Entry: PS51290

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CRIC
Accession [info] PS51290
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2007 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51290
Associated ProRule [info] PRU00621

Name and characterization of the entry

Description [info] CRIC domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=88;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=83;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9025878; R2=0.0097541; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-2151.39409; R2=32.50739; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=779; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19824; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=574; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16508; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-5; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M=  0, 40,-10, 10,-10,-10,  0,-10,  0,  0,-20,  0, 80,-30,-10,-20,  0, 10,-20,-70,-40,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='Q'; M=  7, -7,-23, -7, 20,-24,-17, -6,-20, 13,-20,  0, -7,  3, 54, 24, -7, -3,-27,-13,-10, 30;
/M: SY='F'; M=  0,-10,-23,-20,-20, 23,-16,-20, -3, -7,  0,-14,  0,-17,-13,-16, 17, 16,  3,-23,  0,-20;
/M: SY='L'; M= -3,-13, -7,-17,-10,  7,-20,  0, 17, -7, 33, 33,-13,-33,-17,-13,-20,  0,  7,-23, 17,-10;
/M: SY='T'; M= 20,  0,-23, -3, -7,-17, -7,-17, -3, -3,-10, -3,  3, -7,  0,-17, 23, 27,  4,-44,-23, -7;
/M: SY='H'; M=-10,-10,-13, -6, 17,-17,-23, 42,-10, -6,  7, 10,-13, -3,  0,-13,-10,-13,-17,-26,  3, 14;
/M: SY='H'; M= -7, -7,-40,-10,  0,-24, 14, 30,-17,  3,-17,  6, -3,  3, -7, -7, -3,-17,-27,-20,-14, -4;
/M: SY='L'; M= -3,-13, -7,-13,-17, 17,-23,-17, 27,-20, 30, 13,-20,-33,-23,-17,-17,  3, 23,-23, 23,-17;
/M: SY='N'; M= 10,  9,-13,  0, -7, -3, -7,-13,  7, -7,  4, 10, 19,-23, -7,-17, -4,  7,  0,-46,-16, -7;
/M: SY='G'; M= 16,  0,-30, -7,-14,-23, 21,-23, -3, -7,-10, -4,  3, -7, -4,-20, 10, 13, -4,-29,-27,-10;
/M: SY='A'; M= 30,  0,-27,  0,  0,-17,  0,-17, -3,  0,-13,  0,  0,-10,  4,-10, 20, 13,  4,-44,-34, -3;
/M: SY='A'; M= 30,  0,-27, -3, -7,-20, -7,-20,  0, -3, -7,  7,  3, -7,  7,-17, 13, 24, 10,-50,-30, -3;
/M: SY='H'; M= -7, -7,-37, -7, 13,-17,-17, 35,-20, 19,-17, 20, -3, 10,  0,  3, -3,-13,-23,-30, -7,  7;
/M: SY='N'; M=  0, 43,-17, 38, -3,-24, -3,-13,-14,  0,-17,-10, 56,-23,-10,-17,  0,  3,-20,-60,-30, -7;
/M: SY='F'; M=-13,-17,-10,-24,-20, 48,-23,-17, 13,-17, 33,  6,-17,-33,-23,-17,-17, -7, 10,-10, 30,-20;
/M: SY='Q'; M=  0,-13,-30,-13, 13,-30,-23, 47,-20, -7,-17,  0,-10,  3, 53, 17,-10, -7,-30,-23, -7, 27;
/M: SY='N'; M=  0,  6,-17,  0, -7,-10, -7,-10,-13,  3,-20, -7, 19,-16,  3, 17, 10,  0,-13,-33,-20, -7;
/M: SY='F'; M= -6,-17,-13,-27, -3, 19,-20,-17, 11, -3, 10, -6, -7,-20,-10,-17, -7,-13,  7,-10,  0, -7;
/M: SY='I'; M=  0,-17,-13,-23,-23, 10,-20,-20, 40,-20, 23, 10,-14,-33,-23,-20,-13,  3, 33,-27, 10,-23;
/M: SY='Q'; M= 20, -3,-23, -7,  0,-23,-13,-13, -7, -3,-10,  0,  0, -3, 31, -3,  6, 19, -4,-36,-20, 11;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-33,-10,-17,-23, 47,-23,-17, -3,-20,-13, -7,-10, -3, 13, -3,-23,-23,  7,-20,-13;
/M: SY='C'; M=-14,  0, 49,-10, -3,-17,-20,-24,-17, -7,-13, -7, 17,-24, -1, 12,-10,-13,-17,-30,-34, -3;
/M: SY='H'; M=-13,-17,-23,-13, -7, -6,-23, 40, -9,-10,  4, 14,-17,-10,  3, 16,-13,-16,-10,-24, 10, -3;
/M: SY='G'; M= 10, -6,-30, -7,-10,-20, 21,-20,-13,  0,-17, -4, -6,-10,  6, 16,  0,-13,-10,-13,-24, -7;
/M: SY='D'; M=  3, 17,-13, 34, 23,-34,-10,-10,-27,  7,-13,-20,  0, -3,  0,-10, 13, -4,-20,-27,-17, 13;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='C'; M= -4, -7, 45,-10,  3,-17,-14,-24,-13,-10,-13,-20, -3,-17,-13,-13, 19,  6,-13,-27,-34, -7;
/M: SY='A'; M= 14, -6,-23, -7,-10,-17,-13,-17,-10,  0,-10,  3, -3, -7, 13, 12,  7, 10,  4,-34,-17, -3;
/M: SY='K'; M=  0,  0,-30,  0, 20,-10,-10,-20,-20, 40,-20, 20,  0, 10,  0, 10,  0,-10,-20,-20,-10, 10;
/M: SY='I'; M=  0,-10,-14,-20,-20,  0,-17,-17, 26,-17, 20, 10, -3,-20,-13,-27, -3, 17, 20,-34,  3,-17;
/M: SY='P'; M= -7,  3,-30, 23, 10,-43,-10,  0,-33,  7,-23,-37,-17, 70, -3,-10, -7, -3,-33,-33,-17,  0;
/M: SY='N'; M=  3,  6,-17,-14,-20,-10,-10,-17, 21,-10,  0,  3, 29,-20,-10,-27,  3, 20, 11,-50,-20,-17;
/M: SY='D'; M= -3, 27,-27, 57,  3,-37,-13,-17,-37,  3,-13,-20,  0,-10,  3, 20, -3,-17,-17,-27, -7,  0;
/M: SY='F'; M= -3,-23,-23,-36,-33, 36,-23,-27, 34,-17, 17, -3,-10,-37,-27,-17,-10, -3, 34,-17, 10,-33;
/M: SY='L'; M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='C'; M=-14,-14, 35,-20, -3,-27,-30, 23,-14,-20, -3,  0, -4, -7, -7,-20, -4,  3,-14,-40,-24, -3;
/M: SY='D'; M= 17, 17,-27, 30,  3,-27, -3,-17,-17,  0,-13,-13,  3,-10, -3,-10, 16,  7, -6,-40,-24, -3;
/M: SY='I'; M= 17,-13,-23,-20,-20, -4,-13,-23, 33,-13,  6,  7, -6,-26,-13,-17, -3,  7, 33,-37,-14,-20;
/M: SY='V'; M= 10,-13,-20,-17,-27,  0,-27,-27, 27,-17,  7,  0,-10,-27,-20,-17,  0, 23, 37,-37,  3,-23;
/M: SY='D'; M= -3,  9,-13, 29, 21,-33,-17,-10,-33, 10,-13,-13, -7, -3, 14, 20, -3,-20,-20,-16,-10, 17;
/M: SY='L'; M= -3, -7, -7,-10,-13,  7,-20,-13, 13,-17, 27, 13,-10,-20,-13,-23, -7, 17, 10,-30, 17,-10;
/M: SY='I'; M= -3,-17,-13,-30,-23,  7,-13,-17, 46,-20, 27, 13, -7,-30,-20,-27,-13,  0, 30,-27,  4,-23;
/M: SY='H'; M=  6, -7,-40,-10, -6,-27, 15, 32,-10,-10,-13,  4, -3, -3, -3,-13,  0,-10,-17,-31,-23, -6;
/M: SY='A'; M= 16,  0,-13,  0, 14,-27,-14,-13,-10,  4, -7,  0,  0,  0, 10,-17, 10, 13, -4,-36,-23, 14;
/M: SY='A'; M= 23, -3,-20, -3, -3, -7, -7,-17,  7, -7,  7, 13, -7,-17,  0,-13,  0,  7, 10,-40,-17, -3;
/M: SY='D'; M=  0, 17,-30, 31, 17,-24,-10,-20,-27, 26,-17,  3,  3,  3, -3,  3,  0,-10,-20,-27,-10,  7;
/M: SY='P'; M= 14, -7,-27, -3,  3,-23, -3, -7,-13,  3,-20,-16,-10, 30,  0,-10, 13, 10,-13,-37,-27, -3;
/M: SY='L'; M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='L'; M= -3,-13, -7,-13,-17, 17,-23,-17, 27,-20, 30, 13,-20,-33,-23,-17,-17,  3, 23,-23, 23,-17;
/M: SY='F'; M=  6,-10,-33,-21,-20, 18, 16,-27, -3, -7, -3,-10, -3,-20,-14,-13,  0,-10, -3, -9,-13,-20;
/M: SY='W'; M=-30,-33,-20,-27, -7,  3,  7,-37,-23,-13,-20,-27,-47,-23,-10, -3, -7,-27,-23,123, 27,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='D'; M=  3, 16,-13, 32, 23,-33,-10,-10,-26,  7,-13,-20,  0, -3,  0,-10, 14, -3,-20,-27,-17, 13;
/M: SY='R'; M=-10,-20,-20,-10,-10,-10,-20,-10,-30, 10,-20,  0,-20,-10, 30, 80,-10,-30,-10,  0,  0,  0;
/M: SY='Y'; M= -7,-10,-34, -7,-14,  0,-17,-10, -7, -7,  4,-10,-10,-10, -7,-13, 13, 20,  4, -9, 21,-13;
/M: SY='P'; M=-10,-17,-20,-10,  3,-19,-13,  3,-13,  0, -6,-19,-27, 62, -7,-13,-13,  0,-23,-27, -3, -3;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-30,-50,-40,100,-30,-30,  0,-10, 20,-20,-10,-40,-30,-10,-10,-20, 10, 10, 30,-40;
/M: SY='R'; M= 13, -7,-23, -3, -3,-13, -7,-13,-13,  3,-17, -4, -7,-10, 10, 20, 14,  0, -4,-26,-20, -3;
/M: SY='H'; M=  6, -7,-37, -7,  7,-20,-14, 35,-14,  6,-13, 17, -3,  4,  3, -3,  0, -7,-14,-40,-16,  3;
/M: SY='I'; M=  3,-13,-13,-13, -6,  0,-23,-13, 13,-13, 10,  4,-17,-23, 10,  0,-13,  3, 10,-20, 10,  0;
/M: SY='N'; M=  3, 14, -7,  4, 10,-23,-13,-10,-10,  3,-10, -3, 27, -7,  3,-20,  6, 13,-14,-44,-24, 10;
/M: SY='D'; M=  3, 27,-27, 50,  3,-40,-13, -7,-23,  7,  0,  0,  7,-20,-10, -7, -7, -7,-13,-37,-10, -3;
/M: SY='Y'; M=-33,-30,-50,-24,-27, 54,-30,-10, -7,-10, 27,-13,-30,-27,-17, -3,-17,-13, 10, 36, 69,-27;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-20, -3, -3,-10, -7,-10,-17,  3,-20,-13, -7,-10,  3, 20, 23,  3,-10,-20,-13, -7;
/M: SY='A'; M= 17, -6,-13, -3, 10,-17,-16,-17,  3,  0, -4,  0,-10,-13,  0,-10,  0,  0, 10,-30,-17,  7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='Y'; M=-10,-10,-26, -7,-13,  4,-16, -6, -3, -7, 10, -3,-10, -7, -3,-10,  0, 13,  7,  0, 27,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='C'; M=-24,-20,109,-24,  4,-24,-34,-37,-23,-17, -6,-14,-13,-24, -4, 12,-17,-23,-17,-14,-41,  0;
/M: SY='N'; M=  3,  9,-23, -4, -3,-24, 20,-13,-10, -3,-20,-10, 22,-13, 18, -3, -3, -3,-27,-23,-26,  4;
/M: SY='N'; M=  0, 26, -3, 10, 14,-20, -7, -7,-10,  7,-17, -3, 49,-16,  0,-17,  0,  0,-23,-49,-33, 11;
/M: SY='I'; M=  7,-20,-20,-27,-30,  7,-23,-27, 47,-20, 13,  3,-13,-37,-27,-17,-10,  7, 47,-30,  3,-30;
/M: SY='I'; M= -7,-17,-13,-20,-16,  3,-17,-13, 16,-10, 13, 10,-14,-23, -3, 11,-13,-10, 13,-16,  7,-13;
/M: SY='D'; M=  3, 14,-27, 28, 17,-30,-13,-14,-27, 13,-17, -7,  0,  0, 22, 10, -3, -7,-23,-24,-10, 16;
/M: SY='C'; M=-17,-13, 57,-17, -3,  3,-27,-23,  7,-23, 27,  7,-17,-30,-20,-20,-20, -7,  0,-20,  0, -7;
/M: SY='C'; M=-13,-10, 42,-16, -7,-13,  7,-30, -3,-20,  7, -6,-10,-23,-20,-20,-13,-13,-13,-10,-19,-10;
/M: SY='L'; M= -7, -7,  3, -3, 14, -1,-20, -7,  3, -6, 23, 10,-17,-16, -6,-17,-13, -7, -4,-17, 13, 11;
/M: SY='E'; M=  0,  0, 10, 10, 60,-40,-20,  0,-30, 20,-10,-10,-10, 10, 20,-10,  0,-20,-30,-10,-20, 50;
/M: SY='L'; M=-10,-10,  0,-10,-10, 20,-20,-10, 20,-20, 40, 20,-20,-30,-20,-20,-20,  0, 10,-20, 30,-10;
/M: SY='T'; M= 20,  0,-23, -3, -6,-17, -6,-17, -3, -3,-10, -4,  3, -7,  0,-16, 24, 26,  3,-43,-23, -7;
/M: SY='T'; M= 10, -3,-20,-10, -6,-23,-20,-13, -7, -7, -7, -3,  3,  0, 28, -9, 10, 33, -4,-36,-10,  7;
/M: SY='I'; M=  3,-20,-20,-33,-30,  3,-17,-23, 53,-20, 17,  7, -7,-33,-23,-23,-10,  3, 43,-30, -3,-30;
/M: SY='V'; M= 13,-10,-16,-10,-13,  3,-17,-20, 20,-13, 14, 10,-13,-27,-13,-13, -7,  7, 23,-33,  0,-13;
/M: SY='H'; M=-10,-17,-40,-17,  6,-30,-27, 95,-20,-14,-13, 10,-10,  7, 26,  3,-10,-14,-30,-37, -3, 13;
/M: SY='Q'; M=  0,-10,-10, -3, 24,-27,-20, -3,-27, 10,-17, -7,-13,  0, 43, 33, -7,-17,-23, -7,-10, 30;
/M: SY='D'; M=  0, 50,-30, 90, 10,-50,-10,-20,-40,  0,-10,-30, 10,-10,-10,-10,  0,-10,-20,-40,-10,  0;
/M: SY='C'; M=-13,-13, 34,-16, -7,-23,  8,-30,-20,-10,-14,-13,-10,-16, -3, 13,-10,-23,-20, -3,-30, -7;
/M: SY='P'; M= -7,-17,-27,-23,-16, 13,-20,-13,-10, -3, -4,-20,-10, 25,-10,-16,  0,  9, -7,-23,  0,-17;
/M: SY='A'; M= 30, -6,-27, -6,-10,-10,-10,-23, 13, -6, -4,  7, -6,-20, -3,-10,  4, 10, 23,-44,-24,-10;
/M: SY='Y'; M= -2,-13,-30, -7,-10,  9,-16,-10,  3,-10, 20,  7,-20,-20, -6,-10,-10,  0, 10, -8, 25,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 8 in 8 different sequences
Number of true positive hits 8 in 8 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] CRIC
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
8 sequences

CNKR1_HUMAN (Q969H4), CNKR2_HUMAN (Q8WXI2), CNKR2_MOUSE (Q80YA9), 
CNKR2_RAT   (Q9Z1T4), CNKR3_HUMAN (Q6P9H4), CNKR3_MOUSE (Q8BMA3), 
CNKR3_RAT   (Q5SGD7), CNKR_CAEEL  (G5EEW9)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission