Entry: PS51174

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BARWIN_3
Accession [info] PS51174
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2005 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00619
Associated ProRule [info] PRU00527

Name and characterization of the entry

Description [info] Barwin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=123;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=118;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2817578; R2=0.0121974; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-13083.90535; R2=38.12873; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19483; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=264; N_SCORE=6.5; H_SCORE=17305; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-32; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M=-20,-32,-62,-32, -4,-56,-37,-20,-37, -9,-42,-24,-24,-48, 42,-25,-23,-31,-36,-58,-48, 11;
/M: SY='S'; M= -3,-17,-47,-23, -8,-55,-28,-20,-53, -8,-57,-35, -7,-36, 16,-16, 41, -2,-44,-64,-49,  0;
/M: SY='A'; M= 58,-36,-33,-46,-25,-53,-15,-39,-45,  2,-45,-33,-34,-23,-13,-19,  3,-15,-28,-64,-51,-17;
/M: SY='S'; M= -2,-14,-44,-25,-15,-52,-33,-26,-51,  5,-56,-36, -2,-33, -2,-16, 43, 10,-40,-68,-46,-12;
/M: SY='N'; M=-33, 38,-56, 23,-12,-70,-19,-14,-70,-17,-71,-56, 62,-48,-12,-30,  6,-16,-50,-59,-56,-15;
/M: SY='V'; M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='R'; M=-10,-42,-67,-52,-25,-55,-52,-18,-59, 16,-49,-34,-27,-45, -7, 67,-24,-27,-49,-67,-49,-15;
/M: SY='A'; M= 51,-46,-26,-56,-35,-38,-25,-39,-31,-25,-27, -3,-41,-28,-21,-33,  1,-13,-18,-53,-42,-26;
/M: SY='T'; M=-11,-17,-31,-38,-30,-51,-49,-38,-32,-29,-41,-21, -5,-40,-29,-30, 19, 86,-13,-70,-50,-30;
/M: SY='Y'; M=-50,-61,-59,-70,-70, 37,-80,  6,-35,-50,-37,-47,-51,-70,-41,-51,-50,-49,-46, 16,113,-60;
/M: SY='H'; M=-39, -6,-73,-22,-21,-48,-51, 93,-70,-26,-63,-50, 22,-42,  3,-14,-23,-33,-70,-58, -7,-14;
/M: SY='Y'; M=-43,-68,-50,-73,-68, 19,-79,-29, -4,-54, 11,-12,-58,-68,-46,-56,-47,-41,-20,-20, 32,-60;
/M: SY='Y'; M=-50,-60,-60,-70,-70, 40,-80, 10,-40,-50,-40,-50,-50,-70,-40,-50,-50,-50,-50, 20,120,-60;
/M: SY='N'; M=-13, 19,-47,-10,-22,-64,-23,-10,-63, -8,-63,-44, 60,-43,-11, -8,  3,-11,-58,-74,-50,-19;
/M: SY='P'; M=-16,-48,-76,-49,-39,-69,-57,-49,-68,-29,-69,-49,-47,109,-39,-49,-24,-36,-58,-79,-69,-39;
/M: SY='Q'; M= -7, -5,-62, -9, 25,-66,-39,-10,-61,  1,-58,-36,  4,-38, 36,-15,-10,-22,-48,-66,-52, 29;
/M: SY='Q'; M=-32, -8,-68,-17, -7,-45,-49, -4,-60, 14,-57,-41,  7,-46, 26,-11,-22,-30,-51,-47,-16,  1;
/M:         M=-36,-25,-51,-24,-18,-47,-62,-25, -5,-32,-30,-23, -8,-56,-25,-41,-28,-23,-10,-67,-45,-23;
/M: SY='N'; M=-26, 14,-52,-14,-33,-69,  5,-24,-68,-25,-67,-50, 51,-51,-25,-33, -2, -2,-61,-75,-58,-30;
/M: SY='W'; M=-47,-75,-62, -4,-69,-10,-60,-46,-58,-69,-52,-40,-65,-70,-44,-62,-39,-53,-48,124,  7,-60;
/M: SY='D'; M=-39, 47,-70, 77, 12,-74,-36,-30,-74,-28,-76,-72,  8,-46,-20,-46,  1,-29, -8,-13,-66, -4;
/M: SY='L'; M=-40,-79,-50,-80,-70,  2,-80,-57, 17,-60, 75, 26,-69,-70,-50,-60,-60,-40, -2,-47,-33,-60;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='R'; M=-10,-16,-59,-33,-28,-61,-31,-20,-65, -5,-61,-44,  8,-25,-15, 10,-14,-23,-56,-70,-50,-22;
/M: SY='A'; M= 33,-51,  6,-46,-45,-45,-39,-52,-24,-35,-35,-26,-45,-41,-35,-39, -9,-10, -4,-61,-52,-37;
/M: SY='A'; M= 38,-53,-24,-29,-38,-42,-39,-53, -7,-33,-23,-17,-53,-37,-33,-43,-11,-10, 22,-56,-50,-33;
/M: SY='S'; M= -1,  3,-40,  3,-12,-56,-24,-30,-56,-22,-64,-48,  2,-34,-20,-34, 69,  9,-32,-57,-54,-16;
/M: SY='A'; M= 33,-48,-34,-49,-35,-46,-37,-41,-22,-19,-32,-24,-43,-36,-25,-13,-11,-17,-10,-61,-49,-28;
/M: SY='Y'; M=-50,-59,-52,-70,-72, 62,-77,-10,-34,-52,-26,-34,-51,-69,-46,-53,-48,-48,-43,  8, 81,-62;
/M: SY='C'; M=-28,-74,100,-65,-88,-32,-70,-74,-36,-80,-50,-40,-56,-80,-66,-78,-38,-38,-34,-24,-45,-78;
/M: SY='A'; M= 56,-30,-23,-40,-27,-50,-13,-37,-43,-20,-47,-33,-26,-23,-20,-30, 37,  0,-27,-63,-50,-20;
/M: SY='T'; M=-18, -5,-40,-13,-20,-56,-48,-38,-40,-30,-48,-31, -6,-42,-28,-34, 12, 65, -8,-57,-54,-24;
/M: SY='W'; M=-52,-77,-72, -6,-65,-11,-66,-46,-60,-46,-52,-40,-67,-70,-37,-51,-60,-62,-50,122,  7,-57;
/M: SY='D'; M=-50, 60,-79, 97, 19,-80,-39,-29,-80,-29,-80,-79, 14,-50,-20,-49,-19,-39, -2, -3,-69, -1;
/M: SY='A'; M= 55,-23,-27,-38,-29,-55, -9,-33,-47,-19,-47,-35,-11,-27,-19,-29,  7,-11,-31,-64,-51,-21;
/M: SY='D'; M=-31, 27,-65, 29,-15,-75,  2,-31,-77,-29,-76,-66, 26,-51,-26,-43, -5,-30,-43,-45,-66,-20;
/M: SY='K'; M=-24,-33,-73,-43,-12,-52,-56,-27,-51, 58,-45,-13,-19,-38, 11, 34,-26,-28,-44,-70,-50, -8;
/M: SY='P'; M=-18,-42,-77,-44,-31,-67,-55,-45,-67, -4,-67,-47,-39, 81,-27,-33,-20,-34,-57,-79,-65,-31;
/M: SY='L'; M=-43,-75,-52,-78,-70, 12,-80,-43,  5,-58, 50, 10,-65,-70,-48,-58,-57,-43,-13,-32,  0,-60;
/M: SY='A'; M= 27,-36,-37,-40,-20,-44,-32,-39,-34,-25,-25,-23,-34,-34,-21,-35, 12,-11,-25,-63,-50,-17;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='W'; M=-49,-73,-57,  0,-65,  0,-57,-40,-49,-65,-40,-32,-65,-65,-40,-57,-57,-57,-40,137, 16,-57; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-24,-32,-65,-40,-16,-49,-49, -8,-57, 24,-49,-32,-16,-40,  0, 81,-24,-24,-49,-57,-40, -8; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='Q'; M= -5,-14,-41,-18, -3,-45,-29,-10,-45,  2,-45,-26, -5,-29, 28, -5, 27, -4,-37,-50,-37,  8; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='K'; M=-23,-26,-80,-36, -6,-60,-53,-24,-63, 79,-60,-40,-13,-36, 14, 51,-23,-30,-53,-77,-50, -3;
/M: SY='Y'; M=-50,-61,-59,-71,-71, 44,-80,  7,-39,-51,-38,-48,-51,-70,-41,-51,-50,-50,-49, 19,116,-61;
/M: SY='G'; M=-12,-34,-72,-42,-56,-78, 61,-58,-86,-46,-78,-66,-26,-26,-48,-58,-22,-48,-76,-72,-78,-48;
/M: SY='W'; M=-59,-90,-69, -2,-80,  0,-70,-50,-58,-79,-46,-38,-80,-80,-50,-70,-70,-69,-49,164, 18,-70;
/M: SY='T'; M=  7,-24,-28,-42,-30,-50,-42,-40,-32,-28,-40,-22,-16,-36,-28,-30, 18, 71,-12,-68,-50,-28;
/M: SY='A'; M= 80,-40,-20,-50,-30,-50,-10,-40,-40,-20,-40,-30,-40,-20,-20,-30, 10,-10,-20,-60,-50,-20;
/M: SY='F'; M=-50,-68,-44,-78,-78, 97,-80,-30,-24,-58, -8,-18,-66,-70,-56,-58,-50,-50,-34,  4, 55,-68;
/M: SY='C'; M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='G'; M=-16,-41,-60,-49,-63,-64, 53,-61,-67,-53,-49,-50,-30,-62,-51,-61,-28,-48,-63,-66,-72,-53;
/M: SY='P'; M=-26,-29,-80,-21,-29,-72,-56,-46,-72,-30,-72,-56,-39, 87,-36,-50,-28,-40,-49,-65,-70,-32;
/M: SY='A'; M= 33,-46,-33,-33,-41,-50,-11,-52,-27,-34,-37,-30,-43,-39,-34,-44, -8,-17, -4,-59,-56,-34;
/M: SY='G'; M=-14,-32,-72,-42,-52,-76, 61,-50,-86,-35,-76,-64,-20,-58,-40,-29,-22,-46,-76,-70,-74,-42;
/M: SY='P'; M=  5,-28,-57,-39,-33,-64,-38,-38,-61,-23,-61,-44,-16, 47,-28,-38,-13,-25,-50,-74,-60,-30;
/M: SY='H'; M=-34,-37,-64,-49,-34,-18,-63, 21,-52,-17,-42,-33,-23,-53,-14, 12,-26,-18,-48,-50,-14,-26;
/M: SY='G'; M=-12,-28,-72,-38,-49,-76, 63,-54,-84,-21,-76,-64,-18,-54,-37,-43,-20,-46,-74,-72,-74,-40;
/M: SY='Q'; M=-21,-23,-71,-24, 14,-60,-51,  7,-61, 21,-51,-23,-11,-41, 94, 15,-21,-30,-51,-53,-41, 41;
/M: SY='S'; M= 11,-11,-48, -7,-18,-61,-30,-37,-57,-25,-60,-48,-20, -3,-24,-39, 16,-15,-27,-52,-58,-19;
/M: SY='S'; M= 19,-17,-28,-29,-24,-50,-24,-34,-44,-22,-53,-34, -9,-30,-22,-30, 62, 28,-31,-68,-50,-22;
/M: SY='C'; M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='G'; M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/M: SY='K'; M=-24,-27,-80,-37, -7,-60,-54,-23,-64, 75,-60,-40,-14,-37, 13, 55,-24,-30,-54,-76,-50, -4;
/M: SY='C'; M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='L'; M=-42,-78,-47,-80,-72, 20,-80,-57, 15,-60, 62, 21,-70,-70,-52,-60,-58,-41, -4,-41,-25,-62;
/M: SY='R'; M=-23,-34,-70,-42,-16,-55,-54,-14,-60, 20,-50,-33,-18,-46, 12, 55,-14,-24,-52,-66,-48, -5;
/M: SY='V'; M= -1,-64,-28,-10,-46,-34,-67,-64, 25,-44, -8, -6,-64,-52,-44,-54,-30,-10, 61,-52,-50,-44;
/M: SY='T'; M=-11,-21,-33,-40,-29,-51,-50,-39,-32,-25,-41,-21,-10,-40,-28,-24, 17, 83,-13,-70,-50,-29;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N'; M=-40, 50,-50, 10,-20,-70,-20,  0,-70,-10,-70,-50,110,-50,-10,-20,  0,-10,-70,-80,-50,-20;
/M: SY='T'; M=-19,-30,-53,-45,-27,-55,-55,-29,-49, -6,-50,-30,-17,-34,-19, 20, -3, 34,-33,-71,-51,-23;
/M: SY='A'; M= 30,-36,-46,-46,-36,-60,  6,-40,-59,-17,-55,-42,-29,-37,-24,-15, -5,-19,-43,-65,-58,-27;
/M: SY='T'; M=-16, -7,-34,-30,-28,-54,-44,-32,-38,-26,-46,-26, 13,-42,-26,-28, 16, 71,-21,-72,-50,-28;
/M: SY='G'; M=-19, -8,-65,-26,-48,-77, 57,-42,-84,-38,-77,-64, 16,-57,-38,-46,-15,-39,-77,-73,-71,-41;
/M: SY='A'; M= 39,-17,-29,-32,-27,-55,-19,-32,-45,-20,-47,-34, -5,-30,-20,-29,  9,  4,-27,-64,-51,-21;
/M: SY='Q'; M=-13,-24,-61,-27, -2,-56,-45,-11,-56, 16,-53,-30,-12,-39, 42, 12,  4,-17,-44,-61,-46, 13;
/M: SY='T'; M= -7,-45,-31,-36,-36,-41,-60,-52,  4,-38,-21,-12,-40,-48,-37,-44,-10, 26, 18,-62,-49,-36;
/M: SY='T'; M=-18,-43,-30,-41,-43,-40,-64,-52,  7,-40,-19,-10,-35,-50,-40,-44, -7, 45, 18,-64,-48,-43;
/M: SY='V'; M= 11,-59,-28,-34,-48,-10,-55,-53, -1,-41,-15,-13,-59,-47,-41,-49,-24,-18, 23,-44,-33,-43;
/M: SY='R'; M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='I'; M=-13,-70,-28,-58,-58,-28,-73,-64, 49,-50,  4,  0,-64,-58,-50,-60,-36,-22, 37,-58,-44,-56;
/M: SY='V'; M=-20,-70,-30,  0,-50,-30,-80,-70, 40,-50,  0,  0,-70,-60,-50,-60,-40,-10, 80,-50,-50,-50;
/M: SY='D'; M=-50, 60,-80,100, 20,-80,-40,-30,-80,-30,-80,-80, 10,-50,-20,-50,-20,-40,  0,  0,-70,  0;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='Q'; M=-18,-22,-70,-24,  4,-64,-23, -4,-66,  8,-56,-30,-12,-44, 77,-11,-20,-34,-56,-54,-48, 30;
/M: SY='C'; M=-20,-70,140,-80,-90,-40,-70,-80,-30,-80,-50,-40,-50,-80,-70,-80,-30,-30,-30,-70,-60,-80;
/M: SY='S'; M= 11, -3,-39, -3,-15,-57,-19,-33,-55,-23,-61,-47, -6,-33,-21,-35, 51,  1,-30,-55,-55,-17;
/M: SY='N'; M=-41, 40,-60, 19,-12,-71,-29, -7,-72, -8,-71,-54, 73,-50,-11,-10, -8,-18,-55,-63,-54,-15;
/M: SY='G'; M= -9,-31,-67,-39,-51,-74, 46,-54,-81,-42,-75,-62,-23,-21,-44,-54, -7,-39,-71,-72,-74,-44;
/M: SY='G'; M=  0,-29,-65,-39,-44,-72, 50,-52,-78,-17,-71,-59,-21,-49,-33,-39,-16,-41,-66,-71,-70,-36;
/M: SY='L'; M=-38,-46,-58,-40,-51,-26,-49,-54,-14,-53, 28, -5,-48,-65,-44,-58,-47,-41,-11,-43,-51,-47;
/M: SY='D'; M=-36, 35,-71, 61, 15,-72,-39,-22,-72,-19,-72,-63,  5,-45,  5,-38, -5,-30,-15,-19,-62,  7;
/M: SY='L'; M=-30,-60,-43,-67,-57,-16,-70,-53,  4,-50, 41, 14,-50,-60,-43,-50,-34,  2, -3,-57,-43,-50;
/M: SY='D'; M=-40, 21,-74, 45, -4,-69,-21,-39,-68,-37,-58,-62, -8,-54,-28,-52,-25,-41,-18,-24,-68,-15;
/M: SY='V'; M=-25,-64,-38,-32,-53,-24,-70,-55, 10,-50,-15,-11,-57,-60,-40,-55,-33,-13, 18,-17,-32,-49;
/M: SY='D'; M=-20, 23,-56, 24,-12,-64,-21,-24,-67,-25,-68,-59, 22,-45,-21,-38,  5,-21,-34,-42,-52,-17;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='A'; M= 11,-18,-20,-23,-16,-28,-19,-21,-22,-13,-24,-16,-16,  5,-14,-18,  1,  8,-14,-34,-28,-14; D=-12;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='V'; M=-20,-64,-34,-23,-50,-26,-71,-62, 22,-47,  9,  7,-59,-57,-44,-55,-26,-12, 44,-52,-48,-47;
/M: SY='F'; M=-45,-65,-44,-75,-77, 84,-57,-43,-29,-59,-11,-18,-63,-69,-59,-60,-46,-50,-37, -9, 24,-67;
/M: SY='N'; M=-27, -4,-60,-20,-17,-61,-42,-12,-61,  4,-59,-40, 26,-47, -2, 24, -9,-13,-52,-72,-50,-12;
/M: SY='Q'; M=  2,-25,-59,-32, -5,-57,-40,-16,-56, 25,-53,-32,-16,-34, 34, 10, -1,-19,-44,-64,-47,  8;
/M: SY='L'; M=-36,-72,-40,-75,-65,-14,-80,-61, 36,-56, 41, 16,-62,-66,-51,-60,-45,-19, 14,-56,-41,-60;
/M: SY='D'; M=-46, 45,-80, 80, 12,-79,-43,-33,-79,-30,-79,-76,  2,-27,-23,-50,-21,-40, -8,-11,-70, -5;
/M: SY='T'; M=  8,-24,-28,-41,-30,-50,-41,-40,-33,-28,-41,-23,-15,-36,-28,-30, 20, 69,-13,-68,-50,-28;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M=-35, 37,-68, 55, 18,-73,-36,-25,-72,-21,-74,-64, 17,-45,-13,-38,  4,-23,-23,-34,-64,  3;
/M: SY='G'; M=  1,-32,-64,-42,-52,-75, 66,-54,-82,-38,-73,-62,-22,-53,-42,-46,-16,-43,-70,-69,-74,-43;
/M: SY='A'; M= 13,-44,-42,-42,-33,-43,-37,-40,-27,-12,-32,-19,-37,-41,-16,-18,-14,-20,-15,-59,-48,-25;
/M: SY='G'; M= -7,-27,-65,-37,-55,-76, 75,-56,-85,-46,-77,-66,-17,-56,-46,-56, -5,-41,-75,-70,-76,-46;
/M: SY='Y'; M=-40,-50,-53,-54,-58, -4,-72,-23,-17,-45,-32,-33,-37,-41,-42,-51,-40,-37,-25,-27, 27,-54;
/M: SY='Q'; M= -9,-30,-61,-34,  0,-53,-48,-11,-51,  4,-42,-10,-20,-40, 39,  7,-19,-25,-41,-57,-47, 14;
/M: SY='Q'; M=-16, -6,-66, -5,  1,-63,-42,-10,-64,  5,-58,-40, -2,-42, 33,  7,-16,-28,-40,-49,-50, 12;
/M: SY='G'; M=-10,-29,-65,-40,-56,-76, 71,-57,-82,-47,-75,-63,-19,-57,-47,-56,-15,-31,-71,-70,-76,-47;
/M: SY='H'; M=-10,-19,-60,-31,-22,-45,-43, 70,-62,-26,-57,-45, -3,-42, -1,-17, -5,-25,-56,-56,-12,-14;
/M: SY='L'; M=-31,-69,-45,-72,-59, -9,-70,-54, 10,-51, 51, 37,-57,-61,-40,-52,-36,-28, -5,-51,-43,-51;
/M: SY='I'; M=-27,-40,-42,-51,-43,-41,-61,-41,  1,-28,-24,-15,-23,-54,-33,-21,-12, -5, -9,-66,-46,-40;
/M: SY='V'; M=-19,-63,-30, -5,-47,-33,-76,-66, 31,-47, -5, -3,-62,-57,-47,-56,-32,  3, 68,-53,-50,-47;
/M: SY='N'; M=-39, 44,-58, 35, -7,-71,-31,-16,-68,-20,-69,-57, 59,-49,-16,-32, -4, -7,-37,-50,-57,-14;
/M: SY='Y'; M=-36,-55,-50,-50,-59, 14,-72,-11,-26,-46,-35,-39,-47,-63,-39,-49,-29,-33,-24, -6, 65,-53;
/M: SY='Q'; M=-22,-26,-62,-22, 16,-56,-56,-18,-34, -5,-42,-24,-22,-44, 39,-22,-11,-23,-31,-61,-48, 22;
/M: SY='F'; M=-38,-49,-48,-53,-37, 52,-68,-35,-34,-43,-21,-22,-51,-59,-39,-48,-25,-37,-35,-25,  7,-36;
/M: SY='V'; M= -7,-66,-29, -7,-47,-33,-71,-66, 29,-46, -5, -4,-66,-55,-46,-56,-33,-10, 67,-51,-50,-46;
/M: SY='D'; M=-28, 39,-64, 50, -1,-74,-24,-26,-73,-25,-72,-65, 26,-47,-19,-40,-11,-29,-24,-32,-63,-10;
/M: SY='C'; M=-21,-66,110,-76,-81,-43,-69,-71,-35,-65,-51,-40,-46,-76,-61,-56,-30,-30,-34,-70,-59,-71;
/M: SY='G'; M=-16,-19,-63,-34,-43,-72, 36,-41,-76,-31,-70,-55, -2,-54,-29,-33,-13,-23,-66,-70,-67,-34;
/M: SY='D'; M=-24, 40,-66, 63,  7,-73,-32,-29,-71,-26,-71,-68,  9,-44,-19,-44,-12,-32,-10,-19,-64, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 13 in 13 different sequences
Number of true positive hits 13 in 13 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Barwin
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
13 sequences

BARW_HORVU  (P28814), CHAL_BRARR  (P81729), HEVE_HEVBR  (P02877), 
HEVL_ARATH  (P43082), PR4A_TOBAC  (P29062), PR4B_TOBAC  (P29063), 
PR4_PRUPE   (P83343), PRP2_SOLLC  (P32045), WHW1_WHEAT  (O64392), 
WHW2_WHEAT  (O64393), WIN1_SOLTU  (P09761), WIN2_SOLTU  (P09762), 
WIN_SOYBN   (Q02243)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

PRP_EPHDI   (P85494)

		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

1BW3; 1BW4

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission