ID   NEBULIN; MATRIX.
AC   PS51216;
DT   01-JUN-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Nebulin repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3364296; R2=0.0261239; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=275; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=104; N_SCORE=4.05; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-7; D=-50; I=-50; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-24,-2,-2,-22,-3,2,-25,8,-22,-10,4,-12,0,3,-3,-8,-20,-25,-10,-2;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-22,-16,-26,-22,25,-24,-5,0,-18,1,0,-18,-26,-20,-15,-15,-8,-1,5,30,-21;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-4,-19,-9,-5,-12,-19,-1,-11,-5,-11,-6,-1,-12,-3,-4,5,14,-8,-26,-5,-5;
MA   /M: SY='T'; M=0,-12,-17,-15,-11,-9,-16,-14,-3,-14,-4,-3,-10,-9,-10,-14,0,4,-2,-24,-8,-11;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-20,-20,-22,-16,-7,-23,-19,11,-17,6,8,-18,-8,-15,-17,-9,0,12,-26,-10,-17;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-11,-24,-11,-4,-17,-16,-13,-10,-7,-11,-6,-10,10,-6,-10,-4,-1,-10,-26,-15,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-29,50,21,-35,-10,0,-34,1,-26,-25,15,-10,2,-8,0,-9,-27,-36,-18,12;
MA   /M: SY='T'; M=0,2,-18,0,-3,-16,-13,-11,-16,-7,-15,-12,1,-8,-5,-7,10,16,-9,-29,-12,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-21,-31,-17,-9,-18,-22,-19,-3,-13,-10,-3,-20,42,-12,-18,-12,-8,-10,-28,-20,-14;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-27,12,16,-23,-16,-3,-19,-1,-16,-12,1,-5,5,-6,-3,-8,-18,-28,-13,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-23,-22,-29,-22,11,-28,-11,18,-22,19,18,-19,-25,-16,-18,-18,-7,12,-16,7,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-11,-22,-11,-3,-13,-23,-14,-1,-1,1,1,-12,-19,-5,0,-10,-6,3,-25,-10,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-10,-26,-11,-3,-15,-22,22,-17,0,-7,0,-5,-20,8,12,-11,-11,-17,-17,2,0;
MA   /M: SY='A'; M=26,-13,-5,-20,-14,-13,-9,-18,-4,-14,-7,-6,-11,-17,-14,-19,5,1,6,-25,-15,-14;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-6,-27,-8,2,-21,-20,-8,-18,27,-16,-3,-4,-15,6,22,-10,-8,-13,-21,-9,3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,3,-24,1,6,-21,-16,5,-19,8,-18,-9,5,-14,6,6,-3,-7,-17,-23,-7,5;
MA   /M: SY='A'; M=10,1,-12,-9,-11,-13,-9,-11,-5,-9,-12,-7,8,-18,-10,-11,6,2,-1,-29,-16,-10;
MA   /M: SY='Q'; M=2,-1,-21,-5,0,-20,-6,-6,-18,0,-19,-10,3,-13,8,-1,7,5,-16,-22,-9,3;
MA   /M: SY='K'; M=-6,4,-26,5,10,-24,-16,-6,-20,13,-19,-10,2,-12,7,4,-3,-6,-17,-24,-11,8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-13,-22,-19,-13,-6,-24,-9,11,-16,12,11,-9,-22,-5,-13,-13,-7,4,-24,-5,-10;
MA   /M: SY='M'; M=-2,-14,-21,-19,-10,-9,-22,-11,4,-10,3,6,-11,-19,2,-8,-7,-3,1,-19,-3,-5;
MA   /M: SY='S'; M=6,7,-12,4,0,-20,-1,-7,-20,-8,-29,-20,17,-12,0,-9,34,17,-13,-40,-20,0;
MA   /M: SY='D'; M=-10,20,-27,26,23,-29,-13,0,-27,6,-23,-18,11,-9,8,-2,1,-7,-25,-32,-16,15;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-14,-22,-18,-13,-7,-24,-12,4,-3,0,2,-9,-21,-9,0,-10,-5,6,-21,-3,-13;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-3,-23,-4,4,-19,-19,-8,-14,12,-10,-5,-3,-15,3,6,-7,-7,-12,-23,-9,3;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-3,-28,-4,5,-25,-20,-1,-27,35,-25,-9,0,-14,8,34,-8,-8,-17,-22,-8,5;
MA   /M: SY='E'; M=-2,3,-24,7,19,-26,-13,-7,-23,9,-17,-13,-2,-9,7,1,-2,-7,-19,-26,-15,13;
MA   /M: SY='D'; M=-2,15,-24,19,9,-28,-6,-4,-25,0,-21,-17,8,-12,1,-6,3,-5,-19,-31,-17,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-24,-29,-26,-22,18,-22,-3,-1,-18,3,0,-21,-27,-16,-15,-21,-13,-8,27,33,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,11,-27,15,28,-27,-15,8,-26,7,-21,-15,7,-9,13,3,0,-8,-25,-30,-14,20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,1,8,-23,-15,-3,-24,18,-22,-11,3,-13,7,11,-3,-6,-19,-19,-10,7;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-21,-4,-1,-13,-15,-9,-11,-8,-9,-5,-2,-15,-2,-9,1,2,-9,-18,-8,-1;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-8,-27,-9,0,-21,-21,-9,-15,25,-15,-2,-5,-14,3,18,-10,-7,-10,-22,-8,0;
MA   /M: SY='G'; M=5,-3,-20,-4,-7,-23,7,-9,-23,-5,-19,-13,-1,-13,-7,-7,3,-3,-15,-25,-17,-7;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=320(14); /POSITIVE=320(14); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=181;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=Nebulin;
CC   /VERSION=3;
DR   Q3B7M5    , LASP1_BOVIN, T; P34416    , LASP1_CAEEL, T;
DR   Q8I7C3    , LASP1_DROME, T; Q14847    , LASP1_HUMAN, T;
DR   Q61792    , LASP1_MOUSE, T; Q5R5W0    , LASP1_PONAB, T;
DR   O77506    , LASP1_RABIT, T; Q99MZ8    , LASP1_RAT  , T;
DR   Q9DC07    , LNEBL_MOUSE, T; O76041    , NEBL_HUMAN , T;
DR   Q0II04    , NEBL_MOUSE , T; P20929    , NEBU_HUMAN , T;
DR   Q86VF7    , NRAP_HUMAN , T; Q80XB4    , NRAP_MOUSE , T;
PR   PRU00563;
DO   PDOC51216;
//