Entry: PS51301

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] KILA_N
Accession [info] PS51301
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2007 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC51301
Associated ProRule [info] PRU00631

Name and characterization of the entry

Description [info] KilA-N domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=106;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8082147; R2=0.0164646; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6603.24169; R2=17.28097; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=346; N_SCORE=8.5; H_SCORE=11528; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=225; N_SCORE=6.5; H_SCORE=10474; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M= -7,  5,-23,  1,  3,-16, -6, -2,-20,  1,-20,-12, 10,-15,  0,  0,  4,  1,-18,-26,-10,  1;
/M: SY='F'; M=-16,-22,-23,-29,-22, 38,-28,-10,  4,-18,  4,  2,-16,-26,-21,-13,-15, -7,  1,  2, 27,-21;
/M:         M= -7, -7, -6,-10, -8,-13,-21, -9, -9, -9,-10, -7, -5,-17, -7,-10, -2, -1, -7,-23, -5, -9;
/M: SY='Y'; M= -7,-15,-21,-17,-12, -2,-23,-11, -1, -7, -5, -3,-13,-14,-10, -9, -8, -3, -1,-10,  8,-13;
/M: SY='I'; M= -4,-19,-22,-22,-17, -8,-14,-20,  6,-18,  6,  3,-15,-12,-15,-18,-12, -7,  4,-23,-11,-18;
/M: SY='Q'; M=-11,  0,-25, -2,  6,-19,-19,  4,-14,  6,-13, -5,  4,-16,  9,  7, -5, -6,-15,-25, -6,  6;
/M: SY='Y'; M=-13,-18,-23,-20,-19, 17,-24, -2,  4,-17,  4,  1,-16,-26,-16,-15,-15, -9,  0,  0, 30,-19;
/M: SY='N'; M= -6,  7,-20,  4, -1,-19,  0, -5,-19, -7,-17,-13, 10,-17, -5, -8,  0, -5,-18,-27,-13, -4;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-21, 11, -2,-26,  5,-10,-24, -3,-23,-16,  9,-16, -6, -6,  2, -6,-18,-30,-19, -5;
/M: SY='I'; M=-11,-21,-18,-26,-19, 10,-27,-16, 11,-18,  9,  6,-15,-23,-16,-15,-14, -6,  8,-17,  2,-18;
/M: SY='E'; M= -9,  2,-24,  4, 12,-23,-17, -4,-19,  5,-19,-13,  2,  1,  3, -2, -1, -5,-19,-29,-14,  6;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-19,-28,-23,  0,-30,-21, 24,-20, 18, 13,-21,-25,-19,-15,-15, -5, 24,-25, -5,-23;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-20,-28,-20, -4,-30,-22, 22,-20, 10,  9,-16,-18,-16,-17,-10,  0, 16,-24, -4,-21;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-20,-32,-24,  7,-31,-22, 24,-21, 12, 14,-20,-21,-19,-18,-15, -5, 19,-19,  1,-23;
/M: SY='M'; M=-12, -5,-23, -7, -7,-10,-19, -4, -2, -4,  3, 13, -5,-19, -2,  1,-11, -7, -5,-24, -5, -5;
/M: SY='K'; M= -8,  3,-24,  3,  5,-23,-17, -8,-20, 15,-21,-12,  4,-12,  5, 14,  2,  1,-15,-27,-13,  4;
/M: SY='D'; M= -9, 13,-21, 16,  6,-24,-14, -1,-21,  3,-21,-14,  8,-14,  1,  0,  1, -4,-15,-31,-13,  2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='N'; M= -9, 22,-17, 15,  1,-19, -7, -1,-18,  2,-20,-14, 26,-15, -1,  0,  4,  1,-19,-30,-15, -1; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G'; M= -6,  4,-27,  4, -6,-27, 31, -5,-33,-10,-27,-18,  9,-18, -7,-11,  0,-14,-28,-24,-19, -7;
/M: SY='Y'; M=-18,-23,-23,-26,-22, 29,-28,  3,  0,-15,  5,  4,-21,-29,-15,-10,-21,-11, -7, 21, 49,-20;
/M: SY='I'; M=-11,-27,-25,-33,-26, 11,-34,-19, 30,-23, 13, 13,-21,-24,-19,-22,-18, -8, 21,-11, 14,-25;
/M: SY='N'; M= -7, 32,-19, 17,  1,-21, -1,  6,-20, -2,-30,-20, 49,-18,  1, -2, 15,  3,-26,-40,-20,  1;
/M: SY='A'; M= 18,-21,-11,-27,-19, -8,-18,-23, 12,-19,  9,  5,-19,-20,-17,-22, -7, -4, 14,-22,-11,-19;
/M: SY='T'; M=  0,  3,-12, -6, -7,-13,-15,-14,-12, -9,-13,-11,  7,-12, -6, -9, 20, 35, -5,-32,-12, -6;
/M: SY='K'; M= -5,  7,-26,  8,  6,-27,-13, -7,-27, 22,-25,-14,  4,-12,  5, 15, -2, -5,-19,-24,-12,  5;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-20,-31,-22,  6,-28,-19, 22,-25, 34, 22,-26,-26,-18,-20,-23, -9, 15,-20, -1,-20;
/M: SY='C'; M= -2,-16, 60,-24,-22,-17,-24,-12,-19,-23,-12,-11,-14,-31,-20,-23, -7, -9, -6,-39,-19,-22;
/M: SY='K'; M= -7,  4,-25,  3,  6,-21,-15, -7,-21, 13,-21,-12,  5,-11,  5, 11,  0, -4,-17,-26,-12,  5;
/M: SY='A'; M=  4, -7,-19,-10, -5,-14,-14, -7, -8, -8, -6, -5, -6,-12, -4,-10, -2, -4, -8,-22, -6, -6;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M:         M= -2,-12,-21,-15,-11, -4, -8, -9,-10,-10, -9, -5, -6,-15,-10, -7, -4, -6, -8,-17, -5,-10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G'; M= -5,  8,-26,  5, -4,-25, 20, -5,-29, -3,-26,-17, 15,-17, -6, -5,  2, -9,-24,-26,-19, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='K'; M=-10,  1,-28, -1,  6,-26,-18,  1,-27, 35,-26, -9,  4,-13,  9, 25, -7, -9,-20,-21, -7,  7;
/M: SY='D'; M=-12,  7,-27, 11,  7,-24,-17,  3,-22,  7,-19,-12,  4,-10,  5,  7, -3, -6,-19,-27, -9,  5;
/M: SY='F'; M=-12,-27,-24,-31,-22, 35,-28,-19,  4,-24,  7,  2,-21, -7,-27,-20,-18, -9, -1, -5, 12,-24;
/M: SY='N'; M= -5,  3,-19,  0, -1,-18,-13,  4,-20,  3,-19,-11,  6,-16,  2,  5,  3, -1,-15,-25, -6, -1;
/M: SY='B'; M=-12, 16,-27, 16, 10,-25,-14,  7,-25,  9,-23,-14, 16,-14, 10, 10, -1, -8,-24,-29,-12,  9;
/M: SY='W'; M=-20,-38,-45,-39,-29, 20,-22,-27,-16,-21,-14,-16,-36,-30,-22,-20,-36,-26,-24,123, 31,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-17,-21,-20,-12,  0,-24,-14,  1, -5, 14, 10,-15,-23, -9, -4,-19, -9, -3,-15, -2,-10;
/M: SY='R'; M=-10,  0,-18, -2,  8,-24,-16, -3,-26, 17,-23,-13,  6,-15,  9, 26,  0, -5,-20,-27,-14,  7;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='L'; M= -7, -3,-18,-10,-11, -4,-17,-10,  0,-14,  9,  1,  4,-22,-10, -9, -5,  2, -5,-28, -8,-10; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-25,  5, 15,-25,-17, -7,-19,  8,-16,-11, -1, -9,  9,  2, -1, -6,-16,-27,-15, 11;
/M: SY='S'; M= -3,  5,-21,  3,  7,-24,-10, -4,-22,  7,-24,-13,  9,-12,  9,  5, 11,  5,-18,-30,-15,  7;
/M: SY='T'; M=  7, -4,-14,-10, -9,-11, -7,-15,-12,-12,-16,-10,  1,-13, -8,-12, 18, 20, -5,-25,-11, -8;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-27, -6,  4,-23,-20, -9,-15, 19,-16, -5, -3,-14,  9, 14, -7, -7,-12,-22, -9,  5;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-26,  6, 28,-23,-19,  0,-25, 11,-19,-14, -1, -9, 14,  8, -3, -9,-23,-24,-11, 20;
/M: SY='L'; M=-12,-27,-23,-31,-22, 17,-32,-17, 20,-26, 28, 13,-23,-26,-20,-20,-22, -7, 10,-11, 13,-22;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-24,-34,-26,  3,-34,-23, 35,-26, 26, 22,-24,-24,-19,-23,-21, -8, 24,-20,  0,-25;
/M: SY='E'; M= -9, 11,-24, 12, 16,-26,-10, -5,-24,  7,-22,-15, 10,-11,  5,  2,  2, -4,-21,-30,-17, 11;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-23, -2, 10,-11,-16, -4,-12, -4,-11,-10,  0,-13,  0, -7, -1, -2,-13,-21, -3,  4;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-25,-31,-23,  9,-29,-20, 17,-23, 21, 10,-25,-26,-19,-20,-22, -9,  9,  2,  9,-22;
/M: SY='E'; M= -2,  6,-17,  8, 15,-25,-14, -7,-22,  4,-20,-13,  3, -8,  6, -3,  6, -1,-18,-31,-17, 10;
/M: SY='R'; M= -7,  0,-22, -2,  7,-20,-17, -3,-16,  7,-16, -9,  3,-14,  6,  8,  0, -4,-15,-26,-10,  6;
/M: SY='E'; M= -9, -3,-22, -3,  3,-14,-21, -6, -8, -2, -8, -4, -2,-16,  0, -3, -6, -7, -9,-25, -7,  0;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='N'; M=-10, -3,-18, -8, -4, -6,-19, -6, -6, -8, -6, -6,  2,-15, -7, -7, -5, -1, -9,-20,  0, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -3,  4,-17,  0, -4,-19,  6, -7,-21, -4,-21,-14, 11,-16, -4, -4,  4, -4,-18,-26,-16, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M:         M= -9, -6,-19, -9,-10, -8,-18,-13,  0,-10, -5, -3, -2, -9, -9, -9, -7, -3, -3,-23, -8,-11; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='S'; M= -3, -4,-12, -5, -3,-16,-10, -9,-15, -1,-15,-10, -1, -8, -1, -1,  1, -2,-12,-17,-10, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -5, -2,-17, -5,  0, -8, -6, -7,-11,  0,-12, -7,  1,-12, -3,  0,  0, -2, -8,-17, -7, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -4,  5,-14,  4,  1,-13, -9, -5,-13,  1,-14,-10,  8, -8,  0, -1,  3,  0,-12,-21,-10,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-8;
/M: SY='N'; M= -2,  1,-15,  0,  2,-14, -4, -6,-12,  1,-13, -8,  3, -6,  0, -1,  3, -1,-10,-18, -9,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
/M:         M= -4, -6,-22, -8, -5, -7,-18,-13, -4, -8, -2, -3, -4,-18, -8, -9, -4, -3, -4,-24, -7, -7;
/M: SY='T'; M= -6, -8,-22,-11, -8,-11,-20, -9, -4, -7, -8, -3, -5, -8, -5, -7,  0,  4, -5,-25, -7, -8;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-25, -3,  6,-11,-14,  2,-14, -3,-13, -9,  1,-16,  1, -5, -4, -8,-15,-19, -1,  3;
/M: SY='I'; M= -4,-16,-22,-19,-13, -8,-24,-17,  9,-10,  4,  4,-12,-17,-10, -9, -9, -5,  8,-23, -7,-13;
/M: SY='I'; M= -7,-20,-21,-25,-18, -1,-28,-18, 13,-11,  2,  6,-16,-14,-15,-14,-13, -8, 10,-17,  2,-18;
/M: SY='Y'; M= -8,-12,-24,-14,-12, -8,-14, -1, -3,-11, -4, -1, -7,-20, -7, -9, -7, -5, -4,-16,  4,-11;
/M: SY='N'; M= -6,  6,-23,  4,  4,-20,-14, -8,-14,  4,-17,-11,  9,-15,  0,  1,  2, -2,-11,-30,-14,  1;
/M: SY='N'; M= -8, -5,-16, -8,-11,-12,-12, -9, -9, -5,-12, -7,  1,-20, -9, -3, -2, -2, -5,-26, -8,-11;
/M: SY='K'; M= -3, -4,-23, -6,  0,-19,-12, -8,-14,  5,-15, -8, -1,-15,  1,  2, -2, -4,-11,-23,-11,  0;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-28,  0,  2,-20,-11, -4,-22, 13,-20,-10,  1,-11,  1, 13, -5, -8,-18,-21, -6,  0;
/M: SY='G'; M= -5,  7,-24,  5, -2,-24, 10, -7,-26, -2,-23,-16,  9,-15, -4, -6,  4, -3,-21,-27,-17, -3;
/M: SY='K'; M= -9,  0,-26,  1,  0,-21, -4, -8,-22,  6,-20,-13,  3,-11, -2,  6, -2, -6,-18,-24,-12, -2;
/M: SY='R'; M= -8,  0,-20, -2,  2,-19,-14, -7,-16,  1,-16,-10,  2,-11, -1,  3, -1, -1,-14,-27,-12, -1;
/M: SY='N'; M= -7, -3,-23, -8, -9,-11, -7,-11, -6, -8,-10, -6,  2,-19,-10,-10, -3, -2, -6,-22, -6,-11;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='Q'; M= -5, -6,-22, -7, -3,-15, -5, -1,-13, -7,-11, -6, -3,-14,  1, -6, -3, -8,-13,-19, -4, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-29, -9,-18,-30, 67,-19,-39,-19,-30,-20,  0,-19,-19,-19,  1,-19,-29,-21,-30,-19;
/M: SY='T'; M= -5,-12,-16,-18,-14,  5,-23,-17, -1,-14, -2, -4,-10,-18,-14,-13,  3, 18,  2,-15,  3,-14;
/M: SY='Y'; M=-20,-25,-32,-26,-23, 33,-28,  6, -4,-14, -2, -4,-24,-30,-16,-13,-24,-14,-12, 49, 65,-21;
/M: SY='V'; M=  7,-25,-17,-30,-24, -4,-23,-26, 22,-22, 13,  9,-22,-23,-21,-22,-11, -4, 26,-24, -9,-24;
/M: SY='H'; M=-16, -1,-18, -1, -2,-20,-19, 68,-28,-10,-21, -5,  6,-17,  4, -3, -6,-15,-25,-31, 10, -3;
/M: SY='P'; M=-12,-13,-34, -8,  4,-24,-20, -9,-18,  5,-22,-11,-11, 29,  4,  5, -9,-10,-23,-22,-14,  1;
/M: SY='D'; M=-14, 11,-27, 16,  7,-22,-17, -2,-19,  4,-13,-11,  5,-15,  0,  1, -7, -9,-17,-28,-10,  3;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-31,-22, 10,-31,-19, 23,-29, 41, 19,-27,-28,-20,-21,-27,-10, 12,-19,  2,-21;
/M: SY='V'; M=  9,-24,-16,-29,-22, -1,-23,-24, 18,-21, 15,  8,-22,-23,-20,-21,-10, -4, 21,-22, -8,-22;
/M:         M= -9,-11,-26,-14,-10, -6,-23,-11,  0,-12, -6, -4, -7, -1,-10,-12, -9, -6, -4,-19, -4,-12;
/M: SY='H'; M= -6, -1,-25, -2,  1,-11,-15, 21,-18, -5,-15, -9,  1,-14,  1, -3, -4, -9,-19,-17,  9, -1;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-28, 18,-34,-22, 29,-25, 15, 12,-23,-26,-25,-23,-18, -8, 24,-11, 12,-28;
/M: SY='A'; M= 26,-15,-12,-21,-14,-14, -7,-21, -2,-14, -1, -4,-13,-16,-13,-19,  3, -1,  5,-23,-16,-14;
/M: SY='S'; M= -4, -5,-17, -8, -4,-15,-11, -5,-11, -5,-12, -1, -1,-14, -2, -3,  3,  0, -9,-27,-10, -4;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-44,-40,-30,  9,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-39,-30,-20,-20,-39,-29,-29,142, 28,-20;
/M: SY='I'; M=  0,-26,-16,-34,-25, -2,-31,-27, 30,-26, 18, 13,-21,-22,-20,-26,-16, -8, 21,-22, -5,-25;
/M: SY='S'; M=  6,  1,-13,  0, -1,-18,  0, -9,-20, -9,-28,-19, 10,-11, -1, -9, 32, 16,-12,-37,-18, -1;
/M: SY='P'; M= -2, -9,-29, -5,  1,-23,-18,-16,-13, -9,-19,-14,-11, 35, -6,-16, -4, -6,-16,-29,-21, -6;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-26,  8, 14,-22,-17, -6,-21,  9,-17,-13, -1, -8,  3,  4, -2, -5,-17,-25,-11,  7;
/M: SY='F'; M=-17,-26,-20,-33,-26, 50,-30,-12,  5,-23,  7,  2,-19,-29,-29,-18,-19, -9,  2,  6, 33,-26;
/M: SY='A'; M= 16, -9, -8,-14, -7,-14, -9, -9,-15, -5,-14,-10, -6,-16, -6, -9,  3, -3, -7,-21, -9, -7;
/M: SY='I'; M= -6,-16,-18,-21,-19,  0,-26,-16, 14,-20, 10,  5,-13,-23,-16,-19,-13, -6, 10,-19, -2,-18;
/M: SY='K'; M= -9, -3,-28, -3,  4,-18,-18, -4,-23, 19,-22,-10, -3,-14,  5, 11, -7, -8,-19, -4,  2,  4;
/M: SY='V'; M= -2,-25, -1,-28,-25, -1,-29,-26, 19,-22,  8,  6,-23,-27,-24,-22,-12, -5, 27,-27, -7,-25;
/M: SY='S'; M= -5, -5,-21, -7, -9, -8,-15,-11, -4,-10,-10, -7, -1,-18, -9,-11,  3,  0, -2,-24, -3,-10;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='R'; M= -8, -2,-22, -3,  2,-20,-14, -4,-18, 11,-16, -7,  1,-15,  3, 12, -4, -5,-14,-25,-11,  2; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='I'; M= -8,-20,-24,-24,-14, -4,-25,-15, 13,-17,  7,  9,-17,-20,-10,-15,-14, -7,  8,-11, -2,-14; D=-14;
/I:         I=-14; DM=-29;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-23,-36,-27, 16,-33,-24, 30,-27, 20, 17,-22,-24,-23,-23,-19, -7, 22,-16,  4,-27;
/M: SY='B'; M=-12, 16,-26, 15,  8,-20,-15,  2,-16, -1,-17,-12, 16,-15,  3, -3, -2, -7,-18,-30,-11,  5;
/M: SY='N'; M= -5,  4,-20,  1,  4,-12,-14, -2,-16, -2,-16,-12,  6,-16, -2, -1,  1, -2,-15,-23, -4,  0;
/M: SY='Y'; M=-15,-23,-29,-26,-21, 17,-29, -2,  8,-17,  7,  4,-20,-27,-15,-15,-20,-11, -1, 16, 35,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 21 in 21 different sequences
Number of true positive hits 21 in 21 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Bacteriophages, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] KilA-N
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
21 sequences

006L_IIV6   (Q91G88), 313L_IIV6   (Q91FL1), 315L_IIV6   (Q91FK9), 
KILA_BPP1   (P19653), P28_CWPXB   (Q8QN38), P28_CWPXG   (P87607), 
P28_ECTVM   (Q85318), P28_MONPV   (Q8V571), P28_VACC0   (Q49PZ0), 
P28_VACC8   (P0C775), P28_VACCW   (P17366), P28_VAR67   (Q76R05), 
V236_FOWPN  (P14365), V248_FOWPN  (P14364), YL004_MIMIV (Q5UP83), 
YL032_MIMIV (Q5UPA5), YL033_MIMIV (Q5UPA4), YL037_MIMIV (Q5UPB3), 
YR878_MIMIV (Q5URA6), YR879_MIMIV (Q7T6Y3), YR904_MIMIV (Q5UQZ4)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission