PROSITE entry PS51258
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | MHD1 |
| Accession [info] | PS51258 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-OCT-2006 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51258 |
| Associated ProRule [info] | PRU00587 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Munc13-homology domain 1 (MHD1) profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=134; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9424201; R2=0.0063137; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=19786.6289062; R2=9.0886602; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1118; H_SCORE=29948; N_SCORE=9.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=722; H_SCORE=26349; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-15; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='F'; M=-10,-45,-12,-30, 59,-51,-43, 7,-14, 5, 1,-11,-20, 5,-42,-29, 7, 36,-41,-20; /M: SY='D'; M=-37,-54, 69, 49,-54,-43, 5,-56,-10,-52,-47, -3,-21, 21, 22, -1, -8,-52,-59,-12; /M: SY='M'; M= -6,-12,-57,-50,-25,-55,-23, 30,-48, 37, 67,-51,-52,-44,-48,-44,-32, 49,-53,-31; /M: SY='Y'; M=-41,-50, 13,-38, 22,-39, 2,-28, 12, 31,-23,-38,-21,-35,-35, -2,-23,-32,-26, 79; /M: SY='K'; M= -6,-50, 2, -5, -2,-45, 4,-27, 30, 5, 16,-21, 9, 30, 11, -7,-13,-11,-43, 26; /M: SY='A'; M= 58,-41,-36, 5,-46,-10,-40,-12, -3,-17,-34, -3,-41, -5, -7, 3, 17,-12,-53,-43; /M: SY='L'; M= 31, 1,-51,-27, 3,-47,-43, 25,-46, 47, 10,-47,-51,-41,-47,-14,-15,-12,-44, 8; /M: SY='Q'; M=-15,-25, 38, 38,-53, 4,-32,-37, 24,-48,-41, 1,-14, 40, 1, -1,-19, -7,-55,-25; /M: SY='E'; M= 5,-50, 23, 56,-49,-43,-33,-35, 32,-21, -7, -8,-39,-19, 19, 1,-22, -9,-55,-42; /M: SY='L'; M=-40,-48,-49,-35, 30,-34, 40, 23,-43, 49, 11,-28,-52, 25,-42,-26,-22,-16,-42, 5; /M: SY='E'; M=-20, 33, -6, 57,-48,-29, 21,-26, -4, -8,-18,-17, 28, -1, 29,-28,-35,-20,-56,-42; /M: SY='Q'; M=-37,-55, 17, 20,-55,-27, 16,-34, 48,-33,-38, 5, 12, 65, 18,-30,-26,-49,-53,-39; /M: SY='H'; M=-15, 1, 38,-16, 6,-47, 39, 13,-11, 16, 26, 6,-48,-10,-38,-20,-12, -4,-49, 18; /M: SY='W'; M=-36,-22,-43,-39, -9, 3, 39, 12, 10, 15, -3,-15,-48,-32, 26, 10,-10, -8, 54, 4; /I: I=-8; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='H'; M=-66,-81,-65,-33,-62,-74, 37, -6,-40,-47, 25,-27, 21,-24,-64,-32,-36,-58,-76, -3; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='F'; M= 6,-69,-77,-50, 22,-40,-71,-43,-71, 5,-47,-73,-77,-29,-72,-61,-60, 6,-68,-51; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='F'; M=-21,-72,-70,-38, 16,-73,-65,-48, 10,-23, -6,-65,-74,-60,-33,-23,-57, 3,-67,-19; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='Q'; M=-21,-75,-32, 15,-34,-73,-62,-36,-56,-41,-28,-62,-69, 27,-60,-34,-58, 10,-75,-21; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='D'; M=-42,-74, 22,-49,-72,-37,-11,-52, 16,-24,-17,-30,-68,-20,-51, -6,-26,-66,-83,-64; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='W'; M=-19,-72,-46,-65,-58,-23,-68,-50,-64, -5,-55,-28,-72,-23,-68, 20,-54,-23, 68,-55; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='N'; M=-31,-67,-10,-22, 0,-68,-60,-43,-34, 3,-47, 17,-71,-58,-35,-36,-27, 7,-74,-54; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='D'; M=-60, 17, 33, 1,-58,-32, 17,-71,-48,-45,-60, 3,-67, -8,-11,-34,-55,-69,-69, 23; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='F'; M=-22, 1,-10,-56, 22,-43, 5,-22,-55,-30,-52, 8,-66,-54,-34, 17, -8,-52, 3,-22; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='D'; M=-53,-66, 36, 29,-59,-60, 22,-56, -5, -1, 7,-17,-57,-39,-46, -6,-48,-57,-75,-53; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='D'; M=-22,-31, 43,-17,-42,-29,-42,-46,-43, -6,-25,-14,-45,-44, 4,-30,-18,-13,-55, 40; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='G'; M= -6,-18,-28,-27,-31, 13,-48, -3,-27, 6,-23, 9,-55,-20,-28, -7, 2, 8,-59, -9; D=-8; /I: I=-8; DM=-19; /M: SY='D'; M= 4, -1, 28, -1, -4, 21,-15,-39, 18,-12,-21,-20, 26, 8,-10,-12,-24, -3,-51,-20; /M: SY='K'; M= -9,-50, 20, 30,-20, -6,-33,-41, 34,-11,-37, -6, 8, 22,-26, 11, -7,-11,-50, -4; /M: SY='S'; M= 10,-47, -8,-13,-23, -4, 1, -1,-24, 16,-28, 12, 10, 4, 5, 17,-12, -8,-48, 13; /M: SY='C'; M=-24, 46,-10, -7,-24,-26,-14, 6,-17, 30, 3,-16, 42,-37, 3,-11,-34, -1,-50, 0; /M: SY='P'; M= 7, 21,-28, 3, -2,-44,-25, 15, 5,-12,-31, 1, 38,-33, 11, 3, -6, 8,-50,-11; /M: SY='R'; M=-21,-51, -2, 19, 2, 17, -8,-31, 12,-20,-14, 22, 9, -1, 39, -7,-18,-44,-47, 4; /M: SY='K'; M=-17,-50, 5, 28,-49, 21,-36,-26, 41,-25,-10, -8, 15, 8,-18, 9,-31, 3,-53,-43; /M: SY='M'; M=-36,-48, 21,-15,-24,-15,-36, -2, 13, 29, 48,-24, 11,-18, 4, 5,-11,-14,-51,-17; /M: SY='F'; M= 20,-22,-20, -2, 55,-28, 16,-19,-38, -3,-11,-23, -1,-21, -4, -6,-33, 14,-38, 14; /M: SY='P'; M=-21,-19,-18,-20,-23, -7, 41, 8,-23, 20, 12,-27, 69,-39,-44,-32,-25, 5,-54,-37; /M: SY='Y'; M=-12,-50,-11,-37, 45,-19,-32,-18, 8,-23, 1, -6, 37, -6,-19, 1, -4,-13,-32, 54; /M: SY='E'; M=-29,-53, 23, 51,-35, -6, 48,-20, 9,-49,-41, 36, 8, 19, -5,-14,-25,-48,-58,-39; /M: SY='Y'; M= -3,-47,-28,-50, 39,-33,-43, 33,-48, 28,-17,-49,-54,-47,-49,-27,-34, 32, 19, 41; /M: SY='H'; M=-30,-55, 21, 60,-50,-45, 63,-52,-12,-48,-41,-12, 34, 24,-21, -4, -9,-32,-56, -2; /I: I=-22; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57; /M: SY='N'; M= 26,-45, 19, 9,-50, -6,-34,-26,-21,-35,-39, 30,-10, 23, -9, 30, 21,-22,-57,-43; /M: SY='W'; M=-24,-53,-36,-25, 29,-53,-49, 24,-13, 19, 12,-51, -6,-16,-44,-45,-29, 13,109, 9; /M: SY='F'; M=-42,-46,-57,-53, 91,-54,-43, 17,-48, 4, -4,-47,-56,-52,-26, 9,-35, 1,-26, 5; /M: SY='E'; M= 10,-48,-14, 34, -9, 16,-35, -5, 0, -7, 11,-13,-43, 18,-12, -5,-25, 2,-46, 9; /M: SY='P'; M=-36,-55, 5,-12,-56, 0,-35,-50, 8,-54,-43, 21, 80, 25, 3, -7, 20,-49,-56,-48; /M: SY='F'; M= -2,-46,-54,-50, 64,-10, 9, -8,-49, 39,-18,-48,-24,-48,-48,-41,-22, 9,-33, 25; /M: SY='V'; M=-33,-45,-59,-53, -2,-61,-55, 47,-49, 28,-13,-53,-54,-50,-28,-45,-30, 67,-53,-32; /M: SY='W'; M=-36,-51,-26,-13,-35,-29, -7,-12, 29, 9, 29,-37, -4, 6, 33,-10,-10, 14, 61, -7; /M: SY='R'; M= -1,-51, -1,-24,-20,-43, 10,-44, 15,-32, -4,-29,-45, 49, 63, 8, -7,-21,-48, 1; /M: SY='W'; M=-48,-68,-66,-52, 8,-30,-22,-43,-44,-21,-41,-26,-55,-44,-25,-52,-55,-54,158, 42; /M: SY='I'; M=-37, 33,-56,-52,-16,-59, -9, 48,-50, 47, 18,-31,-54,-47,-51,-46,-17, 34,-52,-31; /M: SY='D'; M=-14,-52, 61, 22,-54,-39, 3,-39, 19,-36,-13, 37, 2, 30, 0, -6,-22,-48,-61,-42; /M: SY='E'; M=-21,-49, 17, 46,-18,-24, -2, 7,-12, 15, -5, 18,-43, 12,-28,-17,-32, 13,-54,-37; /M: SY='M'; M= 2, 20,-36,-34,-25,-25,-34, -3,-11,-21, 43, 27,-44, 29, 21, 17, 28, -3,-55,-37; /M: SY='E'; M= -3,-19, 22, 49, -9,-25, 16, 6, 11, 5, -3,-33,-42,-26,-13,-25,-34, 2,-51, -9; /I: I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; /M: SY='D'; M= 2,-49, 58, 32,-52,-19, -1,-27, 18,-48, -9, 8,-39, 1,-18, 18, 2,-34,-59,-27; /M: SY='R'; M=-22,-49,-16,-21,-21,-27, -5, -4, 41,-32,-34, 10,-44, 18, 46, 17,-11, 12,-53,-37; /I: I=-26; MD=-65; /M: SY='I'; M= 21, -8,-48,-45, -3,-16,-47, 36,-42, 7, 6,-39,-47,-40,-25, 27, 12, 23,-52,-35; D=-26; /I: I=-26; MI=-65; MD=-65; IM=-65; DM=-65; /M: SY='M'; M= 27, -6,-40, -2,-39,-33, -3, -6, 19, 21, 38,-18,-28, 20, 2,-24, -1,-18,-51,-37; D=-26; /I: I=-26; DM=-65; /M: SY='Q'; M= -7,-53, 26, 48,-53, 4,-10,-48, -6,-35, 1,-27,-39, 60,-29, 9,-13,-31, 20,-40; D=-26; /I: I=-26; DM=-65; /M: SY='W'; M=-26, 39,-52,-43, 20,-33,-45,-11,-32,-11,-34,-19,-52,-14, 38, 6,-39, -7,118, 6; /M: SY='I'; M=-35, -9,-30,-51, 0,-59,-53, 54,-50, 28, 15,-50,-52,-48,-51,-26,-14, 53,-52,-31; /M: SY='H'; M=-26,-53, 28, 35,-30,-21, 84,-50, 15,-18,-36, -3,-41, 23, 4, -2,-35,-36,-60,-30; /M: SY='R'; M=-16,-53,-32,-12,-52, 13, -2,-53, 31,-35,-39, 16,-25, 35, 69,-13,-23,-49,-52,-40; /M: SY='A'; M= 59,-40,-40,-39,-20, 21,-43, -6,-39,-19,-34, 2,-43,-36,-43, 21, 5,-14, -3,-41; /M: SY='F'; M=-22, 19,-55,-49, 42,-56,-44, 29, 1, 35, -4,-49,-54,-45,-43,-44,-22, 29,-38, 25; /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; /M: SY='E'; M=-17,-53, 8, 63,-54,-28,-30,-35, 34,-28,-40, -5,-37, 46, 12,-17,-11,-46,-53,-43; /M: SY='Q'; M=-10,-50,-36,-10,-43,-46, 9,-16, 15, -2, 32, 2,-45, 58, 39,-22, 4, 5,-52,-35; /M: SY='D'; M=-38,-55, 79, 70,-59,-44,-29,-58,-12,-38,-51,-20,-36,-18,-31,-12,-33,-53,-64,-46; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='T'; M=-10,-46,-10, 0,-49,-40, 3,-41, 41,-44, -7, 16, -8, 21, -6, 19, 45,-11,-57,-40; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='W'; M=-32,-59,-62,-49, 48,-39,-55, -8, 1, 4,-33,-55,-21,-45,-13,-49,-48,-21,136, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='E'; M=-31, 13, 40, 47,-49,-45,-32, -4, 1,-30, 7, 32,-41, 27,-19,-29, 14,-16,-60,-43; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='P'; M=-29,-58, -9, -2,-55, 5,-42,-34,-35,-38,-42,-19, 94,-10,-14, 8,-32, -9,-55,-51; D=-5; /I: I=-5; MD=-12; /M: SY='F'; M=-38,-75,-68,-47, 26,-45,-63,-22, 15,-36,-55,-32,-50,-31, 8,-63,-61,-26,-65,-40; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='Q'; M=-21,-79, 11,-47,-79,-43,-21,-69,-55,-46, -8,-40, 20, 42,-59,-31,-40,-58,-82,-67; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='S'; M=-20,-69, -9,-32,-67,-43,-60,-17,-32,-29,-35,-51,-15, 11,-58, 25,-12,-32,-78,-63; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='P'; M= 22,-17,-32,-22,-45,-11,-49, 16,-30, -3,-13, -8, 23,-42,-49, 5, 15, 7,-60,-46; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='S'; M= -6,-49, 22, 2,-47, -3,-39,-40,-23,-30, 17, -8,-22,-33,-21, 48, -6, 3,-58, -7; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='E'; M=-19,-56, 36, 60,-58,-47,-34,-54, -5,-42,-47, 0, 26, 10, 7,-12,-10,-32,-61,-49; D=-5; /I: I=-5; DM=-12; /M: SY='H'; M=-14,-49, 30, -1,-43,-15, 47,-11,-31, -3, 38,-13, -4, 38,-17, 15, -3, -3,-57,-34; /M: SY='M'; M= 7,-47,-10, -1,-42,-31, 21,-19, 2, -9, 46, -6,-23, 43, 1,-10, 14, 18,-55,-36; /M: SY='R'; M=-40,-52,-34,-14,-17,-28, 21,-42, 46, 5,-12, 21,-47, 2, 63,-35,-36,-34, 6,-16; /M: SY='H'; M=-42,-15,-42,-42, 38, 10, 94,-15,-41, 8, 4,-33,-19,-35,-39,-30,-41,-38,-37, 52; /M: SY='S'; M= 19, 25,-35,-35,-48, 2,-38,-20,-34,-47,-42,-24,-41,-28,-18, 79, -8,-20,-56,-43; /M: SY='S'; M= 20, 29, 16,-30,-49, -3,-16,-42, 9,-46,-41, 17,-42, -6,-11, 50, 8, -2,-58,-43; /M: SY='S'; M=-14,-41, 7, -5,-44,-30,-34,-45,-32,-33,-42,-21,-39,-26,-37, 80, 31,-38,-54, 1; /M: SY='V'; M= 17,-41,-45,-43,-35,-44, -8, 34,-42, -9,-24,-37,-45,-40,-46, 23, 40, 45,-57,-37; /M: SY='V'; M=-12,-45,-32, 15,-30,-23,-50, 35,-24, 13,-19,-46,-48,-41,-45,-39,-14, 61,-54,-16; /M: SY='D'; M=-39,-55, 91, 51,-60,-24,-29,-58,-26,-54,-12,-16,-38, -9,-35,-30,-14,-54,-68,-46; /M: SY='I'; M= 6,-45,-47, 10,-28,-54,-48, 49,-44, 28, 20,-46,-48,-40,-47,-38, 5, 36,-52,-35; /M: SY='F'; M=-13, -2,-56,-53, 96,-35,-40,-13,-50, -1,-26,-47,-57,-54,-49,-11,-18,-20,-21, 29; /M: SY='W'; M= 7,-47,-40,-10, 32,-32, 9,-40,-13,-16,-19,-33,-45,-31, 36, 21, 37,-37, 78,-24; /M: SY='C'; M=-20, 49,-39, 4,-15,-18,-39, 30, 16, 3, 16,-35,-15, 47,-32, 13,-18,-26,-50,-36; /M: SY='F'; M=-42, -3,-60,-55, 53,-61,-48, 46,-53, 49, 8,-54,-56,-51,-52,-49,-37, 15,-39,-19; /M: SY='P'; M=-22,-52, 27, 27,-45,-16, -7,-49,-13,-37,-41, 45, 47, 20,-14, 4, 1,-48,-51, 23; /M: SY='Q'; M= 21,-51, -2, 30,-50,-23, 19, 14,-26,-29,-32,-14,-23, 74,-30,-14,-22,-12,-53,-38; /M: SY='T'; M= 13, 22,-44,-43, -6, -5,-44, 22,-41, 9,-27,-35, -2,-39,-46, 31, 33, 5,-49, 0; /M: SY='Q'; M= 5,-14,-47,-37, 25,-49, -5, 13, 5, 12, 25,-40,-23, 32,-13,-20, -9, 28,-45, -5; /M: SY='H'; M=-26,-50, 38, 31,-48,-43, 51,-18, 12,-35, 20, 1,-40, 26, 1, 9, 16,-26,-59,-36; /M: SY='F'; M=-29,-49, 0, -7, 57,-51, 14, 23,-37, 0, -8,-37, -1, 40,-23,-24, 9, 2,-41,-20; /M: SY='W'; M=-17,-50, -9, -7, 21,-55,-50, 43,-46, 24, 21,-49,-50,-43,-49,-44,-12, 18, 90,-23; /M: SY='F'; M=-16,-48,-23, 18, 24,-30,-22, -6, 21, 22, 0,-25,-47, 5, 22,-15,-23, 11,-46,-30; /M: SY='Q'; M=-12,-50, 33, -1,-49, 2, 14,-38, 36,-15,-35, 9,-43, 45, 3,-11,-32, 9,-55,-39; /M: SY='L'; M=-40,-47,-50,-21, 9,-56, 2, -1,-44, 63, 20,-49, 6, 29,-43,-31,-37,-11,-46,-28; /M: SY='D'; M= 1,-52, 60, 33,-34,-19, 51,-54, 14,-34,-42, 27,-41, 13, -3,-29,-33,-50,-61,-38; /M: SY='W'; M=-43, 52,-66,-53,-21,-31,-62, -9,-49, 21,-31,-59,-19,-48,-51,-34,-46, 2,142,-16; /M: SY='P'; M= 0,-56, 5, 9,-52,-33,-40,-19,-35,-24,-18, 7, 93,-19,-44,-13,-20,-17,-56,-50; /M: SY='D'; M=-38,-10, 79, 27,-33,-22,-30,-20,-29,-32, 19, 31,-42,-27,-16, -3,-18,-28,-65,-42; /M: SY='P'; M= 2,-53, 22, 37,-54, 26,-19,-49,-19,-28,-42,-31, 55, -3, 9, 1,-33,-31,-55,-47; /M: SY='E'; M= -6,-49, 19, 35, 7,-12,-35, -7,-18, 20, -7,-14,-16, 7,-37, -1, -8,-13,-45, 16; /M: SY='Q'; M=-19,-51, 20, 33, 34, -7, 7, 7,-14,-14,-32,-12,-43, 45,-16,-20, 0,-14,-47,-29; /M: SY='A'; M= 32,-47, -7, 1,-15,-15, 13,-11, 8, 12, -9,-12,-46,-16, 19,-10,-33, -9, 17, 7; /I: I=-16; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; /M: SY='A'; M= 43,-45,-43,-37, 33,-10,-15, 19, 11, 0, -9, 3,-46, 19,-27,-24,-33,-26,-42, -8; /M: SY='H'; M=-25,-53,-18, -3, 23,-26, 60,-13, 13,-27, 20,-15,-14, 56, 18,-33,-23,-13,-45, 5; /M: SY='Y'; M=-30,-48,-52,-45, 49,-55,-11, 9,-44, 32, 24,-47,-54, 25,-42,-42,-27, 15,-29, 57; /M: SY='Y'; M=-38,-49,-21, 38, 8,-28,-29, -9,-26, 10, 59,-27,-45, -9,-37,-31, 6, -8,-33, 62; /M: SY='T'; M= -8,-22,-36,-34,-35,-31,-35, -8, -4,-24,-24, 0,-42, 18, 12, 8, 62, 8,-48, 30; /M: SY='R'; M= -8,-49,-14,-28,-44,-43, 0, -5, 18, -4,-10, 19,-46, 31, 55, 6, 5,-13,-53,-37; /M: SY='L'; M=-39,-46,-51,-46, 43,-53, 7, 20, 0, 44, 15,-44,-52,-41,-41, 6,-13, -5,-38, 22; /M: SY='A'; M= 33,-42,-45,-39, 26,-14,-42, 0, 14, 2, -9,-37,-46,-37,-37, 20, 2, 20,-45, -7; /M: SY='K'; M=-36,-49, 22, 5,-43,-22, -1,-33, 57, 0, 33, -8,-42, -3, 2,-17, -6, 6,-54,-38; /M: SY='M'; M= 17,-43, 19, -5,-18,-11,-12, -3,-24, -8, 36,-13,-42,-33,-40, 32, 28, 3, -8,-36; /M: SY='I'; M= 3,-45,-29,-44, 19, -7,-47, 44,-18, -5, -3,-16,-11,-41,-45, 21, -2, 29,-49,-32; /M: SY='C'; M= -7,100,-18,-23,-43, 8,-42,-20,-41,-12,-37, 9,-50,-25,-46, 39,-17, -9,-60,-24; /M: SY='D'; M= 6,-49, 33, 16,-49, 31,-34,-27, 14,-49,-42, 30,-13,-28, 2, -1, -2,-17,-54,-13; /M: SY='M'; M= 25, 38,-15,-24,-14, 9,-40, -9,-40,-17, 40,-18,-45,-36,-43, 30, 9, 13,-50, 6; /M: SY='V'; M= 9, 12,-48,-40,-32,-39,-45, 30, 21, 26, -5,-42,-49,-18, 18,-30,-19, 31,-52,-36; /M: SY='Q'; M=-16, 2, 3, 23,-39,-22, -1, 2, -9, 21, 4, 29,-45, 35,-34, 0, -7, -8,-55,-38; /M: SY='Q'; M= 2, -6, 13,-13, 11,-40, 11,-39, 6,-41,-36, 11,-44, 35, 17, 23, 16, -6,-46, 20; /M: SY='Y'; M=-44, 45,-18,-47, 17,-53,-20,-28,-23, 3,-24,-46,-58,-39,-39,-42,-39,-11,-12,106; /M: SY='C'; M= 27, 77,-48,-46,-14,-44,-48, 27,-44, 7, 5,-17,-50,-43,-48, 9, 9, 17,-56,-39; /M: SY='P'; M=-14,-54, 49, 21,-56,-40,-34,-29, 10,-43,-44,-16, 62, 26, -8, 17,-15,-47,-57,-46; /M: SY='P'; M=-30, 14,-43,-34,-39,-49,-39, 21, 5, 6, 11,-37, 36, 31, 33, -3, 7, 2, 0,-37; /M: SY='M'; M=-28,-17,-30,-47,-26,-46,-47, 31,-46, 39, 41,-45,-16,-44,-48,-38, 30, 39,-54,-33; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS51259 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of true positive hits | 29 in 29 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | MHD1 |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
29 sequences
BAIP3_HUMAN (O94812), BAIP3_MOUSE (Q80TT2), CAPS1_HUMAN (Q9ULU8), CAPS1_MOUSE (Q80TJ1), CAPS1_RAT (Q62717), CAPS1_XENLA (Q6GLR7), CAPS2_HUMAN (Q86UW7), CAPS2_MOUSE (Q8BYR5), CAPS_CAEBR (Q60PC0), CAPS_CAEEL (Q23658), CAPS_DROME (Q9NHE5), GIT1_SCHPO (Q9P7K5), UN13A_HUMAN (Q9UPW8), UN13A_MOUSE (Q4KUS2), UN13A_RAT (Q62768), UN13B_DROME (Q9VBY8), UN13B_HUMAN (O14795), UN13B_MOUSE (Q9Z1N9), UN13B_RAT (Q62769), UN13C_HUMAN (Q8NB66), UN13C_MOUSE (Q8K0T7), UN13C_RAT (Q62770), UN13D_HUMAN (Q70J99), UN13D_MOUSE (B2RUP2), UN13D_RAT (Q9R189), UNC13_ARATH (Q8RX56), UNC13_CAEEL (P27715), YDY2_SCHPO (O13683), YO296_YEAST (Q08748)» more
|
| PDB [Detailed view] |
11 PDB
3SWH; 4Y21; 5UE8; 5UF7; 6A30; 6A68; 7T7C; 7T7R; 7T7V; 7T7X; 7T81 |