Entry: PS51135

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CIDE_N
Accession [info] PS51135
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUN-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51135
Associated ProRule [info] PRU00447

Name and characterization of the entry

Description [info] CIDE-N domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=78;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=73;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3071549; R2=0.0166859; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2505.46972; R2=21.42936; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=462; N_SCORE=10.0; H_SCORE=11099; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=252; N_SCORE=6.5; H_SCORE=7884; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='P'; M= -8, -9,-28, -8,  2,-25,-18, -8,-17,  6,-20, -4, -7, 18, 10,  3, -2, -2,-19,-26,-16,  4;
/M: SY='P'; M=  1, -6,-24, -7,  0,-22,-14,-10,-13, -3,-13, -8, -2,  7,  4, -7, -1, -4,-16,-27,-17,  1;
/M: SY='R'; M= -7, -5,-28, -6,  4,-25,-18, -7,-28, 35,-24,-10, -1,-14,  8, 39, -8, -9,-18,-20,-11,  4;
/M: SY='P'; M= -7,-20,-21,-15, -9,-22,-15,-21,-13,-15,-18,-13,-18, 43,-15,-20, -7, -8,-15,-31,-25,-15;
/M: SY='F'; M=-13,-20,  5,-29,-26, 35,-26,-20, -1,-24,  0, -3,-13,-30,-31,-19,-13, -7,  6,-14,  6,-26;
/M: SY='R'; M=-15, -6,-29, -6,  3,-22,-21,  6,-26, 29,-18, -6, -1,-17,  7, 37,-12,-11,-19,-21, -6,  3;
/M: SY='V'; M= -4,-26,-15,-28,-25,  2,-30,-26, 24,-23, 20, 11,-26,-27,-24,-20,-13,  2, 31,-26, -6,-25;
/M: SY='R'; M=-11,-14,  0,-16,-11, -7,-21,-13,-18,  4,-15,-10, -8,-23, -8, 18, -4, -5, -6,-25,-10,-11;
/M: SY='N'; M=  1, 13,-18, 11,  1,-23, -6, -5,-23,  0,-24,-18, 16,-13, -1,  3, 14,  6,-16,-33,-18,  0;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='M'; M= -1,-12,-20,-16,-12, -8,-15,  3, -3,-13, -1,  5, -9,-11, -8,-12,-10, -9, -4, -9, -3,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='B'; M=-11, 12,-23, 12,  7,-18, -7,  6,-23,  3,-20,-14, 11,-13,  1,  2,  0, -3,-21,-22, -5,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R'; M= -7, -4,-22, -4,  2,-22,-12,  9,-25,  7,-24,-12,  5,-15, 10, 25, 11,  1,-18,-29,-10,  3;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-22, -1,  8,-24, -2, -9,-24,  2,-23,-16,  4, -4,  0, -1,  7,  0,-19,-28,-19,  3;
/M: SY='R'; M= -9,-14,-16,-15, -4,-18,-24,-15, -4, -1,-11, -4,-11, -6, -3,  1, -7, -6, -2,-27,-13, -6;
/M: SY='K'; M=-12, -5,-31, -3,  9,-30,-20, -5,-27, 31,-26, -9, -2,  0, 17, 29, -8,-10,-23,-21,-12, 11;
/M: SY='Y'; M=-12,-12,-23,-15, -9,  5,-24, -3,-12,  7,-11, -4, -8,-20, -9,  6,-10, -3, -5,-13,  8, -9;
/M: SY='G'; M=  4, -8,-28, -7,-10,-29, 53,-18,-36,-15,-27,-19, -1,-17,-14,-18,  1,-17,-27,-21,-28,-12;
/M: SY='V'; M=  0,-29,-16,-32,-28, -1,-30,-29, 31,-22, 14, 12,-26,-26,-25,-22,-12, -3, 39,-26, -8,-28;
/M: SY='A'; M= 21,-12,  0,-22,-14,-13,-11,-16, -4,-12, -3,  7,-12,-15, -9,-17,  2,  4,  2,-24,-14,-12;
/M: SY='A'; M= 47,-10,-11,-19,-11,-21,  5,-20,-12,-11,-11,-11, -9,-11,-11,-20,  9, -1, -2,-20,-21,-11;
/M: SY='S'; M=  1, -7,-20, -8, -6,-20,  2, -3,-22, -2,-22,-13,  1,-16, -3,  8, 11,  0,-12,-29,-15, -6;
/M: SY='S'; M=  5,  2,  0, -2, -4,-18, -6,-12,-19,-11,-26,-18, 10,-13, -4,-11, 30, 21,-10,-39,-19, -4;
/M: SY='L'; M=-11,-27, -2,-28,-20,  4,-29,-20,  9,-25, 35, 12,-26,-31,-19,-14,-26,-10,  5,-24, -5,-20;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-28,  3, 23,-31, -7, -3,-26,  9,-21,-12, -1, -9, 22,  6,  0,-10,-25,-23,-17, 22;
/M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 31, 43,-33,-11, -1,-33,  5,-23,-23,  5, -4, 12, -4,  0,-11,-30,-32,-21, 27;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 40, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 19,-22, -2,-23;
/M: SY='L'; M=-12,-22,-24,-23,-14, -5,-28,-16,  7, -5, 14,  8,-17,-24,-10,  9,-19, -9,  6,-21, -5,-14;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-22, 10,  7,-24, -9, -3,-25,  8,-26,-18, 15,-13,  4, 12, 10,  0,-20,-32,-17,  4;
/M: SY='K'; M= -5, -7,-30, -8,  2,-23,-18,-13,-27, 33,-26,-11, -6,-13,  4, 22,-11,-11,-19,  0, -6,  3;
/M: SY='A'; M= 17,-15,-18,-20,-19,-17,  9,-23, -5,-17, -9, -6,-11,-17,-17,-20,  1, -4,  3,-22,-18,-19;
/M: SY='C'; M= -5,-10, 30,-17,-15,-18,-14,-16,-20,-14,-11,-11, -6,-27,-11, -9, -7, -9,-13,-34,-20,-14;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-27, 10, 14,-26,-17, -4,-19,  4,-14,-11,  0,-12, 11,  6, -4, -9,-18,-26,-14, 11;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='T'; M=  0,-12,-18,-17,-10, -9,-19,-16,  1, -4,  2,  1, -9,-15, -7,  0, -5,  4,  2,-20, -7,-10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='F'; M=-12,-26,-18,-30,-21, 33,-26,-18, 11,-26, 30, 11,-23,-26,-25,-18,-23, -9,  5, -7, 10,-21; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='Q'; M= -4, -2,-24, -4,  8,-23,-18, -4,-12,  5, -9, -3, -1,-15, 17,  2, -5, -7,-14,-24,-11, 13;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-27,-32,-22,  2,-31,-24, 21,-20, 21, 12,-25,-25,-18,-19,-24,-12, 12, -1,  2,-21;
/M: SY='P'; M= -1, -3, -9, -2, -3,-21,-13,-13,-18, -8,-19,-15, -1,  5, -7,-12,  5,  0,-15,-34,-20, -6;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D'; M= -7,  4, -3,  7,  7,-19,-16,-10,-17, -3,-12,-12, -2,-13, -3, -7,  0, -1,-10,-29,-14,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='N'; M=  3,  3,-23,  3, -2,-25,  3,  0,-26, -2,-25,-16,  6, -7, -3, -4,  6, -5,-20,-29,-17, -4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G'; M= -4,-16,-24,-15,-15,-15, 16,-17,-12,-17, -7, -3,-12, -2,-15,-17, -9,-12,-11,-20,-18,-16; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='V'; M= -2,-19,-14,-19,-16,  1,-19,-19,  7,-17,  3,  1,-17,-11,-18,-16, -2,  1, 14,-24, -8,-17; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='T'; M= -8, -8,-20,-13, -9,-11,-21, -2, -8, -5, -7, -4, -3,-16, -5,  5,  3, 15, -4,-27, -5, -9;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-20,-25,-17,  3,-26,-19, 17,-23, 29, 12,-24,-12,-17,-19,-22, -8,  9,-20, -4,-18; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M= -6,-23, 40,-27,-27,-10,-29,-17,  0,-23, -5, -3,-22,-33,-26,-22,-10, -6, 18,-38,-15,-27;
/M: SY='L'; M=-11,-29, -9,-31,-22, 15,-29,-19, 14,-29, 38, 17,-27,-30,-22,-20,-27,-10,  7,-19,  1,-21;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='Y'; M= -8, -2,-24,  2, 11, -5,-19,  2,-11, -4, -4, -7, -8,-14,  0, -8, -8, -8,-14, -8, 13,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-26, 10, 39,-27,-16, -3,-27,  8,-20,-18,  0, -4, 14,  5,  4, -6,-24,-29,-19, 26;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='E'; M= -5,-11,-24, -9, 11,-14,-24,-13, -1, -5,  0, -3,-12,-14, -2, -4, -9, -8,  0,-25,-12,  3;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-16,-32,-29,  1,-32,-29, 33,-23, 18, 13,-28,-28,-27,-22,-15, -3, 40,-27, -7,-29;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='D'; M=-12, 28,-21, 40, 22,-27, -9,  0,-27,  2,-19,-19, 10, -5,  4, -5,  0, -7,-21,-27,-14, 13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -5, 19,-17, 20,  2,-22,-10, -8,-22, -6,-23,-19, 15,-11, -4, -9, 18, 20,-15,-36,-16, -1;
/M: SY='E'; M=-12, 19,-30, 32, 51,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  5, -2, 15, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 33;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-29, 38, 38,-33,-14, -1,-33,  4,-23,-23,  8, -5, 10, -6,  1, -9,-28,-33,-20, 24;
/M: SY='Y'; M=-19,-23,-17,-27,-24, 41,-30,  5, -2,-17,  2, -1,-20,-31,-20,-14,-19,-10, -7, 19, 58,-24;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-37,-28, 69,-30,-16,  2,-28, 12,  2,-21,-30,-35,-19,-21,-10,  0, 10, 33,-28;
/M: SY='Q'; M= -5,-11,-28,-11,  3,-26,-20, -5,-12,  2,-11, -2, -8, -1, 21,  7, -6, -9,-17,-21,-12, 10;
/M: SY='C'; M=  7, -5, 15,-12,-12,-15,-13,-17,-15,-15,-14,-13, -1,-18,-12,-16, 13, 14, -6,-35,-18,-12;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='P'; M=  1, -8,-32, -2,  3,-29, -9,-17,-22, -8,-25,-19,-11, 47, -7,-17, -4, -9,-24,-28,-26, -5;
/M: SY='D'; M= -5, 17,-27, 25, 13,-31,-11, -7,-28,  1,-27,-22,  7,  9,  0, -8,  2, -6,-24,-33,-21,  5;
/M: SY='N'; M=-11, 33,-24, 26,  4,-27,  5,  4,-27, -2,-29,-21, 40,-17,  2, -4,  6, -5,-30,-36,-20,  3;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-12, -7, -1,-14,-17,-17,-13, -8,-12,-12,  0, -9, -6,-10, 18, 38, -4,-30,-12, -4;
/M: SY='E'; M= -9,  0,-14,  4, 14,-22,-18,  0,-21,  4,-17, -9, -2,-13,  4,  4, -1, -6,-15,-31,-14,  8;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-35,-25, 39,-31,-21, 15,-30, 30, 12,-25,-29,-28,-21,-25,-10,  8, -7, 13,-25;
/M: SY='V'; M= -4,-24,-14,-28,-24,  0,-26,-19, 22,-17, 14, 23,-24,-25,-18,-16,-11,  2, 30,-26, -6,-21;
/M: SY='L'; M=  8,-22, -6,-27,-20, -1,-22,-19,  8,-20, 13,  4,-21,-24,-18,-20,-12, -5, 11,-18, -1,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-26,-18,-26,-19,  5,-26,-20, 16,-27, 37, 14,-25,-28,-19,-19,-20, -5, 11,-23, -3,-19;
/M: SY='L'; M= -4,-15,-21,-16, -5, -5,-22,-14, -4,-10,  1, -1,-14,-10, -3, -6, -7,  0, -3,-21, -7, -4;
/M: SY='P'; M=  0,-11,-23, -9, -4,-20,-15, -7,-13, -4,-18,-10, -7, 10, -6, -8,  4, -1, -9,-30,-15, -6;
/M: SY='G'; M= -5,  0,-29,  1,-14,-24, 43,-11,-34,-15,-27,-19,  5,-20,-15,-16, -1,-16,-28,-18,-16,-15;
/M: SY='E'; M=-10, -1,-28,  3, 28,-29,-21,  0,-20,  9,-17, -8, -3, -9, 28, 10, -2, -9,-20,-25,-14, 27;
/M: SY='S'; M= -3, -9, -5,-13, -8, -8,-18, -6,-15, -3,-16, -9, -4,-17, -8, -6,  3,  1, -8,-26, -7, -8;
/M: SY='W'; M=-18,-29,-45,-30,-23,  2,-18,-24,-20,-17,-22,-20,-26,-15,-17,-18,-31,-24,-30,107, 17,-17;
/M: SY='N'; M= -3, -2,-23, -8, -6,-18,-16, -2, -6,  0,-14, -2,  4, -9, -1, -4, -2, -4, -6,-28,-11, -4;
/M: SY='P'; M= -9,-10,-35, -3, -6,-26,  6,-15,-26,-12,-27,-19,-10, 39,-12,-18, -7,-13,-28,-23,-20,-12;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 15 in 15 different sequences
Number of true positive hits 15 in 15 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CIDE-N
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
15 sequences

CIDEA_HUMAN (O60543), CIDEA_MOUSE (O70302), CIDEB_BOVIN (Q3T191), 
CIDEB_HUMAN (Q9UHD4), CIDEB_MOUSE (O70303), CIDEC_BOVIN (F1MN90), 
CIDEC_HUMAN (Q96AQ7), CIDEC_MOUSE (P56198), CIDEC_RAT   (Q5XI33), 
DFFA_HUMAN  (O00273), DFFA_MOUSE  (O54786), DFFB_BOVIN  (Q58CZ0), 
DFFB_HUMAN  (O76075), DFFB_MOUSE  (O54788), DFFB_RAT    (Q99N34)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission