Entry: PS51259

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MHD2
Accession [info] PS51259
Entry type [info] MATRIX
Date [info] OCT-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51258
Associated ProRule [info] PRU00588

Name and characterization of the entry

Description [info] Munc13-homology domain 2 (MHD2) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=117;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=112;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4859470; R2=0.0068047; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-677.24289; R2=38.71335; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1031; N_SCORE=8.5; H_SCORE=33545; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=737; N_SCORE=6.5; H_SCORE=27854; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-11; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
...
                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='D'; M=-21,-38, 46, 45,-35,-12,-15,-40, -4,-39,-34, 25,-27,  6,-20, 26, -7,-33,-41, 15;
/M: SY='D'; M= 12,-36, 36, 15,-36,-13,-19,-24,  6,-27, -4, 33,-30, 17, -8,  8,  2,-20,  2,-13;
/M: SY='A'; M= 40,-32,-30,-13,-29,-26,-18, -2,-14, -8,-13,-24,-34,-18, 38, 17,-11, 10,-39, -9;
/M: SY='I'; M=-26,-35,-45,-39, -2,-47,-36, 47,-38, 43, 36,-39,-40,-15,-38,-23,-11, 23,-37,-18;
/M: SY='D'; M= -4,-39, 27, 20,-31,-22, 22,-18,  8, -6, 14,-17,-32, 16, 25, -2, -9, -4,-41, -3;
/M: SY='P'; M=-19,-48,-10, -3,-34,-21,-27,-16,-22,-36,  2,-16, 92, 12,-18, -5,-21,-28,-40,-20;
/M: SY='L'; M= -6,-33,-31,-38, 16,-45,-32, 17,-39, 62,  4,-43,-45,-34,-38,-36,-25, -2,-31, -3;
/M: SY='M'; M=-20, -4,-40,-15, 42,-42,-27, 13,-18, 34, 64,-34,-39,-29,-31,-20, -2, -8,-28,  0;
/M: SY='D'; M=-13,-40, 54, 25,-20,-31, -7,-22, 17,-33,  5, 13,-10, -5, 21, -7, -5,-20,-47,-28;
/M: SY='Y'; M=-18,-10,-31,  4, 33,-41, 18,  3,-29,  8,  6,-32,-27,-25,-29,-28, -9, -6, -9, 77;
/M: SY='L'; M=-24,-33,-44,-38, 25,-45,-31, 16,-38, 60, 19,-27,-44,-25,-37,-21,-16, -4,-31,-13;
/M: SY='D'; M=-13,-40, 67, 32,-46,-26,-16,-44,  8,-44,-38, 40, -5,  1,-10, -9, -7,-40,-54,-34;
/M: SY='Q'; M=-13, -4, 17, 25,-36, -2,  9, -8, -4,-14,  0, -3, -7, 35,-14, 18,  4, -9,-44,-28;
/M: SY='N'; M=-22,  5, -2, 15,-17,-23, 16,-16, 13,-25,-26, 67,-33,-13,-18, 14, -2, -9,-48,-17;
/M: SY='L'; M=-30,-33,-45,-39, 40,-46,-31, 13,-25, 60,  3,-26,-46,-35,-36,-24,-25, -5,-28, -9;
/M: SY='T'; M= 28,  9, -1,  4,-35, -8, -5,-33, -1,-34,-20,  0,-12, -7, -9, 32, 33,-25,-43,-11;
/M: SY='I'; M= -7,-35,-36,-17, -6,-41,-32, 42,-30, 24,  6,-31,-36,  9,-24,-18, 22, 12, 16,  9;
/M: SY='M'; M=-28,-34,-45,-39, 28,-45,-27, 19,-37, 46, 51,-40,-43,-32,-35,-19,-24, 12,-26, 26;
/M: SY='C'; M= 30, 46,-20,-23,-28,-21,  4,-31, 13,-28,-26, 42,-34,-19,-21, 16,  4,-20,-37, 22;
