30,-43,-57,-52; M0=-27;
/I:         MM=-4; MI=-92; MD=-22; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-5;
/M: SY='V'; M=  8,-26,  7, -7,-29,-23,-10,-26,  7,-26,-18,-10,  4, -6,-12, 10,  5, 17,-29,-22; M0=-7;
/I:         MM=-4; MI=-88; MD=-22; IM=-9; II=-11; DM=-13; DD=-8;
/M: SY='A'; M= 24,-27,-19,-15,-38,  5,-19,-36,  5,-36,-27, 10,-29,-15,-20, 16,-18,-29,-38,-32; M0=-14;
/I:         MM=0; MI=-87; MD=-98; IM=-9; II=-11; DM=-19; DD=-4;
/M: SY='A'; M= 20,-26,-15,  6,-30,-24,-13,-27, -9,-28,-19,  9,-26, -8,-14,  9, 13,  1,-30,-24; M0=-9;
/I:         MM=-1; MI=-88; MD=-36; IM=-9; II=-11; DM=-29; DD=-2;
/M: SY='W'; M=-13,-26,-11,  6,-29,  9, -9,-26,  8,  5,-17, 15,-23, -5,-10, 10,-12,-22, 25,-22; M0=-6;
/I:         MM=-1; MI=-87; MD=-35; IM=-9; II=-11; DM=-31; DD=-2;
/M: SY='F'; M=  3,-12,-37,-30, 31,-29,-18, -7,-26,  2, -4,-25,-30,-23,-25,-20,  7,  9,-16, 15; M0=-12;
/I:         MM=-2; MI=-86; MD=-33; IM=-9; II=-11; DM=-33; DD=-2;
/M: SY='T'; M=-13,-26,-12, -8,-31,-22,-11,-29,  9,-29,-20, 12, 10, -7,-12,  6, 27,-24,-31,-24; M0=-10;
/I:         MM=-2; MI=-84; MD=-32; IM=-9; II=-11; DM=-10; DD=-10;
/M: SY='L'; M=-28,-26,-51,-46,-19,-44,-35,  8,-42, 28, -8,-42,  7,-37,-40,-36,  7,-13,-30,-29; M0=-22;
/I:         MM=-1; MI=-88; MD=-36; IM=-9; II=-11; DM=-18; DD=-5;
/M: SY='S'; M=-15,-26,-16,  4,-31,  9,-14,-27,-11, -1,-20,-14, 12,-10,-16, 22,  4,-24,-31,-25; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-88; MD=-99; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20;
/M: SY='N'; M=-32,-49, 13,-16,-52,-33,-26,-51,-27,-50,-42, 32,  1, 20,-34, 12,-32,-46,-52,-42; M0=-24;
/I:         MM=-3; MI=-38; MD=-32; IM=-19; II=-4; DM=-4; DD=-22;
/M: SY='N'; M= -1,-30,-14,  5,-33, 10,-12,-31, 10,-30, 12, 18,  4,  9,-13,  8,-15,-26,-32,-25; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-9; DD=-11;
/M: SY='G'; M=  8,-19,-34,-29,-20, 23,-22,  1,-26, -3,-12, 19,-34,-24,-27, -2,-18,  1,-24,-21; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-21;
/M: SY='T'; M=-21,-22,-37,-31,-24,-35,-26, 10,  7,-22,-16,-30,-37,-27,-29, 16, 26,  9,-29,-25; M0=-15;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 22,-22,-24, 12,  6, -4,-18,  2, -1,-21,-13,-20,-31,-16,-21, -3,-17, -1,-26,  8; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M=-19,-18,-39,-33,-18,-35,-23, 17, 16, -1, 13, 10,-35,-27,-29,-25, 16,  9,-23,-19; M0=-13;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-34,-47,  5,-21,-59,-35,-33,-59,-38,-59,-52,  4,-42,-31,-46,-33, 38,-51,-60,-51; M0=-34;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='D'; M=-37,-56, 34,-17,-58,-35, 14,-57,-32,-56,-49, 24,-41,  4,-41, -3,-37,-52,-58,-47; M0=-30;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='H'; M= 15,-31,-16,  1,-33, -3, 21, -4, -9,-31,-22,  5,-28,  7,-14, 12,  1, -2,-33,-26; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M= -3,-46, 18,  1,-48,-33,-24,-47,-23,-46,-38, 32,-36, 15,-29,  6,-29,-42,-48,-39; M0=-21;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='G'; M=-65,-58,-68,-72,-74, 39,-65,-83,-74,-78,-76,-69,-63,-72,-69,-68,-68,-77,-62,-74; M0=-64;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='I'; M=-18,-21,-26, -2,-21,-31,-18, 18, 12,  4,-13,  4,-32,-18,  2,-21,  2, 12,-25,  7; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 33,-36,-57,-55,  9,-50,-26, -1,-51,-29,-27,-44,-51,-43,-47,-42,-39,-29,-20, 12; M0=-30;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-17,-31,-15,  1,-35,-26, 10, -2, 14,-32,-22,  5,-27, 15,  1,  6, 17,-28,-33,  7; M0=-9;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M= 18,-26,-53,-48, 14,-47,-39, 17,-45,-22,-19,-44,-47,-42,-44,-39,  1, 23,-36,-33; M0=-24;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=  4,-31,  3,-16,-40,-29,-20,-37,-16,-37,-28,-19,  2,-15,  4, 12, 29,-32,-39,-33; M0=-15;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='L'; M=-28, 17,-52,-46,  7,-45,-33,  5,-42, 27,-11,-41,-44,-37,-40,-36,-28,  2,-29, 10; M0=-23;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M= -3,-30,-30,-25,-40,-32,-25,-37, 21,-38,-30,-25,-35,-22,-23,  6, 29,-32, 22,-36; M0=-19;
/I:         MM=-32; MI=-93; MD=-2; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='P'; M=-12,-14,-16,-18,-25,-15,-17,-25,-18,-26,-21,-16, 39,-18,-19,-14,-15,-21,-23,-23; M0=-16;
/I:         MM=-14; MI=-7; MD=-72; IM=-1; II=-35; DM=0; DD=-49;
/M: SY='G'; M=  9,-30,-47,-49,-56, 24,-46,-54,-51,-56,-47,  2,  4,-46,-50, 22,-28,-42,-58,-57; M0=-29;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M= -1,-20,  0,-21,  3,-31,-19,-16, -1, -5,-12,-22,-32,-18,-22, -2, 29,  8,-25,-20; M0=-9;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='K'; M= -3,-31,-16,  4,-34,-27,-13,-31, 24, -8, 11,-13,-28,  8,-14, -1, 17,-27,-33,-26; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 13,-27,  0,-13,  1,-28,-15,-25,-12,  3,-18,  3,  9,  7,-16,  6,  9, -3,-30,-24; M0=-5;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='G'; M=-51,-54,-39,  0,-70, 37,-51,-74,-56,-72,-67,-46,-55,-51,-59,-51,-54,-67,-62,-66; M0=-48;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=  6,-31, 10,  1,-34,-27,-13,-32,  3,-31,-22,-13,-27,  7,-14,  0, 20, 14,-33,-26; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='H'; M= -1,-30,  2,-10,-33,-27, 25,-30,  2,-30,-21, 13,-28, -9,-14,  5,  0, 12,-33, 20; M0=-9;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-19,-17,-39,-33,-17,-34,-22,  3,-30, -3, 13,-29, -2,  5,  0,-25, 28, 13,-22,-19; M0=-12;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=-39,-33,-65,-61,  7,-63,-58, 13,-60,  6,-19,-59,-59,-56,-59,-56,-38, 33,-49,-46; M0=-36;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-20,-33,-18,  9,-36,-29,-16,-33,  4,-33, 11,-16,-31,-12,-16, 12, 30,-29,-36,-29; M0=-15;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='A'; M= 31,-31,-59,-57,-37,-44,-51,-12,-55, -6,-26,-48,-49,-52,-54,-38,-33, 19,-49,-46; M0=-31;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-17,-32,  1,  1,-35,-27,-13,-32, 10,-32,-22,-13,-28, -9, 16, 16, 18, -2,-33,-27; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=-31,-28,-55,-49,  6,-48,-37,  2,-45, 19, 12,-45,-47,-40,-43,-40, 10, 23,-33,-31; M0=-24;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='E'; M= 10,-31, 11, 14,-35, -5,-13,-32, -9,-32,-22,  3,-27,  6,-14,  6,  8,  7,-33,-27; M0=-8;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M= -2,-41,  4,  2,-44, 18,-20,-41,-18,-41,-32, 29,-34,-16,-24, -2,-25,-37,-43,  9; M0=-16;
/I:         MM=-1; MI=-93; MD=-43; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='N'; M= -1,-26,-18,-13,-27, 15,-15,-23,-12,-25, 12, 21,-28, 19,-16, -1,-16, -1,-29,  5; M0=-8;
/I:         MM=-1; MI=-93; MD=-41; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20;
/M: SY='G'; M= 11,-31,  4, -9,-34, 17,-13,-31, -8,-31,-22, 12,  3,  6,  2,-15,  2, -2,-33,-26; M0=-8;
/I:         MM=-9; MI=-92; MD=-11; IM=-9; II=-11; DM=-14; DD=-7;
/M: SY='Q'; M=  4,-16,-18,-12, 12,  4,-12,-13,-11,-16, -9,-13,-24, 21,-14, 14,-11,  7,-21,-16; M0=-6;
/I:         MM=-2; MI=-31; MD=-94; IM=-15; II=-6; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='S'; M=  7,-22,  3,-13,-23,-27,-14,  4,  2,-21,-14,-15,-28,-11,-16, 17,  9, 14,-26,-21; M0=-7;
/I:         MM=0; MI=-90; MD=-101; IM=-9; II=-11; DM=-2; DD=-31;
/M: SY='S'; M=-18,-24,-21,  2,-25,-29,-16,-21,  2,  3, 12,-18,-30,  5,-18, 21,-17, 15,-28,-23; M0=-9;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='D'; M= -2,-31, 22,  1,-35,-26,-13,-32,  3,-32, 12, 12,  1, 20,-14,-16,  2,-28,-33,-26; M0=-11;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='Q'; M= 10,-31,-16,-11,-34,-27,-14,-31,-10,-31,-22, 11,-28, 20,  3, 11, 17, -5,-33,-26; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='Q'; M= -2,-30,-16,-10,  4,-27, 10,-30,  8,  0,-21,  4,  0, 22,  1,  1,-16,  7,-32,-26; M0=-6;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M= -2,-29, 11,  2, 10,-27,-14, -1,-10,-29,-20,-14,  8, 13,-15,  7, 14, -4,-32,-25; M0=-6;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-104; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M= -6,-31,-62,-58,-35,-59,-54, 13,-56, -2, 13,-55,-56,-54,-57,-52,-35, 33,-49,-45; M0=-33;
/I:         MM=0; MI=-93; MD=-103; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='T'; M=-16,-30,-15, 10,-33,-26, 11, -1,  3,-30,-21, 17,-27, -8,-14,  0, 23,-26,-32,  9; M0=-10;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='F'; M=-54,-45,-61,  2, 39,-59,-23,-43,-59,  4,-38,-46,-58,-47,-53,-51,-52,-44, 24, 15; M0=-36;
/I:         MM=0; MI=-92; MD=-102; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
/M: SY='V'; M=-26,-23,-51,-45,  6,-44,-35, 23,-42,-20,-16,-41,-44,  7,-41,-36,  2, 28,-33,-29; M0=-23;
/I:         B0=*; E1=-10;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 42 in 9 different sequences
Number of true positive hits 42 in 9 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 17
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Big-1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
9 sequences

EAEA_HAFAL  (P52869), EAE_CITFR   (Q07591), EAE_ECO11   (O31000), 
EAE_ECO27   (P19809), EAE_ECO57   (P43261), INVA_YEREN  (P19196), 
INVA_YERPS  (P11922), YEEJ_ECO57  (Q8X8V7), YEEJ_ECOLI  (P76347)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

1CWV; 1F00; 1F02

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission