PROSITE entry PS51291
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SSUB |
| Accession [info] | PS51291 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-FEB-2007 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC51237 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Aliphatic sulfonate import ATP-binding protein ssuB family profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=231; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=226; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9488828; R2=0.0081189; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1231331; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=10846; N_SCORE=90.0; MODE=1; TEXT='?'; /CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=561; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??'; /DEFAULT: M0=-19; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; ... A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; /M: SY='T'; M= 0,-40, -7, -8,-45, 34,-33,-40, -4,-31,-20,-20, 33, 5,-11, 27, 39,-35,-48,-39; /M: SY='A'; M= 37, -9,-27,-26,-34, -4,-40, 28,-27, -3, -5,-33, 33,-32,-30, 1, 9, 5,-47,-35; /M: SY='A'; M= 55,-37,-18,-12,-40, -6,-35,-28,-29, -2,-19,-11, 33,-11,-14, 2,-23, -3,-46,-38; /M: SY='V'; M=-14,-39,-46,-24, -8, 20,-43, 29,-42, 32, 20,-41,-45,-39,-44,-34,-27, 44,-45,-28; /M: SY='E'; M= -1,-43, 28, 32,-43,-35, 18,-26, 1,-24,-31, 3,-35, 20, 25, 17, 6, -3,-52,-33; /M: SY='L'; M=-28,-18,-46,-13, -4,-51,-42, 31,-42, 50, -5,-44,-47,-38,-43,-10,-12, 37,-44,-25; /M: SY='R'; M=-20,-46, -9, -3,-42,-39, 17,-43, 26,-20,-31, 10,-39, 9, 73, 2, -6,-31,-47,-31; /M: SY='G'; M= -1,-43, -3,-13,-40, 52, -5,-11,-15,-41,-34, 43,-38, 16, -8, -1,-27,-20,-44, 3; /M: SY='L'; M= -9,-38,-26,-34, 31,-50,-42, 24,-44, 44, -7,-45,-48,-42,-44,-38,-17, 42,-40,-20; /M: SY='R'; M=-13,-42,-18,-13,-39, 6, 28,-29,-12,-32,-31, 29,-39, 8, 48, 21, 1, 3, 15,-18; /M: SY='K'; M=-32,-48,-26,-12,-47,-40, -7,-49, 80,-46,-34,-19,-35, 10, 53,-26,-28,-44,-42,-33; /M: SY='W'; M= 21,-43,-32,-12,-26, -6, -2,-39,-19,-23,-32,-15,-38, 29, 35, 30, -1,-31, 82,-25; /M: SY='F'; M=-39,-43,-45,-45, 81,-27,-10,-23,-40,-17,-21,-39,-51,-41,-38,-14, -6,-27, -7, 80; /M: SY='G'; M= 11,-44, -7,-38,-27, 81,-14,-54,-33,-50,-41,-14,-37,-33, -8,-18,-34,-47,-43,-42; /M: SY='D'; M= -5,-42, 51, 5,-45, 15, -9,-34, 0,-40,-35, 10, -9, 0, -6, -1, 23, 6,-55,-37; /M: SY='H'; M=-31,-45,-26,-21,-41,-39, 58,-28, 24,-37,-28, 24,-39, 25, 56,-16, 13, 2,-51,-27; /M: SY='H'; M=-16,-42, -9, 21,-41,-38, 51,-17,-13,-34,-28, -3, -9, 35, 18, -2, 44, 0,-53,-29; /M: SY='V'; M=-22,-36,-52,-46,-22,-54,-54, 28,-44, -8,-11,-47,-47,-46,-46,-36,-20, 83,-56,-30; /M: SY='L'; M=-36,-39,-54,-46,-10,-55,-39, 23,-47, 73, 2,-52,-52,-40,-45,-46,-32, -6,-40,-22; /M: SY='D'; M=-17,-45, 52, 28,-47,-36, 32,-47, 12,-44,-36, 3,-34, 29, 27, -2, 18,-42,-53,-25; /M: SY='D'; M=-15,-45, 68,-15,-52, 49, -6,-54,-25,-52,-44, 37,-37, -4,-12,-15,-28,-50,-56,-40; /M: SY='I'; M=-30,-40,-53,-48, -2,-56,-49, 59,-46, 34, -5,-47,-47,-44,-47,-40,-19, 48,-45,-25; /M: SY='D'; M= -2,-43, 73, 15,-51,-19,-23,-48,-22,-48,-43, 31,-17, 7,-29, 30, -5,-43,-60,-39; /M: SY='L'; M=-28,-38,-53,-46, 16,-54,-39, 4,-46, 69, 0,-51,-52,-41,-44,-44,-30, 18,-39,-20; /M: SY='D'; M=-14,-43, 40, 2,-46,-26, 39,-44,-15,-39,-34, 1,-35, 38, 36, 19, 30,-39,-54,-31; /M: SY='I'; M=-22,-41,-53,-49,-18,-56,-51, 69,-46, 24, -5,-47,-46,-44,-48,-40,-25, 47,-46,-26; /M: SY='A'; M= 47,-41,-20, 26,-47,-19,-14,-41,-20,-42,-34, -2, 46, 6, 15,-18, 3,-33,-47,-40; /M: SY='C'; M= 22, 58,-17, 11,-47,-26,-32,-44, 14,-44,-36,-13, 56,-11, 26, 2,-18,-38,-49,-42; /M: SY='G'; M=-18,-45,-33,-44,-52, 90,-39,-59,-38,-55,-44,-19,-37,-36,-46, -8,-36,-52,-43,-46; /M: SY='E'; M=-22,-50, 19, 80,-54,-36,-21,-51,-11,-44,-38,-22,-27, 57,-18,-12,-29,-45,-48,-39; /M: SY='F'; M=-40, 7,-56,-52, 92,-53,-41, 37,-47, -8,-16,-45,-52,-54,-46,-42,-33, 6,-18, 3; /M: SY='V'; M=-22,-35,-51,-45,-22,-53,-52, 20,-43, 8,-10,-46,-47,-45,-45,-35, -5, 80,-55,-30; /M: SY='A'; M= 67, 15,-34,-29,-42,-21,-37,-32,-30,-36,-31,-26,-35,-28,-36, 26, 26,-12,-48,-39; /M: SY='L'; M=-32,-39,-53,-47, -5,-55,-43, 42,-46, 58, 9,-50,-49,-42,-45,-43,-28, 32,-42,-23; /M: SY='I'; M=-30,-40,-53,-48,-16,-56,-47, 54,-46, 44, -3,-48,-48,-43,-47,-41,-26, 47,-45,-26; /M: SY='G'; M=-18,-46,-33,-45,-52, 91,-40,-60,-39,-55,-44,-19,-37,-36,-46,-18,-37,-53,-43,-47; /M: SY='R'; M= -9,-51,-28, 14,-48,-40,-13,-47, 20,-41,-35,-28, 62,-15, 70,-23,-30,-43,-46,-37; /M: SY='S'; M=-10,-33,-24,-25,-43,-18,-28,-43,-26,-46,-39,-13,-32,-17,-30, 90, -4,-35,-51,-35; /M: SY='G'; M=-18,-46,-33,-45,-52, 91,-40,-60,-39,-55,-44,-19,-37,-36,-46,-18,-37,-53,-43,-47; /M: SY='C'; M=-15,118,-38,-39,-41,-16,-40,-43,-37,-40,-37,-25,-46,-36,-42, 48, 2,-26,-61,-43; /M: SY='G'; M=-18,-46,-33,-45,-52, 91,-40,-60,-39,-55,-44,-19,-37,-36,-46,-18,-37,-53,-43,-47; /M: SY='K'; M=-31,-46,-24,-10,-48,-39,-27,-48, 92,-47,-35,-17,-32, -8, 8,-26,-26,-44,-41,-34; /M: SY='S'; M=-11,-32,-25,-26,-42,-21,-29,-40,-26,-43,-37,-13,-32,-19,-31, 83, 36,-32,-52,-35; /M: SY='T'; M=-21,-30,-26,-29,-36,-37,-37,-27,-26,-32,-29,-15,-28,-31,-35, -4, 96,-19,-57,-34; /M: SY='L'; M=-34,-38,-53,-46, -5,-55,-39, 7,-46, 70, 1,-52,-52,-41,-44,-44,-30, 23,-41,-23; /M: SY='L'; M=-36,-38,-53,-46, -9,-55,-37, 5,-47, 76, 3,-52,-53,-40,-44,-46,-32, -8,-40,-22; /M: SY='R'; M=-35,-51,-31,-19,-45,-45,-10,-51, 29,-44,-33,-24,-43, -9, 96,-29,-34,-45,-44,-31; /M: SY='I'; M= 13,-39,-49,-44,-19,-48,-23, 54,-43, 36, -7,-43,-44,-40,-45,-34, -6, 31,-45,-27; /M: SY='L'; M= -7,-38,-52,-45,-15,-52,-43, 34,-45, 56, -2,-49,-49,-41,-45,-40,-27, 37,-44,-25; /M: SY='A'; M= 78,-31,-36,-29,-44, -1,-38,-34,-31,-36,-14,-30,-35,-28,-36, 2,-13,-22,-45,-40; /M: SY='G'; M=-19,-46, -7,-26,-52, 88,-15,-59,-36,-54,-44,-18,-37,-34,-29,-19,-36,-53,-44,-45; /M: SY='L'; M=-36,-38,-53,-46, 2,-55,-37, -1,-47, 76, 3,-52,-53,-40,-44,-46,-32, -9,-39,-21; /M: SY='D'; M=-29,-47, 78, 56,-53,-34,-23,-52,-19,-49,-47,-11,-31,-14,-27, 23,-23,-47,-60,-40; /M: SY='T'; M=-13,-23, 18, -9,-44, -9, 19,-38, 1,-35,-32, 10, 26, 39, 5, -2, 44,-20,-51,-22; /M: SY='D'; M= 4,-14, 65, 16,-48,-12,-31, 1,-22,-41,-37,-20, 59,-19,-35,-25,-20,-24,-55,-41; /M: SY='H'; M=-10,-40, 31,-20, 39,-32, 57,-18,-31,-29,-27,-21,-39,-16,-33, 18, 29, -7,-38, 26; /M: SY='T'; M= 22,-39, 0, 23,-43, 2,-10,-26,-19,-39,-33,-20,-33, 15, 18, 28, 34,-24,-48,-23; /M: SY='G'; M=-18,-45,-33,-44,-52, 90,-39,-59,-38,-55,-44,-19,-37,-20,-45,-11,-36,-53,-43,-46; /M: SY='E'; M=-13,-42, 37, 41,-46,-16, 13,-43,-17,-43,-37,-11,-32, 14, 12, 36, 24,-26,-53,-35; /M: SY='V'; M=-28,-16,-48,-43,-22, -5,-43, 36,-34, 27, 2,-42,-47,-37, 19,-36,-27, 51,-47,-29; /M: SY='E'; M= 14,-41,-11, 28,-16,-26, 5, -4, -9, 14,-22,-28,-37, 7, 18, -2, 9, -1,-45,-14; /I: I=-11; MD=-34; /M: SY='V'; M= -7,-44,-52,-46, 7,-52,-46, 32,-23, 20, 1,-45,-50,-28,-20,-17,-14, 38,-47,-14; D=-11; /I: I=-11; MD=-34; /M: SY='D'; M=-58,-73, 34,-34,-80, 9,-53,-81,-41,-81,-73, 24,-66,-52,-27,-36,-39,-78,-87,-70; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-34; IM=0; DM=-34; /M: SY='T'; M=-10,-61, -9,-45,-32,-19,-54,-50,-22, -1,-45,-24,-34,-49, -8,-22, 10,-49,-68,-53; D=-11; /I: I=-11; DM=-34; /M: SY='G'; M= 18,-55,-30, 6,-60, 24,-28,-44, 6,-56,-48,-27,-26,-20,-17,-14,-20,-32,-60,-53; D=-11; /I: I=-11; DM=-34; /M: SY='P'; M= 14,-50,-48,-42, 21,-12,-46, 5,-39,-15,-32,-26, 37,-17, -4,-24, -6, -9,-48,-34; D=-11; /I: I=-11; DM=-34; /M: SY='P'; M= -4,-46,-14,-14,-49, 8, 11,-40,-15,-45,-35, -6, 63, 45, -5, 33, -4,-37,-48,-38; /M: SY='E'; M= -2,-45, 21, 37,-45, 21,-14,-15, 11,-26,-11,-15, 17, -5, 13, 2,-18,-26,-48,-38; /M: SY='R'; M= -5,-46, 31, 9,-48,-12,-25,-32, 11,-38,-16, 12, 30, 35, 38, 8,-19,-40,-49,-37; /M: SY='R'; M= -9,-43,-36,-27,-36,-42,-34, 18, -6,-21,-12,-30, 22, 28, 43, -9, 20, 29,-48,-32; /M: SY='R'; M= 24,-16,-34,-30,-39, 31,-31,-38,-17, -1,-29,-25,-39,-22, 52, 23, -4,-33,-45,-35; /M: SY='F'; M=-17,-38,-52,-47, 58,-51,-42, 18,-44, 11, 36,-45,-48,-45,-43,-37,-17, 53,-33, -2; /M: SY='M'; M= 1,-40,-49,-41,-24,-45,-39, 33,-39, 2, 76,-42, 29,-36,-41,-35,-25, 44,-47,-28; /M: SY='F'; M=-44,-43,-57,-51, 99,-50,-36,-20,-46,-12,-22,-47,-54,-54,-44,-43,-38,-26, 78, 34; /M: SY='Q'; M=-29,-53,-24, -4,-57,-37,-17,-45, -6,-40,-27,-19,-36,107, 27,-18,-31,-46,-41,-30; /M: SY='E'; M=-21,-49, 65, 77,-54,-39,-22,-53,-15,-48,-45, -7,-28, -9,-24,-25,-28,-47,-56,-41; /M: SY='P'; M= 26,-45,-12,-26,-44,-22, 55,-32,-31,-39,-31,-30, 77,-29,-37, 7,-24, 7,-52,-35; /M: SY='R'; M=-36,-52,-32,-20,-45,-46,-21,-52, 8,-44,-33,-25,-44, -9,101,-30,-35,-45,-45,-31; /M: SY='L'; M=-34,-37,-49,-43,-11,-53,-37, -3,-44, 72, 0,-47,-49,-38,-43,-39, 16, -9,-41,-23; /M: SY='L'; M=-36,-38,-44,-43, 34,-48,-33, 10,-41, 59, 41, 21,-50,-37,-41,-40,-30,-12,-37,-17; /M: SY='P'; M=-33,-57,-37,-25,-50,-39,-40,-32,-32,-45,-35,-42,110,-16,-43,-32,-27, 4,-49,-49; /M: SY='W'; M=-28,-62,-66,-47,-12,-42,-67,-31,-41,-35,-38,-59,-47,-40,-44,-28,-48, 2,160, 0; /M: SY='K'; M= -8,-44,-13,-12,-24,-42,-26,-21, 48, 28, -1,-29,-41, 9, 25,-30,-21,-27,-34, 32; /M: SY='T'; M=-23,-39, -2,-24,-43, 12,-29,-42, 10,-42,-35, 3,-23,-20, 45, 32, 50,-35,-50,-35; /M: SY='V'; M=-11,-36,-51,-45,-21,-52,-50, 24,-44, 21, -9,-47,-47,-44,-45,-35,-15, 74,-52,-29; /M: SY='W'; M= 10,-42,-38, 18,-21,-43,-40, 22,-33, 34,-15,-39,-40,-30,-21,-31, 16,-12, 88,-22; /M: SY='D'; M= 3,-48, 57, 22,-51,-35, 2,-48, 5,-45,-37, -9,-25, 50, 38,-22, -9,-43,-52,-35; /M: SY='N'; M= 7,-35, -6,-26,-46,-19,-14,-44,-18,-50,-38,102,-41,-20,-26,-13,-16,-43,-62,-41; /M: SY='V'; M=-25,-38,-50,-43,-23,-53,-49, 37,-34, -2,-11,-44,-47,-40, 16,-36,-22, 72,-52,-29; /M: SY='G'; M= 30,-37,-36,-13,-34, 35,-37,-19,-33, 10, 13,-29,-38, -9,-25, -6, 20, 11,-46,-35; /M: SY='L'; M= 6,-37,-47,-42, 39,-46,-38, 7,-42, 49, -8,-42,-47,-40,-42,-33, 17, 12,-35, -1; /M: SY='G'; M= 11,-44, 21,-31,-50, 72,-34,-54,-27,-51,-41,-18,-37,-29, 17, 1,-31,-46,-46,-42; /M: SY='L'; M= 16,-37, 12,-34,-19,-42, -6,-10,-39, 59, -7,-37,-46,-22,-40,-21, -4, -5,-45,-26; /I: I=-18; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57; /M: SY='P'; M= 14,-45, 18, -6,-48, 17,-29,-45, 33,-35,-36, -2, 41,-12, 29, -2,-20,-41,-47,-39; /M: SY='D'; M= 1,-47, 46, -1,-45, 35, 6,-37, -8,-33,-37, -3,-38,-22, 44,-23,-18,-39, 34,-34; /M: SY='R'; M= 1,-45, 0, 2,-46, -1,-14,-40, 9,-31,-32, 14, 25, 33, 44, -3, 8,-21,-48,-36; /I: I=-16; MD=-50; /M: SY='D'; M= 22,-55, 36, -8,-48, -4,-39,-41,-22,-40,-46,-34, -7,-15,-22,-22,-39,-40,-53, 15; D=-16; /I: I=-16; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50; /M: SY='W'; M= 25,-43, 10,-26,-32, -4,-27,-22,-30, 5,-26,-21,-43, -7, 14,-28,-11, 22, 75,-29; D=-16; /I: I=-16; DM=-50; /M: SY='R'; M= -3,-45, -3, -1,-43,-36, -1,-43, 28,-30,-31,-21,-38, 34, 63, 18,-11,-30,-44,-12; /M: SY='D'; M= 24,-45, 49, 29,-50,-29, -1,-45, 8,-44,-37,-10, 23, 25, 18,-12,-26,-33,-51,-38; /M: SY='R'; M= 4,-48,-10, -1,-42,-24,-12,-36, 31,-42,-33,-16,-39, 24, 66, -9,-20,-35, 57,-29; /M: SY='A'; M= 67,-33,-39,-34,-39, 14,-42,-12,-35,-29,-26,-33,-38,-32,-39,-15,-22, 31,-47,-38; /M: SY='R'; M= 29,-41, 8, 30,-39,-28,-20,-33, 4, 9,-26,-26,-36, 12, 36, -8, -9,-24,-46,-34; /M: SY='Q'; M= 39,-42, 7, 37,-47,-25,-27,-42, 6,-40,-33,-24,-34, 40, 30, -6,-20,-24, -9,-36; /M: SY='W'; M= 47,-38,-48,-38,-23,-34,-44, -7,-38, 29, -4,-43,-43,-35,-41,-19,-28, 14, 94,-23; /M: SY='L'; M=-35,-41,-51,-43,-14,-53,-40, 24,-45, 65, -1,-50, 27,-40,-45,-44,-30, 5,-42,-25; /M: SY='E'; M= 36,-40, 37, 37,-39,-27, -7,-30, -9, 2,-29,-24,-35,-20, 9,-21, 3,-30,-48,-19; /M: SY='E'; M= 4,-43, 21, 64,-45,-31,-27, -4,-13,-37,-34,-22,-29, 19,-26, 0, 25,-21,-50,-38; /M: SY='V'; M=-20,-35,-52,-45,-21,-53,-52, 11,-44, 14, -9,-48,-48,-45,-45,-36,-21, 81,-55,-30; /M: SY='G'; M=-20,-45,-29,-21,-50, 75,-33,-55,-15,-51,-41, -3,-37, 3, 17, 16,-30,-49,-44,-42; /M: SY='L'; M=-33,-39,-51,-46,-13, 7,-38, 4,-46, 71, 0,-47,-51,-39,-44,-42,-32,-11,-40,-24; /M: SY='A'; M= 44,-38, 12, -4,-44, 30, -7,-39, 10,-15,-32,-15,-14,-12,-23, 14,-19,-31,-47,-38; /M: SY='D'; M= -8,-47, 57, 8,-52, 54, 23,-53,-26,-49,-41, -3,-35, 30,-32,-20,-21,-49,-52,-38; /M: SY='R'; M= 11, -4,-33,-18, 23,-39, 20,-38, 32,-35,-30,-26,-41,-17, 66, -6,-29,-17,-39, -8; /M: SY='A'; M= 49,-39, -9, 45,-45, 4,-30,-39,-21,-16,-31,-26,-33, 31,-12, -7,-18,-31,-46,-38; /M: SY='R'; M=-15,-45, 42, -3,-48, 5, -2,-49, 29,-48,-38, 47,-38,-13, 47,-21, -6,-45,-53,-36; /M: SY='A'; M= 42,-39, 29, 32,-43,-30,-31,-29,-16,-25,-30,-24,-35, 26,-29, 12,-22, 14,-50,-37; /M: SY='W'; M=-37,-56,-56,-45, 7,-41,-46,-31,-39, 5,-29,-50,-47,-36,-41, 7,-40,-40,146, 42; /M: SY='P'; M=-35,-58,-37,-26,-47,-39,-39,-35,-33, -4,-32,-43,111,-36,-44,-34,-28,-41,-47,-48; /M: SY='A'; M= 48,-37,-32,-16,-39,-17,-16,-33, 32, -5,-28,-17,-37,-20, 23, 17,-22,-18,-44,-22; /M: SY='T'; M= 14,-39,-23, 28,-42,-35, -5,-24,-15,-35,-30, 5,-34, 29, 32, 2, 41, 0,-50,-34; /M: SY='L'; M= 6,-37,-51,-44,-13,-49,-38, 14,-45, 70, 0,-49,-50,-38,-43,-40,-30, -8,-41,-24; /M: SY='S'; M=-12,-33,-27,-27,-38,-21,-29,-35,-28, -2,-32,-16,-34,-19,-31, 85, -7,-31,-50,-33; /M: SY='G'; M=-18,-44,-35,-45,-47, 86,-41,-43,-39,-47,-39,-21,-38,-37,-46,-20,-35, 3,-44,-45; /M: SY='G'; M= 13,-44,-34,-43,-51, 87,-40,-56,-38,-52,-42,-20,-37,-35,-45,-17,-35,-48,-43,-46; /M: SY='Q'; M=-29,-49,-18, 54,-46,-40,-19,-35,-13,-29, 59,-24,-32, 83,-16,-24,-30,-37,-44,-31; /M: SY='A'; M= 47,-11,-31,-21,-47,-28,-31,-41, 30,-42,-33,-25, 30, 11, 30, 16,-23,-33,-45,-38; /M: SY='Q'; M=-27,-50,-23, -5,-55,-36,-18,-42,-10,-39,-26,-18,-34,107,-11,-16, 17,-42,-42,-30; /M: SY='R'; M=-36,-50,-34,-22,-39,-47,-22,-42, 4, -1,-27,-27,-45,-11, 96,-32,-34,-39,-44,-30; /M: SY='V'; M= 19,-34,-49,-42,-24,-45,-49, 6,-42, 12,-12,-44,-46,-42,-43,-30,-15, 73,-53,-31; /M: SY='A'; M= 72,-31,-37,-30,-39, -7,-37,-30,-32, 1,-26,-30,-37,-28,-36, 16,-20,-21,-44,-37; /M: SY='L'; M=-35,-40,-54,-47,-11,-56,-40, 40,-47, 68, 2,-51,-51,-41,-45,-45,-31, -3,-40,-23; /M: SY='A'; M= 76,-32, 21,-24,-46,-15,-36,-36,-30,-38,-32,-27,-35,-27,-36,-11, -8,-23,-47,-40; /M: SY='R'; M=-35,-52,-27, 19,-46,-46,-21,-52, 6,-44,-34,-25,-42, -8, 96,-29,-34,-45,-45,-32; /M: SY='A'; M= 66,-35,-35,-30,-46, 24,-38,-38,-32,-41,-33,-28, 30,-29,-38, 10,-13,-28,-45,-42; /M: SY='L'; M=-37,-38,-54,-46, 31,-55,-37, -2,-47, 73, 1,-52,-53,-41,-44,-46,-32,-10,-35,-17; /M: SY='V'; M=-12,-39,-48,-45, 11, 8,-41, 27,-43, 20,-12,-42,-47,-41,-44,-27,-26, 53,-37, 26; /M: SY='H'; M= 14,-45,-29,-24,-44, 9, 69,-49,-10,-42,-31,-20,-39, 1, 65, 15,-28,-42,-50,-27; /M: SY='E'; M=-30,-47, 16, 51,-42,-25, 38,-42, 5, -1,-30, -1,-34, 27, 34, -2,-28,-40,-49,-31; /M: SY='P'; M=-35,-59, 21,-21,-55,-37,-37,-44,-31,-53,-41,-36,111,-34,-43,-31,-28,-48,-50,-51; /M: SY='D'; M= 16,-45, 38, 32,-49,-15, 21,-47, 3,-44,-36, 6,-35, 35, 36,-12,-14,-41,-51,-35; /M: SY='L'; M=-31,-38,-53,-46,-13,-55,-42, 24,-46, 62, -1,-51,-51,-42,-45,-43,-28, 39,-44,-24; /M: SY='L'; M=-34,-37,-49,-43, -6,-53,-37, -3,-44, 71, 0,-46,-49,-39,-43,-39, 16, -5,-41,-23; /M: SY='L'; M= -9,-39,-49,-41,-14,-50,-34, -6,-35, 68, 20,-47,-50,-34, 17,-41,-31,-12,-41,-24; /M: SY='L'; M= -4,-37,-52,-44, 2,-51,-37, -3,-46, 73, 1,-50,-52,-39,-43,-42,-31, -9,-39,-22; /M: SY='D'; M=-33,-48, 99, -2,-55,-31,-23,-53,-24,-53,-51, -5,-35,-22,-32, 14,-23,-50,-69,-39; /M: SY='E'; M=-29,-48, -3, 90,-47,-45,-22,-44,-12,-36, 37,-27,-26, -5,-21,-27,-29,-40,-48,-39; /M: SY='P'; M=-35,-60,-35,-24,-54,-38,-36,-44,-25,-52,-38,-40,111,-31, 16,-32,-29,-48,-48,-49; /M: SY='F'; M=-39,-38,-51,-47, 86,-51,-37,-13,-44, 36,-12,-43,-50,-48,-43,-37, 16,-18,-20, 1; /M: SY='G'; M= 14,-41,-34,-39,-42, 73,-37,-42,-36, -3,-33,-22,-38,-32,-42, 23,-28,-38,-44,-41; /M: SY='A'; M= 78,-31,-38,-30,-39,-21,-38,-29,-33, 2,-25,-33,-37,-29,-37,-13,-22,-19,-44,-38; /M: SY='L'; M=-34,-37,-53,-45,-11,-55,-39, 1,-46, 72, 1,-52,-52,-40,-44,-45,-30, 21,-42,-23; /M: SY='D'; M=-37,-50,104, 0,-57,-33,-22,-55,-24,-53,-53, -4,-36,-23,-32,-24,-26,-52,-72,-39; /M: SY='A'; M= 78,-31,-38,-30,-39,-21,-38,-29,-33, 2,-25,-33,-37,-29,-37,-13,-22,-19,-44,-38; /M: SY='W'; M=-38,-42,-56,-48, 51,-53,-41, 12,-46, 59, -5,-52,-52,-43,-45,-46,-35,-13, 76, -9; /M: SY='T'; M=-22,-32,-27,-28,-37,-38,-35,-29,-21,-33,-29,-16,-29,-28, 19, -7, 92,-22,-55,-34; /M: SY='R'; M=-35,-52,-27, 19,-46,-46,-21,-52, 6,-44,-34,-25,-42, -8, 96,-29,-34,-45,-45,-32; /M: SY='I'; M=-31,-42,-44,-39,-21,-48, 43, 52,-11, 27, 45,-35,-42,-31,-11, -5,-16, 6,-46,-22; /M: SY='H'; M=-15,-46,-15, 41,-46, 11, 48,-50, 31,-44,-35,-20,-33, 3, 41, 1, -2,-43,-48,-32; /M: SY='M'; M= -4,-38,-52,-43, 28,-45,-28, -6,-38, 33,103,-42,-43,-32,-37,-38,-30,-12,-37,-16; /M: SY='Q'; M=-29,-52,-24,-10,-49, 11, 72,-48,-15,-40,-27,-17,-37, 94, -9,-20,-33,-48,-45,-10; /M: SY='D'; M= 8,-43, 58, 9,-44, -5,-28,-32,-15,-26,-32,-13,-36, 35, 1, -9, 6, 10,-53,-24; /M: SY='L'; M=-34,-37,-53,-45,-10,-55,-39, 1,-47, 73, 2,-52,-53,-40,-44,-45,-30, 18,-41,-23; /M: SY='L'; M=-32,-39,-54,-47,-14,-56,-44, 47,-47, 57, -1,-50,-49,-42,-46,-43,-28, 33,-43,-24; /M: SY='E'; M=-15,-42,-26, 43,-18,-21, -9, -7, -7, 24,-18,-21,-38, 13, 10,-29, -6, 21,-46,-30; /M: SY='D'; M=-24,-44, 48, 21,-48,-27,-12,-46, 3,-44,-37, 17,-35, 25, 43, 5, 26,-41,-53,-35; /M: SY='L'; M=-33,-40,-48,-43,-15,-53, 43, 35,-43, 56, 16,-42,-48,-37,-41,-40,-17, 19,-45,-21; /M: SY='W'; M= -6, 18, 16,-37,-19,-41,-30,-20,-37,-20,-32,-44,-46,-37,-21,-39,-38, 20,139,-10; /M: SY='R'; M= 21,-44,-27, 25,-41,-23, -1,-31, -1,-12,-27,-12,-38, 37, 51,-24,-28, 8,-46,-33; /M: SY='R'; M=-18,-49, 33, 37,-48,-40,-22,-36, 11,-42,-35, -6,-36, 42, 59,-24, -9,-29,-49,-35; /M: SY='H'; M=-34,-48,-21, 19,-35,-40,102,-45, 17,-20,-25, -7,-37, 25, 13,-14,-32,-35,-51, 12; /M: SY='R'; M= 15,-45,-28, -4,-48, 40, 10,-48, 27,-45,-35, -8, -8, 13, 46,-21,-13,-42,-45,-36; /M: SY='F'; M=-33, 11,-45,-40, 63,-46,-39, 8,-38,-11, 19,-39, 54,-43,-29,-33, 18, 17,-32,-13; /M: SY='T'; M= 43,-32,-30,-30,-41, 14,-37,-33,-29,-36,-31,-20,-31,-29,-36, 11, 68,-23,-50,-38; /M: SY='V'; M= 27,-35,-49,-41,-23,-42,-43, 9,-40, 20, 42,-43,-45,-38,-41,-30,-23, 60,-49,-29; /M: SY='L'; M= 6,-38,-51,-45, -9,-49,-42, 37,-45, 58, -3,-48,-48,-40,-44,-39,-28, 19,-42,-25; /M: SY='L'; M=-36,-39, 17,-37, 17,-51,-11, -5,-43, 66, 7,-42,-50,-38,-42,-42,-31, -1,-40,-20; /M: SY='V'; M=-22,-36,-49,-42,-25,-52,-49, 9,-34,-11,-13,-44,-47,-40, 16,-34,-21, 81,-56,-31; /M: SY='T'; M=-21,-31,-28,-31,-35,-39,-38,-21,-28,-29,-26,-18,-30,-32,-36, -7, 92, 14,-57,-34; /M: SY='H'; M=-36,-48,-24,-24,-35,-41,127,-40,-28,-33,-21,-14,-40,-19,-23,-28,-34, 3,-70, -8; /M: SY='D'; M=-35,-48, 99, -3,-51,-35,-25,-40,-26,-45,-45, -7,-37,-25,-34,-25,-25, 3,-70,-38; /M: SY='V'; M=-25,-37,-53,-47,-19,-54,-51, 38,-45, 26, -7,-48,-48,-45,-46,-38,-23, 71,-51,-28; /M: SY='D'; M= -5,-45, 76, 43,-52,-32,-15,-50,-20,-48,-44,-10,-32, 5,-16, 26,-22,-44,-59,-38; /M: SY='E'; M=-30,-50, 33, 91,-53,-43,-22,-54,-11,-46,-43,-22,-25, -4,-21,-25,-29,-46,-51,-42; /M: SY='A'; M= 75,-32,-35,-30,-45, 18,-38,-37,-32,-38,-32,-28,-35,-28,-37, 8,-21,-24,-45,-41; /M: SY='V'; M= 9,-38,-50,-45, 2,-48,-48, 45,-43, 21, -9,-45,-46,-42,-45,-25,-23, 57,-46,-26; /M: SY='Y'; M= 35,-38,-39,-28,-15,-37,-10,-16,-22, 15, -6,-36,-43,-20,-16,-16, 1, 20,-28, 61; /M: SY='L'; M=-34,-38,-53,-45,-11,-55,-39, 5,-46, 71, 13,-52,-52,-40,-44,-44,-30, 22,-42,-23; /M: SY='A'; M= 65,-34,-32,-29,-44, 12, 44,-39,-30,-39,-31,-24,-35,-25,-34, 28,-20,-28,-48,-34; /M: SY='D'; M=-34,-45, 93, -5,-53,-32,-22,-50,-23,-50,-47, 35,-36,-23,-32,-20, 19,-46,-69,-39; /M: SY='R'; M=-36,-50,-33, -9,-39,-47, 1,-42, 3, -1,-27,-27,-44,-11, 94,-31,-34,-39,-45,-30; /M: SY='V'; M=-22,-40, 17,-39,-24,-52,-49, 50,-42, -3,-12,-39,-45,-42,-45,-36,-23, 66,-53,-30; /M: SY='I'; M=-12,-40,-52,-47,-15,-53,-44, 52,-46, 50, -3,-48,-48,-41,-46,-41,-28, 31,-42,-10; /M: SY='V'; M=-21,-39,-50,-43,-21,-51,-47, 31,-43, 27, 15,-47, 28,-42,-45,-37,-24, 60,-49,-29; /M: SY='M'; M=-34,-41, 17,-38,-17,-51,-35, 42,-41, 49, 63,-39,-45,-35,-42,-41,-29, -5,-44,-24; /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='E'; M=-21,-52, 29, 48,-54,-28,-28,-54, 17,-50,-43, -1,-37, 0, 37,-15, -3,-48,-55,-42; D=-21; /I: I=-21; DM=-65; /M: SY='P'; M=-18,-51, 51, 30,-51,-23, 17,-49, -2,-48,-40, 2, 57, -1, 28,-15,-28,-47,-53,-38; /M: SY='G'; M= 13,-43,-33,-41,-51, 85,-39,-55,-37,-52,-42,-20,-37,-20,-44, -9,-34,-47,-43,-45; /M: SY='R'; M= -6,-43,-16, 0,-43,-22, 13,-38, 23,-38,-31,-21,-36, 11, 64,-13, 35,-11,-48,-32; /M: SY='I'; M=-31,-44,-52,-51, 0, 6,-51, 76,-46, 8, -8,-42,-44,-44,-49,-38,-28, 26,-42,-26; /M: SY='A'; M= 46,-38, 1, 17,-43, 8, 37,-28,-16,-36,-18,-23,-34, 3,-15, 1, 11, -6,-49,-34; /M: SY='H'; M= -3,-43, 2, 4,-10, 13, 42,-26, 16, 26, 2, -9,-40, -7, 8,-28,-26,-13,-45,-18; /M: SY='D'; M=-16,-45, 71, 29,-34,-25, -9,-36,-24,-19,-35,-16,-36, 5,-30, 0, -5, -8,-45, 31; /M: SY='L'; M=-28,-41,-39, -9, 11,-49, 20, 32,-25, 33, 8,-35,-42, 7, -4,-31, 22, 11,-41, -8; /M: SY='P'; M= 3,-47, 41, 21,-47,-36, 20,-33,-13,-35,-35,-19, 50, 5, 27,-14, 11,-23,-53,-36; /M: SY='V'; M=-21,-40,-43,-40,-25,-48,-43, 46,-32, 0,-13, 12, -9,-36, 16,-33,-17, 56,-50,-30; /M: SY='D'; M=-16,-47, 51, 20,-37,-15, 26,-45, -9,-44,-37, 17, 47,-21,-10, -4, -3,-43,-44, 31; /M: SY='L'; M=-16,-40,-33,-30,-19,-36, 0, 12,-31, 55, -6,-29,-21,-32, 23,-38,-24, 15,-44,-26; /M: SY='P'; M= 38,-45, 8,-20,-49,-24, -7,-38,-30,-38,-34,-31, 83, -4,-38, -8, -5,-27,-49,-43; /M: SY='R'; M=-28,-48,-28, 17, -2,-13, 23,-33, 2,-38,-31,-25,-40,-14, 75,-16, 1,-39,-37, 26; /I: I=-24; MD=-77; /M: SY='P'; M=-36,-57,-20,-27,-46,-40,-39,-35,-33, 3,-31,-42,104,-18,-33,-34,-20,-40,-48,-46; D=-24; /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; /M: SY='R'; M=-35,-50,-25,-17,-39,-46,-23,-40, 2, 0,-27,-27,-27, 0, 92,-31,-26,-30,-45,-30; /I: I=-21; MD=-65; /M: SY='D'; M= 6,-46, 65, -2,-51,-33, -1,-46,-12,-47,-41, 9,-26, 1, 26, 16,-25,-20,-59,-38; D=-21; /I: I=-21; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; /M: SY='R'; M=-20,-48,-23,-18,-40, 10, 29,-31, 14,-18,-29,-26, 11,-10, 71,-19,-31, -6,-46,-21; /M: SY='G'; M= 4,-40,-17,-29,-45, 49,-33,-43, -8,-43,-36, -6,-11, -9, 31, 8, 40,-30,-48,-39; /M: SY='D'; M= 3,-40, 56,-16,-46,-20, 35,-44,-24,-36,-38, -2,-20, 3,-19, 53, 7,-38,-57,-33; /M: SY='P'; M= 31,-46,-26, -3,-43,-33, 15,-20,-17,-25,-30,-33, 78, 3,-15, -9,-25, -8,-46,-18; /M: SY='E'; M= 17,-42, 19, 36,-41, 9, 4,-36, -8, 1,-29,-23,-35, 4, 16, 11, -8,-22,-48,-35; /M: SY='F'; M=-15,-39,-53,-48, 83,-50,-37, -5,-46, 42,-10,-46,-52,-48,-44,-40,-17,-12,-21, -1; /M: SY='A'; M= 55, -9, -3, 13,-42,-16,-15,-13,-25,-16, -9,-11,-36, 40,-30,-12,-15,-13,-46,-36; /M: SY='Q'; M= 26,-10, 11, 32,-39,-27,-16,-38,-16,-17,-30,-15,-36, 35, 31, 6, -5,-24,-44, 3; /M: SY='L'; M=-26,-42,-49,-31, 16,-37,-35, 38,-41, 53, -5,-45,-48,-15,-24,-40,-19, -8, 9, 27; /M: SY='R'; M=-23,-49,-19, 48,-46,-26,-23,-47, 22,-35,-34,-24,-35, 21, 71,-26,-16,-32,-46,-35; /M: SY='A'; M= 38,-39, -4, 21,-44, 17,-31,-29, 1,-26,-32,-12,-34, 14, 7, 4, 14,-19,-47,-38; /M: SY='R'; M= -1,-45,-12, 45,-46,-39,-15,-42, 22,-36,-32,-23,-33, 40, 49,-17, 13,-20,-47,-35; /M: SY='V'; M= 5,-37,-49,-42, -2,-48,-44, 25,-42, 41, -7,-45,-47,-18,-43,-21,-25, 51,-45,-26; /M: SY='L'; M=-36,-39,-17,-42,-12,-53, 1, 8,-45, 72, 1,-47,-51,-38,-43,-43,-19, -9,-42,-22; /M: SY='N'; M= 8,-41, 30, 14,-46, -3,-24,-42, 7,-27,-34, 35,-35, 31, 10, 15, 15,-38,-51,-37; /M: SY='R'; M= 7,-46,-17, 40,-23,-27, 20,-39,-12, -3,-28,-27,-18, 29, 49, -2,-29,-37, 32,-29; /M: SY='L'; M=-16,-38,-52,-45, 41,-52,-40, 13,-33, 53, 12,-48,-50,-42,-43,-41,-29, 33,-36,-16; /M: SY='G'; M= -9,-43,-31, 23,-11, 42, 1,-26,-31, 29, 31,-30,-39, 19,-34,-19,-32,-28,-40, -9; /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;» more |
Post-processing [info]
| PROMOTED_BY | PS50893 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 96 in 96 different sequences |
| Number of true positive hits | 96 in 96 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | V_Lesaux |
| Taxonomic range [info] | Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Version [info] | 3 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
96 sequences
SSUB1_AGRFC (Q8U8D6), SSUB1_BURCH (A0K739), SSUB1_BURL3 (Q39GW5), SSUB1_BURO1 (Q1BWL4), SSUB1_FRAAA (Q0RT43), SSUB1_NOCFA (Q5Z0P5), SSUB1_PARDP (A1B9H9), SSUB1_PARXL (Q13ZK7), SSUB1_PSE14 (Q48IB9), SSUB1_PSEAB (Q02QT6), SSUB1_PSEAE (Q9HYG4), SSUB1_PSEF5 (Q4KGX6), SSUB1_PSESM (Q885N4), SSUB1_PSEU2 (Q4ZTG9), SSUB1_RHIJ3 (Q1MFL8), SSUB1_RHILO (Q98DT6), SSUB1_RHOJR (Q0SK28), SSUB1_SHOC1 (Q5WKG4), SSUB1_STRAW (Q82MV1), SSUB1_XANAC (Q8PP41), SSUB2_AGRFC (Q8U648), SSUB2_BURCH (A0KE71), SSUB2_BURL3 (Q39LW7), SSUB2_BURO1 (Q1BG75), SSUB2_FRAAA (Q0RKH4), SSUB2_NOCFA (Q5YYR7), SSUB2_PARDP (A1BC20), SSUB2_PARXL (Q13RD3), SSUB2_PSE14 (Q48FT0), SSUB2_PSEAB (Q02QT1), SSUB2_PSEAE (Q9HYF9), SSUB2_PSEF5 (Q4K441), SSUB2_PSESM (Q881U6), SSUB2_PSEU2 (Q4ZQE3), SSUB2_RHIJ3 (Q1M7A6), SSUB2_RHILO (Q981Y8), SSUB2_RHOJR (Q0S6U9), SSUB2_SHOC1 (Q5WCI1), SSUB2_STRAW (Q82CD3), SSUB2_XANAC (Q8PHQ3), SSUB3_NOCFA (Q5YRK2), SSUB3_PARXL (Q13GD4), SSUB3_PSE14 (Q48CA0), SSUB3_PSESM (Q87UI3), SSUB3_PSEU2 (Q4ZLS1), SSUB3_RHOJR (Q0S0X2), SSUB3_SHOC1 (Q5WBL0), SSUB_ACIAD (Q6FFZ1), SSUB_ALBFT (Q21XJ9), SSUB_BACAH (A0RFA4), SSUB_BACAN (Q81P94), SSUB_BACC1 (Q736E0), SSUB_BACCR (Q81C68), SSUB_BACCZ (Q63A38), SSUB_BACHK (Q6HHI7), SSUB_BACLD (Q65M64), SSUB_BACSU (P97027), SSUB_BRADU (Q89ER4), SSUB_BURCM (Q0BFQ0), SSUB_BURMA (Q62K56), SSUB_BURP1 (Q3JSR6), SSUB_BURPS (Q63TW1), SSUB_BURTA (Q2SVN0), SSUB_CORGL (Q8NR42), SSUB_CUPMC (Q1LNM0), SSUB_CUPNH (Q0K9I2), SSUB_CUPPJ (Q46ZU5), SSUB_DELAC (Q8RLB6), SSUB_ECO57 (P0AAI2), SSUB_ECOK1 (A1A9L0), SSUB_ECOL5 (Q0TJC1), SSUB_ECOL6 (Q8FJ95), SSUB_ECOLI (P0AAI1), SSUB_ECOUT (Q1RDS4), SSUB_FRACC (Q2JGF5), SSUB_GRABC (Q0BUR6), SSUB_MYCA1 (A0QFE1), SSUB_MYCPA (Q73YZ5), SSUB_MYCSS (Q1B8U4), SSUB_PECAS (Q6CYU2), SSUB_PSEE4 (Q1IGL4), SSUB_PSEPF (Q3K506), SSUB_PSEPK (Q88R93), SSUB_PSEPU (Q8KZQ6), SSUB_RALN1 (Q8XZQ4), SSUB_RHOP5 (Q07LQ4), SSUB_RHOPA (Q6N6K5), SSUB_SHIF8 (Q0T6A8), SSUB_SHIFL (Q83LN2), SSUB_SHISS (Q3Z3I7), SSUB_TRIV2 (Q3M5J9), SSUB_YERPA (Q1C1S0), SSUB_YERPE (Q74PI5), SSUB_YERPN (Q1CDR0), SSUB_YERPS (Q665B6), SSUB_ZYMMO (Q5NN23)» more
|