PROSITE entry PS51135

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CIDE_N
Accession [info]	PS51135
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51135
Associated ProRule [info]	PRU00447

Name and characterization of the entry

Description [info]

CIDE-N domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=78;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3071549; R2=0.0166859; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5106.3129883; R2=3.3325124; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=462; H_SCORE=6646; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=252; H_SCORE=5946; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P';  M= -8, -9,-28, -8,  2,-25,-18, -8,-17,  6,-20, -4, -7, 18, 10,  3, -2, -2,-19,-26,-16,  4;
/M: SY='P';  M=  1, -6,-24, -7,  0,-22,-14,-10,-13, -3,-13, -8, -2,  7,  4, -7, -1, -4,-16,-27,-17,  1;
/M: SY='R';  M= -7, -5,-28, -6,  4,-25,-18, -7,-28, 35,-24,-10, -1,-14,  8, 39, -8, -9,-18,-20,-11,  4;
/M: SY='P';  M= -7,-20,-21,-15, -9,-22,-15,-21,-13,-15,-18,-13,-18, 43,-15,-20, -7, -8,-15,-31,-25,-15;
/M: SY='F';  M=-13,-20,  5,-29,-26, 35,-26,-20, -1,-24,  0, -3,-13,-30,-31,-19,-13, -7,  6,-14,  6,-26;
/M: SY='R';  M=-15, -6,-29, -6,  3,-22,-21,  6,-26, 29,-18, -6, -1,-17,  7, 37,-12,-11,-19,-21, -6,  3;
/M: SY='V';  M= -4,-26,-15,-28,-25,  2,-30,-26, 24,-23, 20, 11,-26,-27,-24,-20,-13,  2, 31,-26, -6,-25;
/M: SY='R';  M=-11,-14,  0,-16,-11, -7,-21,-13,-18,  4,-15,-10, -8,-23, -8, 18, -4, -5, -6,-25,-10,-11;
/M: SY='N';  M=  1, 13,-18, 11,  1,-23, -6, -5,-23,  0,-24,-18, 16,-13, -1,  3, 14,  6,-16,-33,-18,  0;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='M';  M= -1,-12,-20,-16,-12, -8,-15,  3, -3,-13, -1,  5, -9,-11, -8,-12,-10, -9, -4, -9, -3,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='B';  M=-11, 12,-23, 12,  7,-18, -7,  6,-23,  3,-20,-14, 11,-13,  1,  2,  0, -3,-21,-22, -5,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R';  M= -7, -4,-22, -4,  2,-22,-12,  9,-25,  7,-24,-12,  5,-15, 10, 25, 11,  1,-18,-29,-10,  3;
/M: SY='E';  M=  3,  1,-22, -1,  8,-24, -2, -9,-24,  2,-23,-16,  4, -4,  0, -1,  7,  0,-19,-28,-19,  3;
/M: SY='R';  M= -9,-14,-16,-15, -4,-18,-24,-15, -4, -1,-11, -4,-11, -6, -3,  1, -7, -6, -2,-27,-13, -6;
/M: SY='K';  M=-12, -5,-31, -3,  9,-30,-20, -5,-27, 31,-26, -9, -2,  0, 17, 29, -8,-10,-23,-21,-12, 11;
/M: SY='Y';  M=-12,-12,-23,-15, -9,  5,-24, -3,-12,  7,-11, -4, -8,-20, -9,  6,-10, -3, -5,-13,  8, -9;
/M: SY='G';  M=  4, -8,-28, -7,-10,-29, 53,-18,-36,-15,-27,-19, -1,-17,-14,-18,  1,-17,-27,-21,-28,-12;
/M: SY='V';  M=  0,-29,-16,-32,-28, -1,-30,-29, 31,-22, 14, 12,-26,-26,-25,-22,-12, -3, 39,-26, -8,-28;
/M: SY='A';  M= 21,-12,  0,-22,-14,-13,-11,-16, -4,-12, -3,  7,-12,-15, -9,-17,  2,  4,  2,-24,-14,-12;
/M: SY='A';  M= 47,-10,-11,-19,-11,-21,  5,-20,-12,-11,-11,-11, -9,-11,-11,-20,  9, -1, -2,-20,-21,-11;
/M: SY='S';  M=  1, -7,-20, -8, -6,-20,  2, -3,-22, -2,-22,-13,  1,-16, -3,  8, 11,  0,-12,-29,-15, -6;
/M: SY='S';  M=  5,  2,  0, -2, -4,-18, -6,-12,-19,-11,-26,-18, 10,-13, -4,-11, 30, 21,-10,-39,-19, -4;
/M: SY='L';  M=-11,-27, -2,-28,-20,  4,-29,-20,  9,-25, 35, 12,-26,-31,-19,-14,-26,-10,  5,-24, -5,-20;
/M: SY='E';  M= -3,  0,-28,  3, 23,-31, -7, -3,-26,  9,-21,-12, -1, -9, 22,  6,  0,-10,-25,-23,-17, 22;
/M: SY='E';  M=-12, 19,-30, 31, 43,-33,-11, -1,-33,  5,-23,-23,  5, -4, 12, -4,  0,-11,-30,-32,-21, 27;
/M: SY='L';  M= -8,-30,-19,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 19,-22, -2,-23;
/M: SY='L';  M=-12,-22,-24,-23,-14, -5,-28,-16,  7, -5, 14,  8,-17,-24,-10,  9,-19, -9,  6,-21, -5,-14;
/M: SY='N';  M= -4, 11,-22, 10,  7,-24, -9, -3,-25,  8,-26,-18, 15,-13,  4, 12, 10,  0,-20,-32,-17,  4;
/M: SY='K';  M= -5, -7,-30, -8,  2,-23,-18,-13,-27, 33,-26,-11, -6,-13,  4, 22,-11,-11,-19,  0, -6,  3;
/M: SY='A';  M= 17,-15,-18,-20,-19,-17,  9,-23, -5,-17, -9, -6,-11,-17,-17,-20,  1, -4,  3,-22,-18,-19;
/M: SY='C';  M= -5,-10, 30,-17,-15,-18,-14,-16,-20,-14,-11,-11, -6,-27,-11, -9, -7, -9,-13,-34,-20,-14;
/M: SY='E';  M= -7,  6,-27, 10, 14,-26,-17, -4,-19,  4,-14,-11,  0,-12, 11,  6, -4, -9,-18,-26,-14, 11;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='T';  M=  0,-12,-18,-17,-10, -9,-19,-16,  1, -4,  2,  1, -9,-15, -7,  0, -5,  4,  2,-20, -7,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='F';  M=-12,-26,-18,-30,-21, 33,-26,-18, 11,-26, 30, 11,-23,-26,-25,-18,-23, -9,  5, -7, 10,-21; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='Q';  M= -4, -2,-24, -4,  8,-23,-18, -4,-12,  5, -9, -3, -1,-15, 17,  2, -5, -7,-14,-24,-11, 13;
/M: SY='I';  M=-10,-28,-27,-32,-22,  2,-31,-24, 21,-20, 21, 12,-25,-25,-18,-19,-24,-12, 12, -1,  2,-21;
/M: SY='P';  M= -1, -3, -9, -2, -3,-21,-13,-13,-18, -8,-19,-15, -1,  5, -7,-12,  5,  0,-15,-34,-20, -6;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D';  M= -7,  4, -3,  7,  7,-19,-16,-10,-17, -3,-12,-12, -2,-13, -3, -7,  0, -1,-10,-29,-14,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='N';  M=  3,  3,-23,  3, -2,-25,  3,  0,-26, -2,-25,-16,  6, -7, -3, -4,  6, -5,-20,-29,-17, -4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G';  M= -4,-16,-24,-15,-15,-15, 16,-17,-12,-17, -7, -3,-12, -2,-15,-17, -9,-12,-11,-20,-18,-16; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='V';  M= -2,-19,-14,-19,-16,  1,-19,-19,  7,-17,  3,  1,-17,-11,-18,-16, -2,  1, 14,-24, -8,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='T';  M= -8, -8,-20,-13, -9,-11,-21, -2, -8, -5, -7, -4, -3,-16, -5,  5,  3, 15, -4,-27, -5, -9;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='L';  M= -8,-25,-20,-25,-17,  3,-26,-19, 17,-23, 29, 12,-24,-12,-17,-19,-22, -8,  9,-20, -4,-18; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C';  M= -6,-23, 40,-27,-27,-10,-29,-17,  0,-23, -5, -3,-22,-33,-26,-22,-10, -6, 18,-38,-15,-27;
/M: SY='L';  M=-11,-29, -9,-31,-22, 15,-29,-19, 14,-29, 38, 17,-27,-30,-22,-20,-27,-10,  7,-19,  1,-21;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='Y';  M= -8, -2,-24,  2, 11, -5,-19,  2,-11, -4, -4, -7, -8,-14,  0, -8, -8, -8,-14, -8, 13,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E';  M= -3,  4,-26, 10, 39,-27,-16, -3,-27,  8,-20,-18,  0, -4, 14,  5,  4, -6,-24,-29,-19, 26;
/M: SY='D';  M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G';  M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T';  M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='E';  M= -5,-11,-24, -9, 11,-14,-24,-13, -1, -5,  0, -3,-12,-14, -2, -4, -9, -8,  0,-25,-12,  3;
/M: SY='V';  M= -3,-30,-16,-32,-29,  1,-32,-29, 33,-23, 18, 13,-28,-28,-27,-22,-15, -3, 40,-27, -7,-29;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D';  M=-12, 28,-21, 40, 22,-27, -9,  0,-27,  2,-19,-19, 10, -5,  4, -5,  0, -7,-21,-27,-14, 13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D';  M= -5, 19,-17, 20,  2,-22,-10, -8,-22, -6,-23,-19, 15,-11, -4, -9, 18, 20,-15,-36,-16, -1;
/M: SY='E';  M=-12, 19,-30, 32, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  5, -2, 15, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 33;
/M: SY='D';  M=-10, 25,-29, 38, 38,-33,-14, -1,-33,  4,-23,-23,  8, -5, 10, -6,  1, -9,-28,-33,-20, 24;
/M: SY='Y';  M=-19,-23,-17,-27,-24, 41,-30,  5, -2,-17,  2, -1,-20,-31,-20,-14,-19,-10, -7, 19, 58,-24;
/M: SY='F';  M=-19,-29,-21,-37,-28, 69,-30,-16,  2,-28, 12,  2,-21,-30,-35,-19,-21,-10,  0, 10, 33,-28;
/M: SY='Q';  M= -5,-11,-28,-11,  3,-26,-20, -5,-12,  2,-11, -2, -8, -1, 21,  7, -6, -9,-17,-21,-12, 10;
/M: SY='C';  M=  7, -5, 15,-12,-12,-15,-13,-17,-15,-15,-14,-13, -1,-18,-12,-16, 13, 14, -6,-35,-18,-12;
/M: SY='L';  M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='P';  M=  1, -8,-32, -2,  3,-29, -9,-17,-22, -8,-25,-19,-11, 47, -7,-17, -4, -9,-24,-28,-26, -5;
/M: SY='D';  M= -5, 17,-27, 25, 13,-31,-11, -7,-28,  1,-27,-22,  7,  9,  0, -8,  2, -6,-24,-33,-21,  5;
/M: SY='N';  M=-11, 33,-24, 26,  4,-27,  5,  4,-27, -2,-29,-21, 40,-17,  2, -4,  6, -5,-30,-36,-20,  3;
/M: SY='T';  M=  3,  0,-12, -7, -1,-14,-17,-17,-13, -8,-12,-12,  0, -9, -6,-10, 18, 38, -4,-30,-12, -4;
/M: SY='E';  M= -9,  0,-14,  4, 14,-22,-18,  0,-21,  4,-17, -9, -2,-13,  4,  4, -1, -6,-15,-31,-14,  8;
/M: SY='F';  M=-14,-30,-21,-35,-25, 39,-31,-21, 15,-30, 30, 12,-25,-29,-28,-21,-25,-10,  8, -7, 13,-25;
/M: SY='V';  M= -4,-24,-14,-28,-24,  0,-26,-19, 22,-17, 14, 23,-24,-25,-18,-16,-11,  2, 30,-26, -6,-21;
/M: SY='L';  M=  8,-22, -6,-27,-20, -1,-22,-19,  8,-20, 13,  4,-21,-24,-18,-20,-12, -5, 11,-18, -1,-20;
/M: SY='L';  M= -7,-26,-18,-26,-19,  5,-26,-20, 16,-27, 37, 14,-25,-28,-19,-19,-20, -5, 11,-23, -3,-19;
/M: SY='L';  M= -4,-15,-21,-16, -5, -5,-22,-14, -4,-10,  1, -1,-14,-10, -3, -6, -7,  0, -3,-21, -7, -4;
/M: SY='P';  M=  0,-11,-23, -9, -4,-20,-15, -7,-13, -4,-18,-10, -7, 10, -6, -8,  4, -1, -9,-30,-15, -6;
/M: SY='G';  M= -5,  0,-29,  1,-14,-24, 43,-11,-34,-15,-27,-19,  5,-20,-15,-16, -1,-16,-28,-18,-16,-15;
/M: SY='E';  M=-10, -1,-28,  3, 28,-29,-21,  0,-20,  9,-17, -8, -3, -9, 28, 10, -2, -9,-20,-25,-14, 27;
/M: SY='S';  M= -3, -9, -5,-13, -8, -8,-18, -6,-15, -3,-16, -9, -4,-17, -8, -6,  3,  1, -8,-26, -7, -8;
/M: SY='W';  M=-18,-29,-45,-30,-23,  2,-18,-24,-20,-17,-22,-20,-26,-15,-17,-18,-31,-24,-30,107, 17,-17;
/M: SY='N';  M= -3, -2,-23, -8, -6,-18,-16, -2, -6,  0,-14, -2,  4, -9, -1, -4, -2, -4, -6,-28,-11, -4;
/M: SY='P';  M= -9,-10,-35, -3, -6,-26,  6,-15,-26,-12,-27,-19,-10, 39,-12,-18, -7,-13,-28,-23,-20,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	15 in 15 different sequences
Number of true positive hits	15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	PS_Langendijk_Genevaux
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CIDE-N
Version [info]	5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

15 sequences

CIDEA_HUMAN (O60543), CIDEA_MOUSE (O70302), CIDEB_BOVIN (Q3T191),

CIDEB_HUMAN (Q9UHD4), CIDEB_MOUSE (O70303), CIDEC_BOVIN (F1MN90), 
CIDEC_HUMAN (Q96AQ7), CIDEC_MOUSE (P56198), CIDEC_RAT   (Q5XI33), 
DFFA_HUMAN  (O00273), DFFA_MOUSE  (O54786), DFFB_BOVIN  (Q58CZ0), 
DFFB_HUMAN  (O76075), DFFB_MOUSE  (O54788), DFFB_RAT(Q99N34)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

8 PDB

1C9F; 1D4B; 1F2R; 1IBX; 1V0D; 2EEL; 4IKG; 4MAC