PROSITE entry PS51317

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	NDVA
Accession [info]	PS51317
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-MAY-2007 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC51237

Name and characterization of the entry

Description [info]

Beta-(1-->2)glucan export ATP-binding/permease protein ndvA family profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=254;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=249;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7273581; R2=0.0091813; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1088874; N_SCORE=9999.0; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=9397; N_SCORE=88.0; MODE=1; TEXT='?';
/CUT_OFF: LEVEL=-2; SCORE=520; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='??';
/DEFAULT: M0=-9; D=-80; I=-80; B1=-500; E1=-500; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;

...

                A   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y
/I:         B1=0; BI=-255; BD=-255;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='R';  M=-13,-32,  5, 43,-29,-27, -3,-34, 19,-26,-18, -6,-15, 13, 52, -9,-13,-26,-28,-17;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='E';  M=-13,-25,  1, 42, -8,-31,-10, -2, -5, 28,  4,-18,-17,  2,-11,-15,-12, -5,-26,-13;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='G';  M=  5,-20,-10,-16,-29, 52,-15,-32,-13,-32,-23,  3,-16, -7,-19, 34,  1,-25,-28,-22;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='E';  M=  0,-22,  9, 44,-29,-11, -6,-29,  2,-27,-22,  0, -9, 10, -6, 32,  3,-21,-31,-20;
/M: SY='F';  M=-24,-26,-29,-28, 64,-30,  0, -2,-22,  4,  0,-24,-35,-23,-19,-20,-16, -8, 17, 64;
/M: SY='D';  M= 32,-20, 51,  6,-31, -6,-11,-24, -9,-25,-20,  3,-17, -7,-15,  3, -4,-14,-37,-21;
/M: SY='N';  M= -5,-22,  3,-15,-30, 50, -4,-33, -7,-35,-22, 51,-21, -7,-15,  4, -6,-31,-34,-25;
/M: SY='K';  M=  0,-20, -5,  1,-26, -8, -8,-26, 37,-28,-18,  4,-13,  6, 11, 34,  5,-20,-27,-16;
/M: SY='G';  M= -7,-30,-14,-12,-29, 49,-11,-37,  8,-30,-19, -3,-22, -2, 46, -5,-17,-30,-25,-20;
/M: SY='P';  M=-12,-38,-10,  7,-38,-18, -7,-25,  1,-27,-13, -9, 69, 50, -3, -5,-10,-28,-25,-20;
/M: SY='G';  M= 34,-19,-16,-18,-29, 52,-20,-27,-16,-26,-18, -6,-17,-13,-22,  5,-10,-16,-25,-25;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='E';  M=  1,-21,  8, 42,-28,-10, -6,-29,  1,-27,-22,  0, -9,  9, -6, 34,  4,-21,-31,-20;
/M: SY='D';  M= -7,-29, 52,  1,-35, 50,-12,-39,-12,-35,-29,  8,-18,-10,-20, -2,-13,-34,-35,-24;
/M: SY='V';  M= -9,-17,-34,-27,  3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7;
/M: SY='S';  M=  9,-14, -6, -7,-24,  1, -9,-24, -7,-27,-21,  6,-14,  2,-11, 53, 15,-16,-32,-16;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='E';  M= -6,-20,  8, 43,-25,-22,-10,-20,  2,-20,-16, -2, -7,  5, -8,  5, 36,-12,-34,-19;
/M: SY='V';  M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1,  0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16;
/M: SY='Q';  M=-13,-26,-16,  1, -9,-25, -6,  1, -4, 29,  9,-13,-24, 50, -3,-10,-13, -5,-22, -7;
/M: SY='P';  M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21,  0, -5,-13,-27,-27;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='Q';  M= -9,-35, -4, 16,-40,-17,  3,-26, 11,-21, -7,  0,-16, 74, 10,  2,-12,-28,-22,-11;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='I';  M=-16,-24,-35,-31,  5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='P';  M= 30,-24,-17, -7,-31, -8,-20,-19,-13,-25,-16,-18, 72,-13,-21, -1, -5,-14,-27,-27;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='K';  M=-13,-27, -5,  9,-29,-20, -8,-29, 59,-28,-16,  2,-13, 11, 26, -7, -7,-25,-22,-15;
/M: SY='T';  M=  4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15,  5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='L';  M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19,  5,-20, 31,  9,-22,-25,-15,-21, -6, -7,  5,-23,-11;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='N';  M= 31,-14,  2, -8,-26,  0, -3,-20, -4,-25,-15, 50,-20, -4,-11,  7,  1,-14,-35,-22;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='H';  M=-14,-33, -4,  8,-28,-19, 76,-30,  3,-20, -6,  4,-18, 53,  5, -3,-15,-31,-34,  2;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='V';  M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1,  0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='D';  M= -2,-21, 53,  8,-30, -6, -6,-29, -6,-31,-26, 11,-15, -1,-12, 34,  5,-23,-41,-18;
/M: SY='P';  M=-16,-42,-17, -5,-36,-18,-20,-24,-13,-34,-20,-23, 98,-16,-25,-14, -9,-29,-29,-33;
/M: SY='Q';  M=  1,-23, -5,  6,-31, -7, -3,-25,  2,-24,-14,  3,-15, 50,  0, 36,  4,-21,-27,-13;
/M: SY='T';  M=  4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15,  5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='R';  M= -9,-24,-22,-12,-14,-30,-15,  9,  9, -4, -2,-16,-27, -4, 49,-13, -8, 28,-31,-12;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-35,-31, -1,-37,-36, 47,-27, 15, 11,-27,-26,-26,-30,-20, -4, 43,-30, -9;
/M: SY='K';  M=-15,-23,-18, -6, -5,-27,-13,  1, 34, 30,  8,-13,-23, -3,  7,-16,-10, -3,-22, -9;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='M';  M=-13,-24,-35,-29,  0,-33,-18, 43,-22, 20, 55,-23,-22,-16,-23,-22, -9, 22,-24, -3;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='T';  M= -2,-13,-18,-18,-10,-25,-26, 15,-15,  0, -1, -9,-17,-19,-20,  2, 40, 33,-38,-14;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='G';  M= -1,-18,-11,-17,-24, 47,-19,-21,-13,-23,-17,  2,-13,-14,-21,  8, 37,-13,-31,-21;
/M: SY='V';  M= -9,-17,-34,-27,  3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='M';  M=-14,-26,-22,-10,-12,-26, -3, -4, 11,  4, 50,-12,-23,  3, 50,-15,-13, -7,-25, -6;
/M: SY='K';  M= -1,-20, -5,  2,-27, -9, -8,-27, 39,-28,-18,  4,-13,  6, 12, 32,  5,-20,-27,-16;
/M: SY='G';  M=  5,-20,-10,-15,-28, 50,-14,-31,-13,-31,-23,  3,-16, -6,-18, 36,  2,-24,-28,-21;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='H';  M=-18,-32, -8, -2,-21,-24, 79,-35, 12,-21, -8,  1,-22,  6, 49,-10,-17,-31,-38,  3;
/M: SY='N';  M=  0,-15,  6, -7,-25,  0,  0,-25, -2,-30,-20, 50,-18,  1, -9, 37, 10,-22,-39,-19;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='G';  M= 36,-18,-16,-17,-29, 50,-20,-26,-16,-25,-17, -6,-17,-13,-22,  5, -9,-14,-25,-24;
/M: SY='T';  M= -2,-13,-18,-18,-10,-25,-26, 15,-15,  0, -1, -9,-17,-19,-20,  2, 40, 33,-38,-14;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='Q';  M= -9,-35, -4, 16,-40,-17,  3,-26, 11,-21, -7,  0,-16, 74, 10,  2,-12,-28,-22,-11;
/M: SY='D';  M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35,  2,-31,-28,  6,-11,  7, -7, -6, -9,-30,-41,-22;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='G';  M= -7,-23,-23,-26, -7, 48,-20, -3,-24, 26,  4,-13,-25,-19,-26,-11,-16, -7,-22,-14;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='F';  M=-21,-20,-36,-30, 58,-35,-18, 11,-28, 37, 12,-30,-35,-29,-25,-26,-15,  4, -4, 17;
/M: SY='N';  M=-12,-17, 15, -7,-27,  0,  7,-26,  2,-34,-20, 73,-23,  0, -6,  6,  3,-29,-46,-22;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='S';  M=  9,-14, -6, -7,-24,  1, -9,-24, -7,-27,-21,  6,-14,  2,-11, 53, 15,-16,-32,-16;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='E';  M= 31,-20,  5, 44,-30,-11,-10,-24,  0,-22,-17, -9,-10,  6, -8,  2, -6,-13,-28,-22;
/M: SY='D';  M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35,  2,-31,-28,  6,-11,  7, -7, -6, -9,-30,-41,-22;
/M: SY='N';  M=-12,-17, 15, -7,-27,  0,  7,-26,  2,-34,-20, 73,-23,  0, -6,  6,  3,-29,-46,-22;
/M: SY='I';  M=-16,-24,-35,-31,  5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='R';  M=-15,-30, -9,  4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14;
/M: SY='P';  M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21,  0, -5,-13,-27,-27;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='T';  M=  4,-13, -6, -8,-21, -7,-13,-16, -7,-20,-15,  5,-11, -4,-13, 39, 41, -8,-35,-16;
/M: SY='D';  M=-15,-23, 56,  8,-32, -6,  3,-31, -1,-34,-26, 54,-20, -2,-10,  1, -1,-31,-50,-21;
/M: SY='V';  M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1,  0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='I';  M=-16,-24,-35,-31,  5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5;
/M: SY='H';  M=-18,-32, -8, -2,-21,-24, 79,-35, 12,-21, -8,  1,-22,  6, 49,-10,-17,-31,-38,  3;
/M: SY='A';  M= 32,-15,-25,-17, -5,-13,-19,  4,-19, 29,  8,-21,-24,-14,-21, -5, -7,  5,-23,-12;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='E';  M= -6,-23,  0, 39,-16,-30,-17, 11, -5, -3, -4,-17,-16, -1,-12,-11, -5, 31,-34,-17;
/M: SY='R';  M= 32,-20,-16, -6,-26,-10,-10,-23, 10,-21,-12, -9,-20,  1, 47,  1, -8,-12,-26,-17;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='Q';  M= 34,-21,-11,  5,-32, -7, -7,-20,  0,-19, -9, -6,-16, 49, -2,  6, -6,-12,-24,-16;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='Q';  M=-13,-26,-16,  1, -9,-25, -6,  1, -4, 29,  9,-13,-24, 50, -3,-10,-13, -5,-22, -7;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='D';  M=-17,-24, 50,  1, -7,-24,-10,  0,-15, 29,  3, -4,-25,-12,-19,-16,-10, -5,-34,-11;
/M: SY='R';  M= 32,-20,-16, -6,-26,-10,-10,-23, 10,-21,-12, -9,-20,  1, 47,  1, -8,-12,-26,-17;
/M: SY='N';  M=-12,-22,  6,  2,-28, -9,  0,-28, 41,-31,-18, 49,-18,  6, 14,  0, -2,-26,-32,-18;
/M: SY='D';  M= -2,-21, 53,  8,-30, -6, -6,-29, -6,-31,-26, 11,-15, -1,-12, 34,  5,-23,-41,-18;
/M: SY='G';  M= -7,-23,-23,-26, -7, 48,-20, -3,-24, 26,  4,-13,-25,-19,-26,-11,-16, -7,-22,-14;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='Y';  M=-23,-27,-28,-28, 62,-30,  1, -3,-21,  3,  0,-24,-35,-22,-18,-20,-16, -8, 17, 66;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='N';  M= -7,-17, -4,-16,-13,-15,-10, 12,-10, -5, -3, 45,-26,-12,-16, -4,  1, 31,-42,-16;
/M: SY='V';  M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1,  0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='G';  M= -7,-30,-14,-12,-29, 49,-11,-37,  8,-30,-19, -3,-22, -2, 46, -5,-17,-30,-25,-20;
/M: SY='Q';  M=-10,-26,-16,  2,-17,-21,  0, -2,  0,  5, 51, -8,-18, 51,  0, -8,-11, -7,-23, -5;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='S';  M=  9,-14, -6, -7,-24,  1, -9,-24, -7,-27,-21,  6,-14,  2,-11, 53, 15,-16,-32,-16;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='Q';  M= -9,-35, -4, 16,-40,-17,  3,-26, 11,-21, -7,  0,-16, 74, 10,  2,-12,-28,-22,-11;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='I';  M=-16,-24,-35,-31,  5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5;
/M: SY='A';  M= 37,-12,-12, -8,-25,  1,-14,-19,-10,-22,-15, -3,-15, -4,-14, 36,  7, -8,-29,-19;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='V';  M= -9,-17,-34,-27,  3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='K';  M=-13,-27, -5,  9,-29,-20, -8,-29, 59,-28,-16,  2,-13, 11, 26, -7, -7,-25,-22,-15;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='P';  M= 32,-23,-17, -8,-30, -7,-20,-19,-13,-24,-15,-17, 69,-12,-21,  0, -5,-13,-27,-27;
/M: SY='P';  M=-16,-42,-17, -5,-36,-18,-20,-24,-13,-34,-20,-23, 98,-16,-25,-14, -9,-29,-29,-33;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='S';  M=  9,-14, -6, -7,-24,  1, -9,-24, -7,-27,-21,  6,-14,  2,-11, 53, 15,-16,-32,-16;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='V';  M= 33,-14,-25,-18,-13,-14,-27, 15,-18, -1,  0,-20,-22,-18,-22, -2, -1, 35,-32,-16;
/M: SY='E';  M= -6,-23,  1, 42,-17,-30,-16,  9, -4, -5, -6,-16,-15,  1,-12,-11, -5, 28,-34,-17;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='D';  M= 30,-20, 54,  8,-32, -6,-10,-25, -8,-25,-21,  4,-17, -6,-15,  2, -5,-15,-38,-21;
/M: SY='R';  M=-15,-30, -9,  4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='N';  M=-12,-22,  6,  2,-28, -9,  0,-28, 41,-31,-18, 49,-18,  6, 14,  0, -2,-26,-32,-18;
/M: SY='E';  M=-13,-25,  1, 42, -8,-31,-10, -2, -5, 28,  4,-18,-17,  2,-11,-15,-12, -5,-26,-13;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='I';  M=-16,-24,-35,-31,  5,-39,-27, 43,-29, 38, 18,-30,-29,-23,-29,-26,-11, 23,-22, -5;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-34,-27,  4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7;
/M: SY='M';  M=-14,-26,-22,-10,-12,-26, -3, -4, 11,  4, 50,-12,-23,  3, 50,-15,-13, -7,-25, -6;
/M: SY='R';  M=-15,-30, -9,  4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14;
/M: SY='D';  M= -8,-29, 54,  3,-36, 48,-11,-38,-11,-35,-29,  8,-18,-10,-19, -2,-12,-34,-37,-24;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='I';  M= -8,-22,-35,-31, -1,-37,-36, 47,-27, 15, 11,-27,-26,-26,-30,-20, -4, 43,-30, -9;
/M: SY='I';  M=-15,-28,-36,-35,  1,-41,-36, 58,-29, 18, 15,-26,-24,-26,-33,-24, -8, 31,-23, -7;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='H';  M=-19,-31, -3, -3,-18,-21,103,-36, -8,-18, -4,  7,-20,  3, -2, -9,-18,-36,-53, 13;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='T';  M=  4,-12, -6, -9,-21, -8,-13,-15, -7,-19,-15,  5,-11, -5,-13, 37, 43, -7,-35,-16;
/M: SY='T';  M= -2,-11, -7,-11,-17,-18,-18, -8, -7,-13,-10,  3, -9,-12,-16, 15, 59,  0,-38,-16;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='H';  M=-19,-31, 56, 10,-27,-17, 76,-36, -6,-26,-17, 12,-18, -1, -8, -7,-12,-34,-53, -1;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='D';  M=-10,-20, 55,  7,-27,-16,-10,-21, -6,-23,-21, 10,-13, -8,-15,  5, 36,-14,-45,-18;
/M: SY='R';  M=-17,-25,-23,-13, -4,-32,-10,  1,  6, 30,  8,-18,-30, -3, 46,-19,-14, -3,-23, -7;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='V';  M= -9,-17,-34,-27,  3,-35,-26, 25,-26, 36, 15,-31,-31,-24,-26,-21, -6, 38,-29, -7;
/M: SY='F';  M=-13,-19,-36,-30, 58,-34,-25, 18,-27, 10,  4,-28,-33,-33,-26,-20, -8, 33, -7, 16;
/M: SY='F';  M=-17,-20,-36,-28, 56,-29,-10,  9,-22, 16, 54,-23,-27,-20,-19,-22,-13,  2, -5, 18;
/M: SY='D';  M=-18,-31, 78, 19,-38,-14, -3,-36, -5,-35,-34, 15,-17, -4,-13, -6, -7,-33,-53,-20;
/M: SY='N';  M=-12,-22,  6,  2,-28, -9,  0,-28, 41,-31,-18, 49,-18,  6, 14,  0, -2,-26,-32,-18;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='R';  M=-15,-30, -9,  4,-27,-23, -5,-31, 45,-26,-15, -2,-19, 10, 57, -9,-11,-25,-24,-14;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-33,-27, -4,-34,-36, 31,-25, 11,  8,-29,-29,-28,-26,-16,  0, 53,-38,-12;
/M: SY='I';  M= -8,-21,-35,-30, -1,-37,-36, 46,-27, 14, 11,-27,-26,-27,-29,-20, -4, 44,-31, -9;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='M';  M=  0,-16,-18,-14,-10,-11, -6,  0,-11,  5, 52, -6,-17, -3,-13, 29,  4, -2,-28, -7;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='G';  M=  0,-19,-11,-18,-25, 50,-19,-22,-13,-24,-17,  2,-14,-15,-21,  8, 35,-15,-30,-21;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='D';  M= 32,-20, 51,  6,-31, -6,-11,-24, -9,-25,-20,  3,-17, -7,-15,  3, -4,-14,-37,-21;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='S';  M=  4,-15,-17,-15,-13,-13,-20, 11,-15, -5, -5, -7,-20,-10,-18, 32,  8, 30,-35,-14;
/M: SY='L';  M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19,  5,-20, 31,  9,-22,-25,-15,-21, -6, -7,  5,-23,-11;
/M: SY='R';  M=-13,-34, -9,  8,-32,-22,  0,-29, 20,-23,-11, -3,-21, 52, 53, -5,-14,-27,-24,-12;
/M: SY='N';  M=-15,-24,  4, -4,-26,-11,  3,-29, 16,-29,-17, 51,-24,  5, 48, -1, -5,-27,-35,-17;
/M: SY='G';  M=  1,-27,-14,-26,-33, 74,-21,-41,-20,-36,-25,  0,-18,-17,-27,  1,-18,-34,-24,-28;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='F';  M=-26,-21,-38,-34, 81,-33,-18,  1,-29, 10, -1,-27,-36,-40,-26,-24,-17, -4, 10, 31;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='E';  M=  1,-21,  8, 42,-28,-10, -6,-29,  1,-27,-22,  0, -9,  9, -6, 34,  4,-21,-31,-20;
/M: SY='L';  M=-17,-19,-35,-27, 10,-36,-18, 18,-28, 52, 22,-34,-34,-21,-25,-27,-13, 11,-21, -3;
/M: SY='L';  M= 30,-15,-26,-18, -4,-14,-19,  5,-20, 31,  9,-22,-25,-15,-21, -6, -7,  5,-23,-11;
/M: SY='R';  M=-17,-33,-13, -1,-26,-27, -2,-33, 26,-25,-14, -6,-25, 10, 73,-11,-16,-26,-26,-12;
/M: SY='A';  M= 53,-11,-18,-10,-26,  1,-19,-15,-13,-17,-11,-12,-16, -9,-17,  9, -2, -2,-26,-21;
/M: SY='G';  M= -4,-30, -9, -1,-36, 50, -8,-33, -3,-28,-16,  0,-17, 48, -5,  1,-15,-31,-23,-19;
/M: SY='F';  M=-10,-24,-24,-29, 53, 49,-19,-16,-24, -8,-12,-11,-26,-27,-27, -9,-18,-17, -5, 10;
/M: SY='M';  M=-14,-19,-34,-25,  5,-31,-11, 17,-22, 40, 56,-27,-27,-14,-19,-24,-11,  9,-22, -1;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-34,-27,  4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7;
/M: SY='N';  M=-11,-25,  7,  6,-33, -7,  5,-26,  6,-27,-13, 51,-20, 50,  2,  4, -3,-28,-33,-16;
/M: SY='D';  M=-14,-31, 59, 47,-36,-20, -3,-35,  2,-31,-28,  6,-11,  7, -7, -6, -9,-30,-41,-22;
/M: SY='E';  M=-10,-31, 19, 65,-34,-26, -3,-35,  9,-27,-23, -7, -5, 16, -1, -7,-11,-27,-30,-24;
/M: SY='E';  M= 31,-20,  5, 44,-30,-11,-10,-24,  0,-22,-17, -9,-10,  6, -8,  2, -6,-13,-28,-22;
/M: SY='R';  M= -9,-23,-22,-13,-13,-31,-16, 11,  7, -3, -1,-16,-27, -5, 46,-14, -7, 31,-32,-12;
/M: SY='R';  M= 30,-21,-15, -5,-26,-11,-10,-23, 12,-21,-12, -9,-21,  2, 50,  0, -9,-13,-26,-16;
/M: SY='R';  M= 30,-21,-15, -5,-26,-11,-10,-23, 12,-21,-12, -9,-21,  2, 50,  0, -9,-13,-26,-16;
/M: SY='L';  M= -9,-17,-34,-27,  4,-35,-26, 25,-26, 37, 16,-31,-32,-24,-26,-22, -7, 36,-28, -7;
/M: SY='S';  M= 36,-13,-11, -8,-25,  1,-14,-19, -9,-22,-16, -2,-15, -3,-14, 37,  7, -9,-29,-19;
/M: SY='R';  M= -9,-21,-10, -5,-22,-23, -9,-19, 13,-19,-12, -1,-17,  1, 50,  3, 35,-12,-31,-14;
/M: SY='S';  M= 36,-13,-11, -8,-25,  1,-14,-19, -9,-22,-16, -2,-15, -3,-14, 37,  7, -9,-29,-19;
/M: SY='T';  M= -2,-14,-19,-18,-10,-26,-26, 17,-15,  1,  0,-10,-18,-19,-21,  1, 38, 35,-38,-13;
/M: SY='D';  M=-13,-33, 53, 18,-39,-16,  0,-30,  4,-27,-18,  8,-17, 52,  0, -2,-10,-30,-34,-15;
/M: SY='D';  M= -7,-29, 52,  1,-35, 50,-12,-39,-12,-35,-29,  8,-18,-10,-20, -2,-13,-34,-35,-24;
/M: SY='E';  M= 31,-20,  5, 44,-30,-11,-10,-24,  0,-22,-17, -9,-10,  6, -8,  2, -6,-13,-28,-22;
/I:         E1=0; IE=-255; DE=-255;

» more

Post-processing [info]

PROMOTED_BY

PS50893

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_02 which contains 571'282 sequence entries.

Total number of hits	23 in 23 different sequences
Number of true positive hits	23 in 23 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	V_Lesaux
Taxonomic range [info]	Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

23 sequences

NDVA_AGRFC  (P0A2V0), NDVA_AGRVI  (Q71ED1), NDVA_BARBA  (P70864),

NDVA_BARBK  (A1USS5), NDVA_BARHE  (Q6G2Z5), NDVA_BARQU  (Q6FZF2), 
NDVA_BRADU  (Q89UT8), NDVA_BRUA2  (Q2YQ73), NDVA_BRUAB  (P0C529), 
NDVA_BRUME  (Q8YH20), NDVA_BRUSU  (Q8G0T8), NDVA_NITHX  (Q1QH37), 
NDVA_NITWN  (Q3SP57), NDVA_RHIEC  (Q2K342), NDVA_RHIJ3  (Q1MAB5), 
NDVA_RHILO  (Q983H5), NDVA_RHIME  (P18767), NDVA_RHIRD  (P0A2V1), 
NDVA_RHOP2  (Q2J0F4), NDVA_RHOP5  (Q07QX6), NDVA_RHOPA  (Q6N1Y7), 
NDVA_RHOPB  (Q20Z38), NDVA_RHOPS  (Q13BH6)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment