ID COS; MATRIX. AC PS51262; DT 01-NOV-2006 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE COS domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=59; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=54; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9286619; R2=0.0150344; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3689.9523926; R2=2.8761904; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=504; H_SCORE=5140; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=371; H_SCORE=4757; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='L'; M=0,-13,-9,-17,-13,6,-18,-7,22,-10,29,25,-13,-31,-16,-16,-16,1,13,-26,12,-13; MA /M: SY='E'; M=1,8,-19,17,25,-26,-13,-14,-21,20,-13,0,-1,3,7,-1,-1,-11,-19,-21,-13,17; MA /M: SY='E'; M=3,2,-2,11,40,-35,-17,-4,-26,13,-12,-9,-5,3,24,1,-1,-14,-25,-16,-19,36; MA /M: SY='P'; M=-3,-2,-25,-6,-4,-25,-6,5,-15,0,-19,-15,6,32,-2,-11,1,8,-22,-39,-20,-6; MA /M: SY='D'; M=-1,18,-25,32,7,-28,2,-9,-25,-1,-11,-19,4,-8,-4,-10,1,-11,-21,-23,-13,2; MA /M: SY='H'; M=3,-14,-28,-14,-3,-19,-12,7,-6,3,-5,4,-11,5,3,-3,-4,3,-10,-23,-7,-3; MA /M: SY='A'; M=19,-5,-24,-5,-1,-18,-7,-14,0,-1,-10,-4,-5,2,0,-13,10,11,3,-39,-25,-3; MA /M: SY='A'; M=9,-5,4,-3,-1,-16,-13,-22,-1,-8,-1,-1,-8,-17,-5,-9,-3,-1,4,-30,-19,-2; MA /M: SY='F'; M=-22,-29,-33,-43,-34,82,-29,-24,-3,-9,18,-20,-15,-27,-26,-9,-11,-17,6,12,33,-35; MA /M: SY='L'; M=-3,-11,-7,-13,-13,10,-19,-11,20,-15,28,16,-14,-28,-18,-18,-12,6,14,-25,17,-13; MA /M: SY='Q'; M=7,-11,-19,-12,9,-22,-20,-5,-11,-3,-13,-6,-10,-6,56,23,-9,2,-17,-14,-6,25; MA /M: SY='A'; M=13,-5,-21,-10,-8,-10,-12,-17,9,-5,-2,3,-1,-14,2,-11,5,13,9,-35,-13,-6; MA /M: SY='A'; M=23,-3,-28,-3,-3,-16,0,-7,-2,-3,-12,-1,-2,-11,-1,-11,16,9,2,-39,-27,-6; MA /M: SY='K'; M=-1,3,-25,3,10,-15,-10,-14,-20,22,-20,4,5,6,7,14,0,-7,-20,-25,-14,6; MA /M: SY='Q'; M=9,1,-16,-1,10,-22,-12,-7,-7,2,-10,-4,4,-7,14,-4,2,2,-10,-30,-19,10; MA /M: SY='L'; M=-4,-11,-7,-15,-15,11,-18,-14,25,-18,28,13,-13,-27,-19,-21,-11,5,17,-25,16,-15; MA /M: SY='I'; M=1,-11,-18,-19,-16,-1,-16,-10,25,-13,15,11,-6,-20,-13,-21,-6,8,18,-32,1,-15; MA /M: SY='D'; M=1,16,-16,19,14,-25,-12,-1,-15,5,-9,-3,14,-8,1,-10,-2,-6,-17,-37,-17,9; MA /M: SY='R'; M=-4,-11,-21,-7,2,-13,-11,-11,-21,11,-16,1,-12,-5,22,40,-6,-17,-15,-7,-5,7; MA /M: SY='I'; M=6,-17,-21,-25,-22,-3,-16,-18,34,-13,8,4,-8,-20,-18,-19,-4,8,29,-32,-6,-23; MA /M: SY='A'; M=10,-3,-23,-5,-1,-18,-5,-17,-9,4,-11,-1,-1,-4,4,-5,10,10,-5,-28,-16,0; MA /M: SY='D'; M=4,8,-8,15,2,-22,-14,-15,-12,2,-4,1,3,-16,-5,-5,-1,-1,-7,-33,-16,-2; MA /M: SY='A'; M=19,1,-22,-5,-8,-14,-2,-16,2,-4,-2,7,5,-13,-1,-16,7,14,4,-41,-22,-6; MA /M: SY='S'; M=10,-1,-18,0,7,-23,-10,-10,-9,1,-12,-10,-3,2,8,-10,13,11,-9,-31,-19,5; MA /M: SY='K'; M=4,-6,-23,-7,9,-11,-8,-13,-16,15,-13,5,-3,-5,13,12,-3,-10,-15,-17,-13,9; MA /M: SY='T'; M=9,-1,-13,-4,-7,-11,-10,-18,-4,-7,-4,-5,1,-13,3,-12,6,12,-2,-32,-15,-4; MA /M: SY='W'; M=-12,-14,-10,-10,-4,-2,-7,-23,-15,-8,-8,-15,-21,-18,-8,-5,2,-8,-12,30,6,-7; MA /M: SY='H'; M=-4,-5,-23,-9,-3,-12,-20,19,-3,-9,-2,2,1,-11,5,-8,-4,3,-7,-31,0,0; MA /M: SY='I'; M=3,-7,-21,-10,-9,-7,-3,-18,4,-4,-1,1,-6,-14,-5,-6,1,4,2,-22,-6,-9; MA /M: SY='E'; M=-5,-9,-14,-6,15,-19,-7,2,-18,3,-8,-7,-13,4,12,3,-6,-16,-21,-10,-8,15; MA /M: SY='R'; M=0,-1,-22,3,-4,-13,-15,-13,-10,7,-7,6,-1,-14,3,17,-5,-8,-4,-25,-7,-4; MA /M: SY='P'; M=-2,-12,-19,-8,0,-20,-15,-5,-12,1,-8,-11,-17,33,2,-3,-5,4,-12,-28,-8,-1; MA /M: SY='E'; M=3,-1,-11,3,24,-30,-15,-5,-17,9,-12,-9,-3,13,17,-7,-1,-4,-20,-24,-18,22; MA /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; MA /M: SY='P'; M=-6,-11,-21,-11,-1,-7,-15,3,-10,2,-8,-6,-11,19,-1,1,-8,-5,-13,-21,-3,-3; D=-12; MA /I: I=-12; DM=-25; MA /M: SY='G'; M=3,-3,-27,-4,-10,-19,21,-23,-4,-4,-9,-8,-5,-13,-11,-8,-1,-7,-7,-12,-14,-10; MA /M: SY='Y'; M=-13,-14,-33,-14,-15,20,-18,-12,-2,-5,10,-7,-11,-19,-13,-9,0,2,4,-1,26,-17; MA /M: SY='E'; M=1,4,-13,17,30,-37,-16,6,-28,8,-14,-15,-8,15,15,-5,0,-10,-26,-24,-17,24; MA /M: SY='N'; M=3,10,-16,6,5,-16,-7,-12,-10,6,-15,-7,16,-10,-4,-8,14,6,-13,-35,-20,0; MA /M: SY='M'; M=2,-21,-20,-32,-14,8,-22,2,10,8,17,31,-4,-36,-14,-6,-15,-5,6,-20,-1,-15; MA /M: SY='D'; M=2,33,-26,53,2,-28,-9,-18,-27,0,-10,-21,14,-15,-8,-7,2,-6,-15,-38,-13,-5; MA /I: I=-15; MD=-32; MA /M: SY='H'; M=-12,-15,-33,-14,-2,-12,-23,64,-10,-12,-3,7,-10,0,0,-7,-7,-9,-13,-26,6,-1; D=-15; MA /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='F'; M=-16,-23,-13,-33,-26,54,-27,-20,6,-12,24,-3,-15,-35,-24,-11,-14,-11,11,-1,26,-26; MA /M: SY='T'; M=6,-1,-21,-4,-10,-20,-15,-12,-5,-2,-6,-1,6,-2,4,-7,6,18,-1,-38,-13,-6; MA /M: SY='I'; M=2,-15,-13,-18,-20,10,-21,-20,33,-19,22,10,-15,-32,-22,-17,-13,4,30,-27,11,-20; MA /M: SY='D'; M=3,36,-27,59,3,-36,-10,-14,-25,-2,-10,-19,16,-14,-10,-11,1,-4,-13,-44,-15,-4; MA /M: SY='F'; M=-1,-11,-23,-19,-25,25,-23,-24,5,-11,8,-8,-3,-22,-17,-18,3,14,14,-24,8,-23; MA /M: SY='E'; M=7,4,-10,7,24,-26,-8,-11,-16,11,-12,-6,0,-3,4,-9,5,-6,-15,-24,-21,17; MA /M: SY='H'; M=-2,-2,-27,4,8,-30,-10,23,-22,0,-16,-6,-4,10,10,3,-4,-12,-23,-30,-15,7; MA /M: SY='E'; M=0,-9,-7,-7,11,-10,-21,-1,3,-5,9,5,-14,-14,0,-11,-9,-5,0,-22,1,9; MA /M: SY='A'; M=13,-2,-20,3,9,-21,-8,-11,-13,6,-10,2,-5,-8,12,5,2,-4,-8,-27,-20,9; MA /M: SY='R'; M=3,-4,-23,-2,1,-15,-13,-9,-15,7,-11,1,-2,-10,13,14,1,-2,-10,-20,-7,3; MA /M: SY='A'; M=19,-8,-20,-9,-3,-14,-12,-11,3,1,2,16,-5,-18,1,-5,-1,6,8,-36,-17,-3; MA /M: SY='L'; M=-7,-13,-6,-19,-16,14,-17,-13,33,-20,34,17,-14,-30,-20,-23,-17,0,19,-23,17,-16; MA /M: SY='Q'; M=0,-9,-24,-4,7,-23,-20,12,-18,2,-9,1,-10,-5,26,16,-6,-6,-15,-18,-4,13; MA /M: SY='Q'; M=6,2,-10,-3,7,-21,-13,-3,-13,3,-13,1,9,-6,11,-2,3,2,-13,-35,-23,8; MA /M: SY='L'; M=-5,-12,-8,-17,-16,11,-13,-13,27,-18,30,16,-14,-30,-20,-20,-16,-1,15,-21,16,-16; MA /M: SY='D'; M=0,33,-28,49,2,-27,-10,-10,-25,1,-10,-16,19,-13,-9,-10,-1,-6,-17,-42,-14,-4; MA /M: SY='F'; M=-20,-29,-31,-43,-32,78,-27,-23,-4,-7,14,-22,-14,-19,-25,-10,-10,-17,3,7,26,-34; MA /M: SY='I'; M=-1,-11,-9,-18,-13,-1,-3,-17,7,-10,7,3,-7,-21,-8,-10,-5,-2,2,-19,-6,-12; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=38(38); /POSITIVE=38(38); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=COS; CC /VERSION=5; DR Q9BXM9 , FSD1L_HUMAN, T; Q8BYN5 , FSD1L_MOUSE, T; DR Q05B84 , FSD1_BOVIN , T; Q1LY10 , FSD1_DANRE , T; DR Q9BTV5 , FSD1_HUMAN , T; Q4R539 , FSD1_MACFA , T; DR Q7TPM6 , FSD1_MOUSE , T; O15344 , TRI18_HUMAN, T; DR O70583 , TRI18_MOUSE, T; P82457 , TRI18_MUSSP, T; DR P82458 , TRI18_RAT , T; Q9NQ86 , TRI36_HUMAN, T; DR Q80WG7 , TRI36_MOUSE, T; Q8IWZ5 , TRI42_HUMAN, T; DR Q9D2H5 , TRI42_MOUSE, T; Q7Z4K8 , TRI46_HUMAN, T; DR Q7TNM2 , TRI46_MOUSE, T; A0A0G2JXN2, TRI46_RAT , T; DR Q58D15 , TRI54_BOVIN, T; Q9BYV2 , TRI54_HUMAN, T; DR Q9ERP3 , TRI54_MOUSE, T; Q5REJ9 , TRI54_PONAB, T; DR Q5XIH6 , TRI54_RAT , T; Q9BYV6 , TRI55_HUMAN, T; DR G3X8Y1 , TRI55_MOUSE, T; Q5PQN5 , TRI55_RAT , T; DR Q969Q1 , TRI63_HUMAN, T; Q38HM4 , TRI63_MOUSE, T; DR Q91Z63 , TRI63_RAT , T; Q6ZTA4 , TRI67_HUMAN, T; DR Q505D9 , TRI67_MOUSE, T; Q9UJV3 , TRIM1_HUMAN, T; DR Q9QUS6 , TRIM1_MOUSE, T; Q29RQ5 , TRIM9_BOVIN, T; DR M9MRI4 , TRIM9_DROME, T; Q9C026 , TRIM9_HUMAN, T; DR Q8C7M3 , TRIM9_MOUSE, T; Q91ZY8 , TRIM9_RAT , T; 3D 5IM8; PR PRU00586; DO PDOC51262; //