Entry: PS51282

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] DWNN
Accession [info] PS51282
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2006 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); FEB-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51282
Associated ProRule [info] PRU00612

Name and characterization of the entry

Description [info] DWNN domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=74;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=69;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.1394737; R2=0.0103333; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6159.29747; R2=16.65696; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=519; N_SCORE=8.5; H_SCORE=13189; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=326; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11573; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-31; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='V'; M=-28,-74,-30,-34,-58,-26,-84,-70, 57,-54,  8,  4,-70,-64,-54,-64,-44,-18, 63,-54,-46,-58;
/M: SY='H'; M=-45,-36,-64,-48,-47, 10,-66, 49,-51,-40,-44,-43,-19,-60,-21,-33,-37,-42,-56,-21, 46,-38;
/M: SY='Y'; M=-50,-61,-57,-71,-71, 50,-80,  3,-37,-51,-35,-45,-53,-70,-43,-51,-50,-50,-47, 17,109,-61;
/M: SY='K'; M=-22,-25,-80,-35, -5,-60,-52,-25,-62, 83,-60,-40,-12,-35, 15, 47,-22,-30,-52,-78,-50, -2;
/M: SY='F'; M=-50,-72,-42,-75,-79, 97,-79,-42,-20,-61,  2, -9,-71,-71,-59,-61,-52,-51,-29,  7, 34,-69;
/M: SY='K'; M=-22,-31,-72,-40,-16,-55,-46,-26,-56, 43,-47,-34,-18,-42,  6, 30,-19,-29,-49,-71,-50,-10;
/M: SY='S'; M= 20,-16,-31,-26,-22,-49,-20,-23,-49,-21,-56,-39, -7,-29,-18,-29, 69, 11,-38,-67,-47,-19;
/M: SY='Q'; M=-10,-14,-65,-18, 14,-64,-36,-14,-61,  8,-57,-35, -6,-39, 36, -6,-13,-21,-48,-65,-52, 21;
/M: SY='K'; M=-30,-47,-68,-53,-30,-39,-64,-37,-29, 25,-12,-16,-34,-49,-11, 12,-36,-33,-31,-67,-46,-25;
/M: SY='D'; M=-40, 40,-68, 50, 16,-74,-39,-22,-71,-20,-72,-62, 30,-48,-13,-36,-11,-17,-27,-40,-63,  2;
/M: SY='Y'; M=-37,-49,-62,-55,-45,  6,-69,-15,-46,-32,-44,-41,-44,-27,-29,-42,-34,-38,-47,-22, 35,-40;
/M: SY='S'; M=-19, 12,-55, 21, -5,-57,-34,-31,-61,-11,-65,-53,  0,-39,-17,-31, 28, -9,-25,-43,-54,-12;
/M: SY='T'; M=-15,-29,-50,-38,-25,-53,-51,-29,-45, -3,-49,-30,-15,-43,-17, 19,  7, 26,-29,-69,-50,-21;
/M: SY='I'; M=-33,-76,-34,-50,-63,-20,-84,-68, 54,-56, 24, 10,-70,-66,-54,-64,-48,-24, 48,-54,-44,-61;
/M: SY='T'; M= -8,-24,-48,-30,-17,-51,-41,-15,-45,-20,-45,-29,-16,-33,  1,-26,  9, 13,-32,-63,-45,-10;
/M: SY='F'; M=-46,-70,-28,-80,-78, 84,-79,-45,-14,-60,  0,  0,-67,-69,-57,-60,-48,-45,-24,-11, 22,-68;
/M: SY='D'; M=-44, 43,-81, 76, 34,-78,-44,-25,-76,-20,-76,-69,  3,-47, -1,-40,-20,-37,-13,-18,-67, 16;
/M: SY='G'; M=-10,-30,-70,-40,-60,-80, 90,-60,-90,-50,-80,-70,-20,-60,-50,-60,-20,-50,-80,-70,-80,-50;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='T'; M=-22,-44,-45,-54,-44,-38,-53,-47,-19,-39, -7, -9,-35,-38,-33,-43,-16, 20,-16,-64,-50,-39;
/M: SY='H'; M=-27,-28,-62,-40,-46,-28, -5,  7,-65,-41,-56,-48,-14,-56,-29,-40,-18,-38,-63,-51,-25,-37;
/M: SY='I'; M=-40,-80,-33,-80,-69,-17,-88,-68, 70,-59, 28, 17,-69,-69,-57,-68,-51,-31, 33,-58,-40,-68;
/M: SY='S'; M= -1,-19,-41,-30,-24,-53,-34,-31,-51,-17,-57,-37, -9,-21,-21,-16, 51, 21,-39,-71,-52,-22;
/M: SY='V'; M=-22,-67,-38,-18,-54,-31,-59,-67, 21,-52,  3, -4,-64,-62,-50,-60,-41,-20, 47,-52,-52,-52;
/M: SY='F'; M=-25,-53,-41,-46,-49,  7,-35,-45,-48,-50,-39,-35,-51,-61,-43,-54,-35,-44,-44,-13,-16,-44;
/M: SY='D'; M=-39, 26,-76, 49, 30,-72,-47,-23,-68,-18,-64,-57,  0,-47,  4,-36,-20,-31,-21,-33,-63, 17;
/M: SY='L'; M=-39,-80,-49,-77,-69, -1,-80,-60, 21,-60, 77, 29,-70,-70,-50,-60,-59,-39,  3,-50,-40,-60;
/M: SY='K'; M=-20,-26,-74,-26, -6,-56,-54,-35,-48, 81,-53,-35,-17,-34, 11, 19,-22,-28,-34,-76,-50, -6;
/M: SY='R'; M=-30,-32,-79,-38, -5,-53,-60, -7,-65, 29,-59,-43,-20,-47,  3, 53,-29,-32,-56,-64,-35, -2;
/M: SY='E'; M=-29,-11,-83,  1, 64,-63,-59,-18,-65,  9,-62,-42,-21,-41, 26,-10,-22,-31,-49,-70,-56, 49;
/M: SY='I'; M=-40,-80,-30,-80,-70,-20,-90,-70, 80,-60, 20, 10,-70,-70,-60,-70,-50,-30, 40,-60,-40,-70;
/M: SY='I'; M=-35,-71,-15,-72,-64,-11,-81,-57, 32,-54,  2, 11,-60,-66,-44,-61,-44,-30, 12,-49,-30,-58;
/M:         M=-16,-26,-55,-35,-18,-49,-40,-33,-37,-16,-28,-20,-12,-48,-13,-24,-20,-18,-34,-66,-52,-16;
/M: SY='Q'; M=-21,-12,-66,-17,  1,-60,-45,-12,-61, 27,-58,-35, -2,-39, 37, 10, -5,-17,-46,-61,-48, 11;
/M: SY='K'; M=-28,  4,-70, -8, 15,-67,-43,-15,-66, 22,-66,-46, 22,-42,  5,  9, -8,-20,-57,-78,-55,  9;
/M: SY='K'; M=-28,-19,-73,-31,-13,-56,-46, -1,-60, 33,-52,-37,  0,-43, 13, 19,-23,-30,-55,-69,-42, -7;
/M: SY='L'; M=-36,-75,-49,-77,-66, -7,-67,-58, 11,-56, 60, 40,-63,-66,-44,-56,-54,-37, -5,-49,-44,-56;
/M: SY='G'; M=-16,-27,-70,-28,-37,-69, 25,-50,-68, -1,-66,-54,-20,-50,-26,-31,-22,-40,-53,-69,-67,-32;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='N'; M=-10,  3,-40,  1, -5,-42,-24,-14,-42,  4,-42,-32,  6,-27, -1,  0,  1,-13,-26,-36,-35, -4; D=-13;
/I:         I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='G'; M= -7,-33,-50,-41,-48,-54, 25,-50,-51,-41,-44,-41,-24,-50,-40,-49, -1,-25,-47,-62,-60,-42; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='T'; M=-13,-21,-46,-28, -5,-46,-46,-30,-32,  4,-35,-22,-16,-35, -4,-14, -5, 18,-21,-61,-45, -6; D=-13;
/I:         I=-13; DM=-27;
/M: SY='D'; M=-49, 35,-74, 67,  3,-59,-47,-34,-64,-36,-55,-62, -5,-54,-26,-52,-27,-41, -2, -6,-60,-12;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='F'; M=-39,-61,-15,-69,-69, 71,-68,-40,-17,-54, -3,-11,-58,-62,-52,-54,-39,-40,-25,-12, 18,-61; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='D'; M=-43, 42,-77, 67, 24,-76,-41,-21,-75,-18,-74,-66, 14,-48,  2,-38,-18,-35,-18,-22,-64, 12;
/M: SY='L'; M=-40,-80,-49,-80,-70, -1,-81,-61, 23,-60, 77, 29,-70,-70,-51,-61,-59,-39,  2,-51,-40,-61;
/M: SY='Q'; M=-19,-41,-58,-40,-24,-42,-52,-23,-34, -5,-21,-12,-30,-48, 10, -9,-21,-25,-28,-58,-44,-12;
/M: SY='I'; M=-39,-78,-37,-72,-69, -3,-85,-64, 47,-59, 36, 14,-70,-69,-56,-65,-52,-33, 25,-50,-34,-65;
/M: SY='Y'; M=-27,-40,-47,-48,-42, -2,-60,-15,-37,-33,-39,-33,-31,-53,-18,-38, -9, -5,-33,-27, 23,-34;
/M: SY='N'; M=-39, 38,-58, 15,-13,-67,-30,  5,-69, -9,-69,-53, 73,-48, -9,-21, -6,-15,-56,-65,-47,-15;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M= 28,-27,-35,-35,-26,-49,-12,-35,-45,-22,-42,-33,-22,-12,-22,-32,  7,-14,-33,-59,-50,-21; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q'; M=-25, -5,-71,  8, 22,-62,-50,  4,-60, -6,-57,-40,-11,-43, 38,-20,-17,-29,-34,-48,-46, 26;
/M: SY='T'; M=-15,-11,-38,-25,-21,-54,-47,-33,-39,-24,-46,-26, -3,-41,-15,-28, 14, 63,-16,-63,-51,-20;
/M: SY='N'; M=-28,  5,-65, -5,-16,-65,-28,-26,-65,  7,-62,-48, 20,-29, -9,-20,-11,-23,-49,-65,-57,-16;
/M: SY='E'; M=-31,  9,-82, 22, 63,-76,-52,-21,-69,  7,-70,-52, -4,-40, 11,-18,-14,-28,-44,-69,-65, 42;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M=-26,  0,-79, 18, 88,-70,-53,-18,-61,  0,-61,-44,-18,-35, 18,-18,-18,-26,-44,-70,-61, 61; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='Y'; M=-45,-61,-54,-70,-66, 23,-78, -8,-22,-50,-24,-28,-50,-67,-41,-50,-45,-37,-33, -1, 75,-58;
/M: SY='K'; M=-27,-13,-65,-16, -4,-47,-53,-24,-51,  1,-47,-39,-10,-46,-10,-17,-19,-16,-36,-53,-34, -8;
/M: SY='D'; M=-42, 43,-71, 72,  9,-72,-39,-30,-71,-29,-69,-68,  9,-49,-21,-47, -8,-31, -8,-15,-65, -6;
/M: SY='D'; M=-44, 41,-83, 74, 46,-80,-46,-27,-77,-20,-77,-70,  0,-47, -7,-40,-20,-37,-16,-26,-70, 22;
/M: SY='N'; M=-15,  1,-52, -4,-14,-54,-32,-22,-57,-22,-58,-45,  6,-44,-10,-32, -1, -4,-34,-48,-39,-13;
/M: SY='Q'; M=-18,-26,-53,-22, -6,-28,-54,-29,-40,-22,-36,-17,-29,-46,  1,-32,-16,-15,-23,-45,-38, -3;
/M: SY='L'; M=-32,-73,-43,-53,-57,-15,-78,-59, 25,-50, 39, 27,-64,-63,-38,-55,-49,-28, 24,-50,-44,-49;
/M: SY='I'; M=-37,-79,-30,-70,-67,-21,-89,-70, 75,-59, 17,  9,-70,-69,-59,-69,-49,-27, 45,-59,-41,-67;
/M: SY='P'; M=-12,-44,-71,-46,-38,-67,-47,-47,-67,-29,-68,-49,-42, 88,-37,-47,-12,-31,-57,-78,-67,-37;
/M: SY='R'; M=-26,-35,-76,-45,-15,-55,-57,-21,-59, 50,-52,-25,-19,-43,  6, 61,-27,-29,-51,-71,-50, -9;
/M: SY='N'; M=-19, 25,-42, -2,-20,-62,-20,-12,-62,-14,-66,-46, 65,-42,-14,-24, 37,  2,-58,-76,-50,-20;
/M: SY='S'; M=  0,-15,-30,-30,-25,-50,-35,-35,-40,-25,-50,-30, -5,-35,-25,-30, 56, 54,-25,-70,-50,-25;
/M: SY='S'; M= -5,-20,-38,-31,-26,-36,-36,-14,-46,-25,-50,-31, -9,-38,-17,-30, 49, 13,-38,-59,-31,-23;
/M: SY='V'; M=-25,-72,-32,-18,-55,-26,-81,-69, 43,-52, 11,  4,-70,-62,-51,-61,-43,-16, 67,-51,-48,-54;
/M: SY='I'; M=-38,-79,-35,-73,-68,-16,-86,-67, 60,-59, 34, 14,-70,-69,-56,-66,-52,-31, 33,-56,-41,-65;
/M: SY='V'; M=  5,-63,-27,-34,-49,-34,-61,-61, 26,-43, -7, -7,-61,-50,-43,-53,-27,-15, 40,-55,-48,-46;
/M: SY='R'; M=-19,-29,-69,-38,-12,-58,-49,-14,-63, 28,-59,-38,-13,-42, 12, 52, -3,-20,-53,-69,-49, -3;
/M: SY='R'; M=-30,-40,-80,-50,-20,-60,-60,-10,-70, 30,-60,-40,-20,-50,  0,100,-30,-30,-60,-70,-50,-10;
/M: SY='I'; M=-25,-61,-29,-46,-54,-18,-70,-56, 20,-48,  3, -3,-54,-59,-42,-55,-21,-19, 18,-54,-40,-50;
/M: SY='P'; M=-20,-50,-80,-50,-40,-70,-60,-50,-70,-30,-70,-50,-50,120,-40,-50,-30,-40,-60,-80,-70,-40;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_03 which contains 542'782 sequence entries.


Total number of hits 4 in 4 different sequences
Number of true positive hits 4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DWNN
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
4 sequences

MPE1_YEAST  (P35728), RBBP6_HUMAN (Q7Z6E9), RBBP6_MOUSE (P97868), 
YORF_SCHPO  (O94264)
» More

PDB
[Detailed view]
1 PDB

2C7H

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission