Entry: PS51187

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] AUTOINDUCER_SYNTH_2
Accession [info] PS51187
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00731
Associated ProRule [info] PRU00533

Name and characterization of the entry

Description [info] Autoinducer synthase family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=179;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=174;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0832906; R2=0.0184168; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7298.91304; R2=58.93913; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=702; N_SCORE=15.0; H_SCORE=23036; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=240; N_SCORE=6.5; H_SCORE=21444; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-29,-20, -1,-16, -1, 17,-10, 18, 56,-19,-20, -1,-10,-19,-10,  8,-20, -1,-10;
/M: SY='I'; M= -7,-24,-23,-27,-20, -1,-29,-19, 19,-19, 15, 10,-19,-18,-16,-14,-15, -6, 14,-22, -4,-20;
/M: SY='R'; M= -8, -9,-23, -9,  1,-12,-21, -3, -6, -3, -7, -1, -7,-16,  0,  2, -3, -3, -4,-25, -6, -1;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-23,-28,-19,  2,-28,-20, 21,-22, 15, 11,-18,-22,-14,-20,-14, -4, 15,-19,  0,-19;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='I'; M= -7,-21,-18,-25,-19,  4,-26,-19, 18,-16, 11,  8,-17,-21,-15,-13,-12, -2, 17,-18,  0,-18; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -7,  4,-22,  5, -1,-19,-17, -6,-14, -2,-15,-11,  3,-12, -2, -1,  4,  4,-10,-29,-10, -3;
/M: SY='A'; M=  3,-10,-24,-11, -5,-21,  1, -6,-20, -2,-18,-11, -6,-11, -4, -1, -1, -8,-13,-18,-14, -6;
/M: SY='D'; M= -2, 12,-22, 14,  6,-25, -6, -3,-26,  1,-23,-18, 10,-13,  0,  1,  9,  0,-19,-32,-17,  2;
/M: SY='N'; M=-10,  6,-24,  2, -2, -9,-11,  2,-14, -7,-10, -8, 10,-17, -2, -6, -4, -6,-18,-22, -1, -3;
/M: SY='R'; M= -1, -5,-22, -7,  1,-15,-15, -7,-13,  0, -9, -7, -3,-16,  1,  4, -1, -2,-10,-22, -7,  0;
/M: SY='E'; M=  1, -3,-23, -2,  9,-22, -9, -3,-19, -1,-15,-11, -2, -9,  3, -3,  3, -3,-16,-27,-14,  5;
/M: SY='L'; M=-10,-15,-20,-18, -7, -5,-24, -5, -1, -9,  8,  6,-12,-18, -5, -2,-14, -8, -4,-22, -4, -7;
/M: SY='H'; M=-14, -4,-30, -1, -5, -9,-15, 15,-17, -9,-18,-10, -4,  2, -4,-10, -7, -9,-20,-14, 13, -8;
/M: SY='E'; M=  2, -1,-24,  0,  5,-24,-13, -6,-20,  2,-19,-13, -2, -1,  1,  5,  3, -3,-15,-27,-16,  2;
/M: SY='E'; M=  2,  3,-22,  4, 11,-22,-10, -7,-24,  6,-19,-14,  0,-10,  2,  1,  3,  0,-16,-26,-14,  6;
/M: SY='L'; M= -4,-19,-20,-22,-15,  0,-25,-18, 10,-16, 13,  6,-19,-22,-15,-13,-13, -3, 10,-16, -1,-16;
/M: SY='L'; M= -7,-20,-21,-23,-14,  8,-24,-14,  8,-17, 17, 12,-18,-23,-13,-14,-15, -7,  4,-16,  3,-14;
/M: SY='D'; M= -8,  9,-26, 13, 12,-24,-11,  0,-24,  5,-18,-13,  4,-13,  5,  4, -3, -8,-20,-26,-11,  8;
/M: SY='Q'; M= -4,  2,-26,  5, 17,-29, -9, -3,-24,  3,-21,-11,  0, -5, 18,  3,  3, -5,-23,-26,-17, 17;
/M: SY='M'; M= -7,-23,-21,-28,-19,  5,-25, -6, 16,-18, 23, 29,-21,-24, -9,-15,-20, -9,  8,-16,  6,-15;
/M: SY='F'; M=-13,-21,-23,-26,-21, 34,-16,  1, -7,-22,  3, -1,-14,-26,-22,-16,-15,-11, -8,  0, 25,-21;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-21, -6,  3,-21,-15, -4,-26, 19,-20,-11,  1,-16,  5, 32, -2, -5,-17,-25,-12,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-24,-22,-27,-20, 15,-26,-15, 13,-25, 27, 12,-23,-27,-19,-19,-22,-10,  6,-11, 11,-20;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H'; M= -4, -3,-26, -6, -2,-16,-15, 29,-22,  8,-19, -6,  1,-17,  3,  5, -6,-11,-19,-18,  9, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-27,  3, 18,-27,-19, -5,-22, 15,-19,-11, -1,-10, 16, 13, -2, -5,-19,-24,-13, 16;
/M: SY='V'; M= -1,-24,-16,-28,-23, -5,-29,-25, 25,-18,  7,  9,-22,-24,-17,-19, -8,  0, 33,-26, -8,-21;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 76,-30,-17,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 12, 34,-29;
/M: SY='V'; M= -1,-15,-20,-17,-13,-13,-20,-14,  4, -2, -7,  0,-12,-19,-11, -5, -4, -3, 12,-26, -9,-13;
/M: SY='D'; M=-14, 25,-29, 35, 22,-34, -8, -2,-34,  8,-26,-22, 11, -9,  7,  1, -1, -9,-28,-32,-18, 14;
/M: SY='R'; M=-16, -5,-29, -5, 11,-22,-20, -1,-28, 24,-20,-10,  0,-15, 15, 46, -7, -8,-22,-21,-10, 10;
/M: SY='L'; M=-12,-23,-23,-23,-13,  0,-27,-15,  6,-11, 29, 13,-22,-26,-11,  1,-24,-10,  2,-20, -3,-13;
/M: SY='G'; M= -5, -2,-30, -1, -4,-30, 34,-13,-36,  0,-28,-17,  3,-16, -6, -2, -2,-16,-28,-22,-23, -5;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='D'; M=-12, 18,-27, 25, 14,-29,-15,  0,-28,  4,-22,-16,  8, -6,  5,  3,  0, -3,-23,-31,-15,  8;
/M: SY='V'; M=  1,-20,-15,-20,-21, -4,-25,-24, 18,-20, 13,  7,-22,-25,-22,-19,-11, -2, 26,-27, -9,-22;
/M:         M= -7,-11,-25, -8,  0,-15,-22,-10, -6, -7, -5, -4,-11, -1, -1, -8, -7, -7, -7,-26,-11, -2;
/M: SY='V'; M= -3,-13, -4,-15,-13,-12,-19,-19, -1,-11, -7, -3,-11,-21,-13, -9,  0,  3,  8,-31,-14,-14;
/M: SY='R'; M= -7, -4,-20, -6, -3,-17,-16, -5,-15,  0,-15, -9,  0,-11, -1,  7,  0,  0,-12,-26, -9, -4;
/M: SY='D'; M= -8,  9,-29, 15,  9,-31, -4, -3,-28, -1,-26,-18,  5,  8,  4, -4,  0, -9,-27,-30,-20,  5;
/M: SY='G'; M= -6,  6,-29,  9, -2,-30, 27, -6,-32,-10,-26,-19,  6,-13, -7,-12, -1,-15,-27,-26,-22, -6;
/M: SY='M'; M=-13,-20,-26,-22,-12,  5,-25, -6,  0, -6,  7, 11,-16,-23, -6,  4,-18,-11, -4, -3, 10,-10;
/M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 22, 59,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  1,  0, 19,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 39;
/M: SY='I'; M=-12,-21,-26,-25,-17,  2,-26,-17,  3, -8, -2,  2,-14,-22,-10,  3,-12, -6,  2, -3,  1,-15;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='Q'; M= -8,  0,-27,  1, 17,-27,-14,  3,-24,  9,-20, -9,  2,-11, 26, 13,  2, -6,-24,-24,-12, 21;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-25,-30,-25, 55,-30,  0,  0,-20,  5,  0,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -5, 20, 55,-25;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='B'; M= -4, 17,-17, 14,  2,-24, -6, -1,-24, -3,-22,-17, 16,-15, -3, -4,  5,  1,-19,-33,-17, -1;
/M: SY='P'; M= -4, -6,-27, -2,  7,-19,-15,-12,-14, -9, -8,-10, -9, 11, -2,-13, -7, -8,-17,-26,-17,  1;
/M: SY='D'; M= -8, 20,-25, 23, 10,-29, -7,  7,-29,  4,-26,-18, 16,-13,  5,  1,  3, -7,-24,-32,-15,  7;
/M: SY='P'; M= 11, -9,-19,-12, -7,-19,-14,-20,-13,-10,-17,-13, -8, 20,-10,-16,  9, 17,-10,-28,-19,-10;
/M: SY='V'; M= -5,-19,-20,-22,-15, -5,-26,-11,  9,-13,  7,  5,-15,-22,-12, -6, -9, -2, 11,-23, -3,-16;
/M: SY='Y'; M=-20,-18,-31,-18,-18, 22,-28, 30, -5,-10, -3, -1,-16,-29, -8, -9,-19,-12,-13, 26, 70,-17;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-24,  3,-31,-20, 27,-25, 27, 20,-26,-27,-20,-20,-21, -7, 25,-23, -2,-23;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-15,-30,-24, 11,-30,-19, 19,-23, 21, 13,-25,-28,-22,-20,-18, -5, 19,-17,  6,-24;
/M: SY='A'; M= 13,-15, -9,-21,-17,-13, -2,-20, -7,-17, -7, -6,-12,-19,-15,-20, -1, -3, -3,-13,-11,-16;
/M: SY='L'; M= -9,-18,-16,-20,-11, -5,-27,-10,  6,-12,  8,  7,-15,-22, -7, -9,-13, -8,  4,-23, -3,-10;
/M: SY='D'; M=-12, 20,-21, 28, 13,-28, -9, -6,-29, -1,-25,-21, 10,-13,  0, -6,  2, -5,-22,-29,-18,  6;
/M: SY='D'; M=-11, 12,-24, 16, 14,-28,-10, -6,-27,  2,-25,-19,  7,  2,  2, -2,  1, -6,-24,-32,-20,  7;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -5, -1,-29,  0, -1,-27, 26,-12,-32, -6,-24,-17,  2,-16, -6, -4, -2,-13,-26,-20,-22, -4;
/M: SY='R'; M=-11,  0,-27,  1,  8,-25,-14, -2,-24, 13,-21,-11,  1,-14, 11, 21, -1, -4,-19,-25,-12,  8;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-20,-30,-25,  0,-32,-19, 28,-24, 19, 13,-25,-23,-22,-21,-17, -7, 28,-25, -4,-25;
/M: SY='V'; M= -5,-20,  4,-25,-23, -4,-24,-22,  7,-17,  2,  2,-17,-27,-21,-14, -9, -2, 15,-28, -9,-23;
/M: SY='G'; M=  7,-11,-17,-13,-19,-28, 53,-21,-35,-19,-26,-19, -3,-20,-19,-21,  1,-16,-24,-22,-29,-19;
/M: SY='C'; M= -4,-13, 40,-17,-19,-16, -4,-17,-26,-20,-22,-18, -8,-27,-18,-20,  5, -3,-14,-33,-15,-19;
/M: SY='M'; M=  1,-22,-21,-25,-17, -3,-18,-14,  5,-17,  7,  9,-20,-22,-11,-16,-12, -8,  5, -4, -3,-14;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='L'; M= -7,-28,-20,-31,-21, 14,-28,-20, 18,-28, 39, 17,-27,-28,-21,-20,-25, -9, 10,-17,  2,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-21,-29,-21,  7,-30,-18, 20,-24, 34, 17,-26,-27,-18,-16,-24, -7, 12,-18,  3,-20;
/M: SY='P'; M= -9,-11,-36, -2,  4,-30,-17,-15,-22, -7,-29,-20,-11, 65, -5,-14, -5, -8,-28,-31,-27, -5;
/M: SY='T'; M=  3, -2, -6,-11,-10,-11,-18,-20,-10,-11,-10,-10, -2,-12,-10,-12, 18, 41, -1,-31,-12,-10;
/M: SY='T'; M= -3, -2, -7, -8,-10,-12,-20,-16, -8,-10, -6, -5, -3,-16, -9,-11,  7, 24, -1,-30,-11, -9;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-27, -4, -5,-22, 16,-12,-29,  3,-23,-14, -2,-17, -7,  4, -3,-12,-20,-20,-16, -6;
/M: SY='P'; M= -8,-13,-36, -5,  2,-29,-18,-16,-22, -6,-28,-19,-14, 66, -7,-12, -7, -9,-27,-30,-27, -6;
/M: SY='H'; M=-12,  0,-22, -6, -9, -2,-19, 25,-12, -9,-13, -6,  6,-21, -4, -6, -1,  5,-14,-14, 22, -9;
/M: SY='M'; M=-10,-24,-20,-30,-20,  4,-24, -9, 20,-19, 33, 42,-24,-24, -9,-14,-24,-10, 10,-20,  0,-14;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-21,-31,-21,  7,-29,-18, 23,-27, 42, 26,-27,-27,-17,-19,-27,-10, 12,-20,  0,-19;
/M: SY='S'; M= -3,  3,-22,  3,  5,-23, -5, -5,-25,  5,-26,-16,  7, -9,  1,  3, 11,  3,-18,-29,-14,  2;
/M: SY='D'; M=-13, 28,-28, 38, 17,-33,  0,  1,-35, -2,-27,-24, 15,-11,  2, -8,  3, -8,-28,-35,-19,  9;
/M: SY='V'; M=  0,-20,-15,-23,-19, -6,-27,-25, 17,-17,  3,  4,-19,-18,-20,-18, -3,  9, 28,-28,-10,-20;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-38,-28, 70,-30,-18,  2,-29, 14,  2,-21,-30,-36,-19,-21,-10,  0,  8, 30,-28;
/M: SY='P'; M= -5,-13,-29, -9, -2,-23,-13,-14,-21, -5,-25,-16, -9, 38, -4, -4,  1, -3,-22,-28,-22, -6;
/M: SY='H'; M=-10, -1,-25,  1,  7,-12,-19, 19,-17, -7,-14, -7, -1,-12,  2, -7, -2, -5,-15,-23,  4,  2;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-15,-30,-21, 12,-29,-20, 16,-27, 34, 13,-26,-28,-21,-21,-23, -8, 10,-18,  2,-21;
/M: SY='L'; M= -7,-22,  2,-28,-22, 13,-26,-19,  5,-24, 18,  8,-20,-28,-22,-19,-17, -6,  6,-21, -2,-21;
/M: SY='D'; M= -4,  6,-24,  9, -2,-26,  9, -6,-28, -7,-22,-17,  4,-12, -6, -8,  4, -3,-20,-29,-18, -5;
/M: SY='G'; M= -8,  4,-24, 10, -1,-29, 18, -8,-31, -8,-24,-17,  2,-14, -7, -9, -2,-13,-22,-28,-21, -5;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M=  5, -4,-20, -7,  0,-19, -3, -7,-14, -2,-15, -8,  0, -7,  0, -2,  2, -4,-11,-22,-15, -1; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P'; M=  2,-12,-27,-11, -4,-22,-14,-18,-10,-11,-16,-12,-11, 28, -8,-17, -2, -2,-12,-27,-21, -9;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M=  7,-11,-16,-13, -8,-10,-13,-14,  0,-10,  0, -2,-10, -3, -9,-11, -4, -4,  0,-19,-11, -9; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -8,-22,-35,-16, -7,-22,-23,-22, -6,-14,-17,-11,-21, 61,-13,-21,-12, -9,-15,-28,-23,-14;
/M: SY='R'; M= -7, -6, -9, -7,  2,-22,-19, -5,-22,  9,-19,-11, -2,-17,  6, 21, -3, -5,-15,-27,-14,  2;
/M: SY='S'; M=  2,  4,-21,  6,  1,-23,  4, -2,-26, -5,-25,-17,  7,-14, -2, -3, 13,  0,-18,-29,-15, -2;
/M: SY='P'; M=  2,-10,-29, -8, -3,-26, -9,-11,-20, -7,-26,-17, -7, 39, -7,-14,  0, -5,-22,-29,-23, -8;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-24, 13,  8,-23,-10,  1,-23, -1,-18,-14,  5,-13,  3, -2,  2, -2,-19,-28,-11,  5;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-13,-32,-27, -1,-31,-25, 31,-23, 15, 18,-23,-24,-21,-22,-15, -5, 30,-24, -5,-26; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='W'; M=-14,-32,-37,-33,-25, 12,-21,-20, -9,-18, -7, -8,-32,-27,-18,-17,-30,-21,-15, 89, 26,-19; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='E'; M=-10, 11,-30, 21, 59,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  1,  0, 19,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 39;
/M: SY='L'; M= -1,-21,-15,-24,-18, -4,-16,-20,  1,-20,  3,  2,-18,-22,-14,-18, -8, -5,  0,  0, -5,-16;
/M: SY='T'; M=  6,  0,-10, -4, -4,-16, -8,-14,-16,-10,-22,-16,  6,-10, -4,-10, 32, 33, -6,-36,-16, -4;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-37,-28, 63,-30,-16,  4,-27, 13,  5,-21,-29,-33,-19,-21,-10,  2,  7, 30,-27;
/M: SY='C'; M= 11,-17, 26,-26,-20,  4,-17,-22,-14,-21,-10,-11,-13,-24,-22,-22,  0, -2, -4,-24,-11,-20;
/M: SY='V'; M=  1,-26,-15,-29,-25, -1,-27,-25, 25,-20, 13, 12,-24,-25,-22,-20,-10,  0, 32,-26, -8,-24;
/M: SY='D'; M= -6, 16,-22, 22,  3,-24, -9, -1,-22, -6,-22,-17,  9,-14, -3, -7,  8, -2,-14,-33,-13, -1;
/M: SY='P'; M= -4, -9,-27, -8,  0,-22,-14,-11,-18,  2,-20,-11, -7, 16, -3, -1, -1,  2,-16,-26,-17, -4;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='S'; M= -1,  0,-23,  1, -2,-20, -1, -3,-23, -6,-24,-17,  4, -5, -4, -6,  9, -1,-19,-23,-11, -4;
/M: SY='E'; M= -7, -4,-28, -2,  4,-21,-17, -4,-16, -1,-16,-11, -2,  4,  3,  1, -5, -8,-18,-22,-12,  2;
/M: SY='V'; M=  2,-18,-15,-22,-18, -7,-21,-21, 11,-18,  8,  3,-15,-19,-17,-16, -9, -3, 12,-25,-10,-19;
/M: SY='T'; M=  6, -3,-11, -9,-10,-10, -7,-16,-15,-11,-14,-12, -1,-14,-11,-11, 12, 19, -6,-26,-11,-11;
/M: SY='M'; M= -3,-11,-17,-14, -9, -9, -9, -8, -9, -8, -2,  1, -6,-20, -5, -2, -5, -5, -9,-21, -6, -8;
/M: SY='E'; M= -3, -8,-24, -8,  9,-15,-20, -9, -7, -3, -4,  1,-10, -8,  4, -6, -7, -7, -9,-23,-11,  6;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-20,-31,-21,  8,-29,-19, 22,-27, 39, 22,-27,-27,-19,-20,-25, -9, 14,-20, -1,-20;
/M: SY='F'; M=-11,-27,-19,-33,-24, 33,-27,-17, 12,-25, 25, 19,-24,-27,-24,-18,-22, -9,  8, -9, 10,-22;
/M: SY='A'; M=  2,-18, -8,-22,-14, -7,-20,-19, -2,-16,  2, -2,-15,-19,-11,-13, -6, -1, -1,-16, -9,-13;
/M: SY='A'; M= 18, -6,-18, -8, -5,-24, 18,-16,-24, -9,-23,-16, -1,-12, -7,-14, 13, -2,-14,-26,-22, -6;
/M: SY='I'; M= -6,-25,-20,-30,-23,  2,-25,-20, 24,-23, 21, 21,-22,-24,-18,-20,-17, -6, 20,-22, -3,-22;
/M: SY='I'; M= -4,-21,-11,-25,-19,  0,-21,-12,  8,-19,  6,  6,-18,-24,-13,-17,-13, -8,  8,-17,  3,-17;
/M: SY='E'; M= -7, 11,-27, 14, 29,-28,-15,  1,-27, 12,-22,-16,  8, -8, 13,  7,  1, -7,-25,-29,-16, 20;
/M: SY='Y'; M=-15,-23,-15,-28,-23, 24,-27, -5, -5,-20, -2, -2,-20,-28,-21,-16,-17, -7, -4, 17, 25,-22;
/M: SY='A'; M= 29,-10, -6,-16,-12,-21, 12,-19,-18,-13,-16,-12, -6,-14,-12,-19, 10, -2, -8,-25,-22,-12;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-24,-17, -4,-11,-23, -5,  1, -9,  9,  9,-14,-19,  4, -8,-13, -9, -4,-18, -4, -1;
/M: SY='Q'; M=  4,  3,-21,  3,  2,-22, -9, -7,-16, -4,-13,-10,  2,-14,  5, -6,  4, -3,-13,-26,-13,  3;
/M: SY='N'; M= -5,  1,-22, -5, -1,-14,-14,  2,-13, -2,-12, -7,  9,-17,  5,  3,  1, -3,-15,-25, -8,  1;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-29, -2,-14,-29, 52,-13,-37,-15,-29,-19,  5,-19,-15,-16,  0,-17,-29,-23,-26,-15;
/M: SY='I'; M= -2,-26,-23,-32,-24,  2,-30,-21, 29,-24, 19, 14,-22,-23,-18,-23,-17, -8, 20,-16,  4,-24;
/M: SY='N'; M= -5,  7,-17,  4,  4,-23,-11, -4,-23,  2,-21,-14,  9,-13,  4,  4,  9,  9,-17,-30,-15,  3;
/M: SY='E'; M= -2,  3,-23,  2,  9,-24, -5, -1,-24,  0,-20,-14,  5,-12,  6,  2,  6,  2,-19,-28,-15,  7;
/M: SY='I'; M= -9,-27,-24,-32,-26, 10,-33,-18, 28,-24, 18, 14,-23,-25,-20,-22,-19, -8, 20,-11, 14,-25;
/M: SY='V'; M=  2,-20,-17,-24,-19, -4,-25,-21, 18,-18,  3,  4,-17,-21,-17,-19, -4,  1, 23,-23, -4,-20;
/M: SY='T'; M=  9,-11,-14,-17,-15,-14, -1,-21, -6,-16, -9, -7, -7,-15,-14,-18,  7, 11,  0,-26,-16,-15;
/M: SY='V'; M=  0,-24,-16,-28,-23, -2,-28,-26, 25,-19,  9,  8,-22,-25,-21,-20,-10, -3, 33,-26, -8,-23;
/M: SY='V'; M= -2,-17,-11,-23,-19,  2,-23,-18,  8,-17,  2,  5,-15,-21,-17,-16, -1, 10, 13,-22,  0,-19;
/M: SY='D'; M= -7, 18,-22, 23, 13,-24,-12, -6,-25, -2,-23,-20, 10, -8,  0, -7, 10,  5,-18,-34,-17,  7;
/M: SY='T'; M= -2,-16,-20,-17,-11, -9,-21,-16, -1,-12,  0, -2,-14, -7,-12,-11, -3,  6,  3,-22,-10,-13;
/M: SY='A'; M=  1,-16,-24,-19,-13, -6, -5,-14,-14, -9,-12, -9,-11,-12,-10, -4, -5, -7,-11, -4, -4,-12;
/M: SY='M'; M=-11,-25,-22,-31,-23,  3,-23,-14, 11,-15, 10, 26,-23,-25,-12,-13,-22,-13,  5, 13,  4,-17;
/M: SY='E'; M= -8, -5,-26, -1, 21,-16,-23, -8, -8, -4, -1, -3,-10, -8,  2, -8, -8, -8,-11,-25,-11, 11;
/M: SY='R'; M=-13,-10,-29, -9, -1,-21,-20, -5,-24, 20,-19, -9, -4, -3,  4, 36, -8, -6,-17,-23,-12, -2;
/M: SY='I'; M=-10,-24,-25,-29,-21,  0,-31,-19, 22,-15, 13, 13,-18,-23,-14, -8,-17, -8, 16,-18,  1,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-23, 24,-29,-14, 15,-25, 28, 13,-25,-29,-22,-19,-23, -9,  8, -7, 17,-22;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-26, -8,  2,-21,-20, -7,-19, 21,-16, -5, -2,-16,  7, 30, -6, -6,-12,-22,-10,  3;
/M: SY='R'; M=-15, -8,-29, -8,  1,-21,-20, -2,-23, 22,-16, -7, -2,-18, 12, 44, -9,-10,-18,-19, -8,  4;
/M: SY='A'; M=  6,-13,-11,-19,-14, -7,-13,-16,  1,-18,  2,  2, -8,-19,-12,-17,  1,  0,  2,-27,-11,-13;
/M: SY='G'; M= -2, -9,-30, -9,-17,-29, 58,-15,-38,-15,-29,-18,  0,-19,-16,-14, -1,-18,-29,-21,-26,-17;
/M: SY='W'; M=-12,-30,-24,-33,-27, 13,-24,-25, -2,-21, -4, -7,-27,-29,-23,-20,-23,-15, -4, 52, 14,-23;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-27, -5,  3,-20,-16, -7,-17,  4,-18,-10, -3,  1,  2,  8, -4, -6,-15,-25,-14,  0;
/M: SY='I'; M= -3,-24,-10,-27,-21, -1,-24,-18, 10,-21,  8,  6,-22,-13,-20,-21,-14, -8, 10,-23, -6,-22;
/M: SY='R'; M=-11,  4,-26,  6, 14,-24,-17, 15,-27, 10,-21,-12,  5,-12, 11, 16,  0, -4,-22,-28, -8, 10;
/M: SY='R'; M=-13,-12,-28,-10,  0,-20,-19, -9,-19, 10,-18,-10, -8,  2,  0, 28, -7, -6,-13,-25,-15, -3;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-21,-30,-21,  7,-28,-19, 19,-24, 32, 17,-25,-26,-18,-16,-22, -9, 12,-18,  1,-20;
/M: SY='G'; M=  6, -7,-26, -9,-14,-27, 46,-18,-32,-14,-26,-17,  1,-18,-15,-16,  2,-14,-23,-22,-26,-14;
/M: SY='P'; M= -9, -5,-27, -1,  0,-19,-14,-10,-15, -8,-14,-11, -7,  8, -6, -9, -3, -3,-13,-28,-15, -5;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P'; M=  6,-17,-23,-16,-10,-18,-11,-16, -6,-12,-13, -7,-16, 24,-13,-18, -5, -6, -5,-24,-19,-13; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='H'; M= -8,-10,-24,-11, -2,-13,-22,  7, -8, -3, -3,  2, -7,-18,  4,  2, -9, -8, -8,-23, -3,  0;
/M: SY='R'; M= -7, -8,-23, -7,  0,-19,-11,-10,-16,  2, -9, -4, -7, -9,  0,  4, -8,-10,-14,-24,-14, -1;
/M: SY='I'; M= -8,-17,-23,-19,-13, -5,-26, -8, 12,-17,  4,  9,-14,-14,-11,-16, -9, -4,  8,-22,  1,-14;
/M: SY='G'; M= -5,  3,-29,  7,  3,-30, 23,-12,-34, -3,-27,-19,  3, -7, -5, -9, -1,-12,-27,-26,-24, -1;
/M: SY='G'; M= -4,  2,-25, -1, -6,-22, 14,-11,-24, -1,-23,-15,  9,-17, -7, -3,  0, -9,-19,-25,-19, -7;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-19,  3, 11,-20,-10,-10,-19, -2,-14,-10, -4,-12, -2, -6,  0,  0,-12,-27,-14,  5;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-27, -4,  0,-21,-16, -8,-21,  7,-19,-12, -3, -4,  1, 16, -2,  0,-16,-20,-12, -1;
/M: SY='V'; M=  7,-20,-16,-25,-20, -6,-20,-24, 15,-20,  7,  4,-17,-20,-18,-20, -4,  2, 19,-25,-10,-20;
/M: SY='V'; M= -6,-26,-14,-29,-25,  4,-28,-18, 22,-20, 13, 16,-24,-27,-20,-18,-13, -4, 26,-21,  2,-23;
/M: SY='A'; M= 29,-15,-11,-21,-14,-13, -5,-19, -5,-15, -2, -5,-15,-14,-14,-20,  0, -4,  2,-20,-13,-14;
/M: SY='L'; M= -3,-23,-12,-26,-23, -3, -2,-23,  2,-25,  9,  2,-18,-26,-23,-22,-14,-11,  4,-22,-11,-23;
/M:         M= -7,-13,-23,-15, -6, -4,-20,-10, -9, -8,  0, -3,-11,-19, -6, -2, -8, -1, -9, -6, -3, -6;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-24,-34,-25, 13,-28,-22, 19,-24, 18, 14,-25,-25,-21,-21,-21,-10, 13,  1,  5,-23;
/M: SY='P'; M= -8,  5,-30, 13, 18,-30,-16,  0,-26, -2,-25,-18, -2, 22,  4, -9, -1, -7,-26,-31,-19,  9;
/M: SY='V'; M= -1,-26, -1,-32,-26,  4,-28,-26, 18,-24, 11,  8,-24,-27,-25,-23,-13, -5, 23,-24, -7,-26;
/M: SY='D'; M= -6, 17,-21, 19,  2,-24, -2, -4,-26, -7,-25,-20, 14,-11, -4,-10, 13,  8,-19,-34,-16, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-24,  7, 15,-26,-17, -5,-23,  2,-18,-15, -2,  4,  5,  2, -2, -6,-22,-28,-18,  9;
/M: SY='E'; M= -3, 11,-24, 14, 19,-27,-14, -4,-23,  4,-19,-16,  6,-10,  8,  1,  3, -4,-20,-29,-17, 13;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-15, -7, -9, -7,-16,-11,-10, -9, -9, -9,  1,-16,-10, -8,  7, 17, -3,-26, -7,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-19,-13,-22,-15, -2,-23, -9, -2,-13,  8,  3,-16,-26,-10, -5,-17,-10, -2,-13,  0,-13;
/M: SY='K'; M=  2, -4,-25, -6,  9,-24,-15, -8,-17, 10,-15, -8, -3, -9,  9,  8, -3, -8,-15,-23,-14,  8;
/M: SY='A'; M=  7, -5,-22, -8,  3,-23, -8, -9,-19,  3,-17,-11, -2,-10,  6,  6,  4, -1,-14,-24,-16,  3;
/M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-29,-21,  1,-27,-21, 21,-23, 25, 17,-24,-22,-18,-20,-17, -4, 18,-23, -5,-21;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-15, -9, -6,-17, -9, -9,-21,  4,-13,-10, -2,-20, -4, 17, -5, -5,-15,-24,-12, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

COMPETES_HIT_WITH PS51186

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 26 in 26 different sequences
Number of true positive hits 26 in 26 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
26 sequences

AHYI_AERHY  (Q44058), ASAI_AERSA  (P70774), BJAI_BRADU  (Q89VI2), 
CARI_PECCC  (P33880), EAGI_ENTAG  (P33881), ECHI_DICCH  (Q46968), 
ESAI_PANSE  (P54656), EXPI_DICD3  (Q47187), EXPI_PECSS  (P33882), 
LASI_PSEAE  (P33883), LUXI_ALIFS  (P12747), LUXJ_VIBF1  (P35328), 
PHZI_PSECL  (Q51522), PHZI_PSEFL  (Q51785), PSYI_PSESZ  (P52990), 
RAII_RHIET  (O54451), RHLI_PSEAE  (P54291), SOLI_RALSL  (O30920), 
SOLI_RALSO  (P58584), SWRI_SERLI  (P52989), TRAI_AGRT5  (P33907), 
TRAI_RHIRD  (P33904), TRAI_RHISN  (P55394), VANI_VIBAN  (P74945), 
YENI_YEREN  (P52988), YUKI_YERRU  (O87970)
» More

PDB
[Detailed view]
3 PDB

1K4J; 1KZF; 1RO5

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission