Entry: PS51258

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MHD1
Accession [info] PS51258
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51258
Associated ProRule [info] PRU00587

Name and characterization of the entry

Description [info] Munc13-homology domain 1 (MHD1) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=134;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9424201; R2=0.0063137; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4573.90551; R2=32.90866; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1118; N_SCORE=9.0; H_SCORE=36133; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=722; N_SCORE=6.5; H_SCORE=28334; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='F'; M=-10,-45,-12,-30, 59,-51,-43,  7,-14,  5,  1,-11,-20,  5,-42,-29,  7, 36,-41,-20;
/M: SY='D'; M=-37,-54, 69, 49,-54,-43,  5,-56,-10,-52,-47, -3,-21, 21, 22, -1, -8,-52,-59,-12;
/M: SY='M'; M= -6,-12,-57,-50,-25,-55,-23, 30,-48, 37, 67,-51,-52,-44,-48,-44,-32, 49,-53,-31;
/M: SY='Y'; M=-41,-50, 13,-38, 22,-39,  2,-28, 12, 31,-23,-38,-21,-35,-35, -2,-23,-32,-26, 79;
/M: SY='K'; M= -6,-50,  2, -5, -2,-45,  4,-27, 30,  5, 16,-21,  9, 30, 11, -7,-13,-11,-43, 26;
/M: SY='A'; M= 58,-41,-36,  5,-46,-10,-40,-12, -3,-17,-34, -3,-41, -5, -7,  3, 17,-12,-53,-43;
/M: SY='L'; M= 31,  1,-51,-27,  3,-47,-43, 25,-46, 47, 10,-47,-51,-41,-47,-14,-15,-12,-44,  8;
/M: SY='Q'; M=-15,-25, 38, 38,-53,  4,-32,-37, 24,-48,-41,  1,-14, 40,  1, -1,-19, -7,-55,-25;
/M: SY='E'; M=  5,-50, 23, 56,-49,-43,-33,-35, 32,-21, -7, -8,-39,-19, 19,  1,-22, -9,-55,-42;
/M: SY='L'; M=-40,-48,-49,-35, 30,-34, 40, 23,-43, 49, 11,-28,-52, 25,-42,-26,-22,-16,-42,  5;
/M: SY='E'; M=-20, 33, -6, 57,-48,-29, 21,-26, -4, -8,-18,-17, 28, -1, 29,-28,-35,-20,-56,-42;
/M: SY='Q'; M=-37,-55, 17, 20,-55,-27, 16,-34, 48,-33,-38,  5, 12, 65, 18,-30,-26,-49,-53,-39;
/M: SY='H'; M=-15,  1, 38,-16,  6,-47, 39, 13,-11, 16, 26,  6,-48,-10,-38,-20,-12, -4,-49, 18;
/M: SY='W'; M=-36,-22,-43,-39, -9,  3, 39, 12, 10, 15, -3,-15,-48,-32, 26, 10,-10, -8, 54,  4;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='H'; M=-66,-81,-65,-33,-62,-74, 37, -6,-40,-47, 25,-27, 21,-24,-64,-32,-36,-58,-76, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='F'; M=  6,-69,-77,-50, 22,-40,-71,-43,-71,  5,-47,-73,-77,-29,-72,-61,-60,  6,-68,-51; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='F'; M=-21,-72,-70,-38, 16,-73,-65,-48, 10,-23, -6,-65,-74,-60,-33,-23,-57,  3,-67,-19; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='Q'; M=-21,-75,-32, 15,-34,-73,-62,-36,-56,-41,-28,-62,-69, 27,-60,-34,-58, 10,-75,-21; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='D'; M=-42,-74, 22,-49,-72,-37,-11,-52, 16,-24,-17,-30,-68,-20,-51, -6,-26,-66,-83,-64; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='W'; M=-19,-72,-46,-65,-58,-23,-68,-50,-64, -5,-55,-28,-72,-23,-68, 20,-54,-23, 68,-55; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='N'; M=-31,-67,-10,-22,  0,-68,-60,-43,-34,  3,-47, 17,-71,-58,-35,-36,-27,  7,-74,-54; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='D'; M=-60, 17, 33,  1,-58,-32, 17,-71,-48,-45,-60,  3,-67, -8,-11,-34,-55,-69,-69, 23; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='F'; M=-22,  1,-10,-56, 22,-43,  5,-22,-55,-30,-52,  8,-66,-54,-34, 17, -8,-52,  3,-22; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='D'; M=-53,-66, 36, 29,-59,-60, 22,-56, -5, -1,  7,-17,-57,-39,-46, -6,-48,-57,-75,-53; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='D'; M=-22,-31, 43,-17,-42,-29,-42,-46,-43, -6,-25,-14,-45,-44,  4,-30,-18,-13,-55, 40; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='G'; M= -6,-18,-28,-27,-31, 13,-48, -3,-27,  6,-23,  9,-55,-20,-28, -7,  2,  8,-59, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-19;
/M: SY='D'; M=  4, -1, 28, -1, -4, 21,-15,-39, 18,-12,-21,-20, 26,  8,-10,-12,-24, -3,-51,-20;
/M: SY='K'; M= -9,-50, 20, 30,-20, -6,-33,-41, 34,-11,-37, -6,  8, 22,-26, 11, -7,-11,-50, -4;
/M: SY='S'; M= 10,-47, -8,-13,-23, -4,  1, -1,-24, 16,-28, 12, 10,  4,  5, 17,-12, -8,-48, 13;
/M: SY='C'; M=-24, 46,-10, -7,-24,-26,-14,  6,-17, 30,  3,-16, 42,-37,  3,-11,-34, -1,-50,  0;
/M: SY='P'; M=  7, 21,-28,  3, -2,-44,-25, 15,  5,-12,-31,  1, 38,-33, 11,  3, -6,  8,-50,-11;
/M: SY='R'; M=-21,-51, -2, 19,  2, 17, -8,-31, 12,-20,-14, 22,  9, -1, 39, -7,-18,-44,-47,  4;
/M: SY='K'; M=-17,-50,  5, 28,-49, 21,-36,-26, 41,-25,-10, -8, 15,  8,-18,  9,-31,  3,-53,-43;
/M: SY='M'; M=-36,-48, 21,-15,-24,-15,-36, -2, 13, 29, 48,-24, 11,-18,  4,  5,-11,-14,-51,-17;
/M: SY='F'; M= 20,-22,-20, -2, 55,-28, 16,-19,-38, -3,-11,-23, -1,-21, -4, -6,-33, 14,-38, 14;
/M: SY='P'; M=-21,-19,-18,-20,-23, -7, 41,  8,-23, 20, 12,-27, 69,-39,-44,-32,-25,  5,-54,-37;
/M: SY='Y'; M=-12,-50,-11,-37, 45,-19,-32,-18,  8,-23,  1, -6, 37, -6,-19,  1, -4,-13,-32, 54;
/M: SY='E'; M=-29,-53, 23, 51,-35, -6, 48,-20,  9,-49,-41, 36,  8, 19, -5,-14,-25,-48,-58,-39;
/M: SY='Y'; M= -3,-47,-28,-50, 39,-33,-43, 33,-48, 28,-17,-49,-54,-47,-49,-27,-34, 32, 19, 41;
/M: SY='H'; M=-30,-55, 21, 60,-50,-45, 63,-52,-12,-48,-41,-12, 34, 24,-21, -4, -9,-32,-56, -2;
/I:         I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
/M: SY='N'; M= 26,-45, 19,  9,-50, -6,-34,-26,-21,-35,-39, 30,-10, 23, -9, 30, 21,-22,-57,-43;
/M: SY='W'; M=-24,-53,-36,-25, 29,-53,-49, 24,-13, 19, 12,-51, -6,-16,-44,-45,-29, 13,109,  9;
/M: SY='F'; M=-42,-46,-57,-53, 91,-54,-43, 17,-48,  4, -4,-47,-56,-52,-26,  9,-35,  1,-26,  5;
/M: SY='E'; M= 10,-48,-14, 34, -9, 16,-35, -5,  0, -7, 11,-13,-43, 18,-12, -5,-25,  2,-46,  9;
/M: SY='P'; M=-36,-55,  5,-12,-56,  0,-35,-50,  8,-54,-43, 21, 80, 25,  3, -7, 20,-49,-56,-48;
/M: SY='F'; M= -2,-46,-54,-50, 64,-10,  9, -8,-49, 39,-18,-48,-24,-48,-48,-41,-22,  9,-33, 25;
/M: SY='V'; M=-33,-45,-59,-53, -2,-61,-55, 47,-49, 28,-13,-53,-54,-50,-28,-45,-30, 67,-53,-32;
/M: SY='W'; M=-36,-51,-26,-13,-35,-29, -7,-12, 29,  9, 29,-37, -4,  6, 33,-10,-10, 14, 61, -7;
/M: SY='R'; M= -1,-51, -1,-24,-20,-43, 10,-44, 15,-32, -4,-29,-45, 49, 63,  8, -7,-21,-48,  1;
/M: SY='W'; M=-48,-68,-66,-52,  8,-30,-22,-43,-44,-21,-41,-26,-55,-44,-25,-52,-55,-54,158, 42;
/M: SY='I'; M=-37, 33,-56,-52,-16,-59, -9, 48,-50, 47, 18,-31,-54,-47,-51,-46,-17, 34,-52,-31;
/M: SY='D'; M=-14,-52, 61, 22,-54,-39,  3,-39, 19,-36,-13, 37,  2, 30,  0, -6,-22,-48,-61,-42;
/M: SY='E'; M=-21,-49, 17, 46,-18,-24, -2,  7,-12, 15, -5, 18,-43, 12,-28,-17,-32, 13,-54,-37;
/M: SY='M'; M=  2, 20,-36,-34,-25,-25,-34, -3,-11,-21, 43, 27,-44, 29, 21, 17, 28, -3,-55,-37;
/M: SY='E'; M= -3,-19, 22, 49, -9,-25, 16,  6, 11,  5, -3,-33,-42,-26,-13,-25,-34,  2,-51, -9;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='D'; M=  2,-49, 58, 32,-52,-19, -1,-27, 18,-48, -9,  8,-39,  1,-18, 18,  2,-34,-59,-27;
/M: SY='R'; M=-22,-49,-16,-21,-21,-27, -5, -4, 41,-32,-34, 10,-44, 18, 46, 17,-11, 12,-53,-37;
/I:         I=-26; MD=-65;
/M: SY='I'; M= 21, -8,-48,-45, -3,-16,-47, 36,-42,  7,  6,-39,-47,-40,-25, 27, 12, 23,-52,-35; D=-26;
/I:         I=-26; MI=-65; MD=-65; IM=-65; DM=-65;
/M: SY='M'; M= 27, -6,-40, -2,-39,-33, -3, -6, 19, 21, 38,-18,-28, 20,  2,-24, -1,-18,-51,-37; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='Q'; M= -7,-53, 26, 48,-53,  4,-10,-48, -6,-35,  1,-27,-39, 60,-29,  9,-13,-31, 20,-40; D=-26;
/I:         I=-26; DM=-65;
/M: SY='W'; M=-26, 39,-52,-43, 20,-33,-45,-11,-32,-11,-34,-19,-52,-14, 38,  6,-39, -7,118,  6;
/M: SY='I'; M=-35, -9,-30,-51,  0,-59,-53, 54,-50, 28, 15,-50,-52,-48,-51,-26,-14, 53,-52,-31;
/M: SY='H'; M=-26,-53, 28, 35,-30,-21, 84,-50, 15,-18,-36, -3,-41, 23,  4, -2,-35,-36,-60,-30;
/M: SY='R'; M=-16,-53,-32,-12,-52, 13, -2,-53, 31,-35,-39, 16,-25, 35, 69,-13,-23,-49,-52,-40;
/M: SY='A'; M= 59,-40,-40,-39,-20, 21,-43, -6,-39,-19,-34,  2,-43,-36,-43, 21,  5,-14, -3,-41;
/M: SY='F'; M=-22, 19,-55,-49, 42,-56,-44, 29,  1, 35, -4,-49,-54,-45,-43,-44,-22, 29,-38, 25;
/I:         I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
/M: SY='E'; M=-17,-53,  8, 63,-54,-28,-30,-35, 34,-28,-40, -5,-37, 46, 12,-17,-11,-46,-53,-43;
/M: SY='Q'; M=-10,-50,-36,-10,-43,-46,  9,-16, 15, -2, 32,  2,-45, 58, 39,-22,  4,  5,-52,-35;
/M: SY='D'; M=-38,-55, 79, 70,-59,-44,-29,-58,-12,-38,-51,-20,-36,-18,-31,-12,-33,-53,-64,-46;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='T'; M=-10,-46,-10,  0,-49,-40,  3,-41, 41,-44, -7, 16, -8, 21, -6, 19, 45,-11,-57,-40; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='W'; M=-32,-59,-62,-49, 48,-39,-55, -8,  1,  4,-33,-55,-21,-45,-13,-49,-48,-21,136, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='E'; M=-31, 13, 40, 47,-49,-45,-32, -4,  1,-30,  7, 32,-41, 27,-19,-29, 14,-16,-60,-43; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='P'; M=-29,-58, -9, -2,-55,  5,-42,-34,-35,-38,-42,-19, 94,-10,-14,  8,-32, -9,-55,-51; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-12;
/M: SY='F'; M=-38,-75,-68,-47, 26,-45,-63,-22, 15,-36,-55,-32,-50,-31,  8,-63,-61,-26,-65,-40; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='Q'; M=-21,-79, 11,-47,-79,-43,-21,-69,-55,-46, -8,-40, 20, 42,-59,-31,-40,-58,-82,-67; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='S'; M=-20,-69, -9,-32,-67,-43,-60,-17,-32,-29,-35,-51,-15, 11,-58, 25,-12,-32,-78,-63; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='P'; M= 22,-17,-32,-22,-45,-11,-49, 16,-30, -3,-13, -8, 23,-42,-49,  5, 15,  7,-60,-46; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='S'; M= -6,-49, 22,  2,-47, -3,-39,-40,-23,-30, 17, -8,-22,-33,-21, 48, -6,  3,-58, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='E'; M=-19,-56, 36, 60,-58,-47,-34,-54, -5,-42,-47,  0, 26, 10,  7,-12,-10,-32,-61,-49; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-12;
/M: SY='H'; M=-14,-49, 30, -1,-43,-15, 47,-11,-31, -3, 38,-13, -4, 38,-17, 15, -3, -3,-57,-34;
/M: SY='M'; M=  7,-47,-10, -1,-42,-31, 21,-19,  2, -9, 46, -6,-23, 43,  1,-10, 14, 18,-55,-36;
/M: SY='R'; M=-40,-52,-34,-14,-17,-28, 21,-42, 46,  5,-12, 21,-47,  2, 63,-35,-36,-34,  6,-16;
/M: SY='H'; M=-42,-15,-42,-42, 38, 10, 94,-15,-41,  8,  4,-33,-19,-35,-39,-30,-41,-38,-37, 52;
/M: SY='S'; M= 19, 25,-35,-35,-48,  2,-38,-20,-34,-47,-42,-24,-41,-28,-18, 79, -8,-20,-56,-43;
/M: SY='S'; M= 20, 29, 16,-30,-49, -3,-16,-42,  9,-46,-41, 17,-42, -6,-11, 50,  8, -2,-58,-43;
/M: SY='S'; M=-14,-41,  7, -5,-44,-30,-34,-45,-32,-33,-42,-21,-39,-26,-37, 80, 31,-38,-54,  1;
/M: SY='V'; M= 17,-41,-45,-43,-35,-44, -8, 34,-42, -9,-24,-37,-45,-40,-46, 23, 40, 45,-57,-37;
/M: SY='V'; M=-12,-45,-32, 15,-30,-23,-50, 35,-24, 13,-19,-46,-48,-41,-45,-39,-14, 61,-54,-16;
/M: SY='D'; M=-39,-55, 91, 51,-60,-24,-29,-58,-26,-54,-12,-16,-38, -9,-35,-30,-14,-54,-68,-46;
/M: SY='I'; M=  6,-45,-47, 10,-28,-54,-48, 49,-44, 28, 20,-46,-48,-40,-47,-38,  5, 36,-52,-35;
/M: SY='F'; M=-13, -2,-56,-53, 96,-35,-40,-13,-50, -1,-26,-47,-57,-54,-49,-11,-18,-20,-21, 29;
/M: SY='W'; M=  7,-47,-40,-10, 32,-32,  9,-40,-13,-16,-19,-33,-45,-31, 36, 21, 37,-37, 78,-24;
/M: SY='C'; M=-20, 49,-39,  4,-15,-18,-39, 30, 16,  3, 16,-35,-15, 47,-32, 13,-18,-26,-50,-36;
/M: SY='F'; M=-42, -3,-60,-55, 53,-61,-48, 46,-53, 49,  8,-54,-56,-51,-52,-49,-37, 15,-39,-19;
/M: SY='P'; M=-22,-52, 27, 27,-45,-16, -7,-49,-13,-37,-41, 45, 47, 20,-14,  4,  1,-48,-51, 23;
/M: SY='Q'; M= 21,-51, -2, 30,-50,-23, 19, 14,-26,-29,-32,-14,-23, 74,-30,-14,-22,-12,-53,-38;
/M: SY='T'; M= 13, 22,-44,-43, -6, -5,-44, 22,-41,  9,-27,-35, -2,-39,-46, 31, 33,  5,-49,  0;
/M: SY='Q'; M=  5,-14,-47,-37, 25,-49, -5, 13,  5, 12, 25,-40,-23, 32,-13,-20, -9, 28,-45, -5;
/M: SY='H'; M=-26,-50, 38, 31,-48,-43, 51,-18, 12,-35, 20,  1,-40, 26,  1,  9, 16,-26,-59,-36;
/M: SY='F'; M=-29,-49,  0, -7, 57,-51, 14, 23,-37,  0, -8,-37, -1, 40,-23,-24,  9,  2,-41,-20;
/M: SY='W'; M=-17,-50, -9, -7, 21,-55,-50, 43,-46, 24, 21,-49,-50,-43,-49,-44,-12, 18, 90,-23;
/M: SY='F'; M=-16,-48,-23, 18, 24,-30,-22, -6, 21, 22,  0,-25,-47,  5, 22,-15,-23, 11,-46,-30;
/M: SY='Q'; M=-12,-50, 33, -1,-49,  2, 14,-38, 36,-15,-35,  9,-43, 45,  3,-11,-32,  9,-55,-39;
/M: SY='L'; M=-40,-47,-50,-21,  9,-56,  2, -1,-44, 63, 20,-49,  6, 29,-43,-31,-37,-11,-46,-28;
/M: SY='D'; M=  1,-52, 60, 33,-34,-19, 51,-54, 14,-34,-42, 27,-41, 13, -3,-29,-33,-50,-61,-38;
/M: SY='W'; M=-43, 52,-66,-53,-21,-31,-62, -9,-49, 21,-31,-59,-19,-48,-51,-34,-46,  2,142,-16;
/M: SY='P'; M=  0,-56,  5,  9,-52,-33,-40,-19,-35,-24,-18,  7, 93,-19,-44,-13,-20,-17,-56,-50;
/M: SY='D'; M=-38,-10, 79, 27,-33,-22,-30,-20,-29,-32, 19, 31,-42,-27,-16, -3,-18,-28,-65,-42;
/M: SY='P'; M=  2,-53, 22, 37,-54, 26,-19,-49,-19,-28,-42,-31, 55, -3,  9,  1,-33,-31,-55,-47;
/M: SY='E'; M= -6,-49, 19, 35,  7,-12,-35, -7,-18, 20, -7,-14,-16,  7,-37, -1, -8,-13,-45, 16;
/M: SY='Q'; M=-19,-51, 20, 33, 34, -7,  7,  7,-14,-14,-32,-12,-43, 45,-16,-20,  0,-14,-47,-29;
/M: SY='A'; M= 32,-47, -7,  1,-15,-15, 13,-11,  8, 12, -9,-12,-46,-16, 19,-10,-33, -9, 17,  7;
/I:         I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
/M: SY='A'; M= 43,-45,-43,-37, 33,-10,-15, 19, 11,  0, -9,  3,-46, 19,-27,-24,-33,-26,-42, -8;
/M: SY='H'; M=-25,-53,-18, -3, 23,-26, 60,-13, 13,-27, 20,-15,-14, 56, 18,-33,-23,-13,-45,  5;
/M: SY='Y'; M=-30,-48,-52,-45, 49,-55,-11,  9,-44, 32, 24,-47,-54, 25,-42,-42,-27, 15,-29, 57;
/M: SY='Y'; M=-38,-49,-21, 38,  8,-28,-29, -9,-26, 10, 59,-27,-45, -9,-37,-31,  6, -8,-33, 62;
/M: SY='T'; M= -8,-22,-36,-34,-35,-31,-35, -8, -4,-24,-24,  0,-42, 18, 12,  8, 62,  8,-48, 30;
/M: SY='R'; M= -8,-49,-14,-28,-44,-43,  0, -5, 18, -4,-10, 19,-46, 31, 55,  6,  5,-13,-53,-37;
/M: SY='L'; M=-39,-46,-51,-46, 43,-53,  7, 20,  0, 44, 15,-44,-52,-41,-41,  6,-13, -5,-38, 22;
/M: SY='A'; M= 33,-42,-45,-39, 26,-14,-42,  0, 14,  2, -9,-37,-46,-37,-37, 20,  2, 20,-45, -7;
/M: SY='K'; M=-36,-49, 22,  5,-43,-22, -1,-33, 57,  0, 33, -8,-42, -3,  2,-17, -6,  6,-54,-38;
/M: SY='M'; M= 17,-43, 19, -5,-18,-11,-12, -3,-24, -8, 36,-13,-42,-33,-40, 32, 28,  3, -8,-36;
/M: SY='I'; M=  3,-45,-29,-44, 19, -7,-47, 44,-18, -5, -3,-16,-11,-41,-45, 21, -2, 29,-49,-32;
/M: SY='C'; M= -7,100,-18,-23,-43,  8,-42,-20,-41,-12,-37,  9,-50,-25,-46, 39,-17, -9,-60,-24;
/M: SY='D'; M=  6,-49, 33, 16,-49, 31,-34,-27, 14,-49,-42, 30,-13,-28,  2, -1, -2,-17,-54,-13;
/M: SY='M'; M= 25, 38,-15,-24,-14,  9,-40, -9,-40,-17, 40,-18,-45,-36,-43, 30,  9, 13,-50,  6;
/M: SY='V'; M=  9, 12,-48,-40,-32,-39,-45, 30, 21, 26, -5,-42,-49,-18, 18,-30,-19, 31,-52,-36;
/M: SY='Q'; M=-16,  2,  3, 23,-39,-22, -1,  2, -9, 21,  4, 29,-45, 35,-34,  0, -7, -8,-55,-38;
/M: SY='Q'; M=  2, -6, 13,-13, 11,-40, 11,-39,  6,-41,-36, 11,-44, 35, 17, 23, 16, -6,-46, 20;
/M: SY='Y'; M=-44, 45,-18,-47, 17,-53,-20,-28,-23,  3,-24,-46,-58,-39,-39,-42,-39,-11,-12,106;
/M: SY='C'; M= 27, 77,-48,-46,-14,-44,-48, 27,-44,  7,  5,-17,-50,-43,-48,  9,  9, 17,-56,-39;
/M: SY='P'; M=-14,-54, 49, 21,-56,-40,-34,-29, 10,-43,-44,-16, 62, 26, -8, 17,-15,-47,-57,-46;
/M: SY='P'; M=-30, 14,-43,-34,-39,-49,-39, 21,  5,  6, 11,-37, 36, 31, 33, -3,  7,  2,  0,-37;
/M: SY='M'; M=-28,-17,-30,-47,-26,-46,-47, 31,-46, 39, 41,-45,-16,-44,-48,-38, 30, 39,-54,-33;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS51259

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 27 in 27 different sequences
Number of true positive hits 27 in 27 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MHD1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
27 sequences

BAIP3_HUMAN (O94812), BAIP3_MOUSE (Q80TT2), CAPS1_HUMAN (Q9ULU8), 
CAPS1_MOUSE (Q80TJ1), CAPS1_RAT   (Q62717), CAPS1_XENLA (Q6GLR7), 
CAPS2_HUMAN (Q86UW7), CAPS2_MOUSE (Q8BYR5), CAPS_CAEBR  (Q60PC0), 
CAPS_CAEEL  (Q23658), CAPS_DROME  (Q9NHE5), GIT1_SCHPO  (Q9P7K5), 
UN13A_HUMAN (Q9UPW8), UN13A_MOUSE (Q4KUS2), UN13A_RAT   (Q62768), 
UN13B_HUMAN (O14795), UN13B_MOUSE (Q9Z1N9), UN13B_RAT   (Q62769), 
UN13C_HUMAN (Q8NB66), UN13C_MOUSE (Q8K0T7), UN13C_RAT   (Q62770), 
UN13D_HUMAN (Q70J99), UN13D_MOUSE (B2RUP2), UN13D_RAT   (Q9R189), 
UNC13_CAEEL (P27715), YDY2_SCHPO  (O13683), YO296_YEAST (Q08748)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission