PROSITE entry PS51172
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | CBM3 |
| Accession [info] | PS51172 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2005 CREATED;
13-FEB-2019 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51172 |
| Associated ProRule [info] | PRU00513 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | CBM3 (carbohydrate binding type-3) domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=155; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=150; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5269365; R2=0.0157102; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8498.4697266; R2=6.3099933; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=444; H_SCORE=11300; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=253; H_SCORE=10095; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= 2, 0,-22, 2, 8,-24,-15,-11,-16, -3,-18,-13, -3, 3, 3, -9, 5, 2,-12,-29,-18, 4; /M: SY='S'; M= 0, 0,-21, -3, -3,-15,-10, -9,-16, -5,-17,-13, 3,-10, -5, -7, 5, 4,-13,-17, -8, -5; /M: SY='G'; M= 0, -1,-23, 0, -4,-23, 10,-14,-20, -8,-19,-14, 1,-14, -9,-10, 3, -6,-13,-28,-20, -7; /M: SY='D'; M= -4, 7,-22, 12, 3,-24, -6,-11,-17, -7,-19,-15, 2, -9, -5,-12, 3, -3,-10,-32,-19, -1; /M: SY='L'; M=-10, -8,-24, -7, 4,-11,-25,-13, 4,-12, 9, 4,-11,-17, -4,-13,-12, -6, 0,-26, -9, -1; /M: SY='Y'; M=-10,-11,-24,-12, -3, 8,-18, -7,-13, -1,-12, -8, -7,-18, -7, -3, -4, -4,-11,-10, 10, -5; /M: SY='V'; M= -6,-25,-18,-28,-23, 16,-28,-18, 15,-18, 11, 8,-24,-27,-23,-16,-15, -5, 20,-13, 10,-23; /M: SY='I'; M= -6,-16,-18,-16, -3,-10,-26,-13, 5,-11, 1, 1,-16,-20, -1,-12,-10, -7, 5,-17, -4, -3; /M: SY='Y'; M=-13, -6,-27, -6, 4, 9,-19, 2,-14, -6, -9, -9, -6,-18, -3, -6, -8, -9,-17, -4, 21, 0; /M: SY='A'; M= 9, -9,-20,-13, -9,-13, -2,-10,-16, -1,-14, -8, -5,-17, -6, 0, 1, -4, -9,-17, -6, -9; /M: SY='N'; M= 0, 5,-14, -4, -6,-10,-10, -6,-15, -4,-16,-12, 12,-19, -5, -7, 0, -4,-16,-19, -8, -5; /M: SY='N'; M= -3, -2,-23, -6,-11,-17, 1,-15, -5,-13,-11, -7, 3,-19,-13,-15, -1, -5, -3,-28,-16,-13; /M: SY='N'; M= -7, 18,-22, 15, 5,-23, -5, -2,-20, -3,-22,-13, 20,-14, 1, -5, 7, -2,-19,-34,-18, 3; /M: SY='T'; M= 3, -5,-18, -9, -4,-15, -9,-12,-15, -5,-15,-10, -1,-11, -1, -7, 11, 12,-10,-25,-11, -3; /M: SY='S'; M= 2, 6,-22, 5, 8,-25, -4, -7,-20, -5,-23,-16, 9, -3, 4, -9, 11, 1,-19,-32,-20, 5; /M: SY='S'; M= 12, 1,-18, -3, -4,-23, 8,-13,-21, -7,-22,-15, 4,-10, -6,-12, 13, 3,-14,-28,-20, -5; /M: SY='T'; M= -3, 1,-21, -2, -4,-20, -6,-11,-17, -6,-20,-13, 4, -4, -3, -9, 10, 11,-14,-28,-14, -4; /M: SY='N'; M= -3, 10,-19, 7, 2,-20, -7, -5,-18, -5,-20,-14, 11,-13, -3, -8, 11, 10,-13,-33,-16, -1; /M: SY='N'; M=-10, 6,-21, -1, -5, 0, -8, -3,-18, -6,-18,-13, 14,-19, -6, -2, 4, -1,-18,-21, -2, -5; /M: SY='T'; M= 0, -6,-11, -9, -6,-16,-19,-15, -5,-10, -9, -6, -6,-16, -3,-11, 8, 15, 3,-30,-13, -5; /M: SY='I'; M= -9, -8,-27,-12, 5,-14,-27,-13, 9,-10, 0, 2, -6,-13, 2,-13, -8, -5, 0,-25, -9, 2; /M: SY='I'; M= -6,-17,-19,-21,-14, -6,-26,-16, 7, -7, 4, 3,-13,-21,-11, -3,-11, -5, 7,-21, -3,-14; /M: SY='P'; M= -5,-12,-29,-12, -4,-22,-12,-14,-15, 5,-17, -3,-10, 15, -2, -2, -8, -6,-15,-24,-16, -5; /M: SY='A'; M= 7,-11,-21,-17,-11,-15,-12,-17, -4, -5, -9, -5, -7,-16, -7, -9, -2, -2, -1,-14,-11,-10; /M: SY='F'; M=-13,-23,-23,-28,-20, 17,-28,-11, 11,-18, 13, 11,-18,-24,-16,-11,-18, -9, 6,-12, 9,-18; /M: SY='R'; M=-11,-13,-25,-17,-10, -8,-26,-15, 2, 4, -1, 2, -8,-20, -6, 6,-14, -8, 2,-21, -6,-10; /M: SY='I'; M=-11,-11,-24,-18,-15, -1,-26, -5, 13,-15, 4, 4, -3,-22,-12,-12,-12, -8, 6,-21, 2,-16; /M: SY='N'; M= -7, 15,-19, 4, -3,-17,-12, -4,-12, 1,-18,-11, 24,-18, -3, 0, 4, 5,-12,-33,-15, -3; /M: SY='N'; M=-11, 19,-24, 10, 4,-23, -9, 5,-24, 11,-26,-15, 31,-17, 8, 20, 2, -5,-26,-31,-16, 5; /M: SY='T'; M= 2, 4,-11, -4, -6,-14,-12,-14,-13, -9,-18,-14, 9,-12, -6, -9, 24, 33, -5,-34,-14, -6; /M: SY='G'; M= 8, -9,-18,-12,-16,-25, 41,-19,-30,-18,-23,-17, -2,-18,-16,-19, 6, -9,-20,-24,-26,-16; /M: SY='W'; M= -9,-14,-30,-15,-13, -6, -9,-14,-20,-11,-20,-16, -9,-20,-10,-10, -5, -6,-20, 35, 2,-10; /M: SY='P'; M= -3,-10,-28, -7, -1,-25,-12,-15,-20, -5,-27,-17, -6, 39, -4,-10, 5, 3,-21,-31,-23, -5; /M: SY='P'; M= 16, -8,-22, -9, -4,-24,-11,-18,-14, -9,-18,-14,-10, 22, -7,-17, 4, 1,-12,-26,-21, -7; /M: SY='V'; M=-10,-20,-22,-21,-15, -5,-27,-11, 7, -5, 2, 4,-16,-24,-11, 8,-12, -5, 12,-21, -2,-15; /M: SY='D'; M= -8, 6,-22, 7, -4,-13,-12, -7,-12, -8,-14, -8, 4,-11, -7,-11, 0, -4,-10,-28,-10, -6; /M: SY='L'; M= -6,-19,-16,-20,-11, -2,-23,-18, 6,-19, 21, 6,-18,-22,-14,-15,-12, 1, 4,-25, -7,-13; /M: SY='D'; M= -1, 16,-20, 19, 8,-27, -9, -7,-26, 3,-26,-19, 11,-10, 2, -4, 13, 5,-18,-33,-17, 5; /M: SY='D'; M=-11, 16,-27, 21, 11,-31, -6, -6,-31, 13,-27,-18, 9,-11, 5, 6, 1, -5,-24,-29,-17, 8; /M: SY='L'; M= -5,-29,-18,-30,-24, 4,-28,-23, 24,-26, 31, 17,-27,-28,-22,-21,-21, -7, 23,-23, -4,-23; /M: SY='K'; M= -2, -4,-19, -5, 0,-20,-15,-13,-15, 12,-20, -8, -1,-12, 1, 4, 9, 8, -5,-29,-13, 0; /M: SY='V'; M= -1,-27,-18,-32,-25, 17,-27,-23, 18,-24, 16, 8,-23,-25,-25,-21,-15, -6, 19,-15, 3,-25; /M: SY='R'; M=-19, -7,-30, -8, 1,-21,-19, 5,-30, 28,-21,-10, 3,-19, 10, 60, -9,-10,-21,-21, -9, 1; /M: SY='Y'; M=-19,-18,-29,-18,-16, 25,-29, 17, -2, -9, -1, -1,-18,-28, -9,-10,-17, -7,-11, 24, 71,-17; /M: SY='Y'; M=-20,-28,-32,-30,-25, 40,-28, -3, -5,-18, -2, -5,-25,-30,-21,-15,-25,-15,-12, 53, 54,-23; /M: SY='F'; M=-16,-27,-21,-33,-26, 44,-30,-12, 9,-23, 12, 9,-22,-29,-27,-18,-20, -9, 7, 3, 29,-26; /M: SY='D'; M= -9, 22,-20, 23, 3,-23,-15, -7,-24, -2,-20,-18, 12,-11, -4, -7, 9, 19,-15,-34,-14, 0; /M: SY='L'; M= -3,-14,-22,-16,-12, -8,-23,-17, 7,-11, 10, 4,-12,-20, -9,-11,-10, -4, 4,-24, -7,-12; /M: SY='D'; M= -7, 24,-21, 31, 11,-28, -9, -6,-28, -3,-27,-23, 13,-10, 0, -8, 15, 8,-19,-37,-18, 6; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= -7, 8,-26, 15, 23,-28, 4, -3,-30, -2,-24,-19, 5, -5, 4, -7, 4, -8,-26,-29,-20, 13; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='V'; M= -3, -8,-17,-10,-11, -8,-14,-14, 3,-12, 0, 1, -7,-15,-12,-13, -6, -1, 5,-22, -8,-12; D=-10; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: M= -6,-14,-22,-16, -8, -2,-18,-12, -1, -6, -2, 0,-11,-12, -5, -7, -8, -6, -2,-15, 0, -8; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='A'; M= 11, 0,-18, 0, 7,-23, -2,-10,-19, -1,-18,-13, -1, -5, 3, -8, 7, 0,-14,-23,-17, 5; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='Q'; M= 7, -6,-19, -9, 2,-19,-13, -7, -9, 3, -9, -2, -5,-12, 10, -2, -1, -5, -9,-18, -8, 6; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='G'; M= -3, 2,-25, -1, -9,-26, 31,-12,-30,-11,-26,-17, 10,-17, -8,-10, 5, -4,-25,-26,-23, -9; /M: SY='Y'; M=-12,-20,-24,-25,-17, 27,-24, -6, 0,-16, 1, 0,-16,-25,-15,-12,-13, -8, -3, 3, 28,-17; /M: SY='T'; M= -2, -7,-22,-10,-11, -5,-14,-16,-12,-10,-14,-11, -7,-17,-11,-12, 0, 5, -7, 1, -2,-10; /M: SY='C'; M= -6,-19, 19,-22,-19,-12,-26,-24, -5,-21, -9, -8,-18, -4,-21,-23, -8, -5, 0,-34,-18,-21; /M: SY='D'; M=-12, 34,-26, 44, 14,-34, -9, -1,-33, 3,-29,-24, 19,-11, 4, -5, 6, -5,-26,-37,-19, 9; /M: SY='D'; M=-18, 9,-32, 17, -1,-11,-18, 7,-24, -7,-19,-16, -2,-19, -3,-10,-11,-13,-23, 8, 13, -3; /M: SY='V'; M= 14,-22,-16,-28,-21, -7,-21,-24, 18,-19, 8, 8,-19,-19,-17,-22, -6, -3, 21,-23,-10,-20; /M: SY='Q'; M= -2, -2,-18, -6, -2,-24, -7, -9,-19, 2,-20, -9, 1,-11, 6, -2, 4, 4,-15,-26,-14, 2; /M: SY='V'; M= -4,-24,-17,-28,-25, 2,-29,-22, 24,-19, 11, 10,-21,-26,-22,-17,-12, -2, 29,-22, -1,-25; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='S'; M= 0, 1,-11, 1, 3,-11, -8, -5, -9, -3, -6, -7, 1, -8, 0, -3, 4, 4, -7,-18, -9, 2; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='S'; M= 4, 0,-11, -3, -5,-10, 0, -8, -8, -5,-10, -7, 2, -9, -5, -7, 5, 4, -5,-15, -8, -6; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='G'; M= 0, -4,-19, -8,-11,-14, 10,-10,-16, -8,-18,-11, 3,-16, -9, -8, 5, -1,-11,-20, -9,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='C'; M= -1, -8, 4,-12,-11, -7,-15,-11,-15,-13,-13,-12, -7,-14,-11,-15, 2, 2,-10,-21, -2,-11; D=-8; /I: I=-8; DM=-17; /M: SY='S'; M= 8, -1,-20, -5, -3,-19, 2, -9,-17, -7,-19,-13, 4,-14, -3,-11, 10, 0,-13,-25,-13, -3; /M: SY='N'; M= -6, 8,-24, 4, 6,-23, -7, -1,-20, 4,-23,-12, 13, -9, 8, -1, 4, -4,-21,-27,-12, 6; /M: SY='V'; M= -2,-12,-21,-15,-15,-15, 2,-19, -2,-14, -9, -5, -6,-20,-16,-13, -3, -5, 4,-26,-16,-16; /M: SY='S'; M= 5, -2,-16, -4, -3,-21, -3,-14,-18, -7,-18,-12, -1, -5, -6,-10, 8, 5,-11,-29,-19, -5; /M: SY='A'; M= 8, -7,-16,-11,-11,-18, 6,-15,-17, -7,-16,-11, -4,-17,-12,-11, 2, -2, -7,-25,-17,-11; /M: SY='T'; M= 0,-11,-18,-16,-11, -9,-19,-19, 1, -7, -4, -2, -8,-17,-10,-10, 0, 8, 6,-25,-10,-11; /M: SY='F'; M= -8,-14,-18,-19,-14, 19,-20,-13, -2,-15, -5, -2, -7,-21,-16,-13, -1, 1, 1,-16, 4,-14; /M: M= -4,-11,-22,-13,-12,-17, -3,-17, -8, -6,-11, -5, -7,-14, -9, -7, -2, -3, -1,-26,-15,-11; /M: SY='P'; M= -6, -8,-27, -6, 4,-18,-14,-14,-13, -4,-15,-10, -7, 11, -5,-10, -3, -4,-15,-26,-16, -2; /M: SY='L'; M=-10,-21,-24,-23,-16, 3,-24,-15, 7,-18, 13, 8,-19,-11,-16,-16,-17, -6, 2,-18, 0,-17; /M: SY='S'; M= 3, -6,-20, -6, -3,-17,-10,-13, -8, -9,-11, -9, -5, -9, -7,-13, 4, 0, -4,-29,-15, -6; /M: SY='W'; M= -6,-11,-28,-14,-10, -7,-18, -9,-12, -4,-16,-10, -8, -5, -7, -8, -8, -5,-14, 6, 5, -9; /M: SY='D'; M= -6, 8,-25, 12, 1,-24,-10, 0,-23, -7,-24,-18, 6, 9, -5,-12, 5, -1,-20,-32,-15, -3; /M: SY='A'; M= 6,-10,-18,-12,-10,-15, -4,-15,-10, -9,-11, -8, -9,-14,-12,-12, 1, 2, 0,-25,-13,-12; /M: SY='S'; M= 5, 2,-20, 3, 3,-22, -5,-10,-20, -4,-19,-15, 2, -7, -1, -7, 9, 2,-15,-28,-15, 0; /M: SY='G'; M= -3, 6,-25, 5, -1,-26, 12,-10,-29, 4,-26,-17, 9,-14, -4, 0, 3, -5,-22,-26,-20, -3; /M: SY='A'; M= 15, 2,-19, -4, -8,-21, 6, -1,-20, -8,-18,-13, 7,-15, -7,-11, 5, -3,-15,-24,-14, -8; /M: SY='D'; M=-13, 8,-27, 9, -5,-18,-23,-13, 4,-14, -5, -5, 3,-16, -9,-18, -7, -6, -2,-30,-10, -9; /M: SY='Y'; M=-13,-12,-26,-13,-12, 7,-21, 16,-10, -4, -8, -4, -9,-23, -4, -3, -9, -4,-13, 3, 39,-11; /M: SY='Y'; M=-18,-20,-29,-21,-20, 29,-29, 16, 1,-11, 0, 0,-20,-29,-12,-11,-19, -9, -8, 26, 73,-20; /M: SY='V'; M= -7,-27, -6,-31,-26, 6,-31,-26, 21,-25, 19, 10,-24,-27,-24,-22,-16, -2, 22,-24, -4,-26; /M: SY='E'; M=-10, 12,-27, 19, 38,-27,-19, -3,-25, 5,-16,-17, 2, -5, 12, -2, 0, -4,-24,-30,-17, 25; /M: SY='I'; M= -5,-28,-21,-34,-26, 6,-31,-24, 31,-25, 21, 18,-23,-24,-21,-23,-18, -7, 25,-20, -2,-25; /M: SY='D'; M= -3, 17,-23, 24, 4,-30, 10, -8,-32, -6,-28,-23, 11,-12, -4,-11, 10, -3,-23,-33,-22, 0; /M: SY='F'; M=-17,-29,-17,-36,-27, 49,-25,-18, -1,-26, 9, 2,-23,-30,-31,-19,-22,-12, -3, 17, 23,-26; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='T'; M= 2, -1,-15, -6, -4,-16,-14,-15,-13, -1,-17,-11, 2, -7, -5, -5, 15, 22, -5,-29,-13, -5; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='G'; M= 1, 3,-23, 3, -7,-26, 33,-12,-31,-12,-28,-20, 9,-15,-10,-14, 11, -6,-23,-28,-24, -8; D=-11; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='G'; M= -2, 2,-23, 1, -6,-24, 11,-12,-21, -9,-19,-13, 3,-15, -5, -9, 3, -1,-15,-26,-18, -5; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='T'; M= 0, -5,-19, -9, -7,-15,-14,-11, -8, -2,-11, -5, -2,-16, -3, -3, 3, 5, -4,-25, -9, -6; /M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-34,-25, 7,-31,-24, 30,-28, 29, 17,-24,-26,-21,-24,-23, -9, 19,-18, 2,-25; /M: SY='Y'; M= -4,-14,-20,-16,-11, 2,-11, -6,-12,-12, -7, -5,-12,-12,-11,-13, -9, -8,-12,-10, 8,-12; /M: SY='P'; M= 2,-17,-32,-12, -4,-26,-11,-20,-18, -8,-23,-16,-16, 52,-10,-17, -6, -9,-21,-27,-26,-10; /M: SY='G'; M= 8, -7,-26, -9,-15,-27, 44,-18,-30,-15,-24,-17, 0,-17,-16,-18, 1,-14,-22,-21,-26,-16; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= 6, -6,-24, -8, -8,-26, 31,-15,-29, -8,-24,-16, 0,-15, -7, -9, 5, -8,-21,-22,-23, -8; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='E'; M= -6, 8,-23, 9, 15,-23,-12, -1,-20, 0,-20,-13, 7,-10, 15, -3, 6, -4,-21,-22,-12, 15; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='T'; M= -1, -1,-15, -4, -3,-14,-13,-13, -7,-10,-12, -9, 1,-12, -5,-11, 13, 16, -3,-30,-13, -4; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='G'; M= -5, -3,-21, -3, 2,-18, 9, -5,-18, -6,-12, -7, -1,-12, 1, -7, -2, -8,-17,-14,-12, 1; D=-8; /I: I=-8; MD=-17; /M: SY='H'; M= -7, -4, -9, -5, -5, -2,-11, 12, -6, -5, -6, -2, -1, -9, -2, -4, -4, -5, -8, -8, 9, -5; D=-8; /I: I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='E'; M= -9, 14,-27, 21, 41,-28,-18, -2,-27, 5,-18,-19, 3, -4, 13, -3, 1, -4,-25,-31,-18, 27; /M: SY='I'; M= -4,-27,-20,-33,-25, 6,-30,-24, 28,-24, 18, 15,-22,-23,-21,-23,-15, -5, 24,-21, -2,-25; /M: SY='Q'; M=-11, -3,-29, -3, 12,-32,-20, 12,-18, 6,-18, -1, -1,-10, 42, 9, -1, -7,-25,-20, -6, 26; /M: SY='F'; M=-10,-22,-17,-29,-24, 34,-15,-18, -2,-25, 6, -1,-16,-27,-28,-19,-13, -7, 0, -7, 10,-24; /M: SY='R'; M=-12, -9,-26,-10, -2,-20,-15, -5,-26, 21,-20,-10, -1,-18, 5, 48, -4, -4,-16,-22,-12, -2; /M: SY='I'; M= -8,-29,-24,-37,-28, 10,-34,-26, 35,-28, 21, 17,-22,-23,-23,-25,-20, -9, 24,-18, 2,-27; /M: SY='S'; M= 7, -2,-17, -6, -3,-16,-13, 1,-14, -5,-16, -9, 0,-14, -1, -6, 9, 8, -8,-25, -6, -3; /M: SY='A'; M= 7, -7,-22,-10, -2,-19, -6,-10,-17, 5,-17, -9, -5,-12, 1, -1, 0, -5,-12,-19, -9, -1; /M: SY='P'; M= 0, -4,-27, -3, -3,-24, -1,-12,-22, -8,-26,-17, 0, 20, -5,-12, 4, -3,-22,-28,-20, -6; /M: SY='D'; M= -8, 17,-20, 20, 4,-26, -3, -3,-26, -5,-22,-18, 12,-14, 1, -9, 1, -8,-24,-29,-13, 2; /M: SY='W'; M= -9,-13,-35,-14,-14,-11, 7,-16,-25, -8,-21,-16,-10,-22,-12,-11,-16,-18,-25, 37, 1,-12; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='S'; M= 6, -4,-14, -6, 0,-15, -9,-10,-11, -4,-16, -9, -1, -6, 0, -7, 14, 9, -6,-24,-11, -1; D=-13; /I: I=-13; MD=-27; /M: SY='N'; M= -6, 12,-13, 4, -2,-14, -2, -1,-16, -2,-20,-13, 21, -6, -1, -3, 3, -1,-19,-25,-14, -2; D=-13; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='W'; M=-18,-30,-36,-31,-25, 21,-22,-10, -8,-19, -5, -7,-28,-29,-19,-17,-28,-19,-14, 69, 37,-21; /M: SY='D'; M=-12, 34,-24, 38, 10,-30, -8, -1,-30, 3,-28,-23, 25,-13, 0, -2, 6, -2,-25,-37,-18, 5; /M: SY='Q'; M= -6, -2,-28, -2, 10,-24,-17, 1,-17, 0,-18, -9, 0, 4, 20, -3, 0, -6,-24,-22, -8, 14; /M: SY='S'; M= 7, -1,-13, -4, 1,-18, -7,-10,-17, -9,-20,-15, 3,-10, -3,-10, 24, 21, -8,-33,-16, -1; /M: SY='N'; M=-11, 36,-23, 23, 1,-22, 1, 6,-24, -2,-30,-21, 48,-19, -2, -3, 6, -3,-30,-32,-19, 0; /M: SY='D'; M=-17, 45,-28, 64, 18,-38, -9, -1,-38, -1,-30,-29, 19,-10, 0,-10, 4, -7,-28,-40,-20, 9; /M: SY='Y'; M=-18,-24,-34,-23,-18, 19,-26, -1, -7,-14, -9, -7,-23, -2,-15,-15,-20,-13,-16, 30, 41,-19; /M: SY='S'; M= 9, -1, -4, -2, -2,-20, -2,-11,-20,-11,-29,-20, 8,-11, -2,-11, 37, 20,-10,-40,-20, -2; /M: SY='F'; M=-18,-23,-22,-27,-21, 36,-28, -6, -3,-13, 4, 0,-19,-28,-20, -4,-19,-10, -5, 9, 33,-21; /M: SY='Q'; M= -9, 2,-21, -1, 2,-23, -8, -5,-19, 2,-18, -6, 4,-12, 11, 0, -1, -3,-19,-26,-14, 6; /M: SY='G'; M= 3, 2,-23, 0, -5,-27, 22,-12,-28, -9,-26,-18, 7,-11, -5,-12, 8, -4,-22,-27,-23, -5; /M: SY='L'; M= 0,-10,-19,-13, -9, -8,-15,-14, 0,-17, 8, 0, -7,-19, -9,-15, -3, 0, -2,-27,-10, -9; /M: SY='T'; M= 1, -2,-20, -8, -2,-18, -8,-11,-13, -1,-12, -4, 1,-14, -1, -3, 3, 5,-10,-26,-14, -2; /M: SY='S'; M= -2, 3,-19, 1, 2,-23, -6,-10,-23, 6,-25,-15, 7,-11, 3, 2, 14, 11,-15,-30,-16, 3; /M: SY='T'; M= -6, 5,-23, 5, 0,-15, -9, -8,-18, -8,-17,-14, 2,-14, -3,-10, 4, 6,-14,-19, -5, -2; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='F'; M=-10, -8,-21, -7, -8, 11,-15, -6, -9,-13, -4, -5, -8,-12,-12,-12, -8, -6,-10, -5, 10,-10; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='A'; M= 5, -9,-21,-13, -7,-19, -2,-16, -8, -7,-11, -5, -6,-15, -6,-11, 0, -1, -3,-24,-15, -7; /M: SY='E'; M= -7, 3,-25, 5, 8,-19,-19,-11,-17, 6,-15,-11, -2, -8, -1, 0, -3, -2,-12,-27,-13, 3; /M: SY='T'; M= 1, -2,-22,-10,-11, -9,-11,-11,-14,-10,-18,-14, 3,-13, -9,-12, 4, 6,-14, 3, -3, -9; /M: SY='E'; M= -5, 6,-26, 9, 16,-28,-13, -7,-24, 8,-23,-15, 2, 1, 7, 0, 1, -4,-20,-29,-18, 11; /M: SY='K'; M= -8, -4,-26, -6, -2,-12,-15, -3,-18, 17,-18, -8, 0,-17, 0, 10, -7, -8,-15,-12, 7, -2; /M: SY='I'; M= -8,-28,-17,-34,-26, -2,-35,-27, 37,-25, 14, 16,-22,-23,-20,-25,-16, -8, 30,-24, -5,-26; /M: SY='P'; M= 3,-11,-20,-14, -9,-17,-19,-21, -8,-11,-14,-11,-10, 20,-12,-16, 6, 19, -5,-28,-17,-12; /M: SY='V'; M= 9,-22,-16,-24,-20, -3, -9,-23, 6,-20, 9, 3,-20,-23,-21,-20, -8, -5, 13,-22,-11,-20; /M: SY='Y'; M=-19,-20,-28,-21,-20, 31,-29, 16, 0,-12, 0, 0,-19,-29,-11,-10,-19,-10, -8, 23, 68,-19; /M: SY='D'; M=-11, 4,-24, 9, -1,-16,-20,-10, -7, -6, -6, -7, -2,-18, -7, -6, -6, -6, -5,-29, -9, -5; /M: SY='N'; M= -4, 17,-25, 13, 0,-26, 10, -2,-27, -1,-26,-18, 21,-16, -1, -3, 4, -7,-26,-29,-18, -1; /M: SY='G'; M= 1, 1,-27, 2,-10,-29, 44,-15,-35,-14,-29,-21, 6,-17,-13,-16, 4,-13,-27,-25,-27,-12; /M: SY='V'; M= 1,-10,-16,-11, -9,-12,-19,-20, 3, -9, -5, -3,-12,-19,-14,-13, -1, 6, 15,-29,-13,-12; /M: SY='L'; M=-10,-21,-24,-21,-11, -4,-27,-17, 5, -7, 22, 9,-20,-18,-11, -5,-22, -8, 1,-21, -4,-12; /M: SY='V'; M= -1,-29,-14,-31,-28, 2,-30,-29, 29,-20, 11, 10,-27,-28,-27,-20,-12, -2, 41,-27, -7,-28; /M: SY='W'; M=-16,-29,-35,-31,-24, 23,-23,-10,-11,-19, -8,-10,-26,-28,-19,-16,-24,-17,-17, 69, 36,-20; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-30,-20,-30,-20; /M: SY='T'; M= -3, 1,-20, -5, 1,-18,-18, -9, -9, -2,-12, -7, 5,-13, 4, -3, 5, 10, -8,-28,-12, 2; /M: SY='E'; M= -4, -1,-28, 6, 34,-25,-19, -8,-21, 1,-16,-16, -7, 11, 7, -7, -2, -7,-20,-29,-20, 20; /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-12, -2,-26,-21,-19,-16,-11,-26,-17,-20, 79,-10,-20,-11,-10,-26,-27,-24,-11; /M: SY='G'; M= -1, 0,-25, 0, -4,-25, 13,-13,-22,-10,-23,-16, 4, -3, -9,-13, 3, -6,-18,-29,-23, -7; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 32 in 27 different sequences |
| Number of true positive hits | 32 in 27 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | window20 |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | CBM3 |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
27 sequences
CBPA_CLOCL (P38058), CIPA_ACET2 (Q06851), CIPB_ACETH (Q01866), GUN1_BACIU (P07983), GUN2_BACSU (P10475), GUN3_BACIU (P23549), GUN4_BACS5 (P28622), GUN4_THEFU (P26221), GUNA_BACPU (Q5YLG1), GUNA_CALSA (P22534), GUNA_PAELA (P29719), GUNB_CALSA (P10474), GUNB_CELFI (P26225), GUNF_ACET2 (P26224), GUNG_RUMCH (P37700), GUNI_ACET2 (Q02934), GUNN_PECAT (Q59394), GUNV_PECCC (Q47096), GUNW_PECPM (Q59395), GUNZ_THEST (P23659), GUX2_THES1 (P50900), MANB_CALSA (P22533), RSGI1_ACET2 (A3DBH1), RSGI2_ACET2 (A3DC27), RSGI4_ACET2 (A3DCG3), XG74_PAESP (Q3MUH7), YCEA_PAELA (P29718)» more
|
| PDB [Detailed view] |
17 PDB
1G87; 1GA2; 1JS4; 1K72; 1KFG; 1NBC; 1TF4; 2L8A; 2XFG; 3TF4; 4B97; 4B9C; 4B9F; 4B9P; 4TF4; 6UFV; 6UFW » more |