Entry: PS51172

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CBM3
Accession [info] PS51172
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51172
Associated ProRule [info] PRU00513

Name and characterization of the entry

Description [info] CBM3 (carbohydrate binding type-3) domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=155;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=150;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5269365; R2=0.0157102; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9536.17573; R2=20.93201; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=444; N_SCORE=9.5; H_SCORE=17490; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=253; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14832; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M=  2,  0,-22,  2,  8,-24,-15,-11,-16, -3,-18,-13, -3,  3,  3, -9,  5,  2,-12,-29,-18,  4;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-21, -3, -3,-15,-10, -9,-16, -5,-17,-13,  3,-10, -5, -7,  5,  4,-13,-17, -8, -5;
/M: SY='G'; M=  0, -1,-23,  0, -4,-23, 10,-14,-20, -8,-19,-14,  1,-14, -9,-10,  3, -6,-13,-28,-20, -7;
/M: SY='D'; M= -4,  7,-22, 12,  3,-24, -6,-11,-17, -7,-19,-15,  2, -9, -5,-12,  3, -3,-10,-32,-19, -1;
/M: SY='L'; M=-10, -8,-24, -7,  4,-11,-25,-13,  4,-12,  9,  4,-11,-17, -4,-13,-12, -6,  0,-26, -9, -1;
/M: SY='Y'; M=-10,-11,-24,-12, -3,  8,-18, -7,-13, -1,-12, -8, -7,-18, -7, -3, -4, -4,-11,-10, 10, -5;
/M: SY='V'; M= -6,-25,-18,-28,-23, 16,-28,-18, 15,-18, 11,  8,-24,-27,-23,-16,-15, -5, 20,-13, 10,-23;
/M: SY='I'; M= -6,-16,-18,-16, -3,-10,-26,-13,  5,-11,  1,  1,-16,-20, -1,-12,-10, -7,  5,-17, -4, -3;
/M: SY='Y'; M=-13, -6,-27, -6,  4,  9,-19,  2,-14, -6, -9, -9, -6,-18, -3, -6, -8, -9,-17, -4, 21,  0;
/M: SY='A'; M=  9, -9,-20,-13, -9,-13, -2,-10,-16, -1,-14, -8, -5,-17, -6,  0,  1, -4, -9,-17, -6, -9;
/M: SY='N'; M=  0,  5,-14, -4, -6,-10,-10, -6,-15, -4,-16,-12, 12,-19, -5, -7,  0, -4,-16,-19, -8, -5;
/M: SY='N'; M= -3, -2,-23, -6,-11,-17,  1,-15, -5,-13,-11, -7,  3,-19,-13,-15, -1, -5, -3,-28,-16,-13;
/M: SY='N'; M= -7, 18,-22, 15,  5,-23, -5, -2,-20, -3,-22,-13, 20,-14,  1, -5,  7, -2,-19,-34,-18,  3;
/M: SY='T'; M=  3, -5,-18, -9, -4,-15, -9,-12,-15, -5,-15,-10, -1,-11, -1, -7, 11, 12,-10,-25,-11, -3;
/M: SY='S'; M=  2,  6,-22,  5,  8,-25, -4, -7,-20, -5,-23,-16,  9, -3,  4, -9, 11,  1,-19,-32,-20,  5;
/M: SY='S'; M= 12,  1,-18, -3, -4,-23,  8,-13,-21, -7,-22,-15,  4,-10, -6,-12, 13,  3,-14,-28,-20, -5;
/M: SY='T'; M= -3,  1,-21, -2, -4,-20, -6,-11,-17, -6,-20,-13,  4, -4, -3, -9, 10, 11,-14,-28,-14, -4;
/M: SY='N'; M= -3, 10,-19,  7,  2,-20, -7, -5,-18, -5,-20,-14, 11,-13, -3, -8, 11, 10,-13,-33,-16, -1;
/M: SY='N'; M=-10,  6,-21, -1, -5,  0, -8, -3,-18, -6,-18,-13, 14,-19, -6, -2,  4, -1,-18,-21, -2, -5;
/M: SY='T'; M=  0, -6,-11, -9, -6,-16,-19,-15, -5,-10, -9, -6, -6,-16, -3,-11,  8, 15,  3,-30,-13, -5;
/M: SY='I'; M= -9, -8,-27,-12,  5,-14,-27,-13,  9,-10,  0,  2, -6,-13,  2,-13, -8, -5,  0,-25, -9,  2;
/M: SY='I'; M= -6,-17,-19,-21,-14, -6,-26,-16,  7, -7,  4,  3,-13,-21,-11, -3,-11, -5,  7,-21, -3,-14;
/M: SY='P'; M= -5,-12,-29,-12, -4,-22,-12,-14,-15,  5,-17, -3,-10, 15, -2, -2, -8, -6,-15,-24,-16, -5;
/M: SY='A'; M=  7,-11,-21,-17,-11,-15,-12,-17, -4, -5, -9, -5, -7,-16, -7, -9, -2, -2, -1,-14,-11,-10;
/M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-28,-20, 17,-28,-11, 11,-18, 13, 11,-18,-24,-16,-11,-18, -9,  6,-12,  9,-18;
/M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-17,-10, -8,-26,-15,  2,  4, -1,  2, -8,-20, -6,  6,-14, -8,  2,-21, -6,-10;
/M: SY='I'; M=-11,-11,-24,-18,-15, -1,-26, -5, 13,-15,  4,  4, -3,-22,-12,-12,-12, -8,  6,-21,  2,-16;
/M: SY='N'; M= -7, 15,-19,  4, -3,-17,-12, -4,-12,  1,-18,-11, 24,-18, -3,  0,  4,  5,-12,-33,-15, -3;
/M: SY='N'; M=-11, 19,-24, 10,  4,-23, -9,  5,-24, 11,-26,-15, 31,-17,  8, 20,  2, -5,-26,-31,-16,  5;
/M: SY='T'; M=  2,  4,-11, -4, -6,-14,-12,-14,-13, -9,-18,-14,  9,-12, -6, -9, 24, 33, -5,-34,-14, -6;
/M: SY='G'; M=  8, -9,-18,-12,-16,-25, 41,-19,-30,-18,-23,-17, -2,-18,-16,-19,  6, -9,-20,-24,-26,-16;
/M: SY='W'; M= -9,-14,-30,-15,-13, -6, -9,-14,-20,-11,-20,-16, -9,-20,-10,-10, -5, -6,-20, 35,  2,-10;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-28, -7, -1,-25,-12,-15,-20, -5,-27,-17, -6, 39, -4,-10,  5,  3,-21,-31,-23, -5;
/M: SY='P'; M= 16, -8,-22, -9, -4,-24,-11,-18,-14, -9,-18,-14,-10, 22, -7,-17,  4,  1,-12,-26,-21, -7;
/M: SY='V'; M=-10,-20,-22,-21,-15, -5,-27,-11,  7, -5,  2,  4,-16,-24,-11,  8,-12, -5, 12,-21, -2,-15;
/M: SY='D'; M= -8,  6,-22,  7, -4,-13,-12, -7,-12, -8,-14, -8,  4,-11, -7,-11,  0, -4,-10,-28,-10, -6;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-16,-20,-11, -2,-23,-18,  6,-19, 21,  6,-18,-22,-14,-15,-12,  1,  4,-25, -7,-13;
/M: SY='D'; M= -1, 16,-20, 19,  8,-27, -9, -7,-26,  3,-26,-19, 11,-10,  2, -4, 13,  5,-18,-33,-17,  5;
/M: SY='D'; M=-11, 16,-27, 21, 11,-31, -6, -6,-31, 13,-27,-18,  9,-11,  5,  6,  1, -5,-24,-29,-17,  8;
/M: SY='L'; M= -5,-29,-18,-30,-24,  4,-28,-23, 24,-26, 31, 17,-27,-28,-22,-21,-21, -7, 23,-23, -4,-23;
/M: SY='K'; M= -2, -4,-19, -5,  0,-20,-15,-13,-15, 12,-20, -8, -1,-12,  1,  4,  9,  8, -5,-29,-13,  0;
/M: SY='V'; M= -1,-27,-18,-32,-25, 17,-27,-23, 18,-24, 16,  8,-23,-25,-25,-21,-15, -6, 19,-15,  3,-25;
/M: SY='R'; M=-19, -7,-30, -8,  1,-21,-19,  5,-30, 28,-21,-10,  3,-19, 10, 60, -9,-10,-21,-21, -9,  1;
/M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-18,-16, 25,-29, 17, -2, -9, -1, -1,-18,-28, -9,-10,-17, -7,-11, 24, 71,-17;
/M: SY='Y'; M=-20,-28,-32,-30,-25, 40,-28, -3, -5,-18, -2, -5,-25,-30,-21,-15,-25,-15,-12, 53, 54,-23;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-33,-26, 44,-30,-12,  9,-23, 12,  9,-22,-29,-27,-18,-20, -9,  7,  3, 29,-26;
/M: SY='D'; M= -9, 22,-20, 23,  3,-23,-15, -7,-24, -2,-20,-18, 12,-11, -4, -7,  9, 19,-15,-34,-14,  0;
/M: SY='L'; M= -3,-14,-22,-16,-12, -8,-23,-17,  7,-11, 10,  4,-12,-20, -9,-11,-10, -4,  4,-24, -7,-12;
/M: SY='D'; M= -7, 24,-21, 31, 11,-28, -9, -6,-28, -3,-27,-23, 13,-10,  0, -8, 15,  8,-19,-37,-18,  6;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -7,  8,-26, 15, 23,-28,  4, -3,-30, -2,-24,-19,  5, -5,  4, -7,  4, -8,-26,-29,-20, 13; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='V'; M= -3, -8,-17,-10,-11, -8,-14,-14,  3,-12,  0,  1, -7,-15,-12,-13, -6, -1,  5,-22, -8,-12; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M:         M= -6,-14,-22,-16, -8, -2,-18,-12, -1, -6, -2,  0,-11,-12, -5, -7, -8, -6, -2,-15,  0, -8; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='A'; M= 11,  0,-18,  0,  7,-23, -2,-10,-19, -1,-18,-13, -1, -5,  3, -8,  7,  0,-14,-23,-17,  5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='Q'; M=  7, -6,-19, -9,  2,-19,-13, -7, -9,  3, -9, -2, -5,-12, 10, -2, -1, -5, -9,-18, -8,  6; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='G'; M= -3,  2,-25, -1, -9,-26, 31,-12,-30,-11,-26,-17, 10,-17, -8,-10,  5, -4,-25,-26,-23, -9;
/M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-25,-17, 27,-24, -6,  0,-16,  1,  0,-16,-25,-15,-12,-13, -8, -3,  3, 28,-17;
/M: SY='T'; M= -2, -7,-22,-10,-11, -5,-14,-16,-12,-10,-14,-11, -7,-17,-11,-12,  0,  5, -7,  1, -2,-10;
/M: SY='C'; M= -6,-19, 19,-22,-19,-12,-26,-24, -5,-21, -9, -8,-18, -4,-21,-23, -8, -5,  0,-34,-18,-21;
/M: SY='D'; M=-12, 34,-26, 44, 14,-34, -9, -1,-33,  3,-29,-24, 19,-11,  4, -5,  6, -5,-26,-37,-19,  9;
/M: SY='D'; M=-18,  9,-32, 17, -1,-11,-18,  7,-24, -7,-19,-16, -2,-19, -3,-10,-11,-13,-23,  8, 13, -3;
/M: SY='V'; M= 14,-22,-16,-28,-21, -7,-21,-24, 18,-19,  8,  8,-19,-19,-17,-22, -6, -3, 21,-23,-10,-20;
/M: SY='Q'; M= -2, -2,-18, -6, -2,-24, -7, -9,-19,  2,-20, -9,  1,-11,  6, -2,  4,  4,-15,-26,-14,  2;
/M: SY='V'; M= -4,-24,-17,-28,-25,  2,-29,-22, 24,-19, 11, 10,-21,-26,-22,-17,-12, -2, 29,-22, -1,-25;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='S'; M=  0,  1,-11,  1,  3,-11, -8, -5, -9, -3, -6, -7,  1, -8,  0, -3,  4,  4, -7,-18, -9,  2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='S'; M=  4,  0,-11, -3, -5,-10,  0, -8, -8, -5,-10, -7,  2, -9, -5, -7,  5,  4, -5,-15, -8, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-19, -8,-11,-14, 10,-10,-16, -8,-18,-11,  3,-16, -9, -8,  5, -1,-11,-20, -9,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='C'; M= -1, -8,  4,-12,-11, -7,-15,-11,-15,-13,-13,-12, -7,-14,-11,-15,  2,  2,-10,-21, -2,-11; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='S'; M=  8, -1,-20, -5, -3,-19,  2, -9,-17, -7,-19,-13,  4,-14, -3,-11, 10,  0,-13,-25,-13, -3;
/M: SY='N'; M= -6,  8,-24,  4,  6,-23, -7, -1,-20,  4,-23,-12, 13, -9,  8, -1,  4, -4,-21,-27,-12,  6;
/M: SY='V'; M= -2,-12,-21,-15,-15,-15,  2,-19, -2,-14, -9, -5, -6,-20,-16,-13, -3, -5,  4,-26,-16,-16;
/M: SY='S'; M=  5, -2,-16, -4, -3,-21, -3,-14,-18, -7,-18,-12, -1, -5, -6,-10,  8,  5,-11,-29,-19, -5;
/M: SY='A'; M=  8, -7,-16,-11,-11,-18,  6,-15,-17, -7,-16,-11, -4,-17,-12,-11,  2, -2, -7,-25,-17,-11;
/M: SY='T'; M=  0,-11,-18,-16,-11, -9,-19,-19,  1, -7, -4, -2, -8,-17,-10,-10,  0,  8,  6,-25,-10,-11;
/M: SY='F'; M= -8,-14,-18,-19,-14, 19,-20,-13, -2,-15, -5, -2, -7,-21,-16,-13, -1,  1,  1,-16,  4,-14;
/M:         M= -4,-11,-22,-13,-12,-17, -3,-17, -8, -6,-11, -5, -7,-14, -9, -7, -2, -3, -1,-26,-15,-11;
/M: SY='P'; M= -6, -8,-27, -6,  4,-18,-14,-14,-13, -4,-15,-10, -7, 11, -5,-10, -3, -4,-15,-26,-16, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-24,-23,-16,  3,-24,-15,  7,-18, 13,  8,-19,-11,-16,-16,-17, -6,  2,-18,  0,-17;
/M: SY='S'; M=  3, -6,-20, -6, -3,-17,-10,-13, -8, -9,-11, -9, -5, -9, -7,-13,  4,  0, -4,-29,-15, -6;
/M: SY='W'; M= -6,-11,-28,-14,-10, -7,-18, -9,-12, -4,-16,-10, -8, -5, -7, -8, -8, -5,-14,  6,  5, -9;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-25, 12,  1,-24,-10,  0,-23, -7,-24,-18,  6,  9, -5,-12,  5, -1,-20,-32,-15, -3;
/M: SY='A'; M=  6,-10,-18,-12,-10,-15, -4,-15,-10, -9,-11, -8, -9,-14,-12,-12,  1,  2,  0,-25,-13,-12;
/M: SY='S'; M=  5,  2,-20,  3,  3,-22, -5,-10,-20, -4,-19,-15,  2, -7, -1, -7,  9,  2,-15,-28,-15,  0;
/M: SY='G'; M= -3,  6,-25,  5, -1,-26, 12,-10,-29,  4,-26,-17,  9,-14, -4,  0,  3, -5,-22,-26,-20, -3;
/M: SY='A'; M= 15,  2,-19, -4, -8,-21,  6, -1,-20, -8,-18,-13,  7,-15, -7,-11,  5, -3,-15,-24,-14, -8;
/M: SY='D'; M=-13,  8,-27,  9, -5,-18,-23,-13,  4,-14, -5, -5,  3,-16, -9,-18, -7, -6, -2,-30,-10, -9;
/M: SY='Y'; M=-13,-12,-26,-13,-12,  7,-21, 16,-10, -4, -8, -4, -9,-23, -4, -3, -9, -4,-13,  3, 39,-11;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-21,-20, 29,-29, 16,  1,-11,  0,  0,-20,-29,-12,-11,-19, -9, -8, 26, 73,-20;
/M: SY='V'; M= -7,-27, -6,-31,-26,  6,-31,-26, 21,-25, 19, 10,-24,-27,-24,-22,-16, -2, 22,-24, -4,-26;
/M: SY='E'; M=-10, 12,-27, 19, 38,-27,-19, -3,-25,  5,-16,-17,  2, -5, 12, -2,  0, -4,-24,-30,-17, 25;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-21,-34,-26,  6,-31,-24, 31,-25, 21, 18,-23,-24,-21,-23,-18, -7, 25,-20, -2,-25;
/M: SY='D'; M= -3, 17,-23, 24,  4,-30, 10, -8,-32, -6,-28,-23, 11,-12, -4,-11, 10, -3,-23,-33,-22,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-29,-17,-36,-27, 49,-25,-18, -1,-26,  9,  2,-23,-30,-31,-19,-22,-12, -3, 17, 23,-26;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='T'; M=  2, -1,-15, -6, -4,-16,-14,-15,-13, -1,-17,-11,  2, -7, -5, -5, 15, 22, -5,-29,-13, -5; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='G'; M=  1,  3,-23,  3, -7,-26, 33,-12,-31,-12,-28,-20,  9,-15,-10,-14, 11, -6,-23,-28,-24, -8; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='G'; M= -2,  2,-23,  1, -6,-24, 11,-12,-21, -9,-19,-13,  3,-15, -5, -9,  3, -1,-15,-26,-18, -5; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='T'; M=  0, -5,-19, -9, -7,-15,-14,-11, -8, -2,-11, -5, -2,-16, -3, -3,  3,  5, -4,-25, -9, -6;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-34,-25,  7,-31,-24, 30,-28, 29, 17,-24,-26,-21,-24,-23, -9, 19,-18,  2,-25;
/M: SY='Y'; M= -4,-14,-20,-16,-11,  2,-11, -6,-12,-12, -7, -5,-12,-12,-11,-13, -9, -8,-12,-10,  8,-12;
/M: SY='P'; M=  2,-17,-32,-12, -4,-26,-11,-20,-18, -8,-23,-16,-16, 52,-10,-17, -6, -9,-21,-27,-26,-10;
/M: SY='G'; M=  8, -7,-26, -9,-15,-27, 44,-18,-30,-15,-24,-17,  0,-17,-16,-18,  1,-14,-22,-21,-26,-16;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G'; M=  6, -6,-24, -8, -8,-26, 31,-15,-29, -8,-24,-16,  0,-15, -7, -9,  5, -8,-21,-22,-23, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='E'; M= -6,  8,-23,  9, 15,-23,-12, -1,-20,  0,-20,-13,  7,-10, 15, -3,  6, -4,-21,-22,-12, 15; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -4, -3,-14,-13,-13, -7,-10,-12, -9,  1,-12, -5,-11, 13, 16, -3,-30,-13, -4; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G'; M= -5, -3,-21, -3,  2,-18,  9, -5,-18, -6,-12, -7, -1,-12,  1, -7, -2, -8,-17,-14,-12,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='H'; M= -7, -4, -9, -5, -5, -2,-11, 12, -6, -5, -6, -2, -1, -9, -2, -4, -4, -5, -8, -8,  9, -5; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -9, 14,-27, 21, 41,-28,-18, -2,-27,  5,-18,-19,  3, -4, 13, -3,  1, -4,-25,-31,-18, 27;
/M: SY='I'; M= -4,-27,-20,-33,-25,  6,-30,-24, 28,-24, 18, 15,-22,-23,-21,-23,-15, -5, 24,-21, -2,-25;
/M: SY='Q'; M=-11, -3,-29, -3, 12,-32,-20, 12,-18,  6,-18, -1, -1,-10, 42,  9, -1, -7,-25,-20, -6, 26;
/M: SY='F'; M=-10,-22,-17,-29,-24, 34,-15,-18, -2,-25,  6, -1,-16,-27,-28,-19,-13, -7,  0, -7, 10,-24;
/M: SY='R'; M=-12, -9,-26,-10, -2,-20,-15, -5,-26, 21,-20,-10, -1,-18,  5, 48, -4, -4,-16,-22,-12, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-24,-37,-28, 10,-34,-26, 35,-28, 21, 17,-22,-23,-23,-25,-20, -9, 24,-18,  2,-27;
/M: SY='S'; M=  7, -2,-17, -6, -3,-16,-13,  1,-14, -5,-16, -9,  0,-14, -1, -6,  9,  8, -8,-25, -6, -3;
/M: SY='A'; M=  7, -7,-22,-10, -2,-19, -6,-10,-17,  5,-17, -9, -5,-12,  1, -1,  0, -5,-12,-19, -9, -1;
/M: SY='P'; M=  0, -4,-27, -3, -3,-24, -1,-12,-22, -8,-26,-17,  0, 20, -5,-12,  4, -3,-22,-28,-20, -6;
/M: SY='D'; M= -8, 17,-20, 20,  4,-26, -3, -3,-26, -5,-22,-18, 12,-14,  1, -9,  1, -8,-24,-29,-13,  2;
/M: SY='W'; M= -9,-13,-35,-14,-14,-11,  7,-16,-25, -8,-21,-16,-10,-22,-12,-11,-16,-18,-25, 37,  1,-12;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='S'; M=  6, -4,-14, -6,  0,-15, -9,-10,-11, -4,-16, -9, -1, -6,  0, -7, 14,  9, -6,-24,-11, -1; D=-13;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='N'; M= -6, 12,-13,  4, -2,-14, -2, -1,-16, -2,-20,-13, 21, -6, -1, -3,  3, -1,-19,-25,-14, -2; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='W'; M=-18,-30,-36,-31,-25, 21,-22,-10, -8,-19, -5, -7,-28,-29,-19,-17,-28,-19,-14, 69, 37,-21;
/M: SY='D'; M=-12, 34,-24, 38, 10,-30, -8, -1,-30,  3,-28,-23, 25,-13,  0, -2,  6, -2,-25,-37,-18,  5;
/M: SY='Q'; M= -6, -2,-28, -2, 10,-24,-17,  1,-17,  0,-18, -9,  0,  4, 20, -3,  0, -6,-24,-22, -8, 14;
/M: SY='S'; M=  7, -1,-13, -4,  1,-18, -7,-10,-17, -9,-20,-15,  3,-10, -3,-10, 24, 21, -8,-33,-16, -1;
/M: SY='N'; M=-11, 36,-23, 23,  1,-22,  1,  6,-24, -2,-30,-21, 48,-19, -2, -3,  6, -3,-30,-32,-19,  0;
/M: SY='D'; M=-17, 45,-28, 64, 18,-38, -9, -1,-38, -1,-30,-29, 19,-10,  0,-10,  4, -7,-28,-40,-20,  9;
/M: SY='Y'; M=-18,-24,-34,-23,-18, 19,-26, -1, -7,-14, -9, -7,-23, -2,-15,-15,-20,-13,-16, 30, 41,-19;
/M: SY='S'; M=  9, -1, -4, -2, -2,-20, -2,-11,-20,-11,-29,-20,  8,-11, -2,-11, 37, 20,-10,-40,-20, -2;
/M: SY='F'; M=-18,-23,-22,-27,-21, 36,-28, -6, -3,-13,  4,  0,-19,-28,-20, -4,-19,-10, -5,  9, 33,-21;
/M: SY='Q'; M= -9,  2,-21, -1,  2,-23, -8, -5,-19,  2,-18, -6,  4,-12, 11,  0, -1, -3,-19,-26,-14,  6;
/M: SY='G'; M=  3,  2,-23,  0, -5,-27, 22,-12,-28, -9,-26,-18,  7,-11, -5,-12,  8, -4,-22,-27,-23, -5;
/M: SY='L'; M=  0,-10,-19,-13, -9, -8,-15,-14,  0,-17,  8,  0, -7,-19, -9,-15, -3,  0, -2,-27,-10, -9;
/M: SY='T'; M=  1, -2,-20, -8, -2,-18, -8,-11,-13, -1,-12, -4,  1,-14, -1, -3,  3,  5,-10,-26,-14, -2;
/M: SY='S'; M= -2,  3,-19,  1,  2,-23, -6,-10,-23,  6,-25,-15,  7,-11,  3,  2, 14, 11,-15,-30,-16,  3;
/M: SY='T'; M= -6,  5,-23,  5,  0,-15, -9, -8,-18, -8,-17,-14,  2,-14, -3,-10,  4,  6,-14,-19, -5, -2;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='F'; M=-10, -8,-21, -7, -8, 11,-15, -6, -9,-13, -4, -5, -8,-12,-12,-12, -8, -6,-10, -5, 10,-10; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='A'; M=  5, -9,-21,-13, -7,-19, -2,-16, -8, -7,-11, -5, -6,-15, -6,-11,  0, -1, -3,-24,-15, -7;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-25,  5,  8,-19,-19,-11,-17,  6,-15,-11, -2, -8, -1,  0, -3, -2,-12,-27,-13,  3;
/M: SY='T'; M=  1, -2,-22,-10,-11, -9,-11,-11,-14,-10,-18,-14,  3,-13, -9,-12,  4,  6,-14,  3, -3, -9;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-26,  9, 16,-28,-13, -7,-24,  8,-23,-15,  2,  1,  7,  0,  1, -4,-20,-29,-18, 11;
/M: SY='K'; M= -8, -4,-26, -6, -2,-12,-15, -3,-18, 17,-18, -8,  0,-17,  0, 10, -7, -8,-15,-12,  7, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-17,-34,-26, -2,-35,-27, 37,-25, 14, 16,-22,-23,-20,-25,-16, -8, 30,-24, -5,-26;
/M: SY='P'; M=  3,-11,-20,-14, -9,-17,-19,-21, -8,-11,-14,-11,-10, 20,-12,-16,  6, 19, -5,-28,-17,-12;
/M: SY='V'; M=  9,-22,-16,-24,-20, -3, -9,-23,  6,-20,  9,  3,-20,-23,-21,-20, -8, -5, 13,-22,-11,-20;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-21,-20, 31,-29, 16,  0,-12,  0,  0,-19,-29,-11,-10,-19,-10, -8, 23, 68,-19;
/M: SY='D'; M=-11,  4,-24,  9, -1,-16,-20,-10, -7, -6, -6, -7, -2,-18, -7, -6, -6, -6, -5,-29, -9, -5;
/M: SY='N'; M= -4, 17,-25, 13,  0,-26, 10, -2,-27, -1,-26,-18, 21,-16, -1, -3,  4, -7,-26,-29,-18, -1;
/M: SY='G'; M=  1,  1,-27,  2,-10,-29, 44,-15,-35,-14,-29,-21,  6,-17,-13,-16,  4,-13,-27,-25,-27,-12;
/M: SY='V'; M=  1,-10,-16,-11, -9,-12,-19,-20,  3, -9, -5, -3,-12,-19,-14,-13, -1,  6, 15,-29,-13,-12;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-24,-21,-11, -4,-27,-17,  5, -7, 22,  9,-20,-18,-11, -5,-22, -8,  1,-21, -4,-12;
/M: SY='V'; M= -1,-29,-14,-31,-28,  2,-30,-29, 29,-20, 11, 10,-27,-28,-27,-20,-12, -2, 41,-27, -7,-28;
/M: SY='W'; M=-16,-29,-35,-31,-24, 23,-23,-10,-11,-19, -8,-10,-26,-28,-19,-16,-24,-17,-17, 69, 36,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M= -3,  1,-20, -5,  1,-18,-18, -9, -9, -2,-12, -7,  5,-13,  4, -3,  5, 10, -8,-28,-12,  2;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-28,  6, 34,-25,-19, -8,-21,  1,-16,-16, -7, 11,  7, -7, -2, -7,-20,-29,-20, 20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-12, -2,-26,-21,-19,-16,-11,-26,-17,-20, 79,-10,-20,-11,-10,-26,-27,-24,-11;
/M: SY='G'; M= -1,  0,-25,  0, -4,-25, 13,-13,-22,-10,-23,-16,  4, -3, -9,-13,  3, -6,-18,-29,-23, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 29 in 24 different sequences
Number of true positive hits 29 in 24 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] V_Lesaux
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CBM3
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
24 sequences

CBPA_CLOCL  (P38058), CIPA_CLOTH  (Q06851), CIPB_CLOTM  (Q01866), 
GUN1_BACIU  (P07983), GUN2_BACSU  (P10475), GUN3_BACIU  (P23549), 
GUN4_BACS5  (P28622), GUN4_THEFU  (P26221), GUNA_BACPU  (Q5YLG1), 
GUNA_CALSA  (P22534), GUNA_PAELA  (P29719), GUNB_CALSA  (P10474), 
GUNB_CELFI  (P26225), GUNF_CLOTH  (P26224), GUNG_CLOCE  (P37700), 
GUNI_CLOTH  (Q02934), GUNN_PECAT  (Q59394), GUNV_PECCC  (Q47096), 
GUNW_PECSS  (Q59395), GUNZ_CLOSR  (P23659), GUX2_CLOSH  (P50900), 
MANB_CALSA  (P22533), XG74_PAESP  (Q3MUH7), YCEA_PAELA  (P29718)
» More

PDB
[Detailed view]
12 PDB

1G87; 1GA2; 1JS4; 1K72; 1KFG; 1NBC; 1TF4; 2L8A; 2XFG; 3TF4; 4B9F; 4TF4

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission