ID   NFYA_HAP2_2; MATRIX.
AC   PS51152;
DT   01-OCT-2005 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   NF-YA/HAP2 family profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=61;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6634736; R2=0.0076225; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8405.0878906; R2=3.4995952; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=766; H_SCORE=11086; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=504; H_SCORE=10169; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-27; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='E'; M=22,-53,-28,60,-52,-24,44,-38,-33,-44,-40,-10,46,-28,-39,-33,-35,24,-60,-45;
MA   /M: SY='E'; M=-40,-56,29,59,24,-51,-34,-42,20,-42,-40,-33,-43,45,-29,-35,-14,6,-48,10;
MA   /M: SY='E'; M=-12,-54,-3,63,-60,-44,-32,-57,41,-53,-45,-28,-39,55,-22,30,-32,-51,-55,-46;
MA   /M: SY='P'; M=-42,-65,-44,-36,-47,-10,-42,-49,-41,-56,-45,-47,109,-43,-51,-38,9,-52,-47,35;
MA   /M: SY='I'; M=-41,-50,-63,-58,-4,-65,-55,68,-55,42,28,-56,-56,-51,-56,-51,-37,32,-51,-32;
MA   /M: SY='Y'; M=-48,-55,-54,-53,51,-57,-23,-27,-47,8,42,-52,-60,-43,-44,-47,-43,-33,-13,105;
MA   /M: SY='V'; M=-30,-44,-61,-55,-32,-62,-63,3,-53,-17,-20,-56,-57,-55,-54,-44,-28,93,-66,-40;
MA   /M: SY='N'; M=-40,-45,-13,-35,-55,-28,-20,-54,-26,-62,-48,115,-51,-28,-34,-22,-24,-56,-74,-50;
MA   /M: SY='A'; M=69,-46,25,-32,-57,-32,-44,-47,-39,-50,-43,-36,54,-37,-46,9,-30,-38,-57,-51;
MA   /M: SY='K'; M=-41,-56,-34,-20,-56,-49,-35,-58,93,-55,-43,-27,-42,-17,41,-35,-36,-53,-51,-43;
MA   /M: SY='Q'; M=-37,-63,-32,-12,-67,-45,-25,-53,-17,-49,-35,-28,-44,120,-18,-26,-40,-55,-50,-39;
MA   /M: SY='Y'; M=-49,-57,-50,-52,35,-57,12,-31,-45,7,-25,-50,-61,-41,-42,-46,-43,-36,-10,113;
MA   /M: SY='H'; M=-43,-54,-22,16,-51,-41,106,-59,16,-52,-39,68,-46,8,-27,-31,-36,-59,-71,-29;
MA   /M: SY='R'; M=5,-58,-45,-38,-50,41,-39,-59,-17,-54,-45,-36,-51,-28,82,-35,-45,-54,77,-39;
MA   /M: SY='I'; M=-43,-56,-64,-63,-27,-69,-64,98,-57,-10,-13,-54,-52,-53,-61,-52,-36,3,-51,-34;
MA   /M: SY='M'; M=-42,-49,-58,-49,-26,-60,-44,36,12,53,76,-51,-54,-42,-42,-50,-38,3,-51,-32;
MA   /M: SY='R'; M=-42,-58,-36,-23,-55,-51,-33,-59,77,-55,-43,-29,-46,-18,77,-37,-39,-53,-52,-42;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /M: SY='R'; M=-44,-61,-40,-28,-54,-54,-31,-60,28,-53,-42,-33,-52,-18,103,-39,-43,-54,-53,-41;
MA   /M: SY='Q'; M=17,-54,-26,49,-56,-43,-31,-24,4,-46,1,30,-43,72,0,-29,-35,-16,-56,-44;
MA   /M: SY='M'; M=50,-46,-39,20,-47,-38,-37,-38,-31,-21,67,-37,-44,-2,21,29,-31,-34,-54,-42;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /M: SY='A'; M=64,-48,23,-25,-58,-35,-37,-49,-27,-48,-40,-33,-45,63,24,-24,-34,-40,-55,-45;
MA   /M: SY='K'; M=9,-53,-37,-24,-53,-46,-35,-48,80,-45,43,-30,-43,16,31,-34,-36,-45,-51,-41;
MA   /M: SY='L'; M=36,-45,-57,-49,-26,-50,-45,-17,-50,66,45,-54,-55,-44,-49,-42,-38,-21,-50,-35;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-58,30,86,-62,-49,-31,-59,-21,-53,-48,-31,-37,49,-29,-32,-38,-53,-58,-49;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='D'; M=26,-60,39,14,-61,-50,-48,-56,-40,-7,-51,-41,-56,-40,14,16,-42,-51,-70,-56; D=-19;
MA   /I: I=-19; DM=-61;
MA   /M: SY='E'; M=-33,-51,-27,53,26,-43,-34,-46,-29,-7,-39,-8,-43,53,-33,51,-30,-44,-50,-35;
MA   /M: SY='N'; M=-38,-52,-34,-38,-47,40,-34,-46,21,15,-36,58,-51,-30,47,-33,-37,-47,-56,-44;
MA   /M: SY='K'; M=-38,-54,-38,-28,-52,-10,-34,-50,66,-46,42,-30,-45,-21,62,16,-35,-48,-52,-41;
MA   /M: SY='L'; M=-13,-48,-62,-56,-24,-62,-53,53,-55,59,-11,-57,-57,-50,-55,-50,-37,28,-52,-34;
MA   /M: SY='P'; M=-18,-51,-42,-38,-47,-44,-45,27,-39,-39,-35,3,68,8,-46,34,32,11,-59,-46;
MA   /M: SY='K'; M=-36,-49,-35,-32,-44,-43,-35,-41,49,20,-34,40,-47,-27,33,33,2,-41,-56,-41;
MA   /I: I=-22; MD=-71;
MA   /M: SY='S'; M=2,-53,4,26,-57,-14,-43,-14,-7,-54,-49,-33,-46,-32,9,50,22,-45,-64,-50; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='R'; M=-44,-60,-40,-27,-54,-54,-31,-60,39,-53,-42,-33,-51,-18,100,-38,-42,-54,-53,-41;
MA   /M: SY='K'; M=-40,-58,-34,-18,-59,-48,-31,-56,75,-53,-41,-27,-44,74,40,-32,-38,-54,-50,-41;
MA   /M: SY='P'; M=-19,-59,-36,-28,-59,-44,-39,-54,58,-59,-46,27,88,-30,1,-35,-35,-54,-56,-52;
MA   /M: SY='Y'; M=-50,-59,-50,-52,40,-56,-17,-33,-45,-29,-28,-50,-62,-41,-42,-45,-44,-39,-6,119;
MA   /M: SY='L'; M=-43,-48,-56,-46,-24,-59,-41,-15,15,68,65,-52,-56,-3,-40,-50,-40,-22,-50,-32;
MA   /M: SY='H'; M=-48,-59,-33,-33,-36,-50,134,-59,-37,-44,-31,-23,-49,-26,-31,-37,-45,-60,-62,42;
MA   /M: SY='E'; M=-38,-59,-10,99,-60,-54,36,-63,-20,-54,-49,-33,-34,-12,-29,-35,-39,-55,-59,-47;
MA   /M: SY='S'; M=-19,-42,-33,-35,-52,-27,-37,-52,-35,-55,-49,-22,-41,-26,-39,98,-13,-44,-60,-44;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-59,-32,-31,-46,-49,135,-64,-31,-47,-32,-22,-48,-24,21,-37,-46,-62,-78,-16;
MA   /M: SY='Q'; M=-41,-54,-41,-29,-40,-52,-35,-33,44,39,-26,0,-51,56,38,-39,-38,-19,-51,-38;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-59,-31,-31,-46,-49,139,-64,-36,-46,-32,-20,-48,-25,-30,-37,-46,-63,-81,-15;
MA   /M: SY='A'; M=89,-39,-46,-38,-54,-27,-47,-43,-40,-45,-39,-40,-44,-37,-45,-19,-30,-30,-53,-49;
MA   /M: SY='M'; M=-41,7,-62,-53,-25,-58,-39,14,-49,47,109,-53,-53,-41,-47,-51,-39,-18,-51,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-54,-32,-26,-55,-44,-31,-57,61,-55,-43,43,-47,-20,72,-14,-35,-52,-55,-43;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /M: SY='P'; M=22,-56,-42,-29,-53,-44,-40,-45,27,-1,-37,-40,74,44,20,-34,-37,-44,-53,-47;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /I: I=-24; MD=-77;
MA   /M: SY='G'; M=22,-56,-47,-55,-64,84,-53,-67,-51,-64,-55,-34,-50,-48,-57,-30,-47,-59,-56,-59; D=-24;
MA   /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77;
MA   /M: SY='P'; M=-33,38,-34,30,-50,-44,-42,-10,-14,-17,-40,-34,55,-5,-41,43,36,-39,-59,-47;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-53,22,-44,-60,87,-45,-66,-44,-63,-53,-26,-45,-41,-51,17,-40,-60,-55,-54;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-55,-42,-54,-61,96,-49,-69,-48,-64,-53,-28,-46,-45,-55,-27,-46,-62,-52,-56;
MA   /M: SY='R'; M=-45,-61,-41,-29,-54,-55,-30,-61,-1,-53,-42,-34,-53,-18,107,-39,-44,-54,-54,-40;
MA   /M: SY='F'; M=-54,-49,-66,-61,113,-61,-46,-27,-57,-18,-29,-55,-64,-67,-54,-52,-45,-32,-18,4;
MA   /M: SY='L'; M=3,56,44,-40,3,-53,-44,-24,-49,59,-20,-43,-57,-45,-50,-44,-39,-28,-55,-36;
MA   /M: SY='N'; M=8,-43,-26,-34,-51,-34,-33,-47,14,-52,-43,73,-43,-30,-34,31,56,-42,-65,-46;
MA   /M: SY='K'; M=38,-46,-34,-30,-53,-38,-39,-48,57,-50,-42,26,3,-28,-24,1,41,-40,-57,-46;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=20(20); /POSITIVE=20(20); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /VERSION=6;
DR   P53768    , HAP2_KLULA , T; P24488    , HAP2_SCHPO , T;
DR   P06774    , HAP2_YEAST , T; Q9LXV5    , NFYA1_ARATH, T;
DR   G5EEG1    , NFYA1_CAEEL, T; Q9M9X4    , NFYA2_ARATH, T;
DR   Q5ZEP9    , NFYA2_CAEEL, T; Q93ZH2    , NFYA3_ARATH, T;
DR   Q8VY64    , NFYA4_ARATH, T; Q9SYH4    , NFYA5_ARATH, T;
DR   Q9LVJ7    , NFYA6_ARATH, T; Q84JP1    , NFYA7_ARATH, T;
DR   Q9LNP6    , NFYA8_ARATH, T; Q945M9    , NFYA9_ARATH, T;
DR   Q8LFU0    , NFYAA_ARATH, T; Q5E9S2    , NFYA_BOVIN , T;
DR   Q54S29    , NFYA_DICDI , T; P23511    , NFYA_HUMAN , T;
DR   P23708    , NFYA_MOUSE , T; P18576    , NFYA_RAT   , T;
3D   4AWL; 6QMP; 6QMQ; 6QMS; 6R2V;
DO   PDOC00578;
//