Entry: PS51243

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CCMA
Accession [info] PS51243
Entry type [info] MATRIX
Date [info] AUG-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info] Cytochrome C biogenesis export ATP-binding protein ccmA family profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=200;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=195;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3513448; R2=0.0145995; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=17997.43157; R2=40.87913; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=99999; N_SCORE=9999.0; H_SCORE=151427; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=3264; N_SCORE=50.0; H_SCORE=151427; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=285; N_SCORE=6.5; H_SCORE=29607; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-17, -5,  0,-16,-14,-11,-11, -6, -7, -4, -4,-13, -1, -8,  7,  7, -7,-28,-13, -1;
/M: SY='A'; M= 15,-19,-17,-25,-19, -8,-13,-23,  9,-19,  7,  2,-17,-19,-17,-21, -5, -1, 12,-22,-12,-19;
/M: SY='H'; M=-10, -2,-27, -1,  5,-22,-19, 20,-19,  5,-15, -5,  1,-15,  9,  8, -6,-10,-18,-26, -4,  5;
/M: SY='B'; M=-11, 18,-28, 18, 10,-31, -2,  0,-29,  9,-27,-17, 18,-14, 11,  6,  0, -9,-28,-29,-18, 10;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23,  7,-31,-23, 24,-28, 41, 18,-29,-29,-22,-21,-26, -8, 18,-22, -2,-23;
/M: SY='A'; M= 14, -1,-16, -6, -1,-20,-11,-14,-11, -8,-14,-10, -2,-10,  0,-12, 13, 11, -6,-27,-15, -1;
/M: SY='C'; M= -6,-21, 35,-29,-27,  4,-13,-25,-13,-26, -9,-10,-17,-30,-29,-25,-10,-10, -3,-26,-12,-27;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='V'; M= -5, -9,-19,-10, -6,-13,-19,-12,  4, -9, -5,  3, -7,-15, -2, -7,  0, -2,  5,-25, -9, -6; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='R'; M=-18,-10,-27,-10, -1,-15,-19,  1,-25, 24,-17, -8, -1,-19,  8, 58,-10, -9,-17,-15, -3, -1; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='G'; M= -4,  4,-24,  3, -5,-24, 30, -2,-30,-11,-26,-17, 12,-15, -8,-11,  5,-10,-25,-25,-20, -7; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -4, 10,-25, 15, 21,-25,  0, -5,-27, -1,-21,-19,  6, -9,  3, -7,  0,-10,-25,-18,-17, 12; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='R'; M=-14,  2,-29,  3,  9,-25,-19,  4,-25, 19,-19, -9,  4,-15, 15, 28, -7,-10,-22,-24,-10, 10;
/M:         M= -6,-11,-25,-13, -5,-15,-22,-13, -1, -7, -4, -2, -7, -4, -3, -4, -7, -3, -5,-25,-12, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-33,-25,  5,-33,-25, 30,-28, 34, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 23,-22, -2,-25;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-20,-38,-28, 64,-30,-20,  5,-30, 19,  5,-22,-30,-35,-20,-22,-10,  2,  3, 23,-28;
/M: SY='D'; M= -5, 13,-24, 16, 12,-29, -7, -3,-26,  1,-23,-17,  9,-11, 10,  1,  7, -1,-22,-30,-17, 11;
/M: SY='H'; M=-12,  8,-28,  9,  5,-26, -4, 11,-25, -2,-19,-11,  9, -9,  5, -4, -4,-11,-25,-29,-12,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-23,-21,-28,-23,  8,-29,-21, 23,-26, 26, 13,-18,-27,-21,-20,-20, -7, 16,-21, -1,-23;
/M: SY='N'; M= -5, 20,-20, 18,  2,-23, -8, -5,-18, -7,-24,-18, 22,-13, -3, -9, 15,  6,-16,-37,-17, -1;
/M: SY='F'; M=-16,-27,-18,-36,-27, 59,-29,-21,  3,-27, 11,  1,-20,-28,-35,-19,-16, -3,  5,  1, 21,-27;
/M: SY='S'; M= -1, -5,-19, -5,  5,-10,-14,  3,-17, -6,-17,-11,  0,-14, -2, -4, 10,  3,-10,-28, -8,  1;
/M: SY='L'; M= -5,-29,-22,-31,-22,  5,-28,-23, 20,-27, 32, 14,-28,-27,-20,-21,-24,-10, 14, -9,  0,-22;
/M: SY='N'; M= -2,  1,-24,  0,  0,-22,-10, -1,-16, -5,-19,-13,  5,  1, -5, -6, -1, -7,-14,-30,-17, -4;
/M: SY='A'; M= 22, -3,-17, -4, -2,-24, -5,-15,-18, -4,-21,-15, -3,  2, -5,-12, 12,  2,-10,-28,-20, -4;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-28, -9,-18,-29, 63,-19,-38,-19,-30,-20,  1,-19,-18,-19,  4,-16,-28,-22,-29,-18;
/M: SY='E'; M= -9,  9,-28, 16, 22,-27, -4,  0,-25, -4,-20,-17,  3, -9,  4, -9,  1, -9,-22,-30,-17, 12;
/M: SY='A'; M= 16,-17, -6,-25,-17, -3,-16,-20,  1,-18,  7,  2,-16,-19,-16,-20, -5,  0,  4,-21, -9,-16;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L'; M= -4,-25,-15,-27,-20, 11,-24,-19, 16,-23, 27, 14,-24,-25,-20,-18,-19, -6, 16,-17, -1,-20; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V'; M= -4,-16,-20,-19,-12, -4,-24, -5,  4,-13, -1,  3,-13,-20, -3,-12, -5, -1,  5,-19,  3, -8;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-20,-34,-27,  3,-34,-27, 35,-27, 26, 17,-26,-26,-23,-24,-20, -7, 31,-23, -3,-27;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-23, -4,  6,-22,-16, -3,-17,  7,-17, -7, -3,-13,  8,  5,  1,  1,-10,-26,-11,  6;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -3, -5,-26, -2,  3,-24,-14, -4,-22, -2,-24,-16, -4, 19, -1, -1,  4,  0,-20,-30,-18, -2;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 19,-10,  0,-15,-11,-17, -9,-18, -8,-15,-15,-11, -4,-14, -9,-18, 16,  6, -1,-31,-18,-11;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-30,  0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10,  0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='T'; M=  3,  0,-10, -7, -7,-13,-15,-17,-13,-10,-15,-13,  3,-10, -7,-10, 25, 42, -3,-33,-13, -7;
/M: SY='T'; M=  5,  0,-10, -5, -5,-15,-10,-15,-15,-10,-20,-15,  5,-10, -5,-10, 30, 36, -5,-35,-15, -5;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-31,-21, 16,-30,-20, 18,-30, 47, 18,-29,-30,-22,-20,-29,-10,  9,-17,  3,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 33,-22,-10,  0,-18, 10, 63,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='I'; M= -3,-23,-19,-29,-22,  0,-27,-20, 22,-21, 20, 20,-20,-22,-16,-19,-14,  0, 18,-23, -4,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-23,-33,-24,  6,-33,-24, 31,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24;
/M: SY='A'; M= 39,-11, -4,-20,-12,-19, -5,-20, -8,-13,-10, -9, -9,-12,-11,-20, 10,  1,  1,-23,-19,-12;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-32,-22, 20,-31,-21, 20,-30, 41, 17,-28,-29,-23,-21,-28,-10, 10,-15,  5,-22;
/M: SY='L'; M=  2,-18,-17,-20,-12, -5,-18,-13,  5,-17, 16, 12,-16,-20, -6,-14, -7, -3,  2,-24, -7, -9;
/M: SY='Q'; M=-11, -5,-29, -5,  6,-24,-21,  0,-16,  5,-16, -6, -1,  2, 13,  7, -6, -6,-19,-25,-12,  7;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-36,-10,  1,-29,-21,-18,-18, -4,-27,-16,-17, 66, -4,-13, -9, -9,-24,-28,-25, -6;
/M: SY='S'; M=  7, -1,-19, -1,  8,-17,-11, -8,-17, -4,-15,-13, -2,-11,  0, -5, 10,  3,-12,-26,-11,  4;
/M: SY='A'; M= 16, -3,-20, -5,  1,-26,  4,-12,-22, -1,-20,-13, -2,-11,  1, -5,  7, -5,-15,-24,-19,  1;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-12,  5,-27,  9, 22,-27,-18,  9,-27,  8,-21,-13,  4,-10, 19, 14,  1, -4,-24,-28,-12, 19;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-22,-33,-27, -1,-35,-29, 36,-25, 13, 13,-20,-21,-21,-25,-12,  1, 32,-24, -4,-27;
/M: SY='L'; M= -4,-20,-22,-24,-16, 10,-23,-11,  4,-16, 11,  4,-17,-23,-11,-10,-12, -6,  0,-10, 11,-14;
/M: SY='W'; M=-16,-30,-31,-34,-26, 21,-28,-17,  8,-23, 10,  6,-28,-28,-20,-19,-28,-16, -3, 39, 25,-22;
/M: SY='N'; M=-11, 16,-26, 16, 13,-25, -9, -2,-24,  5,-24,-18, 18, -7,  2,  4,  0, -7,-23,-32,-19,  7;
/M: SY='G'; M= -8, 11,-28,  9, -6,-28, 28, -8,-33, -8,-29,-21, 17,-11, -9, -7,  1,-12,-29,-29,-25, -9;
/M: SY='K'; M= -5, -2,-12, -5,  0,-23, -6, -3,-22,  2,-20,-12,  2,-16, -3,  0, -3, -7,-17,-27,-15, -2;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='D'; M=-11, 12,-27, 16,  1,-18, -6, -8,-24, -8,-24,-20,  9, 13, -8,-12,  0, -6,-24,-29,-17, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='I'; M= -6,-22,-23,-28,-22, -2,-23,-23, 28,-24, 14, 12,-15,-18,-16,-23,-13, -7, 16,-19, -4,-22; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -2,  3,-19, -1, -1,-20, -3, -6,-19,  3,-21,-12,  9, -5,  3,  5,  7,  3,-17,-25,-15,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-19, -2,  6,-12,-14, -5,-14,  5,-14, -9,  5,-12,  3,  4,  0, -1,-12,-21, -9,  5; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='Q'; M= -3, -1,-12, -1,  8,-20,-16, -7,-11, -2,-11, -6, -3,-11,  9, -5, -1, -5,-11,-23,-12,  8; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='R'; M=  1,-10,-20,-11, -3,-13,  0,-10,-17,  0,-10, -8, -6,-14, -3,  8, -6, -9,-13, -5,-10, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='D'; M= -8,  5,-11,  6,  3,-21, -9, -1,-18, -1,-15,-10,  4,-15,  2, -4, -1, -6,-15,-27,-13,  2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='T'; M= -5,  2,-18,  2,  5,-12,-17, -6,-12, -5, -6, -7, -3,-11,  1, -7,  1,  9,-10,-19, -2,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Y'; M=-11,-19,-24,-20,-16, 17,-24,  9,  0,-13,  8,  3,-17,-25,-11, -7,-17, -9, -6,  5, 36,-16; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Q'; M= -5, -2,-24, -2,  5,-24,-13, -4,-19, 12,-21, -9,  1,  4, 14, 12, -1, -5,-19,-21,-13,  8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='R'; M= -7,  2,-22,  6,  8,-16,-14, -3,-18,  6,-11,-10, -1,-12,  2, 10, -4, -6,-14,-18, -5,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-20,  8, 16,-19,-14, -3,-17,  0,-15,-10,  0, -9, 13, -3,  2, -4,-15,-22,-11, 15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='L'; M= -9,-25,  5,-28,-20,  3,-27,-18, 10,-26, 31, 17,-25,-28,-18,-19,-23, -9,  6,-24, -5,-19; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='H'; M= -3,-10, -9,-16,-13, -2,-20,  7, -8,-17,  0, -2, -5,-22,-12,-13, -6,  0, -5,-25, -1,-13;
/M: SY='Y'; M=-19,-23,-31,-25,-22, 29,-28,  9, -1,-13, -1,  2,-23,-29,-13,-12,-23,-13,-11, 41, 64,-20;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-21,-28,-21,  2,-27,-19, 23,-24, 28, 18,-19,-25,-17,-20,-20, -8, 14,-22, -3,-20;
/M: SY='G'; M=  2, -4,-27, -2,-14,-29, 52,-17,-36,-17,-29,-20,  2,-18,-16,-18,  4,-14,-26,-24,-28,-15;
/M: SY='H'; M=-16, -3,-27, -3, -2,-17,-19, 79,-25,-12,-15,  0,  7,-20,  6, -3, -7,-15,-25,-30, 15, -2;
/M: SY='R'; M= -4, -6,-23,-10, -5,-17,-12, -1,-16,  2, -8, -5,  0,-18,  1, 10, -5, -4,-13,-24,-10, -3;
/M: SY='D'; M= -3,  8,-25, 12,  0,-24, -8,-11,-17,-10,-17,-15,  3,  2, -7,-15,  2, -4,-16,-32,-19, -5;
/M: SY='G'; M= 12, -9,-24,-11,-16,-27, 47,-19,-31,-17,-25,-18, -1,-17,-16,-19,  6,-12,-21,-22,-27,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-25, 12,-33,-23, 29,-28, 32, 20,-25,-26,-21,-23,-24, -9, 18,-18,  2,-24;
/M: SY='K'; M=-10,  3,-29,  1,  9,-29,-19, -9,-29, 46,-30,-11,  4,-11,  9, 28, -9, -9,-21,-21,-11,  9;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-25,  7, 15,-27,-12, -9,-24, -1,-24,-19, -1, 13,  2, -5,  8, -2,-21,-31,-21,  7;
/M: SY='E'; M= -8, 12,-25, 19, 20,-23,-16, -3,-25,  1,-17,-17,  3,-10,  4, -1,  1, -3,-20,-27,-10, 11;
/M: SY='L'; M=-12,-28,-22,-30,-20, 12,-29,-18, 18,-24, 36, 20,-25,-27,-18,-14,-26,-10,  9,-17,  2,-19;
/M: SY='T'; M=  1,  3,-11, -6, -7,-13,-15,-16,-13, -9,-15,-13,  6,-11, -7, -9, 23, 41, -4,-33,-13, -7;
/M: SY='V'; M= 17,-21,-12,-25,-20, -6,-18,-24, 11,-17,  8,  3,-21,-21,-20,-19, -4,  1, 21,-25,-12,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-20,-27,-20, -4,  2,-24,-15, -5,-11,  7, -2,-19,-21,-10, -4,-19,-12, -8,  5,  1, -7;
/M: SY='E'; M=-12, 20,-30, 32, 50,-32,-18,  0,-32,  8,-22,-22,  5, -2, 15, -2,  0,-10,-30,-32,-20, 33;
/M: SY='N'; M=-11, 32,-22, 16,  2,-16, -4, 10,-19,  0,-26,-18, 48,-20,  0, -1,  6, -2,-28,-33,-11,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-29, -9,-30,-22,  7,-30,-22, 17,-29, 42, 16,-29,-31,-22,-21,-27, -9, 12,-23, -3,-22;
/M: SY='R'; M= -9, -6,-24, -9, -2,-18,-21, -2,-10,  4, -9, -2, -1,-16,  7,  8, -4,  0,-11,-25, -7,  1;
/M: SY='F'; M=-15,-28,-26,-35,-27, 51,-27,-15, -1,-24,  4, -2,-22,-28,-29,-19,-21,-12, -4, 29, 33,-26;
/M: SY='W'; M=-11,-18,-33,-20,-16,  5,-18,-15,-13,-15, -9,-11,-18,-24,-11,-15,-19,-15,-18, 51, 15,-11;
/M: SY='A'; M=  5, -5,  4,-11, -3,-20,-16,-13,-12,-10,-12, -9, -2,-17,  0,-13,  3,  0,-10,-30,-17, -2;
/M: SY='A'; M=  3, -4,-22, -5,  1,-19,-10, -3,-16, -4, -7, -7, -5,-15,  1, -1, -3, -3,-12,-24,-12,  0;
/M: SY='L'; M=-13,-30,-25,-36,-26, 22,-32,-22, 22,-28, 25, 16,-25,-26,-23,-22,-25,-11, 11, -1,  9,-24;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='H'; M= -2, -9,-17,-11, -9, -1,-15, 15, -6,-11,  0,  0, -7,-16, -5, -9, -4, -2, -7,-10, 14, -9; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='G'; M=  5,  3,-15, -2, -8,-17, 24, -8,-19, -8,-17,-12, 10,-12, -8,-10,  3, -7,-16,-17,-17, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='G'; M= -3, -1,  0,  0, -3,-20, 14,-10,-23, -9,-18,-13,  0,-13, -5,-11,  1, -8,-17,-21,-17, -4; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-20,  5, 16,-20, -5, -4,-20,  1,-19,-15,  5,  5,  4, -1,  5, -3,-19,-24,-16,  9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='I'; M= -4,-10,-18,-13,-10, -6,-16,-10,  4, -9, -1, -1, -7,  1, -8, -7, -8, -5,  0,-14, -3,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='G'; M=  2,  6,-18,  6, -2,-22, 11, -9,-23, -4,-23,-16,  8,-11, -5, -7, 11,  2,-16,-26,-18, -4; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-24, -4,  5,-17,-12, -9,-16,  1,-14,-10, -4,-13, -1,  0, -1, -1,-12,-20, -6,  0;
/M: SY='D'; M= -4,  7,-24, 13, 11,-20, -8, -9,-20, -6,-14,-14,  0,-13, -1,-11,  0, -7,-15,-28,-15,  5;
/M: SY='S'; M= -5,  0,-14,  0, -5,-19, -5, -9,-21, -1,-19,-10, -2,-16, -3, -6,  1,  1,-15,-23, -8, -4;
/M: SY='V'; M= 10,-22,-18,-28,-20, -7,-23,-25, 18,-20,  6,  5,-19,-13,-18,-22, -7, -1, 19,-24,-10,-21;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R'; M= -8,-11,-27,-10, -1,-13,-14,  0,-18, -2,-16,-10, -8,-18,  2,  4, -5, -6,-16,  1,  2,  0;
/M: SY='A'; M= 11,  0,-19,  0, 11,-24,-11,-11,-19, -4,-18,-15, -2,  1,  3,-10, 10,  6,-14,-28,-19,  7;
/M: SY='A'; M= 32,-12,-12,-19,-12,-15, -7,-20, -3,-13, -6, -6,-10,-13,-11,-19,  9,  2,  5,-24,-17,-12;
/M: SY='L'; M= -1,-26,-10,-30,-20,  3,-27,-22, 15,-27, 33, 13,-25,-27,-19,-22,-22, -9,  9,-22, -5,-20;
/M: SY='E'; M=  3, -1,-24,  0, 13,-17,-10,  2,-22, -2,-16,-12, -2,-11,  4, -3, -1, -9,-18,-22,-11,  8;
/M: SY='Q'; M= -3,-10,-23,-13, -2,-12,-21, -8, -7, -1, -3, -2, -9,-16,  4,  3, -6,  0, -8,-17, -1,  0;
/M: SY='V'; M= -8,-28,-16,-33,-28, 20,-29,-22, 21,-22, 16, 17,-26,-28,-26,-19,-16, -5, 27,-17,  3,-26;
/M: SY='G'; M= -3,  3,-27,  1,-10,-29, 41,-13,-35, -8,-30,-20, 10,-18,-12,-11,  3,-13,-28,-25,-25,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='A'; M=  6,  0,-20, -1,  0,-21, -3,  1,-21, -5,-16,-12,  3,-14, -2, -2,  5, -4,-15,-28,-14, -2;
/M: SY='H'; M= -8,  4,-29,  7,  1,-27, 10, 16,-33, -4,-24,-15,  5,-16, -1,  2, -3,-15,-26,-26,-12, -2;
/M: SY='L'; M= -9,-23,-23,-26,-17, 11,-27, -8,  7,-18, 22,  9,-20,-26,-15, -7,-21,-10,  2,-14,  7,-17;
/M: SY='E'; M= -9, -9,-25, -7, 13,-15,-25,-11, -3, -5,  1, -2,-10,-13,  4, -5, -8, -5, -5,-25,-11,  8;
/M: SY='D'; M=-17, 25,-29, 31, 12,-29,-14, 28,-31,  2,-24,-13, 16,-14,  5, -2, -4,-12,-27,-34, -7,  7;
/M: SY='L'; M= -3,-16,-23,-17, -6, -7,-24,-13,  0, -3,  9,  3,-16,-20, -7, -3,-15, -8,  0,-18, -2, -8;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-32, -8,  4,-24,-20,-16,-18,  5,-18,-12,-14, 34, -4, -5,-10, -9,-20,-25,-19, -2;
/M: SY='C'; M= 11,-19, 15,-26,-21, -2,-18,-24, -3,-20, -6, -6,-15,-23,-21,-22, -1, -3,  6,-25,-12,-21;
/M: SY='R'; M=  2,-10,-24,-12, -8,-17,  4, -2,-24,  1,-19,-12, -3,-18, -3, 13,  0, -8,-16,-18, -7, -8;
/M: SY='M'; M= -7,-11,-20,-15, -8, -4,-19,  0, -5, -8, -4,  6, -7,-18,  1, -3,  0,  4, -5,-20,  2, -4;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='A'; M= 25,-10,-14,-16, -7,-18, -7,-13, -8, -9, -6, -2, -8,-13,  0,-14,  8,  0, -3,-23,-15, -3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-29, -3, 16,-36,-20,  9,-16,  8,-16,  6, -2,-11, 54,  8, -2,-10,-26,-20, -9, 35;
/M: SY='R'; M=-14, -3,-30, -3,  9,-29,-20,  6,-27, 28,-23, -6,  1,-14, 25, 36, -7,-11,-24,-21, -8, 15;
/M: SY='R'; M=-17, -7,-30, -7,  3,-23,-20, -3,-30, 37,-23,-10,  0,-17, 10, 56,-10,-10,-20,-20,-10,  3;
/M: SY='R'; M=-18,-11,-30,-12, -1,-19,-22, -2,-22, 23,-16, -6, -2,-19, 11, 56,-10,-10,-16,-20, -9,  0;
/M: SY='L'; M= -3,-26,-17,-29,-22,  3,-27,-22, 21,-23, 27, 16,-25,-26,-20,-19,-17, -3, 21,-23, -5,-21;
/M: SY='A'; M= 30,-10,-14,-16, -8,-20,  0,-16,-11,-11, -9, -8, -8,-13, -4,-16,  9,  0, -5,-23,-18, -6;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-22,-32,-22,  7,-31,-20, 26,-29, 42, 23,-27,-27,-19,-21,-27,-10, 14,-20,  0,-21;
/M: SY='A'; M= 42,-10,-11,-19,-10,-18, -2,-19, -9,-11, -8, -9,-10,-11,-10,-19, 10,  1,  0,-22,-19,-10;
/M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8,  2,-22,-20, -2,-30, 33,-22,-10,  0,-18, 10, 63,-10,-10,-20,-20,-10,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='W'; M= -9,-30,-30,-32,-23,  5,-26,-18, 10,-25, 18,  6,-28,-26,-18,-21,-27,-15,  0, 25,  8,-20;
/M: SY='L'; M=  7,-20,-15,-24,-17, -4,-20,-13,  9,-19, 16, 10,-20,-22,-15,-17,-10, -2, 12,-23, -7,-17;
/M: SY='T'; M=  5, -7, -1,-13,-12,-11,-15,-15, -7,-14,-13,-10, -2,-17,-11,-15, 13, 14,  0,-29,-10,-12;
/M: SY='R'; M=-13,  3,-22,  4,  1,-21,-12, -7,-27,  7,-24,-15,  3, -3,  2, 10, -6,-10,-23,-25,-15,  0;
/M: SY='R'; M=  0, -9,-14,-11, -4,-21,-15,-10,-23, 12,-20,-12, -3,-11,  0, 25,  1, -2,-14,-25,-15, -4;
/M: SY='P'; M=-10, -5,-33,  2,  6,-31,-18,-12,-24,  8,-29,-17, -7, 39,  3, -3, -5, -8,-26,-28,-21,  2;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24,  6,-33,-24, 30,-29, 38, 19,-27,-27,-21,-23,-26, -9, 19,-21, -1,-24;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-23,-34,-25,  5,-34,-25, 33,-29, 35, 19,-26,-26,-21,-24,-25, -9, 21,-21, -1,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='P'; M= -9,-21,-37,-12, -3,-27,-21,-21,-15,-11,-26,-17,-21, 78,-12,-20,-10, -9,-22,-30,-28,-12;
/M: SY='F'; M= -7,-14,-18,-18, -9, 11,-22,-13, -2,-16,  6,  2,-11,-19,-13,-13, -3,  7, -2,-17,  3,-10;
/M: SY='T'; M=  9,-12,-12,-19,-16, -9,-20,-23,  5,-14, -3, -3,-11,-15,-15,-16,  7, 23, 14,-27,-11,-16;
/M: SY='A'; M= 29, -2,-16,-11, -8,-22,  5,-15,-16, -9,-18,-14,  3, -5, -9,-16, 10, -1,-10,-25,-22, -9;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='D'; M=-17, 45,-28, 63, 18,-38, -9, -1,-38, -1,-30,-29, 19,-10,  0,-10,  4, -7,-28,-40,-20,  9;
/M: SY='K'; M= -1, -4,-23, -3,  3,-21,-19,-12,-13, 12,-10, -5, -8,-15,  1,  3, -8, -7, -6,-24,-12,  2;
/M: SY='E'; M=  0, -4,-23, -4,  5,-11,-10,  1,-18, -6,-11,-10, -5,-15,  0, -5, -2, -7,-15,-19, -3,  1;
/M: SY='G'; M=  4, -6,-26, -9,-12,-23, 30,-14,-28,-13,-26,-17,  2,-18, -8,-15,  4,-10,-23, -9,-19,-10;
/M: SY='V'; M= -5,-17,-20,-18,-16,-10,-26,-19, 11,-10,  3,  4,-16,-23,-11, -4,-10, -5, 17,-25, -9,-15;
/M: SY='R'; M=  5, -2,-22, -3,  6,-22,-14, -9,-19,  8,-13,-10, -4,-12,  5, 11, -1, -3,-13,-23,-14,  4;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-22,-25,-14, -1,-26,-18, 11,-20, 21, 12,-22,-23,-11,-17,-18, -6,  6,-11, -3,-13;
/M: SY='F'; M=-13,-30,-21,-35,-26, 35,-31,-22, 17,-29, 29, 12,-25,-29,-28,-21,-24, -9, 11, -9, 11,-26;
/M: SY='N'; M=  3,  3,-22, -1,  4,-22,  5,-10,-20, -5,-20,-14,  8,-12, -3, -9,  6, -2,-17,-28,-19,  0;
/M: SY='N'; M= -1, -1,-23, -5,  1,-19,  2, -6,-22, -2,-18,-13,  3,-15,  0,  1,  2,  0,-18,-21,-10, -1;
/M: SY='L'; M= -6,-24,-22,-28,-19,  0,-28,-15, 20,-20, 25, 17,-21,-24,-15,-17,-20, -9, 13,-21, -2,-19;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-35,-27, 13,-32,-22, 30,-26, 23, 22,-23,-25,-21,-22,-21, -9, 22,-17,  3,-25;
/M: SY='A'; M=  7,-11,-20,-13,  0,-17,-16, -6, -8, -4, -6, -4, -8,-15,  0, -1, -2, -5, -4,-24,-11, -2;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-24,  1, 14,-25,-14, -1,-20,  9,-16, -6, -2,-10,  9,  3, -2, -8,-16,-24,-13, 11;
/M: SY='H'; M=-18,  2,-29,  1,  1,-21,-19, 84,-29, -4,-22, -2, 12,-19,  9,  3, -9,-18,-29,-30, 15,  1;
/M: SY='L'; M=  3,-19,  1,-23,-14,-10,-21,-17, -4,-13,  8,  1,-17,-24,-10, -5,-11, -7,  0,-25,-12,-13;
/M: SY='A'; M= 10,  7,-20,  4,  3,-24, -9,-10,-22,  7,-21,-15,  6,-11, -1,  0,  6,  1,-14,-27,-17,  1;
/M: SY='R'; M= -6, -3,-26, -5,  1,-26, -3, -5,-27, 17,-24,-12,  4,-15,  9, 24,  0, -7,-21,-23,-15,  4;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='I'; M=  3,-22,-13,-31,-22, -5,-26,-21, 22,-21, 12, 18,-18,-19,-14,-22,-12, -5, 15,-22, -6,-20;
/M: SY='V'; M=  4,-27,-15,-31,-27, -3,-28,-29, 29,-21, 10, 10,-25,-25,-25,-22,-10, -2, 39,-26, -9,-27;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-23,-34,-26,  4,-34,-26, 35,-28, 29, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='L'; M=  4,-23,-16,-29,-20,  5,-21,-17, 14,-20, 22, 19,-23,-23,-16,-18,-15, -6, 13,-19, -4,-18;
/M: SY='T'; M= 18, -3,-10,-10, -7,-16, -9,-17,-13,-10,-15,-13,  0,-10, -7,-13, 22, 27, -3,-30,-16, -7;
/M: SY='T'; M=  3, -2,-10, -8, -8,-12,-15,-18,-10,-11,-15,-12,  1,-11, -8,-11, 24, 37,  1,-33,-13, -8;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='Q'; M=-10, -6,-26, -7,  0,-21,-17,  0, -7, -7, -2,  5, -6,-16, 17, -5, -7, -6,-13,-23, -7,  8;
/M: SY='D'; M= -5, 15,-29, 25, 18,-31,-14, -8,-28, -2,-24,-22,  1, 15,  0,-11,  0, -6,-24,-32,-22,  8;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-20,-27,-20,  6,-27,-17, 18,-25, 32, 17,-24,-27,-17,-19,-20, -6, 11,-20,  2,-19;
/M: SY='G'; M=  2,  0,-25,  0, -2,-27, 12,-12,-24, -9,-24,-17,  3,  0, -5,-13,  4, -7,-20,-28,-23, -4;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='I'; M= -5,-25,-22,-31,-22,  5,-29,-22, 27,-25, 19, 15,-18,-20,-17,-23,-15, -7, 16,-18,  0,-22; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-17,  1,  5,-18,-12, -9,-14, 12,-16, -9, -2, -9,  1,  4,  1, -2, -6,-21,-11,  3; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='D'; M= -8,  9,-25, 14,  8,-27,-10, -8,-28,  8,-26,-18,  5, -4,  1,  6,  6,  2,-20,-31,-17,  4;
/M: SY='A'; M= 13,-14,-16,-17,-12, -8,-15,-14, -3, -8, -3, -4,-12,-18,-11,-12,  1,  2,  3,-19, -2,-12;
/M: SY='R'; M=-15, -1,-28, -2, 10,-23,-18,  8,-23, 15,-18, -4,  4,-15, 18, 33, -6,-10,-22,-24,-10, 11;
/M: SY='M'; M= -7,-10,-22,-13, -1,-11,-24, -8,  3, -8,  0,  6, -9,-15, -4,-10, -4,  2,  2,-26, -7, -3;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-20,-26,-16, 12,-29,-18, 14,-23, 26, 10,-23,-26,-19,-18,-19, -4, 11,-16,  5,-18;
/M: SY='R'; M=-13,  0,-26, -1,  0,-18,-12,  2,-21,  6,-14, -9,  5,-19,  0, 21, -5, -6,-16,-26,-11, -2;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-23,-33,-24, 13,-32,-19, 26,-27, 31, 19,-25,-27,-20,-21,-24, -9, 16,-15,  7,-23;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 127 in 127 different sequences
Number of true positive hits 127 in 127 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] V_Lesaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
127 sequences

AB1I_ARATH  (Q9C8T1), CCMA1_RALME (Q1LKR4), CCMA1_SALCH (Q57M97), 
CCMA1_SALPA (Q5PI55), CCMA1_SALTY (Q8ZKZ9), CCMA2_RALME (Q1LFZ8), 
CCMA2_SALPA (Q5PKT6), CCMA2_SALTY (P61378), CCMAE_SALCH (Q57I19), 
CCMA_AGRT5  (Q8UC12), CCMA_ALBFT  (Q21QL9), CCMA_ALCBS  (Q0VR80), 
CCMA_ALKEH  (Q0A808), CCMA_ANAMM  (Q5PBP5), CCMA_AROAE  (Q5P3L0), 
CCMA_BARHE  (Q6G529), CCMA_BARQU  (Q6G0V9), CCMA_BORBR  (Q7WIP8), 
CCMA_BORPA  (Q7W736), CCMA_BRADU  (P30963), CCMA_BRUA2  (Q2YNU0), 
CCMA_BRUAB  (Q57FS7), CCMA_BRUME  (Q8YEM5), CCMA_BRUSU  (Q8G358), 
CCMA_BURXL  (Q13I12), CCMA_CAUCR  (Q9A298), CCMA_CHESB  (Q11CZ6), 
CCMA_COLP3  (Q487I2), CCMA_CUPNH  (Q7WXC1), CCMA_CUPPJ  (Q46RX0), 
CCMA_DECAR  (Q478L3), CCMA_ECO57  (Q8XE58), CCMA_ECOL5  (Q0TFP1), 
CCMA_ECOL6  (Q8FFR2), CCMA_ECOLI  (P33931), CCMA_ECOUT  (Q1R9L8), 
CCMA_GLUOX  (Q5FQN4), CCMA_GRABC  (Q0BV49), CCMA_HAEDU  (Q7VN12), 
CCMA_HAEI8  (Q4QLJ9), CCMA_HAEIN  (P45032), CCMA_HAHCH  (Q2SE49), 
CCMA_HISS1  (Q0I2G0), CCMA_HYPNA  (Q0BWF7), CCMA_IDILO  (Q5QZP7), 
CCMA_JANSC  (Q28NZ8), CCMA_LEGPA  (Q5X6P7), CCMA_LEGPH  (Q5ZX76), 
CCMA_LEGPL  (Q5WY52), CCMA_LEGPN  (Q8RPP4), CCMA_MAGSA  (Q2VZJ1), 
CCMA_MANSM  (Q65V02), CCMA_MARMM  (Q0AKQ2), CCMA_METCA  (Q60AB3), 
CCMA_NITEU  (Q82WC8), CCMA_NITHX  (Q1QR47), CCMA_NITMU  (Q2Y9Q1), 
CCMA_NITOC  (Q3JCI7), CCMA_NITWN  (Q3SVV2), CCMA_NOVAD  (Q2G9A9), 
CCMA_PANCI  (Q9Z651), CCMA_PARDP  (P52218), CCMA_PASMU  (Q9CPN2), 
CCMA_PECAS  (Q6D606), CCMA_PHOPR  (Q6LTL7), CCMA_PSE14  (Q48GL0), 
CCMA_PSEAE  (Q9I3N7), CCMA_PSEAI  (Q8GQ92), CCMA_PSEF5  (Q4KG27), 
CCMA_PSEPF  (Q3KFY6), CCMA_PSEPG  (P95487), CCMA_PSEPK  (Q88EX5), 
CCMA_PSESM  (Q87Z03), CCMA_PSEU2  (Q4ZQZ7), CCMA_RECAM  (O21280), 
CCMA_RHIEC  (Q2K396), CCMA_RHIET  (Q52733), CCMA_RHIL3  (Q1MAL7), 
CCMA_RHILO  (Q98EA4), CCMA_RHIME  (Q92L55), CCMA_RHOCB  (P29959), 
CCMA_RHOP2  (Q2J3F7), CCMA_RHOPA  (Q6NDA6), CCMA_RHOPB  (Q21CV6), 
CCMA_RHOPS  (Q13DS7), CCMA_RHORT  (Q2RYF0), CCMA_RHOS4  (O33570), 
CCMA_RICBR  (Q1RKE4), CCMA_RICCN  (Q92G95), CCMA_RICFE  (Q4UK25), 
CCMA_RICPR  (Q9ZCF9), CCMA_RICTY  (Q68VV5), CCMA_ROSDO  (Q166I9), 
CCMA_RUEPO  (Q5LR15), CCMA_RUEST  (Q1GHY4), CCMA_SACD2  (Q21JK3), 
CCMA_SALTI  (P61377), CCMA_SHEDO  (Q12I82), CCMA_SHEFN  (Q089M3), 
CCMA_SHEON  (Q8EK40), CCMA_SHESM  (Q0HNQ5), CCMA_SHESR  (Q0I074), 
CCMA_SHIBS  (Q31Z24), CCMA_SHIDS  (Q32I01), CCMA_SHIFL  (Q83KD5), 
CCMA_SHISS  (Q3Z006), CCMA_SODGM  (Q2NSG3), CCMA_SPHAL  (Q1GS38), 
CCMA_VIBCH  (Q9KQE3), CCMA_VIBF1  (Q5E3S7), CCMA_VIBPA  (Q87MK8), 
CCMA_VIBVU  (Q8DB62), CCMA_VIBVY  (Q7MIR0), CCMA_WOLPM  (Q73HX8), 
CCMA_XANAC  (Q8PK53), CCMA_XANC5  (Q3BSL0), CCMA_XANC8  (Q4UVG2), 
CCMA_XANCP  (Q8P8M1), CCMA_XANOM  (Q2P3U8), CCMA_XANOR  (Q5H0W2), 
CCMA_XYLFA  (Q9PAP0), CCMA_XYLFT  (Q87BH8), CCMA_YERPA  (Q1C647), 
CCMA_YERPE  (Q8ZD58), CCMA_YERPN  (Q1CHI9), CCMA_YERPS  (Q668T8), 
CCMA_ZYMMO  (Q5NQX0)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission