Due to scheduled maintenance work, this service may not be available on Monday January 22nd between 08.00 am and 9.00 am CEST
To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS51223

General information about the entry

Entry name [info] MAP
Accession [info] PS51223
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-JUN-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 20-DEC-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC51223
Associated ProRule [info] PRU00567

Name and characterization of the entry

Description [info] MAP repeat profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=110;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=110;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8892710; R2=0.0119589; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11865.4472656; R2=12.1775789; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=679; H_SCORE=20134; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=386; H_SCORE=16566; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='B'; M=  7, 27,-20, 23,  3,-26, -3, -3,-23, -3,-23,-20, 24,-14, -3,-10,  7, -3,-20,-33,-20,  0;
/M: SY='K'; M=-14, -7,-30, -7, -1, -9,-24,  1,-19, 29,-19, -6, -7,-17,  3, 16,-14,-10,-16, -2, 22, -1;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='A'; M= 16,-13, -6,-16,-13, -6,-10,-16,  7,-10,  0,  0,-13,-13,-13,-13,  0,  0, 16,-16,-10,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='Y'; M=-10,  6,-16,  0, -7,  3,-10, 10, -6, -3,-10, -6, 13,-16, -3, -3, -3, -3,-13, -3, 20, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Y'; M= -3, -6,-13, -6, -6,  3,-10,  3, -7, -6,-10, -7, -3,-13, -3, -6,  7,  3, -6, -4, 19, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Q'; M=-13, -7,-30, -7,  7,-17,-23, 13,-13,  3,-13,  0, -7,-17, 37,  3, -7,-10,-23, -4, 20, 20;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T'; M=  4,  0,-10, -6, -6,-14,-13,-16,-14,-10,-17,-14,  4,-10, -6,-10, 27, 39, -4,-34,-14, -6;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='N'; M= 13, 11,-14, -3, -6,-17, -6, -9,-14, -6,-17,-14, 18,-14, -6,-10, 13, 16,-11,-30,-17, -6;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-14,-30,-26,  4,-30,-26, 26,-24, 24, 14,-30,-30,-26,-20,-17, -4, 36,-26, -6,-26;
/M: SY='N'; M= -4, 27,-17, 14,  0,-20,  0,  4,-20, -3,-30,-20, 44,-17,  0, -3, 20,  6,-24,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='S'; M=  7,  0,-10, -3, -3,-17, -7,-13,-17,-10,-23,-17,  7,-10, -3,-10, 33, 30, -7,-37,-17, -3;
/M: SY='T'; M= -3,  0,-16, -7,  0,-20,-20,-10,-13, -4,-13, -7,  0,-10, 12, -4, 14, 31,-10,-27,-10,  6;
/M: SY='N'; M=-10, 20,-27, 10,  0,-23, -7,  0,-20, -3,-30,-20, 34, 16, -3, -7,  3, -3,-30,-37,-23, -3;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='L'; M= 10,-23,-17,-27,-17,  0,-20,-20, 10,-23, 30, 10,-23,-23,-17,-20,-17, -7,  7,-20, -7,-17;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='N'; M=-10, 27,-23, 13,  3,-23, -7,  3,-23, 16,-30,-17, 40,-17,  3, 10,  3, -3,-27,-33,-17,  3;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-17, -3,  0,-20,-13,-13,-20, 10,-24,-14,  4,-10,  0,  3, 17, 20,-10,-30,-14,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-27, 57,-30,-20,  7,-30, 23,  7,-23,-30,-33,-20,-23,-10,  3,  0, 20,-27;
/M: SY='S'; M=  4, 13,-13,  6,  0,-20,  0, -4,-20, -7,-30,-20, 26,-13,  0, -7, 30, 14,-16,-40,-20,  0;
/M: SY='N'; M=-10, 27,-23, 14,  3,-23, -6,  4,-23, 16,-30,-17, 41,-17,  3, 10,  4, -3,-27,-34,-17,  3;
/M: SY='K'; M=-10, 13,-27,  6,  7,-27,-14, -4,-27, 34,-30,-13, 19,-13,  7, 20, -4, -7,-23,-26,-13,  7;
/M: SY='Q'; M=-10, -7,-34, -4, 13,-36,-20, -1,-20,  3,-24, -7, -7, 25, 35, -1, -4,-10,-30,-24,-17, 22;
/M: SY='W'; M=-14,-11,-31,-18,-17,  0,-17,-14, -7,-17,  0, -7, -5,-27,-14,-14,-21,-14,-17, 33,  4,-14;
/M: SY='I'; M= -6,-19,-23,-29,-23, -4,-33,-26, 29,-23,  9,  9,-13,-16,-16,-23, -6, 11, 19,-24, -4,-23;
/M: SY='N'; M=  0, 11,-20,  4, -7,-23, 23, -6,-27,-10,-30,-20, 24,-17, -7,-10, 16,  0,-24,-33,-23, -7;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 13,-33,-20, -3,-27, 37,-27, -7,  0,-10, 26, 23, -7,-10,-23,-20,-10, 20;
/M: SY='D'; M=-16, 46,-26, 52, 13,-33, -6,  4,-33,  0,-30,-26, 34,-14,  0, -6,  4, -6,-30,-40,-20,  6;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='N'; M= -6, 16,-20,  9, 16,-20,-13, -4,-20,  0,-20,-16, 20,-10,  3, -4, 10, 14,-19,-33,-16,  9;
/M: SY='D'; M= -6, 16,-23, 22, 10,-30,-10, -7,-30, 13,-30,-20, 10,-10,  3,  3, 11,  1,-20,-33,-17,  6;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 14,-34,-20, -3,-26, 36,-26, -6,  0,-10, 28, 23, -6,-10,-24,-20,-10, 21;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  3,-30,  6, 26,-30,-20, -7,-30, 37,-27,-13,  0, -7, 13, 20, -7,-10,-23,-23,-13, 20;
/M: SY='H'; M=-10,  0,-24,  0,  0,-20,-14, 65,-27,-10,-23, -6, 10,-17,  7, -3,  6, -7,-24,-33,  7,  0;
/M: SY='D'; M=-17, 47,-27, 54, 14,-34, -7,  3,-34,  0,-30,-27, 33,-13,  0, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  7;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='S'; M=  0, 13,-13,  3, -3,-17, -6, -7,-17, -7,-24,-17, 23,-13, -3, -7, 24, 23,-13,-37,-17, -3;
/M: SY='D'; M=-16, 36,-30, 52, 34,-36,-14,  0,-36,  4,-26,-26, 13, -6,  7, -6,  0,-10,-30,-36,-20, 21;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-24,-23,-12,-14,-30,-16, 19,-13,  3, 10,-16,-20,  5,-13,-10, -7, 15,-23, -7, -5;
/M: SY='D'; M=-17, 37,-30, 54, 33,-37,-13,  0,-37,  3,-27,-27, 13, -7,  7, -7,  0,-10,-30,-37,-20, 20;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=-13, -3,-30, -3,  7,-27,-20, -7,-30, 44,-27,-10,  0,-13, 10, 43,-10,-10,-20,-20,-10,  7;
/M: SY='F'; M=-17,-26,-24,-30,-23, 40,-30, -6,  6,-23, 19,  6,-23,-30,-23,-16,-23,-10,  0,  7, 38,-23;
/M: SY='A'; M= 37, -7,-10,-14, -7,-20,  0,-17,-13,-10,-16,-13, -4,-10, -7,-17, 20,  6, -3,-26,-20, -7;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 16,-36,-20,  3,-24, 24,-24, -4,  0,-10, 42, 17, -4,-10,-26,-20,-10, 29;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='K'; M=-14, -7,-30, -7, -1, -9,-24,  1,-19, 29,-19, -6, -7,-17,  3, 16,-14,-10,-16, -2, 22, -1;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-17,-33,-30,  0,-33,-30, 37,-23, 13, 13,-27,-27,-27,-23,-13, -3, 43,-27, -7,-30;
/M: SY='H'; M=-17,  6,-27, -1, -7, -2,-17, 43,-16, -7,-16, -6, 15,-24,  0, -4, -7,-10,-23,-12, 28, -7;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-24, -7, -7,-24, 12,-17,-27,  6,-24,-14,  0,-14, -7,  0,  3,  6,-17,-23,-17, -7;
/M: SY='K'; M= -7,  0,-23, -3,  3,-23,-20,-13,-23, 30,-23,-10,  0,-10,  3, 17,  0, 10,-13,-23,-10,  3;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 10,-30,-20,  0,-27, 30,-23, -7,  0,-14, 26, 38, -7,-10,-23,-20,-10, 16;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-34,-30,  0,-34,-30, 37,-24, 14, 14,-26,-26,-26,-24,-14, -4, 43,-26, -6,-30;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-33,-26,  4,-33,-26, 33,-27, 27, 17,-27,-27,-23,-23,-20, -7, 30,-23, -3,-26;
/M: SY='D'; M=-16, 32,-30, 45, 20,-40,-14,  4,-33,  4,-26,-19, 13,-10, 21, -3,  0,-10,-30,-33,-16, 21;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='K'; M=-10, 14,-26,  7,  6,-26,-13, -3,-26, 32,-30,-14, 21,-14,  6, 19, -3, -6,-24,-27,-14,  6;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='D'; M=-10, 13,-30, 20,  4,-33, 12,-10,-36, 11,-30,-20,  7,-13, -3,  1, -4,-13,-26,-27,-20,  0;
/M: SY='I'; M=-10, -5,-26,-19,-19, -7,-26,-16, 25,-19,  2,  6,  8,-20,-13,-19, -9, -6,  9,-27, -7,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 46,-30,  7,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 64,-23;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='A'; M= 27,-10,-17,-17, -7,-20, -7,-13,-17,  3,-13,-10, -7,-13, -3, 10,  3, -3, -7,-20,-17, -7;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-20,-36,-30, 26,-33,-27, 27,-26, 13, 10,-24,-27,-30,-23,-16, -6, 27,-14,  6,-30;
/M: SY='H'; M= -7, 13,-20,  6,  0,-20, -7, 35,-24, -7,-26,-13, 26,-17,  4, -3, 13,  0,-23,-36, -6,  0;
/M: SY='A'; M= 21,-13,-10,-17,-13,-13,-10,-20,  0,-13,-10, -7,-10,-17,-13,-17, 13,  6, 13,-30,-17,-13;
/M: SY='K'; M= -4,  0,-24,  0,  7,-27,-14,-10,-27, 31,-30,-13,  3,-10,  7, 17,  6,  0,-17,-26,-13,  7;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='R'; M= -7, -4,-24, -4,  3,-23,-14, -6,-27, 24,-26,-13,  3,-14,  7, 31,  6,  0,-17,-26,-13,  3;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='D'; M=-13, 33,-27, 36, 28,-30,-10,  3,-30,  4,-26,-23, 26,-10,  7, -3,  3, -7,-30,-36,-20, 17;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='N'; M= -6, 26,-16,  9, -4,-16, -7, -1,-16, -4,-23,-16, 39,-16, -4, -4, 14, 18,-19,-36,-16, -4;
/M: SY='V'; M=  0,-30,-10,-30,-30,  0,-30,-30, 30,-20, 10, 10,-30,-30,-30,-20,-10,  0, 50,-30,-10,-30;
/M: SY='K'; M=-13, 16,-30, 22, 13,-33,-17, -7,-33, 34,-30,-16,  6,-10,  7, 17, -7,-10,-23,-26,-13, 10;
/M: SY='T'; M= -3,  0,-17, -7,  0,-20,-20,-10,-13, -3,-13, -7,  0,-10, 13, -3, 13, 30,-10,-27,-10,  6;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='Q'; M= -6,  0,-19,  0, 10,-23,-13,  0,-16, 19,-16, -3,  0, -6, 23, 13, -3, -6,-16,-13, -6, 16; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-23; MD=-23; IM=-23; DM=-23;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-13,  0,  3,-16, -6, -6,-16, 13,-19,-10,  3, -6,  3,  6, 10,  3,-10,-20,-10,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='H'; M=-10,  0,-19,  0,  3,-16,-13, 29,-19, 13,-16, -3,  3,-10,  6, 10, -6,-10,-16,-16,  3,  3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='I'; M=  0,-10,-13,-13,-10, -7,-13,-13,  9,-13, -3,  0, -3,-10, -6,-13,  7,  3,  6,-20, -7,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='N'; M= -6, 16,-16, 13, 19,-16, -6,  3,-16,  3,-16,-13, 20, -7,  6,  0,  3, -3,-19,-23,-13, 13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='N'; M= -6,  9,-27,  3, -4,-27, 18, -7,-30,  9,-30,-17, 19,-17, -4,  3,  0,-10,-27,-26,-20, -4;
/M: SY='T'; M= 13, -3,-16,-10, -4,-20,-13,-17,-16,  9,-16,-10, -3,-10, -4, -1,  7, 14, -6,-24,-13, -4;
/M: SY='A'; M=  9,-13,-20,-16, -6,-14,-17,-16, -7,  5,  3,  0,-13,-17, -6, -2,-10, -7, -4,-20,-10, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_12 which contains 556'388 sequence entries.


Total number of hits 31 in 6 different sequences
Number of true positive hits 31 in 6 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] S_Ohji
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 6
Feature key [info] REPEAT
Feature description [info] MAP
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
6 sequences

MAP_STAAM   (Q99QS1    ), MAP_STAAN   (P69775    ), MAP_STAAR   (Q6GFB8    ), 
MAP_STAAU   (Q53599    ), OMP7_STAAC  (Q5HEI2    ), OMP7_STAAE  (A6QIG2    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

OMP7_STAAU  (P0C6P4    )

		
PDB
[Detailed view]
1 PDB

1YN3

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission