ID PFTA; MATRIX. AC PS51147; DT 01-OCT-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Protein prenyltransferases alpha subunit repeat profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=35; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=35; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3351829; R2=0.0088513; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=900; N_SCORE=10.3; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=211; N_SCORE=4.2; MODE=1; TEXT='R?'; MA /DEFAULT: M0=-33; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='Y'; M=-16,-91,44,-31,-26,-34,-73,-12,-38,18,24,30,-23,-19,-9,-6,-31,-2,-84,59; MA /M: SY='W'; M=-49,-92,19,-41,9,-89,-83,11,-80,39,-68,-23,9,-79,5,36,-75,-18,90,3; MA /M: SY='E'; M=20,-92,45,50,-43,-49,-74,-45,24,-19,-81,20,-10,15,-9,-8,-43,-84,-94,4; MA /M: SY='R'; M=-42,-95,32,46,-93,-42,-5,-42,32,-58,-83,-2,-83,18,59,13,-9,-88,-96,-22; MA /M: SY='E'; M=22,-95,-20,105,-97,-89,-74,-39,-63,-89,-86,-75,-76,-56,-72,-72,-76,-22,-98,-90; MA /M: SY='L'; M=-84,-87,-102,-95,30,-103,-87,-4,-95,83,29,-99,-100,-90,-92,-93,-80,2,-86,-66; MA /M: SY='N'; M=15,-91,3,46,-31,-22,18,-48,4,-57,-82,49,-4,43,-17,12,-26,-43,-98,-83; MA /M: SY='Y'; M=-87,-92,-98,-93,73,-99,-77,-1,-8,41,-61,-94,-100,-88,-85,-89,-82,-21,59,81; MA /M: SY='T'; M=-7,60,-87,-86,-76,-91,-91,17,-84,17,-66,-78,-88,-86,-89,-15,78,38,-101,-81; MA /M: SY='E'; M=-6,-91,30,35,-86,-31,-18,-4,28,-16,18,18,-84,15,-17,23,-7,-27,-96,-18; MA /M: SY='E'; M=-11,-94,43,58,-35,-86,-2,-39,37,-18,-10,15,-83,26,7,-16,-75,-42,-97,-82; MA /M: SY='M'; M=29,37,-93,-86,-5,-46,-87,44,18,34,52,-86,-92,-21,-82,-80,-41,4,-91,-75; MA /M: SY='I'; M=-8,-90,-101,-96,8,-101,-93,81,-94,55,4,-94,-95,-90,-95,-88,-35,-47,-88,-70; MA /M: SY='E'; M=-78,-93,17,56,10,-17,-74,-25,19,4,-13,21,-84,36,14,-8,-35,-42,-93,-78; MA /M: SY='D'; M=-4,-89,40,15,-33,-86,-78,-21,26,26,-9,23,-86,-3,-34,-3,24,-10,-97,-80; MA /M: SY='N'; M=-27,-7,83,-30,-7,-78,-69,-39,-72,-53,-86,84,-89,-25,-79,-20,-70,-22,-103,1; MA /M: SY='P'; M=30,-9,-82,-15,6,-82,-85,5,-79,-50,-78,-1,95,1,-87,0,-39,-26,-93,-85; MA /M: SY='K'; M=3,-93,9,25,-42,-23,-9,-94,68,-92,-83,-2,-83,7,31,17,-74,-89,-90,16; MA /M: SY='N'; M=-80,-5,11,-74,16,-73,39,-38,-70,-92,-83,114,-91,-71,-77,-12,-67,-45,-106,-79; MA /M: SY='Y'; M=-43,-96,-76,14,23,-89,-4,-34,-76,-76,-72,48,-29,30,-77,-77,-79,-82,-60,112; MA /M: SY='H'; M=-41,-87,-74,-72,-89,-39,82,-90,-73,-89,-81,-64,-82,45,-75,78,49,-85,44,-74; MA /M: SY='A'; M=59,18,-91,-86,-25,-27,-92,37,-86,-29,-68,-84,-5,-85,-90,-7,-9,48,-96,-82; MA /M: SY='W'; M=-93,-118,-120,-98,-57,-91,-117,-91,-89,-88,-91,-113,-97,-89,-93,-100,-105,-105,181,-4; MA /M: SY='H'; M=-45,-90,-7,-72,-4,-78,94,-42,-69,-88,-79,81,-88,24,-2,26,7,-89,-102,-16; MA /M: SY='Y'; M=-87,-5,-81,-80,10,-92,99,-35,-78,-75,-69,-22,-95,34,-75,-80,-83,-84,-63,110; MA /M: SY='R'; M=-84,-98,-84,-73,-85,-96,-10,-34,-48,16,-73,-77,-94,-62,111,-80,-34,-83,-93,-78; MA /M: SY='R'; M=-23,18,-83,-72,27,-90,-9,-83,20,-30,-8,-76,-91,47,81,-20,-29,-23,-85,15; MA /M: SY='W'; M=-49,-13,-38,-18,46,21,-90,-7,-15,-25,-77,-6,-92,1,-85,-41,-31,-6,128,2; MA /M: SY='V'; M=-25,17,-100,-95,3,-100,-93,50,-93,49,-55,-94,-96,-91,-94,-86,-12,56,-91,-16; MA /M: SY='L'; M=-8,-10,-99,-92,-29,-99,-10,42,-92,65,1,-94,-97,-20,-91,-87,-78,27,17,-1; MA /M: SY='E'; M=-26,-93,-9,44,8,-13,-76,-22,39,-53,-80,-27,-2,43,20,9,10,-41,-92,-80; MA /M: SY='N'; M=-22,-90,2,10,-33,-83,44,-83,5,2,-10,60,-87,25,30,3,14,-43,7,-77; MA /M: SY='F'; M=-2,-88,4,-42,41,-46,-12,14,-37,40,32,-7,-92,-20,-10,-11,13,-66,-85,9; MA /M: SY='P'; M=-26,-93,9,9,-30,29,31,-34,33,-86,31,-10,42,-26,-34,15,-14,-42,-92,3; MA /M: SY='D'; M=-27,-91,25,18,-87,-4,11,-78,10,2,-77,14,17,1,2,19,3,15,12,-82; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=144(27); /POSITIVE=144(27); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=6; CC /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=PFTA; CC /VERSION=3; DR Q9LX33 , FNTA_ARATH , T; P29702 , FNTA_BOVIN , T; DR Q9Y765 , FNTA_CANAX , T; Q54RT9 , FNTA_DICDI , T; DR P49354 , FNTA_HUMAN , T; Q61239 , FNTA_MOUSE , T; DR O24304 , FNTA_PEA , T; Q04631 , FNTA_RAT , T; DR O60052 , FNTA_SCHPO , T; P93227 , FNTA_SOLLC , T; DR P29703 , FNTA_YEAST , T; Q8VYB7 , PGTA1_ARATH, T; DR Q9FJ32 , PGTA2_ARATH, T; Q5EA80 , PGTA_BOVIN , T; DR O93829 , PGTA_CANAX , T; Q55DQ4 , PGTA_DICDI , T; DR Q92696 , PGTA_HUMAN , T; Q9JHK4 , PGTA_MOUSE , T; DR A5A779 , PGTA_PIG , T; Q5NVK5 , PGTA_PONAB , T; DR Q08602 , PGTA_RAT , T; O94412 , PGTA_SCHPO , T; DR Q00618 , PGTA_YEAST , T; A3KPW7 , PTAR1_DANRE, T; DR Q7Z6K3 , PTAR1_HUMAN, T; Q0IHB3 , PTR1A_XENLA, T; DR A1L3L1 , PTR1B_XENLA, T; DR A0A0M4FMK2, RAM1_PETHY , N; 3D 1D8D; 1D8E; 1DCE; 1FPP; 1FT1; 1FT2; 1JCQ; 1JCR; 1JCS; 1KZO; 1KZP; 1LD7; 3D 1LD8; 1LTX; 1MZC; 1N4P; 1N4Q; 1N4R; 1N4S; 1N94; 1N95; 1N9A; 1NI1; 1NL4; 3D 1O1R; 1O1S; 1O1T; 1O5M; 1QBQ; 1S63; 1S64; 1SA4; 1SA5; 1TN6; 1TN7; 1TN8; 3D 1TNB; 1TNO; 1TNU; 1TNY; 1TNZ; 1X81; 2BED; 2F0Y; 2H6F; 2H6G; 2H6H; 2H6I; 3D 2IEJ; 2R2L; 2ZIR; 2ZIS; 3C72; 3DPY; 3DRA; 3DSS; 3DST; 3DSU; 3DSV; 3DSW; 3D 3DSX; 3E30; 3E32; 3E33; 3E34; 3E37; 3EU5; 3EUV; 3HXB; 3HXC; 3HXD; 3HXE; 3D 3HXF; 3KSL; 3KSQ; 3PZ1; 3PZ2; 3PZ3; 3PZ4; 4EHM; 4GTM; 4GTO; 4GTP; 4GTQ; 3D 4GTR; 4GTS; 4GTT; 4GTV; 4YDO; 6J6X; 6J74; 6J7F; 6J7X; 6O60; 7RN5; 7RNI; 3D 8E9E; PR PRU00488; DO PDOC00703; //