PROSITE entry PS51225
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MARVEL |
| Accession [info] | PS51225 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-AUG-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51225 |
| Associated ProRule [info] | PRU00581 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | MARVEL domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=144; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=139; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5839710; R2=0.0037069; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=21790.1640625; R2=12.9502821; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1596; H_SCORE=42459; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1057; H_SCORE=35479; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-16; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='F'; M= -9,-51,-38,-43, 69,-50, -2, -2,-45,-19,-30,-30, -6,-45,-21, 17,-23, 0,-27, 67; /M: SY='W'; M=-14, 20,-59,-52, 33,-56,-50, 10,-51, 42, 25,-55, 24,-50,-47,-28,-30, 23, 56,-28; /M: SY='C'; M= 11, 49,-36,-19,-26,-42,-40,-38, 35, -8, -3,-36, 27,-11, 46,-17, 12,-32,-27,-43; /M: SY='T'; M=-29,-48,-33, 13,-32, 24,-29,-48, -6,-40,-42,-27,-41, 32, 1, 41, 56,-36,-28,-43; /M: SY='P'; M=-17,-42,-48,-35, 1, -5, -2, 11,-22, 3,-13,-45, 76,-33, 5,-20,-18, 2,-50, 0; /M: SY='P'; M=-22,-40,-44,-25,-25,-36, 16, -7, 11, 24,-14,-21, 47, 19, 22, -2,-13, 4,-55,-39; /M: SY='G'; M= 9,-26,-12,-35,-25, 69,-25,-43, -7,-41, -9,-31,-39,-39, 9,-24, 10,-14,-53,-30; /M: SY='I'; M=-11, 17,-58,-32, 36,-42,-37, 52,-50, 27, 19,-51,-45,-38,-35,-42,-13, 25,-23,-23; /M: SY='L'; M=-16, 22,-61,-55, 23,-60,-50, 30,-53, 54, 30,-55,-55,-50,-53,-41,-20, 23,-13,-29; /M: SY='K'; M=-29, -1,-40,-28, -9,-32,-36,-30, 61, -6, 7,-33,-48, 26, 52,-11,-37,-20,-49,-19; /M: SY='I'; M= -8, 19,-58,-40, 2,-14,-53, 47,-52, 33, 26,-52,-38,-49,-54,-35,-26, 39,-53,-35; /M: SY='L'; M= 20, 31,-56,-50, 21,-34,-49, 4,-50, 45, 8,-51, 0,-48,-45,-27,-18, 23,-28,-33; /M: SY='E'; M= -7, 24,-19, 66,-39,-40,-34,-15,-19,-40,-41,-33,-41, 60,-10, 18,-17,-26,-56,-45; /M: SY='W'; M=-16,-29,-61,-53, 12,-30,-54, 31,-51, 34, 28,-54,-21,-27,-52,-38, -9, 20, 98,-26; /M: SY='V'; M=-12,-24,-60,-55, 31,-27,-54, 43,-54, 34,-13,-54,-56,-52,-54,-35,-29, 50,-49,-30; /M: SY='F'; M=-26, 20,-59,-55, 74,-51,-47, 1,-53, 38, 22,-38,-45,-53,-52,-22, -8, 9,-37,-17; /M: SY='C'; M= 34, 59,-36,-43,-50, 37,-44,-28,-41,-23,-31, 13,-47,-38,-47, 42, 1,-31,-59,-49; /M: SY='C'; M= 1, 52,-58,-55, 12,-13,-53, 51,-53, 32, 12,-50,-55,-50,-54,-18,-36, 16,-22,-34; /M: SY='I'; M= 10,-25,-58,-54, 41,-16,-53, 44,-52, 24, 1,-50,-54,-51,-53,-29, -9, 32,-13,-28; /M: SY='V'; M= 38, 17,-53,-49,-29,-22,-42, 44,-48,-10,-19,-34,-39,-46,-51, -8, -1, 45,-57,-41; /M: SY='F'; M=-42,-52,-64,-44, 93,-59,-48, -6,-53, 8, 16,-56,-43,-36,-52,-51,-30, -8, 84, 0; /M: SY='I'; M= 45,-20,-35,-46,-31, 20,-51, 45,-46,-22,-30,-40,-26,-43,-50, 11, -1, 9,-54,-25; /M: SY='C'; M=-15,106,-52,-50, 7,-51,-49,-15,-48, 23, -1,-42,-22,-49,-52, 7, 31,-28,-59,-25; /M: SY='C'; M=-14, 59,-56,-26, 16,-58,-55, 47,-43, 6,-23,-49,-55,-50,-53,-22, 1, 48,-53,-13; /M: SY='A'; M= 41, -9,-35, -5,-25, 26,-36, 2,-40,-24,-21,-10,-46,-24,-27, 22, 7, 13,-55,-35; /M: SY='S'; M= 18, 6, -1,-32,-30, 24, 13,-21,-29,-35,-19, 14,-17,-21,-27, 46, 1, 1,-31,-30; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='Y'; M=-15,-53, -6, 16, 6,-15,-23,-31,-39,-44,-23,-17, -3,-32,-24, 26, 34,-12, -1, 50; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='G'; M=-27,-15,-25,-31,-30, 31,-10,-17,-22, 8,-16, -9, -9,-14,-34, 29,-21,-28,-53, 21; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='Y'; M= -4,-60,-52,-33,-16, 28, 12,-22,-33,-24, 6,-23,-32, -3,-18,-25,-34, 5, 42, 46; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='W'; M=-50, 9,-26,-14,-48,-38, -5,-31, -9,-47,-18,-29, 8, -7,-21, -8, 11, -1, 73, 14; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='N'; M=-62,-72, 23,-20,-24,-52,-12,-58,-44,-25,-43, 25,-70,-41,-63,-23, 18,-51,-82,-22; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='R'; M=-25,-78,-58,-29,-73,-22,-20,-40,-24,-50,-35,-14,-17,-27, 4, 2,-27,-53,-80,-22; D=-4; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='G'; M=-43,-81, -7,-27,-32, 5,-35,-21,-69,-28,-16,-30,-25,-44,-52,-31,-34,-47,-81,-30; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='N'; M=-62,-78,-28,-65,-44, 23,-60,-56,-36,-76,-26, 35,-55, -8,-66,-45,-19,-58,-78, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='D'; M=-35,-68, 38,-31, -5,-11,-50,-50,-21,-20,-55, 1,-64,-23, 13, 0,-32,-51,-67, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='Y'; M=-23,-60,-23,-38,-10,-37, 1,-19,-10,-17,-39, 33, 30, -5, -1, 7,-26,-25,-39, 36; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='S'; M= -5, 11,-25,-13,-24, 15, 1,-49,-28,-14,-15,-16, 16, 2, 8, 34,-23,-37,-54, 18; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='S'; M= 5,-52, -1,-25,-28, 12,-43,-39,-39,-23,-17, 5, 41, 3,-22, 44, -2,-12,-60,-48; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='A'; M= 52,-47,-28,-40,-45, 12,-46,-35,-22,-20, -9,-38, 26, -9,-32, 23, 3,-15,-56,-32; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='C'; M= 24, 63,-34,-32,-11, 2, 7,-16, 1, 2,-26,-10,-12, 20,-40,-23, 12, -9,-18, 7; /M: SY='G'; M=-16,-53,-18, 27,-43, 39, 16,-29,-21,-42,-43, 11, 20, 14, -3, 20, 3,-41, -4, 5; /M: SY='W'; M=-11,-33,-61,-56, 78,-15,-46, -6,-51,-12,-32,-53,-34,-53,-51,-22,-45,-21,105, 46; /M: SY='F'; M= -1, 49,-55,-45, 59, 8,-35,-12,-50, 2, 16,-47,-45,-50,-51,-24,-23, 24, -5, 35; /M: SY='M'; M=-35,-48,-51, -2,-27,-33,-45, 19,-46, 23, 70,-24,-35,-37,-42,-16,-10, 49,-15,-11; /M: SY='F'; M= 40,-27,-49,-39, 58, -1,-24,-26,-45,-13,-15,-40,-49,-45,-48, 4, 28, 7,-15,-11; /M: SY='V'; M= -9, 9,-46,-53, -9,-50,-55, 41,-50, -2, 44,-51,-42,-50,-53,-42, 5, 64,-57,-25; /M: SY='W'; M= 40,-30,-43,-43,-43, 42,-44,-26,-42,-34,-25,-21,-23,-38,-47, 36, 10,-24, 45, 14; /M: SY='V'; M= 13, 43,-43,-50, 6, 8,-53, 12,-49, 2,-10,-45,-53,-48,-52, 7,-10, 53,-56,-29; /M: SY='F'; M= -6, -7,-55,-45, 60,-27,-25, 23,-50, 30, 13,-47,-42,-35,-51, -5, 8, 7,-25,-22; /M: SY='C'; M= 38, 81,-24, 17, 1, -8,-45,-42,-41, -2,-38,-20,-49,-32,-46, 16, 4,-30,-56,-27; /M: SY='F'; M=-44,-38,-63,-58, 93,-39,-47, -7,-53, 8, 36,-54,-44,-57,-43,-49,-13,-12, 67, -6; /M: SY='L'; M= -4, 15,-58,-54, 19,-40,-51, 43,-52, 48, -8,-42,-54,-50,-53,-26, -3, 18,-20,-31; /M: SY='Y'; M= 22, -4,-53,-50, 22, -2,-27, 17,-48, 16, 18,-47,-53,-45,-49,-22, -3, 18, -6, 51; /M: SY='C'; M= 20, 66,-41,-41,-26,-30,-46,-13,-40,-37,-39,-23,-35,-24,-46, 46, 57, -6,-61,-36; /M: SY='M'; M= 1, 10,-56,-51, 10,-20,-48, 26,-50, 41, 42,-48,-53,-46,-51, -9, 10, 21,-51,-33; /M: SY='F'; M= 25, 8,-55,-52, 41, 4,-51, 22,-50, 22,-10,-48,-43,-49,-52,-14,-28, 29,-18,-24; /M: SY='F'; M= 5,-48,-59,-54, 66,-55,-48, 27,-52, 32, -5,-52,-46,-51,-52,-17,-11, 8, 19, 5; /M: SY='L'; M=-41, -6,-48,-55, 43,-37,-46, 25,-53, 55, 13,-54,-58,-51,-52,-42, -7, 8,-42, 10; /M: SY='V'; M= 8,-33,-59,-54, 33,-35,-54, 41,-52, 28, -9,-48,-55,-51,-53,-34,-20, 48,-49,-26; /M: SY='L'; M= 5, 14,-56,-48, 8,-24,-49, 18,-50, 46, 19,-50,-33,-30,-51,-16,-11, 32,-51,-24; /M: SY='Y'; M=-37, 7, 31, 0, 19, 2, 18,-35,-39,-32,-36, -6,-52,-37,-33, -4, -3,-15,-30, 83; /M: SY='L'; M= 16, 15,-56,-51, 25,-48,-49, 23,-50, 35, 21,-50,-54,-48,-51,-15, -7, 34,-48, 0; /M: SY='F'; M=-33, 22,-48,-39, 49, 14,-28, 5,-13, 9, 3,-39,-51,-23,-19, 12, 28,-17,-42, 15; /M: SY='F'; M=-17,-52,-13,-14, 45, 20, 2,-42, 1,-12, 12,-11,-14, -4, 38, 3,-11,-38,-43, 4; /M: SY='Q'; M=-14, 6,-26,-10, 0,-46, 0, 2,-17, 26, 9,-24, 7, 33,-18, -1, -3, 7, -2, 17; /M: SY='H'; M=-30,-34, -7,-10,-37,-25, 73,-40,-15,-34,-37, 29, 15, 43, 11, 5, 4,-24,-16, 29; /I: I=-4; MD=-11; /M: SY='M'; M=-47,-68,-13, -9,-56,-67,-10, 12, 1, -6, 23,-17,-34,-12, 18,-29,-18,-25,-71,-53; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='Y'; M= -9,-41,-53,-35,-23,-26, 1,-14, -6, -5,-26,-48,-23,-20, -4, -7, 9, 0,-24, 54; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='R'; M=-17, -3,-47,-40, 5,-16,-30, 0, 17, 8, 8,-11,-33, 4, 37, -3, -8, 4, 34, -7; D=-4; /I: I=-4; DM=-11; /M: SY='D'; M=-26, -9, 35, 11,-15, -8, 11,-11, 0, 5,-19,-14, 6, 5, 23,-13, 20,-36,-55,-12; /M: SY='R'; M=-29, 28,-16,-16, 16, -7,-22,-17, -9,-25,-15, 14, 34,-17, 36, 25, 9,-42, 12,-17; /M: SY='I'; M=-19, 1,-35,-13,-10,-18,-31, 31, 21, -9,-24, 22, 5,-30, 29, 1, -1, 3,-55,-40; /M: SY='R'; M=-11, -2,-30,-34, -1,-35, 14,-25, 26,-29,-29, 17, 30,-25, 49, 24,-28,-41, 26, -2; /M: SY='W'; M=-12,-60,-61,-52, 38, 10,-55, -4,-32, -6,-22,-43,-47,-12,-49,-36,-42,-16,134, 17; /M: SY='P'; M=-30,-12,-13,-29,-27,-28,-41, -7,-16, -4,-35, 3, 76, -6,-16, -4, -2, 12,-51, 19; /M: SY='L'; M=-26,-27,-42,-32, -7,-55,-44, 17,-20, 51, 39, -3,-47,-25,-17,-14,-12, 12, 31,-29; /M: SY='F'; M= 5,-10,-51,-41, 33, -6,-48, 26,-47, 18, 1,-43,-44,-30,-41, 13, 18, 21,-14, -6; /M: SY='D'; M=-32,-55, 82, 45,-44,-37,-35,-30,-32,-18,-35,-14, -7,-20,-40,-24, -7, -2,-68,-46; /M: SY='F'; M= -1, -4,-59,-54, 57,-40,-48, 22,-52, 46, 11,-52,-57,-50,-47,-14,-16, 2,-16,-22; /M: SY='I'; M= 12, -3,-44,-52, 19, 22,-31, 38,-50, 16, -4,-45,-38,-48,-52,-23, -2, 26,-21,-15; /M: SY='F'; M=-16, 8,-51,-50, 55,-43, 7, 10,-44, 3,-15, 13,-44,-46, -2,-42,-27, 31,-35, 51; /M: SY='T'; M= 11, 30, 11,-35,-41,-32, 43,-29,-36,-44,-32, 28,-20,-15,-41, 44, 46,-40,-60, 3; /M: SY='A'; M= 41, 19,-52,-48, 2, 23,-31, 3,-48, 21, 15,-44,-51,-36,-50,-18,-28, 23,-52,-39; /M: SY='I'; M= 1,-14,-56,-53, 20,-24,-51, 42,-51, 35,-19,-49,-54,-49,-52, -7, -2, 33,-49, -7; /M: SY='W'; M= 39, 14,-53,-42, 31,-12,-50, -5,-46, 15,-10,-33,-51,-44,-49, 3, 1,-18, 89,-27; /M: SY='A'; M= 51, 28,-35,-42, 9, 6,-47,-23,-42,-35,-29,-35,-45,-41,-47, 16, 45, 3,-55,-41; /M: SY='F'; M=-11, 8,-61,-56, 65,-16,-51, 28,-54, 31,-20,-53,-58,-55,-54,-41,-33, 32,-40,-17; /M: SY='M'; M=-22,-35,-61,-54, 43,-21,-44, 2,-53, 58, 64,-54,-58,-48,-51,-45,-40, -3,-44,-24; /M: SY='W'; M=-39, 12,-58,-46, 32,-55,-29,-23,-47, -2, 20,-46,-59,-25,-46,-37,-40, -9,115, 83; /M: SY='F'; M=-14,-19,-52,-55, 68,-31,-47, 4,-54, 50, 21,-54,-59,-52,-52,-29,-40, 3,-38,-18; /M: SY='V'; M= -5,-47,-52,-49,-23,-12,-54, 49,-47,-17,-10,-43, -4,-46,-41, 22, 14, 51,-58,-40; /M: SY='A'; M= 62, 24,-44,-41,-43, 24,-47,-30,-42,-38,-25,-29,-46,-38,-46, 33, -4, -5,-32,-47; /M: SY='S'; M= 10,-44,-44,-43, 48,-15,-27, -8,-37,-15, -3,-34,-47,-39,-45, 61, 18, -4,-47,-28; /M: SY='C'; M=-14, 68,-54,-53,-10,-15,-53, 53,-50, -7,-26,-45,-53,-48,-53, 25,-25, 31, 7, -5; /M: SY='V'; M= 23,-24,-57,-52, 41,-53,-49, 31,-50, 22,-13,-51,-55,-50,-41,-37,-14, 41,-44, 15; /M: SY='W'; M= 4, -6,-42, -5, 12,-51,-40,-29,-40, 22, 10,-45,-39, -9,-39,-25,-26,-15,107, 61; /M: SY='A'; M= 49,-46,-51,-45, 5, 0,-49, -3,-45, 13,-10,-45, 30,-44,-50,-18, 1, 13, 28,-38; /M: SY='N'; M= 12,-48,-16,-27,-16,-39, 22, 1, 29, -6, 7, 35,-48,-11, -6, 11,-14, 10,-53, 8; /M: SY='Q'; M= 17,-37, -7,-11, 3, 31,-15,-33, 7,-26,-29,-21,-19, 41,-21, 0, 5,-27,-45, 27; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='W'; M=-12, -1,-55,-32, -1,-54,-15,-22,-30, 23,-20,-32,-55,-22,-34, 4, 16, 20, 91, 2; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='N'; M=-14,-52,-20,-40, 3,-34,-16, -8,-31,-28,-31, 38,-52, 31,-31, 36, 27,-20,-43,-30; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='D'; M=-22,-64, 45,-18,-61,-30, -7,-44,-17,-27,-24,-11, 29, 7, 18,-10,-23,-13,-46,-53; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='T'; M=-17,-59,-39,-38,-12,-21, -9, -4,-52,-26, 11,-26,-39,-26,-33, 12, 23, 21, 16,-47; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='K'; M= -8,-68,-30,-13,-54,-17,-22,-68, 42,-48,-59, 5,-61,-43,-21, 1,-31,-64,-14, -5; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='W'; M=-49,-33,-39,-47,-51,-41, -3,-42,-45,-16,-22,-23, -1, 13,-43,-15,-20,-28, 27, 17; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='A'; M= 17, 13,-38,-50,-80,-23,-54,-59,-67,-64,-33,-25, -8,-43,-53,-13,-11,-67,-87,-55; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='C'; M=-48, 69,-21,-26,-33,-61,-37,-35,-27,-32,-46,-39,-21,-20,-47,-49,-51,-29,-66, 32; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='T'; M=-52, -6, 7,-22,-37,-50,-19,-31,-18, -8,-36, -2, 4,-21,-34, -8, 14,-38,-76,-40; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='Y'; M= -5,-68,-24,-23,-27, -2,-16,-51,-16,-20,-43, 2, 19,-41,-37,-23,-37,-34, 22, 26; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='H'; M=-26,-67,-36,-31, -1, 1, 37,-43,-36,-16, 0,-11, 18,-29,-19,-25,-11,-25,-33, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='Y'; M=-26,-41,-14,-11, -4, 2, 8,-33,-40, -9,-34, 6,-52,-18, 5, 2,-18,-29,-55, 30; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='C'; M=-41, 81, -6,-20, -8, -4, -2,-52,-44,-19,-45, -1,-18,-23, -2,-10,-22,-15,-65, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='C'; M=-28, 37,-16, 5,-40,-29, -1,-21,-15,-33,-18,-19, 25, 12, 18, 3,-10, -3, 28, -3; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='V'; M=-13,-30,-22,-30,-13, 24, 16,-10,-25,-11, 1, 7, -2, -7,-29, -2, -8, 28,-57, -8; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='W'; M= -8,-25, 17, 3,-16,-24, 30,-11,-19,-26, 34, 3,-19,-20, 7, 0, 11,-23, 59, 41; /M: SY='G'; M=-14,-53, 43,-23,-39, 44, 16,-51,-19,-48,-40, 27, 27,-15,-27, 22,-12,-47,-35,-11; /M: SY='A'; M= 35,-48,-38, -6,-26, 19, 0,-12,-14,-16,-20, 7,-11, 20, 6, 29,-16,-35,-53,-20; /M: SY='W'; M= 24,-25, 14, 20,-22,-37,-36,-25,-13, 15, 7, 13,-40, 11, 4,-14,-24,-25, 35, 24; /M: SY='I'; M= 15,-49,-43,-35,-25,-19,-33, 39, -3, 3, 8, 29,-39, -4, 18,-26, -1, 9,-53,-14; /M: SY='A'; M= 66,-42,-48,-43,-19,-17,-49, 18,-43,-19, -5,-36,-46,-41,-47, 2, 10, 14,-54,-43; /M: SY='A'; M= 64,-17,-36,-29,-51, 16,-47,-29,-41,-44,-39,-35,-45,-37,-46, 35,-10, 12,-56,-48; /M: SY='I'; M= 21,-47,-50,-49,-16, 16,-50, 41,-46,-14, 8,-41,-49,-35,-50, 17, 9, 35,-53,-11; /M: SY='V'; M= 13,-31,-56,-52, 20,-54,-54, 36,-50, 8,-16,-33,-53,-50,-52,-31, 7, 58,-11, -8; /M: SY='F'; M=-38, 25,-63,-58, 97,-59,-30,-17,-55, 24, 10,-45,-44,-59,-53,-38,-36,-24,-27, -2; /M: SY='G'; M= 27, 28,-32,-45,-21, 60,-46,-29,-42,-33,-15,-18,-46,-40,-36, 31, 11,-38,-55,-47; /M: SY='F'; M= -9, 40,-58,-56, 84, -7,-21, -8,-53, 13,-21,-30,-60,-55,-52,-40,-35, -6, 6, 20; /M: SY='L'; M=-16, 10,-60,-55, 39,-47,-51, 31,-53, 40, 32,-53,-57,-51,-53,-37,-12, 38,-47,-27; /M: SY='N'; M= 37, 8,-28,-39,-46,-21,-39,-12,-37,-15,-36, 54,-47,-18,-43, 30, 21, 12,-61,-45; /M: SY='T'; M= 6, 0,-52,-49, 27,-19,-41, 32,-40, 12, 33,-43,-50,-37,-50,-12, 36, 26,-51,-32; /M: SY='I'; M= 1, 0,-57,-47, 29,-21,-53, 53,-52, 27,-19,-38,-32,-50,-45,-26,-26, 32,-48,-22; /M: SY='L'; M= 26, 40,-54,-49, -1,-37,-49, 7,-49, 41, 8,-47,-44,-46,-50, -5, 10, 22,-53,-28; /M: SY='W'; M=-37, 20,-58,-54, 46,-54,-16,-33,-48, -3,-32,-40,-59,-38,-47,-32,-32,-41,116, 86; /M: SY='A'; M= 41, 4,-49,-35, 7, 39,-50, 16,-47, 2,-21,-41,-28,-44,-51,-10,-13, 10,-51,-40; /M: SY='I'; M= 16, -1,-53,-51, 5, 29,-50, 32,-49, 18, -6,-45,-30,-36,-52,-25,-15, 28,-21, 0; /M: SY='D'; M=-19,-10, 58, 16,-52, 1, 16,-14,-29,-17,-27, 39,-31, 6,-39, 28,-19,-45,-41,-44; /M: SY='A'; M= 48, 46,-50,-45, -6,-30,-34, 11,-45, 10, 9,-42,-25,-43,-49, -6, 23, 10,-55,-40; /M: SY='W'; M= -8, 0,-59,-54, 47,-27,-47, 3,-50, 3,-20,-52,-56,-50,-51,-15,-19, 33, 95, 46; /M: SY='F'; M=-39,-29,-59,-54, 70,-47,-22, -1,-29, 42, 12,-53,-59,-51,-31,-34,-29, 7, 18, 31; /M: SY='A'; M= 45, 14,-45,-41,-15,-17,-35, 18,-17,-23, 4,-32,-46, -6,-32, 28, 20, 8,-55,-32; /M: SY='Y'; M=-15, -6,-43,-47, 52,-54, -6, 0,-32, 13,-23,-47,-56, 4, 6,-23,-10, 7, 43, 60; /M: SY='K'; M= -8, 0,-25,-20,-51,-39,-14,-22, 60,-31,-25, -7, -9, 35, 51,-34,-18,-30,-33,-18; /M: SY='R'; M= -5,-37,-14, 35,-46,-26, 20,-17, 8, 1,-18,-14,-45, -1, 47, -5, 20,-30,-56,-23; /M: SY='W'; M=-42,-55,-30,-32, 27,-41, 2,-10,-16,-10, -6,-43, 12,-39, 29,-22, 23, 0, 88, 46; /M: SY='R'; M=-20, -2,-30,-24, 5, 12, -8,-35, 27,-17,-16,-34, -6, 6, 66, -6,-21,-32,-51,-30; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 114 in 103 different sequences |
| Number of true positive hits | 114 in 103 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 1 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.13 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MARVEL |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
103 sequences
CKLF1_HUMAN (Q8IZ96), CKLF2_HUMAN (Q8TAZ6), CKLF3_HUMAN (Q96MX0), CKLF3_MOUSE (Q99LJ5), CKLF4_HUMAN (Q8IZR5), CKLF4_MOUSE (Q8CJ61), CKLF5_HUMAN (Q96DZ9), CKLF5_MOUSE (Q9D6G9), CKLF6_HUMAN (Q9NX76), CKLF6_MOUSE (Q9CZ69), CKLF6_PONAB (Q5RFC1), CKLF7_HUMAN (Q96FZ5), CKLF7_MOUSE (Q9ESD6), CKLF8_BOVIN (Q1RMP9), CKLF8_HUMAN (Q8IZV2), CKLF8_MOUSE (Q9CZR4), CKLF_HUMAN (Q9UBR5), CKLF_MOUSE (Q9DAS1), CKLF_RAT(Q9JK79), CLF2A_MOUSE (Q9DAR1), CLF2B_MOUSE (Q9DAC0), CSPL1_CHLAT (P0DI72), CSPL2_CHLAT (P0DI73), MADL2_BOVIN (Q08DL4), MADL2_HUMAN (A6NDP7), MADL2_MOUSE (Q08AU7), MADL2_RAT (B2RZ87), MADL2_XENLA (Q5XGR0), MAL2_BOVIN (A2VE13), MAL2_HUMAN (Q969L2), MAL2_MOUSE (Q8BI08), MAL2_PONAB (Q5RAI2), MALD1_DANRE (Q5BLB7), MALD1_HUMAN (Q9BSK0), MALD1_MOUSE (Q7TQJ1), MALD1_XENLA (Q6GPN9), MALD2_HUMAN (Q8N4S9), MALD2_MOUSE (Q3UZP0), MALD2_XENTR (Q0IHQ3), MALD3_HUMAN (Q96A59), MALD3_MOUSE (Q9D956), MALL_HUMAN (Q13021), MALL_MOUSE (Q91X49), MAL_BOVIN (Q3ZBY0), MAL_CANLF (Q28296), MAL_HUMAN (P21145), MAL_MOUSE (O09198), MAL_RAT (Q64349), MYADM_HUMAN (Q96S97), MYADM_MOUSE (O35682), MYADM_PONAB (Q5R6H1), MYADM_RAT (Q6VBQ5), MYADM_XENLA (Q63ZU3), MYADM_XENTR (Q6DFR5), NCE2_CANAL (Q5ANE3), OCLN_CANLF (Q28269), OCLN_CHICK (Q91049), OCLN_HUMAN (Q16625), OCLN_MOUSE (Q61146), OCLN_PONAB (Q5RFS5), OCLN_POTTR (Q28793), OCLN_RAT(Q6P6T5), OCLN_XENLA (Q9PUN1), PLLP_BOVIN (A6H7B0), PLLP_HUMAN (Q9Y342), PLLP_MOUSE (Q9DCU2), PLLP_RAT(P47987), PLP2_BOVIN (Q6Y1E2), PLP2_HUMAN (Q04941), PLP2_MOUSE (Q9R1Q7), PLP2_RABIT (Q95MN6), PLP2_RAT(Q6P742), SINGL_DROME (Q9VXD1), SNG1_CAEEL (O76735), SNG1_HUMAN (O43759), SNG1_MOUSE (O55100), SNG1_PONAB (Q5R703), SNG1_RAT(Q62876), SNG2L_HUMAN (A8MWL6), SNG2_BOVIN (A7E3W5), SNG2_HUMAN (O43760), SNG2_MOUSE (O55101), SNG2_RAT(O54980), SNG3_BOVIN (A2VE58), SNG3_HUMAN (O43761), SNG3_MOUSE (Q8R191), SNG4_BOVIN (Q2YDD6), SNG4_HUMAN (O95473), SNG4_MOUSE (Q9Z1L2), SNG_DROME (Q7JYV2), SYNPR_HUMAN (Q8TBG9), SYNPR_MOUSE (Q8BGN8), SYNPR_RAT (P22831), SYPH_BOVIN (P20488), SYPH_HUMAN (P08247), SYPH_MOUSE (Q62277), SYPH_RAT(P07825), SYPH_SPECI (Q5YJC1), SYPL1_HUMAN (Q16563), SYPL1_MOUSE (O09117), SYPL2_HUMAN (Q5VXT5), SYPL2_MOUSE (O89104), SYPL2_RABIT (O62646)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
CSPL1_MICPC (C1N652) |
| UniProtKB/Swiss-Prot 'Partial' sequences |
1 sequence
PLP2_SHEEP (Q28597) |
| PDB [Detailed view] |
5 PDB
8A6M; 9BRA; 9BRQ; 9BRT; 9BRZ |