PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS51237

General information about the entry

Entry name [info]

CYSA

Accession [info]

PS51237

Entry type [info]

MATRIX

Date [info]

01-AUG-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 05-JUL-2017 INFO UPDATE.

PROSITE Doc. [info]

PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein cysA family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=148;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=143;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7113944; R2=0.0100890; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=990910; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=4142; N_SCORE=43.5; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=475; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-20; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='Q'; M=-31,-56,-27, -7,-53,-39,-18,-46,-12,-41,-29,-22,-18,112,-13,-21,-34,-48,-40,  7;
/M: SY='E'; M=-17,-51, 23, 85,-55,-43,-25,-54,  9,-48,-43,-25,-29, 21,-21, -4,-30,-47,-52,-43;
/M: SY='E'; M=-31,-53, -2, 97,-55,-48,-25,-56,-13,-48,-44,-28,-27, -5,-23,-28,-32,-48,-52,-45;
/M: SY='A'; M= 85,-33,-39,-31,-47,-20,-41,-37,-34,-39,-33,-34,-38,-31,-39,-12,-24,-23,-47,-43;
/M: SY='M'; M=-36,-41,-55,-47,-16,-54,-37, 14,-45, 64, 74,-49,-50,-38,-44,-44, -9,-10,-44,-24;
/M: SY='E'; M=-30,-51, 36, 88,-55,-43,-25,-55,-15,-49,-46,-24,-29, -9,-25,  8,-29,-48,-54,-44;
/M: SY='V'; M=-28,-39,-55,-48,-21,-56,-49, 18,-47, 35, 30,-51,-51,-45,-47,-41,-26, 70,-53,-30;
/M: SY='A'; M= 77,-33,-37,-31,-47,-21,-39,-38,-33,-40,-34,-30,-37,-29,-38, 31,-15,-26,-48,-42;
/M: SY='D'; M=-39,-52,101, -4,-59,-36,  7,-57,-25,-55,-52, 10,-39,  8,-33,-26,-29,-54,-73,-40;
/M: SY='R'; M=-35,-53,-24, 44,-50,-47, -2,-54, 10,-46,-37,-27,-40, 17, 84,-20,-21,-47,-49,-36;
/M: SY='I'; M=-30,-43,-56,-52,-23,-59,-57, 70,-48, -7,-10,-49,-48,-48,-51,-41,-26, 64,-52,-31;
/M: SY='V'; M= 14,-37,-52,-46,-28,-50,-55, 12,-45,-13,-16,-48,-49,-46,-47,-34,-22, 82,-58,-34;
/M: SY='V'; M=-27,-40,-55,-49,-23,-57,-54, 38,-47, 18,-11,-50,-50,-48,-49,-40,-25, 75,-54,-31;
/M: SY='M'; M=-35,-41,-56,-46, 13,-51,-31, -6,-42, 43,107,-46,-47,-35,-40,-44,-33, -9,-42,-20;
/M: SY='N'; M=-29,-40,  6, -1,-48,-25, -2,-48,  7,-53,-41, 90,-41,-19, -3, 33,-18,-47,-62,-41;
/M: SY='Q'; M= -1,-48,-23,  6,-51,-35, 37,-49, 39,-46,-34, 32,-38, 69, 21,  1,-28,-46,-50,-34;
/M: SY='G'; M=-20,-48,-36,-48,-54, 93,-43,-62,-41,-58,-47,-22,-40,-39,-49,-21,-40,-56,-45,-49;
/M: SY='R'; M=-20,-24,-29,-21,-48,-14,  4,-47, 37,-45,-35, 29,-43, 29, 73,-27,-32,-21,-49,-35;
/M: SY='I'; M=-35,-47,-57,-54,  1,-61,-56, 83,-50,  8, -8,-48,-47,-47,-52,-44,-29, 35,-45,-27;
/M: SY='E'; M=-32,-51, -7, 91,-47,-49,-27,-14,-16,-12,-36,-31,-29, -9,-26,-30,-32,-22,-51,-42;
/M: SY='Q'; M=-31,-56,-26, -5,-61,-39,-19,-47,-11,-42,-29,-21,-38,115,-11,-20,-33,-49,-44,-32;
/M: SY='V'; M=-12,-42,-49,-41,-27,-52,-48, 52,-40, -2,  5,-42,-46, 27,-42,-34,  1, 58,-51,-31;
/M: SY='G'; M=-12,-48, 24,-38,-55, 86,-39,-61,-38,-57,-47, -6,-40,-36,-46,-21,-37,-54,-48,-48;
/M: SY='T'; M= -6,-36,-28,-12,-43,-31,-34,-39,  3,-42,-36,-18,-33,-24, -8, 60, 66,-31,-55,-38;
/M: SY='P'; M= 15,-56,-38,-27,-55,-36,-41,-44,-34,-53,-40,-42,109,-36,-45,-12,-28,-45,-50,-52;
/M: SY='D'; M= 16,-47, 51, 28,-52,-12,-28,-28, 14,-44,-38,  1,-37, 46,  7,-23,-12,-19,-53,-39;
/M: SY='E'; M= -4,-50, 39, 77,-54,-41,-24,-52,-16,-47,-13, 13,-32, 23, -5,-26,-30,-46,-54,-42;
/M: SY='V'; M=-29,-41,-56,-50,-22,-58,-54, 53,-48, 21, -9,-50,-50,-47,-49,-41,-26, 67,-52,-30;
/M: SY='Y'; M=-41,  1,-44,-44,  5,-47,  7,-31,-37,-28,-25,-43,-53,-33,-35,-11,-37,-36, 81,110;
/M: SY='D'; M=-17,-50, 78, 37,-54,-37,  6,-55,-17,-51,-46, 22,-38,-18, 35,-18,-29,-50,-62,-40;
/M: SY='H'; M= -2,-47,-23, 16,-45,-23, 78,-48, 16,-43,-32, 16,-38, 46, 14, -5, 16,-44,-53,-12;
/M: SY='P'; M=-38,-63,-38,-27,-58,-40,-41,-45,-34,-56,-42,-45,117,-38,-47,-35,-30,-51,-51,-55;
/M: SY='A'; M= 57,-38,-29,  6,-45,-28,-34, -2, -7,-37,-32, 27,-38,  9, -7,  2,  5,-14,-50,-40;
/M: SY='S'; M=-21,-36, -1,-28,-44,-27,-29,-40,-26,-45,-38, 51,-35,-24,-33, 61, 57,-34,-59,-39;
/M: SY='P'; M= 24,-49,-16, -2,-15,-36,-35,-43,-25,-46,-37,-34, 82,-29, 25,  3, -2,-40,-46, -5;
/M: SY='F'; M=-47,-43,-60,-55,109,-54,-39,-20,-50,-12,-22,-48,-58,-61,-47,-46,-39,-26,-12, 10;
/M: SY='V'; M=-23,-37,-55,-48,-26,-56,-57, 10,-46,-11,-14,-50,-51,-49,-48,-38,-22, 88,-60,-33;
/M: SY='Y'; M=-24, 14,-44,-44, 37, -6, 13,-23,-39, -2, 62,-37,-48,-36,-38,-33, 15,-27,-20, 77;
/M: SY='S'; M=-26,-47, 22, 36,-49, 36, 25, -8,-25,-45,-39,  7,-36, 15,-12, 36,-26,-41,-53,-38;
/M: SY='F'; M=-47,-43,-59,-55,108,-55,-39,-20,-50, -3,-21,-49,-57,-60,-47,-46,-39,-25,-13,  9;
/M: SY='L'; M=-34,-42,-55,-49, -5,-55,-43, 39,-48, 57, 32,-50,-51,-42,-47,-21,-30, 27,-45,-26;
/M: SY='G'; M=-20,-48,-36,-48,-54, 93,-43,-62,-41,-58,-47,-22,-40,-39,-49,-21,-40,-56,-45,-49;
/M: SY='D'; M= 13,-46, 45, 43,-44,-35, 14,-43,-24,-10,-36, 27,  5, 18,-30,  3,-27,-40,-52, -4;
/M: SY='V'; M= 19,-37,-44,-39, -6,-40,-46,  4,-10,-10,-21,-37,-44,-37,-39, 26, -4, 62,-52,-33;
/M: SY='N'; M=-27,-42,  3,-31,-47,-27,-21,  6,-25,-47,-39, 97,-46,-26,-33,  8,-21,-39,-66,-43;
/M: SY='R'; M=-18,  2,-36,  9,-40,-48, 15,-31, -2,  0,-29,-33,-45, 13, 59,-13,  1, 12, 11,-34;
/M: SY='F'; M=-42,-44,-59,-53, 63,-32,-44, 22,-52, 52,-10,-53,-56,-50,-50,-48,-37, -4,-33,-13;
/M: SY='P'; M=-22,-53, 12,  1,-50,-39, 56,-47,-19,-49,-39,  7, 71,  8,-12, 13,-10,-28,-56,-17;
/M: SY='G'; M= -4,-47,-15,-41,-14, 67,-41,-38,-17,-23,-37, -4,-44, -6,-24,-10,-34, 10,-49,-41;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='R'; M=-34,  1,  6, 18,-45,-46, 23,-36,-14,-13,-34, -1,-44,  5, 39,  1, 25,  4,-59,-38; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='V'; M=  0,-48,-28,-19,-33,-50,-48, 28,-43,  0,-24,  5,-25,-42,-27,-10,-31, 42, 33,-12; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='H'; M=  4,-55, -2, 35,-57,-25, 37,-58, -1,-54,-45,-31,-44, 14, 33,  9,-22,-51,-60,-43; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='G'; M=-15,-54,  2, -7,-53, 34,  5, -8, -5,-29,-42, 20,-47, 13,-10,  0,-25,-45,-59,-46; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='G'; M=-17,-55,-19,-50, -4, 66,-47,-28,-45,-33,-47,  8,-50,-45,-27,-11,-43,-51,-53,-47; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='Q'; M=-31,-57, -9,  6, -7, -6, 16,-48,  5,-37,-41, 14,-49, 48, 17,-34,-16,-16,-56,-39; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='W'; M=-12,-55,-61,-35, 31,-40,-56,  7,-54, 10,-29,-56,-59,-53,-56,-23,-24, 18, 75, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='W'; M=-23,-59,-44,  0, -8,-38, 36,-39, -7, -8,-37,-21,-11, 15, -3,-42,-16, -2, 55, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='V'; M= -5,-53,-56,-56, -8,-36,-22, 16,-53, 21,-26,  5,-60,-51,-55,-32,-25, 22,-56, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='G'; M=  6,-57,-29,-27,-33, 55,-14,-29,-49,-57,-51,-10,-53,-22,-55,-15,-45,-25,-60,-53; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='G'; M= -3,-59, 17, 27,-64, 32,-46,-64,-29,-49,-55,-20,-11,-36,-47, 10,-41,-58,-65,-57; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='H'; M=-16,-60,-26,-47, 14,-36, 49, -8,-43,-19,-40,-16,-60,-11, 10, -6,-29,-20,-61,-36; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='W'; M=-19,-67,-36,-58,-12,-66,  2, 12,-40,-16,-41,-38, 16,-57,-20,-55,-35,  3, 25,-47; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='W'; M=-34,-68,-20,  2,-44,-64,-59, 11,-24,  7,-39,-58, 19,-23,-54,-54,-35,-40, 80,-42; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M=  3,-57,-29,-47,-55,-11,-53,-44,-48, -8,-44,-46, 38,-24,-35, 15,  2,-15,-66,-55; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M=-36, -3, -7,-43,-29,-38,-50,-15,-23, 17,-35,-20, 58,-10,-51,-32,-29,-27,-61,-49; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M=  8,-58,  7, 17,-23,  7,-46, -3,-40,-50,-46, -7, 26,-22,-22,-26,-20,-31,-60,-50; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='H'; M=  9,-51,-43,-14, 14,-48, 38,-14,-17,-12,-33, -7,-17,  2,-22, -4,-17,  3,-50,  8; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='Q'; M= 13,-52,  8,-21,-50,-20,-37,-51,-12,-52,-44,-15, 13, 37,-37, 25, 11,-46,-53,  9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M=  1,-53,  2, 19,-55,-12,  8,-50,-14,-20,-43, 23, 26,  9,-38, -5,  2,-48,-62,-48; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='W'; M= 12,-52,-26,-21,-42,-14,-14, -1,-41,  5,  6,-23,  5,  9,-18, -5,-37,  4, 27,-41; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='H'; M=  0,-53,  9,  9,-26,  4, 28,-50,-21,-22,-42,  0, 17, -4,-24, 11,-13,-47,-55, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='Q'; M=  9,-52, 24,  9,-51,-11, -4,  0,-20,-44,  0, 25,-23, 30,-22,-25, -4,-39, 18,-42; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='Q'; M= -8,-54,-13,  2,-58, 49, 20,-54,-31,-44,-41,  0,-23, 60,-35,-26,-25,-35,-54,-44; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M= 14,-51, -2, 17,-55,-34, 35,-50,  4,-50,-41, -3, 35, 25, -6, 11,-11,-33,-58,-42; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='A'; M= 39,-12,-42,-14,-39,  9,-28,-27, -8,-26,-32,-38, -8,-26,-24,  1,-30, 27,-48, 13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='T'; M=-24,-49, 31, 22,-45,-46, 22, -5,-16,-17,-34,-13,-18,  7, 11,-13, 33, -5,-60,-39; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='L'; M= 25,-44,-54,-49, 27, -2,-46, 11,-48, 30,-19,-47,-52,-46,-49,-37,-34, 23,-43, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='Y'; M=-29,-49,-52,-51, 74,-53,-24,-24,-45,  6,-21,-48,-58,-45,-42,-43,-39,-29,-10, 87;
/M: SY='V'; M=  3, -7,-56,-50, 28,-53,-51, 28,-48, 24,-15,-50,-52,-48,-49,-39,-19, 55,-47,-26;
/M: SY='R'; M=-26,-56,-37,-25,-49,-50,-26,-56,  2,-48,-37,-30,-49,-14,100,-34,-39,-49,-49,-36;
/M: SY='P'; M=-39,-64,-40,-29,-59,-41,-42,-48,-34,-57,-44,-44,112,-38,-16,-14,-32,-52,-53,-55;
/M: SY='H'; M=-41,-55,-11, 15,-34,-24,111,-54,-30,-43,-32, -4,-43, -8,-18,-32,-21,-54, 60, 27;
/M: SY='D'; M=-38,-55, 79, 62,-59,-43,  5,-59,-22,-54,-50,-17,-35,  4,-30,-29,-33,-54,-65,-43;
/M: SY='V'; M=-36,-44,-59,-52, 28,-59,-50, 39,-50, 36, 24,-53,-53,-48,-50,-46,-33, 43, 29,-22;
/M: SY='E'; M=  3,  8, 20, 42,-40,-44, -3, -1,-28,-18,-11,-31,-40,  0, -7,  4, -3, 15,-52, -4;
/I:         I=-10; MD=-33;
/M: SY='I'; M=-40,-49,-61,-56,-22,-63,-53, 55,-54, 39,  3,-56,-55,-50,-54,-50,-36, 29, 22,-10; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-33;
/M: SY='S'; M=  5,-53,-12,  6,-57,  0, -7,-54, -8,-23,-47, -7,-49, -9,-42, 35, -8,-49,-64,-50; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='T'; M= -8,-58,-48,-13,-51,-55,-49,-17,  5,-15,-42,-43,-25, -4,  5, -4, 22,-30,  9,-24; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-33;
/M: SY='Q'; M= -4,-58,  4, 24,-58,-32,-12,-50, -9,-44,-44,-35, 28, 39,  3, -8,-12,-21,-59,-32; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-33;
/M: SY='P'; M=  5,-50, 10,  0,-50,  5, 32,-11,-23,-45, -1,  4, 53,  0,-38, 14, -9,-40,-56,-41;
/M: SY='D'; M= 12, 18, 31,  7,-48,  7,-11,-26,-30,-10,-37, 12,-43, 11, -1, 18,-15,-34,-57,-42;
/M: SY='Q'; M= 17,-47, 21,  7,-48, 11,  1,-33,-11,-14,-36,-27, -6, 27,-17,  2, 16,-19,-55,-41;
/M: SY='N'; M=  3, -4, 26, 22,-55, 19,-32,-52,-10,-53,-44, 31, 19, 22,-34,  9, -8,-48,-57,-46;
/M: SY='G'; M= 29, 27,-38,-23,-48, 33, 11,-40,-38,-43,  0, -5, 17,-36,-43,  4, 19, -7,-56,-44;
/M: SY='W'; M=-13,-48,-56,-52,  2,-56,-19, 53,-48, 33,-13,-50,-51,-45,-41,-43, -7,  6, 54, 11;
/M: SY='P'; M= 19,  7,-39,-10,-49,-26,-40,-27,-23,-20,-37,-39, 79, -1,-10,  7,-30,-40,-51,-21;
/M: SY='A'; M= 56,-40,-45,-41, -9, 24,-47,-26,-41,-35,-32,-37,-44,-40,-46,-22, -3, 29,-51,-41;
/I:         I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='Q'; M= -2,-47,-15, 14,-48,-43,-15,-15, 21,-33,-34, -2,-40, 39, 23,-10, 35,-12,-54,-39;
/M: SY='V'; M=-32,-45,-58,-54, -9,-61,-57, 49,-51,  1,-14,-53,-53,-51,-52,-44,-29, 67,-53,-11;
/M: SY='E'; M= -4,-48,  6, 28,-41,-46,-11,-16, 15, -4,-31,-15,-41,  3, 20,-17, 22,  0,-52,-14;
/M: SY='W'; M= 11,-51,  4,  7,-42,-22, 37,-50,  7,-37,-38, -5,-44,-23, 50,-19, -4,-45, 53,  4;
/M: SY='I'; M= -2, -6,-50,-27,-31,-49,-50, 47,-30,  6,  6,-44,-20,-41,-47, 14,-27, 41,-54,-36;
/M: SY='H'; M=-34,-48,-40,-36,-34,-47, 38, 21,-28,  7, -4, -1,-47, 13, 32,  8, 10,  9,-53,-13;
/M: SY='P'; M=  9,-52, -3,-32,-15,-42, 35,-29,-19,-31,-13,-19, 43,-30, 32, -9,-12,-30, 16, 42;
/M: SY='L'; M=-24,-46,-24,-39, -4,-15,-43, 18, 16, 28,-20,-39,-49,-35, 10,  1,-16, 20,-49,-33;
/M: SY='G'; M= 10,-49,-15,-44,-56, 79,-43,-60,-37,-57,-47,-26,-43,-38,  0,-23,-23,-52,-50,-50;
/M: SY='W'; M= 18,-48,-38,-38,  6, 23, 31,-44,-35,-45,-39, 14, 36,-35, -9, -7, 12,-28, 55,-32;
/M: SY='W'; M=-16,-48,-34, 29, 22,-48,-36, -2, -9, -7, 19,-16,-44,-12, 11, -2,  7,  0, 29,  4;
/M: SY='V'; M=  2,-44,-48,-42,-33,-49,-46, 15,-35, -4, 19,-41,-47, -5, 15,-23, 23, 46, 33,-34;
/M: SY='R'; M=-39,-57,-34,-10,-28,-48, 40,-33, 18,-44,-34,-28,-46, 56, 68,-32,-38,-31,-47,  3;
/M: SY='V'; M=  7,-43,-56,-50,-23,-54,-49, 25,-49, 44,-12,-52,-53,-46,-50,-42,-31, 46,-50,-11;
/M: SY='E'; M=-35,-52, 40, 69,-51,-47,-31,-26,-20,-28,-42,-27,-36,-17, 12, -4, -6,-20,-58,-44;
/M: SY='L'; M= 11,-43,-55,-49,-23,-52,-48, 20,-49, 52,-11,-52,-53,-45,-49,-26,-32, 33,-50,-32;
/M: SY='Q'; M=  5,-48, 11, 17,-13,-41,-32,-27, 22,-24,-35,-15,-42, 27, 16,  7,  4,-17,-47,  7;
/M: SY='P'; M=-24,-48,-23,-39,-15,-26,  4, 12,-34, 24,-23,-25, 30,-36, 19,  5, -6, 10,  2,-34;
/M: SY='D'; M= 13,-48, 26, 22,-26,  4,-37,-13, -7, -4, -9,-14,  3,-12,  0,-28,  9,-24,-53,-40;
/M: SY='D'; M= -1,-51, 49,-15,-56, 39,  0,-39,  1,-54,-46,  4,  6,  9,-23,  8,-32,-49,-57,-45;
/I:         I=-11; MD=-35;
/M: SY='W'; M= -9,-49, -2,-14,  5, 21,-39,-43,-25,-32,-11, 11,-44, 25,-38, 17, 13,-29, 76,-30; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-35;
/M: SY='Q'; M=-23,-56, 32, -1,-56, 17, 19,-51,-19,-26,-43,  0,-20, 40, -8, -4,-22,-31,-61,-44; D=-11;
/I:         I=-11; MD=-35;
/M: SY='W'; M=-26,-66,-17,  6,-60, -9, 11,-59,-43,-44,-53,-10,  5, 17,-27, -5,-27,-32, 53,-49; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-35; IM=0; DM=-35;
/M: SY='N'; M=-21,-63,-30,-36,-48,-63,-56,  1,-58, 11,-39, 15,-11,-55,-62,-30,-28, -6,-69,-22; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-35;
/M: SY='W'; M=-48,-58,-16,-36,  6,-41,-57, 30,-57, 22,-25,-58,-62,-55,-59,-55,-45, 15, 54,  1; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-35;
/M: SY='E'; M=-24,-52, -1, 52,-48,-32, 34,-15,  1,-32,-16, -1,  8,  0, 11,-21, 12,-30,-55,-24;
/M: SY='A'; M= 39,-43,-27,  0,-35,-42,-47, 33,-40,-14,-24,-41,-45,-20,-44,-11,-15, 37,-52,-16;
/M: SY='H'; M=-23,-53,-23, 50,-24,-45, 51,-27,  2,-33,-37,-29, 28, 29, -8,  1, -4,-44,-52,-14;
/M: SY='L'; M=-38,-46,-59,-54,  7,-38,-51, 47,-52, 48, -9,-54,-54,-49,-52,-48,-34, 30,-47,-28;
/M: SY='S'; M=  2, -4,  1, 26,-50,  5,-37,-41,-31,-46,-41,  1, 21,-28,-39, 34, 29, -7,-58,-45;
/M: SY='R'; M=-10,-51,-41,-22,-34,-23, 10, 10, 20, -5,-28,-20, 16,-29, 38,-22,-34,  6, 13, 15;
/M: SY='D'; M=-20,-52, 36, 33,-53,-14, 11,-46, -7,-48,-42,-11, 26, 16, 13, 16,-30, -9,-58,-42;
/M: SY='D'; M= 22,-49, 29, 15,-47,-39, 14,-30, -5,-19, 18,-29, -1, 19, 15,  4,-31,-26,  3,-38;
/M: SY='F'; M= 22,-48,-23,-13, 59, -7, -6,-33,-42,-10,-31,-42, 34,-42,-45,-23,-36,-25, 15, 19;
/M: SY='R'; M= -6,-49, 20, -4,-50, -7, 11,-46, -7,-28,-38, 23,-26, 23, 45, 12,-14,-23,-56,-39;
/M: SY='Q'; M=  1,-50, 30, 27,-25,-19,-31,-26,  1, -6,-35, 18,-42, 31, 14, -9,-32,-27,-54,-39;
/M: SY='L'; M=-11,-47, 16, -8, -7,-49, 37,-24,-24, 41,-19,-36,-49,  9,-24,-20, -9,-12,-47, 12;
/M: SY='Q'; M= 18,-48,-18, -3,-48, 12, 28,-31,-29,-33,-37, 26, 27, 33,-12,  1,-13,-31,-52,-11;
/M: SY='L'; M= -3,-46,-53,-47,  3,-33,-45, 30,-47, 44,-14,-48, 16,-44,-49,-15,-12,  5,-45, -5;
/M: SY='Q'; M= 15,-50, -8, 17,-51,-21,-34,-42, 25,-32, -3,-30,-21, 43, 20,  2,-22,-13,-52,-41;
/M: SY='P'; M=  1,-51,  6, 17,-50,-14,  9,-40,  6,-30,-38,-31, 35,  0, 16, 10,-20,  2,-56,-42;
/I:         I=-16; MD=-50;
/M: SY='G'; M=-33,-54,-14,-30, 16, 64,-44,-52, -3,-51,-46,  2,-49,-23, -9,-32,-42,-21,-49,-41; D=-16;
/I:         I=-16; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
/M: SY='Q'; M=-24,-54, 46, 41,-59,-22,-29,-55,  1,-52,-45,  2,-39, 54, -4,  5,-14,-51,-58,-43;
/M: SY='Q'; M=-10,-49,-32,  6,-36,-44, -8,-25, 15,-42,-35,  4,-20, 40, 35,-12, 31, -3,-55,-39;
/M: SY='V'; M=-27,-45,-58,-53,-21,-60,-50, 33,-51, 38,-12,-55,-55,-49,-51,-46,-32, 51,-48, 13;
/M: SY='Y'; M=-13,-53,-47,-45, 40,-12, -1,-17,-25,-23,-30,-25,-23,-20,  7,-38,-24,-17, 51, 74;
/M: SY='I'; M=  0,-46,-58,-51, 23,-56,-52, 44,-50, 23,-15,-52,-53,-22,-51,-43,-33, 42,-47,-28;
/M: SY='R'; M=-25,-52,-36, -7,-26, -2,-35, -8, 29,-42,-36,-30,-18, 41, 42, -3, -1, -9,-51,-39;
/M: SY='P'; M= -5,-59,-45,-34,-25,-18,-45,-38,-38, -8,-37,-47, 95,-18,-22,-37,-35,-19,-52,-49;
/M: SY='R'; M=-13,-52,-14,-24,-51,-32,-32,-50, 37,-35,-38,-28,-18, 21, 63, -9, 15,-45,-52,-40;
/M: SY='R'; M= -3,-51,-17, -1,-46,-43, 28,-44, 26,-28,-37, 21,-46, 18, 39,-12, -9,-15,-53, -7;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY

PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_07 which contains 555'100 sequence entries.

Total number of hits

65 in 65 different sequences

Number of true positive hits

65 in 65 different sequences

Number of 'unknown' hits

Number of false positive hits

Number of false negative sequences

Number of 'partial' sequences

Precision (true positives / (true positives + false positives))

100.00 %

Recall (true positives / (true positives + false negatives))

100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]

protein_domain

Scaling database [info]

window20

Author [info]

V_Lesaux

Taxonomic range [info]

Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)

Maximum number of repetitions [info]

Version [info]

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

65 sequences

CYSA1_AGRFC (Q8UH62    ), CYSA1_CHRVO (Q7NX01    ), CYSA1_RHIME (Q92XW1    ),

CYSA1_SHEON (Q8EBC3    ), CYSA2_AGRFC (Q8UA73    ), CYSA2_CHRVO (Q7NWX3    ), 
CYSA2_RHIME (Q92VJ2    ), CYSA2_SHEON (Q8E8K8    ), CYSA_ACIAD  (Q6F9A8    ), 
CYSA_ANTFO  (Q85A69    ), CYSA_BACC1  (O31339    ), CYSA_BACCR  (Q81GU1    ), 
CYSA_BACHD  (Q9K876    ), CYSA_BORBR  (Q7WGW1    ), CYSA_BORPA  (Q7W9U5    ), 
CYSA_BORPE  (Q7VZE5    ), CYSA_BRADU  (Q89UD2    ), CYSA_BRUME  (P63353    ), 
CYSA_BRUSU  (P63354    ), CYSA_BURMA  (Q62K82    ), CYSA_BURPS  (Q63TY1    ), 
CYSA_CAUCR  (Q9A7X1    ), CYSA_CUCSA  (Q9G4F5    ), CYSA_ECO57  (Q8XBJ8    ), 
CYSA_ECOL6  (Q8FFB3    ), CYSA_ECOLI  (P16676    ), CYSA_GLOVI  (Q7NIW1    ), 
CYSA_LEPIC  (Q72PE5    ), CYSA_LEPIN  (Q8F6Z1    ), CYSA_MANSM  (Q65T42    ), 
CYSA_MARPO  (P10091    ), CYSA_MESVI  (Q9MUN1    ), CYSA_METCA  (Q609Q1    ), 
CYSA_MYCBO  (P0A4W3    ), CYSA_MYCPA  (Q73XU8    ), CYSA_MYCTO  (P9WQM0    ), 
CYSA_MYCTU  (P9WQM1    ), CYSA_NEIMA  (Q9JUX4    ), CYSA_NEIMB  (Q9JZW0    ), 
CYSA_NEPOL  (Q9TKX3    ), CYSA_NITEU  (Q82WT5    ), CYSA_NOCFA  (Q5YZY9    ), 
CYSA_NOSS1  (Q8Z0H0    ), CYSA_PECAS  (Q6D201    ), CYSA_PHOLL  (Q7N6Z2    ), 
CYSA_PSEAE  (Q9I6L0    ), CYSA_PSEPK  (Q88CL2    ), CYSA_PSESM  (Q88AS5    ), 
CYSA_RALSO  (Q8XZP8    ), CYSA_RHILO  (Q98K23    ), CYSA_RHOPA  (Q6NBT1    ), 
CYSA_SALTI  (Q8Z4V6    ), CYSA_SALTY  (P40860    ), CYSA_SHIFL  (Q7UC29    ), 
CYSA_SYNE7  (P14788    ), CYSA_SYNY3  (P74548    ), CYSA_THEEB  (Q8DIA0    ), 
CYSA_VIBCH  (Q9KUI0    ), CYSA_VIBVU  (Q8D653    ), CYSA_XANAC  (Q8PNN4    ), 
CYSA_XANCP  (Q8PC11    ), CYSA_XYLFA  (Q9PDN2    ), CYSA_XYLFT  (Q87DT9    ), 
CYSA_YERPE  (Q8D0W8    ), CYSA_YERPS  (Q668K6    )

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences

2 sequences

CYSA_BURCE  (Q93DX8    ), CYSA_CHLVU  (P56344    )

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top