/M: SY='Q'; M=  0,-35, 18, 11,-38, 13,-24,-16, 15,-28,-27, -4,-29, 30,-18, 27, 12, -3,-44,-30;
/M: SY='N'; M= -6,-32,-19,  1,-13,-22, -7, 12,  3, -8, -8, 37,-31,-11,-23,  8, 35,  5,-41,  1;
/M: SY='L'; M=-27, 52,-44,-26,  3,-47,-34, 13,-38, 56,  1,-41,-46,-16,-38,-27,-24, 14,-38,-19;
/M: SY='H'; M= -6,-34,-22, 15,-23,-33, 25,-14,-20,  0,  6,  1, -3, -4, -3, 13, 23, 20,-40, 13;
/M: SY='D'; M=-12,-39, 35, 29,-19,-30,  5,-37, 35,-21,-28,  7, -5, 16, -5,  6, -4,-34,-39,  4;
/M: SY='E'; M=  2,-38, 14, 29,-40,-15, -5,-15, 12,-35,-28, 14, 23,  7, 22,-10, 23,-29,-45,-31;
/M: SY='N'; M=  8, -3,-24,-12,-23,-30,-27,  1,-25, 21,-12, 41,-14,-24,-16, -3, 11, 25,-46,-27;
/M: SY='F'; M=-23,-36,-40,-30, 52,-27,-25, -5,-21, 32, 34,-32,-42, 11, 31,-30,-16,-15,-25, -6;
/M: SY='K'; M=-18,-37, 17, -1,  1,-30,  7,-13, 28, -6, 10, 21, 12,  9,-10,  6,  5,-15,-39, -8;
/M: SY='R'; M=-12,-40,-13,-10,-28,-36,-19,-25, 15,  0, 24,-22,-10,  8, 64, -5,-16, -8,-37,  0;
/M: SY='V'; M=  7,  7,-42,-38,  8,-41,-41, 29,-36, 19, -6,-22,-41,-36,-38,-18, -9, 54,-41,-21;
/M: SY='M'; M=-26,-33,-46,-39,-10,-45,-29, 29,-36, 46, 73,-24,-41,-30,-35,-36,-23, 20,-38,-17;
/M: SY='T'; M=  3,-33, -1, -7,-29,-31,-25,-18, 29, 10, -4,-17,-31, -1, 22, 11, 32,-14,-41,-26;
/M: SY='R'; M= 13,-38,  3, 30,-20, -1,-21,-36, 12,-17,-27,-18,-13, 12, 36, 17,-20,-31,-38,-16;
/M: SY='L'; M=-10,  1,-43,-36,-12,-45,-36, 30,-36, 45, 13,-38,-41, -3,-36,-30, -2, 34,-40,-21;
/M: SY='W'; M=-34,-16,-58,-42, 18,-38,-48,-22,-35, -4, 39,-50,-42,-33,-37,-28,-39,-21,147,  5;
/M: SY='K'; M=-12,-40, -2, 11,-19,-31, 18,-23, 47,-35,-26, 12,-30, 31, 34, -1, -7,-33,-38, -8;
/M: SY='E'; M= 19,-34,-20, 25,-30, -3,  4, 10,-13, -1,-18,  2,-30, 13,-14, 13, -4,  3,-42,-28;
/M: SY='V'; M= -9, 23,-38,-34, -6,-37,-38, 33,-33, 12, -9,-29,-37,-16,-36, 23,  5, 43,-43,-23;
/M: SY='L'; M=-27,-33,-47,-40, 30,-46,-33, 17,-38, 49, 41,-41,-43,-34,-37,-23,-14, 22, 19,-11;
/M: SY='E'; M=-11,-11, 26, 31,-37,-19, 11,-19,  8,-20, -4, 19,-29, 23,  6,  3,  7, -8,-46,-28;
/M: SY='T'; M= 20,-32,-22, 14,-32, 15,-29, 10,-10,-16, -1,  4,-29, -3,-17,  2, 28,  4,-43,-30;
/M: SY='M'; M=  1,-34,-44,-39, 41,-28,-30, 31,-36, 31, 48,-37,-40,-33,-36,-30, -9,  3,-26, 12;
/M: SY='E'; M=-19,-39, 24, 43,-11,-39, -3, -4,-18, 23,  4,-24,-14,  0, -2,-17,-17, -6,-38,  4;
/M: SY='E'; M=-13,-25, 17, 29,-15,-14,-20,-29, 18, -4,  6,  1,-31, 15, 23,  5,-14,-20, 14, -4;
/I:         I=-30; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
/M: SY='I'; M= 10,  4,-43,-36,-15,-41,-37, 39,-35, 33, 16,-37,-39, -5,-36,-28, -8, 33,-40,-22;
/M: SY='L'; M=-15,-33,-47,-40, -9,-47,-36, 35,-39, 51, 33,-42,-42,-34,-38,-35,-14, 28,-38,-19;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='L'; M=-30,-37,-26,-24, 12,-35,-36,  5,-22, 46, -5,-41,-46, -7,-37,-36, -9, 22,-39,-20; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='P'; M= 12,-48, 10,  4,-46,-22, -9,-28,-27,-43,-34,-29, 80, -8,-35,-15,-15,-37,-45,-18; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='P'; M=-15,-49,-29,-16,-51, 38,-33,-48, -6,-51,-40,  4, 65,-11,-10, -7,-26,-47,-47,-45; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='G'; M=-22,-44,-40,-15,-12, 35,-38,-22,-38, 28,  5,-18,-15,-35,-24,-24,-33,-13,-44,-32; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='P'; M=-17,-46,-32,-32,-49, -8,-26,-26, -4,-38,-39, 10, 34,-16,-34, 29, 10,-39,-56,-44; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='D'; M=-53,-27, 48,-12,-63,-56,-46,-58,-33,-37,-58,-15,-59,-44,-52,-21,-45,-34,-80,-38; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-11;
/M: SY='K'; M=-13,-62,-50,-39,-63,-53,-49,-43, 19,-33,-49,-43,-57, 16,-29, -1,-38,-53,-65,-54; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='P'; M=-44,-67,-14,-40,-65,-54, -8,-63, -9,-51,-54,-27, 31,-39, 15, -4,-28,-61,-70,-55; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-11;
/M: SY='S'; M=-37, -6,-31, 10,-53,  2,-41,-45,-38,-43,-50, -7,-50,-20,-23, 19,-28,-52,-59,-13; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-11;
/M: SY='H'; M=-21,-53,  7,  7, -8,-46, 27,-29,-21,-30,-38,  6,-48,-13,-13,-12,-28,-29,-52,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-11;
/M: SY='Q'; M=  3,-35, 11, 13,-40,  6,  6,-36,  4,-30, -1, 20,-14, 36, -1, 23, 14,-32,-44,-29;
/M: SY='R'; M=-24,-40,-25,-16,-33,-15,-11, -8, 38, -9,-21, -9,-34, 14, 58, -2, -2, -8,-39,-26;
/M: SY='P'; M=  9,-38,  3, -1,-13, -1,-26,-10,-21,-22, -4, 14, 51, -5, -4,  1,-18, 14,-41,-11;
/M: SY='F'; M=-29,-33,-41,-36, 49,-21,-29, -4,-13, 47, 11,-17,-44,-32, -6,-22,-13,  1,-27, -8;
/M: SY='T'; M= -4, -7, -8,-10,-23,-17, -9,-27,-20,-18,-25, 12, 19, -6,-13, 33, 53,-15,-45,-17;
/M: SY='P'; M=-12,-42,  1,  5,-18,-31, -6,-15, 10,-21, 15,-13, 63, 11, 15,  4, -7,-17,-41,-29;
/M: SY='Q'; M= -3,-37,  4, -2,-32,-15, 12,-32, 28,-16, -8, 11,-31, 32, 27, 12,  1,-23,-37,  7;
/M: SY='D'; M= -3,-41, 47, 43, 17,-32,-18,-38, -4,-33,-30,-14,-28, 46, -6, -9,-10,-35,-37, -8;
/M: SY='C'; M= -6, 62,-36,-33, -7,-36, 39, 15,-33, 19,  6,-28,-16,-29,-34, 13,-19, 17,-40,  9;
/M: SY='D'; M= 20,-36, 44, 21,-28,-11,  2,-34,  4,-17,-28, -8,  5, 13,-21,  8,  4,-24,-45,-30;
/M: SY='I'; M= -7,-36,-37,-33,-19,-30,-32, 41,-13, 16, 28, -5,-38,-25, 27,-27, -6, 26,-40,-23;
/M: SY='V'; M=-18,-33,-47,-41, 16,-47,-37, 34,-38, 37, 41,-41,-42,-36,-38,-34,-15, 43,-37,-16;
/M: SY='E'; M=-28,-40, 16, 44, 37,-37, 17,-29,  8, -5,-22, -6,-32,  3,  2,-12,-24,-30,-25, 32;
/M: SY='E'; M=-14,-14,  4, 36,-14,  0, -8,-21, 10,-12, -8,-11,-30, 17, 14,  7, -8,  0,-37,  1;
/M: SY='W'; M= 18,-39, 44,-20,-23,-29,-34,-14,-27, -5,-25, -9,-35,-26,-33,-11,  1, -3,108,-15;
/M: SY='L'; M=-32,-34,-48,-41, 41,-48,-31, 10,-41, 60, 15,-45,-47,-36,-38,-39,-27, -2, 22,  5;
/M: SY='D'; M= -7,-41, 37, 28,-44, -3, 24,-41, 12,-39,-31,  6, -4, 36, 18,  5,-16,-28,-46,-29;
/M: SY='T'; M=  8, -3,-28, -7, 18,-32,-29, 12,-27, 20,  8,  7,-34,-25,-21, 12, 27,  0,-37,-19;
/M: SY='L'; M=-20,-33,-47,-40, 11,-48,-33, 33,-40, 59, 27,-43,-44,-34,-38,-37,-14,  1,-33,-15;
/I:         I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
/M: SY='K'; M=-24,  5,-23, 14, -4,-25,-23,-10, 50, -6,  1,-13,-32, -1, 12,-10,-11,  7,-34,  7;
/M: SY='D'; M=-17,-42, 55, 33,-20,-31,-17,-26,  1,-35,-30, -1,-29, 51,  5, -2, -9,-19,-45,-28;
/M: SY='F'; M=-11, 20,-42,-33, 75,-41,-24,-11,-36,  9, -2,-21,-45,-38,-35,-24,-15,  1,-10, 49;
/M: SY='F'; M=-38,-35,-47,-26, 98,-46,-29,-12,-39, -1,  2,-39,-47,-33,-37,-36,-30,-18, -5, 24;
/M: SY='H'; M=-30, 30,-23,-24,-23,-35, 95,  7, -5, -8,  0, 20,-36,-18,-10,-23, -9,-26, 29, 14;
/M: SY='A'; M= 55,-28, -1,-21,-38,  4,  3,-31,-22,-33,-27, 19,-30,-20,-13, 17, 10,-14,-44,-32;
/M: SY='G'; M= -6, 35, 25, 33,-23, 39,-24,-41, -8,-40,-34, 17,-24,-16,  6, -4,-22,-25,-44,-34;
/M: SY='G'; M=-12,-40, 17,-11,-24, 78,-31,-48,-29,-45,-37,-13,-31,-12,-36,-14,-21,-37,-39,-37;
/M: SY='N'; M=-14,  4, 41, 43,-42,-14,  7,-39,  6,-26,-31, 45,-29, 17,-11, -8,-19,-28,-50,-32;
/M: SY='G'; M=-14,-40,-25,-12,-44, 78,-30,-33,-17,-43,-12, -3,-31, -7,-21, -4,-28,-41,-38,-38;
/M: SY='L'; M=-17,-34,-39,-23,-14, -7,-33, 10,-35, 51, -2,-36, 23,-31,-37,-17,  1, 12,-38,-23;
/M: SY='P'; M= -7,-39,-24, -6,-39, -6,-28,-17, 25,-28,-28, -4, 68,-18,-20, 29,-15, -8,-42,-35;
/M: SY='M'; M=-13,-37,-28,  6,-12,-37,-26, -2, 28, 18, 28,-25, 21,  1, 12, -7, -4,  1,-38,-24;
/M: SY='E'; M= -5,-38, 36, 45,-39, -3, -7,-37,  0,-32,-32,  7,  6,  0,-21,  4, 22,-27,-45,-13;
/M: SY='F'; M=  9, -2,  7,  1, 40,-20,-19,  3,-19, 10,-15,  9,-36,-10,-30, -9,  2,  9,-33,-14;
/M: SY='L'; M=-17,-32,-42,-24,  6,-24,-35, 16,-37, 48, 12,-39,-21,-33,-37,-21,-13, 35,-37,-19;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50;
/M: SY='K'; M=-36,-51, -4,  3,-50,-45, 35,-43, 45,-45,-37,-11,-40,  7, -3,-30, -9,-14,-55,-36; D=-20;
/I:         I=-20; DM=-50;
/M: SY='S'; M=-11,-33, 28, 25,-38,-16,-20,-23, -5,-28,-31, 28,-27,-12,-10, 45, 24,-29,-48,-31;
/M: SY='P'; M=-16,-44, 33, 20,-43,  3,-21,-40, 19,-42,-32, 12, 57, 18,  5,-19,-22,-31,-42,-14;
/M: SY='E'; M=-15,-41, 38, 42,-25,-33, 19,-23, 21,-23,-27,-13,-11, 32, -6, -9,  2,-18,-43,-16;
/M: SY='Y'; M= 12,-36,-36,-33, 19,-33,  5,-14,-31, 21, -5,-32,-41,-26,-30,  9,-22, -5, 37, 70;
/M: SY='H'; M=  1,-39,-19, 12,-35,-30, 51,-34, 28,-17, -2, -4,-29, 47,  4,  5,  4,-32, 32,-20;
/M: SY='S'; M=  1,-35,  2, 19,-34,-16, -1,-30, -4,-18,-24,  8, -7, 15, 23, 32,  7, -9,-42, -9;
/M: SY='L'; M= -5,-33,-45,-38, -1,-45,-36, 30,-34, 46, 16,-40,-42,-33, -9,-32,-12, 33,-38,-19;
/M: SY='R'; M=-14,-40,-22, 16,-30,-36,  8,-16, 33,  8, 23, -6,-11, 27, 38,-23,-23,-12,-39,-24;
/M: SY='Y'; M= -9,-37,-16,  0,-17, -6,-11,-14, -2,  7, -3,  8,-17, 12,  8, 21,-11,-12,-27, 42;
/M: SY='V'; M= 14,-33,-16,-19,-17,-39,-35, 34,-29, 22, -6,-33,-38,-29, -1,-25, -3, 37,-39, -1;
/M: SY='L'; M=-21,-36,-37,-32, -9,-29,-21, 23,-21, 47, -2,  0, 26, -5,-22,-31,-23, 10,-38,-22;
/M: SY='Q'; M= -6,-37, 17, 11,  8,-21,-22,-28, -2, -8,-24,-17, 11, 37,  1, 33, -8,-13,-38,-23;
/M: SY='L'; M=-22,-34,-45,-39, 36,-46, -6,  0,-39, 58,  3,-43,-47,-34,-36,-37,-27, -1,-22, 35;
/M: SY='Y'; M=-31,-41,-30,-30, 23,-37, 49,-12,-26, -6, 36, -2,-41,  8,-24,-15,-26,-23, -7, 84;
/M: SY='D'; M= -3,-35, 35, -5, 16,  7,-24,-31,  8,-23,-28,-13, -9,  2,  4, 20, 22,-20,-39,-23;
/M: SY='Q'; M=-13,  1, -9,  9,-11,-25,-20,-16, -2, 13,  4,-10,-32, 54,  0, -9, 20,-14,-35,  6;
/M: SY='P'; M=  0,-37, 34, 28,-42,-25,-23,-37, -2,-39,-24,  4, 44, -8,-23, 30, 20,-32,-47,-34;
/M: SY='T'; M= -7,-27,-11,-22,-32,-27,-29,-22,-12,-21,-24,  2,  7,-22,-27, 27, 72, -4,-49,-30;
/M: SY='D'; M=-24, -9, 58, 42,-45,-11,-18,-45, -3,-42,-36, 11,  0,  7, 16,  2, -1,-40,-50,-34;
/M: SY='Q'; M=  3,-37, 15, 29, -8,-28,  2,-20,  8,-27,  2, 11,-29, 38, -7, 14,  5,-21,-38, -1;
/M: SY='L'; M=-29,  3,-47,-40,  4,-32,-32,  6,-41, 68,  7,-45,-47,-35,-39,-39,-26,  2,-34,-17;
/M: SY='I'; M=-27, -3,-43,-37,-16,-48,-39, 68,  5,  6, 35,-34,-12,-20,-32,-33,-14, 16,-38,-21;
/M: SY='E'; M=-20,-43, 34, 45,-42,-34, 27,-39, 29,-30,-13,-13,-27, 34, 25,-11,-23,-25,-44,-27;
/M: SY='Q'; M=-17,-37, 21, 25,-17,-34,-21,-26, 21, -9, 14,-16,-29, 33, 12, -7, 27,-10,-42,-26;
/M: SY='F'; M=-28, 37,-39,-37, 63,-39,  1, -3,-34,  6,-13,-32,-44,-16,-33, 11,-22,  0,-13, 53;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;
» More

Post-processing [info]

PROMOTED_BY PS51258

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 18 in 18 different sequences
Number of true positive hits 18 in 18 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MHD2
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
18 sequences

BAIP3_HUMAN (O94812), BAIP3_MOUSE (Q80TT2), GIT1_SCHPO  (Q9P7K5), 
UN13A_HUMAN (Q9UPW8), UN13A_MOUSE (Q4KUS2), UN13A_RAT   (Q62768), 
UN13B_HUMAN (O14795), UN13B_MOUSE (Q9Z1N9), UN13B_RAT   (Q62769), 
UN13C_HUMAN (Q8NB66), UN13C_MOUSE (Q8K0T7), UN13C_RAT   (Q62770), 
UN13D_HUMAN (Q70J99), UN13D_MOUSE (B2RUP2), UN13D_RAT   (Q9R189), 
UNC13_CAEEL (P27715), YDY2_SCHPO  (O13683), YO296_YEAST (Q08748)
» More

PDB
[Detailed view]
1 PDB

3SWH

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission